Karbolfukszin vagy Gram-festés. aznap. Gram-festés + gomba tenyésztés n. Tenyésztés HK automatában: aerob + anaerob.

Átírás

1 1 Bakteriológiai és Mycológiai Szolgáltatási jegyzék Pécsi Tudományegyetem, Orvosi Mikrobiológiai és Immunitástani Intézet Bakteriológiai és Kórházhigiénés Laboratórium Készítette: Dr. Mestyán Gyula Átnézte: Dr. Kovács Krisztina, Dr. Melegh Szilvia Készült: szeptember Klinikai diagnózis Minta Vizsgálat neve Alkalmazott módszer Negatív és pozitív lelet átfordulási ideje, nap (n) Felső légúti fertőzés Plaut- Vincent angina Vattatamponnal vett minta steril tárgylemezen készített, hővel fixált kenetét laboratóriumba küldeni vizsgálattal Karbolfukszin vagy Megjegyzés A laboratóriumi diagnózishoz nem feltétlenül szükséges! Szájnyálkahártya fertőzése Nyálkahártya kaparék, biopszia; Vattatampon törlés Kórokozó Epiglottitis A klinikai diagnózis felállításához nem szükséges i (torokváladék v. epiglottis váladék) eredmény! Pharyngitis / bakteriális Peritonsilláris abscessus, Vér / (HK) Torokváladék / vattatamponon, transzport közegben Biopszia, aspirátum, abscessus mosófolyadék a a HK aerob anaerob Aerob 5-10 n 2-4 n Vigyázat! Torokváladék vétele / epiglottis törlése légúti elzáródást okozhat! Figyelem! Vattapálcával vett minta kis mennyisége miatt a vizsgálat álnegatív

2 2 Lemierre szindróma, szubmandibuláris -, retropharyngeális abscessus, Ludwig angina Otitis externa Akut otitis media Krónikus otitis media Mastoiditis Orrváladék / MRSA szűrés Akut bakteriális sinusitis Komplikált sinusitis / Vattapálca használata nem javasolt! Vér / HK Külső hallójárati exsudátum, kaparék, biopszia Középfül aspirátum Szivárgó középfül folyadék/ kis átmérőjű vattatamponon, transzport közegben Középfül aspirátum Szivárgó középfül folyadék / kis átmérőjű vattatamponon anaerob transzport közegben Középfül aspirátum, mastoid szövet biopszia Orrüreg elülső részének (mindkét felének) törlése, vattatamponon, transzport közegben Sinus aspirátum Sinus aspirátum MRSA HK aerob anaerob aerob aerob ; Szelektív, aerob aerob eredménnyel zárulhat! 3-5 n 3-5 n 3-5 nap 3-5 n Vigyázat! Orrüreg vizsgálata félrevezető, álnegatív vagy álpozitív eredménnyel járhat! Vigyázat! Orrüreg vizsgálata félrevezető, álnegatív vagy álpozitív eredménnyel járhat! Komplikált sinusitis Sinus aspirátum, szövetminta Kórokozó Vigyázat! Orrüreg vizsgálata félrevezető,

3 3 / Alsólégúti fertőzés Krónikus bronchitis akut exacerbációja Pneumonia / CAP, HAP, VAP Köpetminta Középsugaras vizelet Köpet, tracheaváladék BAL Minta kvalitatív értékelés vizsgálattal; Streptococcus pneumoniae szolubilis antigén Minta kvalitatív értékelése vizsgálattal; és és Középsugaras vizelet Streptococcus pneumoniae és/vagy Legionella pneumophila szolubilis antigén Vér / HK aerob Immunkromatográfia aerob szemikvantitatív aerob Immunkromatográfia HK 2-5 n 2-5 n 2-5 n álnegatív vagy álpozitív eredménnyel járhat!

4 4 Aspirációs pneumonia Invazív aspergillosis Bronchoszkóppal vett minta a Vér / HK Trachea, BAL Szérum, BAL Aspergillus a Aspergillus galactomannan Ag Pleura űr fertőzése Pleurális folyadék a Vér / HK Cisztás fibrózis Köpet, torokváladék, egyéb légúti minta Gasztrointesztinális traktus fertőzései Oesophagitis / Candidiasis Gastritis / Helicobacter pylori Kaparék, biopszia Több helyről vett biopsziás minta Kórokozó a Helicobacter pylori a HK aerob anaerob, -festés ELISA aerob, anaerob HK aerob, festés microaerophil 4-7n vizsgálat napján, 4-7 nap 4-6 n 3 hét Tervezett vizsgálatok: minden héten / hétfő és csütörtök / 10:00h Mintavétel előtt konzultálni szükséges a bakteriológiai laboratóriummal!

5 5 Kardiovaszkuláris rendszer és véráram fertőzés Szepszis, bakteriémia, fungaemia, Endocarditis Vér / Vér / szívbillentyű a aerob, anaerob n n n 4-7 nap Érkanül fertőzés Kanülvég Érgraft fertőzése Vér / Biopszia, graft darab, szövetminta kórokozó aerob és szemikvantitatív, aerob Aerob 4-7 n 4-6 n A kanül i eredménye csak a párhuzamosan vett HK eredménnyel együtt értékelhető!

6 6 Pericarditis, myocarditis Vér / Pericardiális folyadék, biopszia Vér / Központi idegrendszeri fertőzések Meningitis Liquor Kórokozó ok a vizsgálattal, antigén detektálással és Vér / Shunt fertőzés Liquor Kórokozó ok gombák a vizsgálattal, antigén detektálással és Vér / Aerob és anaerob latex agglutináció, latex agglutináció, 4-7 n n 4-6 nap 4-6 nap

7 7 Encephalitis Liquor Kórokozó ok a Vér / aerob 4-7 n Agyi abscessus Szem fertőzései Conjunctivitis Cellulitis, könnycsatorna, szemhéj fertőzései Aspirátum, biopszia ( liquor) Vér / 2 darab vattapálcán vett minta (1. festés, 2. ) Konjunktíva kaparék, szövetbiopszia Vér / kórokozó és kórokozó a kórokozó a ; aerob n 2-4 n 4-6 n

8 8 Keratitis Endophtalmitis Cornea kaparék betegágy mellett készített tárgylemez kenete leoltott illetve beoltott aerob Véres -, Csokoládé - és folyékony dúsító táptalajok Aspirátum, biopszia minta betegágy mellett készített tárgylemez kenet és leoltás táptalajai Vér / Intraabdominális fertőzések Peritonitis, Peritoneális dialízissel asszociált peritonitis Peritoneális folyadék minta, 2 darab 1. Natív: ml vagy dializáló zsák 2. HK és Gomba 4-6 n 4-6 n Abscessus (máj, lép) epeúti -, pancreas fertőzés Vér / Aspirátum, 2 darab 1. Natív: ml 2. HK Vér / Aerob és anaerob

9 9 Csont és izületi fertőzések Osteomyelitis Biopsziás minta, sebváladék Arthritis, Bursitis, Izületi protézis fertőzés Vér / Szinoviális folyadék aspirátum, 2 darab: 1. Natív: ml 2. HK Biopsziás minta Protézis Vér / és Húgyúti fertőzések Cystitis Középsugaras vizelet Pyelonephritis Középsugaras vizelet Szemikvantitatív aerob Szemikvantitatív aerob 4-6 n n 2-4 n 2-4 n

10 10 Vér / Akut prostatitis Középsugaras vizelet és Krónikus prostatitis Vér / I.Három szeparált vizelet minta (első -, középső-, utolsó porció) II. prostata masszátum és Szemikvantitatív aerob Szemikvantitatív összehasonlító vizsgálata aerob 4-6 n Genitális traktus fertőzései Urethritis ( Mycoplasma, Ureaplasma) Gonorrhea (cervicitis, urethritis, conjunctivitis, pharyngitis, proctitis) I.Urethra minta vagy II. Vizelet (első porció) Vattapálca törlés a és antibiotikum érzékenységi vizsgálata N. gonorrhoeae Szemikvantitatív antibiotikum érzékenység vizsgálat Aerob (CO2) 2 n 3 n 2-7 n A vizsgálat speciális transzport rendszert igényel, ezért előzetes konzultáció szükséges a laboratóriummal!

11 11 Vaginitis / sarjadzó I.Betegágy mellett készített tárgylemez kenet II. vaginális törlés vattapálcával Endometritis, PID I. endometriális -, tubo-ovarialis -, tartalom, 2 darab 1. Natív: ml 2. HK II. Biopsziás minta Gomba és Gomba Aerob és anaerob Vér / Bőr és lágyrész fertőzések Felületes sebfertőzés Traumás eredetű bőrfertőzés; Műtéti sebfertőzés; Emberi, állati harapott sebek; Egyéb mélyszöveti fertőzések Aspirátum, szövetbiopszia Aspirátum, szövetbiopszia Vér / és aerob 2-4 n Kórokozó közvetlen a mintából, nem es vizsgálattal Klinikai diagnózis Minta Vizsgálat neve Alkalmazott módszer Lelet Megjegyzés

12 12 Invazív aspergillosis BAL, szérum Aspergillus galactomannan Bakteriális meningitis (bakteriémia) Szerotipizálás β-hemolizáló streptococcusok Salmonella spp. Liquor (vér, vizelet) Baktérium színtenyészete Baktérium színtenyészete Meningitist okozó fontos kórokozók (S. pneumoniae, S agalactiae, H. influezae, N meningitidis) szolubilis antigénjeinek közvetlen a Csoportspecifikus antigének meghatározása Salmonella antigénjeinek (O és H) detektálása Kvantitatív antigén ELISA módszerrel Kereskedelmi forgalomban kapható latex-agglutinációs kit Kereskedelmi forgalomban kapható latex-agglutinációs kit Tárgylemez-agglutináció, kereskedelmi forgalomban kapható polyvalens savókkal átfordulási idő, nap (n) A vizsgálat napján, Vizsgálati időpontok: hétfő és csütörtök / 10:00h / minden héten ok és gombák identifikálása Kórokozók Minta Identifikálás alapja Alkalmazott módszer Lelet átfordulási idő, Aerob és anaerob ok Színtenyészet Meghatározás alapja: telepmorfológia, sejtmorfológia, antigén -, biokémiai -, genetikai és fehérje profil / tárgylemez, latex agglutináció MALDI-TOF hagyományos és/vagy kereskedelmi biokémiai próbák (API) PCR nap (n) 1-2 n Megjegyzés

13 13 Sarjadzó gombák Színtenyészet Meghatározás alapja: telepmorfológia, sejtmorfológia, biokémiai -, genetikai és fehérje profil Fonalas gombák Színtenyészet Meghatározás alapja: telepmorfológia, sejtmorfológia, és fehérje profil MALDI-TOF hagyományos és/vagy kereskedelmi biokémiai próbák (API) Kulturális tulajdonságok,, -festés MALDI-TOF 1-2 n Kétes identifikálás esetén a törzseket referencia laboratóriumba küldjük! Kórokozók antibiotikum/antimycotikum érzékenységének vizsgálata Kórokozók Minta Vizsgálat alapja Alkalmazott módszer Lelet átfordulási idő, Aerob és anaerob ok Színtenyészet antibiotikum érzékenységének / rezisztenciájának meghatározása szaporodás gátlásának szemikvantitatív kvantitatív vizsgálatával; Rezisztencia mechanizmus genotípusos fentotípusos meghatározása Korong-diffúziós vizsgálat gradiens diffúziós vizsgálat latex-agglutináció PCR 1-2 n 1-2 n nap (n) Megjegyzés

14 14 Sarjadzó gombák Színtenyészet Kórokozó antibiotikum érzékenységének/re zisztenciájának meghatározása szaporodás gátlásának szemikvantitatív kvantitatív vizsgálatával Fonalas gombák Színtenyészet Szaporodás gátlásának kvantitatív vizsgálata Korong-diffúziós vizsgálat kereskedelmi mikrodilúciós gradiens diffúziós vizsgálat gradiens diffúziós vizsgálata 1-2 n 1-2 n 1-2 n 2-4 n Kétes identifikálás esetén a törzseket referencia laboratóriumba küldjük! Multirezisztens ok detektálása Diagnosztikus és/vagy szűrővizsgálatok során izolált multirezisztens kórokozó ok Színtenyészet A identifikálása Identifikálás: hagyományos biokémiai vizsgálatokkal MALDI-TOF korong- és gradiens diffúziós vizsgálat latex-agglutináció PCR Multirezisztencia mechanizmusának (ESBL, CRE, MACI, MRPAE, MRST, MRSA, VRE)* igazolása fenotípusos és genotípusos vizsgálatokkal * ESBL: kiterjesztett spektrumú β-laktamáz, CRE: karbapenem rezisztens Enterobacteriaceae, MACI: multirezisztens Acinetobacter baumannii, MRPAE: multirezisztens Pseudomonas aeruginosa, MRST: multirezisztens Stenotrophomonas maltophilia, MRSA: methicillin rezisztens Staphylococcus aureus, VRE: vancomycin rezisztens Enterococcus spp.

15 15 Infekciókontroll célú vizsgálatok Kórokozók Minta Vizsgálat alapja Alkalmazott módszer Negatív és pozitív lelet átfordulási ideje, Betegek és környezetük bakteriológia vizsgálata Élettelen környezet felületeiről vattatamponnal vett minta Levegő ütköztetésével leoltott táptalaj Felületek mikrobiális szennyezettség vizsgálata es vizsgálattal Levegő mikrobiális szennyezettség vizsgálata es vizsgálattal aerob anaerob (Clostridium sp.) kvantitatív aerob nap (n) 2-5 n 2-3 n Megjegyzés Betegek és kórházi személyzet tagjainak szűrővizsgálatai Orr-. torok-, bőr-, sebváladékok, széklet vattatamponnal vett mintái transzport közegben vagy a nélkül Pathogén (pl. S. pyogenes, S. aureus) és/vagy multirezisztens ok (pl. MRSA) a vizsgálattal, antigén detektálással, Antibiotikum érzékenység és rezisztencia mechanizmus meghatározás aerob/anaerob latex agglutináció, MALDI-TOF vizsgálat hagyományos és/vagy kereskedelmi biokémiai próbák PCR antibiotikum korongdiffúziós gradiens diffúziós vizsgálat 2-5 n