Képalkotás modellezése, metrikái. Orvosi képdiagnosztika 6. ea ősz

Hasonló dokumentumok
Képalkotás modellezése, metrikái. Orvosi képdiagnosztika 2017 ősz

Jelfeldolgozás bevezető. Témalaboratórium

Fourier térbeli analízis, inverz probléma. Orvosi képdiagnosztika 5-7. ea ősz

Képalkotó diagnosztikai eljárások:

Ellenőrző kérdések a Jelanalízis és Jelfeldolgozás témakörökhöz

Irányítástechnika 2. előadás

Képrekonstrukció 3. előadás

RENDSZERTECHNIKA 8. GYAKORLAT

Dekonvolúció a mikroszkópiában. Barna László MTA Kísérleti Orvostudományi Kutatóintézet Nikon-KOKI képalkotó Központ

Digitális jelfeldolgozás

Villamosságtan szigorlati tételek

Rekonstrukciós eljárások. Orvosi képdiagnosztika 2017 ősz

Wavelet transzformáció

Híradástechikai jelfeldolgozás

DINAMIKAI VIZSGÁLAT OPERÁTOROS TARTOMÁNYBAN Dr. Aradi Petra, Dr. Niedermayer Péter: Rendszertechnika segédlet 1

Z v 1 (t)v 2 (t τ)dt. R 12 (τ) = 1 R 12 (τ) = lim T T. ill. periódikus jelekre:

Jelek és rendszerek - 4.előadás

Fourier térbeli analízis, inverz probléma. Orvosi képdiagnosztika 5-7. ea ősz

Digitális jelfeldolgozás

Fourier térbeli analízis, inverz probléma. Orvosi képdiagnosztika 7-8. ea ősz

Az Orvosi Fizika Szigorlat menete a 2012/2. tanévtől

Jelfeldolgozás. Gyakorlat: A tantermi gyakorlatokon való részvétel kötelező! Kollokvium: csak gyakorlati jeggyel!

Mintavétel: szorzás az idő tartományban

Rekonstrukciós eljárások. Orvosi képdiagnosztika 2017 ősz

Fourier térbeli analízis, inverz probléma. Orvosi képdiagnosztika 6-8. ea ősz

7. Előadás tartalma. Lineáris szűrők: Inverz probléma dekonvolúció: Klasszikus szűrők súly és átviteli függvénye Gibbs jelenség

ADAT- ÉS INFORMÁCIÓFELDOLGOZÁS

ÉRZÉKELŐK ÉS BEAVATKOZÓK I. 3. MÉRÉSFELDOLGOZÁS

Fehérzajhoz a konstans érték kell - megoldás a digitális szűrő Összegezési súlyok sin x/x szerint (ez akár analóg is lehet!!!)

Jelek és rendszerek 1. 10/9/2011 Dr. Buchman Attila Informatikai Rendszerek és Hálózatok Tanszék

Jelfeldolgozás - ANTAL Margit. impulzusválasz. tulajdonságai. Rendszerek. ANTAL Margit. Sapientia - Erdélyi Magyar Tudományegyetem

Pontműveletek. Sergyán Szabolcs Óbudai Egyetem Neumann János Informatikai Kar február 20.

Shift regiszter + XOR kapu: 2 n állapot

7. Moduláció átviteli függvény mérése

Tartalomjegyzék. Emlékeztetõ. Emlékeztetõ. Spektroszkópia. Fényelnyelés híg oldatokban A fény; Abszorpciós spektroszkópia

Digitális jelfeldolgozás

Képfeldolgozó eljárások áttekintés. Orvosi képdiagnosztika

Abszorpciós spektroszkópia

Jelek és rendszerek MEMO_03. Pletl. Belépő jelek. Jelek deriváltja MEMO_03

MRI áttekintés. Orvosi képdiagnosztika 3. ea ősz

Rekonstrukciós eljárások. Orvosi képdiagnosztika 2017 ősz

Tartalomjegyzék. Emlékeztetõ. Emlékeztetõ. Spektroszkópia. Fényelnyelés híg oldatokban 4/11/2016. A fény; Abszorpciós spektroszkópia

Számítógépes gyakorlat MATLAB, Control System Toolbox

Lineáris leképezések. Wettl Ferenc március 9. Wettl Ferenc Lineáris leképezések március 9. 1 / 31

4. Szűrés frekvenciatérben

2. témakör. Sztochasztikus, stacionárius és ergodikus jelek leírása idő és frekvenciatartományban

Digitális képek. Zaj és tömörítés

Elektronika Előadás. Digitális-analóg és analóg-digitális átalakítók

Objektív beszédminősítés

Mátrix-exponens, Laplace transzformáció

3. Szűrés képtérben. Kató Zoltán. Képfeldolgozás és Számítógépes Grafika tanszék SZTE (

1. Képalkotás. Kató Zoltán. Képfeldolgozás és Számítógépes Grafika tanszék SZTE (

Mérés és adatgyűjtés

Akusztikai tervezés a geometriai akusztika módszereivel

Ha sokáig mérünk: kiátlagoljuk a jelet Milyen lesz ez a súlyfüggvény? T idejű integrálás + delta függvény T ideig integrálva:

ELLENŐRZŐ KÉRDÉSEK. Váltakozóáramú hálózatok

M N. a. Spin = saját impulzus momentum vektor: L L nagysága:

Gépészeti rendszertechnika (NGB_KV002_1)

FODOR GYÖRGY JELEK ÉS RENDSZEREK

Hadházi Dániel.

Rugózott vezetőülés vizsgálata

Mechatronika alapjai órai jegyzet

Orvosi képdiagnosztika

Mérés és adatgyűjtés

Képfeldolgozó eljárások áttekintés. Orvosi képdiagnosztika 9. ea ősz

Spektrográf elvi felépítése. B: maszk. A: távcső. Ø maszk. Rés Itt lencse, de általában komplex tükörrendszer

2. gyakorlat Mintavételezés, kvantálás

Számítógépes gyakorlat Irányítási rendszerek szintézise

Röntgensugárzás az orvostudományban. Röntgen kép és Komputer tomográf (CT)

Idő-frekvencia transzformációk waveletek

Az ipari komputer tomográfia vizsgálati lehetőségei

1. témakör. A hírközlés célja, általános modellje A jelek osztályozása Periodikus jelek leírása időtartományban

A gyakorlat célja a fehér és a színes zaj bemutatása.

Képalkotó diagnosztikai eljárások:

Képrestauráció Képhelyreállítás

Számítógép-vezérelt szabályozás- és irányításelmélet

Objektív beszédminısítés

Mérési struktúrák

DIGITÁLIS KÉPANALÍZIS KÉSZÍTETTE: KISS ALEXANDRA ELÉRHETŐSÉG:

illetve, mivel előjelét a elnyeli, a szinuszból pedig kiemelhető: = " 3. = + " 2 = " 2 % &' + +

ÉRZÉKELŐK ÉS BEAVATKOZÓK I. 5. A JELFELDOLGOZÁS ALAPJAI: JELEK

Bevezetés az ökonometriába

A következő feladat célja az, hogy egyszerű módon konstruáljunk Poisson folyamatokat.

Rekonstrukciós eljárások. Orvosi képdiagnosztika előadás 2015 ősz

π π A vivőhullám jelalakja (2. ábra) A vivőhullám periódusideje T amplitudója A az impulzus szélessége szögfokban 2p. 2p [ ]

Következõ: Lineáris rendszerek jellemzõi és vizsgálatuk. Jelfeldolgozás. Lineáris rendszerek jellemzõi és vizsgálatuk

Irányítástechnika GÁSPÁR PÉTER. Prof. BOKOR JÓZSEF útmutatásai alapján

Mintavételezés és AD átalakítók

Fény- és fluoreszcens mikroszkópia. Optikai szeletelés

Idő-frekvencia transzformációk waveletek

Matematika A2 vizsga mgeoldása június 4.

Gibbs-jelenség viselkedésének vizsgálata egyszer négyszögjel esetén

ÉRZÉKELŐK ÉS BEAVATKOZÓK II. 5. DC MOTOROK SZABÁLYOZÁS FORDULATSZÁM- SZABÁLYOZÁS

ÉRZÉKELŐK ÉS BEAVATKOZÓK I. 6. A MINTAVÉTELI TÖRVÉNY

Fourier-sorfejtés vizsgálata Négyszögjel sorfejtése, átviteli vizsgálata

Az Informatika Elméleti Alapjai

FEGYVERNEKI SÁNDOR, Valószínűség-sZÁMÍTÁs És MATEMATIKAI

(Independence, dependence, random variables)

Történeti Áttekintés

Informatika Rendszerek Alapjai

Átírás:

Képalkotás modellezése, metrikái Orvosi képdiagnosztika 6. ea. 2015 ősz

Jelölésjegyzék Rendszer válasza f gerjesztésre: Dirac-delta: x ; egységugrás: 0 idejű Dirac-delta gerjesztése a rendszer válasza: h x, x h x x Konvolúció: g Fourier transzformáltja: G FT g g spektruma: G g sávszélessége: bwg X eloszlás várható értéke: X, szórása: std X 2 Szürkeárnyalatos képet leíró leképezés: I : R R Elemenkénti átlagolás: S f x h x, x0 LTI esetben: 0 0 1 x i 1: M I x, y 1 M I x, y i

Tartalom Elméleti áttekintés lineáris rendszerek: LTI rendszerek leírása konvolúciós integrál Rendszer identifikáció Folytonos idejű Fourier transzformáció Képalkotás mérése lineáris rendszerekkel: Point Spread Function, Modulation Transfer Function, Noise Power Spectra, SNR, CNR NEQ, DQE

Lineáris rendszerek Komplex, fizikai rendszerek sosem lineárisak Linearizálás nélkül kezelhetetlenül bonyolultak Leginkább sztochasztikus folyamatok Lin. rendszerként várható értékük jellemezhető Lineáris rendszerek jellemzői Rendszer: S : A B Lineáris: S a f b g a S f b S g a, b R f, g : C A

Lineáris rendszerek vizsgálata Eltolás-invariáns (idő invariáns) rendszer: S f x x y x S f y 0 0 Dirac impulzus: 2 1 x x lim exp 0 2 2 2 Impulzusválasz: h x, x S y x x Eltolás-invariáns rendszernél: 0 0 LTI rendszereket egyértelműen leírja h x, x h x x 0 0 h x

LTI rendszerek válasza (konvolúciós integrál) Közelítsük infinitezimális téglákkal f-et: S f x yˆ x : f j x hx, j x x Ha Közelítő modell helyességének feltételei: f folytonos h x, y is folytonos függvénye y -nak x 1 eltolás invariáns: Tömörebben: j S S f x lim yˆ x f x ' hx x ' dx ' x0 x ' y x : S f x f h x

LTI rendszerek válasza (konvolúciós integrál) + + :

LTI rendszerek válasza (konvolúciós integrál)

LTI rendszerek Impulzusválasz ( h) egyéb elnevezései: Súlyfüggvény Gerjesztés Válasz függvény Képalkotó rendszereknél: Point Spread Function Fizikai képalkotó rendszerek sajátosságai: Rögzített képek (projekciók, stb.): y h x 3 Általában x : R R, 2 y : R R a képalkotás, és a fizikai foton interakciók függvénye

Egyszerű rendszerek impulzusválasza Arányos tag: (szemléltetés) Integráló tag: Diffrenciáló tag: Holtidős tag:

Fourier Transzformáció Folytonos függvények lineáris transzformációja: 2 2 ; f x F e j e j F f x x dx x d Euler formula: LTI rendszerek vizsgálata Fourier tartományban: ' x ' Konvolúció tétel: exp j 2 x cos 2 x j sin 2 x j2 xx ' y x h x F e d dx ' 2 ' 2 ' j y x F h x e x dx ' e j x d x ' Y F H

LTI rendszerek konvolúció tétel LTI rendszer sajátfüggvényei az FT bázisfüggvényei (komplex exponenciálisak): frekvenciájú szinuszos jelre adott válasz is frekvenciájú szinuszos jel: LTI

LTI rendszerek átviteli függvény Átviteli függvény: H FT h H H exp j H értelmezése: H rendszer erősítése (1/ tehetetlensége): ~ jel változásának sebessége Fizikailag realizálható rendszerek sávkorlátozottak:, ha bw h H 1 Általában monoton csökkenő függvény H rendszer fázis tolása (késleltetése): FT f x x F exp j 2 x 0 0

LTI rendszerek identifikációja H meghatározása: Egységimpulzus ( x) gerjesztés Egységugrás gerjesztés: h x ds 1 x dx 1 x x ' dx ' Szinuszos vizsgálójellel (LTV-hez is jó): f x A cos 2 x 0 0 cos2 y x A A x H x 0 0 exp A j sign? esetén

LTI rendszerek identifikációja Multiszinuszos vizsgálójel (LTV rendszerekhez is): f x A cos2 i i x i i y x H i Fourier Sorfejtése megadja értékeit S Fehér zajjal: Bemeneti zaj: teljesítménysűrűség spektruma egyenletes Kimeneti zaj teljesítménysűrűség spektruma H 2

Képalkotó rendszerek jellemzése Képalkotás általános modellje: Lineáris rendszer: Lineáris rendszerek GV vizsgálat Ideális gerjesztés: dirac-delta Közelítése: pontszerű gerjesztés A gerjesztés is GV válasza egy lineáris rendszernek ( l,, ) Közvetlenül a ( h*l ) rendszert vizsgáljuk

Point Spread Function Általános modell (konv. integrál)- a gerjesztés képét elmosás és additív zaj degradálja: g x, y h x, y;, f, d dd x, y,, 0 f,, : gerjesztés (vizsgált objektum) xy, : additív zaj h x, y;,, : rendszer súlyfüggvénye PSF-je Inverz probléma később részletesen tárgyaljuk

Point Spread Function Nem szükségszerűen izotropikus: Fényképezőgépek / mikroszkópok inhomogén lencsék okozzák az anizotróp PSF-et PA röntgen, CT, DTS esetén tipikusan anizotróp MRI esetén felvételi paraméterek függvénye Nem szükségszerűen shift invariáns: Jelentősen nagyobb probléma Közelítés shift invariáns rendszerekkel: Alapelv: PSF folytonos függvény Isoplanatic régiók

Modulation Transfer Function (modulációs átviteli függvény) Tételezzük fel, hogy a PSF pozíció független Ekkor a PSF spektrumát érdemes vizsgálni: MTF: H F h Elterjedt még az OTF / MTF felbontás is: Optical Transfer Function: HH Modulation Transfer Function: Effektív felbontás (zaj nélkül): Képalkotásban 0.5-ös MTF érték határozza meg 0,0 HH bwh 0,0

Röntgen detektor MTF példák

MTF mérése MTF definiálásánál LTI modellt használtunk: Expected MTF: célja az alul-mintavételezés hatására keletkező moire hatásait degradálni Gyakori megvalósításai: Vonalpár fantom: MTF származtatható belőle Rés módszer: magas frekvencián pontosabb Él módszer: alacsony frekvencián pontosabb Általában egy irány mentén mérhető: Ami a fantom elhelyezésétől függ

MTF mérése vonalpár fantomok Catphan 500 FBP-vel rekonstruált axiális szelet

MTF mérése vonalpár fantom Digitális fényképezőgépekhez készült fantom:

MTF mérése: él módszer - A fantom éle nem párhuzamos az oszlopokkal. - Így lehetőség nyílik az él felül-mintavételezésére, korrigálható az alulmintavételezési probléma. - Az élre merőleges derivált adja meg a PSF-et.

MTF PSF közötti kapcsolat

MTF szerinti minősítés

Signal to Noise Ratio (jel / zaj viszony) Általános jelfeldolgozásban: Általában additív zaj Képalkotó rendszerek esete: f homogén objektum legyen SNR 10log P P 20 log A A db x,y 10 signal noise 10 signal noise N N a homogén objektum képének kiterjedése, fontos, hogy elegendően nagy legyen (pl.: 20 cm 20 cm) Egyéb módszerekkel is mérhető x, y x, y SNR I std I x,y N

Contrast to Noise Ratio (kontraszt / zaj viszony) Kontraszt önmagában nem jó minősítő: Gyakran főleg a zaj generálja Objektumok elkülönítését javítja a jobb kontraszt, de degradálja a nagyobb zaj CNRA, B CA, B N I x, y I x, y std I x, y x,y A A,B a két elkülöníteni kívánt objektum képe N azon régió, melyből becsülhető a képzaj: Ennek konkrét megválasztása esetfüggő Alkalmazása (mint metrika) főleg orvosi körben elterjedt x,y B x,y N

CNR mérése CT esetén - Fontos, hogy nem tételez fel lineáris képalkotást! - Szeleten belüli felbontás vs. sugárdózis optimalizáció - Nemlineáris rekonstrukciók minősítése Catphan 600

Röntgen kvantum jellemzői Kvantum: fotonok száma Fotonok eloszlása: Érzékelő felületén/ időben nem egyenletes Sugárzás inherens zaját ez a jelenség generálja Ergodikus eloszlással írható le Véletlen Poisson Folyamat: Q várható érték esetén Q szórás Ideális képalkotó rendszer: Plusz zajt nem generál ( SNR SNR ) out in

Noise Power Spectrum (zaj teljesítmény spektrum) A képzaj energiája frekvenciafüggő: DFT felbontásával szorzás oka: Összehasonlíthatóvá válnak különböző pixel méretű detektorok - mintavételezési területtel normálunk Parseval tétel:, lim bin 1:M 2 NPS u v f F I S Nx, Ny, M NPS u, v 2 N uv, 2D DFT felbontása (következő órán részletezzük): f f N 1 N N bin sampling samples x y x y

Normalized NPS: Noise Equivalent Quanta (zaj ekvivalens kvantum) Kompenzálja a rendszer erősítését (akkor van értelme, ha ROI-kat vizsgálunk) 2 NNPS u, v NPS u, v I x, y dxdy Noise Equivalent Quanta: xy, Mennyi foton lenne szükséges ugyanazon képminőség eléréséhez, ha ideális lenne a képalkotás NEQ u, v MTF u, v NNPS u, v SNR u, v 2 2

Detective Quantum Efficiency (kvantum feldolgozás hatékonysága) Eddigi metrikáknál nem vizsgáltuk a dózistól / fotonok számától való függést: DQE u, v NEQ u, v Q Q a vizsgált detektort elérő foton kvantum (kb. fotonok száma, dózis, ) Fontos interpretáció: 2 2 DQE u, v SNR u, v SNR u, v SNR out in u, v in : érzékelőelemre belépő jel (pl. röntgensugár, fotonok) SNR je A kész rendszer információ átvitelének hatékonyságát méri, értéke 0 és 1 között változik.

DQE számolási példák -1- Adott egy röntgen detektor, melyet az alábbi rendszer ír le: Egy ideális detektor és egy csillapító réteg soros kaszkádja (pl. CsI szcintillátor), a csillapító réteg nem változtatja az átmenő sugárzás eloszlásának osztályát. A szcintillátor a felületét elérő fotonok ¼-éből generál látható fotont, plusz zajt nem generál. Q=5000 röntgen foton/ pixel éri a teljes rendszert. NEQ=? DQE=? SNRin=? SNRout=?

DQE számolási példák -2- Adott egy röntgen detektor, mely: Ideális detektor, és zajos A/D átalakító soros kaszkádja, mely zaja ekvivalens 50 foton/pixel-el a belépő sugárzás fluxusában (inherens zaj). A kiolvasási zaj és a detektort érő fotonok zaja Poisson eloszlású, egymással korrelálatlan. Q=10000 foton/pixel éri a detektor felületét. NEQ=? DQE=? SNRin=? SNR=? Jó közelítéssel ez a két zajforrás aggregálódik (Hf. az aggregált rendszer metrikái).

Röntgen detektor kvantum modellje