Trinucleotide Repeat Diseases: CRISPR Cas9 PacBio no PCR Sequencing MFMER slide-1
|
|
- Gyöngyi Szőke
- 5 évvel ezelőtt
- Látták:
Átírás
1 Trinucleotide Repeat Diseases: CRISPR Cas9 PacBio no PCR Sequencing 2015 MFMER slide-1
2 Fuch s Eye Disease TCF 4 gene Fuchs occurs in about 4% of the US population. Leads to deteriorating vision without corneal replacement surgery. Roughly 80% of Fuch s cases appear to be caused by expansion of a CAG repeat in a TCF-4 intron Transcription factor 4 (TCF-4) also known as immunoglobulin transcription factor 2 (ITF-2) is a protein that in humans is encoded by the TCF4 gene located on chromosome 18q21.2
3 TCF 4 sgrna design (BROAD) CGGAGCCCCCCCACCCATTTCTTTGCTGAACTTGCAATTCCGTGCGCCTCGGCGTGTTTCCCCCTCCCCCCTTCCCTCCGTCCCCT CCCCTCCCCGGAGAAGAGAGTTGGTGTTAAGAGTCAGGGATCTTGGCTGTGTGTCTGCGGATCTGTAGTGGCGGCGGCGGCGGCG GCGGCGGGGAGGCAGCAGGCGCGGGAGCGGGCGCAGGAGCAGGCGGCGGCGGTGGCGGCGGCGGTTAGACATGAACGCCGC CTCGGCGCCGGCGGTGCACGGAGAGCCCCTTCTCGCGCGCGGGCGGTAGGTACCGGCGCCTGCGGGGCTCGGCGGGGCGGAG GCGCCCGGCGGCGCGGGGTTCGGGCTCGGCGGCCCCGCACGCGGCTCCGCGCCTCCCGCGCCGCGGGCTCCCGGCGCCCGG CGCTCCCAGAAGAGACACCCCTTCCCCTCCCGCCGCTTCCCTCCCCCTCGCCGCCAGCCCCCCCGCCCCTCCCCTTGATGCCCCC TCGGAGGGACCGAGGACTTTGCCAGGGGCCTGACTTTAATTTTTATAACCCCTTTCTTTCACAAATTAGGGTGCTGGACAATTAGAGG ACCCGACCCTCCACTCCGCTCCCCCCAACCCTGTCACCCCACCCCTCCCCCTTTGGACGTGTTTTCACTCCAGAGACGCTCATCTT TAATTTCTTGATAGCTACTTTGAAAAGCGGAGGGGAGTGGTGTGTGCGAGTGTGTGTGCGTGTGCGAGTGTGAGTGTGCGAGGGGG GTGGGGTGCAGGGTGGGGGGAAAGTTGAGATCGGATCGTTCTCAGTAGTTTCTCTTTTCTCTGTGATCCATTCATTTCTCGCTCTACC TCCTGTTGCATAAAATGATGCGCTGAAGAGCGGCTTTTTTTTTTTCTTTCCCTGATTTGGTTTTATAGTGGATGTTACCAGTTTGATCGT CTCTTTGGAAATACAATATCGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTATTGCTGCCTATTCCATCTTAAAAAAACAAAA CCAAACCCAACCCAACAACAAGTCTCCCATCCCTTCCTCCTTTCCACCTTAATCCCACCCGCCCCCACGTCCCCACCCCCAACCCC CCAGTCTCCAAAAATCCGATTGTGTTTTCTCCAAGGATTGGGACTGGATTTTCTGATTGCGGTTATTTCCATGTTTCTAGGTTTGTGTG ATTTTGCTAAAATGCATCACCAACAGCGAATGGCTGCCTTAGGGACGGACAAAGAGCTGAGTGATTTACTGGATTTCAGTGCGGTAA GAAAGAACGGTGGAAACTAACAACAGCTGTGAAAAAAACAAAACAAAAACCCAAACACTTCAGCTAGAAACCAGTAGGAATCTAAAG GACAGTAATAATTTTTAATTGGCTGAATCCTTGGTAAATATGAAGGTCTTTTTGACAAGTTTTTAACTATAATTTTGTGGTGTGATGGAAG ATTCAGGCTTTTTTTTTTTTTTGAGTTTTATTACTGGCCTTCAATTCCCTACCCACTGATTACCCCAAATAATGGAATCTCACCCCAGTG GAAAGCAAAAATAGACACCCCTAAAACTAAACCACCCCTAAAACTTGGCCATGTCTGAACACTGAGACTACTAATACTTTGCACACTA CTCTTCGTTTTATTTATTGTTTTTGGAAATGGAAAATAGAAAATAGGAGACCCAGTTGTCTCTTTAAAGTTTTAAGCTAATGATGCTTTGG ATTGGTAGGACCTGTTCCTTACATCTTACCTCCTAGTTACATCTTTTCCTAGGATTCTTAAAACTAGTATGGATATGCTGAGCATACATTC TTTAGAACCTTTTGGACTGTTTTGGTAAATTTCGTAGTCGTAGGATCAGCACAAAGCGGAACTTGACACACTTGTGGAGTTTTACGGC TGTACTTGGTCCTTCTCCATCCCTTTGCTTCCTTTTCCTAAACCAAGTCCCAGACATGTCAGGAGAATGAATTCATTTTTAATGCCAGA TGAGTTTGGTGTAAGATGCATTTGTAAAGCAAAATAAAAAGAATCCACAAAACACACAAATAAAATCCAAACCGCCTTCCAAGTGGGG CTCTTTCATGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTCC TCCTCCTCCTCCTCCTTCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCTAGACCTTCTTTTGGAGAAATGGCTTTCGGAAGTTTTGCCAGGAAACGTA GCCCTAGGCAGGCAGCTTTGCAGCCCCCTTTCTGCTTGTTGCACTTTCTCCATTCGTTCCTTTGCTTTTTGCAGGCTCTGACTCAGG GAAGGTGTGCATTATCCACTAGATACGTCGAAGAAGAGGGAAACCAATTAGGGTCGAAATAAATGCTGGAGAGAGAGGGAGTGAAAG
4 BROAD Institute TCF 4 cr/sgrna design CRISPR Enzyme - S. pyogenes Target Human Paste in 1500 bases from 5 end (repeat for 3 end) Quota 200 Submit Save (sgrna Picking results) excel
5 crrna or crrna-xt IDT Guide RNAs (grnas) contain the target-specific sequence for guiding Cas9 protein to a genomic location. Choose from crrnas or crrna XT, which form a grna duplex with tracrrna. Under challenging experimental conditions (e.g., high nuclease environments or with Cas9 mrna), use crrna XT or sgrna, which have additional chemical modifications for the highest level of stability and performance MFMER slide-5
6 Topo Cloning:TCF4 Gene Unique cutting site? NotI CGGAGCCCCCCCACCCATTTCTTTGCTGAACTTGCAATTCCGTGCGCCTCGGCGTGTTTCCCCCTCCCCCCTTC CCTCCGTCCCCTCCCCTCCCCGGAGAAGAGAGTTGGTGTTAAGAGTCAGGGATCTTGGCTGTGTGTCTGCGGAT CTGTAGTGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGGGAGGCAGCAGGCGCGGGAGCGGGCGCAGGAGCAGGCGGC GGCGGTGGCGGCGGCGGTTAGACATGAACGCCGCCTCGGCGCCGGCGGTGCACGGAGAGCCCCTTCTCGCG CGCGGGCGGTAGGTACCGGCGCCTGCGGGGCTCGGCGGGGCGGAGGCGCCCGGCGGCGCGGGGTTCGGGC TCGGCGGCCCCGCACGCGGCTCCGCGCCTCCCGCGCCGCGGGCTCCCGGCGCCCGGCGCTCCCAGAAGAGA CACCCCTTCCCCTCCCGCCGCTTCCCTCCCCCTCGCCGCCAGCCCCCCCGCCCCTCCCCTTGATGCCCCCTCG GAGGGACCGAGGACTTTGCCAGGGGCCTGACTTTAATTTTTATAACCCCTTTCTTTCACAAATTAGGGTGCTGGA CAATTAGAGGACCCGACCCTCCACTCCGCTCCCCCCAACCCTGTCACCCCACCCCTCCCCCTTTGGACGTGTTT TCACTCCAGAGACGCTCATCTTTAATTTCTTGATAGCTACTTTGAAAAGCGGAGGGGAGTGGTGTGTGCGAGTGT GTGTGCGTGTGCGAGTGTGAGTGTGCGAGGGGGGTGGGGTGCAGGGTGGGGGGAAAGTTGAGATCGGATCGT TCTCAGTAGTTTCTCTTTTCTCTGTGATCCATTCATTTCTCGCTCTACCTCCTGTTGCATAAAATGATGCGCTGAAG AGCGGCTTTTTTTTTTTCTTTCCCTGATTTGGTTTTATAGTGGATGTTACCAGTTTGATCGTCTCTTTGGAAATACAA TATCGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTATTGCTGCCTATTCCATCTTAAAAAAACAAAACC AAACCCAACCCAACAACAAGTCTCCCATCCCTTCCTCCTTTCCACCTTAATCCCACCCGCCCCCACGTCCCCACC CCCAACCCCCCAGTCTCCAAAAATCCGATTGTGTTTTCTCCAAGGATTGGGACTGGATTTTCTGATTGCGGTTATT TCCATGTTTCTAGGTTTGTGTGATTTTGCTAAAATGCATCACCAACAGCGAATGGCTGCCTTAGGGACGGACAAA GAGCTGAGTGATTTACTGGATTTCAGTGCGGTAAGAAAGAACGGTGGAAACTAACAACAGCTGTGAAAAAAACAA AACAAAAACCCAAACACTTCAGCTAGAAACCAGTAGGAATCTAAAGGACAGTAATAATTTTTAATTGGCTGAATCC TTGGTAAATATGAAGGTCTTTTTGACAAGTTTTTAACTATAATTTTGTGGTGTGATGGAAGATTCAGGCTTTTTTTTT TTTTTGAGTTTTATTACTGGCCTTCAATTCCCTACCCACTGATTACCCCAAATAATGGAATCTCACCCCAGTGGAAA GCAAAAATAGACACCCCTAAAACTAAACCACCCCTAAAACTTGGCCATGTCTGAACACTGAGACTACTAATACTTT GCACACTACTCTTCGTTTTATTTATTGTTTTTGGAAATGGAAAATAGAAAATAGGAGACCCAGTTGTCTCTTTAAAG TTTTAAGCTAATGATGCTTTGGATTGGTAGGACCTGTTCCTTACATCTTACCTCCTAGTTACATCTTTTCCTAGGAT TCTTAAAACTAGTATGGATATGCTGAGCATACATTCTTTAGAACCTTTTGGACTGTTTTGGTAAATTTCGTAGTCGT AGGATCAGCACAAAGCGGAACTTGACACACTTGTGGAGTTTTACGGCTGTACTTGGTCCTTCTCCATCCCTTTGC TTCCTTTTCCTAAACCAAGTCCCAGACATGTCAGGAGAATGAATTCATTTTTAATGCCAGATGAGTTTGGTGTAAG ATGCATTTGTAAAGCAAAATAAAAAGAATCCACAAAACACACAAATAAAATCCAAACCGCCTTCCAAGTGGGGCTC TTTCATGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGC TGCTGCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTTCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCTAGACCTTCTTTTGGAGAAATGGCTTTCG GAAGTTTTGCCAGGAAACGTAGCCCTAGGCAGGCAGCTTTGCAGCCCCCTTTCTGCTTGTTGCACTTTCTCCATT CGTTCCTTTGCTTTTTGCAGGCTCTGACTCAGGGAAGGTGTGCATTATCCACTAGATACGTCGAAGAAGAGGGAA ACCAATTAGGGTCGAAATAAATGCTGGAGAGAGAGGGAGTGAAAG
7 crrna Testing TCF4 Clone Mix crrna and tracrrna equal volume of 10uM. Incubate 50 degrees 5 min. slow cool to 25 degrees. Mix CRISPR buffer, Cas9, Guide RNA. Incubate 37 degrees 10 min. Add Heparin final conc. 3ug/ul. Incubate 37 degrees 3 min. Add 200 ng of cloned DNA incubate 37 degrees 1 hour. AMPure clean 0.45X AMPure. Fragment Analyzer or Gel
8 crrna Testing TCF4 Clone NEB Procedure Component Nuclease free water 10X Cas9 Nuclease Reaction Buffer 10uM crrna & 10uM tracrrna Pre Incubate 50 degrees 5 min slow cool to 25 1uM Cas ( Nuclease S. pyogenes) Reaction volume 30ul reaction 20ul 3ul 3ul Incubate 1.0ul 27ul 200 ng substrate DNA 3.0ul Total reaction volume 30.0ul Mix and pulse spin. Incubate 37 degrees 15 minutes Add 1ul Proteinase K (NEB #P8107S) Incubate Room temp. for 10 minutes. AATI Fragment Analysis
9 AATI Fragment Analyzer
10 AATI Fragment Analyzer
11 2015 MFMER slide-11 Workflow
12 2015 MFMER slide-12 TCF 4 Data Dr. Wieben- PacBio
13 Sample with no Repeat Expansion
14 Same sample analyzed with Brett Bowman s software from PacBio
15 Sample with Repeat Expansion note insertions in about half the reads
16 Same sample analyzed with Brett Bowman s software from PacBio
17 PacBio positive controls HTT
18 PacBio positive controls FMR-1
19 Hurdles of CRISPR Design and testing crrna Bioinformatics pipeline Labor Intensive Amount of upfront DNA (20ug) 2015 MFMER slide-19
20 Thank You! Ross Aleff 2015 MFMER slide-20
Supporting Information
Supporting Information Cell-free GFP simulations Cell-free simulations of degfp production were consistent with experimental measurements (Fig. S1). Dual emmission GFP was produced under a P70a promoter
RészletesebbenPhenotype. Genotype. It is like any other experiment! What is a bioinformatics experiment? Remember the Goal. Infectious Disease Paradigm
It is like any other experiment! What is a bioinformatics experiment? You need to know your data/input sources You need to understand your methods and their assumptions You need a plan to get from point
RészletesebbenSOLiD Technology. library preparation & Sequencing Chemistry (sequencing by ligation!) Imaging and analysis. Application specific sample preparation
SOLiD Technology Application specific sample preparation Application specific data analysis library preparation & emulsion PCR Sequencing Chemistry (sequencing by ligation!) Imaging and analysis SOLiD
RészletesebbenExpression analysis of PIN genes in root tips and nodules of Lotus japonicus
Article Expression analysis of PIN genes in root tips and nodules of Lotus japonicus Izabela Sańko-Sawczenko 1, Dominika Dmitruk 1, Barbara Łotocka 1, Elżbieta Różańska 1 and Weronika Czarnocka 1, * 1
RészletesebbenBIZTONSÁGI ADATLAP. 1. Az anyag/keverék és a vállalat/vállalkozás azonosítása PV4421 FL-PGC1A PEPTIDE, 100 UM
BIZTONSÁGI ADATLAP Az anyag/készítmény azonosítása 1. Az anyag/keverék és a vállalat/vállalkozás azonosítása Termék neve FL-PGC1A PEPTIDE, 100 UM A vállalat/vállalkozás azonosítása Life Technologies 5791
RészletesebbenMiskolci Egyetem Gazdaságtudományi Kar Üzleti Információgazdálkodási és Módszertani Intézet Factor Analysis
Factor Analysis Factor analysis is a multiple statistical method, which analyzes the correlation relation between data, and it is for data reduction, dimension reduction and to explore the structure. Aim
RészletesebbenCorrelation & Linear Regression in SPSS
Petra Petrovics Correlation & Linear Regression in SPSS 4 th seminar Types of dependence association between two nominal data mixed between a nominal and a ratio data correlation among ratio data Correlation
RészletesebbenSupplementary Table 1. Cystometric parameters in sham-operated wild type and Trpv4 -/- rats during saline infusion and
WT sham Trpv4 -/- sham Saline 10µM GSK1016709A P value Saline 10µM GSK1016709A P value Number 10 10 8 8 Intercontractile interval (sec) 143 (102 155) 98.4 (71.4 148) 0.01 96 (92 121) 109 (95 123) 0.3 Voided
RészletesebbenCurrent Weed Control strategies in sorghum I
Current Weed Control strategies in sorghum I In Pre-planting/pre-emergence chemichal fallow use of seed safeners residual herbicides efficacy uncertain high dependency on rains Current Weed Control strategies
RészletesebbenMiskolci Egyetem Gazdaságtudományi Kar Üzleti Információgazdálkodási és Módszertani Intézet Nonparametric Tests
Nonparametric Tests Petra Petrovics Hypothesis Testing Parametric Tests Mean of a population Population proportion Population Standard Deviation Nonparametric Tests Test for Independence Analysis of Variance
RészletesebbenMiskolci Egyetem Gazdaságtudományi Kar Üzleti Információgazdálkodási és Módszertani Intézet. Hypothesis Testing. Petra Petrovics.
Hypothesis Testing Petra Petrovics PhD Student Inference from the Sample to the Population Estimation Hypothesis Testing Estimation: how can we determine the value of an unknown parameter of a population
RészletesebbenAngol Középfokú Nyelvvizsgázók Bibliája: Nyelvtani összefoglalás, 30 kidolgozott szóbeli tétel, esszé és minta levelek + rendhagyó igék jelentéssel
Angol Középfokú Nyelvvizsgázók Bibliája: Nyelvtani összefoglalás, 30 kidolgozott szóbeli tétel, esszé és minta levelek + rendhagyó igék jelentéssel Timea Farkas Click here if your download doesn"t start
RészletesebbenSupporting Information
Supporting Information Plasmid Construction DNA cloning was carried out according to standard protocols. The sequence of all plasmids was confirmed by DNA sequencing and amplified using the E. coli strain
RészletesebbenOrvosi Genomtudomány 2014 Medical Genomics 2014. Április 8 Május 22 8th April 22nd May
Orvosi Genomtudomány 2014 Medical Genomics 2014 Április 8 Május 22 8th April 22nd May Hét / 1st week (9. kalendariumi het) Takács László / Fehér Zsigmond Magyar kurzus Datum/ido Ápr. 8 Apr. 9 10:00 10:45
RészletesebbenKELER KSZF Zrt. bankgarancia-befogadási kondíciói. Hatályos: 2014. július 8.
KELER KSZF Zrt. bankgarancia-befogadási kondíciói Hatályos: 2014. július 8. A KELER KSZF a nem-pénzügyi klíringtagjaitól, és az energiapiaci alklíringtagjaitól a KELER KSZF Általános Üzletszabályzata szerinti
RészletesebbenSupplemental Information. RNase H1-Dependent Antisense Oligonucleotides. Are Robustly Active in Directing RNA Cleavage
YMTHE, Volume 25 Supplemental Information RNase H1-Dependent Antisense Oligonucleotides Are Robustly Active in Directing RNA Cleavage in Both the Cytoplasm and the Nucleus Xue-Hai Liang, Hong Sun, Joshua
Részletesebben(NGB_TA024_1) MÉRÉSI JEGYZŐKÖNYV
Kommunikációs rendszerek programozása (NGB_TA024_1) MÉRÉSI JEGYZŐKÖNYV (5. mérés) SIP telefonközpont készítése Trixbox-szal 1 Mérés helye: Széchenyi István Egyetem, L-1/7 laboratórium, 9026 Győr, Egyetem
RészletesebbenNEVEZÉSI LAP / ENTRY FORM MARATON - váltó / MARATHON - relay
NEVEZÉSI LAP / ENTRY FORM MARATON - váltó / MARATHON - relay RAJTSZÁM / START NUMBER: (A rajtszámot a rendezőség tölti ki. / To be entered by the organisers:) Kérjük a nevezési lapot NYOMTATOTT BETŰVEL,
RészletesebbenA modern e-learning lehetőségei a tűzoltók oktatásának fejlesztésében. Dicse Jenő üzletfejlesztési igazgató
A modern e-learning lehetőségei a tűzoltók oktatásának fejlesztésében Dicse Jenő üzletfejlesztési igazgató How to apply modern e-learning to improve the training of firefighters Jenő Dicse Director of
Részletesebbenkpis(ppk20) kpis(ppk46)
Table S1. C. elegans strains used in this study Strains carrying transgenes Strain Transgene Genotype Reference IT213 tcer-1 prom:tcer-1orf:gfp:tcer-1 3'utr unc-119(ed3) III; kpis(ppk6) This study IT283
RészletesebbenRotary District 1911 DISTRICT TÁMOGATÁS IGÉNYLŐ LAP District Grants Application Form
1 A Future Vision pilot célja a Future Vision Plan (Jövőkép terv) egyszerűsített támogatási modelljének tesztelése, és a Rotaristák részvételének növelése a segélyezési folyamatokban. A teszt során a districteknek
RészletesebbenTéli kedvezményes ajánlataink
Téli kedvezményes ajánlataink Ajánlataink 2017 január 31-ig érvényesek! BIOBASE műszerek a NucleotestBio Kft. kínálatában! Steril box-ok, lamináris box-ok: Hűtők, fagyasztók, ultramélyhűtők, autoklávok,
RészletesebbenNEVEZÉSI LAP I ENTRY FORM MARATON - váltó MARATHON - relay
NEVEZÉSI LAP I ENTRY FORM MARATON - váltó MARATHON - relay RAJTSZÁM / START NUMBER: (A rajtszámot a rendezőség tölti ki. / To be entered by the organisers:) Kérjük a nevezési lapot NYOMTATOTT BETŰVEL,
RészletesebbenSebastián Sáez Senior Trade Economist INTERNATIONAL TRADE DEPARTMENT WORLD BANK
Sebastián Sáez Senior Trade Economist INTERNATIONAL TRADE DEPARTMENT WORLD BANK Despite enormous challenges many developing countries are service exporters Besides traditional activities such as tourism;
RészletesebbenModular Optimization of Hemicellulose-utilizing Pathway in. Corynebacterium glutamicum for Consolidated Bioprocessing of
[Supplementary materials] Modular Optimization of Hemicellulose-utilizing Pathway in Corynebacterium glutamicum for Consolidated Bioprocessing of Hemicellulosic Biomass Sung Sun Yim 1, Jae Woong Choi 1,
RészletesebbenContact us Toll free (800) fax (800)
Table of Contents Thank you for purchasing our product, your business is greatly appreciated. If you have any questions, comments, or concerns with the product you received please contact the factory.
RészletesebbenMestský úrad Rožňava '4.
11) Slovnaft Mestský úrad Rožňava '4. Dotiodna: 1 9-09- 2014 7... č, ybul Č, daamu:...1--,5-,1 Y Pdloko. Spracovidet: ĺaĺ- Zoznam faktúr / Invoice summary Nie je daňový doklad / Not valid for VAT purposes
RészletesebbenNan Wang, Qingming Dong, Jingjing Li, Rohit K. Jangra, Meiyun Fan, Allan R. Brasier, Stanley M. Lemon, Lawrence M. Pfeffer, Kui Li
Supplemental Material IRF3-dependent and NF- B-independent viral induction of the zinc-finger antiviral protein Nan Wang, Qingming Dong, Jingjing Li, Rohit K. Jangra, Meiyun Fan, Allan R. Brasier, Stanley
Részletesebben2016 év eleji ajánlatok. Speciális áraink 2016 május 31-ig érvényesek!
2016 év eleji ajánlatok Speciális áraink 2016 május 31-ig érvényesek! BIOBASE műszerek a NucleotestBio Kft. kínálatában! Steril box-ok, lamináris box-ok: Hűtők, fagyasztók, ultramélyhűtők, autoklávok,
RészletesebbenConstruction of a cube given with its centre and a sideline
Transformation of a plane of projection Construction of a cube given with its centre and a sideline Exercise. Given the center O and a sideline e of a cube, where e is a vertical line. Construct the projections
RészletesebbenGottsegen National Institute of Cardiology. Prof. A. JÁNOSI
Myocardial Infarction Registry Pilot Study Hungarian Myocardial Infarction Register Gottsegen National Institute of Cardiology Prof. A. JÁNOSI A https://ir.kardio.hu A Web based study with quality assurance
RészletesebbenMapping Sequencing Reads to a Reference Genome
Mapping Sequencing Reads to a Reference Genome High Throughput Sequencing RN Example applications: Sequencing a genome (DN) Sequencing a transcriptome and gene expression studies (RN) ChIP (chromatin immunoprecipitation)
RészletesebbenCsatlakozás a BME eduroam hálózatához Setting up the BUTE eduroam network
Csatlakozás a BME eduroam hálózatához Setting up the BUTE eduroam network Table of Contents Windows 7... 2 Windows 8... 6 Windows Phone... 11 Android... 12 iphone... 14 Linux (Debian)... 20 Sebők Márton
RészletesebbenPARK ATRIUM IRODAHÁZ PARK ATRIUM OFFICE BUILDING
01 0.floor/0.emelet 1550 32 2969 1 1 +600 8 91 1650 +600 65 95 low 44 high 40-1 35-20 18,4 5 131,64 m 2 1 5 1 5 33, m 2 15,8 m 2 32,3 m 2 PARK ATRIUM IROAHÁZ PARK ATRIUM BUILING 15,00 m 2 see service block
RészletesebbenOxacillin MIC µ g ml borderline oxacillin-resistant Staphylococcus aureus. oxacillin Staphylococcus aureus MRSA
oxacillin Staphylococcus aureus MRSA 8 17 11 1 Oxacillin MIC 1248 µ gml borderline oxacillin-resistant Staphylococcus aureus BORSA79 NCCLS CLSIM100-S142004 cefoxitin disk oxacillin cefoxitin methicillin-resistant
RészletesebbenSupporting Information
Supporting Information Paired design of dcas9 as a systematic platform for the detection of featured nucleic acid sequences in pathogenic strains Yihao Zhang 1,2,8, Long Qian 4,8, Weijia Wei 1,3,7,8, Yu
RészletesebbenTavaszi Sporttábor / Spring Sports Camp. 2016. május 27 29. (péntek vasárnap) 27 29 May 2016 (Friday Sunday)
Tavaszi Sporttábor / Spring Sports Camp 2016. május 27 29. (péntek vasárnap) 27 29 May 2016 (Friday Sunday) SZÁLLÁS / ACCOMODDATION on a Hotel Gellért*** szálloda 2 ágyas szobáiban, vagy 2x2 ágyas hostel
RészletesebbenForensic SNP Genotyping using Nanopore MinION Sequencing
Forensic SNP Genotyping using Nanopore MinION Sequencing AUTHORS Senne Cornelis 1, Yannick Gansemans 1, Lieselot Deleye 1, Dieter Deforce 1,#,Filip Van Nieuwerburgh 1,#,* 1 Laboratory of Pharmaceutical
RészletesebbenMiskolci Egyetem Gazdaságtudományi Kar Üzleti Információgazdálkodási és Módszertani Intézet. Nonparametric Tests. Petra Petrovics.
Nonparametric Tests Petra Petrovics PhD Student Hypothesis Testing Parametric Tests Mean o a population Population proportion Population Standard Deviation Nonparametric Tests Test or Independence Analysis
RészletesebbenSTUDENT LOGBOOK. 1 week general practice course for the 6 th year medical students SEMMELWEIS EGYETEM. Name of the student:
STUDENT LOGBOOK 1 week general practice course for the 6 th year medical students Name of the student: Dates of the practice course: Name of the tutor: Address of the family practice: Tel: Please read
RészletesebbenRegisztráció a Researcher ID adatbázisban
Regisztráció a Researcher ID adatbázisban Használati útmutató Készítette: Dr. Sasvári Péter és Urbanovics Anna 1 Bevezetés Ez egy online regisztráció, egyedi azonosító (Researcher ID) létrehozására. Saját
RészletesebbenA rosszindulatú daganatos halálozás változása 1975 és 2001 között Magyarországon
A rosszindulatú daganatos halálozás változása és között Eredeti közlemény Gaudi István 1,2, Kásler Miklós 2 1 MTA Számítástechnikai és Automatizálási Kutató Intézete, Budapest 2 Országos Onkológiai Intézet,
RészletesebbenKIEGÉSZÍTŽ FELADATOK. Készlet Bud. Kap. Pápa Sopr. Veszp. Kecsk. 310 4 6 8 10 5 Pécs 260 6 4 5 6 3 Szomb. 280 9 5 4 3 5 Igény 220 200 80 180 160
KIEGÉSZÍTŽ FELADATOK (Szállítási probléma) Árut kell elszállítani három telephelyr l (Kecskemét, Pécs, Szombathely) öt területi raktárba, melyek Budapesten, Kaposváron, Pápán, Sopronban és Veszprémben
RészletesebbenUSER MANUAL Guest user
USER MANUAL Guest user 1 Welcome in Kutatótér (Researchroom) Top menu 1. Click on it and the left side menu will pop up 2. With the slider you can make left side menu visible 3. Font side: enlarging font
RészletesebbenNYOMÁSOS ÖNTÉS KÖZBEN ÉBREDŐ NYOMÁSVISZONYOK MÉRÉTECHNOLÓGIAI TERVEZÉSE DEVELOPMENT OF CAVITY PRESSURE MEASUREMENT FOR HIGH PRESURE DIE CASTING
Anyagmérnöki Tudományok, 39/1 (2016) pp. 82 86. NYOMÁSOS ÖNTÉS KÖZBEN ÉBREDŐ NYOMÁSVISZONYOK MÉRÉTECHNOLÓGIAI TERVEZÉSE DEVELOPMENT OF CAVITY PRESSURE MEASUREMENT FOR HIGH PRESURE DIE CASTING LEDNICZKY
RészletesebbenKN-CP50. MANUAL (p. 2) Digital compass. ANLEITUNG (s. 4) Digitaler Kompass. GEBRUIKSAANWIJZING (p. 10) Digitaal kompas
KN-CP50 MANUAL (p. ) Digital compass ANLEITUNG (s. 4) Digitaler Kompass MODE D EMPLOI (p. 7) Boussole numérique GEBRUIKSAANWIJZING (p. 0) Digitaal kompas MANUALE (p. ) Bussola digitale MANUAL DE USO (p.
RészletesebbenFÖLDRAJZ ANGOL NYELVEN GEOGRAPHY
Földrajz angol nyelven középszint 0623 ÉRETTSÉGI VIZSGA 2007. május 15. FÖLDRAJZ ANGOL NYELVEN GEOGRAPHY KÖZÉPSZINTŰ ÍRÁSBELI ÉRETTSÉGI VIZSGA INTERMEDIATE LEVEL WRITTEN EXAM JAVÍTÁSI-ÉRTÉKELÉSI ÚTMUTATÓ
RészletesebbenRENDEZVÉNYTERMEK / EVENT VENUE
RENDEZVÉNYTERMEK / EVENT VENUE A tökéletes választás rendezvények, csapatépítő tréningek, konferenciák és üzleti találkozók számára. Az épület a város szívében helyezkedik el kiváló tömegközlekedési csatlakozással,
RészletesebbenSupplemental Table S1. Overview of MYB transcription factor genes analyzed for expression in red and pink tomato fruit.
Supplemental Table S1. Overview of MYB transcription factor genes analyzed for expression in red and pink tomato fruit. MYB Primer pairs TC AtMYB Forward Reverse TC199266 MYB12 AGGCTCTTGGAGGTCGTTACC CAACTCTTTCCGCATCTCAATAATC
RészletesebbenBioinformatics: Blending. Biology and Computer Science
Bioinformatics: Blending Biology and Computer Science MDNMSITNTPTSNDACLSIVHSLMCHRQ GGESETFAKRAIESLVKKLKEKKDELDSL ITAITTNGAHPSKCVTIQRTLDGRLQVAG RKGFPHVIYARLWRWPDLHKNELKHVK YCQYAFDLKCDSVCVNPYHYERVVSPGI DLSGLTLQSNAPSSMMVKDEYVHDFEG
RészletesebbenBúza László, M Schill Judit, Szentgyörgyi Mária, Ábrahám Ágnes, Debreczeni Lajos, Keresztúri József, Muránszky Géza. 2009. április 22.
Gondolatok a MÉZ hamisítása kapcsán MIT-MIKOR-MELY Szereplő- MIKÉPPEN-MIÉRT hamisít, hamisíthat? Szofisztikált analitikai módszerek a hamisítások megelőzésére Búza László, M Schill Judit, Szentgyörgyi
RészletesebbenKNOW-HOW FROM SITE TO SHELF
BURKOLÁS KNOW-HOW FROM SITE TO SHELF 2 AZ 1-BEN VÍZSZIGETELŐ ÉS CSEMPERAGASZTÓ HABARCS ÚJ BURKOLÁS VÍZSZIGETELÉS ÚJÍTÁS: Az egyedülálló két funkciót egyesít: vízszigetelést és burkolatragasztást, ezzel
RészletesebbenExcel vagy Given-When-Then? Vagy mindkettő?
TESZT & TEA BUDAPEST AGILE MEETUP Pénzügyi számítások automatizált agilis tesztelése: Excel vagy Given-When-Then? Vagy mindkettő? NAGY GÁSPÁR TechTalk developer coach Budapest, 2014 február 6. SpecFlow
RészletesebbenNéhány folyóiratkereső rendszer felsorolása és példa segítségével vázlatos bemutatása Sasvári Péter
Néhány folyóiratkereső rendszer felsorolása és példa segítségével vázlatos bemutatása Sasvári Péter DOI: http://doi.org/10.13140/rg.2.2.28994.22721 A tudományos közlemények írása minden szakma művelésének
RészletesebbenUFS Productspecification
Page 1 of 5 General Information Dry mix for 'Potato Flakes with Milk' - the mixture contains skimmed milk powder - solely water is necessary for the preparation of the potato mash - bulk density 380-420
RészletesebbenÚj temékek az UD- GenoMed Kft. kínálatában!
Új temékek az UD- GenoMed Kft. kínálatában! Szolgáltatásaink: Medical Genomic Technologies Kft. Betegtoborzás és biobanking Bioinformatika o Adatelemzés/adatbányászás o Integrált adatbázis készítés Sejtvonal
RészletesebbenDECLARATION OF PERFORMANCE CPR-20-IC-040
Page 1 of 4 DECLARATION OF PERFORMANCE CPR-20-IC-040 1. Unique identification code of the product-type: Name: Item Number: UPONOR RENOVIS PANEL PACK 1.2/0.8; 5 M2 1062201 UPONOR RENOVIS PANEL PACK 1.2/0.8;
Részletesebben(A F) H&E staining of the duodenum in the indicated genotypes at E16.5 (A, D), E18.5
Fig. S1. Brg1 ablation leads to abnormal villous structure in the duodenum in the perinatal period (A F) H&E staining of the duodenum in the indicated genotypes at E16.5 (A, D), E18.5 (B, E), and P0.5
RészletesebbenPME8 QTAPAS A LABEL FREE
PME8 QTAPAS A LABEL FREE QUANTIFICATION APPROACH MARTA MENDES, MARÍA FERNANDÉZ AND IGNACIO CASAL CENTRO DE INVESTIGACIONES BIOLÓGICAS MADRID MARCH 2013 PME 8 QTAPAS OVERVIEW TARGETED PROTEOMICS FOR AQUA
RészletesebbenTHS710A, THS720A, THS730A & THS720P TekScope Reference
THS710A, THS720A, THS730A & THS720P TekScope Reference 070-9741-01 Getting Started 1 Connect probes or leads. 2 Choose SCOPE 3 or METER mode. Press AUTORANGE. Copyright Tektronix, Inc. Printed in U.S.A.
RészletesebbenEndonuclease enzyme that hydrolyzes DNA; produced by the mammalian pancreas. Termék típus
GE Healthcare BIZTONSÁGI ADATLAP Összhangban van az 1907/2006 számú (EU) Szabályzat (REACH), II. Mellékletével Magyarország 1. SZAKASZ: Az anyag/keverék és a vállalat/vállalkozás azonosítása 1.1 Termékazonosító
RészletesebbenSuppl. Materials. Polyhydroxyalkanoate (PHA) Granules Have no Phospholipids. Germany
Suppl. Materials Polyhydroxyalkanoate (PHA) Granules Have no Phospholipids Stephanie Bresan 1, Anna Sznajder 1, Waldemar Hauf 2, Karl Forchhammer 2, Daniel Pfeiffer 3 and Dieter Jendrossek 1 1 Institute
RészletesebbenEladni könnyedén? Oracle Sales Cloud. Horváth Tünde Principal Sales Consultant 2014. március 23.
Eladni könnyedén? Oracle Sales Cloud Horváth Tünde Principal Sales Consultant 2014. március 23. Oracle Confidential Internal/Restricted/Highly Restricted Safe Harbor Statement The following is intended
RészletesebbenStatistical Inference
Petra Petrovics Statistical Inference 1 st lecture Descriptive Statistics Inferential - it is concerned only with collecting and describing data Population - it is used when tentative conclusions about
RészletesebbenUniversity of Bristol - Explore Bristol Research
Al-Salihi, S. A. A., Scott, T. A., Bailey, A. M., & Foster, G. D. (2017). Improved vectors for Agrobacterium mediated genetic manipulation of Hypholoma spp. and other homobasidiomycetes. Journal of Microbiological
RészletesebbenFÖLDRAJZ ANGOL NYELVEN GEOGRAPHY
Földrajz angol nyelven középszint 0612 É RETTSÉGI VIZSGA 2006. október 25. FÖLDRAJZ ANGOL NYELVEN GEOGRAPHY KÖZÉPSZINTŰ ÍRÁSBELI ÉRETTSÉGI VIZSGA INTERMEDIATE LEVEL WRITTEN EXAM JAVÍTÁSI-ÉRTÉKELÉSI ÚTMUTATÓ
Részletesebben7 th Iron Smelting Symposium 2010, Holland
7 th Iron Smelting Symposium 2010, Holland Október 13-17 között került megrendezésre a Hollandiai Alphen aan den Rijn városában található Archeon Skanzenben a 7. Vasolvasztó Szimpózium. Az öt napos rendezvényen
RészletesebbenEnergy analyses of 16 public buildings and recommendations for development possibilities
Energy analyses of 16 public buildings and recommendations for development possibilities György MÁRTON 27.03.2015. METHODOLOGY OF ENERGY ANALYSIS Tasks to be elaborated: 1. Compiling the set of operative
RészletesebbenSupplementary Figure 1
Supplementary Figure 1 Plot of delta-afe of sequence variants detected between resistant and susceptible pool over the genome sequence of the WB42 line of B. vulgaris ssp. maritima. The delta-afe values
RészletesebbenIPSC Level 2.9 pisztoly versenykiírás IPSC Level 2.9 match
A verseny helye/location: A verseny ideje/date: Rendező/Organiser: BEL SE Nevezés: Registration: Indulási feltételek: Rendezési hozzájárulás Entry fee: Szabályok, büntetések, biztonsági szabályok: Értékelés:
RészletesebbenSupplementary Figure 1
Supplementary Figure 1 Barcode analysis for the identification of mirnas that break B cell tolerance. (a) Barcode identification method. Genomic DNA samples from purified splenic B cells that escaped tolerance
Részletesebben}w!"#$%&'()+,-./012345<ya
Flexible Similarity Search of Seman c Vectors Using Fulltext Search Engines Michal Růžička, Vít Novotný, Petr Sojka; Jan Pomikálek, Radim Řehůřek Masaryk University, Faculty of Informa cs, Brno, Czech
Részletesebben4 vana, vanb, vanc1, vanc2
77 1) 2) 2) 3) 4) 5) 1) 2) 3) 4) 5) 16 12 7 17 4 8 2003 1 2004 7 3 Enterococcus 5 Enterococcus faecalis 1 Enterococcus avium 1 Enterococcus faecium 2 5 PCR E. faecium 1 E-test MIC 256 mg/ml vana MRSA MRSA
RészletesebbenSzéchenyi István Egyetem www.sze.hu/~herno
Oldal: 1/6 A feladat során megismerkedünk a C# és a LabVIEW összekapcsolásának egy lehetőségével, pontosabban nagyon egyszerű C#- ban írt kódból fordítunk DLL-t, amit meghívunk LabVIEW-ból. Az eljárás
RészletesebbenDescriptive Statistics
Descriptive Statistics Petra Petrovics DESCRIPTIVE STATISTICS Definition: Descriptive statistics is concerned only with collecting and describing data Methods: - statistical tables and graphs - descriptive
RészletesebbenIP/09/473. Brüsszel, 2009. március 25
IP/09/473 Brüsszel, 2009. március 25 A mobiltelefon-használat nő, míg a fogyasztói árak csökkennek: a Bizottság jelentése szerint az európai távközlési ágazat ellenáll a gazdasági lassulásnak 2008-ban
Részletesebben2. Tavasz Kupa. Uszonyos és Búvárúszó Verseny Kiírása
2. Tavasz Kupa Uszonyos és Búvárúszó Verseny Kiírása 1,/ A verseny célja: Az uszonyos-, és búvárúszás népszerűsítése, versenyzők részére versenyzési lehetőség biztosítása. 2,/ A verseny rendezője: HÓD
RészletesebbenSejt- és szövetkultúra
Sejt- és szövetkultúra Subline Innenteil 14pt TC Tested Tested Cryo Performance Sterile/ DNA-/ DNase-/ RNase-/ Pyrogen-free/ non-cytotoxic CE/ IVD/ Sterile/ Pyrogen-free/ non-cytotoxic/ non-mutagenic Come
RészletesebbenOn The Number Of Slim Semimodular Lattices
On The Number Of Slim Semimodular Lattices Gábor Czédli, Tamás Dékány, László Ozsvárt, Nóra Szakács, Balázs Udvari Bolyai Institute, University of Szeged Conference on Universal Algebra and Lattice Theory
RészletesebbenKAQUN in Sports. Dr. Ágota Lénárt, PhD Head of Department of Psychology, Associate Professor, University of Physical Education, Budapest, Hungary
KAQUN in Sports Dr. Ágota Lénárt, PhD Head of Department of Psychology, Associate Professor, University of Physical Education, Budapest, Hungary Introduction The KAQUN technology allows us to produce a
RészletesebbenInternal Combustion Engine Test
Engine Test Emission Test and Certification Quality and Performance Investigation 1 Excess air factor C 8 H 18 + 12,5 O 2 = 8 CO 2 + 9 H 2 O C 8 H 18 + 12,5 (O 2 +79/21N 2 ) = 8 CO 2 + 9 H 2 O + 12,5 79/21N
RészletesebbenStage 1st: 1. pálya:
Stage 1st: 1. pálya: GUN READY CONDITION: Ready START POSITION: Anywhere FEGYVER INDULÁSI HELYZET: Készenléti helyzet START POZÍCIÓ : Bárhol SCORING: 8 rounds min, unlimited PONTOZÁS: 8 lövés minimum,
RészletesebbenTudományos Ismeretterjesztő Társulat
Sample letter number 3. Russell Ltd. 57b Great Hawthorne Industrial Estate Hull East Yorkshire HU 19 5BV 14 Bebek u. Budapest H-1105 10 December, 2009 Ref.: complaint Dear Sir/Madam, After seeing your
RészletesebbenA cell-based screening system for RNA Polymerase I inhibitors
Electronic Supplementary Material (ESI) for MedChemComm. This journal is The Royal Society of Chemistry 2019 Supporting Information A cell-based screening system for RNA Polymerase I inhibitors Xiao Tan,
RészletesebbenTELJESÍTMÉNYNYILATKOZAT. sz HU. Re deltetésszerű hasz álat. függelék, mellékletek B 1 - B 4
TELJESÍTMÉNYNYILATKOZAT sz. 0081 HU 1. A terméktípus egyedi azonosító kódja: fischer FAZ II horgonycsap 2. Felhasználás célja(i): Termék Nyo atéksza ályozott feszítődü el Re deltetésszerű hasz álat Repedezett
RészletesebbenCrash Course in Omics Terminology, Concepts & Data Types
Crash Course in Omics Terminology, Concepts & Data Types 14 th Annual EuPathDB Workshop Jessie Kissinger June 2, 2019 FungiDB MicrosporidiaDB AmoebaDB PlasmoDB ToxoDB CryptoDB PiroplasmaDB TrichDB GiardiaDB
Részletesebbenmintasepcifikus mikrokapilláris elektroforézis Lab-on-Chip elektroforézis / elektrokinetikus elven DNS, RNS, mirns 12, fehérje 10, sejtes minta 6
Agilent 2100 Bioanalyzer mikrokapilláris gélelektroforézis rendszer G2943CA 2100 Bioanalyzer system forgalmazó: Kromat Kft. 1112 Budapest Péterhegyi u. 98. t:36 (1) 248-2110 www.kromat.hu bio@kromat.hu
RészletesebbenÚj hálózati megoldások Gbit xdsl technológiával
Új hálózati megoldások Gbit xdsl technológiával ITU szabványok és piaci termékek Mérnöki Kamara előadás 2019. február 18. Takács György Az ITU-T 15. Tanulmányi Bizottság Q4 kérdése VDSL2, G.fast, G.mgfast
RészletesebbenRoad traffic-control equipment
Road traffic-control equipment Info Version 3 Url http://com.mercell.com/permalink/39149889.aspx External tender id 44515-2014 Tender type Contract Award Document type Contract award Procurement procedure
RészletesebbenIstván Micsinai Csaba Molnár: Analysing Parliamentary Data in Hungarian
István Micsinai Csaba Molnár: Analysing Parliamentary Data in Hungarian The Hungarian Comparative Agendas Project Participant of international Comparative Agendas Project Datasets on: Laws (1949-2014)
RészletesebbenÁtlagtermés és rekordtermés 8 növénykultúrában
Átlagtermés és rekordtermés 8 növénykultúrában Növény Rekord termés * Átlag termés * Veszteség típusa Biotikus Abiotikus Abiotikus stressz okozta kiesés (% a rekord terméshez képest) Kukorica 19300 4600
RészletesebbenSoftware Engineering Babeş-Bolyai Tudományegyetem Kolozsvár
Software Engineering Dr. Barabás László Bemutatkozás Dr. Barabás László magán személyként szakmai önéletrajz 2005-2007 evoline, projektvezető 1999-2005 Németország, doktori tanulmányok IT szakmai tevékenység
RészletesebbenVerderair VA25-HP (DA) nagynyomású
ÚJDONSÁG! ÚJDONSÁG! ÚJDONSÁG! Verderair VA25-HP (DA) nagynyomású levegő működtetésű membránszivattyú VA25-HP (DA) fő jellemzői: Két nagynyomású folyadékkamrája van Megduplázza az üzemeltető levegő nyomását
RészletesebbenUsing the CW-Net in a user defined IP network
Using the CW-Net in a user defined IP network Data transmission and device control through IP platform CW-Net Basically, CableWorld's CW-Net operates in the 10.123.13.xxx IP address range. User Defined
RészletesebbenIES TM Evaluating Light Source Color Rendition
IES TM-30-15 Evaluating Light Source Color Rendition "Original" "CRI = 80" Desaturated "CRI = 80" Saturated More metrics Color Fidelity Color Discrimination Color Preference Metrics/Measures R f (IES TM-30-15)
RészletesebbenAZ ÁRPA SZÁRAZSÁGTŰRÉSÉNEK VIZSGÁLATA: QTL- ÉS ASSZOCIÁCIÓS ANALÍZIS, MARKER ALAPÚ SZELEKCIÓ, TILLING
Hagyomány és haladás a növénynemesítésben AZ ÁRPA SZÁRAZSÁGTŰRÉSÉNEK VIZSGÁLATA: QTL- ÉS ASSZOCIÁCIÓS ANALÍZIS, MARKER ALAPÚ SZELEKCIÓ, BÁLINT ANDRÁS FERENC 1, SZIRA FRUZSINA 1, ANDREAS BÖRNER 2, KERSTIN
RészletesebbenBKI13ATEX0030/1 EK-Típus Vizsgálati Tanúsítvány/ EC-Type Examination Certificate 1. kiegészítés / Amendment 1 MSZ EN 60079-31:2014
(1) EK-TípusVizsgálati Tanúsítvány (2) A potenciálisan robbanásveszélyes környezetben történő alkalmazásra szánt berendezések, védelmi rendszerek 94/9/EK Direktíva / Equipment or Protective Systems Intended
RészletesebbenCluster Analysis. Potyó László
Cluster Analysis Potyó László What is Cluster Analysis? Cluster: a collection of data objects Similar to one another within the same cluster Dissimilar to the objects in other clusters Cluster analysis
RészletesebbenDG(SANCO)/2012-6290-MR
1 Ensure official controls of food contaminants across the whole food chain in order to monitor the compliance with the requirements of Regulation (EC) No 1881/2006 in all food establishments, including
RészletesebbenSkills Development at the National University of Public Service
Skills Development at the National University of Public Service Presented by Ágnes Jenei National University of Public Service Faculty of Public Administration Public Ethics and Communication 13. 12. 2013
Részletesebben