BAKTERIOLÓGIAI ÉS MIKOLÓGIAI SZOLGÁLTATÁSI JEGYZÉK

Átírás

1 1 BAKTERIOLÓGIAI ÉS MIKOLÓGIAI SZOLGÁLTATÁSI JEGYZÉK Pécsi Tudományegyetem Orvosi Mikrobiológiai és Immunitástani Intézet Bakteriológiai és Kórházhigiénés Laboratórium Készítette: Dr. Mestyán Gyula Átnézte: Dr. Kovács Krisztina, Dr. Melegh Szilvia Készült: szeptember Felülvizsgálta: Dr. Mestyán Gyula / február 26. BAKTERIOLÓGIAI ÉS KÓRHÁZHIGIÉNÉS LABORATÓRIUM TEVÉKENYSÉGI KÖRE Klinikai diagnózis Minta Vizsgálat neve Alkalmazott módszer Lelet átfordulási idő nap (n) Plaut-Vincent angina Felső légúti fertőzés Vattatamponnal vett minta steril tárgylemezen készített, hővel fixált kenetét kell a laboratóriumba küldeni! Kórokozó (ok) vizsgálattal Karbolfukszin vagy Megjegyzés A laboratóriumi diagnózishoz nem feltétlenül szükséges! Szájnyálkahártya fertőzése Nyálkahártya kaparék, biopszia; Vattatampon törlés Kórokozó kimutatás Epiglottitis A klinikai diagnózis felállításához nem szükséges i (torokváladék v. Vigyázat! 5-10 n

2 2 Pharyngitis / bakteriális Peritonsilláris-, submandibuláris -, retropharyngeális abscessus, Lemierre szindróma, Ludwig angina Otitis externa Akut otitis media Krónikus otitis media epiglottis váladék) eredmény! Vér / (HK) Torokváladék / vattatamponon, transzport közegben Biopszia, aspirátum, abscessus mosófolyadék Vattapálca használata nem javasolt! Vér / (HK) Külső hallójárati exsudátum, kaparék, biopszia Középfül aspirátum Szivárgó középfül folyadék/ kis átmérőjű vattatamponon, transzport közegben Középfül aspirátum Szivárgó középfül folyadék / kis átmérőjű vattatamponon anaerob transzport közegben kimutatás HK aerob anaerob Aerob HK aerob anaerob aerob aerob 2-4 n 3-5 n 3-5 n Torokváladék vételekor az epiglottis törlése légúti elzáródást okozhat! Vattapálcával vett minta kis mennyisége miatt a vizsgálat álnegatív eredménnyel zárulhat! mellett a vér e is fontos. Mastoiditis Középfül aspirátum, mastoid szövet biopszia

3 3 Orrváladék / MRSA szűrés Akut bakteriális sinusitis Komplikált sinusitis / Komplikált sinusitis / Krónikus bronchitis akut exacerbációja Pneumonia / CAP, HAP, VAP Alsólégúti fertőzés Orrüreg elülső részének (mindkét felének) törlése, vattatamponon, transzport közegben Sinus aspirátum Sinus aspirátum Sinus aspirátum, szövetminta Köpetminta Középsugaras vizelet Köpet, tracheaváladék MRSA Kórokozó Minta kvalitatív értékelése vizsgálattal Streptococcus pneumoniae szolubilis antigén kimutatás Minta kvalitatív értékelése vizsgálattal Szelektív, aerob aerob aerob Immunkromatográfia aerob 3-5 nap 3-5 n 2-5 n 2-5 n Vigyázat! Orrüreg vizsgálata félrevezető álnegatív vagy álpozitív eredménnyel járhat! Az alsó légúti minták vizsgálata mellett a vér e is fontos.

4 4 Aspirációs pneumonia Invazív aspergillosis BAL Középsugaras vizelet Vér / (HK) Bronchoszkóppal vett minta Vér / (HK) Trachea, BAL Szérum, BAL és Streptococcus pneumoniae és/vagy Legionella pneumophila szolubilis antigén kimutatás a Aspergillus Aspergillus galactomannan Ag kimutatás szemikvantitatív aerob Immunkromatográfia HK HK aerob anaerob, -festés ELISA 2-5 n 4-7n vizsgálat napján Vizsgálatok indításának időpontjai: hétfőn és csütörtökön / 10:00h Pleura űr fertőzése Pleurális folyadék Vér / (HK) aerob, anaerob HK 4-7 nap Az alsó légúti minták vizsgálata mellett a vér e is fontos.

5 5 Cisztás fibrózis Oesophagitis / Candidiasis Gastritis / Helicobacter pylori Köpet, torokváladék, egyéb légúti minta Gasztrointesztinális traktus fertőzései Kaparék, biopszia Több helyről vett biopsziás minta Kórokozó Helicobacter pylori aerob, microaerophil 4-6 n 3 hét Mintavétel előtt konzultálni szükséges a bakteriológiai laboratóriummal. Kardiovaszkuláris rendszer és véráram fertőzés Szepszis, bakteriémia, fungaemia, Endocarditis Vér / (HK) Vér / (HK) szívbillentyű aerob, anaerob 4-7 nap A sikeres hez speciális transzport közeg szükséges. Érkanül fertőzés Kanülvég

6 6 Érgraft fertőzése Pericarditis, myocarditis Vér / (HK) Biopszia, graft darab, szövetminta Vér / (HK) Pericardiális folyadék, biopszia Vér / kórokozó aerob és Központi idegrendszeri fertőzések Meningitis Liquor Kórokozó ok vizsgálattal, antigén detektálással és szemikvantitatív, aerob Aerob Aerob és anaerob latex agglutináció, 4-7 n 4-6 n 7-21 n 4-7 n 4-6 nap A kanülvég vizsgálata mellett a vér e is fontos. A kanül i eredménye csak a párhuzamosan vett HK eredménnyel együtt értékelhető. mellett a vér e is fontos. mellett a vér e is fontos. A liquor vizsgálata mellett a vér e is fontos.

7 7 Shunt és ventriculáris drain fertőzés Vér / Liquor Vér / Kórokozó ok vizsgálattal, antigén detektálással és Encephalitis Liquor Kórokozó ok Vér / latex agglutináció, aerob 4-6 nap 4-7 n A liquor vizsgálata mellett a vér e is fontos. A liquor vizsgálata mellett a vér e is fontos. Agyi abscessus Aspirátum, biopszia ( liquor) Vér / kórokozó ; n mellett a vér e is fontos.

8 8 Szem fertőzései Conjunctivitis Cellulitis, könnycsatorna, szemhéj fertőzései Keratitis Endophtalmitis 2 darab vattapálcán vett minta (1. festés, 2. ) Konjunktíva kaparék, szövetbiopszia Vér / Cornea kaparék betegágy mellett készített tárgylemez kenete leoltott illetve beoltott aerob Véres -, Csokoládé és folyékony dúsító táptalajok Aspirátum, biopszia minta betegágy mellett készített tárgylemez kenet és leoltás táptalajai Vér / Intraabdominális fertőzések kórokozó kórokozó aerob 2-4 n 4-6 n 4-6 n 4-6 n mellett a vér e is fontos lehet. mellett a vér e is fontos lehet.

9 9 Peritonitis: peritoneális dialízissel asszociált peritonitis Peritoneális folyadék; Kétféle formában kell küldeni, párhuzamosan: 1. Natív folyadék dializáló zsákban 2. HK palackokba injektált folyadék A peritoneális folyadék vizsgálata mellett a vér e is fontos. Abscessus (máj, lép), epeúti -, pancreas fertőzés Vér / Aspirátum; Kétféle formában kell küldeni, párhuzamosan: 1. Natív: ml 2. HK Aerob és anaerob mellett a vér e is fontos. Vattapálcával vett minta kis mennyisége miatt a vizsgálat álnegatív eredménnyel zárulhat! Vattapálca használata nem javasolt! Vér / Csont és ízületi fertőzések Osteomyelitis Biopsziás minta, sebváladék 4-6 n mellett a vér e is fontos.

10 10 Arthritis, Bursitis, Izületi protézis fertőzés Vér / A. Szinoviális folyadék, aspirátum; Kétféle formában kell küldeni, párhuzamosan: 1. Natív: 5-50 ml 2. HK 5-25 n Vattapálcával vett minta kis mennyisége miatt a vizsgálat álnegatív eredménnyel zárulhat! mellett a vér e is fontos. B. Biopsziás minta C. Protézis Vattapálca használata nem javasolt! Vér / Húgyúti fertőzések Cystitis Középsugaras vizelet Pyelonephritis Középsugaras vizelet Szemikvantitatív aerob Szemikvantitatív aerob 2-4 n 2-4 n A vizelet vizsgálata mellett a vér e is fontos.

11 11 Vér / Akut prostatitis Középsugaras vizelet Krónikus prostatitis Vér / A. Három, szeparált vizelet minta (első -, középső-, utolsó porció) B.prosztata masszátum Genitális traktus fertőzései Szemikvantitatív aerob A minták szemikvantitatív összehasonlító vizsgálata; aerob 2-4 n 4-6 n mellett a vér e is fontos. Urethritis (Mycoplasma, Ureaplasma) Gonorrhea (cervicitis, urethritis, conjunctivitis, pharyngitis, proctitis) Urethra minta vagy Vizelet (első porció) Vattapálca törlés és antibiotikum érzékenységi vizsgálata N. gonorrhoeae kimutatás Szemikvantitatív antibiotikum érzékenység vizsgálat Aerob (CO2) 2 n 3 n Vaginitis / sarjadzó A. Betegágy mellett készített Gomba kimutatás 2-7 n Mintavétel előtt konzultálni szükséges a bakteriológiai laboratóriummal. A sikeres hez speciális transzport közeg szükséges.

12 12 tárgylemez kenet B. Vaginális törlés vattapálcával Endometritis, PID A. Endometriális -, tubo-ovarialis -, egyéb aspirátumok; Kétféle formában kell küldeni, párhuzamosan: Gomba Aerob és anaerob mellett a vér e is fontos. 1. Natív: 5-50 ml 2. HK B. Biopsziás minta Vér / Bőr és lágyrész fertőzések Felületes sebfertőzés Traumás eredetű bőrfertőzés; Műtéti sebfertőzés; Emberi, állati harapott sebek; Egyéb mélyszöveti fertőzések Aspirátum, szövetbiopszia Vattapálca használata nem javasolt! Aspirátum, szövetbiopszia Vattapálca használata nem javasolt! Vér / és kimutatás aerob 2-4 n Vattapálcával vett minta kis mennyisége miatt a vizsgálat álnegatív eredménnyel zárulhat! Vattapálcával vett minta kis mennyisége miatt a vizsgálat álnegatív eredménnyel zárulhat! mellett a vér e is fontos.

13 13 Kórokozó közvetlen mintából, nem es vizsgálattal Klinikai diagnózis Minta Vizsgálat neve Alkalmazott módszer Lelet átfordulási idő nap (n) Invazív aspergillosis BAL, szérum Aspergillus galactomannan kimutatás Bakteriális meningitis (bakteriémia) Szerotipizálás β-hemolizáló streptococcusok Salmonella spp. Liquor (vér, vizelet) Baktérium színtenyészete Baktérium színtenyészete Meningitist okozó fontos kórokozók (S. pneumoniae, S. agalactiae, H. influezae, N. meningitidis) szolubilis antigénjeinek közvetlen Csoportspecifikus antigének meghatározása Salmonella antigénjeinek (O és H) detektálása Kvantitatív antigén kimutatás ELISA módszerrel Kereskedelmi forgalomban kapható latex-agglutinációs kit Kereskedelmi forgalomban kapható latex-agglutinációs kit Tárgylemez-agglutináció, kereskedelmi forgalomban kapható polyvalens savókkal A vizsgálat napján, Megjegyzés Vizsgálatok indításának időpontjai: minden hétfő és csütörtök / 10:00 ok és gombák identifikálása Kórokozók Minta Identifikálás alapja Alkalmazott módszer Lelet átfordulási idő Aerob és anaerob ok Színtenyészet Telepmorfológia és sejtmorfológia; Antigén -, i tulajdonságok vizsgálata nap (n) Ki napján Megjegyzés

14 14 biokémiai -, genetikai és fehérje profil Sarjadzó gombák Színtenyészet Telepmorfológia és sejtmorfológia; biokémiai -, genetikai és fehérje profil Fonalas gombák Színtenyészet Meghatározás alapja: telepmorfológia, sejtmorfológia, és fehérje profil MALDI-TOF Tárgylemez és/vagy latex agglutináció hagyományos és/vagy kereskedelmi biokémiai próbák (API) PCR i tulajdonságok vizsgálata MALDI-TOF Hagyományos és/vagy kereskedelmi biokémiai próbák (API) i tulajdonságok vizsgálata Mikroszkópos vizsgálat MALDI-TOF Ki napján Ki napján Kétes identifikálás esetén a törzseket referencia laboratóriumba küldjük. Kórokozók antibiotikum/antimycotikum érzékenységi vizsgálata Kórokozók Minta Vizsgálat alapja Alkalmazott módszer Lelet átfordulás időtartama Aerob és anaerob ok Színtenyészet antibiotikum érzékenységének/rezisztenciájának meghatározása Korong-diffúziós nap (n) Ki napját követően: Megjegyzés

15 15 szaporodás gátlásának szemikvantitatív kvantitatív vizsgálatával; Rezisztencia mechanizmus fenotípusos genotípusos meghatározása Sarjadzó gombák Színtenyészet Kórokozó antibiotikum érzékenységének/re zisztenciájának meghatározása szaporodás gátlásának szemikvantitatív kvantitatív vizsgálatával Fonalas gombák Színtenyészet Szaporodás gátlásának kvantitatív vizsgálata Gradiens diffúziós Mikrodilúciós Latex-agglutináció PCR vizsgálat Korong-diffúziós vizsgálat Kereskedelmi mikrodilúciós Gradiens diffúziós vizsgálat Gradiens diffúziós vizsgálat Ki napját követően: 2-4 n Kétes identifikálás esetén a törzseket referencia laboratóriumba küldjük. Multirezisztens ok detektálása Diagnosztikus és/vagy szűrővizsgálatok során izolált multirezisztens kórokozó ok Színtenyészet Baktérium identifikálása és multirezisztencia mechanizmusának (pl. ESBL, CRE, MACI, MRPAE, MRSA, VRE)* igazolása fenotípusos és genotípusos vizsgálatokkal Identifikálás: MALDI-TOF hagyományos biokémiai vizsgálatokkal Antibiotikum rezisztencia vizsgálat: - Korong- és gradiens diffúziós - Latex agglutinációs - Mikrodilúciós (API) Ki napját követően:

16 16 - PCR vizsgálatok Infekciókontroll célú vizsgálatok Kórokozók Minta Vizsgálat alapja Alkalmazott módszer Lelet átfordulá si idő Betegek és környezetük bakteriológia vizsgálata Élettelen környezet felületeiről vattatamponnal vett minták Felületek mikrobiális szennyezettség vizsgálata es vizsgálattal (Clostridium spp.) nap (n) 2-5 n Megjegyzés Levegő ütköztetésével leoltott táptalaj Levegő mikrobiális szennyezettség vizsgálata es vizsgálattal Kvantitatív aerob 2-3 n Betegek és kórházi személyzet tagjainak szűrővizsgálatai: orr-. torok-, bőr-, sebváladékok, anus, széklet vattatamponnal vett mintái transzport közegben vagy a nélkül Pathogén ok (pl. S. pyogenes, S. aureus, Clostridium spp.) Multirezisztens ok (pl. MRSA) vizsgálattal,, antigén detektálással, antibiotikum érzékenység és rezisztencia mechanizmus meghatározással I.Festés: - II.: - Aerob/anaerob I.Identifikálás: - MALDI-TOF vizsgálat - Latex agglutináció - Hagyományos és/vagy kereskedelmi biokémiai próbák (API) IV.Antibiotikum rezisztencia vizsgálat: - Korong- és grádiens diffúziós - Latex agglutinációs 2-5 n

17 - Mikrodilúciós (API) - PCR vizsgálatok 17