Génkifejeződési vizsgálatok. Kocsy Gábor

Méret: px
Mutatás kezdődik a ... oldaltól:

Download "Génkifejeződési vizsgálatok. Kocsy Gábor"

Átírás

1 Génkifejeződési vizsgálatok MTA Mezőgazdasági Kutatóintézete Növényi Molekuláris Biológia Osztály

2 A génkifejeződés A sejtmag géneket tartalmaz; (fehérjéket, RNSeket kódoló); A gének átíródnak mrns; Pre-mRNS vagy hn-rns szintetizálódik; RNS-utófeldolgozás vagy érés; Az RNS a citoplazmába szállítódik; Fehérjévé fordítódik a riboszómákon transzláció.

3 Génkifejeződés A kromatin szerkezet fellazulása DNS hn-rns Transzkripciós kontroll utófeldolgozás Transzkripciós faktorok: DNS kötő fehérjék jellegzetes motívumokkal Transzport kontroll mrns stabilitás Inaktív mrns Transzláció A fehérje poszt-transzlációs módosulása Aktív vagy inaktív fehérje

4 Az eukarióta, fehérjét kódoló gének szerkezete Promóter: 5 szabályozó szekvenciák 5 nem kódoló régió: 5 fehérjét és RNS-t nem kódoló szekvenciák Kódoló régió: fehérjék, rrns és trns kódjai (exonok, intronok) 3 nem kódoló régió: fehérjét és RNS-t nem kódoló régiók 3 STOP jel

5 Az eukarióta gének szerkezete Gén Átíródó régió Promóter/ A transzkripció megindulásának szabályozására Fehérjét kódoló szakaszok Terminátor

6 Az eukarióta struktúrgén szerkezete

7 Promóterek A transzkripció cisz elemei, a DNS molekula szabályozó szakaszai, amelyekhez az RNS polimeráz enzimek és a transzkripciós faktorok kapcsolódnak.

8 Promóterek típusai Konstitutív promóter: nem szabályozott promóter, amely a hozzátartozó gén folyamatos átírását biztosítja, állandó nemspecifikus génexpressziót eredményezve. Indukálható vagy induktív promóter: környezeti tényezők hatására aktiválódó promóterek.

9 A promóterek főbb típusai

10 Indukálható promóterek TetR: Tn10 kódolta Tet represszor; 35S CaMV: karfiol mozaikvírusból származó konstitutív promóter; Tc: tetraciklin

11 A génkifejeződés szabályozása géncsendesítéssel Először petúniában írták le Az antocianin-szintézisben szerepet játszó kalkon-szintáz génjét fejeztették ki fokozott mértékben a virág színének sötétítése céljából. Az eredmény pigmenthiány lett a koszupresszió jelensége miatt.

12 A géncsendesítés kis RNS-eken alapuló mechanizmusa (endoribonuclease) (RNA-induced silencing complex)

13 A környezeti és anyagcsere-változások hatása a génkifejeződésre Környezeti hatás Érzékelés (szignálpercepció) Jelátvitel (szignáltranszdukció) Anyagcsere változások Génexpresszió regulátorgének (transzkripciós faktorok) struktúrgének

14 A génkifejeződés szabályozása Környezeti hatás Fejlődés, növekedés Indukció Módosítás Lebontás Téglalapban A, B, C: cisz-elemek, Körben A, B, C: transzkripciós faktorok, Ub: Ubiquitin Yamaguchi-Shinozaki and Shinozaki, Trends Plant Sci, 10:88-94, 2005 RNS-polimeráz Gén

15 A génkifejeződést szabályozó jelátviteli utak Szárazság Hideg ABA-független útvonal Ca ABA-függő útvonal ABA: abszcizinsav, AREB: ABRE-kötő fehérjék, ABRE: ABA-függő elemek, CBF: C-ismétlődést kötő elem, DRE/CRT: dehidrációra válaszoló elem, DREB: DRE-kötő fehérje, ICE: CBF-kifejeződés indukálója Shinozaki és mtsai, Curr. Op Plant Biol, 6: , 2003

16 Módszerek a génexpresszió tanulmányozására Növényi kivonatokban végzett vizsgálatok egyes gének expressziójának vizsgálata Northern analízis RT-PCR transzkriptom-analízis több ezer gén expressziójának egyidejű vizsgálata array következő generációs, nagy hatékonyságú módszerek In situ vizsgálatok metszetekben vagy élő sejtekben és szövetekben hibridizáción alapuló közvetlen módszer látható terméken alapuló közvetett módszer

17 Génkifejeződés kivonatokban: Northern analízis Lépések: RNS-izolálás elválasztás agarózgélen átvitel Nylon-membránra hibridizáció jelölő próbával Időigényes: 1 hét Ca-kötő p. 26S rrna CS CS(Tsp5A) CS(Ch5A) 18/15 C 2/2 C h h d 18/15 C 2/2 C h h d 18/15 C 2/ 2 C h h d A Ca-kötő fehérje génjének expressziós változásai a hidegkezelés során búzában Itt 32 P-vel jelölt nukleotiddal készült hibridizációs próbát használtunk Lehet nem-radioaktív próbát is használni pl. fluoreszcens jelölés

18 Normalizált mennyiség Normalizált mennyiség Génkifejeződés kivonatokban: valós idejű (real time) RT-PCR Lépések: Gyors: 2 nap RNS-izolálás cdns (másolat DNS) készítése reverz transzkripcióval (RT) DNS-felszaporítás PCR-rel (polimeráz láncreakció) fluoreszcensen jelölt termék folyamatos detektálása a reakció közben adatelemzés a beépített programmal A Ca-kötő fehérje génjének expressziós változásai a hidegkezelés során búzában Rövid távú változások Hosszú távú változások 0, ,06 2 0,04 0, ,02-0,04 óra CS-C CS-2 CS(Tsp5A)-C CS(Tsp5A)-2 CS(Ch5A)-C CS(Ch5A) nap CS CS(Tsp5A) CS(Ch5A)

19 Génkifejeződés kivonatokban: array módszer transzkriptom-elemzés Array: sorrend; a hibridizációhoz használt cdns vagy oligonukleotid szekvenciákat sorokba rendezve viszik fel valamilyen hordozóra Transzkriptom-elemzés: az mrns-ek és a nem kódoló RNS-ek összeségének egyidejű elemzése Felhasználás: gének kiválasztására, az eredményeket más módszerrel (RT-PCR) meg kell erősíteni Csoportosítás: méret szerint: macroarray hordozó 8 12 cm-es Nylon-membrán, g RNS szükséges hozzá, gén expressziójának egyidejű vizsgálatára alkalmas, radioaktív jelölés microarray hordozó tárgylemez, 1-2 g RNS szükséges hozzá, gén expressziójának egyidejű vizsgálatára alkalmas, fluoreszcens jelölés felvitt nukleotidszekvencia szerint: cdns-array baktériumokban klónozott, PCR-rel felszaporított, nukleotidnyi EST (expressed sequenced tag szekvenált nukleotid hosszú cdns, melyeket cdnskönyvtárakból határoznak meg) szekvenciákat visznek fel, kevésbé specifikus oligonukleotid-array adatbázisok szekvenciái alapján nukleotidnyi oligonukleotidokat szintetizálnak és visznek fel, specifikusabb 3 végre tervezett Időigény: RNS-izolálás, cdns-szintézis, hibridizáció, fényképezés 2-3 hét adatelemzés minimum 2-3 hónap

20 Génkifejeződés kivonatokban: array módszer transzkriptom-elemzés A transzkriptom-elemzés mérföldkővei:

21 Génkifejeződés kivonatokban: cdns-macroarray módszer A búza 5A kromoszómájának hatása a transzkripciós mintázatra a 3 hetes hidegedzés során eltérő fagytűrésű búza genotípusokban Búza cdns hibridizálása árpa cdns macroarray-hez heterológ hibridizáció CS fagyérzékeny CS(Tsp5A) mérs. fagyérzékeny A vizsgált egyedi gén közül 921 volt hidegfüggő, 174 kifejeződésére volt hatással az 5A kromoszóma CS(Ch5A) fagytűrő N. Stein, IPK, Gatersleben, Németo., 2005

22 CS CS(Tsp5A) CS(Ch5A) CS CS(Tsp5A) CS(Ch5A) CS CS(Tsp5A) CS(Ch5A) CS CS(Tsp5A) CS(Ch5A) Génkifejeződés kivonatokban: cdns-macroarray módszer Az 5A kromoszóma által befolyásolt és a hidegedzés elején nagy átmeneti expressziós növekedést mutató gének nap (2 C) Glutation-S-transzferáz Hideg akklimatizációs fehérje Ca-kötő fehérje Szacharóz-szintetáz 1 -Amiláz Dehidrin 4 Dehidrin 6 Lektin prekurzor LEA 14A fehérje Embrió-specifikus fehérje Log 2 (gén-központosított jelerősség) CS: Chinese Spring mérsékelten fagyérzékeny CS(Tsp5A): Chinese Spring (Triticum spelta 5A) fagyérzékeny CS(Ch5A): Chinese Spring (Cheyenne 5A) fagytűrő

23 Génkifejeződés kivonatokban: oligonukleotid-microarray módszer Homológ hibridizáció: búzachip búza cdns-sel, oligonukleotid Festés: kontroll zöld, kezelt piros fluoreszcens festék Első hibridizáció: kontroll, 1 nap 2 C; CS, Ch, CS(Ch5A), CS(Tsp5A) számos gén (antioxidánsok, Ca 2+ -kötő fehérje) esetében a cdns-macroarray-jel azonos az eredmény

24 Génkifejeződés kivonatokban: Transzkriptom-elemzés következő generációs, nagy hatékonyságú módszerekkel A következő generációs transzkriptom-elemzés szekvenáláson alapul. A szekvenáláson alapuló módszerek összehasonlítása: Genomi DNS cdns Sanger-féle dideoxinukleotidos módszer - drága A génexpresszió elemzése sorozatban direkt mérés, új szekvenciák detektálása Következő generációs módszerek véletlen elhelyezkedő rövid szekvenciák Adott szekvencia leolvasási gyakoriságából meghatározható a megfelelő gén kifejeződése Morozova et al. (2009), Annu. Rev. Genom.Human Genet., 10:

25 Génkifejeződés kivonatokban: Transzkriptom-elemzés következő generációs, nagy hatékonyságú módszerekkel

26 Génkifejeződés kivonatokban: Transzkriptom-elemzés következő generációs, nagy hatékonyságú módszerekkel

27 Transzkriptom-mintázatok elemzése - > Rendszerbiológia Cél: a rendelkezésre álló adattengerből értelmezhető tudás megszerzése automatizált módon, bioinformatikai eszközökkel Módszer: különböző kísérleti rendszerekből származó komplex adathalmazok megszerzése, integrálása, analizálása, az adatokból kölcsönhatási rendszerek, hálózatok létrehozása interdiszciplinális eszközökkel. Felhasznált tudományterületek: Infraindividuális rendszerbiológia szervezet, szövet, sejt szintű kölcsönhatások leírása Genomika: szervezet (szövet vagy sejt) szintű DNS-szekvenciák leírása Epigenomika: szervezet szintű, nem a genomban kódolt szabályozó folyamatok (DNS-metilálás) tanulmányozása Transzkriptomika: szervezet szintű génexpressziós mintázatok vizsgálat Interferomika: szervezet szintű korrekciós folyamatok (RNS interferencia) leírása. Proteomika: fehérje mintázatok tanulmányozása Metabolomika: anyagcseretermék mintázatok tanulmányozása (részterület: glikomika, lipidomika) Interaktomika: szervezet, szövet és sejt szintű kölcsönhatások leírása a molekulák közt Fluxomika: molekluláris dinamikai változások leírása Szupraindividuális rendszerbiológia - a fajjal és a magasabb rendszertani egységekkel foglalkozik Biomika: a Föld különböző éghajlatú, flórájú és faunájú területei közti kölcsönhatások leírása Hierarchikus rendszerbiológia: különböző szerveződésű szintek közti kölcsönhatások leírása molekula sejt szervezet faj populáció életközösség különböző fajokkal Alkalmazás: gyógyszertervezés, megelőző gyógyítás, rendszerelméletű természetvédelem és mezőgazdaság.

28 In situ génkifejeződés: hibridizáción alapuló közvetlen kimutatás metszetekben A leafy (leveles, virágmerisztéma differenciálódásáért felelős) gén kifejeződése (narancssárga szín) a virágkezdeményből és az embriózsákból készült metszeteken fluoreszcens festéssel (fast red) Arabidopsisban. Takechi et al. (1999), Plant Mol Biol Rep,, 17: 43-51

29 In situ génkifejeződés: közvetlen kimutatás RT-PCR-rel metszetekben 18S rrns kifejeződése a Zinnia elegans epikotil metszeteiben RT-PCR-rel. A PCR-reakcióhoz használt egyik nukleotidot fluoreszcensen jelölték. A nyilak a faedényekben jelzik a génkifejeződést. Pasquet et al. (2004) Plant J, 39:

30 In situ génkifejeződés: közvetlen kimutatás hibridizációval teljes növényben 32 P-tal jelzett vírus RNS kimutatása Arabidopsis levelekben Kong, Simon (1998): Arabidopsis protocols, p , Humana Press,

31 In situ génkifejeződés: közvetett kimutatás teljes növényben Alapja valamely jól detektálható termék képződése, pl. zöld fluoreszkáló fehérje, luciferáz Példa: luciferáz gén összekapcsolása stressz által bekapcsolható promóterrel (DREB1::luc; DREB1: drought-responsive element binding factor1, stressz indukálható transzkripciós faktor; luc: luciferáz, luciferinből lumineszkáló terméket képez), Arabidopsis transzformálása vad típus transzformáns vad típus transzformáns vad típus transzformáns 12 h 0 C-on sötétben 5 h 300 mm NaCl 3 h 100 M ABS

NÖVÉNYGENETIKA. Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP /1/A

NÖVÉNYGENETIKA. Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP /1/A NÖVÉNYGENETIKA Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP-4.1.2-08/1/A-2009-0010 A citológia és a genetika társtudománya Citogenetika A kromoszómák eredetét, szerkezetét, genetikai funkcióját,

Részletesebben

Antiszenz hatás és RNS interferencia (a génexpresszió befolyásolásának régi és legújabb lehetőségei)

Antiszenz hatás és RNS interferencia (a génexpresszió befolyásolásának régi és legújabb lehetőségei) Antiszenz hatás és RNS interferencia (a génexpresszió befolyásolásának régi és legújabb lehetőségei) Az antiszenz elv története Reverz transzkripció replikáció transzkripció transzláció DNS DNS RNS Fehérje

Részletesebben

Kromoszómák, Gének centromer

Kromoszómák, Gének centromer Kromoszómák, Gének A kromoszóma egy hosszú DNS szakasz, amely a sejt életének bizonyos szakaszában (a sejtosztódás előkészítéseként) tömörödik, így fénymikroszkóppal láthatóvá válik. A kromoszómák két

Részletesebben

Genomadatbázisok Ld. Entrez Genome: Összes ismert genom, hierarchikus szervezésben (kromoszóma, térképek, gének, stb.)

Genomadatbázisok Ld. Entrez Genome: Összes ismert genom, hierarchikus szervezésben (kromoszóma, térképek, gének, stb.) Genomika Új korszak, paradigmaváltás, forradalom: a teljes genomok ismeretében a biológia adatokban gazdag tudománnyá válik. Új kutatási módszerek, új szemlélet. Hajtóerõk: Genomszekvenálási projektek

Részletesebben

I. A sejttől a génekig

I. A sejttől a génekig Gén A gének olyan nukleinsav-szakaszok a sejtek magjainak kromoszómáiban, melyek a szervezet működését és növekedését befolyásoló fehérjék szabályozásához és előállításához szükséges információkat tartalmazzák.

Részletesebben

DNS-szekvencia meghatározás

DNS-szekvencia meghatározás DNS-szekvencia meghatározás Gilbert 1980 (1958) Sanger 3-1 A DNS-polimerázok jellemzői 5'-3' polimeráz aktivitás 5'-3' exonukleáz 3'-5' exonukleáz aktivitás Az új szál szintéziséhez kell: templát DNS primer

Részletesebben

TÉMAKÖRÖK. Ősi RNS világ BEVEZETÉS. RNS-ek tradicionális szerepben

TÉMAKÖRÖK. Ősi RNS világ BEVEZETÉS. RNS-ek tradicionális szerepben esirna mirtron BEVEZETÉS TÉMAKÖRÖK Ősi RNS világ RNS-ek tradicionális szerepben bevezetés BIOLÓGIAI MOLEKULÁK FEHÉRJÉK NUKLEINSAVAK DNS-ek RNS-ek BIOLÓGIAI MOLEKULÁK FEHÉRJÉK NUKLEINSAVAK DNS-ek RNS-ek

Részletesebben

transzláció DNS RNS Fehérje A fehérjék jelenléte nélkülözhetetlen minden sejt számára: enzimek, szerkezeti fehérjék, transzportfehérjék

transzláció DNS RNS Fehérje A fehérjék jelenléte nélkülözhetetlen minden sejt számára: enzimek, szerkezeti fehérjék, transzportfehérjék Transzláció A molekuláris biológia centrális dogmája transzkripció transzláció DNS RNS Fehérje replikáció Reverz transzkriptáz A fehérjék jelenléte nélkülözhetetlen minden sejt számára: enzimek, szerkezeti

Részletesebben

RNS SZINTÉZIS ÉS ÉRÉS

RNS SZINTÉZIS ÉS ÉRÉS RNS SZINTÉZIS ÉS ÉRÉS A genom alapvetõ funkciója, hogy a sejt mûködéséhez esszenciális gépek (fehérjék) elõállí tására vonatkozó információt tartalmazza. A DNS-ben rejlõ információ egy kétlépéses folyamatban

Részletesebben

Biológiai módszerek alkalmazása környezeti hatások okozta terhelések kimutatására

Biológiai módszerek alkalmazása környezeti hatások okozta terhelések kimutatására Szalma Katalin Biológiai módszerek alkalmazása környezeti hatások okozta terhelések kimutatására Témavezető: Dr. Turai István, OSSKI Budapest, 2010. október 4. Az ionizáló sugárzás sejt kölcsönhatása Antone

Részletesebben

13. RNS szintézis és splicing

13. RNS szintézis és splicing 13. RNS szintézis és splicing 1 Visszatekintés: Az RNS típusai és szerkezete Hírvivő RNS = mrns (messenger RNA = mrna) : fehérjeszintézis pre-mrns érett mrns (intronok kivágódnak = splicing) Transzfer

Részletesebben

A szamóca érése során izolált Spiral és Spermidin-szintáz gén jellemzése. Kiss Erzsébet Kovács László

A szamóca érése során izolált Spiral és Spermidin-szintáz gén jellemzése. Kiss Erzsébet Kovács László A szamóca érése során izolált Spiral és Spermidin-szintáz gén jellemzése Kiss Erzsébet Kovács László Bevezetés Nagy gazdasági gi jelentıségük k miatt a gyümölcs lcsök, termések fejlıdésének mechanizmusát

Részletesebben

10. Genomika 2. Microarrayek és típusaik

10. Genomika 2. Microarrayek és típusaik 10. Genomika 2. 1. Microarray technikák és bioinformatikai vonatkozásaik Microarrayek és típusaik Korrelált génexpresszió mint a funkcionális genomika eszköze 2. Kombinált megközelítés a funkcionális genomikában

Részletesebben

Fehérje expressziós rendszerek. Gyógyszerészi Biotechnológia

Fehérje expressziós rendszerek. Gyógyszerészi Biotechnológia Fehérje expressziós rendszerek Gyógyszerészi Biotechnológia Expressziós rendszerek Cél: rekombináns fehérjék előállítása nagy tisztaságban és nagy mennyiségben kísérleti ill. gyakorlati (therapia) felhasználásokra

Részletesebben

Hamar Péter. RNS világ. Lánczos Kornél Gimnázium, Székesfehérvár, 2014. október 21. www.meetthescientist.hu 1 26

Hamar Péter. RNS világ. Lánczos Kornél Gimnázium, Székesfehérvár, 2014. október 21. www.meetthescientist.hu 1 26 Hamar Péter RNS világ Lánczos Kornél Gimnázium, Székesfehérvár, 2014. október 21. 1 26 Főszereplők: DNS -> RNS -> fehérje A kód lefordítása Dezoxy-ribo-Nuklein-Sav: DNS az élet kódja megkettőződés (replikáció)

Részletesebben

Új genetikai stratégia kidolgozása az Arabidopsis stressz válaszát szabályzó gének azonosítására

Új genetikai stratégia kidolgozása az Arabidopsis stressz válaszát szabályzó gének azonosítására Új genetikai stratégia kidolgozása az Arabidopsis stressz válaszát szabályzó gének azonosítására Tézisfüzet Papdi Csaba Témavezető: Dr. Szabados László MTA Szegedi Biológiai Központ Növénybiológia Intézet

Részletesebben

A termesztett búza diploid őseinek molekuláris citogenetikai elemzése: pachytén- és fiber-fish.

A termesztett búza diploid őseinek molekuláris citogenetikai elemzése: pachytén- és fiber-fish. OTKA K67808 zárójelentés 2012. A termesztett búza diploid őseinek molekuláris citogenetikai elemzése: pachytén- és fiber-fish. A fluoreszcens in situ hibridizáció (FISH) olyan technikai fejlettséget ért

Részletesebben

TEMATIKA Biokémia és molekuláris biológia IB kurzus (bb5t1301)

TEMATIKA Biokémia és molekuláris biológia IB kurzus (bb5t1301) Biokémia és molekuláris biológia I. kurzus (bb5t1301) Tematika 1 TEMATIKA Biokémia és molekuláris biológia IB kurzus (bb5t1301) 0. Bevezető A (a biokémiáról) (~40 perc: 1. heti előadás) A BIOkémia tárgya

Részletesebben

Az X kromoszóma inaktívációja. A kromatin szerkezet befolyásolja a génexpressziót

Az X kromoszóma inaktívációja. A kromatin szerkezet befolyásolja a génexpressziót Az X kromoszóma inaktívációja A kromatin szerkezet befolyásolja a génexpressziót Férfiak: XY Nők: XX X kromoszóma: nagy méretű több mint 1000 gén Y kromoszóma: kis méretű, kevesebb, mint 100 gén Kompenzációs

Részletesebben

TDK lehetőségek az MTA TTK Enzimológiai Intézetben

TDK lehetőségek az MTA TTK Enzimológiai Intézetben TDK lehetőségek az MTA TTK Enzimológiai Intézetben Vértessy G. Beáta egyetemi tanár TDK mind 1-3 helyezettek OTDK Pro Scientia különdíj 1 második díj Diákjaink Eredményei Zsűri különdíj 2 első díj OTDK

Részletesebben

NUKLEINSAVAK. Nukleinsav: az élő szervezetek sejtmagvában és a citoplazmában található, az átöröklésben szerepet játszó, nagy molekulájú anyag

NUKLEINSAVAK. Nukleinsav: az élő szervezetek sejtmagvában és a citoplazmában található, az átöröklésben szerepet játszó, nagy molekulájú anyag NUKLEINSAVAK Nukleinsav: az élő szervezetek sejtmagvában és a citoplazmában található, az átöröklésben szerepet játszó, nagy molekulájú anyag RNS = Ribonukleinsav DNS = Dezoxi-ribonukleinsav A nukleinsavak

Részletesebben

DNS replikáció. DNS RNS Polipeptid Amino terminus. Karboxi terminus. Templát szál

DNS replikáció. DNS RNS Polipeptid Amino terminus. Karboxi terminus. Templát szál DNS replikáció DNS RNS Polipeptid Amino terminus Templát szál Karboxi terminus Szuper-csavarodott prokarióta cirkuláris DNS Hisztonok komplexe DNS hisztonokra történő felcsvarodása Hiszton-kötött negatív

Részletesebben

ADATBÁNYÁSZAT I. ÉS OMICS

ADATBÁNYÁSZAT I. ÉS OMICS Az élettudományi-klinikai felsőoktatás gyakorlatorientált és hallgatóbarát korszerűsítése a vidéki képzőhelyek nemzetközi versenyképességének erősítésére TÁMOP-4.1.1.C-13/1/KONV-2014-0001 ADATBÁNYÁSZAT

Részletesebben

A replikáció mechanizmusa

A replikáció mechanizmusa Az öröklődés molekuláris alapjai A DNS megkettőződése, a replikáció Szerk.: Vizkievicz András A DNS-molekula az élőlények örökítő anyaga, kódolt formában tartalmazza mindazon információkat, amelyek a sejt,

Részletesebben

A FISH technika alkalmazása az előnemesítésben

A FISH technika alkalmazása az előnemesítésben Linc Gabriella A FISH technika alkalmazása az előnemesítésben Czuczor Gergely Bencés Gimnázium és Kollégium Győr, 2016. április 13. www.meetthescientist.hu 1 26 - 1997-98 vendégkutató - növény genetikai

Részletesebben

Molekuláris biológiai eljárások alkalmazása a GMO analitikában és az élelmiszerbiztonság területén

Molekuláris biológiai eljárások alkalmazása a GMO analitikában és az élelmiszerbiztonság területén Molekuláris biológiai eljárások alkalmazása a GMO analitikában és az élelmiszerbiztonság területén Dr. Dallmann Klára A molekuláris biológia célja az élőlények és sejtek működésének molekuláris szintű

Részletesebben

I. Az örökítő anyag felfedezése

I. Az örökítő anyag felfedezése 1 I. Az örökítő anyag felfedezése Az alábbi feladatokban az egy vagy több helyes választ kell kiválasztanod! 1. Mendel egyik legfontosabb meglátása az volt, hogy (1) A. tiszta származéksorokat hozott létre,

Részletesebben

5. Molekuláris biológiai technikák

5. Molekuláris biológiai technikák 5. Molekuláris biológiai technikák DNS szaporítás kémcsőben és élőben. Klónozás, PCR, cdna, RT-PCR, realtime-rt-pcr, Northern-, Southernblotting, génexpresszió, FISH 5. Molekuláris szintű biológiai technikák

Részletesebben

GENOMIKA TÖBBFÉLE MAKROMOLEKULA VIZSGÁLATA EGYIDŐBEN

GENOMIKA TÖBBFÉLE MAKROMOLEKULA VIZSGÁLATA EGYIDŐBEN GENOMIKA TÖBBFÉLE MAKROMOLEKULA VIZSGÁLATA EGYIDŐBEN Strukturális genomika Genomkönyvtárak DNS szekvenálás Genom programok Polimorfizmusok RFLP DNS könyvtár készítés humán genom 1. Emésztés RE-kal Emberi

Részletesebben

RNS-ek. 1. Az ősi RNS Világ: - az élet hajnalán. 2. Egy már ismert RNS Világ: - a fehérjeszintézis ben résztvevő RNS-ek

RNS-ek. 1. Az ősi RNS Világ: - az élet hajnalán. 2. Egy már ismert RNS Világ: - a fehérjeszintézis ben résztvevő RNS-ek RNS-ek RNS-ek 1. Az ősi RNS Világ: - az élet hajnalán 2. Egy már ismert RNS Világ: - a fehérjeszintézis ben résztvevő RNS-ek 3. Egy újonnan felfedezett RNS Világ: - szabályozó RNS-ek 4. Transzkripció Ősi

Részletesebben

Génexpresszió prokariótákban 1

Génexpresszió prokariótákban 1 β-galaktozidáz-szint laktóz elfogy a laktóz Génexpresszió prokariótákban 1 14. A GÉNEXPRESSZIÓ SZABÁ- LYOZÁSA PROKARIÓTÁKBAN Enzimindukció, indukálható operon. Policisztronos. Katabolit represszió, represszálható

Részletesebben

Epigenetikai mintázatok biomarkerként történő felhasználási lehetőségei a toxikológiában

Epigenetikai mintázatok biomarkerként történő felhasználási lehetőségei a toxikológiában Epigenetikai mintázatok biomarkerként történő felhasználási lehetőségei a toxikológiában Czimmerer Zsolt, Csenki-Bakos Zsolt, Urbányi Béla TOX 2017 Tudományos Konferencia 2017.10.12. Bükfürdő A sejtek

Részletesebben

A géntechnológia genetikai alapjai (I./3.)

A géntechnológia genetikai alapjai (I./3.) Az I./2. rész (Gének és funkciójuk) rövid összefoglalója A gének a DNS információt hordozó szakaszai, melyekben a 4 betű (ATCG) néhány ezerszer, vagy százezerszer ismétlődik. A gének önálló programcsomagként

Részletesebben

Bakteriális identifikáció 16S rrns gén szekvencia alapján

Bakteriális identifikáció 16S rrns gén szekvencia alapján Bakteriális identifikáció 16S rrns gén szekvencia alapján MOHR ANITA SIPOS RITA, SZÁNTÓ-EGÉSZ RÉKA, MICSINAI ADRIENN 2100 Gödöllő, Szent-Györgyi Albert út 4. info@biomi.hu, www.biomi.hu TÖRZS AZONOSÍTÁS

Részletesebben

Epigenetikai Szabályozás

Epigenetikai Szabályozás Epigenetikai Szabályozás Kromatin alapegysége a nukleoszóma 1. DNS Linker DNS Nukleoszóma mag H1 DNS 10 nm 30 nm Nukleoszóma gyöngy (4x2 hiszton molekula + 146 nukleotid pár) 10 nm-es szál 30 nm-es szál

Részletesebben

A BIOTECHNOLÓGIA ALKALMAZÁSI LEHETŐSÉGEI A GYÓGYSZERKUTATÁSBAN

A BIOTECHNOLÓGIA ALKALMAZÁSI LEHETŐSÉGEI A GYÓGYSZERKUTATÁSBAN Az élettudományi-klinikai felsőoktatás gyakorlatorientált és hallgatóbarát korszerűsítése a vidéki képzőhelyek nemzetközi versenyképességének erősítésére TÁMOP-4.1.1.C-13/1/KONV-2014-0001 A BIOTECHNOLÓGIA

Részletesebben

Silhavy Dániel. A növényi génexpresszió RNS-szintű minőségbiztosítási rendszereinek molekuláris biológiája. című Doktori Értekezésének bírálata.

Silhavy Dániel. A növényi génexpresszió RNS-szintű minőségbiztosítási rendszereinek molekuláris biológiája. című Doktori Értekezésének bírálata. Silhavy Dániel A növényi génexpresszió RNS-szintű minőségbiztosítási rendszereinek molekuláris biológiája című Doktori Értekezésének bírálata. Bíráló: Dr. Szabados László, MTA doktora MTA Szegedi Biológiai

Részletesebben

3. Sejtalkotó molekulák III. Fehérjék, enzimműködés, fehérjeszintézis (transzkripció, transzláció, poszt szintetikus módosítások)

3. Sejtalkotó molekulák III. Fehérjék, enzimműködés, fehérjeszintézis (transzkripció, transzláció, poszt szintetikus módosítások) 3. Sejtalkotó molekulák III. Fehérjék, enzimműködés, fehérjeszintézis (transzkripció, transzláció, poszt szintetikus módosítások) 3.1 Fehérjék, enzimek A genetikai információ egyik fő manifesztálódása

Részletesebben

Fehérje szintézis 2. TRANSZLÁCIÓ Molekuláris biológia kurzus 7. hét. Kun Lídia Genetikai, Sejt- és immunbiológiai Intézet

Fehérje szintézis 2. TRANSZLÁCIÓ Molekuláris biológia kurzus 7. hét. Kun Lídia Genetikai, Sejt- és immunbiológiai Intézet Fehérje szintézis 2. TRANSZLÁCIÓ Molekuláris biológia kurzus 7. hét Kun Lídia Genetikai, Sejt- és immunbiológiai Intézet Gén mrns Fehérje Transzkripció Transzláció A transzkriptum : mrns Hogyan mutatható

Részletesebben

Engedélyszám: 18211-2/2011-EAHUF Verziószám: 1. 2460-06 Humángenetikai vizsgálatok követelménymodul szóbeli vizsgafeladatai

Engedélyszám: 18211-2/2011-EAHUF Verziószám: 1. 2460-06 Humángenetikai vizsgálatok követelménymodul szóbeli vizsgafeladatai 1. feladat Ismertesse a gyakorlaton lévő szakasszisztens hallgatóknak a PCR termékek elválasztása céljából végzett analitikai agaróz gélelektroforézis során használt puffert! Az ismertetés során az alábbi

Részletesebben

A molekuláris biológia eszközei

A molekuláris biológia eszközei A molekuláris biológia eszközei I. Nukleinsavak az élő szervezetekben Reverz transzkripció replikáció transzkripció transzláció DNS DNS RNS Fehérje DNS feladata: információ tárolása és a transzkripció

Részletesebben

A búzaszem fejlődésében szerepet játszó gének azonosítása bioinformatikai és molekuláris módszerekkel. Doktori (Ph.D.) értekezés SZŰCS ATTILA

A búzaszem fejlődésében szerepet játszó gének azonosítása bioinformatikai és molekuláris módszerekkel. Doktori (Ph.D.) értekezés SZŰCS ATTILA A búzaszem fejlődésében szerepet játszó gének azonosítása bioinformatikai és molekuláris módszerekkel Doktori (Ph.D.) értekezés SZŰCS ATTILA MTA Szegedi Biológiai Központ, Növénybiológiai Intézet Témavezető:

Részletesebben

Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen

Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen Azonosító szám: TÁMOP-4.1.2-08/1/A-2009-0011 Az orvosi

Részletesebben

3. előadás Sejtmag, DNS állomány szerveződése

3. előadás Sejtmag, DNS állomány szerveződése 3. előadás Sejtmag, DNS állomány szerveződése Örökítő anyag: DNS A DNS-lánc antiparallel irányultságú kettős hélixet alkot 2 lánc egymással ellentétes iráyban egymással összecsavarodva fut végig. Hélixek

Részletesebben

Sejtmag, magvacska magmembrán

Sejtmag, magvacska magmembrán Sejtmag, magvacska magmembrán Láng Orsolya Semmelweis Egyetem, Genetikai, Sejt- és Immunbiológiai Intézet Kompartmentalizáció Prokaryóta Cytoplazma Eukaryóta Endomembrán Kromatin Plazma membrán Eredménye

Részletesebben

DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI. Az MDR1 gén kromatin szerkezetének tanulmányozása gyógyszerérzékeny és gyógyszerrezisztens humán sejtekben.

DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI. Az MDR1 gén kromatin szerkezetének tanulmányozása gyógyszerérzékeny és gyógyszerrezisztens humán sejtekben. DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI Az MDR1 gén kromatin szerkezetének tanulmányozása gyógyszerérzékeny és gyógyszerrezisztens humán sejtekben Tóth Mónika Témavezető: Dr. Bálint Éva SZTE TTIK Biológia Doktori Iskola

Részletesebben

NÖVÉNYÉLETTAN. Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP-4.1.2-08/1/A-2009-0010

NÖVÉNYÉLETTAN. Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP-4.1.2-08/1/A-2009-0010 NÖVÉNYÉLETTAN Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP-4.1.2-08/1/A-2009-0010 Sejtfal szintézis és megnyúlás Környezeti tényezők hatása a növények növekedésére és fejlődésére Előadás áttekintése

Részletesebben

CzB 2010. Élettan: a sejt

CzB 2010. Élettan: a sejt CzB 2010. Élettan: a sejt Sejt - az élet alapvető egysége Prokaryota -egysejtű -nincs sejtmag -nincsenek sejtszervecskék -DNS = egy gyűrű - pl., bactériumok Eukaryota -egy-/többsejtű -sejmag membránnal

Részletesebben

Juhász Angéla MTA ATK MI Alkalmazott Genomikai Osztály SZEKVENCIA ADATBÁZISOK

Juhász Angéla MTA ATK MI Alkalmazott Genomikai Osztály SZEKVENCIA ADATBÁZISOK Juhász Angéla MTA ATK MI Alkalmazott Genomikai Osztály SZEKVENCIA ADATBÁZISOK Fehérjét kódol? Tulajdonságai? -Hol lokalizálódik? -Oldható? -3D szerkezete? -Accession #? -Annotációja elérhető? Már benne

Részletesebben

Transzláció. Szintetikus folyamatok Energiájának 90%-a

Transzláció. Szintetikus folyamatok Energiájának 90%-a Transzláció Transzláció Fehérje bioszintézis a genetikai információ kifejeződése Szükséges: mrns: trns: ~40 Riboszóma: 4 rrns + ~ 70 protein 20 Aminosav aktiváló enzim ~12 egyéb enzim Szintetikus folyamatok

Részletesebben

AZ ALACSONY HŐMÉRSÉKLET HATÁSÁRA BEKÖVETKEZŐ REDOX ÉS GÉNEXPRESSZIÓS VÁLTOZÁSOK GABONAFÉLÉKBEN

AZ ALACSONY HŐMÉRSÉKLET HATÁSÁRA BEKÖVETKEZŐ REDOX ÉS GÉNEXPRESSZIÓS VÁLTOZÁSOK GABONAFÉLÉKBEN A martonvásári agrárkutatások hatodik évtizede AZ ALAONY HŐMÉRSÉKLET HATÁSÁRA BEKÖVETKEZŐ REDOX ÉS GÉNEXPRESSZIÓS VÁLTOZÁSOK GABONAFÉLÉKBEN KOY GÁBOR, VÁGÚJFALVI ATTILA, TÓTH BALÁZS, SZALAI GABRIELLA,

Részletesebben

Az antioxidánsok és a poli(adp-ribóz) polimeráz szerepe a gabonafélék abiotikus stresszek által indukált öregedésében. Részletes jelentés

Az antioxidánsok és a poli(adp-ribóz) polimeráz szerepe a gabonafélék abiotikus stresszek által indukált öregedésében. Részletes jelentés Az antioxidánsok és a poli(adp-ribóz) polimeráz szerepe a gabonafélék abiotikus stresszek által indukált öregedésében 1. Bevezetés Részletes jelentés A kedvezőtlen környezeti hatások, illetve az általuk

Részletesebben

A nukleinsavak polimer vegyületek. Mint polimerek, monomerekből épülnek fel, melyeket nukleotidoknak nevezünk.

A nukleinsavak polimer vegyületek. Mint polimerek, monomerekből épülnek fel, melyeket nukleotidoknak nevezünk. Nukleinsavak Szerkesztette: Vizkievicz András A nukleinsavakat először a sejtek magjából sikerült tiszta állapotban kivonni. Innen a név: nucleus = mag (lat.), a sav a kémhatásukra utal. Azonban nukleinsavak

Részletesebben

CIÓ A GENETIKAI INFORMÁCI A DNS REPLIKÁCI

CIÓ A GENETIKAI INFORMÁCI A DNS REPLIKÁCI A GENETIKAI INFORMÁCI CIÓ TÁROLÁSA ÉS S KIFEJEZŐDÉSE A DNS SZERKEZETE Két antiparalel (ellentétes lefutású) polinukleotid láncból álló kettős helix A két lánc egy képzeletbeli közös tengely körül van feltekeredve,

Részletesebben

Az ADA2b adaptor fehérjéket tartalmazó hiszton acetiltranszferáz komplexek szerepének vizsgálata Drosophila melanogaster-ben

Az ADA2b adaptor fehérjéket tartalmazó hiszton acetiltranszferáz komplexek szerepének vizsgálata Drosophila melanogaster-ben Az ADA2b adaptor fehérjéket tartalmazó hiszton acetiltranszferáz komplexek szerepének vizsgálata Drosophila melanogaster-ben DOKTORI TÉZIS Pankotai Tibor Témavezető: Dr. Boros Imre Miklós Szeged, 2007

Részletesebben

IN SITU HIBRIDIZÁCIÓS HISZTOKÉMIA (ISHH)

IN SITU HIBRIDIZÁCIÓS HISZTOKÉMIA (ISHH) IN SITU HIBRIDIZÁCIÓS HISZTOKÉMIA (ISHH) Dobolyi Árpád SE Anatómiai, Szövet- és Fejlődéstani Intézet AZ ISHH ÖSSZEHASONLÍTÁSA A FLUORESZCENS IN SITU HIBRIDIZÁCIÓVAL (FISH) RNS és nem DNS vizsgálata Tipikusan

Részletesebben

A laboratóriumi medicina fejlődése az elmúlt 35 évben

A laboratóriumi medicina fejlődése az elmúlt 35 évben A laboratóriumi medicina fejlődése az elmúlt 35 évben Kovács L. Gábor egyetemi tanár, az MTA rendes tagja Pécsi Tudományegyetem 1976 2011? INTÉZETIGAZGATÓ PROFESSZOROK KLINIKAI KÉMIA 1976 Mérleg Spektrofotométer

Részletesebben

A kromoszómák kialakulása előtt a DNS állomány megkettőződik. A két azonos információ tartalmú DNS egymás mellé rendeződik és egy kromoszómát alkot.

A kromoszómák kialakulása előtt a DNS állomány megkettőződik. A két azonos információ tartalmú DNS egymás mellé rendeződik és egy kromoszómát alkot. Kromoszómák, Gének A kromoszóma egy hosszú DNS szakasz, amely a sejt életének bizonyos szakaszában (a sejtosztódás előkészítéseként) tömörödik, így fénymikroszkóppal láthatóvá válik. A kromoszómák két

Részletesebben

A biológia szerepe az egészségvédelemben

A biológia szerepe az egészségvédelemben A biológia szerepe az egészségvédelemben Nagy Kinga nagy.kinga@mail.bme.hu 2017.10.24 Mikróbák az ember szolgálatában (Néhány példán keresztül bemutatva) Antibiotikumok (gombák, baktériumok) Restrikciós

Részletesebben

I. Strukturális Genomika II. Funkcionális Genomika III. Integratív Genomika

I. Strukturális Genomika II. Funkcionális Genomika III. Integratív Genomika I. Strukturális Genomika II. Funkcionális Genomika III. Integratív Genomika A genomika főbb területei Strukturális (szerkezeti ) genomika Funkcionális (működési) genomika Transzkriptomika Proteomika Integratív

Részletesebben

Egy új genetikai módszerrel azonosított Arabidopsis A4A hősokk faktor funkcionális jellemzése

Egy új genetikai módszerrel azonosított Arabidopsis A4A hősokk faktor funkcionális jellemzése Egy új genetikai módszerrel azonosított Arabidopsis A4A hősokk faktor funkcionális jellemzése Tézisfüzet Immaculada Pérez Salamó Témavezető: Dr. Szabados László MTA Szegedi Biológiai Központ Növénybiológia

Részletesebben

In situ hibridizáció különböző módszereinek adaptálása és továbbfejlesztése búza genetikai alapanyagok elemzésére

In situ hibridizáció különböző módszereinek adaptálása és továbbfejlesztése búza genetikai alapanyagok elemzésére OTKA F037331 Zárójelentés 2006. In situ hibridizáció különböző módszereinek adaptálása és továbbfejlesztése búza genetikai alapanyagok elemzésére Kísérleteinkben célul tűztük ki a transzgének kimutatására

Részletesebben

A C. elegans TRA-1/GLI/Ci szex-determinációs faktor célgénjeinek meghatározása és analízise. Doktori értekezés tézisei.

A C. elegans TRA-1/GLI/Ci szex-determinációs faktor célgénjeinek meghatározása és analízise. Doktori értekezés tézisei. A C. elegans TRA-1/GLI/Ci szex-determinációs faktor célgénjeinek meghatározása és analízise Doktori értekezés tézisei Hargitai Balázs Eötvös Loránd Tudományegyetem Természettudományi Kar Biológia Doktori

Részletesebben

Összefoglalás első fejezete

Összefoglalás első fejezete Összefoglalás Az utóbbi években a transzkriptómikai vizsgálatokban alkalmazott technológiák fejlődésének köszönhetően a genom kutatás területén jelentős előrehaladás figyelhető meg. A disszertáció első

Részletesebben

A bioinformatika gyökerei

A bioinformatika gyökerei A bioinformatika gyökerei 1944: Avery a transforming principle a DNS 1952: Hershey és Chase perdöntő bizonyíték: a bakteriofágok szaporodásakor csak a DNS jut be a sejtbe 1953: Watson és Crick a DNS szerkezete

Részletesebben

RNS-ek. 1. Az ősi RNS Világ: - az élet hajnalán. 2. Egy már ismert RNS Világ: - a fehérjeszintézis ben résztvevő RNS-ek

RNS-ek. 1. Az ősi RNS Világ: - az élet hajnalán. 2. Egy már ismert RNS Világ: - a fehérjeszintézis ben résztvevő RNS-ek RNS-ek RNS-ek 1. Az ősi RNS Világ: - az élet hajnalán 2. Egy már ismert RNS Világ: - a fehérjeszintézis ben résztvevő RNS-ek 3. Egy újonnan felfedezett RNS Világ: - szabályozó RNS-ek 4. Transzkripció 5.

Részletesebben

Bioinformatika előadás

Bioinformatika előadás 10. előadás Prof. Poppe László BME Szerves Kémia és Technológia Tsz. Bioinformatika proteomika Előadás és gyakorlat Genomika vs. proteomika A genomika módszereivel nem a tényleges fehérjéket vizsgáljuk,

Részletesebben

TARTALOM. Előszó 9 BEVEZETÉS A BIOLÓGIÁBA

TARTALOM. Előszó 9 BEVEZETÉS A BIOLÓGIÁBA Előszó 9 BEVEZETÉS A BIOLÓGIÁBA A biológia tudománya, az élőlények rendszerezése 11 Vizsgálati módszerek, vizsgálati eszközök 12 Az élet jellemzői, az élő rendszerek 13 Szerveződési szintek 14 EGYED ALATTI

Részletesebben

A genomikai oktatás helyzete a Debreceni Egyetemen

A genomikai oktatás helyzete a Debreceni Egyetemen A genomikai oktatás helyzete a Debreceni Egyetemen Bálint Bálint L. GNTP Oktatás és Tudásmenedzsment Munkabizottság, 2009. június 10. Tények Debreceni Egyetemről 21000 nappali és 33000 összes hallgató

Részletesebben

Tartalom. Előszó... 3

Tartalom. Előszó... 3 4 TARTALOM Tartalom Előszó... 3 1. Bevezetés a biológiába... 9 1.1. A biológia tudománya... 9 Vizsgálati szempontok az élőlények rendszere... 10 Evolúciós fejlődés... 11 Vizsgáló módszerek... 12 1.2. Az

Részletesebben

Humán genom variációk single nucleotide polymorphism (SNP)

Humán genom variációk single nucleotide polymorphism (SNP) Humán genom variációk single nucleotide polymorphism (SNP) A genom ~ 97 %-a két különböző egyedben teljesen azonos ~ 1% különbség: SNP miatt ~2% különbség: kópiaszámbeli eltérés, deléciók miatt 11-12 millió

Részletesebben

Népegészségügyi genomika

Népegészségügyi genomika Népegészségügyi genomika Népegészségügyi genomika Tartalom 1. A genom szerkezete... 1 1. A genom szerkzet... 1 1.1. Bevezetés a humán genom... 1 1.2. A genetika rövid története... 1 2. A DNS szerkezete...

Részletesebben

BIOINFORMATIKA Ungvári Ildikó

BIOINFORMATIKA Ungvári Ildikó 1 BIOINFORMATIKA Ungvári Ildikó Az elmúlt évtizedekben a molekuláris biológiai, genomikai technológiák robbanásszerű fejlődése a biológiai adatok mennyiségének exponenciális növekedéséhez vezetett. Ebben

Részletesebben

Poligénes v. kantitatív öröklődés

Poligénes v. kantitatív öröklődés 1. Öröklődés komplexebb sajátosságai 2. Öröklődés molekuláris alapja Poligénes v. kantitatív öröklődés Azok a tulajdonságokat amelyek mértékegységgel nem, vagy csak nehezen mérhetők, kialakulásuk kevéssé

Részletesebben

Transzgénikus állatok előállítása

Transzgénikus állatok előállítása Transzgénikus állatok előállítása A biotechnológia alapjai Pomázi Andrea Mezőgazdasági biotechnológia A gazdasági állatok és növények nemesítése új biotechnológiai eljárások felhasználásával. Cél: jobb

Részletesebben

Zárójelentés. Gabonafélék stresszadaptációját befolyásoló jelátviteli folyamatok tanulmányozása. (K75584 sz. OTKA pályázat)

Zárójelentés. Gabonafélék stresszadaptációját befolyásoló jelátviteli folyamatok tanulmányozása. (K75584 sz. OTKA pályázat) Zárójelentés Gabonafélék stresszadaptációját befolyásoló jelátviteli folyamatok tanulmányozása (K75584 sz. OTKA pályázat) A tervezett kísérletek célja, hogy jobban megértsük a növények változó környezetre

Részletesebben

Diagnosztikai célú molekuláris biológiai vizsgálatok

Diagnosztikai célú molekuláris biológiai vizsgálatok Diagnosztikai célú molekuláris biológiai vizsgálatok Dr. Patócs Attila, PhD MTA-SE Molekuláris Medicina Kutatócsoport, Semmelweis Egyetem II. sz. Belgyógyászati Klinika Laboratóriumi Medicina Intézet Genetikai

Részletesebben

Expressziós microarray. Dr. Győrffy Balázs

Expressziós microarray. Dr. Győrffy Balázs Expressziós microarray Dr. Győrffy Balázs Áttekintő 1. A technológia 2. Feldolgozás 2.1. Minőség-ellenőrzés 2.2. Jellemző kiválasztás 2.3. Vizualizálás 2.4. Kereszt-elemzés 2.5. Online diagnosztika 3.

Részletesebben

A proteomika új tudománya és alkalmazása a rákdiagnosztikában

A proteomika új tudománya és alkalmazása a rákdiagnosztikában BIOTECHNOLÓGIAI FEJLESZTÉSI POLITIKA, KUTATÁSI IRÁNYOK A proteomika új tudománya és alkalmazása a rákdiagnosztikában Tárgyszavak: proteom; proteomika; rák; diagnosztika; molekuláris gyógyászat; biomarker;

Részletesebben

Genetika. Tartárgyi adatlap: tantárgy adatai

Genetika. Tartárgyi adatlap: tantárgy adatai Genetika Előadás a I. éves Génsebészet szakos hallgatók számára Tartárgyi adatlap: tantárgy adatai 2.1. Tantárgy címe Genetika 2.2. Előadás felelőse Dr. Mara Gyöngyvér, docens 2.3. Egyéb oktatási tevékenységek

Részletesebben

3. Általános egészségügyi ismeretek az egyes témákhoz kapcsolódóan

3. Általános egészségügyi ismeretek az egyes témákhoz kapcsolódóan 11. évfolyam BIOLÓGIA 1. Az emberi test szabályozása Idegi szabályozás Hormonális szabályozás 2. Az érzékelés Szaglás, tapintás, látás, íz érzéklés, 3. Általános egészségügyi ismeretek az egyes témákhoz

Részletesebben

A T sejt receptor (TCR) heterodimer

A T sejt receptor (TCR) heterodimer Immunbiológia - II A T sejt receptor (TCR) heterodimer 1 kötőhely lánc lánc 14. kromoszóma 7. kromoszóma V V C C EXTRACELLULÁRIS TÉR SEJTMEMBRÁN CITOSZÓL lánc: VJ régió lánc: VDJ régió Nincs szomatikus

Részletesebben

Immunológia alapjai. 10. előadás. Komplement rendszer

Immunológia alapjai. 10. előadás. Komplement rendszer Immunológia alapjai 10. előadás Komplement rendszer A gyulladás molekuláris mediátorai: Miért fontos a komplement rendszer? A veleszületett (nem-specifikus) immunválasz része Azonnali válaszreakció A veleszületett

Részletesebben

DER (Felületén riboszómák találhatók) Feladata a biológiai fehérjeszintézis Riboszómák. Az endoplazmatikus membránrendszer. A kódszótár.

DER (Felületén riboszómák találhatók) Feladata a biológiai fehérjeszintézis Riboszómák. Az endoplazmatikus membránrendszer. A kódszótár. Az endoplazmatikus membránrendszer Részei: DER /durva (szemcsés) endoplazmatikus retikulum/ SER /sima felszínű endoplazmatikus retikulum/ Golgi készülék Lizoszómák Peroxiszómák Szekréciós granulumok (váladékszemcsék)

Részletesebben

Bioinformatika 2 10.el

Bioinformatika 2 10.el 10.el őadás Prof. Poppe László BME Szerves Kémia és Technológia Tsz. Bioinformatika proteomika Előadás és gyakorlat 2009. 04. 24. Genomikavs. proteomika A genomika módszereivel nem a tényleges fehérjéket

Részletesebben

(1) A T sejtek aktiválása (2) Az ön reaktív T sejtek toleranciája. α lánc. β lánc. V α. V β. C β. C α.

(1) A T sejtek aktiválása (2) Az ön reaktív T sejtek toleranciája. α lánc. β lánc. V α. V β. C β. C α. Immunbiológia II A T sejt receptor () heterodimer α lánc kötőhely β lánc 14. kromoszóma 7. kromoszóma 1 V α V β C α C β EXTRACELLULÁRIS TÉR SEJTMEMBRÁN CITOSZÓL αlánc: VJ régió β lánc: VDJ régió Nincs

Részletesebben

A tananyag felépítése: A BIOLÓGIA ALAPJAI. I. Prokarióták és eukarióták. Az eukarióta sejt. Pécs Miklós: A biológia alapjai

A tananyag felépítése: A BIOLÓGIA ALAPJAI. I. Prokarióták és eukarióták. Az eukarióta sejt. Pécs Miklós: A biológia alapjai A BIOLÓGIA ALAPJAI A tananyag felépítése: Környezetmérnök és műszaki menedzser hallgatók számára Előadó: 2 + 0 + 0 óra, félévközi számonkérés 3 ZH: október 3, november 5, december 5 dr. Pécs Miklós egyetemi

Részletesebben

A Drosophila melanogaster Dtl és Ada2a/Rpb4 génjeinek szerkezeti és funkcionális vizsgálata

A Drosophila melanogaster Dtl és Ada2a/Rpb4 génjeinek szerkezeti és funkcionális vizsgálata A Drosophila melanogaster Dtl és Ada2a/Rpb4 génjeinek szerkezeti és funkcionális vizsgálata A PhD értekezés tézisei Pápai Gábor Témavezető: Dr. Boros Imre MTA Szegedi Biológiai Központ Biokémiai Intézet

Részletesebben

Szignalizáció - jelátvitel

Szignalizáció - jelátvitel Jelátvitel autokrin Szignalizáció - jelátvitel Összegezve: - a sejt a,,külvilággal"- távolabbi szövetekkel ill. önmagával állandó anyag-, információ-, energia áramlásban áll, mely autokrin, parakrin,

Részletesebben

BIOLÓGIA ALAPJAI. Anyagcsere folyamatok 2. (Felépítő folyamatok)

BIOLÓGIA ALAPJAI. Anyagcsere folyamatok 2. (Felépítő folyamatok) BIOLÓGIA ALAPJAI Anyagcsere folyamatok 2. (Felépítő folyamatok) A molekuláris biológiai alapjai DNS replikáció RNS transzkripció Fehérje szintézis (transzláció) (Az ábrák többsége Dr. Lénárd Gábor Biológia

Részletesebben

Többgénes jellegek. 1. Klasszikus (poligénes) mennyiségi jellegek. 2.Szinte minden jelleg több gén irányítása alatt áll

Többgénes jellegek. 1. Klasszikus (poligénes) mennyiségi jellegek. 2.Szinte minden jelleg több gén irányítása alatt áll Többgénes jellegek Többgénes jellegek 1. 1. Klasszikus (poligénes) mennyiségi jellegek Multifaktoriális jellegek: több gén és a környezet által meghatározott jellegek 2.Szinte minden jelleg több gén irányítása

Részletesebben

Omikák a modern biológiában

Omikák a modern biológiában Prof. Dr. Pócsi István Omikák a modern biológiában Kőrösi Csoma Sándor Gimnázium, Szakközép-, Szakképző Iskola és Kollégium Hajdúnánás, 2014. január 29. www.meetthescientist.hu 1 26 Fordított nap 1979.

Részletesebben

MOLEKULÁRIS GENETIKA A LABORATÓRIUMI MEDICINÁBAN. Laboratóriumi Medicina Intézet 2017.

MOLEKULÁRIS GENETIKA A LABORATÓRIUMI MEDICINÁBAN. Laboratóriumi Medicina Intézet 2017. MOLEKULÁRIS GENETIKA A LABORATÓRIUMI MEDICINÁBAN Laboratóriumi Medicina Intézet 2017. 1 Történeti áttekintés Humán genom projekt 20-25 000 gén azonosítása 1,800 betegséghez köthető gén 1000 genetikai teszt

Részletesebben

A HupSL és Hox1 NiFe hidrogenáz enzimek összehangolt szabályozásának vizsgálata Thiocapsa roseopersicina baktériumban. Ph.D.

A HupSL és Hox1 NiFe hidrogenáz enzimek összehangolt szabályozásának vizsgálata Thiocapsa roseopersicina baktériumban. Ph.D. A HupSL és Hox1 NiFe hidrogenáz enzimek összehangolt szabályozásának vizsgálata Thiocapsa roseopersicina baktériumban Ph.D. értekezés tézisei Készítette: Nagy Ildikó Katalin Témavezetők: Dr. Maróti Gergely

Részletesebben

Molekuláris terápiák

Molekuláris terápiák Molekuláris terápiák Aradi, János Balajthy, Zoltán Csősz, Éva Scholtz, Beáta Szatmári, István Tőzsér, József Varga, Tamás Szerkesztette Balajthy, Zoltán és Tőzsér, József, Debreceni Egyetem Molekuláris

Részletesebben

Biológus MSc. Molekuláris biológiai alapismeretek

Biológus MSc. Molekuláris biológiai alapismeretek Biológus MSc Molekuláris biológiai alapismeretek A nukleotidok építőkövei A nukleotidok szerkezete Nukleotid = N-tartalmú szerves bázis + pentóz + foszfát N-glikozidos kötés 5 1 4 2 3 (Foszfát)észter-kötés

Részletesebben

OTKA K83642 számú pályázat zárójelentése

OTKA K83642 számú pályázat zárójelentése OTKA K83642 számú pályázat zárójelentése 2011.07.01. 2015.06.30. A stressz hatására bekövetkező edződési, korai virágzási és elhalási folyamatok jellemzése gabonafélékben Összefoglalás Hipotézisünk szerint

Részletesebben

Bevezetés a bioinformatikába. Harangi János DE, TEK, TTK Biokémiai Tanszék

Bevezetés a bioinformatikába. Harangi János DE, TEK, TTK Biokémiai Tanszék Bevezetés a bioinformatikába Harangi János DE, TEK, TTK Biokémiai Tanszék Bioinformatika Interdiszciplináris tudomány, amely magába foglalja a biológiai adatok gyűjtésének,feldolgozásának, tárolásának,

Részletesebben

Nanotechnológia. Nukleinsavak. Készítette - Fehérvári Gábor

Nanotechnológia. Nukleinsavak. Készítette - Fehérvári Gábor Nanotechnológia Nukleinsavak Készítette - Fehérvári Gábor Bevezető A nukleinsavak az élő anyag alapvetően fontos komponensei. Meghatározó szerepet töltenek be az átöröklésben, a fehérjék szintézisében

Részletesebben

Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen

Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen Azonosító szám: Az orvosi biotechnológiai mesterképzés

Részletesebben