Kutatási terület. Szervetlen és szerves molekulák szerkezetének ab initio tanulmányozása

Hasonló dokumentumok
A TÖMEGSPEKTROMETRIA ALAPJAI

Folyadékszcintillációs spektroszkópia jegyz könyv

A kémiai kötés magasabb szinten

összetevője változatlan marad, a falra merőleges összetevő iránya ellenkezőjére változik, miközben nagysága ugyanakkora marad.

Elektronegativitás. Elektronegativitás

A kémiai kötés magasabb szinten

Modern Fizika Labor Fizika BSC

Gamma-röntgen spektrométer és eljárás kifejlesztése anyagok elemi összetétele és izotópszelektív radioaktivitása egyidejű elemzésére

A periódusos rendszer, periodikus tulajdonságok

Idegen atomok hatása a grafén vezet képességére

A kvantummechanika kísérleti előzményei A részecske hullám kettősségről

Modern fizika laboratórium

Középfeszültségű gázszigetelésű kapcsolóberendezések villamos szilárdsági méretezése. Madarász Gy. - Márkus I.- Novák B.

Kötések kialakítása - oktett elmélet

Sugárzások kölcsönhatása az anyaggal

Modern Fizika Labor. Fizika BSc. Értékelés: A mérés dátuma: A mérés száma és címe: 13. mérés: Molekulamodellezés PC-n április 29.

4. Fejezet Csonka Gábor István MTA Doktori Értekezés

Modern Fizika Labor. 12. Infravörös spektroszkópia. Fizika BSc. A mérés dátuma: okt. 04. A mérés száma és címe: Értékelés:

Modern fizika laboratórium

Fizikai kémia 2. Előzmények. A Lewis-féle kötéselmélet A VB- és az MO-elmélet, a H 2+ molekulaion

MTA Atommagkutató Intézet, 4026 Debrecen, Bem tér 18/c.

2. (d) Hővezetési problémák II. főtétel - termoelektromosság

8. Egyszerû tesztek sûrûség funkcionál módszerek minõsítésére

Kémiai kötés. Általános Kémia, szerkezet Slide 1 /39

Compton-effektus. Zsigmond Anna. jegyzıkönyv. Fizika BSc III.

Modern Fizika Labor. Fizika BSc. Értékelés: A mérés dátuma: A mérés száma és címe: 12. mérés: Infravörös spektroszkópia május 6.

Modern Fizika Labor. Fizika BSc. Értékelés: A mérés dátuma: A mérés száma és címe: 5. mérés: Elektronspin rezonancia március 18.

FELADATMEGOLDÁS. Tesztfeladat: Válaszd ki a helyes megoldást!

Atomfizika. Fizika kurzus Dr. Seres István

Modern Fizika Labor Fizika BSC

OPTIKA. Fénykibocsátás mechanizmusa fényforrás típusok. Dr. Seres István

Kémiai kötés. Általános Kémia, szerkezet Dia 1 /39

Geofizikai kutatómódszerek I.

BÍRÁLAT. Kállay Mihály Automatizált módszerek a kvantumkémiában című MTA doktori értekezéséről.

Tartalom. Történeti áttekintés A jelenség és mérése Modellek

BŐVÍTETT TEMATIKA a Kondenzált anyagok fizikája c. tárgyhoz

Energiaminimum- elve

Z bozonok az LHC nehézion programjában

Kvarkok. Mag és részecskefizika 2. előadás Február 23. MRF2 Kvarkok, neutrínók

Modern Fizika Labor. A mérés száma és címe: A mérés dátuma: Értékelés: Infravörös spektroszkópia. A beadás dátuma: A mérést végezte:

Atomfizika. Fizika kurzus Dr. Seres István

Savak bázisok. Csonka Gábor Általános Kémia: 7. Savak és bázisok Dia 1 /43

Elektrodinamika. Maxwell egyenletek: Kontinuitási egyenlet: div n v =0. div E =4 div B =0. rot E = rot B=

A kovalens kötés elmélete. Kovalens kötésű molekulák geometriája. Molekula geometria. Vegyértékelektronpár taszítási elmélet (VSEPR)

Atomok és molekulák elektronszerkezete


A hőterjedés dinamikája vékony szilikon rétegekben. Gambár Katalin, Márkus Ferenc. Tudomány Napja 2012 Gábor Dénes Főiskola

Erős terek leírása a Wigner-formalizmussal

Al-Mg-Si háromalkotós egyensúlyi fázisdiagram közelítő számítása

Kémiai kötés. Általános Kémia, szerkezet Dia 1 /39

OH ionok LiNbO 3 kristályban (HPC felhasználás) 1/16

Szervetlen kémia I. kollokvium, (DEMO) , , K/2. Írják fel a nevüket, a Neptun kódjukat és a dátumot minden lapra!

Szalai István. ELTE Kémiai Intézet 1/74

Szakdolgozat Vegyész MSc. Sarka János. A H5 + molekulaion és izotopológjai nagyfelbontású spektroszkópiájának kvantumkémiai vizsgálata.

Alapvető bimolekuláris kémiai reakciók dinamikája

Savak bázisok. Csonka Gábor Általános Kémia: 7. Savak és bázisok Dia 1 /43

A Coupled-Cluster módszer alkalmazhatósága molekulák elektrongerjesztett állapotának leírására

ESR-spektrumok különbözı kísérleti körülmények között A számítógépes értékelés alapjai anizotróp kölcsönhatási tenzorok esetén

MOLEKULÁRIS TULAJDONSÁGOK

Hangfrekvenciás mechanikai rezgések vizsgálata

Pelletek térfogatának meghatározása Bayes-i analízissel

Evans-Searles fluktuációs tétel

Rádl Attila december 11. Rádl Attila Spalláció december / 21

Atomfizika. A hidrogén lámpa színképei. Elektronok H atom. Fényképlemez. emisszió H 2. gáz

A csillagközi anyag. Interstellar medium (ISM) Bonyolult dinamika. turbulens áramlások MHD

Modern Fizika Labor. 5. ESR (Elektronspin rezonancia) Fizika BSc. A mérés dátuma: okt. 25. A mérés száma és címe: Értékelés:

Molekuláris dinamika: elméleti potenciálfelületek

Kémiai kötések. Kémiai kötések kj / mol 0,8 40 kj / mol

Átmenetifém-komplexek mágneses momentuma

fizikai szemle 2018/4

Problémás regressziók

Abszorpciós spektrumvonalak alakja. Vonalak eredete (ld. előző óra)

3. (b) Kereszthatások. Utolsó módosítás: április 1. Dr. Márkus Ferenc BME Fizika Tanszék

Az ionizáló sugárzások fajtái, forrásai

Hibrid mágneses szerkezetek

Periódusos rendszer (Mengyelejev, 1869) nemesgáz csoport: zárt héj, extra stabil

Lendület. Lendület (impulzus): A test tömegének és sebességének szorzata. vektormennyiség: iránya a sebesség vektor iránya.

Azonos és egymással nem kölcsönható részecskékből álló kvantumos rendszer makrókanónikus sokaságban.

Úton az elemi részecskék felé. Atommag és részecskefizika 2. előadás február 16.

Univerzalitási osztályok nemegyensúlyi rendszerekben, Ódor Géza

3. A kémiai kötés. Kémiai kölcsönhatás

A kémiai kötés eredete; viriál tétel 1

Bevezetés a modern fizika fejezeteibe. 4. (a) Kvantummechanika. Utolsó módosítás: november 15. Dr. Márkus Ferenc BME Fizika Tanszék

Radioaktív sugárzások tulajdonságai és kölcsönhatásuk az elnyelő közeggel. A radioaktív sugárzások detektálása.

Speciális fluoreszcencia spektroszkópiai módszerek

Toluol (Bruckner II/1 476) µ= 0.33 Debye

Modern Fizika Laboratórium Fizika és Matematika BSc 12. Infravörös spektroszkópia

NA61/SHINE: Az erősen kölcsönható anyag fázisdiagramja

Fermi Dirac statisztika elemei

Thomson-modell (puding-modell)

Magspektroszkópiai gyakorlatok

Polimerek fizikai, mechanikai, termikus tulajdonságai

MATROSHKA kísérletek a Nemzetközi Űrállomáson. Kató Zoltán, Pálfalvi József

Ponthibák azonosítása félvezető szerkezetekben hiperfinom tenzor számításával

Monte Carlo módszerek a statisztikus fizikában. Az Ising modell. 8. előadás

Kémiai kötés. Általános Kémia, szerkezet Slide 1 /39

Alap-ötlet: Karl Friedrich Gauss ( ) valószínűségszámítási háttér: Andrej Markov ( )

Megmérjük a láthatatlant

Az α értékének változtatásakor tanulmányozzuk az y-x görbe alakját. 2 ahol K=10

Mechanika I-II. Példatár

Átírás:

Kutatási terület zervetlen és szerves molekulák szerkezetének ab initio tanulmányozása Cél: a molekulák disszociatív ionizációja során keletkező semleges és ionizált fragmentumok energetikai paramétereinek és fragmentációs csatornáinak meghatározása. Meghatározandó tulajdonságok: megjelenési küszöb (E ap ) és disszociációsenergiák (D) ; a különböző fragmentációs csatornák valószínűsége; ionizációs potenciál (I) és elektronaffinitás (E a ); gerjesztési energiák (E exc ); molekulapályák kötési energiái (E b ) és térszerkezete; rezgési energiák (G v ) és normál módok. Módszerek: Hartree-Fock, sűrűség-funkcionál (DFT, TD-DFT), perturbáció-elmélet (MP2), csatolt klaszter (CCD(T)) valamint többkonfigurációs (MCCF) módszerek alkalmazása a GAME és GAUIAN szoftverekkel. 2016.08.25. 2

Erőforrások Az UTA Elektronfizikai Kutatóintézetének Linux klasztere zoftveres ellátottság: GAME, NWCHEM, Intel fordítók és matematikai könyvtárak, OpenMPI. A NIIF Intézet magyarországi szuperszámítógép-rendszerének szuperszámítógépei (zeged, Debrecen1): zoftveres ellátottság: GAUIAN, GAME, NWCHEM, Intel fordítók és matematikai könyvtárak, OpenMPI. 2016.08.25. 3

zerkezeti számítások Geometriai optimalizálás különböző elméleti szinteken Kezdőgeometria optimalizálása a Hartree-Fock (HF) módszerrel További optimalizálás magasabb szintű módszerekkel sűrűségfunkcionál (DFT), perturbációs elmélet (MP2) vagy csatolt klaszter (CCD(T)) az elektronkorrelációs energia lehető legpontosabb meghatározásával. zisztematikus báziskészlet választás Gauss-típusú pályák (GTO); legtöbb esetben a Dunning-féle vagy az aug-cc-pvxz, (X=D,T,Q) típusú bázisok megfelelőek. zisztematikus XC-funkcionál választás a DFT módszer esetében. 2016.08.25. 4

További szerkezeti számítások A molekula-fragmentumok teljes energiáinak (E t ) meghatározása a legkisebb multiplett állapotokban (M=1-4). A molekulák nullponti rezgési energiáinak (G v0 ) és rezgési módjainak meghatározása. Izotóp-hatások számítása, amennyiben releváns. Alacsonyabb gerjesztési energiák (E exc ) meghatározása az időfüggő sűrűség-funkcionál (TD-DFT) módszerrel. A molekulapályák kötési energiáinak (E b ) meghatározása. Az adiabatikus és vertikális (Franck-Condon típusú) energiakülönbségek kiszámítása a disszociatív ionizációs folyamatok energetikai paramétereinek meghatározásához. 2016.08.25. 5

A kén-klaszterek térszerkezete Néhány kén-klaszter térszerkezete Központi szimmetrikus szerkezet (3-5) Gyűrű-alakú szerkezet (6-8) A kén-klaszterek térszerkezete a 2D-elektronsűrűséggel ábrázolva a 0,0030,2 metszeti síkokban 2016.08.25. 6

Az energetikai paraméterek meghatározása A megfelelő energiakülönbségeket a kén-fragmentumok esetében a következő egyenletekkel határozzuk meg: Ionizációs potenciál І[ k ] = E tot [ k ] -E tot [ k ] Elektronaffinitás E a [ k- ] = E tot [ k ] E tot [ k- ] Disszociációs energia D[( k-n n)/ k ] = = E tot [ k-n ] ne tot [] E tot [ k ] Megjelenési küszöbenergia E AP [( k-n n)/ k ] = = E tot [ k-n ] ne tot [] E tot [ k ] = = D[( k-n n)/ k ] I[ k-n ] Kén-ionok megjelenési küszöb-energiáinak meghatározása a teljes ionizációs görbéből. Kísérleti eredmények [1]. [1] A.N. Zavilopulo et al. Tech. Phys. Lett. 40, 13 (2015) 2016.08.25. 7

A kén-klaszterek ionizációs potenciálja, elektronaffinitása valamint disszociációs energiája Energetikai paraméterek zámított (elméleti) érték, ev DFT/B3PW91 HF/MP2 Kísérleti érték, ev E a 2.15 1.80 2.017149 ± 0.000009 ; 2.07 ± 0.13 I 10.48 9.78 10.360; 10.4 ± 0.3; 10.5 ± 0.3 2 E a 1.66 1.45 1.565 ± 0.050; 1.670 ± 0.015 I 9.65 9.17 9.356 ± 0.002; 9.6 ± 0.2; D(2/ 2 ) 4.50 4.03 4.45 5 E a -0.28 0.60 2.800 ± 0.050 I 7.81 8.62 8.8 ± 0.2; 8.60 ± 0.05 7 E a 1.90 1.67 3.160 ± 0.050 I 8.53 8.47 9.0 ± 0.2; 8.7 ± 0.2; 9.3 ± 0.3 D( 6 / 7 ) 2.74 2.52 8 E a 2.09 1.50 3.590 ± 0.050 I 8.06 7.52 9.3 ± 0.2; 9.6 ± 0.2; 7.3 ± 0.3 D( 7 / 8 ) 2.54 2.36 2016.08.25. 8

Néhány k ion-fragmentum megjelenési küszöb-energiája (E AP ) elektron-impakt disszociatív ionizáció során k ion Legvalószínűbb fragmentációs csatorna zámított (elméleti) érték, ev DFT/B3PW91 E AP ( k / 8 ), k=1-8 HF/MP2 Kísérleti érték, ev 8 8 8 e - 8.06 7.52 9.04 ± 0.03 7 8 7 e - 11.07 10.84 6 8 6 2 e - 9.50 9.25 11.0; 9.5 ± 0.3; 9.7 ± 0.3 6 8 6 2 e - 14.01 13.28 5 8 5 3 e - 10.60 11.04 10.2; 8.7 ± 0.2; 8.8 ± 0.2 5 8 5 2 e - 13.07 13.45 4 8 4 2 2 e - 12.97 14.01 12.5 ± 0.3; 10.3 ± 0.2 4 8 4 4 e - 13.28 14.12 3 8 3 3 2 e - 12.62 12.23 12.6 ± 0.5; 10.2 ± 0.2 3 8 3 5 e - 12.68 12.25 12.6 ± 0.5; 10.2 ± 0.2 2 8 2 6 e - 10.43 10.02 9.55 ± 0.2; 9.6 ± 0.2 8 4 3 e - 11.07 10.84 10.30 ± 0.2; 10.40 ± 0.1 2016.08.25. 9

Néhány k ion-fragmentum megjelenési küszöb-energiája (E AP ) elektron-impakt disszociatív ionizáció során (folytatás) k ion Legvalószínűbb fragmentációs csatorna zámított (elméleti) érték, ev DFT/B3PW91 E AP ( k / 6 ), k=1-6 HF/MP2 Kísérleti érték, ev 6 6 6 e - 8.72 8.39 8.5 ± 0.3; 9.5 ± 0.3; 9.7 ± 0.3 5 6 5 e - 12.29 12.60 4 6 4 2 e - 12.19 13.15 11.94 ± 0.05; 10.3 ± 0.2 4 6 4 2 e - 16.69 17.18 3 6 3 2 e - 14.31 13.78 13.3 ± 0.5 3 6 3 3 e - 18.81 17.81 2 6 2 2 2 e - 12.04 11.50 12.8 ± 1.0; 9.55 ± 0.2 2 6 2 4 e - 12.35 11.61 12.8 ± 1.0 2 6 2 3 e - 14.07 13.12 12.8 ± 1.0 2 6 2 2 2 e - 16.54 15.53 E AP ( k / 2 ), k=1-2 2 2 2 e - 9.65 9.17 9.6 ± 0.2; 9.55 ± 0.2 2 e - 14.99 13.80 14.732 ± 0.005; 13.5 ± 0.5 2016.08.25. 10

A kén-klaszterek fragmentációjának statisztikai vizsgálata A DFT/B3LYP módszerrel meghatározott teljes energiák, térszerkezet valamint a vizsgált molekulák normál módjainak rezgési energiái további számítások elvégzésének az alapjául szolgáltak. tatisztikus számítások Néstor Aguirre madridi kutatócsoportjával együttműködve, az M3C programcsomag [2] segítségével (M3C = Mikro-kanonikus Metropolis Monte-Carlo). A számítások célja: a klaszterek fragmentációs elágazási rátái; a különböző fragmentációs csatornák letörési görbéi; kísérletek során mért tömeg-spektrumok reprodukálása; A fragmentumok által felhalmozott energia eloszlás-függvénye. [2] N. Aguirre,. Díaz-Tendero, P-A. Hervieux, M. Alcamí and F. Martín, M3C: A software package designed to describe statistical fragmentation of excited molecules. In preparation (2016). 2016.08.25. 11

Az M3C módszer tatisztikus módszer alapvetően termodinamikai tulajdonságok vizsgálatára. Alapelve: addig mozogni a fázistérben, amíg a maximális entrópiát elérjük, majd ebben a tér-régióban a keresett fizikai mennyiséget statisztikus kiátlagolással meghatározni. A fázistér dimenzióit a tömeg-, töltés-, energia- és impulzusmegmaradás törvényei felírásával határozzuk meg. Nem időfüggő. 2016.08.25. 12

Az 6 molekula fragmentációs csatornáinak letörési görbéi (breakdown curves) A különböző fragmentációs csatornák letörési görbéi a felhalmozott energia függvényében. A p az egyszeresen töltött pozitív ionokra utal. 2016.08.25. 13

Az 6 molekula fragmentációja során keletkező kénionok letörési görbéi típusuk szerint A fragmentáció során keletkező, egyszeres pozitív töltésű kén-ionokhoz tartozó letörési görbék a felhalmozott energia függvényében. A p az egyszeresen töltött pozitív ionokra utal. 2016.08.25. 14

Az 6 molekula kísérleti és elméleti tömeg-spektruma [NIT] EI, 70 ev Az 6 molekula elektronütközés során mért tömegspektruma [NIT adatbázis, 70 ev], összevetve az M3C elméleti módszerrel kapott intenzitásokkal. 2016.08.25. 15

Diszkusszió Mi lehet a nagyobb eltérés oka az 2 csúcs esetében a kísérleti és elméleti tömeg-spektrum összehasonlításakor??? Egy reakciós barrier (átmeneti állapot), amit nem vettünk figyelembe; A DFT módszer hibája, amely a legszembetűnőbb a teljes energiák meghatározásakor. Miért ennyire intenzív ez a csúcs a kísérletek során? Új számítások kellenek, a lehető legmagasabb elméleti szintet alkalmazva (pl. CCD(T)). 2016.08.25. 16

Folyamatban lévő számítások 35 különböző semleges és egyszeresen töltött pozitív kén-klaszter struktúrája DFT/M06-L [aug-cc-pvqz] számítások: Geometriai optimalizálás (relaxált térszerkezet); Normál módok rezgési energiája. CCD(T) [aug-cc-pvqz] számítások (extrém számításigényű): Teljes energia 2016.08.25. 17

Következtetések A disszociatív ionizáció energetikai paraméterei viszonylag pontosan meghatározhatóak a kisebb kén-klaszterek illetve azok ionizált fragmentumainak esetében az elérhető kvantum-kémiai módszerekkel. A DFT módszer a megfelelő XC-funkcionállal kielégítő eredményeket nyújt. A megjelenési küszöb-energiák meghatározásánál, bár úgy tűnik, pontos elméleti eredményeket kaptunk, a kísérleti fragmentációs csatornák ismeretének hiánya miatt nem lehetünk teljesen biztosak az eredmények helyességében. Az M3C statisztikus módszer lényegesen bővebb forrást nyújthat a molekula-fragmentáció dinamikájának és energetikájának megértéséhez, a különböző fragmentációs csatornák valószínűségének meghatározásához. 2016.08.25. 18