1 BAKTERIOLÓGIAI ÉS MIKOLÓGIAI SZOLGÁLTATÁSI JEGYZÉK PÉCSI TUDOMÁNYEGYETEM, KLINIKAI KÖZPONT ORVOSI MIKROBIOLÓGIAI ÉS IMMUNITÁSTANI INTÉZET Bakteriológiai és Kórházhigénés Laboratórium A 01-18017/18-12913/18 regisztrációs számon a CERTOP Kft. által tanúsított laboratórium laboratórium-vezetı: Dr. Mestyán Gyula 7624, PÉCS, SZIGETI ÚT 12. (földszint) Tel: 06 72/536-000/31665; E-mail: bakteriologia@pte.hu Honlap: http://aok.pte.hu/hu/egyseg/index/220 Készítette: Dr. Mestyán Gyula Átnézte: Dr. Kovács Krisztina, Dr. Melegh Szilvia Készült: 2016. szeptember Felülvizsgálta: Dr. Mestyán Gyula, Dr. Kovács Krisztina, Dr Nyul Adrienn / 2019. március 5. BAKTERIOLÓGIAI ÉS KÓRHÁZHIGIÉNÉS LABORATÓRIUM TEVÉKENYSÉGI KÖRE Klinikai diagnózis Minta Vizsgálat neve Alkalmazott módszer Lelet átfordulási idı nap (n) Megjegyzés Plaut-Vincent angina Felsı légúti fertızés Vattatamponnal vett minta steril tárgylemezen készített, hıvel fixált kenetét kell a laboratóriumba küldeni! (ok) kimutatása vizsgálattal Karbolfukszin vagy A laboratóriumi diagnózishoz nem feltétlenül szükséges!
2 Szájnyálkahártya fertızése Nyálkahártya kaparék, biopszia Vattapálca használata nem javasolt! Kórokozó kimutatás 5-10 n Epiglottitis A klinikai diagnózis felállításához nem szükséges i (torokváladék v. epiglottis váladék) eredmény! Vigyázat! Torokváladék vételekor az epiglottis törlése légúti elzáródást okozhat! Pharyngitis / bakteriális Vér / (HK) Torokváladék / vattatamponon, transzport közegben kimutatása kimutatás HK automatában: aerob anaerob Aerob 2-4 n Peritonsilláris-, submandibuláris -, retropharyngeális abscessus, Lemierre szindróma, Ludwig angina Otitis externa Biopszia, aspirátum, abscessus mosófolyadék Vattapálca használata nem javasolt! /- Vér / (HK) Külsı hallójárati exsudátum, kaparék, biopszia kimutatása vizsgálattal és kimutatása /- HK automatában: aerob anaerob aerob /- 3-5 n Vattapálcával vett minta kis mennyisége miatt a vizsgálat álnegatív eredménnyel zárulhat! A megnevezett minták vizsgálata mellett a vér e is fontos. Akut otitis media Középfül aspirátum, szivárgó középfül folyadék / kis átmérıjő vattatamponon, transzport közegben kimutatása aerob 3-5 n Krónikus otitis media Középfül aspirátum, szivárgó középfül folyadék / kis átmérıjő vattatamponon anaerob transzport közegben kimutatása vizsgálattal és Mastoiditis Középfül aspirátum, mastoid szövet biopszia kimutatása
3 Orrváladék / MRSA szőrés Akut bakteriális sinusitis Orrüreg elülsı részének (mindkét felének) törlése, vattatamponon, transzport közegben Sinus aspirátum MRSA kimutatása Szelektív, aerob 3-5 nap kimutatása vizsgálattal és aerob 3-5 n Vigyázat! Orrüreg vizsgálata félrevezetı álnegatív vagy álpozitív eredménnyel zárulhat! Komplikált sinusitis / Sinus aspirátum kimutatása vizsgálattal és Komplikált sinusitis / Sinus aspirátum, szövetminta Kórokozó vizsgálattal és Krónikus bronchitis akut exacerbációja Köpetminta Alsólégúti fertızés Minta kvalitatív értékelése vizsgálattal kimutatása vizsgálattal és aerob 2-5 n Pneumonia / CAP, HAP, VAP Középsugaras vizelet Köpet, tracheaváladék Streptococcus pneumoniae és/vagy Legionella pneumophila szolubilis antigén kimutatás Minta kvalitatív értékelése vizsgálattal /- Immunkromatográfia aerob /- 2-5 n Az alsó légúti minták vizsgálata mellett a vér e is fontos.
4 BAL Középsugaras vizelet és kimutatása Streptococcus pneumoniae és/vagy Legionella pneumophila szolubilis antigén kimutatás szemikvantitatív aerob /- Immunkromatográfia 2-5 n Aspirációs pneumonia Vér / (HK) Bronchoszkóppal vett minta kimutatása kimutatása HK automatában: aerob és anaerob 4-7n Invazív aspergillosis Vér / (HK) Trachea, BAL Szérum, BAL Pleura őr fertızése Pleurális folyadék kimutatása Aspergillus kimutatása Aspergillus galactomannan Ag kimutatás /- HK automatában: aerob anaerob, -festés ELISA vizsgálat napján Vizsgálatok indításának idıpontjai: hétfın és csütörtökön / 10:00h aerob, anaerob /- 4-7 nap Az alsó légúti minták vizsgálata mellett a vér e is fontos. /- Vér / (HK) kimutatása HK automatában:
5 Cisztás fibrózis Köpet, torokváladék, egyéb légúti minta kimutatása aerob 4-6 n Oesophagitis / Candidiasis Szepszis, bakteriémia, fungaemia, Endocarditis Kaparék, biopszia Gasztrointesztinális traktus fertızései Kórokozó vizsgálattal és, Kardiovaszkuláris rendszer és véráram fertızés Vér / (HK) Vér / (HK) /- /- automatában: aerob és anaerob /- automatában: /- /- szívbillentyő /- aerob, anaerob /- Érkanül fertızés Kanülvég 4-7 nap
6 Érgraft fertızése Pericarditis, myocarditis Vér / (HK) Biopszia, graft darab, szövetminta Vér / (HK) Pericardiális folyadék, biopszia Vér / /- /- kórokozó aerob és /- /- /- Központi idegrendszeri fertızések Meningitis Liquor ok kimutatása vizsgálattal, antigén detektálással és szemikvantitatív, aerob /- anaerob /- Aerob /- anaerob /- Aerob és anaerob /- anaerob /- latex agglutináció, 4-7 n 4-6 n 7-21 n 4-7 n 4-6 nap A kanülvég vizsgálata mellett a vér e is fontos. A kanül i eredménye csak a párhuzamosan vett HK eredménnyel együtt értékelhetı. A megnevezett minták vizsgálata mellett a vér e is fontos. A megnevezett minták vizsgálata mellett a vér e is fontos. A liquor vizsgálata mellett a vér e is fontos.
7 Vér / kimutatása automatában: Shunt és ventriculáris drain fertızés Liquor ok /- vizsgálattal, antigén detektálással és /- latex agglutináció, /- 4-6 nap A liquor vizsgálata mellett a vér e is fontos. Vér / /- anaerob /- Encephalitis Liquor ok kimutatása aerob 4-7 n A liquor vizsgálata mellett a vér e is fontos. Vér / kimutatása anaerob Agyi abscessus Aspirátum, biopszia (/- liquor) kórokozó /- ; /- 14-18 n A megnevezett minták vizsgálata mellett a vér e is fontos. Vér / /- anaerob /-
8 Szem fertızései Conjunctivitis 2 darab vattapálcán vett minta (1. festés, 2. ) kórokozó kimutatása aerob 2-4 n Cellulitis, könnycsatorna, szemhéj fertızései Konjunktíva kaparék, szövetbiopszia kórokozó /- 4-6 n A megnevezett minták vizsgálata mellett a vér e is fontos lehet. /- Vér / /- anaerob /- Keratitis Cornea kaparék betegágy mellett készített tárgylemez kenete leoltott illetve beoltott aerob Véres -, Csokoládé és folyékony dúsító táptalajok /- /- 4-6 n Endophtalmitis Aspirátum, biopszia minta betegágy mellett készített tárgylemez kenet és leoltás táptalajai /- /- 4-6 n A megnevezett minták vizsgálata mellett a vér e is fontos lehet. /- Vér / /- Intraabdominális fertızések anaerob /-
9 Peritonitis: peritoneális dialízissel asszociált peritonitis Peritoneális folyadék; Kétféle formában kell küldeni, párhuzamosan: 1. Natív folyadék dializáló zsákban 2. HK palackokba injektált folyadék /- /- A peritoneális folyadék vizsgálata mellett a vér e is fontos. /- Vér / /- anaerob /- Abscessus (máj, lép), epeúti -, pancreas fertızés Aspirátum; Kétféle formában kell küldeni, párhuzamosan: 1. Natív: 10-50 ml 2. HK /- Aerob és anaerob /- A megnevezett minták vizsgálata mellett a vér e is fontos. Vattapálcával vett minta kis mennyisége miatt a vizsgálat álnegatív eredménnyel zárulhat! Vattapálca használata nem javasolt! /- Vér / /- anaerob /- Csont és ízületi fertızések Osteomyelitis Biopsziás minta, sebváladék /- /- 4-6 n A megnevezett minták vizsgálata mellett a vér e is fontos.
10 Vér / /- anaerob /- Arthritis, Bursitis, Izületi protézis fertızés A. Szinoviális folyadék, aspirátum; Kétféle formában kell küldeni, párhuzamosan: 1. Natív: 5-50 ml 2. HK /- /- 5-25 n Vattapálcával vett minta kis mennyisége miatt a vizsgálat álnegatív eredménnyel zárulhat! A megnevezett minták vizsgálata mellett a vér e is fontos. /- B. Biopsziás minta /- C. Protézis Vattapálca használata nem javasolt! Vér / /- Húgyúti fertızések Cystitis Középsugaras vizelet /- anaerob /- Szemikvantitatív aerob /- 2-4 n Pyelonephritis Középsugaras vizelet /- Szemikvantitatív aerob /- 2-4 n A vizelet vizsgálata mellett a vér e is fontos.
11 /- Vér / /- anaerob /- Akut prostatitis Középsugaras vizelet /- Szemikvantitatív aerob /- 2-4 n A megnevezett minták vizsgálata mellett a vér e is fontos. Krónikus prostatitis Urethritis Mycoplasma Ureaplasma /- Vér / A. Három, szeparált vizelet minta (elsı, középsı, utolsó porció) B. Prosztata masszátum Genitális traktus fertızései Urethra minta vagy Vizelet (elsı porció) /- /- kimutatása és antibiotikum érzékenységi vizsgálata anaerob /- A minták szemikvantitatív összehasonlító vizsgálata; aerob Szemikvantitatív /- antibiotikum érzékenység vizsgálat 4-6 n 2 n 3 n Gonorrhea (cervicitis, urethritis, conjunctivitis, pharyngitis, proctitis) Vaginitis / sarjadzó Vattapálca törlés A.Betegágy mellett készített tárgylemez kenet B. Vaginális törlés vattapálcával N. gonorrhoeae kimutatás Gomba kimutatás Aerob (CO2) Gomba 2-7 n Mintavétel elıtt konzultálni szükséges a bakteriológiai laboratóriummal. A sikeres hez speciális transzport közeg szükséges.
12 Endometritis, PID A. Endometriális -, tubo-ovarialis -, egyéb aspirátumok; Kétféle formában kell küldeni, párhuzamosan: /- Aerob és anaerob /- A megnevezett minták vizsgálata mellett a vér e is fontos. 1. Natív: 5-50 ml 2. HK /- B. Biopsziás minta /- Vér / /- anaerob /- Felületes sebfertızés Traumás eredető bırfertızés; Mőtéti sebfertızés; Emberi, állati harapott sebek; Egyéb mélyszöveti fertızések Bır és lágyrész fertızések Aspirátum, szövetbiopszia Vattapálca használata nem javasolt! Aspirátum, szövetbiopszia Vattapálca használata nem javasolt! /- Vér / és kimutatás /- /- aerob /- automatában: 2-4 n Vattapálcával vett minta kis mennyisége miatt a vizsgálat álnegatív eredménnyel zárulhat! Vattapálcával vett minta kis mennyisége miatt a vizsgálat álnegatív eredménnyel zárulhat! A megnevezett minták vizsgálata mellett a vér e is fontos.
13 /- Kórokozó közvetlen kimutatása mintából, nem es vizsgálattal Klinikai diagnózis Minta Vizsgálat neve Alkalmazott módszer Lelet átfordulási idı nap (n) Megjegyzés Invazív aspergillosis BAL, szérum Aspergillus galactomannan kimutatás Bakteriális meningitis (bakteriémia) Liquor (vér, vizelet) Meningitist okozó fontos kórokozók (S. pneumoniae, S. agalactiae, H. influezae, N. meningitidis) szolubilis antigénjeinek közvetlen kimutatása Kvantitatív antigén kimutatás ELISA módszerrel Kereskedelmi forgalomban kapható latex-agglutinációs kit A vizsgálat napján, Vizsgálatok indításának idıpontjai: minden hétfı és csütörtök / 10:00 Szerotipizálás β-hemolizáló streptococcusok Salmonella spp. Baktérium színtenyészete Baktérium színtenyészete Csoportspecifikus antigének meghatározása Salmonella antigénjeinek (O és H) detektálása Kereskedelmi forgalomban kapható latex-agglutinációs kit Tárgylemez-agglutináció, kereskedelmi forgalomban kapható polyvalens savókkal ok és gombák identifikálása Kórokozók Minta Identifikálás alapja Alkalmazott módszer Lelet átfordulási idı nap (n) Megjegyzés Aerob és anaerob ok Színtenyészet Telepmorfológia és sejtmorfológia; Antigén -, i tulajdonságok vizsgálata Ki napján
14 biokémiai -, genetikai és fehérje profil Sarjadzó gombák Színtenyészet Telepmorfológia és sejtmorfológia; biokémiai -, genetikai és fehérje profil MALDI-TOF /- Tárgylemez és/vagy latex agglutináció /- hagyományos és/vagy kereskedelmi biokémiai próbák /- PCR i tulajdonságok vizsgálata MALDI-TOF /- Hagyományos és/vagy kereskedelmi biokémiai próbák 1-2 n Ki napján 1-2 n Fonalas gombák Színtenyészet Meghatározás alapja: telepmorfológia, sejtmorfológia, és fehérje profil i tulajdonságok vizsgálata Mikroszkópos vizsgálat MALDI-TOF Ki napján Kétes identifikálás esetén a törzseket referencia laboratóriumba küldjük. Kórokozók antibiotikum/antimycotikum érzékenységi vizsgálata Kórokozók Minta Vizsgálat alapja Alkalmazott módszer Lelet átfordulás idıtartama Aerob és anaerob ok Színtenyészet antibiotikum érzékenységének / rezisztenciájának meghatározása; Korong-diffúziós /- nap (n) Ki napját követıen: 1-2 n Megjegyzés
15 Szaporodás gátlásának szemikvantitatív /- kvantitatív vizsgálaával; Rezisztencia mechanizmus fenotípusos /- genotípusos meghatározása Gradiens diffúziós /- Mikrodilúciós /- Latex-agglutináció /- PCR vizsgálat 1-2 n 1-2 n Sarjadzó gombák Színtenyészet Kórokozó antibiotikum érzékenységének/re zisztenciájának meghatározása szaporodás gátlásának szemikvantitatív /- kvantitatív vizsgálatával Korong-diffúziós vizsgálat /- Kereskedelmi mikrodilúciós /- Gradiens diffúziós vizsgálat Ki napját követıen: 1-2 n 1-2 n 1-2 n Fonalas gombák Színtenyészet Szaporodás gátlásának kvantitatív vizsgálata Gradiens diffúziós vizsgálat 2-4 n Kétes identifikálás esetén a törzseket referencia laboratóriumba küldjük. Multirezisztens ok detektálása Diagnosztikus és/vagy Színtenyészet Baktérium Identifikálás: Ki szőrıvizsgálatok során identifikálása MALDI-TOF napját izolált multirezisztens követıen: kórokozó ok és hagyományos biokémiai vizsgálatokkal 1-2 n multirezisztencia mechanizmusának (pl. ESBL, CRE, MACI, MRPAE, MRSA, VRE)* igazolása fenotípusos és genotípusos vizsgálatokkal Antibiotikum rezisztencia vizsgálat: - Korong- és gradiens 1-2 n diffúziós /- - Latex agglutinációs /- - Mikrodilúciós /- 1-2 n
16 - PCR vizsgálatok Infekciókontroll célú vizsgálatok Kórokozók Minta Vizsgálat alapja Alkalmazott módszer Lelet átfordulá si idı nap (n) Betegek és környezetük bakteriológia vizsgálata Élettelen környezet felületeirıl vattatamponnal vett minták Levegı ütköztetésével leoltott táptalaj Felületek mikrobiális szennyezettség vizsgálata es vizsgálattal Levegı mikrobiális szennyezettség vizsgálata es vizsgálattal (Clostridium spp.) 2-5 n Kvantitatív aerob 2-3 n Megjegyzés Betegek és kórházi személyzet tagjainak szőrıvizsgálatai: orr-. torok-, bır-, sebváladékok, anus, széklet vattatamponnal vett mintái transzport közegben vagy a nélkül Pathogén ok (pl. S. pyogenes, S. aureus, Clostridium spp.) /- Multirezisztens ok (pl. MRSA) kimutatása vizsgálattal,, antigén detektálással, antibiotikum érzékenység és rezisztencia mechanizmus meghatározással I.Festés: - II.: - Aerob/anaerob I.Identifikálás: - MALDI-TOF vizsgálat /- - Latex agglutináció /- - Hagyományos és/vagy kereskedelmi biokémiai próbák IV.Antibiotikum rezisztencia vizsgálat: - Korong- és grádiens diffúziós /- - Latex agglutinációs /- 2-5 n - Mikrodilúciós /- - PCR vizsgálatok