Molekuláris dinamika: elméleti potenciálfelületek

Hasonló dokumentumok
A kvantumkémia alkalmazása PES kémiai szempontból fontos jellemzői. A kvantumkémia alkalmazása Fogalmak

A MOLEKULADINAMIKAI MÓDSZEREK SZISZTEMATIKUS TÁRGYALÁSA: KLASSZIKUS DINAMIKA A POSTERIORI KORREKCIÓJA

Monte Carlo számítások. Monte Carlo számítások. Monte Carlo számítások. Monte Carlo számítások. Monte Carlo számítások. Monte Carlo számítások

ORVOSI STATISZTIKA. Az orvosi statisztika helye. Egyéb példák. Példa: test hőmérséklet. Lehet kérdés? Statisztika. Élettan Anatómia Kémia. Kérdések!

SZAKDOLGOZAT. FARKAS ÁDÁM LÁSZLÓ fizika BSc. (fizikus szakirány) Jahn-Teller felületek és vibronikus energiaszintek ab initio számítása

Idegen atomok hatása a grafén vezet képességére

RAMAN SZÓRÁS NANOSZERKEZET KALKOGENID ÜVEGEKBEN

7. Regisztráció. Kató Zoltán. Képfeldolgozás és Számítógépes Grafika tanszék SZTE (

A s r ségfunkcionál elmélet (Density Functional Theory)

Pauli-Schrödinger egyenlet

Méréselmélet: 5. előadás,

2 Wigner Fizikai Kutatóintézet augusztus / 17

Minősítéses mérőrendszerek képességvizsgálata

3D - geometriai modellezés, alakzatrekonstrukció, nyomtatás

A tárgy neve Meghirdető tanszék(csoport) Felelős oktató: Kredit Heti óraszám típus Számonkérés Teljesíthetőség feltétele Párhuzamosan feltétel

Ötvözetek mágneses tulajdonságú fázisainak vizsgálata a hiperbolikus modell alkalmazásával

Atomok és molekulák elektronszerkezete

A Ga-Bi OLVADÉK TERMODINAMIKAI OPTIMALIZÁLÁSA

Molekulák elektronszerkezete - kv2n1p07/1 vázlat

3D-s számítógépes geometria

v i = v i V. (1) m i m i (v i V) = i P = i m i V = m i v i i A V = P M

Molekuláris dinamika I. 10. előadás

Az elektromos kölcsönhatás

8. Egyszerû tesztek sûrûség funkcionál módszerek minõsítésére

Atomok elektronszerkezete

Robotok direkt geometriája

AZ ELEKTRON MÁGNESES MOMENTUMA. H mágneses erœtérben az m mágneses dipólmomentummal jellemzett testre M = m H forgatónyomaték hat.

Kutatási terület. Szervetlen és szerves molekulák szerkezetének ab initio tanulmányozása

Szerven belül egyenetlen dóziseloszlások és az LNT-modell

X Physique MP 2013 Énoncé 2/7

TÉRBELI STATISZTIKAI VIZSGÁLATOK, ÁTLAGOS JELLEMZŐK ÉS TENDENCIÁK MAGYARORSZÁGON. Bihari Zita, OMSZ Éghajlati Elemző Osztály OMSZ

Compton-effektus. Zsigmond Anna. jegyzıkönyv. Fizika BSc III.

Káprázás -számítási eljárások BME - VIK

Bevezetés a kémiai termodinamikába

2015/16/1 Kvantummechanika B 2.ZH

Szárítás során kialakuló hővezetés számítása Excel VBA makróval

Fizikai kémia 2. Előzmények. A Lewis-féle kötéselmélet A VB- és az MO-elmélet, a H 2+ molekulaion

Egyenáramú szervomotor modellezése

Molekuláris dinamika. 10. előadás

Számítógépes szimulációk: molekuláris dinamika és Monte Carlo

3D Számítógépes Geometria II.

Az előadás kvaternió alapú dárumtranszformációs analitikus megoldást ismertet Bemutatja

A kémiai kötés magasabb szinten

/11 Változtatások joga fenntartva. Kezelési útmutató. UltraGas kondenzációs gázkazán. Az energia megőrzése környezetünk védelme

Support Vector Machines

Elektrokémia 05. Elektródreakciók kinetikája. Láng Győző. Kémiai Intézet, Fizikai Kémiai Tanszék Eötvös Loránd Tudományegyetem Budapest

Véletlen gráfok szerkesztésekor n csomópontból indulunk ki. p valószínűséggel két csomópontot éllel kötünk össze.

Sugárzások kölcsönhatása az anyaggal

Egy mozgástani feladat

Fotovillamos és fotovillamos-termikus modulok energetikai modellezése

A TERMODINAMIKA MIKROSZKOPIKUS ÉRTELMEZÉSE: A STATISZTIKUS TERMODINAMIKA ALAPJAI

Elektrokémia 05. Elektródreakciók kinetikája. Láng Győző. Kémiai Intézet, Fizikai Kémiai Tanszék Eötvös Loránd Tudományegyetem

IDA ELŐADÁS I. Bolgár Bence október 17.

3D - geometriai modellezés, alakzatrekonstrukció, nyomtatás

A multikritériumos elemzés célja, alkalmazási területe, adat-transzformációs eljárások, az osztályozási eljárások lényege

Statisztika elméleti összefoglaló

1.Tartalomjegyzék 1. 1.Tartalomjegyzék

Elegyek. Fizikai kémia előadások 5. Turányi Tamás ELTE Kémiai Intézet. Elegyedés

3D - geometriai modellezés, alakzatrekonstrukció, nyomtatás

ORVOSI STATISZTIKA. Az orvosi statisztika helye. Egyéb példák. Példa: test hőmérséklet. Lehet kérdés? Statisztika. Élettan Anatómia Kémia. Kérdések!

January 16, ψ( r, t) ψ( r, t) = 1 (1) ( ψ ( r,

Nagynyomású fázisegyensúly vizsgálata opálosodási pont megfigyelésével

VIK A3 Matematika, Gyakorlati anyag 2.

VÁLASZOK A FIZKÉM I ALAPKÉRDÉSEKRE, KERESZTÉVFOLYAM 2006

Magszerkezet modellek. Folyadékcsepp modell

SEMMELWEIS EGYETEM. Biofizikai és Sugárbiológiai Intézet, Nanokémiai Kutatócsoport

7. Mágneses szuszceptibilitás mérése

10. Transzportfolyamatok folytonos közegben

Az entrópia statisztikus értelmezése

Mágneses monopólusok?

MOLEKULAMECHANIKA (MM)

A bifiláris felfüggesztésű rúd mozgásáról

Két körhenger általánosabban ( Alkalmazzuk a vektoralgebrát! ) 1. ábra

1. Potenciális-energia felület, koordinátarendszerek

Töréskép optimalizálás Elmélet, megvalósítás, alkalmazás

Molekuladinamika. Molekuladinamika. Molekuladinamika. Molekuladinamika. Molekuladinamika. Molekuladinamika

4 Approximációs algoritmusok szorzatalakú hálózatok esetén

A kémiai kötés magasabb szinten

Megoldott feladatok november 30. n+3 szigorúan monoton csökken, 5. n+3. lim a n = lim. n+3 = 2n+3 n+4 2n+1

Regresszió. Fő cél: jóslás Történhet:

F. F, <I> F,, F, <I> F,, F, <J> F F, <I> F,,

4. előadás Reaktorfizika szakmérnököknek

Radiokémia vegyész MSc radiokémia szakirány Kónya József, M. Nagy Noémi: Izotópia I és II. Debreceni Egyetemi Kiadó, 2007, 2008.

Robotirányítási rendszer szimulációja SimMechanics környezetben

Zaj- és rezgés. Törvényszerűségek

Atomfizika. Az atommag szerkezete. Radioaktivitás Biofizika, Nyitrai Miklós

Radioaktív sugárzások tulajdonságai és kölcsönhatásuk az elnyelő közeggel. A radioaktív sugárzások detektálása.

A csavarvonal axonometrikus képéről

Darupályák ellenőrző mérése

Variancia-analízis (ANOVA) Mekkora a tévedés esélye? A tévedés esélye Miért nem csinálunk kétmintás t-próbákat?

Az α értékének változtatásakor tanulmányozzuk az y-x görbe alakját. 2 ahol K=10

Reaktivitás on-line digitális mérhetősége virtuális méréstechnikával

Egy negyedrendű rekurzív sorozatcsaládról

Sinkovicz Péter, Szirmai Gergely október 30

rendszer: a világ általunk vizsgált, valamilyen fallal (részben) elhatárolt része környezet: a világ rendszert körülvevő része

Határtalan neutrínók

A hordófelület síkmetszeteiről

Hely és elmozdulás - meghatározás távolságméréssel

Hőmérsékleti sugárzás

EGY ABLAK - GEOMETRIAI PROBLÉMA

Átírás:

Molekulárs dnamka: elmélet potencálfelületek éhány szó a potencál felület meghatározásáról Szemempírkus és ab nto potencál felületek a teles felület meghatározása (pontos nem megy részletek: mndárt éhány kora szememprkus modell (történet szempontból érdekes durva felület (akár ad hoc dnamka számítás összehasonlítás kísérlettel paraméter vált. dnamka számolás swtchng functons kapcsoló függvények pl. kollneárs C C reakcóra: (R C, R C (R C f (R (R f (R C, C smert, ha 0, f (R, f (R C 0 szmptotkus forma OK, de f, f -t meg kell találn. LEPS (London - Eyrng - Polány Sato szemempírkus módszer: Datomos potencál (H Hetler London modelle alapán: (R Q ± (Coulomb kcseréldés tag (Q, 0, ha R Q Q C Q C ± ( C ( C C ( C

DIM (datomcs n molecules: : sznglet - : trplet egy vegyérték elektronos rendszerre gaz! De: alkalmazzák másra s! ( elektronállapot C elektronállapot és (C elektronállapot elektronállapot és (C elektronállapot elektronállapot ez a bázs az elektronkus Ĥ -t dagonolzálák ezen a bázson! sok pontra! (sok etrára! Potencál felületek számítás: napankban használt módszerek Szemempírkus módszerek (kb. 90-es évek eleég: M, PM3 Ma már kzárólag ab nícó módszereket alkalmaznak. éhány megfontolandó tény: elektron elácó fgyelembevétele szükséges (poszt - HF módszerek kellenek! poszt HF módszerek közül a méretkonzsztens módszerek önnek számításba E (... E( 0 r Ált. def.: ha kölcsönható részecske van, energa ~, ha. CI módszerek nem lyenek! (természetesen a full-ci méretkonzsztens. (MO-kból képzett determnánsok lneárs kombnácóa a hfv.

ók a perturbácós módszerek (pl. MPT-n alapuló módszerek! M: másodrend perturbácós tagot tartalmazó módszer (MP a legolcsóbb. CI-ból levezetett Compled-Cluster módszerek (Szalay Péterék (par, coupled-par, CC módszerek már méretkonzsztensek DFT módszerek: srség funkconál elméleten alapuló módszerek szemben a fent módszerekkel melyek konfgurácós tér függvényekkel dolgoznak DFT az elektron valószínség srséggel dolgozk. HF egyenletekhez formalag hasonló Kohn-Sham egyenletek megoldása szolgáltaták a KS-pályákat és az elektronkus energát. ázs függvények megválasztása gyakorlatlag már csak Gauss-típusú, atomra centrált függvényeket használnak (Slater pályákkal még mndg kísérleteznek nagy bázs kell a potencál topológáának pontos vsszaadásához de így s fellép a bázs-kteresztés hba: SSE SSE forrása: ( E( E( < E ( ( E( Kküszöbölés: Counterpose ekcó CP ( E( E ( ex

hol [ E ( E ( ( E ( E ( ] ( Csak akkor, ha nncs etra relaxácó! Ekkor: [ E (, E (, E (, E (, ] ( Több test potencálfelületek esetén tovább bonyolódk a helyzet: ( E( E( E( ( E( C C [ E ( E ( E ( C ( E ( E ( E ( C ] utentkus rodalom: PC, 97, 488, 993. SSE hatása: mélyebb potencálgödör, ersebb kölcsönhatás energa potencál erállandónak változása, alacsonyabb vbrácós frekvencák potencál mnmumának eltolódása

Potencál felületek számítás: Kvtelezés energaszámítások véges számú pontra felület llesztése Pot. felület llesztése: tsztán numerkus módszerek (pl. splne llesztése HOr MCSCF módszerrel számított pot. felületére Füst-Molnár L. doktor dolgozata valamféle parametrzált, ksebb-nagyobb fzka háttérrel bíró módszer. 3 példa: Lennard-ones potencál llesztése E qq r r 6 r Kéttest-potencál! Effektív potencál. E e arrpox e ( R v ( R I v ( R I, R v3 ( R I, R, R K... I I < I < < K Ilyent csnáltunk hangyasav dmerre, folyadékszmulácóban alkalmazható. PC, 0, 66, 997. CP, 999,, 340 potencál felület HS-ra (hdrox-szllén CS SCF számítások 630 konfgurácóra Potencál llesztés nterpolált potencáls energa felülettel:

d MS d ( W ( R ( X X Taylor sorfetés (másodk rendg : ref. pontok száma; W : súlyfüggvény a 3-6 bels koordnáta függvénye (X 3 ( X X ( g ( 3 k : -edk ref. pont pot. energáa X : X -edk koordnátáa : ref. pont -k koordnátáa ( X ( g ( f k : ref. pont gradense f ( k ( X X : ref. pont Hesse mátrxa (ermátrx ( ( X k X ( k W 3 6 ( ahol w R ( R ( ( R w ( R R d w ( R k k CP, 999, ol., 386 p p 5 ebben a tanulmányban. O( 3 P potencáls energa felülete 503 pont számítva MR-CISD számítások TZF bázssal ( r, r, r OCl ( ( r ( ( r R ( r ClO (3 ( v, r, Θ Cl ahol ( ( r D e c η (η exp(-β(r - r e, 4 β és c számítása a ckkben. R taszító pot., hasonló alak ( (r-hez 6 7 (3 c kl k l 0 [ ( r r ] k l ρ ρ cos ( ΘCl k l 9 ρ r exp α e, ahol α 0,75 β és c kl paraméterllesztéssel lesz meghatározva!