MOLEKULÁRIS GENETIKA. Klinikai Biokémia 2018.
|
|
- Gyöngyi Patakiné
- 5 évvel ezelőtt
- Látták:
Átírás
1 MOLEKULÁRIS GENETIKA Klinikai Biokémia
2 Történeti áttekintés
3 Humán genom projekt gén azonosítása 1,800 betegséghez köthető gén 1000 genetikai teszt 350 biotechnológiai eszköz Egyéni tulajdonságok meghatározása; populációs haplotípus meghatározás: HapMaps (haplotype map) Etikai és törvényi szabályozás (ELSI) 3
4 Humán genom projekt Célok: a humán genom génszintű azonosítása Az emberi DNS lánc szekvencia-meghatározása adatbázisok létrehozása az adatelemzéshez szükséges eszközök fejlesztése a transzferrendszerhez kapcsolódó technológia kifejlesztése a köz és magánszféra felé etikai, jogi és társadalmi következmények (ELSI) meghatározása Mérföldkövek: 1990: A Projekt kezdete (U.S. Department of Energy and the National Institutes of Health) 2000: A teljes emberi genom nyers szekvenálása 2001: A nyers adatok elemzése megjelent nyomtatott formában 2003: HGP szekvencia analízis befejeződött, a projektet 2 évvel a tervezett befejezés előtt sikeresen lezárták
5 A jelenleg folyó kutatások: genetika - genomika Gének pontos lokalizációja és funkciómeghatározása DNS szekvencia elrendeződése Kromoszómális struktúra és elrendeződés Nemkódoló DNS szakaszok típusa, mérete, megoszlása, információtartalma és funkciója A génkifejeződés szabályozása, fehérjeszintézis és poszt transzlációs események SNP összefüggése különböző betegségekkel (egyéni érzékenység) Multigénes alacsony penetranciájú megbetegedések Összetett rendszerbiológia mikrobiális konzorciumok környezeti célokra Fejlődésgenetika,-genomika
6 Genomika Strukturális genomika Komparatív genomika Funkcionális genomika
7 A genomika vizsgálómódszerei DNS Szekvenciaanalízis: Southern blot Restrikciós térképezés Sanger-féle lánctermináció DNS microarray NGS újgenerációs szekvenálás Amplifikálás In vivo: DNS-klónozás In vitro: PCR, real time-pcr RNS Minőségi meghatározás: Elektroforézis Northern blot Dot blot in situ hibridizáció Expressziós microarray mrns, mirns, lnc-rns Amplifikálás: Egy ill. kétlépcsős reverz transzkripciós real time PCR
8 Southern blot 1. A nagyobb (akár genomi méretű) DNS-t kisebb szakaszokra hasítják restrikciós endonukleázok segítségével. 2. A DNS-t ezután denaturálják NaOH segítségével, melynek következtében a DNS két szála elválik egymástól. A DNS denaturálása fontos a későbbi membránhoz való kötődés és a próbákhoz való kapcsolódás miatt. 3. Nitrocellulóz membránt helyeznek a gél tetejére, a kapillárishatás miatt a minták felfelé mozdulnak el, kikötődnek a membránra, megőrizve a gélbeli egymáshoz viszonyított helyzetüket. 4. Száraz hőkezelés ( C) során megtörténik meg a DNS-membrán kovalens keresztkötése. 5. Hibridizációs próbával kezelik jelölve van (radioaktív, fluoreszcens, kromogenikus festékkel). 6. A nem hibridizált próbákat lemossák a felületről, és a hibridizációs mintázatot Röntgenfilmen autoradiográfiával vagy fluorescens jelölés esetén fluorométerrel, esetleg a kromogén szubsztát alkalmazásával enzimatikus színreakcióval teszik láthatóvá.
9 Southern blot
10 Molekuláris hibridizációs technikák: Linear Array HPV genotipizáló teszt 1. HPV target DNS és humán genomiális DNS kinyerése: AmpliLute Liquid Media Extraction kit 2. Target szekvencia amplifikáció (PCR): szelektív amplifikálás 37 HPV genotípusból származó DNS-hez és a humán β-globin génhez alkalmazott biotinilált primerekkel (a HPV genom polimorf L1 szakaszán levő 450bp hosszú nukleotidszekvencia meghatározásához) 3. Hibridizáció: Linear Array HPV genotipizáló csík a HPV és β-globin próbákkal és egy keresztreaktív oligonukleotid próbával fedve (HPV 33,35,52,58). 4. Kimutatási reakció: sztreptavidintormaperoxidáz konjugátum és tetrametilbenzidin szubsztrátoldat 37 anogenitális HPV genotípus azonosítására alkalmas: 6, 11, 16, 18, 26, 31, 33, 35, 39, 40, 42, 45, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 58, 59, 61, 62, 64, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73 (MM9), 81, 82 (MM4), 83 (MM7), 84 (MM8), IS39, CP6108
11 DNS microarray Egy kisméretű (1-2 cm 2 ) szilárd hordozó (pl. szilikon, üveg) felületére szabályos elrendezésben több 10000, eltérő szekvenciájú DNS próbát rögzítenek. A próbák nukleotid hosszúságúak, génekre vagy cdns-ekre specifikus oligonukleotidok vagy in vitro szintetizált DNSfragmentumok. Az eljárás lényege, hogy mikroszkóp segítségével detektálják azokat a próbákat a chipen, amelyekkel komplementer DNS vagy RNS jelen van a mintában. Ennél a módszernél a mintát kell fluoreszcens módon jelölni. A klasszikus hibridizációs módszerekhez képest a chip technológiánál megfordult a próba és a minta viszonya: itt a próbát, míg az előző módszereknél a mintát immobilizálják.
12 In vitro DNS amplifikálás valós idejű detekció: PCR A PCR-t a DNS-szál egy rövid, jól definiált szakaszának amplifikálására használják: egyetlen gén, génrészlet Az élő szervezetekkel ellentétben a PCR-folyamat csak kis DNS-szakaszok másolására képes, ezek hossza általában legfeljebb 10 kbp=1000 bázispár. A PCR reakció komponensei: 1.DNS-templát ez tartalmazza a DNS-szakasz amplifikálandó régióját 2.Primerpár amely meghatározza az amplifikálandó szakasz elejét és végét (forward, reverse primer) 3. 4.DNS-polimeráz amely lemásolja az amplifikálandó szakaszt 5.Nukleotidok amelyekből a DNS-polimeráz felépíti az új DNS-t 6.Puffer amely biztosítja a DNS-polimeráz számára megfelelő kémiai környezetet
13 In vitro DNS amplifikálás valós idejű detekció: PCR A Real-Time PCR során a DNS mennyiségének mérése fluoreszcens detektáláson alapul, amihez kettős szálú DNS-hez kötődő fluoreszcens festékeket vagy fluoreszcensen jelölt szekvenciaspecifikus próbákat használnak. A Q-PCR mérés alapvető feltétele, hogy a fluoreszcens jel erőssége egyenesen arányos legyen az amplikon mennyiségével.
14 Kvantitatív valós idejű PCR: kvantitatív HBV DNS kimutatás HBV GeneProof HBV kvantitatív in vitro diagnosztikai teszt Kiindulási minta: serum Metodika 1. A minta előkészítése (dekontaminálás, DNS izolálás) 2. A kiválasztott target DNS amplifikálása PCR reakció során 3. Az amplifikációs termékek hibridizációja target specifikus oligonukleotid próbákhoz LightCycler A hibridizált termékek detektálása kolorimetriás módszerrel
15 Restrikciós fragmenthossz polimorfizmus (RFLP) A DNS molekula restrikciós endonukleázokkal történő emésztést követően jól jellemezhető a DNS-fragmentumok hosszában meglévő különbségekkel. Ez az úgynevezett hasítási fragmentumhossz polimorfizmus (RFLP) Az RFLP-technikával nem csak a restrikciós endonukleázokkal végzett emésztés után kapott DNS-fragmentumok hosszának különbségeit lehet kimutatni, hanem az inszerciót, a deléciót és a bázisváltozást is. A deléció és az inszerció megváltoztatja az érintett fragmentumok elektroforetikus mobilitását. Felhasználási terület: Mutáció analízis, genetikai térképezés, DNS fingerprint
16 A molekuláris klónozás (in vivo amplifikáció)
17 A betegségek genetikai és genomikai szerepének vizsgálata szegregációs analízis: Az adott genetikai eltérés öröklődésének (monogénes: autoszomális domináns, recesszív, X kromoszómához kötött, mitokondriális DNS-hez kapcsolt illetve poligénes), penetranciájának és kifejeződésének (kisfokú, enyhe, erős) vizsgálata. linkage analízis (kapcsoltsági vizsgálat): A betegség kialakításában résztvevő gén vagy gének egymással illetve más génekkel történő együttes öröklődésének meghatározása. asszociációs vizsgálatok (társulás elemzés): Azonosítja, milyen allélvariánsok szerepelnek hajlamosító tényezőként az egyes betegségekben. A család alapú asszociációs vizsgálatok a transzmissziós diszequilibrium tesztek. A populációs alapon szervezett vizsgálatok pedig allélcsoportok illetve haplocsoportok vizsgálata alapján történik. A legújabb kutatási irányvonal a teljes genom asszociációs vizsgálat (genome-wide association studies, GWAS).
18 Géntérképezés A linkage analízis során a gének egymástól való távolságát, a genomban való viszonylagos elhelyezkedésüket határozzuk meg anélkül, hogy valóban megszekvenálnánk a DNS-t. Képesek vagyunk egy ismert gén vagy marker (ismert DNS szekvencia) alapján megmondani egy másik gén helyét a genomban. Ezt oly módon érik el, hogy az együtt öröklődő tulajdonságok gyakoriságát figyelik és ebből következtetnek a megfelelő gének egymástól való távolságára a kromoszómán. A fizikai térképezés az egyes határjelzők (gének, markerek) közötti távolságot jelzi a DNS molekula teljes hosszához viszonyítva. Míg az előbbi módszer viszonylagos, a fizikai térképezés valós távolságokat határoz meg. Ilyen térképeket a DNS ujjlenyomatoknál (fingerprinting) használnak. 18
19 Az 1. humán kromoszóma térképe 19
20 Monogénes megbetegedések csírasejtes mutáció autoszómális mutáció lehetőség nyílik a diagnosztikára, magas penetranciájuk és a hozzájuk kapcsolt rendellenességek magas élethossz prevalenciája miatt lehetőség nyílik szűrésre vagy korai tesztelésre legtöbb esetben a klinikai genetika feladata a genetikai tanácsadás és kezelés
21 Mi a különbség mutáció és polimorfizmus között? Egy nukleotidot érintő polimorfizmus (SNP) vs. mutáció Több generáción keresztül történő szekvenciát érintő változás Time A mutáció véletlenszerű esemény csupán néhánynak van hatása a következő generációkban A szekvenciák összehasonlítása az evolúciógenetika alapja Összehasonlítás s 1 és s 2 s 1 : s 2 : A C A G A G T A A C A C A TA T A GA C szubsztitúció deléció inzerció
22
23 Hutchinson-Gilford Progeria Szindróma A laminin A gén domináns mutációja, ami aberráns lamin A fehérje (progerin) létrejöttéhez vezet. A nukleáris lamina alapvető sejtmag funkciót meghatározó folyamatokban játszik szerepet, ilyen a DNS replikáció és a sejtciklus szabályozás. A progerin a magmembránt instabillá teszi. Nukleáris morfológiai eltérések Kromatin dezintegráció DNA repair defektusai Megnövekedett genom instabilitás A halálozás fiatalkorban fordul elő, oka progresszív szív és agyi ereket érintő arterioszklerózis Sporadikus autoszomális domináns mutáció az LMNA génben 1 Kromoszóma
24 Werner Szindróma (felnőttkori progeria) Autoszomális recesszívöröklődést mutató rendellenesség, korai öregedés arterioszklerózis, 2-ex típusú cukorbetegség, oszteoporózis, lágyszövet szarkóma megjelenése jellemzi WRN gén mutációja (mindkét allélt érintő mutáció szükséges) 8. kromoszóma Autoszomális recesszív mutáció a WRN génben WRN gén genetikai instabilitás, DNS száltörések, kromoszómális transzlokáció, extenzív genetikai állomány vesztés
25 Monogénes öröklődésű megbetegedések Leggyakrabban mendeli öröklésmenet Alacsony prevalencia 1:2000 Magas penetrancia A környezeti és életmódbeli hatások szerepe a betegség megjelenésére kisfokú A Genomikai Medicina és Ritka Betegségek Intézete (GRI) diagnosztizálja azokat a betegségeket, melyek kialakulásában az egyes gének rendellenességei szerepet játszanak, illetve a humán genom bizonyos variációi ismeretében becsli a gyakori, komplex betegségek kialakulásának valószínűségét genetikai tanácsadás, családtervezést, bizonyos betegségek és gyógyszer mellékhatások megelőzését
26 OMIM adatbázis
27 Genetikai tesztek Prevenciós tesztek: preimplantációs tesztek Prediktív tesztek: preszimptómás tesztek Diagnosztikus tesztek: prenatális és újszülöttkori diagnosztikus tesztek A teszteknek analitikai és klinikai validitáson kell átesniük széles körű felhasználásuk előtt! Genetikai tesztelés Genetikai szűrés
28 Prediktív genetikai tesztek Gén HFE APOE 4 CYP2D6 BRCA 1 BRCA 2 Factor V APC Betegség Öröklött hemochromatosis Alzheimer kór Citokróm P452 aktivitás Emlő daganat Emlő daganat Leiden mélyvénás thrombózis Familiáris adenomatózus polipózis
29 Kiválasztott gének célzott vizsgálata SNP fókuszált vizsgálata LD (linkage disequilibrium) vizsgálat Génkifejeződés mennyiségi vizsgálata Hipotézis indukálta célzott genetikai vizsgálatok nagy gén nagy hatás APC, RET, BRCA, BRAF, p53 Jelátviteli útvonal vizsgálata EGFR, VEGF, TLR (receptoriális) MAPK, JNK, RTK (kináz gátlás) NfKB, Wnt (transzkripciós faktor)
30 Új generációs szekvenálás (NGS) Az új generációs szekvenálási technikák segítségével, különböző módszerekkel gyorsan, nagy mennyiségű szekvencia adathoz juthatunk bármilyen eredetű nukleinsav mintából Az új generációs szekvenálás felhasználási területei: a genom, a célzott (pl. EXOM) és az RNS szekvenálás A új generációs szekvenálás alkalmas transzkripciós faktor kötőhelyek karakterizálására személyre szabható diagnosztika és terápia technologia/ch05s02.html
31 Genome wide analysis studies (GWAS) A humán genom teljes hosszában azonosítják az SNP-ket Előnyös ha ismerjük a populáció specifikus LD haplotípus blokkokat, így haplotípusonkét kevesebb, gyakran 2 SNP is elég lehet. Jelenleg folyamatban van a HapMap projekt, mely az emberi genom 3.1 millió SNP-re vonatkozó térképét tartalmazza rekombinációs forrópontokra, LD blokkokra és az SNP előfordulás alapvető összefüggéseire vonatkozóan. A HapMap négy, földrajzilag és etnikailag eltérő népcsoportból származó 270 egyén teljes genom szekvenálásából származik. Eddig a vizsgált során az azonos népcsoportba tartozó személyeknél körülbelül 25-30%-os SNP átfedést azonosítottak. Kimutatták, hogy a rekombinációs arány szisztematikusan különbözik az egyes gének vonatkozásában illetve eltérő funkciójú gének között, valamint azonosítottak a populációs természetes szelekcióban szerepet játszó allél polimorfizmusokat.
32 Genome wide association studies Manhattan plot: minden pont egy SNP-t jelöl, az x-tengelyen a lokalizáció az y-tengelyen az asszociáció szorossága látható. Jelen vizsgálat egy mikrocirkulációs rendellenességeket vizsgáló tanulmány része, melyben a kisérszűkülettel összefüggő SNP variánsok ábrázolódnak Ikram MK et al (2010) Four Novel Loci (19q13, 6q24, 12q24, and 5q14) Influence the Microcirculation In Vivo. PLoS Genet (10):e
33 Poligénes és multifaktoriális betegségek Több gén, génkomplexumok és környezeti hatások interferenciája befolyásolja a kialakulást Populációs szinten magas prevalenciájú betegségek Gének penetranciája változó, széles skálán mozog Családi halmozódást mutathat a betegség és a génkomplexumok mutathatnak hasonlóságokat a családon belül, de többnyire nem figyelhető meg a családi öröklődési mintázat Csupán a genetikai vizsgálattal nehéz egy személy lehetséges érintettségét pontosan meghatározni!!! Hypertonia Stroke Sporadikus daganatok Diabetes mellitus Asthma Epilepszia Ritkán néhány veleszületett rendellenesség: Szájpadhasadék Velőcső defektusok
34 Genom-környezet interferencia Gének Magas vagy alacsony penetranciájú Környezet Külső fizikai kémyiai biológiai társadalmi
35 Vizsgálati módszerek az egyéni érzékenység meghatározására Perifériás vérből lymphocyta izolálást követően DNA repair kapacitás A reporter gének sérülésének mennyiségi meghatározása (pcmvcat, pcmvluc) Az alacsony DRC fenotípus önálló kockázati tényezőként szerepel epitheliális daganatokban (fiatal, nő, enyhe dohányos, családi anamnézisben daganatos betegség) Mutagén szenzitivitás Mutagén expozíciót követően a DNS károsodás mennyiségi meghatározása, egyszálú, kettős szál károsodás, adduktképződés Comet assay DNs károsodás mérése sejtszinten Micronucleus assay Könnyű kvantifikáció Telomer hossz meghatározás TL eltérések általánosan előfordulnak az epiteliális daganatok korai és bevezető stádiumában
36 A farmakokinetikát befolyásoló gének Multidrog-rezisztencia-1 (MDR-1), ABCB1. A vesetubulusokban és a hepatocyták canalicularis membránjában levők a drogok szervezetből való kiürítését végzik. Az ABCB1 gén C3435T polimorfizmusában a T allél a gén csökkent expresszióját okozza. Ezért a TT genotípusúakban, pl. metotrexát kezelésnél akut limfoblasztos leukémiában (ALL) emelkedik a mellékhatások gyakorisága. Multidrog-rezisztencia-asszociált protein (MRP1), ABCC1 Az antraciklinek egyik legfontosabb, kifelé irányuló transzportere a szívben. Az antraciklinek a daganatkemoterápia egyik leghatékonyabb szerei (pl. doxorubicin). Egyik legfontosabb mellékhatása a kardiotoxicitás, melynek hatása sokszor évtizedekkel a kezelés után jelentkezik. Az ABCC1 polimorfizmusai befolyásolják működését és az antraciklinek korai és késői mellékhatásait.
37 A farmakokinetikát befolyásoló gének Cytochrom P-450 (CYP) család A májban termelődik, összesen 57 gén tartozik ide, és fő hatása az idegen anyagok oxidálása. A géncsalád néhány tagja igen polimorf, és becslések szerint a génekben található variációk a súlyos gyógyszermellékhatások 80%-áért felelősek. Néhány ismertebb, polimorf CYP gén: CYP3A4, CYP3A5 : a gyógyszerek 50%-nak a metabolizmusáért felelősek. CYP2D6 : a gyógyszerek negyedének metabolizmusáért felelős. CYP2C9 : 5%-ért felelős. CYP2C19 : sok fontos gyógyszer metabolizmusáért felelős (pl. Clopidogrel).
38 Epigenetika Örökölhető sejtfenotípus és génkifejeződés eltérések, melyek a DNS szekvenciától függetlenek: Kromoszomális remodelling Hiszton módosulás DNS metilációs mintázat Fehérjét nem kódoló RNS szakaszok: mirns
39
40 Epigenetikai tényezők módosítása Beltenyésztett egértörzseken végzett kísérletekben a metildonorként szereplő tápanyagok (B12, folsav) bevitelének arányai az agouti gén metiláltságát befolyásolták az embrionális fejlődés során, ami befolyásolja az utód szőrzetének színét. Epidemiológiai vizsgálatokban kimutatták, hogy a prenatális és korai posztnatális diéta befolyásolja a felnőttkori táplálkozással összefüggésben álló nem fertőző betegségre való hajlamot ( cardiovascularis betegség, 2-es típusú diabetes mellitus obezitás és daganatos betegségek). A Folsav, zink, betain és a B12 fontos szerepet játszanak az egy szénatomos transzfer rendszerek (Folsav-Tetrahidrofolsav és S adenozil-metionin rendszer) kulcsszerepet játszanak a SAM szintézisében, meghatározva ezzel annak mennyiségét és a promoter metilációt. (Hypo és Hypermetiláció szerepe) A folsav hiány számos betegség kockázatát emeli: anaemia, idegrendszeri defektusok daganatok pl: colorectalis daganat. Metilén-tetrahidrofolát- reduktáz (MTHFR) csökkent szintje összefügg a csökkent folsav, metionin és SAM szintekkel. Alternatív beviteli forrás lehet a betain, ami metildonorként funkcionál a homocysztein remetilációhoz. L-karnitin hiszton acetiláció egyik fontos faktora. CoQ10 esszenciális kofaktorként szerepel az elektrontranszportban szerepet játszó enzimekben, ill. a pirimidin bioszintézisben.
41
42 A genomika hatásai Molekuláris medicina diagnosztika, prevenció betegségek genetikai pedispozíciójának meghatározása molekuláris alapú egyénre szabott gyógyszerelés molekuláris célzott terápia Mikrobiológia patogének gyors azonosítása és célzott kezelése új energiatermelési eljárások (bioüzemanyag) környezeti szennyezők monitorozása a toxikus anyagok biztonságos lebontása, megsemmisítése U.S. Department of Energy Genome Programs, Genomics and Its Impact on Science and Society, 2003
43 A genomika hatásai Kockázatbecslés az egészségügyi kockázat meghatározása fizikai és kémiai környezeti expozíció során, daganatkockázat Bioarchaeológia, Antropológia, Evolúció- és Migrációkutatás a csírasejtes mutációk tanulmányozása mitokondriális DNS, Y kromoszóma meghatározás
44 A genomika hatásai DNS azonosítás (Igazságügyi orvostan) áldozatok és elkövetők azonosítása apasági és családi eredet meghatározás veszélyeztetett és védett fajok azonosítása a vadvédelmi szervek felé biológiai szennyezők azonosítása donor-recipiens egyezőség meghatározása transzplantációs programban Növénytermesztés, állattenyésztés betegség és kártevő rezisztens fajok létrehozása magasabb hozamtermelés növény és állatfajoknál biopeszticidek kifejlesztése
45 Elsi: etikai, jogi, és társadalmi következmények A genomikai információ személyes és megbízható kezelése biztosító társaságok, alkalmazók, törvényhozók, oktatási intézmények, katonai intézmények és egyéb szerveket érintően. Pszichoszociális hatás, stigmatizáció, diszkrimináció az egyéni genomikai különbözőségből fakadóan. Reproduktív következmények becslése és szabályozása a reproduktivitást érintő döntéshozatalban. Klinikai vonatkozások beleértve az orvosképzés, genetikai információ szolgáltatása az egészségügyi ellátó személyzet felé, a genetikailag elemzett személy ill. a népesség tájékoztatása a lehetőségekről és korlátokról, szociális kockázat, standard protokoll és minőségbiztosítás alkalmazása.
46 Hgp-n túl: mi a következő lépés? HapMap Genetikai változékonyság meghatározása a humán genomban Systems Biology Mikrobiális genom lehetőségei energiatermelés és környezeti célok felhasználására
47 PTE KK LMI Molekuláris genetikai laboratórium
48 Diagnosztikai vizsgálatok HPV Linear array HPV genotipizáló teszt cervicalis sejtek, FFPE szövetek HBV serum GeneProof HBV kvantitatív in vitro diagnosztikai teszt MTB LightMix Mycobacterium spp/m. tuberculosis kvalitatív in vitro diagnosztikai teszt köpet,bronchusmosó folyadék, pleurapunctatum, genny, gyomormosó folyadék, liquor, vizelet CT LightMix Chlamydia trachomatis kvalitatív IVD teszt NG LightMix Neisseria gonorrhoea kvalitatív IVD teszt vizelet, urethralis ill. endocervicalis swab, conjunctiva váladék Metodika 1. A minta előkészítése (dekontaminálás, DNS izolálás) 2. A kiválasztott target DNS amplifikálása PCR reakció során 3.Az amplifikációs termékek hibridizációja target specifikus oligonukleotid próbákhoz LightCycler A hibridizált termékek detektálása kolorimetriás módszerrel qrt PCR
49 Diagnosztikai vizsgálatok HCV -GeneProof HCV kvalitatív in vitro diagnosztikai teszt -Genotípus meghatározás 1a/b, 2 a/c, 4, 2b, 3a genotípusoknak megfelelően serum Prothrombin G20210A és Factor V Leiden G1691A mutáció detekció Fluoreszcensen jelölt hibridizációs próbákkal és DNA Master HybProbe kittel teljes vér MDR-1 C3435T mutáció detektáló teszt Fluoreszcensen jelölt hibridizációs próbákkal és DNA Master HybProbe kittel teljes vér PB19 LightMix Parvovírus B19 kvalitatív IVD teszt serum HSV EBV CMV LightMix Herpes simplex vírus 1/2 kvalitatív IVD teszt serum, liquor LightMix Eppstein-Barr vírus kvalitatív IVD teszt serum LightMix humán Cytomegalovírus kvalitatív IVD teszt serum
MOLEKULÁRIS GENETIKA A LABORATÓRIUMI MEDICINÁBAN. Laboratóriumi Medicina Intézet 2017.
MOLEKULÁRIS GENETIKA A LABORATÓRIUMI MEDICINÁBAN Laboratóriumi Medicina Intézet 2017. 1 Történeti áttekintés Humán genom projekt 20-25 000 gén azonosítása 1,800 betegséghez köthető gén 1000 genetikai teszt
RészletesebbenHAPMAP -2010 Nemzetközi HapMap Projekt. SNP GWA Haplotípus: egy kromoszóma szegmensen lévő SNP mintázat
HAPMAP -2010 Nemzetközi HapMap Projekt A Nemzetközi HapMap Project célja az emberi genom haplotípus* térképének(hapmap; haplotype map) megszerkesztése, melynek segítségével katalogizálni tudjuk az ember
RészletesebbenADATBÁNYÁSZAT I. ÉS OMICS
Az élettudományi-klinikai felsőoktatás gyakorlatorientált és hallgatóbarát korszerűsítése a vidéki képzőhelyek nemzetközi versenyképességének erősítésére TÁMOP-4.1.1.C-13/1/KONV-2014-0001 ADATBÁNYÁSZAT
RészletesebbenIn Situ Hibridizáció a pathologiai diagnosztikában és ami mögötte van.
In Situ Hibridizáció a pathologiai diagnosztikában és ami mögötte van. Kneif Józsefné PTE KK Pathologiai Intézet Budapest 2017. 05. 26 Kromoszóma rendellenesség kimutatás PCR technika: izolált nukleinsavak
RészletesebbenEngedélyszám: 18211-2/2011-EAHUF Verziószám: 1. 2460-06 Humángenetikai vizsgálatok követelménymodul szóbeli vizsgafeladatai
1. feladat Ismertesse a gyakorlaton lévő szakasszisztens hallgatóknak a PCR termékek elválasztása céljából végzett analitikai agaróz gélelektroforézis során használt puffert! Az ismertetés során az alábbi
RészletesebbenTöbbgénes jellegek. 1. Klasszikus (poligénes) mennyiségi jellegek. 2.Szinte minden jelleg több gén irányítása alatt áll
Többgénes jellegek Többgénes jellegek 1. 1. Klasszikus (poligénes) mennyiségi jellegek Multifaktoriális jellegek: több gén és a környezet által meghatározott jellegek 2.Szinte minden jelleg több gén irányítása
RészletesebbenA genetikai lelet értelmezése monogénes betegségekben
A genetikai lelet értelmezése monogénes betegségekben Tory Kálmán Semmelweis Egyetem, I. sz. Gyermekklinika A ~20 ezer fehérje-kódoló gén a 23 pár kromoszómán A kromoszómán található bázisok száma: 250M
RészletesebbenMolekuláris genetikai vizsgáló. módszerek az immundefektusok. diagnosztikájában
Molekuláris genetikai vizsgáló módszerek az immundefektusok diagnosztikájában Primer immundefektusok A primer immundeficiencia ritka, veleszületett, monogénes öröklődésű immunhiányos állapot. Családi halmozódást
RészletesebbenHumán genom variációk single nucleotide polymorphism (SNP)
Humán genom variációk single nucleotide polymorphism (SNP) A genom ~ 97 %-a két különböző egyedben teljesen azonos ~ 1% különbség: SNP miatt ~2% különbség: kópiaszámbeli eltérés, deléciók miatt 11-12 millió
RészletesebbenDiagnosztikai célú molekuláris biológiai vizsgálatok
Diagnosztikai célú molekuláris biológiai vizsgálatok Dr. Patócs Attila, PhD MTA-SE Molekuláris Medicina Kutatócsoport, Semmelweis Egyetem II. sz. Belgyógyászati Klinika Laboratóriumi Medicina Intézet Genetikai
RészletesebbenNÖVÉNYGENETIKA. Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP /1/A
NÖVÉNYGENETIKA Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP-4.1.2-08/1/A-2009-0010 A citológia és a genetika társtudománya Citogenetika A kromoszómák eredetét, szerkezetét, genetikai funkcióját,
RészletesebbenAz orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen
Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen Azonosító szám: TÁMOP-4.1.2-08/1/A-2009-0011 Az orvosi
RészletesebbenGENOMIKA TÖBBFÉLE MAKROMOLEKULA VIZSGÁLATA EGYIDŐBEN
GENOMIKA TÖBBFÉLE MAKROMOLEKULA VIZSGÁLATA EGYIDŐBEN Strukturális genomika Genomkönyvtárak DNS szekvenálás Genom programok Polimorfizmusok RFLP DNS könyvtár készítés humán genom 1. Emésztés RE-kal Emberi
RészletesebbenNorvég Finanszírozási Mechanizmus által támogatott projekt HU-0115/NA/2008-3/ÖP-9 ÚJ TERÁPIÁS CÉLPONTOK AZONOSÍTÁSA GENOMIKAI MÓDSZEREKKEL
Norvég Finanszírozási Mechanizmus által támogatott projekt HU-0115/NA/2008-3/ÖP-9 ÚJ TERÁPIÁS CÉLPONTOK AZONOSÍTÁSA GENOMIKAI MÓDSZEREKKEL KÖZÖS STRATÉGIA KIFEJLESZTÉSE MOLEKULÁRIS MÓDSZEREK ALKALMAZÁSÁVAL
RészletesebbenPrenatalis diagnosztika lehetőségei mikor, hogyan, miért? Dr. Almássy Zsuzsanna Heim Pál Kórház, Budapest Toxikológia és Anyagcsere Osztály
Prenatalis diagnosztika lehetőségei mikor, hogyan, miért? Dr. Almássy Zsuzsanna Heim Pál Kórház, Budapest Toxikológia és Anyagcsere Osztály Definíció A prenatális diagnosztika a klinikai genetika azon
RészletesebbenGenetikai vizsgálat. Intergenomialis kommunikációs zavarok (mtdns depléció/deléció jelenléte esetén javasolt) Alpers syndroma (POLG1 gén analízis)
Genetikai vizsgálat Intergenomialis kommunikációs zavarok (mtdns depléció/deléció jelenléte esetén javasolt) Alpers syndroma (POLG1 gén analízis) SANDO (POLG1 gén analízis) TWINKLE ANT1 OPA1 SCO2 RRM2B
RészletesebbenVeleszületett rendellenességek etiológiai csoportjai
MULTIFAKTORIÁLIS ÖRÖKLŐDÉS PRIMER IZOLÁLT RENDELLENESSÉGEK: MALFORMÁCIÓK ÉS GYAKORI FELNŐTTKORI KOMPLEX BETEGSÉGEK Veleszületett rendellenességek etiológiai csoportjai Kromoszóma rendellenességek és kisméretű
RészletesebbenDNS-szekvencia meghatározás
DNS-szekvencia meghatározás Gilbert 1980 (1958) Sanger 3-1 A DNS-polimerázok jellemzői 5'-3' polimeráz aktivitás 5'-3' exonukleáz 3'-5' exonukleáz aktivitás Az új szál szintéziséhez kell: templát DNS primer
RészletesebbenMutáció detektáló módszerek
Mutáció detektáló módszerek Molekuláris genetikai vizsgáló módszerek 2014.03.19. Bármilyen eltérés a referencia szekvenciától Lehet Egy bázispárnyi szubsztitúció, deléció, inzerció Kromoszóma deléció,
RészletesebbenMolekuláris biológiai eljárások alkalmazása a GMO analitikában és az élelmiszerbiztonság területén
Molekuláris biológiai eljárások alkalmazása a GMO analitikában és az élelmiszerbiztonság területén Dr. Dallmann Klára A molekuláris biológia célja az élőlények és sejtek működésének molekuláris szintű
RészletesebbenGenomika. Mutációk (SNP-k) és vizsgálatuk egyszerű módszerekkel. DNS szekvenálási eljárások. DNS ujjlenyomat (VNTR)
Genomika (A genom, génállomány vizsgálata) Mutációk (SNP-k) és vizsgálatuk egyszerű módszerekkel DNS szekvenálási eljárások DNS ujjlenyomat (VNTR) DNS chipek statikus és dinamikus információk vizsgálata
Részletesebben10. Genomika 2. Microarrayek és típusaik
10. Genomika 2. 1. Microarray technikák és bioinformatikai vonatkozásaik Microarrayek és típusaik Korrelált génexpresszió mint a funkcionális genomika eszköze 2. Kombinált megközelítés a funkcionális genomikában
RészletesebbenBiológiai módszerek alkalmazása környezeti hatások okozta terhelések kimutatására
Szalma Katalin Biológiai módszerek alkalmazása környezeti hatások okozta terhelések kimutatására Témavezető: Dr. Turai István, OSSKI Budapest, 2010. október 4. Az ionizáló sugárzás sejt kölcsönhatása Antone
RészletesebbenKözös stratégia kifejlesztése molekuláris módszerek alkalmazásával a rák kezelésére Magyarországon és Norvégiában
Norvég Finanszírozási Mechanizmus által támogatott projekt Közös stratégia kifejlesztése molekuláris módszerek alkalmazásával a rák kezelésére Magyarországon és Norvégiában Norvég Alap támogatással javul
RészletesebbenAntiszenz hatás és RNS interferencia (a génexpresszió befolyásolásának régi és legújabb lehetőségei)
Antiszenz hatás és RNS interferencia (a génexpresszió befolyásolásának régi és legújabb lehetőségei) Az antiszenz elv története Reverz transzkripció replikáció transzkripció transzláció DNS DNS RNS Fehérje
RészletesebbenDr. Máthéné Dr. Szigeti Zsuzsanna és munkatársai
Kar: TTK Tantárgy: CITOGENETIKA Kód: AOMBCGE3 ECTS Kredit: 3 A tantárgyat oktató intézet: TTK Mikrobiális Biotechnológiai és Sejtbiológiai Tanszék A tantárgy felvételére ajánlott félév: 3. Melyik félévben
RészletesebbenAz orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen
Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen Azonosító szám: TÁMOP-4.1.2-08/1/A-2009-0011 Az orvosi
RészletesebbenSZEMÉLYRE SZABOTT ORVOSLÁS II.
Az élettudományi-klinikai felsőoktatás gyakorlatorientált és hallgatóbarát korszerűsítése a vidéki képzőhelyek nemzetközi versenyképességének erősítésére TÁMOP-4.1.1.C-13/1/KONV-2014-0001 SZEMÉLYRE SZABOTT
RészletesebbenEpigenetikai Szabályozás
Epigenetikai Szabályozás Kromatin alapegysége a nukleoszóma 1. DNS Linker DNS Nukleoszóma mag H1 DNS 10 nm 30 nm Nukleoszóma gyöngy (4x2 hiszton molekula + 146 nukleotid pár) 10 nm-es szál 30 nm-es szál
RészletesebbenA metabolikus szindróma genetikai háttere. Kappelmayer János, Balogh István (www.kbmpi.hu)
A metabolikus szindróma genetikai háttere Kappelmayer János, Balogh István (www.kbmpi.hu) Definíció WHO, 1999 EGIR, 1999 ATP III, 2001 Ha három vagy több komponens jelen van a betegben: Vérnyomás: > 135/85
RészletesebbenHátterükben egyetlen gén áll, melynek általában számottevő a viselkedésre gyakorolt hatása, öröklési mintázata jellegzetes.
Múlt órán: Lehetséges tesztfeladatok: Kitől származik a variáció-szelekció paradigma, mely szerint az egyéni, javarészt öröklött különbségek között a társadalmi harc válogat? Fromm-Reichmann Mill Gallton
RészletesebbenMangalica specifikus DNS alapú módszer kifejlesztés és validálása a MANGFOOD projekt keretében
Mangalica specifikus DNS alapú módszer kifejlesztés és validálása a MANGFOOD projekt keretében Szántó-Egész Réka 1, Mohr Anita 1, Sipos Rita 1, Dallmann Klára 1, Ujhelyi Gabriella 2, Koppányné Szabó Erika
RészletesebbenA HUMÁNGENETIKA LEGÚJABB EREDMÉNYEI Péterfy Miklós
A HUMÁNGENETIKA LEGÚJABB EREDMÉNYEI Péterfy Miklós Összefoglalás A humángenetika korunk egyik legdinamikusabban fejlődő tudományága. Ennek a fejlődésnek legfőbb mozgatórugója az, hogy a humángenetika,
Részletesebben2. SZ. SZAKMAI ÖSSZEFOGLALÓ PIR 2
Az Országos Onkológiai Intézet Norvég Finanszírozási mechanizmus keretében elnyert Kutatás Fejlesztési Pályázata Közös stratégia kifejlesztése molekuláris módszerek alkalmazásával a rák kezelésére Magyarországon
RészletesebbenMolekuláris biológiai módszerek m. hibridizációs s technikák
Molekuláris biológiai módszerek m II: közvetlen k szekvencia analízis, hibridizációs s technikák Tordai Attila OVSZ Molekuláris Diagnosztikai Labor Bp., 2011. április 21. Labordiagnosztikai szinten tartó
RészletesebbenFehérje expressziós rendszerek. Gyógyszerészi Biotechnológia
Fehérje expressziós rendszerek Gyógyszerészi Biotechnológia Expressziós rendszerek Cél: rekombináns fehérjék előállítása nagy tisztaságban és nagy mennyiségben kísérleti ill. gyakorlati (therapia) felhasználásokra
RészletesebbenA BIOTECHNOLÓGIA ALKALMAZÁSI LEHETŐSÉGEI A GYÓGYSZERKUTATÁSBAN
Az élettudományi-klinikai felsőoktatás gyakorlatorientált és hallgatóbarát korszerűsítése a vidéki képzőhelyek nemzetközi versenyképességének erősítésére TÁMOP-4.1.1.C-13/1/KONV-2014-0001 A BIOTECHNOLÓGIA
RészletesebbenEpigenetikai mintázatok biomarkerként történő felhasználási lehetőségei a toxikológiában
Epigenetikai mintázatok biomarkerként történő felhasználási lehetőségei a toxikológiában Czimmerer Zsolt, Csenki-Bakos Zsolt, Urbányi Béla TOX 2017 Tudományos Konferencia 2017.10.12. Bükfürdő A sejtek
RészletesebbenOpponensi Vélemény Dr. Nagy Bálint A valósidejű PCR alkalmazása a klinikai genetikai gyakorlatban ' című értekezéséről
Opponensi Vélemény Dr. Nagy Bálint A valósidejű PCR alkalmazása a klinikai genetikai gyakorlatban ' című értekezéséről Dr. Nagy Bálint az MTA doktora fokozat megszerzéséhez a fenti címen nyújtott be a
RészletesebbenGenomikai Medicina és Ritka Betegségek Intézete Semmelweis Egyetem
Tisztelt Hölgyem, Tisztelt Uram! Örömmel jelentjük be Önöknek, hogy a Genomikai Medicina és Ritka Betegségek Intézetének egyik új projektje azon betegségek genetikai hátterének feltérképezésére irányul,
RészletesebbenOrvosi Genomika. 1. Trendek a modern orvostudományban. 2. Genomika és modern orvostudomány
1 1. ORVOSI GENOMIKA Orvosi Genomika 1. Trendek a modern orvostudományban DIA 1 Az emberi genom megfejtése óta eltelt 10 évben rendkívül gyors fejlődés ment végbe a genomikai technikákban, ill. a genomikai
RészletesebbenLujber László és a szerző engedélyé
Allergia genetikai háttere Dr. Szalai Csaba 2012. Szeptember 24. 1 Allergia: multifaktoriális vagy komplex betegség: Genetikai háttér (több száz gén, több ezer genetikai variáció) + környezeti tényezők
Részletesebben(11) Lajstromszám: E 008 532 (13) T2 EURÓPAI SZABADALOM SZÖVEGÉNEK FORDÍTÁSA
!HU00000832T2! (19) HU (11) Lajstromszám: E 008 32 (13) T2 MAGYAR KÖZTÁRSASÁG Szellemi Tulajdon Nemzeti Hivatala EURÓPAI SZABADALOM SZÖVEGÉNEK FORDÍTÁSA (21) Magyar ügyszám: E 03 783231 (22) A bejelentés
Részletesebben5. Molekuláris biológiai technikák
5. Molekuláris biológiai technikák DNS szaporítás kémcsőben és élőben. Klónozás, PCR, cdna, RT-PCR, realtime-rt-pcr, Northern-, Southernblotting, génexpresszió, FISH 5. Molekuláris szintű biológiai technikák
RészletesebbenBioinformatika előadás
10. előadás Prof. Poppe László BME Szerves Kémia és Technológia Tsz. Bioinformatika proteomika Előadás és gyakorlat Genomika vs. proteomika A genomika módszereivel nem a tényleges fehérjéket vizsgáljuk,
RészletesebbenA PKU azért nem hal ki, mert gyógyítják, és ezzel növelik a mutáns allél gyakoriságát a Huntington kór pedig azért marad fenn, mert csak későn derül
1 Múlt órán: Genetikai alapelvek, monogénes öröklődés Elgondolkodtató feladat Vajon miért nem halnak ki az olyan mendeli öröklődésű rendellenességek, mint a Phenylketonuria, vagy a Huntington kór? A PKU
RészletesebbenTesztkérdések. 1 A nem fertőző betegségek halálozási aránya az európai régióban: a) 77% b) 68% c) 86%
Tesztkérdések 1 A nem fertőző betegségek halálozási aránya az európai régióban: a) 77% b) 68% c) 86% 2. Az étkezés és az életmód megváltoztatásával milyen arányban előzhetők meg a szívérrendszeri betegségek?
RészletesebbenMolekuláris terápiák
Molekuláris terápiák Aradi, János Balajthy, Zoltán Csősz, Éva Scholtz, Beáta Szatmári, István Tőzsér, József Varga, Tamás Szerkesztette Balajthy, Zoltán és Tőzsér, József, Debreceni Egyetem Molekuláris
RészletesebbenDaganatok kialakulásában szerepet játszó molekuláris folyamatok
Daganatok kialakulásában szerepet játszó molekuláris folyamatok Genetikai változások Onkogének Tumorszuppresszor gének DNS hibajavító gének Telomer és telomeráz Epigenetikai változások DNS-metiláció Mikro-RNS
RészletesebbenTEMATIKA Biokémia és molekuláris biológia IB kurzus (bb5t1301)
Biokémia és molekuláris biológia I. kurzus (bb5t1301) Tematika 1 TEMATIKA Biokémia és molekuláris biológia IB kurzus (bb5t1301) 0. Bevezető A (a biokémiáról) (~40 perc: 1. heti előadás) A BIOkémia tárgya
RészletesebbenA humán mitokondriális genom: Evolúció, mutációk, polimorfizmusok, populációs vonatkozások. Egyed Balázs ELTE Genetikai Tanszék
A humán mitokondriális genom: Evolúció, mutációk, polimorfizmusok, populációs vonatkozások Egyed Balázs ELTE Genetikai Tanszék Endoszimbiotikus gén-transzfer (Timmis et al., 2004, Nat Rev Gen) Endoszimbiotikus
RészletesebbenI./1. fejezet: Jelátviteli utak szerepe a daganatok kialakulásában A daganatkeletkezés molekuláris háttere
I./1. fejezet: Jelátviteli utak szerepe a daganatok kialakulásában A daganatkeletkezés molekuláris háttere Kopper László A fejezet célja, hogy megismerje a hallgató a daganatok kialakulásában szerepet
RészletesebbenRoche Personalised Healthcare Megfelelő kezelést az egyénnek 2009 szeptember 9
Roche Personalised Healthcare Megfelelő kezelést az egyénnek 2009 szeptember 9 dr Kollár György Elvárás az egészségügytől Több hatékonyabb és biztonságosabb gyógyszer legyen elérhető 80 Kezelésre válaszolók
RészletesebbenA genetikai vizsgálatok jelene, jövője a Ritka Betegségek vonatkozásában
Budapest, 2014. február 22. Ritka Betegségek Világnapja A genetikai vizsgálatok jelene, jövője a Ritka Betegségek vonatkozásában dr. Kósa János PentaCore Laboratórium, Budapest Semmelweis Egyetem I. sz.
RészletesebbenCYP2C19 polimorfizmusok szerepe a clopidogrel rezisztencia vizsgálatában iszkémiás stroke-on átesett betegekben
CYP2C19 polimorfizmusok szerepe a clopidogrel rezisztencia vizsgálatában iszkémiás stroke-on átesett betegekben Bádogos Ágnes DE-ÁOK V. évfolyam Témavezető: Dr. Bagoly Zsuzsa Debreceni Egyetem, Általános
RészletesebbenPéldák a független öröklődésre
GENETIKAI PROBLÉMÁK Példák a független öröklődésre Az amelogenesis imperfecta egy, a fogzománc gyengeségével és elszíneződésével járó öröklődő betegség, a 4-es kromoszómán lévő enam gén recesszív mutációja
RészletesebbenAz X kromoszóma inaktívációja. A kromatin szerkezet befolyásolja a génexpressziót
Az X kromoszóma inaktívációja A kromatin szerkezet befolyásolja a génexpressziót Férfiak: XY Nők: XX X kromoszóma: nagy méretű több mint 1000 gén Y kromoszóma: kis méretű, kevesebb, mint 100 gén Kompenzációs
RészletesebbenAz orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen
Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen Azonosító szám: TÁMOP-4.1.2-08/1/A-2009-0011 Az orvosi
Részletesebben11. Dr. House. Biokémiai és sejtbiológiai módszerek alkalmazása az orvoslásban
11. Dr. House. Biokémiai és sejtbiológiai módszerek alkalmazása az orvoslásban HIV fertőzés kimutatása - (fiktív) esettanulmány 35 éves nő, HIV fertőzöttség gyanúja. Két partner az elmúlt időszakban. Fertőzött-e
Részletesebbengenetikai variációk, szerepük k a mindennapi transzfúziológiai ziológiai gyakorlatban
A vércsoport v rendszereket érintő genetikai variációk, szerepük k a mindennapi transzfúziológiai ziológiai gyakorlatban Tordai Attila OVSZK Molekuláris Diagnosztikai Labor Transzfúzi ziólógiai szinten
RészletesebbenAz orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen
Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen Azonosító szám: TÁMOP-4.1.2-08/1/A-2009-0011 Az orvosi
RészletesebbenOrvosi Genomtudomány 2014 Medical Genomics 2014. Április 8 Május 22 8th April 22nd May
Orvosi Genomtudomány 2014 Medical Genomics 2014 Április 8 Május 22 8th April 22nd May Hét / 1st week (9. kalendariumi het) Takács László / Fehér Zsigmond Magyar kurzus Datum/ido Ápr. 8 Apr. 9 10:00 10:45
RészletesebbenGyógyszerrezisztenciát okozó fehérjék vizsgálata
Gyógyszerrezisztenciát okozó fehérjék vizsgálata AKI kíváncsi kémikus kutatótábor 2017.06.25-07.01. Témavezetők : Telbisz Ágnes, Horváth Tamás Kutatók : Dobolyi Zsófia, Bereczki Kristóf, Horváth Ákos Gyógyszerrezisztencia
RészletesebbenAz egészségügyi miniszter 8013/2007. (EüK. 19.) EüM. tájékoztatója
Az egészségügyi miniszter 8013/2007. (EüK. 19.) EüM tájékoztatója az egészségügyi szakellátás társadalombiztosítási finanszírozásának egyes kérdéseirıl szóló 9/1993. (IV. 2.) NM rendelet 2. számú mellékletében
RészletesebbenA FISH technika alkalmazása az előnemesítésben
Linc Gabriella A FISH technika alkalmazása az előnemesítésben Czuczor Gergely Bencés Gimnázium és Kollégium Győr, 2016. április 13. www.meetthescientist.hu 1 26 - 1997-98 vendégkutató - növény genetikai
RészletesebbenXV. DOWN SZIMPÓZIUM Korszakváltás a klinikai genetikában
XV. DOWN SZIMPÓZIUM Korszakváltás a klinikai genetikában Kötelező szinten tartó tanfolyam Szervező: A Szegedi Tudományegyetem Általános Orvostudományi Kar Orvosi Genetikai Intézete PROGRAMFÜZET Helyszín:
RészletesebbenA Multi Locus Sequence Typing (MLST) alkalmazhatósága az élelmiszermikrobiológiában
A Multi Locus Sequence Typing (MLST) alkalmazhatósága az élelmiszermikrobiológiában Sipos Rita, Lukács Alena, Simon Janka, Szántó-Egész Réka, Micsinai Adrienn 2100 Gödöllő, Szent-Györgyi Albert út 4. info@biomi.hu,
RészletesebbenPrenaTest Újgenerációs szekvenálást és z-score
PrenaTest Újgenerációs szekvenálást és z-score számítást alkalmazó, nem-invazív prenatális molekuláris genetikai teszt a magzati 21-es triszómia észlelésére, anyai vérből végzett DNS izolálást követően
RészletesebbenBiológiai biztonság: Veszély: - közvetlen - közvetett
Biológiai biztonság Biológiai biztonság: Minden biológiai anyag potenciálisan kórokozó és szennyező; a biológiai biztonság ezen biológiai anyagok hatásaira (toxikus hatások, fertőzések) koncentrál és célja
RészletesebbenEvolúcióbiológia. Biológus B.Sc tavaszi félév
Evolúcióbiológia Biológus B.Sc. 2011. tavaszi félév A biológiában minden csak az evolúció fényében válik érthetővé Theodosius Dobzhansky : Nothing in biology makes sense except in the light of evolution.
RészletesebbenA genomiális medicina szép új világa
A genomiális medicina szép új világa HALADÁS A REUMATOLÓGIA, IMMUNOLÓGIA ÉS OSTEOLÓGIA TERÜLETÉN 2012 2014 2015. ÁPRILIS 16. Falus András Semmelweis Egyetem Genetikai Sejt és Immunbiológiai Intézet A medicina
RészletesebbenDNS replikáció. DNS RNS Polipeptid Amino terminus. Karboxi terminus. Templát szál
DNS replikáció DNS RNS Polipeptid Amino terminus Templát szál Karboxi terminus Szuper-csavarodott prokarióta cirkuláris DNS Hisztonok komplexe DNS hisztonokra történő felcsvarodása Hiszton-kötött negatív
RészletesebbenKromoszómák, Gének centromer
Kromoszómák, Gének A kromoszóma egy hosszú DNS szakasz, amely a sejt életének bizonyos szakaszában (a sejtosztódás előkészítéseként) tömörödik, így fénymikroszkóppal láthatóvá válik. A kromoszómák két
RészletesebbenBioinformatika 2 10.el
10.el őadás Prof. Poppe László BME Szerves Kémia és Technológia Tsz. Bioinformatika proteomika Előadás és gyakorlat 2009. 04. 24. Genomikavs. proteomika A genomika módszereivel nem a tényleges fehérjéket
RészletesebbenPETEFÉSZEK ELÉGTELENSÉG
PETEFÉSZEK ELÉGTELENSÉG Dr. Beke Artúr Semmelweis Egyetem I. Szülészeti és Nőgyógyászati Klinika Bevezetés POI (Primary Ovarian Insufficiency - primer petefészekelégtelenség) POF (Premature Ovarian Failure
RészletesebbenPopulációgenetikai. alapok
Populációgenetikai alapok Populáció = egyedek egy adott csoportja Az egyedek eltérnek egymástól morfológiailag, de viselkedésüket tekintve is = genetikai különbségek Fenotípus = külső jellegek morfológia,
RészletesebbenA bioinformatika gyökerei
A bioinformatika gyökerei 1944: Avery a transforming principle a DNS 1952: Hershey és Chase perdöntő bizonyíték: a bakteriofágok szaporodásakor csak a DNS jut be a sejtbe 1953: Watson és Crick a DNS szerkezete
RészletesebbenTÉMAKÖRÖK. Ősi RNS világ BEVEZETÉS. RNS-ek tradicionális szerepben
esirna mirtron BEVEZETÉS TÉMAKÖRÖK Ősi RNS világ RNS-ek tradicionális szerepben bevezetés BIOLÓGIAI MOLEKULÁK FEHÉRJÉK NUKLEINSAVAK DNS-ek RNS-ek BIOLÓGIAI MOLEKULÁK FEHÉRJÉK NUKLEINSAVAK DNS-ek RNS-ek
RészletesebbenThe nontrivial extraction of implicit, previously unknown, and potentially useful information from data.
Budapesti Műszaki és Gazdaságtudományi Egyetem Méréstechnika és Információs rendszerek Tanszék Adatelemzés intelligens módszerekkel Hullám Gábor Adatelemzés hagyományos megközelítésben I. Megválaszolandó
RészletesebbenGenetika 3 ea. Bevezetés
Genetika 3 ea. Mendel törvényeinek a kiegészítése: Egygénes öröklődés Többtényezős öröklődés Bevezetés Mendel által vizsgált tulajdonságok: diszkrétek, két különböző fenotípus Humán tulajdonságok nagy
RészletesebbenBiobank Hálózat kialakításának minőségügyi kérdései a Semmelweis Egyetemen
Biobank Hálózat kialakításának minőségügyi kérdései a Semmelweis Egyetemen Magyarósi Szilvia Molnár Mária Judit SE Genomikai Medicina és Ritka Betegségek Intézete Semmelweis Egyetem DEMIN 2014. május 22.
RészletesebbenA DNS szerkezete. Genom kromoszóma gén DNS genotípus - allél. Pontos méretek Watson genomja. J. D. Watson F. H. C. Crick. 2 nm C G.
1955: 46 emberi kromoszóma van 1961: mrns 1975: DNS szekvenálás 1982: gén-bank adatbázisok 1983: R (polymerase chain reaction) Mérföldkövek 1 J. D. Watson F. H.. rick 2008 1953 2003 Watson genomja DNS
RészletesebbenMolekuláris neurológia
Molekuláris neurológia Molekuláris neurológia Neurológiai vizsgálat, genetikai tanácsadás Professzori vizsgálat Professzori kontroll vizsgálat Docensi/főorvosi vizsgálat Docensi/főorvosi kontroll vizsgálat
RészletesebbenTudománytörténeti visszatekintés
GENETIKA I. AZ ÖRÖKLŐDÉS TÖRVÉNYSZERŰSÉGEI Minek köszönhető a biológiai sokféleség? Hogyan történik a tulajdonságok átörökítése? Tudománytörténeti visszatekintés 1. Keveredés alapú öröklődés: (1761-1766,
RészletesebbenGenomadatbázisok Ld. Entrez Genome: Összes ismert genom, hierarchikus szervezésben (kromoszóma, térképek, gének, stb.)
Genomika Új korszak, paradigmaváltás, forradalom: a teljes genomok ismeretében a biológia adatokban gazdag tudománnyá válik. Új kutatási módszerek, új szemlélet. Hajtóerõk: Genomszekvenálási projektek
RészletesebbenBakteriális identifikáció 16S rrns gén szekvencia alapján
Bakteriális identifikáció 16S rrns gén szekvencia alapján MOHR ANITA SIPOS RITA, SZÁNTÓ-EGÉSZ RÉKA, MICSINAI ADRIENN 2100 Gödöllő, Szent-Györgyi Albert út 4. info@biomi.hu, www.biomi.hu TÖRZS AZONOSÍTÁS
RészletesebbenMikroszatellita instabilitás immunhisztokémiai kimutatása colorectális carcinomában: antitestek, módszerek, standardizálás
Mikroszatellita instabilitás immunhisztokémiai kimutatása colorectális carcinomában: antitestek, módszerek, standardizálás Dr. Krenács Tibor Semmelweis Egyetem I. sz. Patológiai és Kísérleti Rákkutató
RészletesebbenORVOSI LABORATÓRIUMI DIAGNOSZTIKA
ORVOSI LABORATÓRIUMI DIAGNOSZTIKA Általános Laboratóriumi Diagnosztika és Molekuláris Vizsgálatok 1. Referencia tartomány, terápiás tartomány, cut off értékek 2. Szenzitivitás, specificitás, prediktív
RészletesebbenI. A sejttől a génekig
Gén A gének olyan nukleinsav-szakaszok a sejtek magjainak kromoszómáiban, melyek a szervezet működését és növekedését befolyásoló fehérjék szabályozásához és előállításához szükséges információkat tartalmazzák.
RészletesebbenMit tud a genetika. Génterápiás lehetőségek MPS-ben. Dr. Varga Norbert
Mit tud a genetika Génterápiás lehetőségek MPS-ben Dr. Varga Norbert Oki terápia Terápiás lehetőségek MPS-ben A kiváltó okot gyógyítja meg ERT Enzimpótló kezelés Őssejt transzplantáció Genetikai beavatkozások
RészletesebbenA PET szerepe a gyógyszerfejlesztésben. Berecz Roland DE KK Pszichiátriai Tanszék
A PET szerepe a gyógyszerfejlesztésben Berecz Roland DE KK Pszichiátriai Tanszék Gyógyszerfejlesztés Felfedezés gyógyszertár : 10-15 év Kb. 1 millárd USD/gyógyszer (beleszámolva a sikertelen fejlesztéseket)
RészletesebbenAz ABCG2 multidrog transzporter fehérje szerkezetének és működésének vizsgálata
Az ABCG2 multidrog transzporter fehérje szerkezetének és működésének Kutatási előzmények Az ABC transzporter membránfehérjék az ATP elhasítása (ATPáz aktivitás) révén nyerik az energiát az általuk végzett
RészletesebbenAz emberi erőforrás értéke
Szabó László SZABÓ LÁSZLÓ Az emberi erőforrás értéke A génvizsgálat, mint egészségügyi prevenció Az emberi tényező fontos elem a stratégiai kezdeményezésekben, a versenyelőny megszerzésében és megtartásában.
RészletesebbenA laboratóriumi medicina fejlődése az elmúlt 35 évben
A laboratóriumi medicina fejlődése az elmúlt 35 évben Kovács L. Gábor egyetemi tanár, az MTA rendes tagja Pécsi Tudományegyetem 1976 2011? INTÉZETIGAZGATÓ PROFESSZOROK KLINIKAI KÉMIA 1976 Mérleg Spektrofotométer
Részletesebben10. CSI. A molekuláris biológiai technikák alkalmazásai
10. CSI. A molekuláris biológiai technikák alkalmazásai A DNS mint azonosító 3 milliárd bázispár az emberi DNS-ben (99.9%-ban azonos) 0.1%-nyi különbség elegendő az egyedek megkülönböztetéséhez Genetikai
RészletesebbenGénkifejeződési vizsgálatok. Kocsy Gábor
Génkifejeződési vizsgálatok MTA Mezőgazdasági Kutatóintézete Növényi Molekuláris Biológia Osztály A génkifejeződés A sejtmag géneket tartalmaz; (fehérjéket, RNSeket kódoló); A gének átíródnak mrns; Pre-mRNS
RészletesebbenAz orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen
Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen Azonosító szám: TÁMOP-4.1.2-08/1/A-2009-0011 Az orvosi
RészletesebbenTerhesség és emlőrák genetikai szempontok. Kosztolányi György PTE Orvosi Genetikai Intézet
erhesség és emlőrák genetikai szempontok Kosztolányi yörgy PE Orvosi enetikai Intézet Előfordulás 1 emlőrák / 3000 várandós fokozódása várható: öröklődő emlőrák diagnózisa családon belül : I. generáció
RészletesebbenAz Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP-4.1.2-08/1/A-2009-0010 projekt
Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP-4.1.2-08/1/A-2009-0010 projekt ÁLLATGENETIKA Debreceni Egyetem Nyugat-magyarországi Egyetem Pannon Egyetem A projekt az Európai Unió támogatásával, az
RészletesebbenSugárbiológiai ismeretek: LNT modell. Sztochasztikus hatások. Daganat epidemiológia. Dr. Sáfrány Géza OKK - OSSKI
Sugárbiológiai ismeretek: LNT modell. Sztochasztikus hatások. Daganat epidemiológia Dr. Sáfrány Géza OKK - OSSKI Az ionizáló sugárzás biológiai hatásai Determinisztikus hatás Sztochasztikus hatás Sugársérülések
Részletesebben