A krónikus myeloid leukémia molekuláris genetikai követésére szolgáló, BCR-ABL mennyiségi PCR magyarországi standardizációja



Hasonló dokumentumok
A krónikus myeloid leukémia kezelésének finanszírozási protokollja (eljárásrend)

A krónikus myeloid leukémia kezelésének finanszírozási protokollja

A krónikus myeloid leukémia kezelésének finanszírozási protokollja (eljárásrend)

Mangalica specifikus DNS alapú módszer kifejlesztés és validálása a MANGFOOD projekt keretében

A krónikus myeloid leukémia kezelésének finanszírozási protokollja

Lymphoma sejtvonalak és gyerekkori leukémia (ALL) sejtek mikro RNS (mir) profiljának vizsgálata

A krónikus myeloid leukémia kezelésének finanszírozási protokollja

IQ TM 200 vizeletüledék vizsgáló automata

Indikátorok alkalmazása a labordiagnosztikai eljárások minőségbiztosításában

Kappelmayer János. Malignus hematológiai megbetegedések molekuláris háttere. MOLSZE IX. Nagygyűlése. Bük, 2005 szeptember

KEZELÉSMENTES REMISSZIÓ CML-BEN

Posztanalitikai folyamatok az orvosi laboratóriumban, az eredményközlés felelőssége

In Situ Hibridizáció a pathologiai diagnosztikában és ami mögötte van.

RÉSZLETEZŐ OKIRAT (1) a NAH /2017 nyilvántartási számú akkreditált státuszhoz

A kvantitatív PCR alkalmazhatósága a fertőző bronchitis vakcinák hatékonysági vizsgálatában. Derzsy Napok, Sárvár, 2011 Június 2-3.

ORVOSI LABORATÓRIUMI DIAGNOSZTIKA

2014. május 23-án (PÉNTEK) 8:30-18:15-ig.

Prognosztikai vizsgálatok krónikus myeloid leukémiában. Dr. Kajtár Béla

Genomikai Medicina és Ritka Betegségek Intézete Semmelweis Egyetem

BD Vacutainer Molekuláris Diagnosztikai termékei

együtt lét lap a CML-GIST Betegek Egyesületének hírlevele, 2015/1 A CML genetikai vizsgálatának aktuális kérdései dr. Andrikovics Hajnalka

Minıségellenırzés a laboratóriumi akkreditáció szemszögébıl

TUDNIVALÓK A CML DIAGNÓZISÁRÓL

MH TUDOMÁNYOS STRATÉGAI KUTATÁS-FEJLESZTÉS. Tudományos Kutató Intézet Int. vez.: 3 fő

Engedélyszám: /2011-EAHUF Verziószám: Humángenetikai vizsgálatok követelménymodul szóbeli vizsgafeladatai

PLASMA HUMANUM COAGMENTATUM CONDITUMQUE AD EXSTIGUENDUM VIRUM. Humán plazma, kevert, vírus-inaktiválás céljából kezelt

CML: A KEZELÉS MELLÉKHATÁSAI

Molekuláris biológiai eljárások alkalmazása a GMO analitikában és az élelmiszerbiztonság területén

Baán Julianna, Barta Katalin, Somogyi Józsefné, Tóth Erzsébet, Bognár Balázs, Laczik Lívia, Kerezsi Katalin

Norvég Finanszírozási Mechanizmus által támogatott projekt HU-0115/NA/2008-3/ÖP-9 ÚJ TERÁPIÁS CÉLPONTOK AZONOSÍTÁSA GENOMIKAI MÓDSZEREKKEL

mintasepcifikus mikrokapilláris elektroforézis Lab-on-Chip elektroforézis / elektrokinetikus elven DNS, RNS, mirns 12, fehérje 10, sejtes minta 6

Klinikai Genomika Központ Biobankok

Új temékek az UD- GenoMed Kft. kínálatában!

FELHASZNÁLÓI KÉZIKÖNYV

Haematológiai automatizáció: tapasztalataink az új Sysmex XT-2000 automatával az elmúlt 5 hónap során. Nagy Nóra Gróf Esterházy Kórház Laboratórium

Nemzeti Akkreditáló Testület. BŐVÍTETT RÉSZLETEZŐ OKIRAT (1) a NAT /2012 nyilvántartási számú akkreditált státuszhoz

Patogén mikroorganizmusok vizsgálata molekuláris biológiai módszerekkel

POSZTGENOMIKAI SZEMLÉLETVÁLTÁS ELSİ ELEMEINEK MEGJELENÉSE A MEDICINÁBAN

Molekuláris biológiai diagnosztika alkalmazása

A VIZELET CYTOLÓGIAI (TPS) NOMENKLATÚRA A PÁRIZSI RENDSZER TÜKRÉBEN. Horváth Ilona dr.

Szinoviális szarkómák patogenezisében szerepet játszó szignálutak jellemzése szöveti multiblokk technika alkalmazásával

Az allergia molekuláris etiopatogenezise

SALMONELLA SSP. GYORS, MOLEKULÁRIS BIOLÓGIAI MÓDSZEREKKEL TÖRTÉNŐ DETEKTÁLÁSA

Astrid research INC. Introducing

Her2 fehérje overexpresszió gyomorrákokban: Hazai tapasztalatok

Laboratóriumi riumi diagnosztikai folyamatok pre-és posztanalitikai hibalehetıségei

Prenatalis diagnosztika lehetőségei mikor, hogyan, miért? Dr. Almássy Zsuzsanna Heim Pál Kórház, Budapest Toxikológia és Anyagcsere Osztály

Önállóan gazdálkodó közszolgáltató költségvetési szerv Ajánlatkérő fő tevényeségi köre:

A születéskor gyűjthető. őssejtekről, felhasználási. lehetőségükről, valamint a KRIO Intézet. szolgáltatásairól

Krónikus myeloid leukémia diagnosztikájának és kezelésének finanszírozási protokollja

Kvantitatív immunhisztokémia a patológiában

szerzett tapasztalataink

JAVÍTÁSI-ÉRTÉKELÉSI ÚTMUTATÓ. Orvosi laboratóriumi technikai asszisztens szakképesítés Műszer és méréstechnika modul. 1.

ADATBÁNYÁSZAT I. ÉS OMICS

11. Március 14. Klinikai enzimológia Szarka András 12. Március 21. Preanalitika, klinikai kémia, vizeletvizsgálat gyakorlat

Dózis Gyógyszerforma Alkalmazási mód Tartalom (koncentráció) megnevezés. engedély jogosultja

Klinikai kémia. Laboratóriumi diagnosztika. Szerkesztette: Szarka András. Írta: Budapesti Műszaki és Gazdaságtudományi Egyetem Semmelweis Egyetem

A pre-analitika szerepe a patológiai minták. Dr. Lotz Gábor Semmelweis Egyetem, II. sz. Patológiai Intézet

15-25C -20 fok fok. 2-8 C fok -20 fok. Nem tárolható. Nem tárolható 1 hónap Vérvétel után a csövet azonnal centrifugálni, szeparálni és -

III./18.3. Krónikus myeloid leukaemia

Molekuláris biológiai technikák

KERINGŐ EXTRACELLULÁRIS VEZIKULÁK ÁLTAL INDUKÁLT GÉNEXPRESSZIÓS MINTÁZAT VIZSGÁLATA TROPHOBLAST SEJTVONALBAN

Adszorbeálható szerves halogén vegyületek kimutatása környezeti mintákból

A preventív vakcináció lényege :

IV. melléklet. Tudományos következtetések

MOTORHAJTÓANYAG ADALÉKOK KÖRNYEZETI HATÁSAI ÉS MEGHATÁROZÁSI MÓDSZEREI

GYORSTESZTEK ALKALMAZÁSA A

A keringı tumor markerek klinikai alkalmazásának aktuális kérdései és irányelvei

Humán genom variációk single nucleotide polymorphism (SNP)

Mérési hibák

Szövettani minőségbiztosítás követelménymodul szóbeli vizsgafeladatai

Molekuláris genetikai vizsgáló. módszerek az immundefektusok. diagnosztikájában

A harkányi gyógyvízzel végzett vizsgálataink eredményei psoriasisban között. Dr. Hortobágyi Judit

A laboratórium feladata. Interferáló tényezők

2016 év eleji ajánlatok. Speciális áraink 2016 május 31-ig érvényesek!

Továbbadása, sokszorosítása írásos engedélyhez kötött.

Real time PCR módszerrel végzett patogén vizsgálatok tapasztalati

A prokalcitonin prognosztikai értéke

Quality Control a napi gyakorlatban

Esettanulmányok. Dr. Toldi József OVSZ Szegedi Regionális Vérellátó Központ

Biotechnológia, egészség- és környezetvédelem. Műegyetem - Kutatóegyetem Biotechnológia, egészség-és környezetvédelem

A betegbiztonság növelése humán diagnosztikai laboratóriumban

Készítette: Ellenőrizte és egyeztette:

96/2009. (IX. 24.) számú hat. A SEMMELWEIS EGYETEM BIOBANK HÁLÓZATÁNAK MŐKÖDÉSI RENDJE IDEIGLENES SZABÁLYOZÁS

Szakmai zárójelentés

Dr. Máthéné Dr. Szigeti Zsuzsanna és munkatársai

LÉGZÉSFUNKCIÓS VIZSGÁLATOK. Pulmonológiai Klinika

Célzott terápiás diagnosztika Semmelweis Egyetem I.sz. Pathologiai és Kísérleti Rákkutató Intézet, Budapest Tamási Anna, Dr.

TANULSÁGOS KLINIKOPATOLÓGIAI LYMPHOMÁS ESETEK

URISED. Egy forradalmian új méréstechnika a vizeletüledék ledék automatikus vizsgálatára. Bayer Gábor. 77 Elektronika Kft. Budapest

Adszorbeálható szerves halogén vegyületek koncentráció változásának vizsgálata kommunális szennyvizek eltérő módszerekkel történő fertőtlenítése során

Mit tud a tüdő-citológia nyújtani a klinikus igényeinek?

A mikrobiológiai diagnosztika, a ribotipizálás és a binary toxin vizsgálat jelentősége a CDI hazai epidemiológiai jellemzésében

cobas TaqScreen West Nile Virus Test a cobas s 201 rendszeren történő használatra

Tüdő adenocarcinomásbetegek agyi áttéteiben jelenlévő immunsejtek, valamint a PD-L1 és PD-1 fehérjék túlélésre gyakorolt hatása

Az egészségügyi miniszter 8013/2007. (EüK. 19.) EüM. tájékoztatója

mtorc1 and C2 komplexhez köthető aktivitás különbségek és ennek jelentősége humán lymphomákbanés leukémiákban

DR. HAJNAL KLÁRA / DR. NAHM KRISZTINA KÖZPONTI RÖNTGEN DIAGNOSZTIKA Uzsoki utcai kórház. Emlő MR vizsgálatok korai eredményei kórházunkban

akkreditálása Dr. Dán D n Anikó Központi Laboratórium rium

Budapest, június 4.

Átírás:

A krónikus myeloid leukémia molekuláris genetikai követésére szolgáló, BCR-ABL mennyiségi PCR magyarországi standardizációja Andrikovics Hajnalka 1, Bors András 1, Meggyesi Nóra 1, Bödör Csaba 2, Rajnai Hajnalka 2, Alpár Donát 3, Kajtár Béla 3, László Zsuzsa 4, Antal-Szalmás Péter 5, Matolcsy András 2 és Tordai Attila 1 1 OVSZ, Molekuláris Diagnosztikai Laboratórium 2 SE I. Pathológiai Intézet 3 PTE, Patológiai Intézet 4 SZTE, Genetikai Intézet 5 DEOEC, KBMPI

Krónikus myeloid leukémia (CML) Definíció: a vérképző rendszer rosszindulatú megbetegedése, amely érettebb fehérvérsejtek kóros felszaporodásával jár. Genetikai háttér: t(9;22)(q34;q11)

CML patogenezise és új terápiás megközelítése Célzott BCR-ABL tirozin kináz inhibitorok Szabályozatlan és kóros jelátviteli folyamatok elindítása Sejtproliferáció

CML követésében alkalmazott genetikai módszerek Karyotipizálás 0,0001 FISH BCR-ABL (%) 100 10 1 0,1 0,01 Philadelphia-pozitivitás, Citogenetikai módszerekm vizsgálati tartománya Molekuláris módszerekm vizsgálati tartománya Major molekuláris válasz (MMR) = BCR-ABL IS =0,1% 10 12 10 11 10 10 10 9 10 8 A leukémiás sejtek száma 0,001 10 7 Minőségi BCR-ABL PCR Teljes molekuláris válasz 10 6 Mennyiségi BCR-ABL PCR

IRIS vizsgálat (2000) (International Randomized Study of Interferon and STI571) EFS: 18-Month Landmark Analysis % Without Event 100 90 80 70 60 50 40 30 20 10 0 BCR-ABL % (IS) 0.1% <=0.01% (n = 164) >0.1-1% (n = 47) - <0% Ph pozitivitás >1-10% (n = 25) 0-35% Ph pozitivitás >10% (n = 13) - >35% Ph pozitivitás 95% 86% 62% 58% 0 12 24 36 48 60 72 84 Months Since Start of Treatment P =.01

BCR-ABL mennyiségi PCR (RQ-PCR) standardizáció Számos eltérő metodika Nehezen standardizálható módszer A módszer m CV% magas Kimutathatósági alsó határ r laboronként nt változó Különböző laborok eredményei nem hasonlíthatóak ak össze. Kezelőorvosok és s betegek könnyen k összezavarhatóak ak ( PCR-itis ). Szuboptimális kezelés Ezt kiküszöbölendő: BCR-ABL molekuláris monitorozás s standardizáció

BCR-ABL RQ-PCR egyszerűsített folyamata FOLYAMAT VARIÁCIÓK Mintavétel 1. Minta típusa: perifériás vér, csontvelő 2. Alvadásgátlás (EDTA, citrát) 3. Szállítási idő (<6h), ±RNS stabilizáló oldat Fehérvérsejt szeparálás 1. Vvs lízis 2. Ficoll- nem ajánlott RNS izolálás 1. Trizol (RNáz védelem GTvel, fenol-kloroform extrakció) 2. Qiagen oszlopos extrakció 3. MagnaPure Reverz transzkripció 1. Reverz transzkriptáz (MMLV, Supercript, AMV.) 2. Primer (random hexa/oligodt/szekvencia spec.) Real-time kvantitatív PCR (RQ-PCR) 1. RT-platform: LC, AB, RG 2. Kontroll gén: ABL, BCR, GUSB, B2M, G6PD 3. Standard görbe: nincs-dct, plazmid, RNS, cdns

BCR-ABL RQ-PCR standardizáció hogyan? A) Minden preanalitikai és analitikai lépés egységes protokoll szerinti megvalósítása (RNS izolálás, reverz transzkripció, PCR protokoll, kontroll gén, egységes plazmid kontroll, kiértékelés) A korábban beállított módszerek cseréjét teszi szükségessé. B) Nagy mennyiségben előállítható nemzetközi referencia anyagok előállításával munkaigényes mintacserék nélkül is megállapítható lesz a laborokra jellemző CF. C) A kapott eredmények nemzetközi skála ( International Scale, IS) szerinti megadása. A laboratóriumi BCR-ABL eredmények átszámítása BCR-ABL IS-re egy konverziós faktor (CF) segítségével. A CF egy standardizált laboratóriummal történő mintacsere során meghatározható, így a laboratóriumokban a korábban beállított BCR-ABL RQ-PCR módszerek használhatóak.

BCR-ABL RQ-PCR standardizáció International Scale meghatározás mintacserével T. Hughes S. Branford Adelaide, Australia Ausztrál referencia laboratórium IRIS vizsgálat Európai referencia laboratórium A. Hochhaus M. Müller Mannheim, Németország Ausztrália, Új Zéland, É/D-Amerika, D-Afrika Országszintű referencia laboratóriumok 26 európai országszintű referencia labor Magyar referencia Laboratórium OVSZ Sejtkeverék lizátum küldése CML beteg perifériás vér lizátum küldése SE PTE SZTE DEOEC Kalibrálandó hazai laboratóriumok Branford, Blood 2008; 112: 3330 Müller, Leukemia, 2009: 23: 1957

Hazai laborok (2009) BCR-ABL teszt/ zt/év Referencia OVSZ SE PTE SZTE DEOEC 1200 1200 600 500 350 Europe Against Cancer standardised protocol (Gabert J et al: Leukemia. 2003;17:2318-57. Készülék LC480 AB7300 MJ Res. CHROMO4, PTC 200 BioRad i- cycler LC - t(9;22) Quant.Kit LC1.0 Kontroll géng ABL1 ABL1 ABL1 ABL1 G6PDH Standard görbe Kontrol Reverz transzk zkripció Plasmid (inhouse) patient cdna (low/high) MMLV RT (Promega) random hexamer ΔΔCt K562/patie nt cdna AB High Capacity RT Kit Plazmid (IPSOGENE) Omniscript+Sensiscr ipt QUANTITECT RT KIT (Qiagen) K562 hígítás BioRad c- DNS synthesis kit LC - t(9;22) Quant. Kit LC - t(9;22) Quant. Kit LC - t(9;22) Quant. Kit RNS S izolálás Trizol Trizol Trizol Trizol Qiagen

A `Nemzetközi Skálá -n történő BCR-ABL meghatározás menete mintacserével Résztvevő laboratóriumok: 1) Referencia laboratórium: standardizált, meghatározott CF 2) Kalibrálandó laboratórium(ok) Mintacsere: 1) A referencia laboratórium BCR-ABL-pozitív és negatív fehérvérsejt keverékek (hígítási sorát) lizátumait küldi a kalibrálandó laboratóriumoknak eredmények összevetése előzetes konverziós faktor meghatározása 2) A kalibrálandó laboratóriumok CML-ben szenvedő betegek mintáit (25-30 db) küldik a referencia laboratóriumba, amelyekből korábban már elvégezték BCR-ABLmeghatározást. eredmények összevetése végleges konverziós faktor meghatározása

Előzetes konverziós faktor meghatározása 1) Fehérvérsejt keverék lizátumok előállítása: egészséges donorok buffy coat fehérvérsejtjeiből (~5-10*10 9 WBC) + egy CML-beteg diagnózis megállapításkor levett perifériás vérminta (b3a2 poz.) keveréke 2) 12 minta laboronként, 4 hígítás (10%, 1%, 0.1%, 0.01%) 3) 10 millió WBC mintánként, 1ml Trizolban Azonos (harmonizált) munkafolyamat: RNS izolálás Trizollal Nem feltétlenül azonos munkafolyamatok: cdns szintézis, RQ- PCR, plazmid, kiértékelési mód.

Fehérvérsejt keverék lizátumok: Linearitás és szenzitivitás vizsgálata Lineáris eredmény R 2 >98% Nem lineáris eredmény R 2 <98% Formula: Log y = (meredekség (log MMR IS )) + ordináta tengely metszet CF = MMR IS / antilog y Müller, Leukemia, 2009: 23: 1957

Előzetes konverziós faktor meghatározása Sejtkeverék lizátum meghatározás eredményei (konverzió előtt) Hígítás OVSZ DEOEC PTE SE SZTE 0,01% 0,0355 0,0138 0,0105 0,0317-0,1% 0,1634 0,1078 0,0748 0,2283 0,3467 1% 1,2016 1,2033 0,7985 2,410 4,0667 10% 9,8330 13,242 7,7675 25,40 50,50 Sejtkeverék lizátum meghatározás eredményei (konverzió után) (CF) OVSZ (0,540) DEOEC (0,879) PTE (1,249) SE (0,409) SZTE (0,245) 0,01% 0,0192 0,0121 0,0131 0,0130-0,1% 0,0883 0,0948 0,0934 0,0935 0,0849 1% 0,6493 1,0575 0,9970 0,9875 0,9960 10% 5,3138 11,638 9,6980 10,410 12,3678 CV%: 55% 58% 68% 82% CV%: 23% 5% 17% 30% 100 100 Mért BCR-ABL/ABL (%) 10 DEOEC 1 PTE SE 0,1 OVSZ SZTE Mért BCR-ABL/ABL IS (%) (%) 10 1 0,1 OVSZ DEOEC PTE SE SZTE 0,01 0,01 0,01 0,10 1,00 10,00 0,01 0,10 Elméleti 1,00 hígítás 10,00 (%) Elméleti hígítás (%) Elméleti hígítás (%)

Előzetes konverziós faktor validálása 25-30 b3a2 /b2a2 pozitív minta küldése a referencia laboratóriumba (WBC Trizolban) a BCR-ABL expresszió széles tartományt öleljen fel (0.01%- 10% BCR-ABL IS, legmagasabb BCR-ABL értéket mutató beteg is legalább major citogenetikai választ mutasson). Eredmények összevetése (referencia és kalibrálandó laboratórium): i) CF felhasználása a sejtkeverék lizátumokból ii) új CF megállapítása a betegmintákból (Bland-Altman difference plots)

Konverziós faktor meghatározása Bland Altman korrelációval OVSZ- SE I Pathológia Elfogadható az egyezés a két laboratóriumi módszer között, ha 2 a 3 kritériumból teljesül: 2x (0,5-2x) eltérésen belül van a minták 50%-a OVSZ-SE I. Path 56% 3x (0,33-3x) eltérésen belül van a minták 75%-a OVSZ-SE I. Path 83% CF=0,5046 5x (0,2-5x) eltérésen belül van a minták 90%-a OVSZ-SE I. Path 94%

Európai standardizáció eredményei 57 laboratórium indított standardizációt 51/57 lineáris sejtkeverék lizátum eredmény 48/51 küldött 30 betegmintát 43/48 minta-cserénél egyeztek megfelelő mértékben az eredmények. OVSZ 2008 BCR-ABL/ABL: 2x: 78% 3x: 96% 5x: 100% Konverziós faktorok jellemzői: Branford, 2008 CF (n=36) 0,18-13,5 EAC (n=14): 0,23-1,4 (1,4x alacsonyabb -4,3x magasabb) BCR-ABL/BCR (n=11) CF: 0,42-5,27 (5,3 x alacsonyabb- 2,4x magasabb) Müller, 2009 CF (n=51) 0,103-104,7 A teljes analitikai rendszer felelős a variabilitásért. Branford: ismételt mintacsere, 16/20 labor 1,2x eltérésen belül maradt, ahol eltérések voltak:1) Random primer koncentrációt optimalizáltak EAC szerint, 2) RT-t csere 3) PCR-készülék csere: Taqman rendszerek 1,7x magasabbak LC rendszereknél. 4) referencia gén csere.

Összefoglalás A sejtkeverék lizátum hígításainak vizsgálata a körkontroll keretében a BCR-ABL RQ-PCR linearitás és szenzitivitás vizsgálatára alkalmas. A laboratórium-specifikus konverziós faktor meghatározása lehetővé teszi, hogy az adott laboratórium BCR-ABL eredményét a nemzetközi skála (International Scale, IS) alapján fejezze ki: BCR-ABL local * CF local = BCR-ABL IS A betegminta cserék alapján meghatározott konverziós faktor alkalmazása nagyobb konkordanciával járt a referencia és a kalibrálandó labor eredményei között.

4 fő projekt * CML adatbázis * Molekuláris monitorozás * Farmakológiai monitorozás * Ismeretek/tudás terjesztése.

Köszönetnyilvánítás OVSZ, Molekuláris Diagnosztikai Laboratórium Bors András Csehné Bánhidi Klára Horváth Csongorné Meggyesi Nóra Pfundt Antalné Tordai Attila SE I. Pathológiai Intézet Bödör Csaba Rajnai Hajnalka Csernus Balázs Matolcsy András PTE KK Patológiai Intézet Alpár Donát Kajtár Béla Pajor László DEOEC KBMPI Antal-Szalmás Péter Kappelmayer János SZTE, Genetikai Intézet László Zsuzsanna