Table S1. Top and Bottom 10 most up- and down-regulated statistically significant transcripts (H 2 O 2 vs. untreated zebrafish larvae)

Méret: px
Mutatás kezdődik a ... oldaltól:

Download "Table S1. Top and Bottom 10 most up- and down-regulated statistically significant transcripts (H 2 O 2 vs. untreated zebrafish larvae)"

Átírás

1 Table S1. Top and Bottom 10 most up- and down-regulated statistically significant transcripts (H 2 O 2 vs. untreated zebrafish larvae) Rank Symbol logfc P- value Description 1 hsp70l heat shock cognate 70-kd protein, like Up-regulated GO Slim (summary) cell morphogenesis; anatomical structure development; cell cycle; ion binding; response to stress 2 mcm MCM5 minichromosome maintenance deficient 5 cell morphogenesis; anatomical structure development; cell cycle 3 mmp matrix metalloproteinase 9 peptidase activity; ion binding 4 mmp13a matrix metalloproteinase 13a peptidase activity; ion binding; cell motility; locomotion; anatomical structure development; embryo development 5 cyp24a cytochrome P450, family 24, subfamily A, polypeptide 1 oxidoreductase activity; ion binding 6 fosl1a FOS-like antigen 1a nucleic acid binding transcription factor activity; nucleus 7 cyp1a cytochrome P450, family 1, subfamily A oxidoreductase activity; ion binding 8 cry cryptochrome 5 lyase activity; cellular nitrogen compound metabolic process; response to stress; DNA metabolic process 9 plek pleckstrin 2 lipid binding; signal transduction; ion binding 10 per period homolog 2 signal transduction; response to stress Down-regulated Rank Symbol logfc Pvalue Description GO Slim (summary) 1 npas4a neuronal PAS domain protein 4a DNA binding; signal transduction; organelle; nucleus; biosynthetic process; cell; intracellular; cellular nitrogen compound metabolic process 2 plekhf pleckstrin homology domain containing, family F lipid binding; ion binding 3 serpinh1b serpin peptidase inhibitor, clade H, member 1b enzyme regulator activity; cytoplasm; response to stress 4 EGR early growth response 4 ion binding 5 nfκbiaa nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells inhibitor, alpha a DNA binding, inhibitor of NF-κB 6 lrata lecithin retinol acyltransferase a NA 7 fabp11b fatty acid binding protein 11b lipid binding; transport 8 GPR G protein-coupled receptor 3 signal transduction 9 noxo1a NADPH oxidase organizer 1a lipid binding; ion binding 10 elf E74-like factor 3 nucleic acid binding transcription factor activity; nucleus

2 Table S2. Functional annotation (Enriched Pathways) of RNA-seq data: Up-regulated differentially regulated gene set of H 2 O 2 vs. untreated larval zebrafish Up-regulated Gene Set IPA Category and Predicted Activation p-value # Molecules Cellular Growth and Proliferation 1.25E Cell Death and Survival 1.11E Organismal Survival ( death) 5.54E Gene Expression 5.79E Cellular Development ( differentiation) 8.01E Tissue Morphology ( cell quantity) 5.39E Molecular Transport 9.67E Cell Death and Survival ( survival) 9.31E Cellular Function and Maintenance ( homeostasis) 1.14E Cell Death and Survival ( viability) 1.11E Small Molecule Biochemistry (lipid amount) 2.63E Lipid Metabolism ( synthesis) 3.28E Organismal Development ( size) 7.99E Gene Expression (transactivation) 8.92E Cellular Development ( connective tissue diff.) 4.03E Cellular Movement 7.72E Immune Cell Trafficking 7.72E Tissue Morphology (connective tissue) 2.04E Digestive System Development and Function 2.42E Cellular Development (prolif. immune cells) 4.38E Molecular Transport (steroids) 5.31E Cellular Movement ( invasion) 1.50E Lipid Metabolism (fatty acids) 1.57E Embryonic Development ( abdomen) 5.31E Hematological System Development ( cell movement) 4.70E Organ Morphology (skin) 3.21E Vitamin and Mineral Metabolism ( terpenoid) 6.30E Cell Signaling 4.32E Vitamin and Mineral Metabolism ( steroids) 7.55E Free Radical Scavenging 1.18E Hair and Skin Development and Function (epidermal cells) 1.27E-03 9 Connective Tissue Development and Function (fibroblasts) 1.02E-02 8 Cellular Movement (fibroblasts) 1.07E-02 8 Hepatic System Development (regeneration) 6.05E-05 7 Organismal Injury ( glomerulonephritis) 8.18E-03 7 Hair and Skin Development (keratinocytes) 1.24E-02 7 Vitamin and Mineral Metabolism (quantity) 2.22E-03 6 Antimicrobial Response 2.88E-03 6 Immune Cell Trafficking (lymphocytes) 5.01E-03 6 Tissue Development (adhesion) 1.37E-02 5 Vitamin and Mineral Metabolism (alitretinoin) 1.09E-02 2 Note: Predicted direction (activation/deactivation) shown by arrows; Table corresponds to Worksheet 2.

3 Table S3. Functional annotation (Enriched Pathways) of RNA-seq data: Down-regulated differentially regulated gene set of H 2 O 2 vs. untreated larval zebrafish Down-regulated Gene Set IPA Category and Predicted Activation p-value # Molecules Inflammatory Response 3.34E Cellular Compromise (ER stress) 1.51E Organ Morphology (abnormal morphology of gland) 3.03E-02 9 Molecular Transport 2.82E-02 7 Organ Morphology (exocrine cells) 2.82E-05 6 Organismal Injury ( oligozoospermia) 4.63E-03 6 Cell Morphology (abnormal morphology of epithelial cells) 5.16E-03 6 DNA Replication, Recombination, and Repair 2.74E-02 6 Tissue Morphology (abnormal glandular epithelium) 1.55E-04 5 Tissue Development (organization of ECM) 7.08E-03 5 Inflammatory Response (antigen presenting cells) 2.54E-02 5 Cellular Function and Maintenance (phagocytosis) 1.28E-02 4 Cell Death and Survival (B lymphocytes) 2.19E-02 4 Protein Folding 3.11E-02 4 Small Molecule Biochemistry (cholesterol hydroxylation) 2.94E-03 2 Visual System Development and Function (abnormal morphology) 1.02E-04 3 Free Radical Scavenging (induction of ROS) 1.79E-02 2 Post-Translational Modification (refolding) 1.79E-02 2 Lipid Metabolism (catabolism of steroid) 2.42E-02 2 Cell-To-Cell Signaling (disruption of intercellular junctions) 2.42E-02 2 Free Radical Scavenging (metabolism of superoxide) 3.11E-02 2 Note: Predicted direction (activation/deactivation) shown by arrows; Table corresponds to Worksheet 2.

4 Table S4: Primers Up-regulated genes Zebrafish (RT-PCR) primer ID primer sequence gene name product length junbb_fwd AGTCGGAGCCTCCCATTTAC junbb_rev AGAACAGACGCTGTGTTGGA Jun B proto-oncogene 400bp xpc_ex8_fwd ATGGAGCCGTGAAAATATGC xpc_ex8_rev TAGTCTCCTCCCACCACTCG Xeroderma pigmentosum 396bp scd_ex6_fwd CCACACGTTTCCCTACGACT scd_ex6_rev GAGAAGAGGAAGCCGGAAAC Stearoyl-Desaturase 397bp cyp1a_ex2_fwd GTCCTGGAAATCGGAAACAA cyp1a_ex2_rev AGCTTCCATCGGCTTTCATA Cytochrome P450 Family 1, Subfamily A polypeptide 398bp sqstm1_ex3_fwd TCACTTTAGCCCTCCTGGTC sqstm1_ex3_rev CCCACATGCAGTGTCTCATC Sequestosome 1 396bp odc1_ex2_fwd CGCGGTTTACCACAGCTACT odc1_ex3_rev CAGGAAGGCGAAGTCAAAGT Ornithine Decarboxylase 402bp mmp13a_ex2_fwd AATTACCTGACTCGACTGTATGG mmp13a_ex3_rev CCAGTGGCGAAGAAGATCA Matrix Metalloproteinase 13a 404bp apold1_ex14_fwd CATCATCATCTCTGCCATCG apold1_ex15_rev AGCCCTTCTTCACCTCCTTC Apolipoprotein L domain containing 1 395bp plek2_ex9_fwd ATCGCTCTCTGAATGGCACT plek2_ex9_rev TGCATTCAGATTAACGCACA Pleckstrin 2 392bp fosl1a_ex1_fwd TTTTTATTTTATTCTACCGCTGTCA fosl1a_ex1_rev CTGTTGTTGTTGGGTTGTGC Fos-like antigen 1 390bp egfr_ex1_fwd AACGGATTCCAGGTTTTTCC egfr_ex4_rev GTCTGGGTTATCCAGGTTGG Epidermal growth factor receptor 400bp mknk1_ex14_fwd GTCTGCTCCATGAGGCTTTC mknk1_ex14_rev TAAAAGCGATGCGAATGTCA MAPK-interacting serine/threonine kinase 1 398bp junba_fwd TCACACCTGCAGCCAACTAC junba_rev TGAGCTACCTGCTCCCTCAG Jun a proto-oncogene 400bp epha2_ex3_fwd TGGTGAACGGCTCTCTTCTT Ephrin Type-A Receptor 2 (transcript 1) 403bp

5 epha2_ex3_rev GCCACACAGCCTCCTAAATC cyp24a1_fwd cyp24a1_rev AAAAGTCAACGGCAAAATGG TCTGTTGTGGCAGCGTAAAG Cytochrome P450, family 24, subfamily A, polypeptide 1 384bp gadd45bb_fwd gadd45bb_rev CTGCACAGCGACAAAACTGT TAGAAGGCACCCACTGGTTC Growth arrest and DNA-damage-inducible, beta b 372bp socs3b_fwd socs3b_rev CTCGGACCATCACCACTTCT ATGGGAGCATCGTACTCCTG Suppressor of cytokine signaling 3b 396bp hmox1a_fwd hmox1a_rev GGAAGAGCTGGACAGAAACG TCCTGCCTCTTTTGCTCTGT Heme oxygenase (decycling) 1a 405bp hsp70l_fwd hsp70l_rev GGCACCACCTACTCCTGTGT GTCACCTTCTGCCCCAGATA Heat shock cognate 70-kd protein, like 386bp mmp-9_ex4_fwd mmp-9_ex6_rev CTCACGCTTATCCTCCAGGT TTGAAAAACAAAATGGTGAAGAAA Matrix metalloproteinase 9 402bp foxo1a_fwd foxo1a_rev GCAGAATGAGGGGACTGGTA GAGGTCATTTTGGTCCCTGA Forkhead box O1 a 390bp il6st_fwd il6sf_rev CACATCATTGGCTGTTGGTC TGGTTTCATCGGAGGGTATC Interleukin 6 signal transducer 383bp vsig-10_fwd vsid-10_rev AACCCGTCAGTGCATCTTTC CCCTTGATCTAGTGGCTGGA V-set and immunoglobulin domain containing bp iitga11a_fwd iitga11a_rev CCAACAACACATTGCTGGAG TGAACCGTCCAAGACAATCA Integrin, alpha 11a 394bp Itgb4_fwd Itgb4_rev ATTGCTGAGCTGGGACAGTT TTCCCACAGACCAGATCTCC Integrin, beta 4 416bp Down-regulated genes Zebrafish (RT-PCR) primer ID primer sequence gene name cnot7_ex3_fwd cnot7_ex5_rev elf3_ex3_fwd elf3_ex4_fwd GTAGCGAGACCAATCGGAGA CGACCTCTTCATCTGGCAAC AAACCTGAGCGGCTATTCTTC TGGAGGGAAATGAGTTCTGC CCR4-NOT transcription complex, subunit 7 E74-like factor 3 (ets-domain TF, epithelia-specific) product length 400bp 402bp

6 klf4a_ex2_fwd TTCTCCATCAGGAGGTTTCG klf4a_ex2_rev CCTGCGGAAATCCAGAATAA Kruppel-like factor 4 mc1r_fwd TGGCAATCATCAAGAACAGG mc1r_rev AGTCACGAGACAGGCGATG Melanocortin 1 receptor npas4a_ex7_fwd GAAGCCTCACCTGGAAAACA npas4a_ex7_rev TCAGGAGTGGAGGGAGAAGA Neuronal PAS domain 4 itpkb_ex2_fwd GTTCAACATTCAGCCCACCT itpkb_ex2_rev GTAAGTTGGACAGGGGCAAA Inositol-trisphosphate 3-kinase B cngb3_ex6_fwd CTCCACCTCAACGCTTGTCT cngb3_ex8_rev CAACATGCCCTGGGAGTC Cyclic nucleotide gated channel beta 3 tnfb_ex2_fwd GAAGGTCAGAAACCCAACAGA tnfb_ex2_rev CAAAACCCAATGTTGGATCA TNF superfamily, member 2 nfkbiaa_ex1_fwd TCTCTCGGGCTTCACTTGTT Nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells nfkbiaa_ex2_rev GTCGTTCTGGCACTGTTTGA inhibitor, alpha a ftr53_ex4_fwd ATCAGCACCCCTTGAAATTG ftr53_ex6_rev ACACACCATAAGGCCCACTC FinTRIM family, member 53 egr_ex2_fwd ACCTACACCGGCAGCTTCTA egr_ex2_rev CTGCTTGATCCAAGTGTCCA Early growth response 4 404bp 401bp 401bp 400bp 390bp 401bp 396bp 401bp 396bp

7 Table S5. Uncharacterized differentially regulated protein-coding transcripts and lincrna (H 2 O 2 vs. untreated zebrafish larvae) Gene Homologous to: Chr Begin End logfc P Ensembl Gene ID BX IKNASE C TYPE EC_ NPKC ENSDARG BX UNKNOWN ENSDARG BX CTD SMALL PHOSPHATASE ENSDARG BX ADENYLATE CYCLASE TYPE EC_ ENSDARG BX UNKNOWN ENSDARG BX UNKNOWN ENSDARG BX RHO GTPASE ACTIVATING ENSDARG BX SYNTHASE ENSDARG BX UNKNOWN ENSDARG BX UNKNOWN ENSDARG CABZ UNKNOWN ENSDARG CABZ UNKNOWN ENSDARG CABZ ARF GAP WITH RHO GAP DOMAIN ANK REPEAT AND PH DOMAIN CONTAINING ENSDARG CENTAURIN DELTA CNT CABZ UNKNOWN ENSDARG CABZ FERRIC CHELATE REDUCTASE STROMAL CELL DERIVED ENSDARG RECEPTOR 2 SDR 2 CABZ IMMUNOGLOBULIN SUPERFAMILY MEMBER ENSDARG PRECURSOR IGSF3 CABZ UNKNOWN ENSDARG CABZ COLLAGEN ALPHA 1 IX CHAIN ENSDARG CABZ KINESIN ENSDARG CABZ POU DOMAIN CLASS 2 TRANSCRIPTION ENSDARG FACTOR OCTAMER CABZ CENTROSOMAL OF 120 KDA CEP120 COILED COIL DOMAIN ENSDARG CONTAINING 100 CABZ UNKNOWN ENSDARG CABZ MIDNOLIN MIDBRAIN NUCLEOLAR ENSDARG CR UNKNOWN ENSDARG CR UNKNOWN ENSDARG CR PERIOD CIRCADIAN HOMOLOG CIRCADIAN ENSDARG CT ARYL HYDROCARBON INTERACTING ENSDARG CU RHO GUANINE NUCLEOTIDE EXCHANGE FACTOR ENSDARG CU UNKNOWN ENSDARG CU LYSYL OXIDASE HOMOLOG PRECURSOR ENSDARG CU COLLAGEN ALPHA 1 CHAIN ENSDARG CU PROTO ONCOGENE C FOS ENSDARG CU RETINOL DEHYDROGENASE ENSDARG CU VON WILLEBRAND FACTOR A DOMAIN ENSDARG CONTAINING 7 PRECURSOR FP TYROSINE PHOSPHATASE AUXILIN EC_ DNAJ HOMOLOG SUBFAMILY C ENSDARG MEMBER 6 si:ch b12.7 UNKNOWN ENSDARG si:ch h7.5 UNKNOWN ENSDARG si:ch b11.1 SODIUM AND CHLORIDE DEPENDENT TRANSPORTER SOLUTE CARRIER FAMILY ENSDARG

8 MEMBER si:ch e1.3 LAMININ SUBUNIT ALPHA 3 PRECURSOR ENSDARG si:ch73-25i22.2 UNKNOWN ENSDARG si:dkey-104n9.1 UNKNOWN ENSDARG si:dkey-193c22.1 UNKNOWN ENSDARG si:dkey-22f5.9 UNKNOWN ENSDARG si:dkey-242g16.2 UNKNOWN ENSDARG TTC17 TETRATRICOPEPTIDE REPEAT ENSDARG wu:fj08f03 UNKNOWN ENSDARG zgc: SIALIC ACID SYNTHASE ENSDARG zgc: UNKNOWN ENSDARG zgc: FERRITIN HEAVY CHAIN ENSDARG zgc: CHYMOTRYPSINOGEN B PRECURSOR ENSDARG zgc: UNKNOWN ENSDARG zgc: UNKNOWN ENSDARG zgc: CALPAIN SUBUNIT ENSDARG zgc: UNKNOWN ENSDARG zgc:66382 TRYPSIN PRECURSOR EC_ ENSDARG zgc:91849 IMMUNOGLOBULIN SUPERFAMILY MEMBER 2 PRECURSOR IGSF ENSDARG si:dkeyp-86h10.3 Family: lincrna ENSDART

9 Table S6. Top and Bottom 40-most statistically significant differentially regulated genes (H 2 O 2 vs. untreated) from the RNA-seq larval zebrafish analysis Rank Symbol logfc (H 2 O 2 vs Untreated) Rank Symbol Up-regulated logfc (H 2 O 2 vs Untreated) Down-regulated 1 hsp70l npas4a mcm plekhf mmp serpinh1b mmp13a EGR cyp24a nfkbiaa fosl1a lrata cyp1a fabp11b cry GPR plek noxo1a per elf wdr kcnj1a cbx7a cnot cry-dash kcnj1a igfbp1a cyr sqstm CHORDC ctssb kcnj1a dnajb1b guca1c cebpb cry2a itgb ca4b bach dnaja1l junbb grk1b abhd aldh3b hsd17b12a jund APOLD CNGB bcl6ab RGS9BP keap1a muc13a junba IMPG hebp CINP pck ace abcb6a obfc grhl kcnj1a itga6b glmnb scd znf vtg mettl7a egln eif3bb lsm impg1a irg1l ugt5d AP1M hsp90aa LDLR kcnj1a lonrf rbm FDR 0.1

10 Table S7. Validation of RNAseq vs. qpcr Gene logfc RNAseq logfc qpcr eph junba mknk odc plek sqstm junbb xpc cyp1a scd mmp13a apold junba elf klf4a cnot mc1r npas itpkb fosl egfr cngb tnfb nfkbiaa ftr egr cyp24a gadd45bb socs3b hmox1a hsp70l itgb vsig itga11a foxo1a il6st mmp tgfb1b g6pca g6pca

11 Table S8. Correlation of 41 overlapping genes (GSE46343 vs. RNA-seq) Genes GSE46343 (logfc) RNA-seq (logfc) ABCD ALDH3B ATF ATF6B ATG16L CAV CHD CPT1B CYP24A EDC EGFR ENC ERCC FASN FHOD FOSL FRRS GRHL HMOX HSPA1l IL6ST LIPG LSM MAFF MKNK MMP NANS NISCH NRF NUDT NUDT PIH1D PIR RALGPS SLC23A SORBS TSPO VSIG XPC ZNF ZNF note: bolded are correlated/congruent genes used for functional clustering analysis

12

Akt1 Akt kinase activity Creb signaling CCTTACAGCCCTCAAGTACTCATTC GGCGTACTCCATGACAAAGCA Arc Actin binding

Akt1 Akt kinase activity Creb signaling CCTTACAGCCCTCAAGTACTCATTC GGCGTACTCCATGACAAAGCA Arc Actin binding Additional File 1 (Table S1): Description and primer sequences of 80 candidate genes tested as potential synaptic plasticity formation genes in qrt-pcr array. Abbreviations: LTP: long-term potentiation,

Részletesebben

Glyma10g15850 aagggatccattctggaaccatatcttgctgtg ttgggtacccttggatgcaggatgacacg AtMKK6, AT5g56580

Glyma10g15850 aagggatccattctggaaccatatcttgctgtg ttgggtacccttggatgcaggatgacacg AtMKK6, AT5g56580 Supplemental table 1. Soybean MAPK, MAPKK, and MAPKKK genes and primers for VIGS cloning Gene_ID Forward Primer Reverse Primer Arabidopsis Ortholog Glyma04g03210 aagggatcctgcagcaagaaccagttcat ttgggtaccctaatggatgcgcattaggataaag

Részletesebben

Nan Wang, Qingming Dong, Jingjing Li, Rohit K. Jangra, Meiyun Fan, Allan R. Brasier, Stanley M. Lemon, Lawrence M. Pfeffer, Kui Li

Nan Wang, Qingming Dong, Jingjing Li, Rohit K. Jangra, Meiyun Fan, Allan R. Brasier, Stanley M. Lemon, Lawrence M. Pfeffer, Kui Li Supplemental Material IRF3-dependent and NF- B-independent viral induction of the zinc-finger antiviral protein Nan Wang, Qingming Dong, Jingjing Li, Rohit K. Jangra, Meiyun Fan, Allan R. Brasier, Stanley

Részletesebben

Supplementary Table 2. Gossypol-induced Decrease of Levels of Reduced Cysteine-containing Peptides

Supplementary Table 2. Gossypol-induced Decrease of Levels of Reduced Cysteine-containing Peptides Supplementary Table 2. Gossypol-induced Decrease of Levels of Reduced Cysteine-containing Peptides Accession Description Sequences of Cys-containing peptides IPI00021263 14-3-3 protein zeta/delta DICNDVLSLLEK

Részletesebben

T-helper Type 2 driven Inflammation Defines Major Subphenotypes of Asthma

T-helper Type 2 driven Inflammation Defines Major Subphenotypes of Asthma T-helper Type 2 driven Inflammation Defines Major Subphenotypes of Asthma Prescott G. Woodruff, M.D., M.P.H., Barmak Modrek, Ph.D., David F. Choy, B.S., Guiquan Jia, M.D., Alexander R. Abbas, Ph.D., Almut

Részletesebben

Architecture of the Trypanosome RNA Editing Accessory Complex, MRB1

Architecture of the Trypanosome RNA Editing Accessory Complex, MRB1 Architecture of the Trypanosome RNA Editing Accessory Complex, MRB1 Michelle L. Ammerman, Kurtis M. Downey, Hassan Hashimi, John C. Fisk, Danielle L. Tomasello, Drahomíra Faktorová, Lucie Hanzálková, Tony

Részletesebben

A sejtek szilárd környezete A sejtadhézió és sejt-vándorlás alapjelenségei

A sejtek szilárd környezete A sejtadhézió és sejt-vándorlás alapjelenségei A sejtek szilárd környezete A sejtadhézió és sejt-vándorlás alapjelenségei Szuszpenzióban a sejtek gömbszerő alakot vesznek fel; sejttípustól függetlenül 10 µm Szöveti sejtek 6-8 óránál hosszabb idıt letapadás

Részletesebben

kpis(ppk20) kpis(ppk46)

kpis(ppk20) kpis(ppk46) Table S1. C. elegans strains used in this study Strains carrying transgenes Strain Transgene Genotype Reference IT213 tcer-1 prom:tcer-1orf:gfp:tcer-1 3'utr unc-119(ed3) III; kpis(ppk6) This study IT283

Részletesebben

Supporting Information

Supporting Information Supporting Information Cell-free GFP simulations Cell-free simulations of degfp production were consistent with experimental measurements (Fig. S1). Dual emmission GFP was produced under a P70a promoter

Részletesebben

Expression analysis of PIN genes in root tips and nodules of Lotus japonicus

Expression analysis of PIN genes in root tips and nodules of Lotus japonicus Article Expression analysis of PIN genes in root tips and nodules of Lotus japonicus Izabela Sańko-Sawczenko 1, Dominika Dmitruk 1, Barbara Łotocka 1, Elżbieta Różańska 1 and Weronika Czarnocka 1, * 1

Részletesebben

Genetikai panel kialakítása a hazai tejhasznú szarvasmarha állományok hasznos élettartamának növelésére

Genetikai panel kialakítása a hazai tejhasznú szarvasmarha állományok hasznos élettartamának növelésére Genetikai panel kialakítása a hazai tejhasznú szarvasmarha állományok hasznos élettartamának növelésére Dr. Czeglédi Levente Dr. Béri Béla Kutatás-fejlesztés támogatása a megújuló energiaforrások és agrár

Részletesebben

Involvement of ER Stress in Dysmyelination of Pelizaeus-Merzbacher Disease with PLP1 Missense Mutations Shown by ipsc-derived Oligodendrocytes

Involvement of ER Stress in Dysmyelination of Pelizaeus-Merzbacher Disease with PLP1 Missense Mutations Shown by ipsc-derived Oligodendrocytes Stem Cell Reports, Volume 2 Supplemental Information Involvement of ER Stress in Dysmyelination of Pelizaeus-Merzbacher Disease with PLP1 Missense Mutations Shown by ipsc-derived Oligodendrocytes Yuko

Részletesebben

Supplementary materials to: Whole-mount single molecule FISH method for zebrafish embryo

Supplementary materials to: Whole-mount single molecule FISH method for zebrafish embryo Supplementary materials to: Whole-mount single molecule FISH method for zebrafish embryo Yuma Oka and Thomas N. Sato Supplementary Figure S1. Whole-mount smfish with and without the methanol pretreatment.

Részletesebben

A felszíni ektoderma differenciációja

A felszíni ektoderma differenciációja A felszíni ektoderma differenciációja - elkülönülése - kialakulása az egyedfejlődés során - szerkezete és a felnőttkori őssejtek -interfollikuláris epidermis -szőrtüsző -faggyúmirigy - a bőrpótlás (klinikai)

Részletesebben

Az Oxidatív stressz hatása a PIBF receptor alegységek összeszerelődésére.

Az Oxidatív stressz hatása a PIBF receptor alegységek összeszerelődésére. Újabban világossá vált, hogy a Progesterone-induced blocking factor (PIBF) amely a progesteron számos immunológiai hatását közvetíti, nem csupán a lymphocytákban és terhességgel asszociált szövetekben,

Részletesebben

Flowering time. Col C24 Cvi C24xCol C24xCvi ColxCvi

Flowering time. Col C24 Cvi C24xCol C24xCvi ColxCvi Flowering time Rosette leaf number 50 45 40 35 30 25 20 15 10 5 0 Col C24 Cvi C24xCol C24xCvi ColxCvi Figure S1. Flowering time in three F 1 hybrids and their parental lines as measured by leaf number

Részletesebben

(A F) H&E staining of the duodenum in the indicated genotypes at E16.5 (A, D), E18.5

(A F) H&E staining of the duodenum in the indicated genotypes at E16.5 (A, D), E18.5 Fig. S1. Brg1 ablation leads to abnormal villous structure in the duodenum in the perinatal period (A F) H&E staining of the duodenum in the indicated genotypes at E16.5 (A, D), E18.5 (B, E), and P0.5

Részletesebben

Pro- és antioxidáns hatások szerepe az endoplazmás retikulum eredetű stresszben és apoptózisban

Pro- és antioxidáns hatások szerepe az endoplazmás retikulum eredetű stresszben és apoptózisban Pro- és antioxidáns hatások szerepe az endoplazmás retikulum eredetű stresszben és apoptózisban Az endoplazmás retikulum (ER) számos környezeti és metabolikus hatás szenzora. Mindazon tényezők, melyek

Részletesebben

www.szentagothailab.sote.hu Glükokortikoid receptorok felépítése, műküdése Szignalizációs kapcsolatok szívizom, bél immunrendszer Idegrendszer (nem szinaptikus kapcsolatok) Korai embrionális fejlődés Szignalizációs

Részletesebben

Biodízel előállítás alapanyagainak és melléktermékeinek vizsgálata állatkísérletekben. DOKTORI (PhD) ÉRTEKEZÉS TÉZISEI. Dr.

Biodízel előállítás alapanyagainak és melléktermékeinek vizsgálata állatkísérletekben. DOKTORI (PhD) ÉRTEKEZÉS TÉZISEI. Dr. Biodízel előállítás alapanyagainak és melléktermékeinek vizsgálata állatkísérletekben DOKTORI (PhD) ÉRTEKEZÉS TÉZISEI Dr. Szele Eszter B-149 Daganatok molekuláris epidemiológiája Doktori Iskola vezetője:

Részletesebben

Új generációs sporttudományi képzés és tartalomfejlesztés, hazai és nemzetközi hálózatfejlesztés és társadalmasítás a Szegedi Tudományegyetemen

Új generációs sporttudományi képzés és tartalomfejlesztés, hazai és nemzetközi hálózatfejlesztés és társadalmasítás a Szegedi Tudományegyetemen Új generációs sporttudományi képzés és tartalomfejlesztés, hazai Pályázati azonosító: TÁMOP-4.1.2.E-15/1/Konv-2015-0002 3. alprojekt Sportélettani képzés és tartalomfejlesztés Pilot 1: Dinamikus változások

Részletesebben

Suppl. Materials. Polyhydroxyalkanoate (PHA) Granules Have no Phospholipids. Germany

Suppl. Materials. Polyhydroxyalkanoate (PHA) Granules Have no Phospholipids. Germany Suppl. Materials Polyhydroxyalkanoate (PHA) Granules Have no Phospholipids Stephanie Bresan 1, Anna Sznajder 1, Waldemar Hauf 2, Karl Forchhammer 2, Daniel Pfeiffer 3 and Dieter Jendrossek 1 1 Institute

Részletesebben

A C1 orf 124/Spartan szerepe a DNS-hiba tolerancia útvonalban

A C1 orf 124/Spartan szerepe a DNS-hiba tolerancia útvonalban Ph.D. tézisek A C1 orf 124/Spartan szerepe a DNS-hiba tolerancia útvonalban Írta: Juhász Szilvia Témavezető: Dr. Haracska Lajos Magyar Tudományos Akadémia Szegedi Biológiai Kutatóközpont Genetikai Intézet

Részletesebben

pjnc-pgluc Codon-optimized Gaussia luciferase (pgluc) Vector backbone: JM83 pjnc-pgluc is resistant to ampicillin and neomycin High or low copy:

pjnc-pgluc Codon-optimized Gaussia luciferase (pgluc) Vector backbone: JM83 pjnc-pgluc is resistant to ampicillin and neomycin High or low copy: pjnc-pgluc Gene/Insert name: Codon-optimized Gaussia luciferase (pgluc) Vector backbone: pcmv-jnc Vector type: Mammalian cells Backbone size w/o insert (bp): 5375 Bacterial resistance: Ampicillin and neomycin

Részletesebben

Receptor Tyrosine-Kinases

Receptor Tyrosine-Kinases Receptor Tyrosine-Kinases MAPkinase pathway PI3Kinase Protein Kinase B pathway PI3K/PK-B pathway Phosphatidyl-inositol-bisphosphate...(PI(4,5)P 2...) Phosphatidyl-inositol-3-kinase (PI3K) Protein kinase

Részletesebben

Mozgás - Gyógyszer TÁMOP-4.2.2/08/1-2008-0006

Mozgás - Gyógyszer TÁMOP-4.2.2/08/1-2008-0006 TÁMOP-4.2.2/08/1-2008-0006 Mozgás - Gyógyszer Varga Csaba, Puskás László G, Balogh László, Kovács Gyula, Kiss Gábor, Seres Erika, Pósa Anikó, Magyariné Berkó Anikó, Molnár Andor, Szablics Péter, Orbán

Részletesebben

Trinucleotide Repeat Diseases: CRISPR Cas9 PacBio no PCR Sequencing MFMER slide-1

Trinucleotide Repeat Diseases: CRISPR Cas9 PacBio no PCR Sequencing MFMER slide-1 Trinucleotide Repeat Diseases: CRISPR Cas9 PacBio no PCR Sequencing 2015 MFMER slide-1 Fuch s Eye Disease TCF 4 gene Fuchs occurs in about 4% of the US population. Leads to deteriorating vision without

Részletesebben

A cell-based screening system for RNA Polymerase I inhibitors

A cell-based screening system for RNA Polymerase I inhibitors Electronic Supplementary Material (ESI) for MedChemComm. This journal is The Royal Society of Chemistry 2019 Supporting Information A cell-based screening system for RNA Polymerase I inhibitors Xiao Tan,

Részletesebben

Supplementary Table 1. Cystometric parameters in sham-operated wild type and Trpv4 -/- rats during saline infusion and

Supplementary Table 1. Cystometric parameters in sham-operated wild type and Trpv4 -/- rats during saline infusion and WT sham Trpv4 -/- sham Saline 10µM GSK1016709A P value Saline 10µM GSK1016709A P value Number 10 10 8 8 Intercontractile interval (sec) 143 (102 155) 98.4 (71.4 148) 0.01 96 (92 121) 109 (95 123) 0.3 Voided

Részletesebben

Akce platí od do Do objednávky uveďte kód akce CLON16.

Akce platí od do Do objednávky uveďte kód akce CLON16. Média Lonza se slevou 25-30% Seznam produktů se slevou, konkrétní cenovou nabídku žádejte na eastport@eastport.cz nebo tel. 721 867 038. Akce platí od 1.10.2016 do 31.12. 2016. Do objednávky uveďte kód

Részletesebben

Horizontal gene transfer drives adaptive colonization of apple trees by the fungal pathogen Valsa mali. Zhiyuan Yin, Baitao Zhu, Hao Feng, Lili Huang*

Horizontal gene transfer drives adaptive colonization of apple trees by the fungal pathogen Valsa mali. Zhiyuan Yin, Baitao Zhu, Hao Feng, Lili Huang* Supplementary Information Horizontal gene transfer drives adaptive colonization of apple trees by the fungal pathogen Valsa mali Zhiyuan Yin, Baitao Zhu, Hao Feng, Lili Huang* State Key Laboratory of Crop

Részletesebben

Bevezetés Áttekintés

Bevezetés Áttekintés Bevezetés Áttekintés Fogalmak Egy lymphocita életének áttekintése Human Ig-izotípusok morfológiája Human Ig-izotípusok funkciói Miért? Válasz: más Ig effektor funkciók C fixáció FcR Polymerizáció Izotípusváltás

Részletesebben

Supporting Information

Supporting Information Supporting Information Paired design of dcas9 as a systematic platform for the detection of featured nucleic acid sequences in pathogenic strains Yihao Zhang 1,2,8, Long Qian 4,8, Weijia Wei 1,3,7,8, Yu

Részletesebben

Az izomváltozások szabályozása a smoothelin-like 1 fehérje által. Tudományos hétfő előadássorozat. Lontay Beáta Orvosi Vegytani Intézet

Az izomváltozások szabályozása a smoothelin-like 1 fehérje által. Tudományos hétfő előadássorozat. Lontay Beáta Orvosi Vegytani Intézet Az izomváltozások szabályozása a smoothelin-like 1 fehérje által Tudományos hétfő előadássorozat Lontay Beáta Orvosi Vegytani Intézet Kutatási témák: 1. A protein foszfatázok és kinázok szerepe a neurotranszmitter

Részletesebben

A sejtfelszíni FasL és szolubilis vezikulakötött FasL által indukált sejthalál gátlása és jellemzése

A sejtfelszíni FasL és szolubilis vezikulakötött FasL által indukált sejthalál gátlása és jellemzése A sejtfelszíni FasL és szolubilis vezikulakötött FasL által indukált sejthalál gátlása és jellemzése Doktori értekezés tézisei Hancz Anikó Témavezetők: Prof. Dr. Sármay Gabriella Dr. Koncz Gábor Biológia

Részletesebben

A posztszinapszis és a PSD (posztszinaptikus. szinaptikus plaszticitásban játszott szerepük

A posztszinapszis és a PSD (posztszinaptikus. szinaptikus plaszticitásban játszott szerepük A posztszinapszis és a PSD (posztszinaptikus denzitás), valamint a szinaptikus plaszticitásban játszott szerepük A posztszinapszis szimmetrikus (Gray II): variábilis, nagy vezikulák; ált. gátló aszimmetrikus

Részletesebben

Tóth István Balázs személyi adatai és szakmai önéletrajza

Tóth István Balázs személyi adatai és szakmai önéletrajza Személyi adatok Tóth István Balázs személyi adatai és szakmai önéletrajza Név: Tóth István Balázs Születési hely, idő: Debrecen, 1978. december 30. Családi állapot: nős, két gyermek édesapja Szakmai önéletrajz

Részletesebben

Supplemental Table S1. Overview of MYB transcription factor genes analyzed for expression in red and pink tomato fruit.

Supplemental Table S1. Overview of MYB transcription factor genes analyzed for expression in red and pink tomato fruit. Supplemental Table S1. Overview of MYB transcription factor genes analyzed for expression in red and pink tomato fruit. MYB Primer pairs TC AtMYB Forward Reverse TC199266 MYB12 AGGCTCTTGGAGGTCGTTACC CAACTCTTTCCGCATCTCAATAATC

Részletesebben

A hízósejtek szerepe az immunológiai folyamatokban

A hízósejtek szerepe az immunológiai folyamatokban A hízósejtek szerepe az immunológiai folyamatokban Berki Timea Boldizsár F, Bartis D, Talabér G, Szabó M, Németh P, University of Pécs, Department of Immunology & Biotechnology, Pécs, Hungary Additon of

Részletesebben

The beet R locus encodes a new cytochrome P450 required for red. betalain production.

The beet R locus encodes a new cytochrome P450 required for red. betalain production. The beet R locus encodes a new cytochrome P450 required for red betalain production. Gregory J. Hatlestad, Rasika M. Sunnadeniya, Neda A. Akhavan, Antonio Gonzalez, Irwin L. Goldman, J. Mitchell McGrath,

Részletesebben

dc_250_11 1. Bevezetés 3

dc_250_11 1. Bevezetés 3 MTA DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI TARTALOMJEGYZÉK NADPH-OXIDÁZ ÉS PEROXIDÁZ ENZIMEK VIZSGÁLATA EMLŐS SEJTEKBEN 1. Bevezetés 3 2. Tudományterületi háttér 3 2.1 Reaktív oxigén származékok (ROS) 3 2.2 A NADPH

Részletesebben

HELYSZÍNEK PROGRAM ÁPRILIS 20. csütörtök SZÁLLÁS

HELYSZÍNEK PROGRAM ÁPRILIS 20. csütörtök SZÁLLÁS HELYSZÍNEK PROGRAM SZÁLLÁS 1 (6721 Szeged, Maros u. 1.) 2 Matrix Hotel (6721 Szeged, Zárda u. 8.) 3 Partium Hotel (6722 Szeged, Honvéd tér 3.) 4 Tisza Hotel (6720 Szeged, Széchenyi tér 3.) 5 Oázis Apartmanház

Részletesebben

A doktori értekezés tézisei. A növényi NRP fehérjék lehetséges szerepe a hiszton defoszforiláció szabályozásában, és a hőstressz válaszban.

A doktori értekezés tézisei. A növényi NRP fehérjék lehetséges szerepe a hiszton defoszforiláció szabályozásában, és a hőstressz válaszban. A doktori értekezés tézisei A növényi NRP fehérjék lehetséges szerepe a hiszton defoszforiláció szabályozásában, és a hőstressz válaszban. Bíró Judit Témavezető: Dr. Fehér Attila Magyar Tudományos Akadémia

Részletesebben

MikroRNS-ek szerepe az autoimmun és reumatológiai kórképek kialakulásában

MikroRNS-ek szerepe az autoimmun és reumatológiai kórképek kialakulásában MikroRNS-ek szerepe az autoimmun és reumatológiai kórképek kialakulásában Butz Henriett SE Laboratóriumi Medicina Intézet MTA-SE Molekuláris Medicina Kutatócsoport 2017. április 20-21 Amiről szó lesz 1.

Részletesebben

Telomerek a lineáris kromoszómák végei

Telomerek a lineáris kromoszómák végei Telomer Telomeráz Telomerek a lineáris kromoszómák végei Repetitív DNS szekvencia, TTAGGG gerincesekben Speciális telomerkötő fehérjék Telomer méret Telomer-3D lineáris? A telomerek szerkezete: t &D hurok

Részletesebben

Tissue Extracellular Matrix (ECM)

Tissue Extracellular Matrix (ECM) Tissue Extracellular Matrix (ECM) ECM Key Facts Present in all tissues and functions as the biological scaffold for cells Contains structural, adhesion and signaling molecules Tissue function and healing

Részletesebben

A citokin egyensúly. Gyulladásgátló cytokinek. Gyulladáskeltő citokinek. Védelem és sejttúlélés. Gyulladás, sejtpusztulás NA DA.

A citokin egyensúly. Gyulladásgátló cytokinek. Gyulladáskeltő citokinek. Védelem és sejttúlélés. Gyulladás, sejtpusztulás NA DA. Apoptózis; Asztrocita: fagocitózis; PGD4; Növekedési faktorok: TGFβ1; neurosteroidok Gyulladásgátló cytokinek A citokin egyensúly NEUROTRANSZMITTEREK Reaktív asztroglia, aktivált mikroglia; Perifériás

Részletesebben

3. Főbb Jelutak. 1. G protein-kapcsolt receptor által közvetített jelutak 2. Enzim-kapcsolt receptorok által közvetített jelutak 3.

3. Főbb Jelutak. 1. G protein-kapcsolt receptor által közvetített jelutak 2. Enzim-kapcsolt receptorok által közvetített jelutak 3. Jelutak 3. Főbb Jelutak 1. G protein-kapcsolt receptor által közvetített jelutak 2. Enzim-kapcsolt receptorok által közvetített jelutak 3. Egyéb jelutak I. G-protein-kapcsolt receptorok 1. által közvetített

Részletesebben

Expressziós microarray. Dr. Győrffy Balázs

Expressziós microarray. Dr. Győrffy Balázs Expressziós microarray Dr. Győrffy Balázs Áttekintő 1. A technológia 2. Feldolgozás 2.1. Minőség-ellenőrzés 2.2. Jellemző kiválasztás 2.3. Vizualizálás 2.4. Kereszt-elemzés 2.5. Online diagnosztika 3.

Részletesebben

University of Bristol - Explore Bristol Research

University of Bristol - Explore Bristol Research Al-Salihi, S. A. A., Scott, T. A., Bailey, A. M., & Foster, G. D. (2017). Improved vectors for Agrobacterium mediated genetic manipulation of Hypholoma spp. and other homobasidiomycetes. Journal of Microbiological

Részletesebben

Új diagnosztikus és terápiás lehetőségek a glioblastoma multiforme kezelésében

Új diagnosztikus és terápiás lehetőségek a glioblastoma multiforme kezelésében New diagnostic and therapeutical possibilities in the treatment of glioblastoma multiforme Új diagnosztikus és terápiás lehetőségek a glioblastoma multiforme kezelésében Ph.D. Thesis Ph.D Tézisek Dr. Bellyeiné

Részletesebben

Fehérjeglikoziláció az endoplazmás retikulumban mint lehetséges daganatellenes támadáspont

Fehérjeglikoziláció az endoplazmás retikulumban mint lehetséges daganatellenes támadáspont Fehérjeglikoziláció az endoplazmás retikulumban mint lehetséges daganatellenes támadáspont Doktori tézisek Dr. Konta Laura Éva Semmelweis Egyetem Molekuláris Orvostudományok Tudományági Doktori Iskola

Részletesebben

Modular Optimization of Hemicellulose-utilizing Pathway in. Corynebacterium glutamicum for Consolidated Bioprocessing of

Modular Optimization of Hemicellulose-utilizing Pathway in. Corynebacterium glutamicum for Consolidated Bioprocessing of [Supplementary materials] Modular Optimization of Hemicellulose-utilizing Pathway in Corynebacterium glutamicum for Consolidated Bioprocessing of Hemicellulosic Biomass Sung Sun Yim 1, Jae Woong Choi 1,

Részletesebben

Apoptózis. 1. Bevezetés 2. Külső jelút 3. Belső jelút

Apoptózis. 1. Bevezetés 2. Külső jelút 3. Belső jelút Jelutak Apoptózis 1. Bevezetés 2. Külső jelút 3. Belső jelút Apoptózis Sejtmag 1. Kondenzálódó sejtmag apoptózis autofágia nekrózis Lefűződések Összezsugorodás Fragmentálódó sejtmag Apoptotikus test Fagocita

Részletesebben

Nevezze meg a jelölt csontot latinul! Name the bone marked! Nevezze meg a jelölt csont típusát! What is the type of the bone marked?

Nevezze meg a jelölt csontot latinul! Name the bone marked! Nevezze meg a jelölt csont típusát! What is the type of the bone marked? 1 Nevezze meg a jelölt csontot latinul! Name the bone marked! 2 Nevezze meg a jelölt csont típusát! What is the type of the bone marked? 3 Milyen csontállomány található a jelölt csont belsejében? What

Részletesebben

- Supplementary Data

- Supplementary Data 1 Open Access Asian Australas. J. Anim. Sci. Vol. 29, No. 3 : 321-326 March 2016 http://dx.doi.org/10.5713/ajas.15.0331 www.ajas.info pissn 1011-2367 eissn 1976-5517 Analysis of Swine Leukocyte Antigen

Részletesebben

Barangolások a peptidek és fehérjék világában

Barangolások a peptidek és fehérjék világában Barangolások a peptidek és fehérjék világában Orbán Erika Kutató-fejlesztő, Biotechnológiai analitikai osztály, Richter Gedeon Vegyészeti Gyár Nyrt. Magyar Tudomány Ünnepe, Kémiai Tudományok Osztálya és

Részletesebben

Mapping Sequencing Reads to a Reference Genome

Mapping Sequencing Reads to a Reference Genome Mapping Sequencing Reads to a Reference Genome High Throughput Sequencing RN Example applications: Sequencing a genome (DN) Sequencing a transcriptome and gene expression studies (RN) ChIP (chromatin immunoprecipitation)

Részletesebben

Forensic SNP Genotyping using Nanopore MinION Sequencing

Forensic SNP Genotyping using Nanopore MinION Sequencing Forensic SNP Genotyping using Nanopore MinION Sequencing AUTHORS Senne Cornelis 1, Yannick Gansemans 1, Lieselot Deleye 1, Dieter Deforce 1,#,Filip Van Nieuwerburgh 1,#,* 1 Laboratory of Pharmaceutical

Részletesebben

Paralóg jelátviteli útvonalak finom szabályozásának szerkezeti alapú vizsgálata

Paralóg jelátviteli útvonalak finom szabályozásának szerkezeti alapú vizsgálata Paralóg jelátviteli útvonalak finom szabályozásának szerkezeti alapú vizsgálata Tézisfüzet Glatz Gábor okleveles biológus ELTE Biológia Doktori Iskola, Szerkezeti Biokémia Program Iskolavezető: Dr. Erdei

Részletesebben

TRANSZPORTEREK Szakács Gergely

TRANSZPORTEREK Szakács Gergely TRANSZPORTEREK Szakács Gergely Összefoglalás A biológiai membránokon keresztüli anyagáramlást számos membránfehérje szabályozza. E fehérjék változatos funkciója és megjelenésük mintázata biztosítja a sejtek

Részletesebben

Immunológia alapjai előadás MHC. szerkezete és genetikája, és az immunológiai felismerésben játszott szerepe. Antigén bemutatás.

Immunológia alapjai előadás MHC. szerkezete és genetikája, és az immunológiai felismerésben játszott szerepe. Antigén bemutatás. Immunológia alapjai 5-6. előadás MHC szerkezete és genetikája, és az immunológiai felismerésben játszott szerepe. Antigén bemutatás. Antigén felismerés Az ellenanyagok és a B sejt receptorok natív formában

Részletesebben

AZ ANYA-MAGZATI FELSZÍN IMMUNOLÓGIÁJA ÉS AZ ANYAI IMMUNRENDSZER SZISZTÉMÁS VÁLTOZÁSAI TERHESSÉG SORÁN

AZ ANYA-MAGZATI FELSZÍN IMMUNOLÓGIÁJA ÉS AZ ANYAI IMMUNRENDSZER SZISZTÉMÁS VÁLTOZÁSAI TERHESSÉG SORÁN AZ ANYA-MAGZATI FELSZÍN IMMUNOLÓGIÁJA ÉS AZ ANYAI IMMUNRENDSZER SZISZTÉMÁS VÁLTOZÁSAI TERHESSÉG SORÁN AZ ANYAI IMMNVÁLASZT BEFOLYÁSOLÓ TÉNYEZŐK MAGZATI ANTIGEN BEMUTATÁS (TROPHOBLAST) B TH1/TH2 BALANCE

Részletesebben

Supplemental Information. Investigation of Penicillin Binding Protein. (PBP)-like Peptide Cyclase and Hydrolase

Supplemental Information. Investigation of Penicillin Binding Protein. (PBP)-like Peptide Cyclase and Hydrolase Cell Chemical Biology, Volume upplemental Information Investigation of Penicillin Binding Protein (PBP)-like Peptide Cyclase and ydrolase in urugamide on-ribosomal Peptide Biosynthesis Yongjun Zhou, Xiao

Részletesebben

Pályázatok/Grants 2012-

Pályázatok/Grants 2012- 2012-2015 OTKA Pál Gábor/ Pályázatok/Grants 2012-49 984 NK 100769 A komplementrendszer aktiválódási mechanizmusa és élettani szerepe: átfogó vizsgálat irányított evolúcióval kifejlesztett, útvonal-szelektív

Részletesebben

KUTATÁSI TÉMAJAVASLAT ITC hallgatónak jelentkezők számára ROP GTPÁZOK ÁLTAL KÖZVETÍTETT JELÁTVITEL NÖVÉNYEKBEN

KUTATÁSI TÉMAJAVASLAT ITC hallgatónak jelentkezők számára ROP GTPÁZOK ÁLTAL KÖZVETÍTETT JELÁTVITEL NÖVÉNYEKBEN KUTATÁSI TÉMAJAVASLAT ITC hallgatónak jelentkezők számára témavezető: MÉNESI Dalma, M.Sc. intézet: Növénybiológiai Intézet e-mail cím: menesi.dalma@brc.mta.hu CV: http://www.szbk.hu/file/cv/plant_menesi_dalma_hu.pdf

Részletesebben

Kotlan Beatrix. A rosszból is a jót kihozni! A tumorban rejlő immunsejtek hordozta genetikai információ a rákterápiában hasznosítható.

Kotlan Beatrix. A rosszból is a jót kihozni! A tumorban rejlő immunsejtek hordozta genetikai információ a rákterápiában hasznosítható. Kotlan Beatrix A rosszból is a jót kihozni! A tumorban rejlő immunsejtek hordozta genetikai információ a rákterápiában hasznosítható. Budapest, 2011. Május 10. www.meetthescientist.hu 1 26 A rosszból is

Részletesebben

Supporting Information

Supporting Information Supporting Information Plasmid Construction DNA cloning was carried out according to standard protocols. The sequence of all plasmids was confirmed by DNA sequencing and amplified using the E. coli strain

Részletesebben

Phenotype. Genotype. It is like any other experiment! What is a bioinformatics experiment? Remember the Goal. Infectious Disease Paradigm

Phenotype. Genotype. It is like any other experiment! What is a bioinformatics experiment? Remember the Goal. Infectious Disease Paradigm It is like any other experiment! What is a bioinformatics experiment? You need to know your data/input sources You need to understand your methods and their assumptions You need a plan to get from point

Részletesebben

A fiziológiás terhesség hátterében álló immunológiai történések

A fiziológiás terhesség hátterében álló immunológiai történések A fiziológiás terhesség hátterében álló immunológiai történések APAI Ag ANYAI Ag FERTŐZÉS AUTOIMMUNITÁS MAGZATI ANTIGEN ALACSONY P SZINT INFERTILITAS BEÁGYAZÓDÁS ANYAI IMMUNREGULÁCIÓ TROPHOBLAST INVÁZIÓ

Részletesebben

A CSONTPÓTLÓ MŰTÉTEK BIOLÓGIAI ALAPJAI, A JÖVŐ LEHETŐSÉGEI

A CSONTPÓTLÓ MŰTÉTEK BIOLÓGIAI ALAPJAI, A JÖVŐ LEHETŐSÉGEI Semmelweis Egyetem Arc- Állcsont- Szájsebészeti- és Fogászati Klinika Igazgató: Prof. Németh Zsolt A CSONTPÓTLÓ MŰTÉTEK BIOLÓGIAI ALAPJAI, A JÖVŐ LEHETŐSÉGEI Dr. Barabás Péter, Dr. Huszár Tamás SE Szak-

Részletesebben

Computational Neuroscience

Computational Neuroscience Computational Neuroscience Zoltán Somogyvári senior research fellow KFKI Research Institute for Particle and Nuclear Physics Supporting materials: http://www.kfki.hu/~soma/bscs/ BSCS 2010 Lengyel Máté:

Részletesebben

Jelutak. Apoptózis. Apoptózis Bevezetés 2. Külső jelút 3. Belső jelút. apoptózis autofágia nekrózis. Sejtmag. Kondenzálódó sejtmag

Jelutak. Apoptózis. Apoptózis Bevezetés 2. Külső jelút 3. Belső jelút. apoptózis autofágia nekrózis. Sejtmag. Kondenzálódó sejtmag Jelutak Apoptózis 1. Bevezetés 2. Külső jelút 3. Belső jelút Apoptózis Sejtmag Kondenzálódó sejtmag 1. autofágia nekrózis Lefűződések Összezsugorodás Fragmentálódó sejtmag Apoptotikus test Fagocita bekebelezi

Részletesebben

Stresszfehérjék (hősokk fehérjék)

Stresszfehérjék (hősokk fehérjék) Stresszfehérjék (hősokk fehérjék) Ama különféle fehérjék összefoglaló elnevezése, amelyeket az élő sejtek a megemelkedett hőmérsékletre (a hősokkra) válaszul fokozott mértékben termelnek. A hősokk-fehérjék

Részletesebben

RAYMOND RIFE gyógyító frekvenciái

RAYMOND RIFE gyógyító frekvenciái RAYMOND RIFE gyógyító frekvenciái Sárgabarackmag és a B17 vitamin Szerencsére egyre többen hallottak már a regeneráló, gyógyulást segítõ frekvenciákról. Ezeket a készülékeket R. Raymond Rife munkáinak

Részletesebben

Epithelialis-mesenchymalis átmenet vastagbél daganatokban

Epithelialis-mesenchymalis átmenet vastagbél daganatokban Epithelialis-mesenchymalis átmenet vastagbél daganatokban Éles Klára Országos Onkológiai Intézet Sebészi és Molekuláris Daganatpatológiai Centrum Budapest, 2010. 12. 03. Epithelialis-mesenchymalis átmenet

Részletesebben

Markerless Escherichia coli rrn Deletion Strains for Genetic Determination of Ribosomal Binding Sites

Markerless Escherichia coli rrn Deletion Strains for Genetic Determination of Ribosomal Binding Sites Markerless Escherichia coli rrn Deletion Strains for Genetic Determination of Ribosomal Binding Sites Selwyn Quan *, Ole Skovgaard, Robert E. McLaughlin, Ed T. Buurman,1, and Catherine L. Squires * Department

Részletesebben

GERONTOLÓGIA. 6. Biogerontológia: öregedési elméletek SEMSEI IMRE. Debreceni Egyetem Orvos- és Egészségtudományi Centrum Egészségügyi Kar

GERONTOLÓGIA. 6. Biogerontológia: öregedési elméletek SEMSEI IMRE. Debreceni Egyetem Orvos- és Egészségtudományi Centrum Egészségügyi Kar GERONTOLÓGIA 6. Biogerontológia: öregedési elméletek SEMSEI IMRE Debreceni Egyetem Orvos- és Egészségtudományi Centrum Egészségügyi Kar KEZDETI PRÓBÁLKOZÁSOK A fiatalság kútja Giacomo Jaquerio (Italy)

Részletesebben

Bird species status and trends reporting format for the period (Annex 2)

Bird species status and trends reporting format for the period (Annex 2) 1. Species Information 1.1 Member State Hungary 1.2.2 Natura 2000 code A634-B 1.3 Species name Ardea purpurea purpurea 1.3.1 Sub-specific population East Europe, Black Sea & Mediterranean/Sub-Saharan Africa

Részletesebben

KIS GTP-KÖTŐ FEHÉRJE SZEREPE A NÖVÉNYI CIRKADIÁN ÓRA, STRESSZ-VÁLASZOK ÉS A FÉNYFÜGGŐ ENDOREDUPLIKÁCIÓ SZABÁLYOZÁSÁBAN

KIS GTP-KÖTŐ FEHÉRJE SZEREPE A NÖVÉNYI CIRKADIÁN ÓRA, STRESSZ-VÁLASZOK ÉS A FÉNYFÜGGŐ ENDOREDUPLIKÁCIÓ SZABÁLYOZÁSÁBAN KIS GTP-KÖTŐ FEHÉRJE SZEREPE A NÖVÉNYI CIRKADIÁN ÓRA, STRESSZ-VÁLASZOK ÉS A FÉNYFÜGGŐ ENDOREDUPLIKÁCIÓ SZABÁLYOZÁSÁBAN Doktori (Ph.D.) értekezés tézisei Terecskei Kata Témavezető: Dr. Kozma-Bognár László

Részletesebben

Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálata

Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálata Az idiopathiás scoliosis molekuláris biológiai vizsgálata Czibula Ágnes Ph.D. értekezés tézisei Témavezetı: Dr. Raskó István MTA Szegedi Biológiai Központ Genetikai Intézet Biológiai Ph.D. Iskola, SZTE

Részletesebben

DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI AZ OPPORTUNISTA HUMÁNPATOGÉN CANDIDA PARAPSILOSIS ÉLESZTŐGOMBA ELLENI TERMÉSZETES ÉS ADAPTÍV IMMUNVÁLASZ VIZSGÁLATA

DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI AZ OPPORTUNISTA HUMÁNPATOGÉN CANDIDA PARAPSILOSIS ÉLESZTŐGOMBA ELLENI TERMÉSZETES ÉS ADAPTÍV IMMUNVÁLASZ VIZSGÁLATA DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI AZ OPPORTUNISTA HUMÁNPATOGÉN CANDIDA PARAPSILOSIS ÉLESZTŐGOMBA ELLENI TERMÉSZETES ÉS ADAPTÍV IMMUNVÁLASZ VIZSGÁLATA TÓTH ADÉL TÉMAVEZETŐ: DR. GÁCSER ATTILA TUDOMÁNYOS FŐMUNKATÁRS

Részletesebben

A circadian melatonin (MT) szekréció kialakulásának vizsgálata

A circadian melatonin (MT) szekréció kialakulásának vizsgálata 2004 és 2007 közötti eredményeink összefoglalása: Az óragének vizsgálata A madarak tobozmirigyének circadian ritmusos működésében is feltehetőleg kulcsszerepet játszó óragének azonosítása céljából más,

Részletesebben

Tumor immunológia. Dr. Nagy György

Tumor immunológia. Dr. Nagy György Tumor immunológia Dr. Nagy György Semmelweis Egyetem, Genetikai Sejt és Immunbiológiai Intézet & III. Sz. Belgyógyászati Klinika, Reumatológiai és Fizioterápiás Tanszéki Csoport Kötelező szintentartó tanfolyam

Részletesebben

KÖZLEMÉNYEK: A vér-agy gát zárt koponyasérülést követ acut változásának nyomonkövetése MRvizsgálattal

KÖZLEMÉNYEK: A vér-agy gát zárt koponyasérülést követ acut változásának nyomonkövetése MRvizsgálattal KÖZLEMÉNYEK: Function-dependent expressions of CGRP in neuromuscular junctions of facial muscles B. Csillik, E. Knyihár-Csillik, E. Kukla, J. Tajti, A. Czigner, G.W.Kreutzberg Eur. Arch. Otorhinolaryngol.,

Részletesebben

CzB 2010. Élettan: a sejt

CzB 2010. Élettan: a sejt CzB 2010. Élettan: a sejt Sejt - az élet alapvető egysége Prokaryota -egysejtű -nincs sejtmag -nincsenek sejtszervecskék -DNS = egy gyűrű - pl., bactériumok Eukaryota -egy-/többsejtű -sejmag membránnal

Részletesebben

(AD) β (A ) (2) ACDP ACDP ACDP APP. APP-C99 γ (3) A 40 A 42 A A A A 42/A 40. in vivo A A A A

(AD) β (A ) (2) ACDP ACDP ACDP APP. APP-C99 γ (3) A 40 A 42 A A A A 42/A 40. in vivo A A A A (AD) β (A) A AAPP APP-C99 γ A A40 A42 A AA42/A40 γ A A γ AD A A A A APP APP APP A A A A A A (1)AD A42 A AD AD (2) ACDP AACDP ACDP A A ACDP (3) (1)A in vivo A APP Gray and Whittaker 1962; Perez-Otano et

Részletesebben

Számla Hiteles másolat 2/2.példány 1.lap

Számla Hiteles másolat 2/2.példány 1.lap Számla Hiteles másolat 2/2.példány 1.lap 1111 Fizetési mód/payment method Atutalás Teljesítés kelt/fulfillment date 2000-07-28 Számla kelt/invoice date 2000-07-28 Fizetési határidõ/payment due 2000-07-28

Részletesebben

VÁLASZ OPPONENSI VÉLEMÉNYRE

VÁLASZ OPPONENSI VÉLEMÉNYRE VÁLASZ OPPONENSI VÉLEMÉNYRE Dr. Taller János Tudományos főmunkatárs Pannon Egyetem, Georgikon Kar, Növénytudományi és Biotechnológiai Tanszék Biotechnológiai Kutatócsoport Farkas Valéria Tejtermelést és

Részletesebben

HTS (High Throughput Screening) Lehetőségek a Debreceni Egyetemen. DE OEC Orvosi Vegytani Intézet

HTS (High Throughput Screening) Lehetőségek a Debreceni Egyetemen. DE OEC Orvosi Vegytani Intézet HTS in HTS (High Throughput Screening) Lehetőségek a Debreceni Egyetemen Virág László DE OEC Orvosi Vegytani Intézet ET III. emelet BIO MMKK DE-BIK Mi a HTS? Robotizált mintamozgatási, műszeres mérési

Részletesebben

HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS (HIV) ÉS AIDS

HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS (HIV) ÉS AIDS HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS (HIV) ÉS AIDS Dr. Mohamed Mahdi MD. MPH. Department of Infectology and Pediatric Immunology University of Debrecen 2010 Történelmi tények a HIV-ről 1981: Első megjelenés San

Részletesebben

A minimális sejt. Avagy hogyan alkalmazzuk a biológia több területét egy kérdés megválaszolására

A minimális sejt. Avagy hogyan alkalmazzuk a biológia több területét egy kérdés megválaszolására A minimális sejt Avagy hogyan alkalmazzuk a biológia több területét egy kérdés megválaszolására Anyagcsere Gánti kemoton elmélete Minimum sejt Top down: Meglevő szervezetek genomjából indulunk ki Bottom

Részletesebben

Mutagenezis és s Karcinogenezis kutatócsoport. Haracska Lajos.

Mutagenezis és s Karcinogenezis kutatócsoport. Haracska Lajos. Mutagenezis és s Karcinogenezis kutatócsoport SZBK Genetikai Intézete (429 dolgozó,, Tel: 62-599666) haracska@brc.hu Haracska Lajos www.brc.hu/lajoslab Evolúci ció és s karcinogenezis: közös k s gyökerek

Részletesebben

Immunológia alapjai T sejt fejlődés a tímuszban Differenciálódási stádiumok, környezeti faktorok szerepe

Immunológia alapjai T sejt fejlődés a tímuszban Differenciálódási stádiumok, környezeti faktorok szerepe Immunológia alapjai T sejt fejlődés a tímuszban Differenciálódási stádiumok, környezeti faktorok szerepe Berki Timea A tímusz szerkezet A tímusz lebenyke szerkezet The thymic stoma creates the microenvironment

Részletesebben

Tempfli Károly 1 Kovács Bálint 2 Simon Zoltán 3 Bali Papp Ágnes 4. tempflik@gmail.com

Tempfli Károly 1 Kovács Bálint 2 Simon Zoltán 3 Bali Papp Ágnes 4. tempflik@gmail.com Tempfli Károly 1 Kovács Bálint 2 Simon Zoltán 3 Bali Papp Ágnes 4 Az adiponectin, a zsírsavkötő fehérje és a leptin gének expressziója sertés izom- és zsírszövetben Expression of adiponectin, adipocyte

Részletesebben

DEBRECENI EGYETEM. Folyóiratcikkek

DEBRECENI EGYETEM. Folyóiratcikkek Folyóiratcikkek Idegen nyelvű közlemények tudományos folyóiratban (34) Első szerzős közlemények (5) 1. Czifra, G., Szöllősi, A., Nagy, Z., Boros, M., Juhász, I., Kiss, A., Erdődi, F., Szabó, T., Kovács,

Részletesebben

13. RNS szintézis és splicing

13. RNS szintézis és splicing 13. RNS szintézis és splicing 1 Visszatekintés: Az RNS típusai és szerkezete Hírvivő RNS = mrns (messenger RNA = mrna) : fehérjeszintézis pre-mrns érett mrns (intronok kivágódnak = splicing) Transzfer

Részletesebben

2. A jelutak komponensei. 1. Egy tipikus jelösvény sémája 2. Ligandok 3. Receptorok 4. Intracelluláris jelfehérjék

2. A jelutak komponensei. 1. Egy tipikus jelösvény sémája 2. Ligandok 3. Receptorok 4. Intracelluláris jelfehérjék Jelutak 2. A jelutak komponensei 1. Egy tipikus jelösvény sémája 2. Ligandok 3. Receptorok 4. Intracelluláris jelfehérjék Egy tipikus jelösvény sémája 1. Receptor fehérje Jel molekula (ligand; elsődleges

Részletesebben

Azobezitás és a sejtek metabolizmusának összefüggései, a diabetes és táplálkozás viszonya

Azobezitás és a sejtek metabolizmusának összefüggései, a diabetes és táplálkozás viszonya Azobezitás és a sejtek metabolizmusának összefüggései, a diabetes és táplálkozás viszonya Máthé Endre, Sipos Péter, Remenyik Judit, Vígh Szabolcs, Horváth Brigitta Debreceni Egyetem, Mezőgazdaság, Élelmiszertudományi

Részletesebben

Diabéteszes redox változások hatása a stresszfehérjékre

Diabéteszes redox változások hatása a stresszfehérjékre Semmelweis Egyetem Molekuláris Orvostudományok Tudományági Doktori Iskola Pathobiokémia Program Doktori (Ph.D.) értekezés Diabéteszes redox változások hatása a stresszfehérjékre dr. Nardai Gábor Témavezeto:

Részletesebben