Rekonstrukciós eljárások. Orvosi képdiagnosztika előadás 2015 ősz

Hasonló dokumentumok
Rekonstrukciós eljárások. Orvosi képdiagnosztika 2017 ősz

Rekonstrukciós eljárások. Orvosi képdiagnosztika 2017 ősz

Rekonstrukciós eljárások. Orvosi képdiagnosztika 2017 ősz

Rekonstrukciós eljárások. Orvosi képdiagnosztika előadás 2016 ősz

Rekonstrukciós eljárások. Orvosi képdiagnosztika 2018 ősz

Képrekonstrukció 3. előadás

Fourier térbeli analízis, inverz probléma. Orvosi képdiagnosztika 5-7. ea ősz

7. Előadás tartalma. Lineáris szűrők: Inverz probléma dekonvolúció: Klasszikus szűrők súly és átviteli függvénye Gibbs jelenség

Fourier térbeli analízis, inverz probléma. Orvosi képdiagnosztika 5-7. ea ősz

Képrekonstrukció 4. előadás

Képalkotás modellezése, metrikái. Orvosi képdiagnosztika 6. ea ősz

PET gyakorlati problémák. PET rekonstrukció

Fourier térbeli analízis, inverz probléma. Orvosi képdiagnosztika 6-8. ea ősz

Képalkotás modellezése, metrikái. Orvosi képdiagnosztika 2017 ősz

Fourier térbeli analízis, inverz probléma. Orvosi képdiagnosztika 7-8. ea ősz

Jelfeldolgozás bevezető. Témalaboratórium

ACM Snake. Orvosi képdiagnosztika 11. előadás első fele

Hadházi Dániel.

Nem roncsoló tesztelés diszkrét tomográfiával

Képalkotó diagnosztikai eljárások:

A maximum likelihood becslésről

Dekonvolúció a mikroszkópiában. Barna László MTA Kísérleti Orvostudományi Kutatóintézet Nikon-KOKI képalkotó Központ

Képalkotó diagnosztikai eljárások

Least Squares becslés

Képalkotó diagnosztikai eljárások:

Számítási feladatok a Számítógépi geometria órához

Diszkréten mintavételezett függvények

Haladó lineáris algebra

Q 1 D Q 2 (D x) 2 (1.1)

Pontműveletek. Sergyán Szabolcs Óbudai Egyetem Neumann János Informatikai Kar február 20.

8. előadás. Kúpszeletek

Függvények Megoldások

A röntgendiagnosztika alapjai

Adatelemzési eljárások az idegrendszer kutatásban Somogyvári Zoltán

Wavelet transzformáció

Folyadékszcintillációs spektroszkópia jegyz könyv

Alkalmazás a makrókanónikus sokaságra: A fotongáz

Lineáris leképezések. Wettl Ferenc március 9. Wettl Ferenc Lineáris leképezések március 9. 1 / 31

Alap-ötlet: Karl Friedrich Gauss ( ) valószínűségszámítási háttér: Andrej Markov ( )

Lin.Alg.Zh.1 feladatok

Abszolút és relatív aktivitás mérése

Compton-effektus. Zsigmond Anna. jegyzıkönyv. Fizika BSc III.

Jelek és rendszerek 1. 10/9/2011 Dr. Buchman Attila Informatikai Rendszerek és Hálózatok Tanszék

Ellenőrző kérdések a Jelanalízis és Jelfeldolgozás témakörökhöz

Matematika (mesterképzés)

Képrestauráció Képhelyreállítás

Line aris f uggv enyilleszt es m arcius 19.

Geofizikai kutatómódszerek I.

Vektorterek. =a gyakorlatokon megoldásra ajánlott

Numerikus módszerek beugró kérdések

Norma Determináns, inverz Kondíciószám Direkt és inverz hibák Lin. egyenletrendszerek A Gauss-módszer. Lineáris algebra numerikus módszerei

MATEMATIKA ÉRETTSÉGI TÍPUSFELADATOK MEGOLDÁSAI KÖZÉPSZINT Függvények

A röntgendiagnosztika alapjai

Konjugált gradiens módszer

ADAT- ÉS INFORMÁCIÓFELDOLGOZÁS

Gauss-Seidel iteráció

Sajátértékek és sajátvektorok. mf1n1a06- mf1n2a06 Csabai István

Mérési hibák

Lineáris regressziós modellek 1

12. előadás. Egyenletrendszerek, mátrixok. Dr. Szörényi Miklós, Dr. Kallós Gábor

Az egyenlőtlenség mindkét oldalát szorozzuk meg 4 16-al:

Differenciálszámítás. 8. előadás. Farkas István. DE ATC Gazdaságelemzési és Statisztikai Tanszék. Differenciálszámítás p. 1/1

Saj at ert ek-probl em ak febru ar 26.

Abszorpciós spektroszkópia

Problémás regressziók

(Independence, dependence, random variables)

Röntgensugárzás az orvostudományban. Röntgen kép és Komputer tomográf (CT)

6. gyakorlat. Gelle Kitti. Csendes Tibor Somogyi Viktor. London András. jegyzetei alapján

VIK A2 Matematika - BOSCH, Hatvan, 3. Gyakorlati anyag. Mátrix rangja

LNM folytonos Az interpoláció Lagrange interpoláció. Lineáris algebra numerikus módszerei

Röntgensugárzás. Röntgensugárzás

Lin.Alg.Zh.1 feladatok

Röntgendiagnosztikai alapok

Éldetektálás, szegmentálás (folytatás) Orvosi képdiagnosztika 11_2 ea

Képszegmentáló eljárások. Orvosi képdiagnosztika 2018 ősz

Vektorterek. Wettl Ferenc február 17. Wettl Ferenc Vektorterek február / 27

Szcintillációs gamma spektrumok gyors és hatékony kiértékelésére alkalmazható numerikus módszerek továbbfejlesztése

Matematika A1a Analízis

Alkalmazott algebra. Lineáris leképezések EIC. Wettl Ferenc ALGEBRA TANSZÉK BMETE90MX57 (FELSŐBB MATEMATIKA INFORMATIKUSOKNAK )

Digitális képek szegmentálása. 5. Textúra. Kató Zoltán.

Az Ampère-Maxwell-féle gerjesztési törvény

Feladatok a Gazdasági matematika II. tárgy gyakorlataihoz

Az Orvosi Fizika Szigorlat menete a 2012/2. tanévtől

Matematika A2 vizsga mgeoldása június 4.

Tárgy. Forgóasztal. Lézer. Kamera 3D REKONSTRUKCIÓ LÉZERES LETAPOGATÁSSAL

azonosságot minden 1 i, l n, 1 j k, indexre teljesítő együtthatókkal, amelyekre érvényes a = c (j) i,l l,i

Gazdasági matematika II. vizsgadolgozat megoldása A csoport

5 1 6 (2x3 + 4) 7. 4 ( ctg(4x + 2)) + c = 3 4 ctg(4x + 2) + c ] 12 (2x6 + 9) 20 ln(5x4 + 17) + c ch(8x) 20 ln 5x c = 11

6. Függvények. 1. Az alábbi függvények közül melyik szigorúan monoton növekvő a 0;1 intervallumban?

Keresztmetszet másodrendű nyomatékainak meghatározása

1. Generátorrendszer. Házi feladat (fizikából tudjuk) Ha v és w nem párhuzamos síkvektorok, akkor generátorrendszert alkotnak a sík vektorainak

A diplomaterv keretében megvalósítandó feladatok összefoglalása

FEGYVERNEKI SÁNDOR, Valószínűség-sZÁMÍTÁs És MATEMATIKAI

Bevezetés az algebrába 1

Összeállította: dr. Leitold Adrien egyetemi docens

Geometria II gyakorlatok

1. ábra. 24B-19 feladat

A kvantummechanika kísérleti előzményei A részecske hullám kettősségről

Testek. 16. Legyen z = 3 + 4i, w = 3 + i. Végezzük el az alábbi. a) (2 4), Z 5, b) (1, 0, 0, 1, 1) (1, 1, 1, 1, 0), Z 5 2.

Gauss-Jordan módszer Legkisebb négyzetek módszere, egyenes LNM, polinom LNM, függvény. Lineáris algebra numerikus módszerei

Átírás:

Rekonstrukciós eljárások Orvosi képdiagnosztika 14.-15. előadás 2015 ősz

Előadások témája Röntgen tomográfia fizikai és matematikai alapjai 2D Radon transzformáció, szűrt visszavetítés: Fan beam / Cone beam felvételi elrendezések esete Általánosított (3D) röntgen tomográfia alapjai ART rekonstrukciós eljárások Pozitron emissziós tomográfia alapjai ML-EM statisztikai rekonstrukciós eljárás Modell alapú rekonstrukciós eljárások Tomoszintézis felvételi elrendezés MITS rekonstrukció Rekonstrukciós eljárások minősítése

Röntgen tomográfia alapjai Általánosított Beer-Lambert törvény: Emax I 0, 0 0 exp, x y I E E xdxde Emin Px0, y0 I E E 0 : röntgencsövet elhagyó energiájú sugárzás fluxusa (tehát ez a térfogatba belépő sugárzás intenzitása ) P x, y: röntgencsövet a detektor xy, koordinátájú pontjával összekötő szakasza a 3d térnek E, x : a vizsgált térfogat xkoordinátájú pontjának lineáris csillapítási együtthatója E energián Egyszerűsített Beer-Lambert törvény: (monokróm spektrum esete) 0 exp : I E x dx Px0, y0

Röntgen tomográfia alapjai Monokróm spektrumú sugárzás esete: Általánosan alkalmazott feltételezés Rekonstrukció célja a lin. csillapítási együtthatók meghatározása az alábbi összefüggés invertálásával: ln, I xy 0 Px I x dx 0, y0 Valódi röntgensugarak ezzel szemben: Polikromatikusak sugárkeményedés problémája Compton szóródnak: nem igaz, hogy csak a vetítősugár mentén elhelyezkedő képletek számítanak. Projekciók egyéb zajjal is terheltek : kis intenzitásnál rossz SNR

Röntgen alapú képalkotás Konvencionális P-A röntgen: Nincs rekonstrukció Számítógépes tomográfia (CT): Párhuzamos vetítősugarakon alapuló eljárások (kevés ilyen eszköz van csak forgalomban), cserébe egyszerű elmélet Legyező (Fan-beam) helikális CT Cone-beam CT, ennek speciális változata a Tomoszintézis Orvosi képdiagnosztika alapvető eszköze: Mivel a röntgen sugárzás ionizál, ezért protokollokkal szabályozott a vizsgálatok gyakorisága, és effektív dózisa

2D Radon transzformáció: Radon transzformáció (2D szelet 1D projekciók): Input: 2D Descartes - koordinátarendszerbeli kép Output: sinogram 2D polár-koordinátarendszerbeli kép Sinogram: t

Radon transzformáció Fourier vetítősík tétel Radon transzformáció (2D szelet 1D projekciók): Vetítősugarak merőlegesek az x tengellyel szöget bezáró egyenesre: t x cos y sin Vetítősugarak mentén integráljuk a szelet elemeit: P t f x, y x cos y sin t dxdy xy, Legyen exp 2 Fourier vetítősík tétel származtatása: x, y, t S FT P t P t j t dt S f x, y x cos y sin t exp 2 j t dtdydx, exp2 cos sin S f x y j x y dydx xy,

Fourier vetítősík tétel Lényegében f spektrumának egy szakaszát kaptuk meg: F cos, sin S Vizuális interpretáció:

Rekonstrukció FBP alapötlete Rekonstrukció célja: Radon Transzf. invertálása Fourier vetítősík tétel értelmében a vizsgált szelet spektrumainak bizonyos részeit ismerjük: Az ismert részeket illesszük egy üres spektrumba Polár koordinátás frekvencia sugarának függvényében a spektrum mintavételi helyeinek eltérő a távolsága: K 2 2 Korrekció: spektrumba illesztés előtt -val súlyozzunk frekvenciatérben (ez az ún. rámpaszűrés).

Szűrt visszavetítés (FBP) származtatása FT inverze:,, exp 2 f x y F u v j ux vy dvdu uv, Fourier vetítősík miatt a spektrumot polárkoordináta-rendszerben ismerjük: u cos ; v sin 2,, exp 2 cos sin f x y F j x y Jdd 0 0 u u J..., dudv Jdd v v Továbbiakban k : x cos y sin 2 f x, y F, exp j2 k d d 0 0

Szűrt visszavetítés (FBP) származtatása Vágjuk szét a külső integrált: 2 j 2 k j 2 k f x, y F, e dd F, e dd 0 0 0 f, a sinogram egy oszlopa, melynek definíciójából (Radon transzf.) következik, hogy F, F,, hiszen:, exp 2 exp 2 F P t j t dt P t j t dt t t dt F, P lexp j2 l dl F, l t dl l Felhasználtuk, hogy k x cos y sin, illetve cos cos és sin sin

Szűrt visszavetítés (FBP) származtatása Behelyettesítve az két integrálba: j 2 k j 2 k,, e, e f x y F dd F dd 0 0 0 f x, y F, exp j2k dd Q k d : Q k S exp j2 k dekvivalens a projekciók projekciók (sinogram oszlopai) rámpa szűrővel történő szűrésével f x, y Q x cos y sin d : az ú.n. visszavetítés 0 0 0 0

Szűrt visszavetítés értékelése Rámpaszűrő: 0, f N 0, fpn f Ideális rekonstrukció feltételei: 180 -ból rögzített projekciók 2arcsin f 2 fpn Projekciók felbontása elegendően nagy: f 2 f tipikus az 1cyc/mm PN Zajt az eljárás expliciten nem kezeli, ez jelentős problémaforrás. N képtérben

Szűrt visszavetítés implementációja Rámpaszűrés frekvenciatérben történik: 5 5-ös szűrő esetén már a frekvenciatartománybeli szűrés a gyorsabb (ennek főleg régebben volt jelentősége). Visszavetítés kép / időtartományban: Frekvenciatartományban interpolálnunk kellene a spektrum ismert egyeneseiből a DFT által mintavett frekvenciák értékét (mely messze nem triviális). Szűrések, projekciók visszavetítése egyenként (sugaranként) jól párhuzamosítható

Szűrt visszavetítés zajérzékenysége Detektorok NNPS-e a frekvencia függvényében monoton nő zajos magas frekvencia (PET esetén a röntgenes esetnél jóval rosszabb). Ráadásul magas frekvencián távolabb vannak a spektrum ismert értékei (ezért kell a rámpa szűrés is). Legegyszerűbb megoldás az alul-áteresztés: Az alul-áteresztés és a visszavetítés sorrendje tetszőleges Erőforrásigény miatt érdemes a rámpa szűrőt megszűrni: P h h P h h Ramp Lowpass Ramp Lowpass

Szűrt visszavetítés zajérzékenysége Rámpa szűrő módosítottjaival szűrünk: Szűrők átviteli függvényének abszolút értéke: CT MTF-je a szűrők függvényében:

Szűrt visszavetítés működése Demo videó az FBP rekonstrukciójáról: https://www.youtube.com/watch?v=ddzelnh9aac A szinogramban oszlop-folytonosan helyezkednek az 1D projekciók. A videón jól követhető a limitált szögtartomány által okozott artifakt: Magas frekvenciás komponensek (pl. fantom széle) kis szögtartományból is jól rekonstruálódik. Alacsony frekvenciás komponensek viszont erősen szétmosódottak (jellegzetesen V alakban).

FBP Fan-beam geometria esetén Eddig párhuzamosak voltak a vetítősugarak: Gyakorlatban egy ilyen CT nem realizálható Fan-beam vetítősugaras helikális CT:

Fan-beam projekciók Virtuális projekciók FBP Fan-beam geometria esetén Alapötlet: a mért intenzitások átcsoportosítása párhuzamos vetítősugár alapú geometria szerint: Lényegében új, párhuzamos vetítősugár szerinti virtuális projekciókat állítunk elő a fan-beam projekciókból. Átcsoportosítás

FBP Cone-beam geometria esetén CBCT rendszerek - Cone-Beam geometria: Flat-panel detektort használ, a sugarak kúpszerűen (innen az elnevezés) vetülnek a detektorra:

Cone-beam geometria szerinti vetületek FBP rekonstukciója - FDK Feldkamp, Davis, Kress CBCT-s algoritmusa: Fan-beam rekonstrukciók sorozatára vezet vissza Párhuzamos sugarakként kezeli a divergáló sugarakat Ideális rekonstrukció esetén is Cone-beam artifakt

Projekciók keletkezésének általános 3D modellje Általános modellje a (röntgen) képalkotásnak: g x, y h x, y;, f, d dd x, y,, 0 Mérésekkel rendelkezünk: g x, y Teoretikusan ismerjük a rendszer PSF-jét: Beer- Lambert törvény szerint, ami nem modellezi a Compton szóródást és a foto-elektronikus kölcsönhatás során keletkező sugarakat sem. Rekonstrukció célja f,, meghatározása Feltétel, hogy több projekciót ismerjünk, egyébként erősen alul-határozott a probléma (egy voxel csak egy fotodiódára vetül tehát csak egy mérés eredményét befolyásolja).

Projekciók keletkezésének általános 3D modellje Megfigyelési modell diszkretizáltja g H f η : g tartalmazza az összes vetítősugár fotodiódákon mért intenzitások negatív logaritmáltját (tehát minden projekció minden pixeléhez tartozó intenzitását tartalmazó vektor). H a vetítő mátrix,, : i-edik vetítősugár a j-edik voxelben milyen hosszú utat tesz meg (ritka mtx.). η H i j az additív zaj nem modellezett hatások determinálják Lényegében ez is inverz probléma: Ugyanúgy jelentős a zajérzékenység, mint 2D esetben Ellentétben nagyságrendekkel több változó (akár 1E7)

Algebrai rekonstrukciós technika (Gordon ART) Kaczmarz iterációval történik megoldása: Rekonstrukciónál a f H g megoldás lenne az ideális, de: Túl nagy H mérete a ma elérhető számítási teljesítményhez Ráadásul H nagyon ritka, melyet általános algebrai módszerek nem képesek hatékonyan kihasználni Eljárás alapötlete: g Hf lényegében N db (vetítősugarak száma), M dimenziós hipersík egyenlete Ha létezik egzakt inverz, akkor a hipersíkok az M dimenziós tér ugyanazon pontjában metszik egymást. Ha túlhatározott, akkor nincs metszéspont, ha alulhatározott akkor az M dimenziós teret egy résztartományra szűkítik. g H f

Algebrai rekonstrukciós technika (Gordon ART) Az eljárás k+1. iterációban merőlegesen vetíti az aktuális -et g H f hipersíkra ( ): f i k(mod N) f a -re merőleges azon síkon helyezkedik el, mely távolsága az origótól Tehát i i,: H i,: 1 g f f H H i i,: k k T i,: k g H f H T i i,: i,: H f k g,: H i i i,: Hi,: 1 2, a merőleges vetítés után teljesül, amiből kifejezve: T k k k i,: i,: i T f f H f g H T H, behelyettesítve: H i,: i,:

Algebrai rekonstrukciós technika (Gordon ART) k 1 k k i,: interpretációja: k k H f g a rögzített projekciók és az aktuális ( f ) rekonstrukció modell szerinti vetületének a különbsége (vetületi hiba) T T H H H : a vetületi hibát vetíti vissza Eljárás tulajdonságai: Sok, könnyen számolható iteráció, melyek nem párhuzamosíthatóak Konvergál, ha megfigyeléseink konzisztensek, ellentétben limit hurokba szorul, mely belsejében helyezkedik el az f H g. Hátránya, hogy nem kezeli a projekciók zaját, ezért túlilleszkedésre hajlamos (lényegében egy ML becslés Gauss eloszlású likelihood-dal) Szükség van egy f f H f g i,: i,: i,: H H i,: i T f 0 -ra: gyakran FBP / BP eredménye T H i,: i,:

Kaczmarz iteráció példa N=2, M=2 esete: Ha a két merőleges hipersík egymásra merőleges, akkor két iteráció alatt megvan a metszéspont Ha a hipersíkok párhuzamosak, akkor az iteráció nem áll le (limit hurokba kerül) Minél nagyobb a két egyenes által bezárt szög, annál gyorsabb a konvergencia.

Limit hurok viselkedés Gordon ART inkonzisztens projekciók esetén limit hurokba lép (mely megfelelő esetén stabil): Stabil limit hurkok viselkedés: a rendszer állapotváltozója hurok trajektóriába ragad

Algebrai rekonstrukciós technika Egyidejű ART (SART): (Simultaneous ART) Hibaképzés nem vetítősugaranként, hanem projekciónként: 1 f f g H f k k k S i js j j,: : i-edik projekció pixeleit előállító vetítősugarak halmaza Limit hurok viselkedés itt is jellemző: Hurok területe viszont jelentősen kisebb Jól párhuzamosítható: i Azonos projekcióhoz tartozó vetítősugarak menti levetítés és visszavetítés egymástól független Zajra túlilleszkedés tulajdonsága változatlanul megmaradt H H T j,: H j,: j,: T

Algebrai rekonstrukciós technika (Simultaneous Iterative Reconstructive Technique) Egyidejű Iteratív Rekonstrukciós eljárás: Összes projekció, összes pixele szerint egyszerre képez hibát: 1 f f g H f k k k j j,: Limit hurok viselkedés megmaradt: Viszont az SART-nél is kisebb hurokterülettel Jól párhuzamosítható, de: j Egyszerre csak egy projekció le / visszavetítése nem módosítja többször u.a. voxelt (egyébként versenyhelyzet). Gyakorlatban lényegesen lassabban konvergál a másik két ART-nél) Létezik olyan változat, mely kezeli a polikróm energia spektrum miatt kialakuló sugárkeményedés artifaktumot. H H T j,: H j,: j,: T

Algebrai rekonstrukciós technika (Multiplikatív ART) Eddig Additív ART-ket néztünk: Kezdeti iterációk során lassan konvergálnak Pozitivitási kényszert nem lehet kikényszeríteni Multiplikatív ART-k: Hibát multiplikatív módon származtatják k1 k j pl.: f f 1 1, A hibát 1g H f j j,: H k g j,: értéke méri Kezdeti iterációk hatékonyabbak, de gyakran divergál f k 0

Pozitron emissziós tomográfia alapelve Szervezetbe pozitron kibocsátására képes radioaktív izotópot tartalmazó anyagot visznek cukoroldatban. Sejtek tápanyagfelvétele miatt nagyobb energiaigényű (pl. gyulladt / daganatos) sejtek helyén több pozitron emisszió. Pozitron elektronnal ütközik: Két db, egymással ellentétes irányú foton emittálódik. Detektor ezeknek a beütését méri.

Pozitron emissziós tomográfia rekonstrukciója Line of Response : ugyanazon bomló izotóp által kibocsátott γ fotonok beütési helyét összekötő szakasz Érdemes szem előtt tartani, hogy előre nem határozható meg, hogy egy-egy foton milyen irányba fog haladni Elegendően sok kisugárzás esetén viszont hasonlóan viselkedik, mint akármilyen sugárforrás (Poisson folyamat).

Pozitron emissziós tomográfia projekciók zajának értelmezése Sokszor téves LOR-t mérünk: Compton szóródás miatt a térfogaton belül megváltoztatja irányát a γ foton. Két, hozzávetőlegesen egy időben történő bomlás is fals látszólagos LOR-t eredményez.

Pozitron emissziós tomográfia rekonstrukciója Rekonstrukció során a LOR-ok interpretálhatóak vetítősugaraknak is (intenzitás meg az adott LOR menti gyakorisága a γ beütéseknek). Elegendően sok beütés szükséges az eloszlás becsléséhez: Egy scan kb. 20 perc Nagyságrenddel rosszabb SNR, mint CT esetén

ML-EM rekonstrukció (Emissziós tomográfiai értelmezés) EM eljárások alapelve: Vannak megfigyelt adataink (méréseink), esetünkben a PET LOR-ok mentén érzékelt gamma beütési szám ( yd) Vannak becsülni kívánt adataink ( xb), jelenleg ez a vizsgált szövet pozitron emissziójának a gyakorisága Létezik olyan v.v., mely ha ismert lenne leegyszerűsödne az egész feladat: a PET esetén pb d : annak a valószínűsége, hogy a d LOR mentén beütő gamma részecskét a b képlet emittálta. Megoldás iteratív, iterációnként két lépés: pb d Expectation lépés: frissítése Maximization lépés: xb ML becslése

ML-EM rekonstrukció (Emissziós tomográfiai értelmezés) E lépés formálisan - Bayes tétel alkalmazása: p k 1 b d b ' k k ' ' p d b x b p d b x b p b d : annak a valószínűsége, hogy a d LOR mentén érzékelt fotonok a b pozíciójú képletből származnak. p d b : annak a valószínűsége, hogy a b pozíciójú képlet által emittált fotonok a d LOR mentén ütnek be a detektorba. Ennek a tagnak a meghatározása előzetesen történik (nem a becslés feladata). Általában Monte-Carlo szimulációkkal becslik, pontos meghatározása fontos.

ML-EM rekonstrukció (Emissziós tomográfiai értelmezés) M lépés célja a sűrűségbecslés frissítése: k1 k1 arg max d x b p y x b x k 1 Elvégezve p b d behelyettesítését: k1 x b x b b ' k 1 y d p b d Eljárás előnye, hogy expliciten modellezi a zajt d p d b p d b 1 k ' ' p d b y d k d x b p d b d

ML-EM rekonstrukció (Emissziós tomográfiai értelmezés) Módosító összefüggés interpretációja: k1 x b x b b ' p d b 1 k ' ' p d b y d k d x b p d b k x b' p d b ' : aktuális rekonstrukció alapján becsült b ' LOR beütések k y d x b ' p d b ' : d LOR menti beütések b ' becslésének a hibája y d p d b 1 : hiba visszavetítése k d x b ' p d b ' p d b b ' d d

ML-EM és FBP öszehasonlítása (Emissziós tomográfia PET) Kis beütésszám miatt alacsony effektív felbontás Ráadásul jelentős nem Gauss-i zaj FBP rekonstrukció ML-EM rekonstrukció

PET/CT modalitás PET funkcionális képet állít elő: Lokalizálhatóak a nagy energiaigényű szövetek Cserébe erősen zajos, rossz minőségű rekonstrukciók Megfelelő zajmodell nélkül lehetetlen értelmezhető rekonstrukciót előállítatni vele CT rekonstrukciók - morfológiai információ: Kisméretű (korai stádiumú, ezért jó hatásfokkal kezelhető) tumorok nehezen detektálhatóak Cserébe kevésbé zajos, felbontását tekintve részletgazdagabb felvételek

PET/CT modalitás Rekonstrukció lényegében a PET, illetve a CT rekonstrukciók regisztrálását jelenti Balról jobbra: CT, PET, regisztrátum

Modell alapú rekonstrukciós eljárások (Röntgen alapú képalkotás) Cél a pácienst érő sugárterhelés minimalizálása: Viszont kisebb dózis zajosabb projekciókat eredményez Limitált szögtartomány problémája jelentősen alulhatározottá teszi a z inverz problémát ( g H f ) MAP becslés alkalmazása szükséges: Emlékeztetőül f g g f f f arg max P arg max P P Likelihood log P g f f bünteti az eltérést f log P f f apriori ismeretek alapján regularizál Prior f

Modell alapú rekonstrukciós eljárások (Röntgen alapú képalkotás) Likelihood tag megválasztása: PET-nél Poisson modellt alkalmazzuk (ritka esemény törvény) Röntgen esetén negatív logaritmálást követően Gauss modell Likelihood T -1 f 12 g H f Σ g H f 2 Σ Σ i, i i gyakran diagonális, ekkor : Lényegében az i-edik vetítősugár NSR-jének a négyzete Megfelelő megválasztásával a foton éhezés hatása mérsékelhető Kvadratikus függvény, minimalizációja analitikus

Modell alapú rekonstrukciós eljárások (Röntgen alapú képalkotás) Regularizációs tag megválasztása: Logikusnak tűnik a gradiens energiáját büntetni: T T f f S f, S D D, ahol D a deriválás mtx.-ja Prior Belátható, hogy ekvivalens egy regularizáció nélküli rekonstrukció alul-áteresztettjével. Tehát ez a regularizáció csökkenti az effektív felbontást, a rekonstruált szeletekre merőleges irányban növeli az átmosódást, ami egyáltalán nem kívánatos. Inkább él őrző regularizációk alkalmazása javallott pl. Teljes Variancia minimalizáció, Huber büntetőfüggvény

Teljes variancia minimalizáció Rekonstrukció, mint optimalizálási feladat: f arg min g H f D f f D diszkrét differencia / wavelet transzformációk mátrxia Lényegi változás, hogy a regularizáció L1 norma szerinti Könnyebben számítható 2 2 1 2 2 f, z g H f z z Df 2 1 2 változókkal: Alternálva minimalizáljuk -et és z-t iterációnként: z Df f n1 n 2 n f arg min f, z arg min g H f z Df f f 2 2 z arg min f, z arg min z z Df n 1 n 1 n 1 z z 1 2 2 2

Teljes variancia minimalizáció Az iterációk első lépése kicsit átalakítva: min. f T n T T T T g z H D f Formálisan visszajutottunk az alapproblémához, csak most már biztosan túl-határozott (additív ART probléma) Minimalizálása erőforrásigény miatt sokszor SART-vel Iterációk második lépésének optimuma egy lépésben, analitikusan meghatározható: arg min z z Df Az úgynevezett lágy küszöb operátor használatával A minimalizálás voxelenként történik z T 2 2 n1 1 2 2

Teljes variancia minimalizáció Jobb SNR az ML-EM és az FBP-hez képest: FBP-nél kevésbé zajos, de hasonló kontrasztú kép ML-EM-nél jelentősen jobb kontraszt FBP ML-EM TV-ART

Huber büntetőfüggvény Huber büntetőfüggvénnyel regularizálunk: Prior f LHuber D f x L Huber 2 x 2 x 2 2 2 x 2 x 2 2 Pet fantom MAP L2 prior MAP Huber prior

Kvadratikus és abszolútérték hiba/büntetőfüggvény Két hibafüggvény jelentősen eltérő eloszlást kényszerít ki: Abszolútérték büntetőfüggvény Kvadratikus büntetőfüggvény

Lineáris tomoszintézis Speciális CBCT változatnak tekinthető: Detektor és a sugárforrás egymással és a flat-panel detektor oszlopaival párhuzamosan mozog. Projekciók limitált szögtartományból (±10-30 ) Irányfüggő felbontás / képminőség: Detektorral párhuzamos szeletek felbontása megegyezik a detektor felbontásával Detektorra merőleges irányban nagyon rossz felbontás : limitált szögtartomány ára

Shift And Add (Lineáris tomoszintézis esetén) A térfogat 0 vastagságú szeleteinek vetületei a felvételi geometria és a szelet magasságának függvényében eltolódnak. SAA rekonstrukciója egy adott szeletnek: 1. Projekciók eltolása úgy, hogy a rekonstruálni kívánt sík vetülete minden projekción azonos legyen 2. Eltolt projekciók összegzése Mind az összegzés, mind az eltolás LTI művelet: Soros kaszkádjuk, tehát a rekonstrukció egy MIMO LTI rendszer (bemenetek a projekciók, kimenetek a szeletek) Létezik PSF/MTF-je, mellyel analitikusan minősíthető

Shift And Add (Lineáris tomoszintézis esetén) SAA szeleteken fókuszba kerülnek a rekonstruálni kívánt sík képleteinek vetületei De jelentős átmosódás marad a térfogat többi síkjáról Piros ellipszis: szelten belüli képlet vetülete Kék ellipszis: szeleten kívüli képletek bemosódása

Mátrix Inverziós Tomoszintézis Alapötletet ugyanaz a megfigyelés adja, mint ami az SAA algoritmusét: g 1 :, i n... 1 2 :,i 11, :,i 1, 2 :,i 1,n f t f t f t n... 2 1 2 :,i :,i 2, 1 :,i 2, 2 :,i 2,n g f t f t f t n... m 1 2 t f f t :,i :,i m, 1 :,i m, 2 :,i m,n g f t g j :,i j-edik projekció i-edik oszlopának intenzitásaiból képzett vektor

Mátrix Inverziós Tomoszintézis Alapötletet ugyanaz a megfigyelés adja, mint ami az SAA algoritmusét: 1 n 1 2 f... :,i :,i 11, :,i 1, 2 :,i 1,n g t f t f t g n... 2 1 2 f t f t f t :,i :,i 2, 1 :,i 2, 2 :,i 2,n 1 n... 2 m 1 2 :,i :,i m, :,i m, :,i m,n g f t f t f t f j :,i j-edik modellezett és rekonstruálni kívánt 0 vastagságú szelet projekciójának i-edik oszlopának intenzitásaiból képzett vektor

Mátrix Inverziós Tomoszintézis Alapötletet ugyanaz a megfigyelés adja, mint ami az SAA algoritmusét: 11 n 1 1 2 t... :,i :,i, :,i 1, 2 :,i 1,n g f f t f t n... 2 1 2 :,i :,i 2, 1 :,i 2, 2 :,i 2,n g f t f t f t 1 2 n... m :,i :,i m, 1 :,i m, 2 :,i m,n g f t f t f t t j,i i-edik rekonstruálandó szelet vetületének j-edik projekcióbeli impulzusválaszát leíró vektor, mivel csak eltolást modellez, ezért egy dirac-delta diszkretizáltja.

Mátrix Inverziós Tomoszintézis Jelentősen egyszerűsödik a feladat, ha a vektor egyenletrendszert frekvenciatérben vizsgáljuk: g T f j j 1 2 j j f T g m :, :, :, T 1 2 n :, :, :, g j FT g j FT g FT j g j f j FT f j FT f FT j f j T FT t j,i Összegezve a MITS alapötlete, hogy lineáris tomo esetén a frekvenciatérbeli felírás jelentősen kompaktabb az inverz probléma képtérbeli felírásánál. T

Mátrix Inverziós Tomoszintézis gyakorlati megvalósítása Diszkretizálás és a DFT okozta problémák: Mintavételezés: ti, j mintavételezése az egész rendszer viselkedését jelentősen befolyásolja: Energiája nem változhat a mintavételezés hatására, ellentétben jelentősen torzítunk Figyelembe véve a frekvenciatérbeli műveletvégzést, a mintavételezés frekvenciatartományban történik (ideális - sinc interpolációval ekvivalens képtérben). DFT által okozott spektrumszivárgás is jelentős probléma: Klasszikus megoldás, az ablakozás natívan nem adekvát.

Mátrix Inverziós Tomoszintézis spektrumszivárgás Felvételi elrendezés miatt oszloponként történik az inverz szűrés, elegendő a függőleges cirkularitás: Az projekciók extrapolációja nem úszható meg, ellenkező esetben a csavarodás artefekt történik. Extrapoláció szükséges mértéke t tartóinak a maximuma, j,i ezzel elérhető, hogy csak extrapolált terület csavarodhat be. Probléma projekciók extrapolálásával kezelhető: Extrapoláció olyan képterülettel terjeszti ki a projekciókat, mely a legsimább átmenetet és cirkuláris projekciót generál.

Mátrix Inverziós Tomoszintézis spektrumszivárgás Extrapoláció nélkül Extrapoláció alkalmazásával

Mátrix Inverziós Tomoszintézis Dekonvolúció numerikus problémái T zajérzékenysége jelentős problémaforrás cond T max min Kondíciós szám származtatása: 1 1 1 T e T b T e e 2 2 2 2 cond T max, 1 eb e b T b b 2 2 2 2 Legyen T U Σ V SVD felbontás, ekkor T V Σ U Mivel U és V oszlopvektorai ortonormált bázisok, ezért 1 max T e e és 1 min T b b max e 2 2 b 2 2 min Zajcsökkentő regularizáció célja cond T minimalizálása

Mátrix Inverziós Tomoszintézis Dekonvolúció zajérzékenysége T előállítása csonkolt SVD-vel: 1 i i T V Σ U, ahol Σ ii, 0 i Kísértetiesen hasonlít a csonkolt dekonvolúcióra: Joggal, a különbség annyi, hogy ott a DFT mátrixával diagonalizálunk, míg SVD esetén a bal, illetve jobboldali sajátérték mtx.-okkal diagonalizálunk T regularizált Moore- Penrose pszeudoinverze a Wiener dekonvolúció általánosítottja

Mátrix Inverziós Tomoszintézis Kondíció lineáris tomoszintézis esetén Korlátolt szögtartomány miatt alacsony frekvencia esetén a projekciókon kisebb a változás, aminek következménye a nagyobb zajérzékenység.

Mátrix inverziós tomoszintézis Csonkolt SVD hatása Jól látható, hogy a magasfrekvenciás tartomány zaja dominál a direkt dekonvolúciónál, míg a Csonkolt SVD jelentősen javít a helyzeten.

3D Röntgen tomográfia rekonstrukciós eljárásainak minősítése Rekonstrukció metrikái: Szeleten belüli effektív felbontása (emlékeztetőül ) Irányfüggő átviteli függvény közelíthető az élpár fantom / él fantom rekonstrukciójából. Szeletek effektív vastagsága: Mind CT, mind Tomo esetén a rekonstruált szeletekre merőleges irány menti kiterjedése a szeleteknek. Felhasználási területfüggő optimális értéke. Minél kisebb, annál több szelet kell, hogy minden képlet láthatóvá váljon (legalább egy szeleten). Mérése tipikusan ferde fémlemezzel / fémhuzallal. bw h

CT Szeletvastagság Slice Sensitivity Profile mérése a lemezek rekonstrukciójára merőlegesen: szeletvastagság FWHM elvvel becsülhető

3D Röntgen tomográfia rekonstrukció Modulációs Átviteli Függvénye Ferde huzal fantommal (elvben) mérhető: Ha az eljárás az X-Y síkokat rekonstruálja, akkor a huzal ne legyen párhuzamos a Z tengellyel. Lineáris tomo MITS rekonstrukció MTF-e