Transzgenikus egerek előállítása és felhasználásuk. Erdélyi Ferenc MTA KOKI Orvosi Géntechnológiai Részleg

Hasonló dokumentumok
Transzgénikus állatok előállítása

Transzgenikus technikák a neurobiológiában. általános fogalmak

Összefoglaló - Transzgénikus állatok

Az X kromoszóma inaktívációja. A kromatin szerkezet befolyásolja a génexpressziót

Ph.D. Tézis. Új módszerek a transzgénes egér technológiában. Dr Bélteki Gusztáv

TRANSZGENIKUS NYÚL ELŐÁLLITÁSA HUMÁN BETEGSÉGMODELL CÉLJÁBÓL BŐSZE ZSUZSANNA 2013

Fehérje expressziós rendszerek. Gyógyszerészi Biotechnológia

A szamóca érése során izolált Spiral és Spermidin-szintáz gén jellemzése. Kiss Erzsébet Kovács László

A BIOTECHNOLÓGIA ALKALMAZÁSI LEHETŐSÉGEI A GYÓGYSZERKUTATÁSBAN

Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen

Alkalmazott biokémia, transzgénikus organizmusok TRANSZGENIKUS NYÚL ELŐÁLLITÁSA ÉS ALKALMAZÁSI TERÜLETEI

Molekuláris biológiai eljárások alkalmazása a GMO analitikában és az élelmiszerbiztonság területén

In vivo szövetanalízis. Különös tekintettel a biolumineszcens és fluoreszcens képalkotási eljárásokra

Lele Zsolt. MTA Kísérleti Orvostudományi Kutatóintézet

Transzgénikus technológiák az orvostudományban A kövér egerektől a reumás betegségek gyógyításáig

DNS replikáció. DNS RNS Polipeptid Amino terminus. Karboxi terminus. Templát szál

Kromoszómák, Gének centromer

OTKA ZÁRÓJELENTÉS

Egy emlős mesterséges kromoszóma több génnel történő. feltöltésének új módszere

Rekombináns Géntechnológia

TDK lehetőségek az MTA TTK Enzimológiai Intézetben

Genom editálás: Zn-finger nukleázok, Talen, CRISPR- Cas9 rendszerek. Hiripi László Mezőgazdasági Biotechnológiai Kutatóközpont

Mit tud a genetika. Génterápiás lehetőségek MPS-ben. Dr. Varga Norbert

Semmelweis Egyetem Doktori Iskola. Dr Bélteki Gusztáv. Új módszerek a transzgénes egér technológiában

Mint emlős, az ember genetikai modelljeként is szolgál. Genomja, génjeinek elrendeződése, szabályozása sok hasonlóságot mutat az emberével.

Új genetikai stratégia kidolgozása az Arabidopsis stressz válaszát szabályzó gének azonosítására

Epigenetikai Szabályozás

Klónozás: tökéletesen egyforma szervezetek csoportjának előállítása, vagyis több genetikailag azonos egyed létrehozása.

MODELLORGANIZMUSOK GENETIKÁJA. Drosophila melanogaster, muslica (borlégy)

Biológiai módszerek alkalmazása környezeti hatások okozta terhelések kimutatására

A preventív vakcináció lényege :

SZENT ISTVÁN EGYETEM Állattenyésztés-tudományi Doktori Iskola

A genetikai lelet értelmezése monogénes betegségekben

A T sejt receptor (TCR) heterodimer

A C. elegans TRA-1/GLI/Ci szex-determinációs faktor célgénjeinek meghatározása és analízise. Doktori értekezés tézisei.

A felgyorsult fehérje körforgás szerepe a transzlációs hibákkal szembeni alkalmazkodási folyamatokban

Alkalmazott transzgénikus állattechnológiák

Többgénes jellegek. 1. Klasszikus (poligénes) mennyiségi jellegek. 2.Szinte minden jelleg több gén irányítása alatt áll

(1) A T sejtek aktiválása (2) Az ön reaktív T sejtek toleranciája. α lánc. β lánc. V α. V β. C β. C α.

Génkifejeződési vizsgálatok. Kocsy Gábor

A génterápia genetikai anyag bejuttatatása diszfunkcionálisan működő sejtekbe abból a célból, hogy a hibát kijavítsuk.

Norvég Finanszírozási Mechanizmus által támogatott projekt HU-0115/NA/2008-3/ÖP-9 ÚJ TERÁPIÁS CÉLPONTOK AZONOSÍTÁSA GENOMIKAI MÓDSZEREKKEL

5. Molekuláris biológiai technikák

TRANSZGENIKUS BIOMARKER ZEBRADÁNIÓ (DANIO RERIO) VONALAK ALKALMAZÁSÁNAK LEHETŐSÉGEI AZ ÖKOTOXIKOLÓGIÁBAN

A növény inváziójában szerepet játszó bakteriális gének

TRANSZGENIKUS BIOMARKER ZEBRADÁNIÓ (DANIO RERIO) VONALAK POTENCIÁLIS ALKALMAZÁSA A TOXIKOLÓGIÁBAN

Transzgénikus modellállatok: genomikai megközelítések

A kromoszómák kialakulása előtt a DNS állomány megkettőződik. A két azonos információ tartalmú DNS egymás mellé rendeződik és egy kromoszómát alkot.

A TATA-kötő fehérje asszociált faktor 3 (TAF3) p53-mal való kölcsönhatásának funkcionális vizsgálata

TRANSZGENIKUS NYÚL ELŐÁLLITÁSA ÉS ALKALMAZÁSI TERÜLETEI. BŐSZE ZSUZSANNA MTA Doktora MEZŐGAZDASÁGI BIOTECHNOLÓGIAI KUTATÓKÖZPONT 2013

TÉMAKÖRÖK. Ősi RNS világ BEVEZETÉS. RNS-ek tradicionális szerepben

Receptorok és szignalizációs mechanizmusok

I. A sejttől a génekig

LENTIVÍRUS ALAPÚ TRANSZGENEZIS ÉS A SLEEPING BEAUTY TECHNOLÓGIA ALKALMAZÁSA

Antiszenz hatás és RNS interferencia (a génexpresszió befolyásolásának régi és legújabb lehetőségei)

Transzgénikus. nikus állatok. Transzgénikus nikus minden olyan állat, melynek genomja emberi közremk bejuttatott DNS-t t tartalmaz.

Az ADA2b adaptor fehérjéket tartalmazó hiszton acetiltranszferáz komplexek szerepének vizsgálata Drosophila melanogaster-ben

Az Ig génátrendeződés

A Hardy-Weinberg egyensúly. 2. gyakorlat

A C1 orf 124/Spartan szerepe a DNS-hiba tolerancia útvonalban

Egy új, a szimbiotikus gümőfejlődésben szerepet játszó ubiquitin ligáz funkcionális jellemzése

Ellenanyag reagensek előállítása II Sándor Noémi

TRANSZGÉNIKUS NIKUS. GM gyapot - KÍNA. GM szója - ARGENTÍNA

VÁLASZ. Dr. Vértessy G. Beáta opponensi véleményére

transzláció DNS RNS Fehérje A fehérjék jelenléte nélkülözhetetlen minden sejt számára: enzimek, szerkezeti fehérjék, transzportfehérjék

A határsejtvándorlás szabályozásában résztvevœ gének azonosítása és jellemzése ecetmuslicában

Immunitás és evolúció

Az ellenanyagok szerkezete és funkciója. Erdei Anna Immunológiai Tanszék ELTE

Molekuláris genetikai vizsgáló. módszerek az immundefektusok. diagnosztikájában

BEVEZETÉS. A magasabbrendű növényeknek egész életciklusuk folyamán flexibilisen

In Situ Hibridizáció a pathologiai diagnosztikában és ami mögötte van.

Immunológia I. 2. előadás. Kacskovics Imre

Fehérje interakciók az ecetmuslica telomerének retrotranszpozonjain. Takács Sándor

Poligénes v. kantitatív öröklődés

Transzgénikus növények alkalmazása a funkcionális genomikai kutatásokban

Hátterükben egyetlen gén áll, melynek általában számottevő a viselkedésre gyakorolt hatása, öröklési mintázata jellegzetes.

NÖVÉNYGENETIKA. Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP /1/A

Molekuláris terápiák

ÖSSZ-TARTALOM 1. Az alapok - 1. előadás 2. A jelutak komponensei 1. előadás 3. Főbb jelutak 2. előadás

RNS-ek. 1. Az ősi RNS Világ: - az élet hajnalán. 2. Egy már ismert RNS Világ: - a fehérjeszintézis ben résztvevő RNS-ek

A BIZOTTSÁG 2009/120/EK IRÁNYELVE

Jelutak ÖSSZ TARTALOM. Jelutak. 1. a sejtkommunikáció alapjai

Populációgenetikai. alapok

7. SOKFÉLESÉG. Sokféleség

AZ IS30 BAKTERIÁLIS INSZERCIÓS ELEM CÉLSZEKVENCIA VÁLASZTÁSÁNAK MOLEKULÁRIS TÉNYEZŐI DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI SZABÓ MÓNIKA

Molekuláris biológiai technikák

DNS TRANSZPOZON ALAPÚ GÉNBEVITELI ELJÁRÁSOK VIZSGÁLATA EMLŐS RENDSZEREKBEN. Doktori értekezés. Kolacsek Orsolya

Molekuláris Medicina

Transzgénikus állatok előállítási lehetőségei

11. Dr. House. Biokémiai és sejtbiológiai módszerek alkalmazása az orvoslásban

CzB Élettan: a sejt

A T sejtes immunválasz egy evolúciós szempontból váratlan helyzetben: Szervtranszplantáció

BIOLÓGIA HÁZIVERSENY 1. FORDULÓ BIOKÉMIA, GENETIKA BIOKÉMIA, GENETIKA

- Conrad Hal Waddington számára a gének fizikai háttere még ismeretlen volt (Watson-Crick-Franklin 1953), így próbálta leírni a sejt specializációt=>

ÖSSZ-TARTALOM. 1. Az alapok - 1. előadás 2. A jelutak komponensei 1. előadás 3. Főbb jelutak 2. előadás 4. Idegi kommunikáció 3.

Anyai eredet kromoszómák. Zigóta

Az adaptív immunválasz kialakulása. Erdei Anna Immunológiai Tanszék ELTE

A molekuláris biológia eszközei

Az anafázis promoting complex (APC/C) katalitikus modulja Drosophila melanogasterben. Nagy Olga

Egy új genetikai módszerrel azonosított Arabidopsis A4A hősokk faktor funkcionális jellemzése

Átírás:

Transzgenikus egerek előállítása és felhasználásuk Erdélyi Ferenc MTA KOKI Orvosi Géntechnológiai Részleg

Transzgenikus állatok Mesterségesen megváltozatott genetikai állománnyal rendelkeznek. Genom módosítás Génaddíció Géntranszfer eredményeként a genomba (random) beépülve egy idegen DNS darabot tartalmaznak. Célzott génmódosítás Endogén gén célzott mesterséges megváltoztatása. Öröklődő: a gén/genom módosítás érinti az ivarsejtet is. (ivarsejt- embrionális őssejt módosítás) Szomatikus: gén/genom módosítás csak a testi sejteket érinti. (módosítás testi sejtekbe történik, a DNS integrálódhat a genomba, vagy lehet episzómális is ) A genom módosítás lehet térben és időben szabályozott és reverzibilis is.

Genetikai állatmodellek random spontán mutánsok kémiai mutagenezis tervezett (transzgenikus) szomatikus csíravonal öröklődő funkciónyeréses mutáns (gain-of-function) funkióvesztéses mutáns (loss-of-function) túltermelés domináns negatív null-mutáns knockout részleges (hipomorf) mutáns knockdown mutáció knockin sejt-abláció kondicionális/indukálható térben és/vagy időben szabályozott

Transzgenikus állatok felhasználása kutatás gyakorlat szövet- és fejlődés- specifikus génszabályozás (promoter vizsgálat) génfunkciós és fejlődéstani vizsgálatok sejtazonosítás sejtfunkciós vizsgálatok emberi betegségek állatmodelljeinek létrehozása gyógyszercélpontok validálása-fejlesztés gyógyászatban fontos fehérjék előállítása (bioreaktorok) haszonállatok előnyös tulajdonságainak javítása

Miért pont egér? Régóta tenyésztik Sok jól definiált törzse ismert Kis helyigény Felhasználó barát Könnyen manipulálható

Egerek embrionális fejlődése

Donor nőstények előkészítése 5-8 hetes nőstény: 5U Pregnant Mare Serum Gonadotropin (FSH) 5U Human Chorionic Gonadotropin Időzítés: PMSG 14 h 47 órával később HCG 13 h Pároztatás donor hímmel Másnap reggel plugolás

Donor nőstény X Donor hím Embrió Álvemhes anya Recipiens nőstény X Vazektomizált hím

Embrió preparálás ampulla Hyaluronidáz

Mikroinjektált embrió beültetése

Az eukarióta génexpresszió szabályozásának lépései transzkripció sejtmag citoplazma mrns degradáció DNS primér mrns mrns transzkriptum transzlációs szabályozás RNS processzing RNS transzport inaktív mrns fehérje poszttranszlációs modifikáció aktív inaktív

Gének általános szerkezete 5 -upstream régió exon inron 3 -downstream régió ATG Kozák konszenzus GCCACCATGGCTG PoliA addiciós szignál Határoló szekvenciák MAR, SAR, LCR

Genetikai módosítás fajtái 1. transzgenikus A transzgén A transzgén transzgén A

A mikroinjektált transzgén sorsa Fej-farok irányú konkatamér képződés Beépülés a genomba általában egy helyre Koinjektált DNS együttes beépülésének esélye magas Integráció helye random (preferenciális helyek?) Bépülés helye hatással van az expresszióra (heterokromatikus régió- néma)

Hagyományos pronukleáris mikroinjektálás Előnyök Felszerelés igénye kicsi Olcsó Gyors Hatékony (1-25%) Nagy kópiaszám Expresszió szintje magas Hátrányok Véletlenszerű beépülés Transzgén beépülése konkatamer formában Inaktiváció esélye magas Csak génaddíció lehetséges.

Riportergéneket expresszáló transzgenikus egerek A riportergén egy olyan fehérjét kódol, amelynek az expressziója egy meghatározott génhez kötött és nem befolyásolja a sejtfunkciót. Alkalmazása gének szabályozó elemeinek azonosítása, jellemzése sejtek jelölése fehérjék jelölése fehérje expresszió, aktivitás lokalizáció sejtben, szövetben, szervezetben fehérje-fehérje kapcsolat fehérje mozgás jelátviteli funkciók

Riporterfehérjék bakteriális -galaktozidáz enzim: LacZ gén kódolja kimutatása enzimhisztokémiával/enzimaktivitás alapján Luciferáz enzim (szentjánosbogár) kimutatása: biolumineszcenciával/enzimaktivitás alapján fluoreszkáló fehérjék (GFP, DsRED) kimutatása autofluoreszcencia alapján Biolumineszcencia és fluoreszcencia alapján élőben, egész állatban is kimutathatók, nyomon követhetők (hűtött CCD kamera).

A génexpresszió helye in vivo detektálható a biolumineszcens markergént hordozó transzgenikus modellben könnyű valós in vivo detektálás ugyanazon kísérleti állaton több időpontban is elvégezhető a vizsgálat

Az inos gén transzkripciós aktivitásának in vivo egész állatban történő valós detektálása inos luciferáz IFN +slps kontrol IFNg+sLPS 30000 25000 20000 15000 transzkripció a májban gyulladásos állapotokban aktiválódik: zimozán-indukálta arthritis bőrsérülés gyógyulása Gyulladáscsökkentő szerek tesztelésére IFNg+sLPS + Dex 10000 5000

Genetikailag kódolt fluorogének fluoreszcens riporter fehérjék fluoreszcens szenzorok (PF-k)

Genetikailag kódolt fluoreszkáló fehérjék használatának előnyei, hátrányai! detektálásához nem kell szubsztrát! expresszáló sejtek élőben és fixálatlan szeletben is azonosíthatók! fixálás után is működik! ellenanyaggal is kimutatható! mivel nincs amplifikálás a kimutatásnál nem túl érzékeny! nagyon stabil, ezért az expresszió gyors változásainak kimutatására kevésbé alkalmas! sokféleképpen módosítható aminósavcsere fúzió inszerció cirkuláris permutáció

Prototípus: zöld fluoreszkáló fehérje (GFP) GFP fehérje

GFP mesterséges színvariánsok

mrfp variánsok Spectra are normalized to the excitation and emission peak for each protein. (a,b) Excitation (a) and emission (b) curves are shown as solid or dashed lines for monomeric variants and as a dotted line for dtomato and tdtomato, with colors corresponding to the color of each variant. (c,d) Purified proteins (from left to right, mhoneydew, mbanana, morange, tdtomato, mtangerine, mstrawberry, and mcherry) are shown in visible light (c) and fluorescence (d). The fluorescence image is a composite of several images with excitation ranging from 480 nm to 560 nm.

Transzgenikus egérben: DsRedT3

Transzgén kódoló régiója start ATG kódoló régió stop TGA poli(a) riportergén: mrns másolat (cdns) minigén hibrid gén valódi gén intakt/mutáns sejtek jelölése/fehérjék -galaktozidáz zöld fluoreszkáló fehérje (GFP) luciferáz jelző funkció promoter sejt fehérje valódi gén mutáns, hibrid,csonkolt megváltozott sejtfunkció

Transzgén kifejeződés specificitását a DNS szabályozó elem határozza meg promoter GFP mindes sejtjében transzgenikus egér Általános (CAG) -gal transzgenikus agy Agyspecifikus (NSE) -gal transzgenikus idegsejt Purkinje sejt specifikus (L7)

Transzgenikus kisagyi Purkinje sejtek L7 Purkinje sejt specifikus gén E1 E2 E3 kisagy Purkinje sejt zöld fluoreszkáló fehérje -galaktozidáz

Gátló (GABAerg) idegsejtek genetikai módosítása GABAerg idegsejt-specifikus gén (GABA-szintetizáló enzim- GAD65) transzgén egfp medúza zöld fluoreszkáló fehérje gén embrió agy hippocampus cortex fluoreszáló GABAerg idegsejtek az agyban szaglógumó kisagyi Purkinje sejt

GFP+ Purkinje sejtek izolálása FAX-szal L7/gfp transzgenikus egér FAX tiszta Purkinje sejt tenyészet Purkinje sejt

Transzgén expresszió térbeni szabályozása transzgén regulációs régiója enhancer-promoter intron kódoló régió poli(a) Meghatározza a transzgén expressziójának: helyét idejét szabályozását promoter típusok természetes hibrid/mesterséges szövetspecfikus enhancerhsp68 (tk) minimál promoter szövetspecifikus enhancerek azonosítására általános, minden sejtben működő promoter CAG (csirke aktin promoter CMV enhancer) ROSA26 ubiqutin, RNS pol. II szövetspecifikus sejttípus-specifikus indukálható

Tipikus emlős génregulációs régió Az emlős géneket a promotereken kívül több enhancer és silencer szabályozza. Egy tipikus enhancer 500 bp hosszú 10 Kötőhelyet tartalmaz, amelyhez legalább háromféle transzkripciós faktor, valamint 2 különböző aktivátor és egy represszor kötődik.

A transzkripció szabályozásában résztvevő transz elemek

Nagyméretű inszertet tartalmazó klónozó vektorok Plazmid: ~10 kb l-fág: ~20 kb cosmid: 34-40 kb P1 fág: 100 kb PAC/BAC: 350 kb YAC: 2 Mb

P1 fág BAC vector

YAC vector

PV-GFP transzgenikus egerek plazmid: csak izom expresszió BAC: izom és agy expresszió izom agy cerebellum Purkinje sejtek cortex hippocampus

Hagyományos pronukleáris mikroinjektálás Előnyök Felszerelés igénye kicsi Olcsó Gyors Hatékony (5-30%) Nagy kópiaszám Expresszió szintje magas Hátrányok Véletlenszerű beépülés Transzgén beépülése konkatamer formában Inaktiváció esélye magas Csak génaddíció lehetséges.

Genetikai módosítás fajtái 2. knock-out A exon1 P X Neo R gén exon2 X Homológ rekombináció P Neo R gén Transzláció nem megy végbe

Genetikai módosítás fajtái 3. knock-in A P X exon1 Transzlációs start kifejezendő gén X exon2 Homológ rekombináció P Transzlációs start

Genetikai módosítás fajtái 4. Speciális fajtája a speedy mouse, ahol egy olyan konstitutív génbe inzertálják homológ rekombinációval a kifejezendő gént, aminek hiánya nem okoz fiziológiai változást, viszont a gén környezete lehetővé teszi, hogy minden sejtben egyenletes expresszió alakuljon ki. (hprt lókusz X kromoszóma, ROSA26) P P Transzlációs start

Kiméra előállítás

Szőrszín kimérák

C57BL/6NTac- Atm1.1ArteTyrtm1Arte Blasztociszta donor cc,aa ES sejt CC,aa C57Bl6 CC,aa Hibridek Cc, Aa aguti

ES-sejt gén manipuláció Előnyök A génbevitel nagy hatásfokú Szelekciós lehetőségek állnak rendelkezésre Könnyen archiválható Szinte bármilyen gén és genom manipulációra lehetőség van. Knockout Mouse Project Hátrányok Korlátozott a sejtvonalak száma Folyamatos kromoszóma és fertilitás ellenőrzés Drága Csak olyan laborokban működik, ahol folyamatosan nagyszámú mutánst állítanak elő Neo kazetta problémás

Taconic rendszer exon flp flp loxp exon loxp Neo

Hagyományos pronukleáris mikroinjektálás Előnyök Felszerelés igénye kicsi Olcsó Gyors Hatékony (1-25%) Nagy kópiaszám Expresszió szintje magas Hátrányok Véletlenszerű beépülés Transzgén beépülése konkatamer formában Inaktiváció esélye magas Nagy kópiaszám Csak génaddíció lehetséges.

Transzpozícióra képes segédfehérjék használata Lentivírus Vírus mediált beépülés Módosított, defektív HIV vírus Helper vírussal burok generálás Korlátozott cargo kapacitás BLS2 szintű labor és állatház Transzpozonok

Genetikai módosítás fajtái 1b. transzgenikus A Transzpozáz LTR transzgén LTR A transzgén A LTR LTR

Transzpozon mediált genom módosítás A 2. típusú transzpozonok olyan mobil genetikai elemek, amelyek önkivágó/beépítő aktivitással rendelkező transzpozázt kódolnak és annak felismerő helyét is tartalmazzák. transzpozon alapú géntranszfer rendszer cut and paste transzpozició 1 2 önkivágás beépülés új helyre 1. a transzpozáz felismerő helyekkel (IR) körülvett beültetendő gént tartalmazó vektor 2. A transzpozázt hordozó vektor RNS-sel helyettesíthető Amennyiben mindkettő jelen van a sejtben a kivágás és a genomiális DNS-be való Integráció megtörténik.

Transzpozon mediált genom módosítás Gerincesekben aktív 2-es típusú transzpozon rendszerek Név/forrás Transzpozon család Cargo méret Integrációs preferencia Sleeping beauty (SB)* Tc1/mariner 5-7 kb? Méret növelésével csökken a hatásfok nincs gén preferencia inkább intron piggybac piggybac Hatásfok csökken 9 kb felett -pronukl. injektálás Frog prince Tc1/mariner ua. min egyéb Tc1/mainer Tol1/2 hat nagyobb mint a többi 10-20 kb (BAC transzgén 70 kb) gén kódoló régió preferencia intron preferencia gének 5 -régiója? Izsvák Zs, Ivics Z, Matés L SB100 X- 100X aktívabb: 35-50% hatékonyság stem sejtekben, 45% stabil transzgenikus egér

Transzpozon mediálta genom módosítás Alapja random inszerciós mutagenezis (funkció vesztés funkció nyerés) két-komponensű rendszer: (1) transzpozon vektor tartalmazza a bevinni kívánt cdns-t, vagy a gén inaktiváláshoz (aktiváláshoz) szükséges elemeket (2) transzpozáz RNS/vektor formában. Mindkét komponenst be kell juttatni a sejtbe Néhány kópiába épül be (függ a transzpozon/transzpozáz mennyiségétől) Szomatikus és ivarsejt módosításra is alkalmas Nem vírus-eredetű géntranszfert tesz lehetővé Nagy hatásfokú, gyors módszer Használható Transzgenikus modellállatok előállítása (egér, patkány, nyúl stb) génaddíció RNAi knock down- kiválthatja a lentivírust Inszerciós mutagenezis- nem homológ rekombináción alapuló KO technológia- ES sejt független - nagyléptékű patkány KO projekt génterápia Humán (és egyéb) KO sejtvonalak előállítása ipsc vonalak előállítása vírus nélkül

sb-cag/eyfp transzgén kópiaszáma az alapító egyedekben

line # founder offspring F1 offspring F2 ID copy number pups/tg copy number ID/copy number pups/tg copy number 22 105798 mosaic 8/3 1 5/2 1 23 105799 mosaic 4/4 1 7/3 24 105800 2 11/0 25 105801 2 0 26 105802 3-4 4/4 2 5/4 1-2 108977 male/2 10/8 1-2 27 105803 6 6/6 1-6 110175 female/6 6/5 3-4 110176 female/4 8/8 1-4 28 105804 4-5 6/6 1-4 8/8 43 105815 1 7/5 1 7/6 7/6 6/5 44 105816 ~1 7/2 1 6/2 105817 ~2 6/1 ~2 45 11/0 4/1 46 105818 1 9/5 1-2 7/3 105819 5 9/9 3-5 108961 male/4 47 108964 female/5 4/4 2-4 108967 female/5 7/7

A B C D SB-CAG/eYFP mouse brain sagittal sections. A: Cerebral Cortex, B: Cerebellum, C: Hippocampus D: Detailed part of prefrontal cortex. As figures show, however the brain itself seems to be green, CAG promoter is not active in neurons oposite of endothel layer of vessels.

Transzpozáz mediált genom módosítás Előnyök Nagy hatásfokú (15-85%) Az integrálódás egyedi, így a transzgén inaktiválódás esélye alacsonyabb A transzgén továbbörökítés aránya magas Hátrányok RNS munkát igényel, ami drágább és nagyobb odafigyelést igényel. Az alacsony kópiaszámból adódóan a transzgén expressziója alacsony lehet A cargo méretre korlátoz A random integrálódásból adódó gén inaktiválódás előfordulhat

PhiC31 integráz mediált géntranszfer Streptomyces ΦC31fág integráz attb helyek elhelyezése a ROSA26 locusba

Genetikai módosítás fajtái 4. Speciális fajtája a speedy mouse, ahol egy olyan konstitutív génbe inzertálják homológ rekombinációval a kifejezendő gént, aminek hiánya nem okoz fiziológiai változást, viszont a gén környezete lehetővé teszi, hogy minden sejtben egyenletes expresszió alakuljon ki. (hprt lókusz X kromoszóma, ROSA26) P P Transzlációs start

Meganukleázok Endonukleáz aktivitással bíró enzimek DNS duplaszál törést követően megnő a repair aktivitás, ami rekombinációs hot spotot alakít ki Target specifitással bíró hibrid meganukleázok kialakítása

Genetikai módosítás fajtái 2b. knock-out A P X TALEN, ZFN, CRISPR XX MN MN X P P Transzláció nem megy végbe

ZN-finger nukleáz mediált genom módosítások

ZN-finger nukleáz mediálta genom módosítások ZNF kettőszálú törést okoz a genom meghatározott helyén. Specificitást a ZF biztosítja. 1. A törést a sejt NHEJ mechanizmussal javítja mikrodeléció/inszerció potenciális KO 2. A törést a sejt HR mechanizmussal javítja + módosított homológ régió knock in deléció mutáció

ZN-finger nukleáz mediálta genom módosítással KO sejtek és modellállatok is létrehozhatók Előnye Transzgenikus patkány előállítása ZNF technológiával Homológ rekombináció nélkül létrehozható KO sejtvonal, vagy modellállat Azokba az állatfajokban is alkalmazható, amelyeknél nem áll rendelkezésre pluripotens ES sejt Nagy a hatásfoka és gyors Hátránya A kívánt specificitású ZNF-et elő kell állítani Ez nem egyszerű és drága mutáció a kódoló exonban KO

SIGMA-SAGE labs ZNF KO sejtvonalak előállítása GMO állatmodellek előállítása: egér, patkány és nyúl constitutive KO humanization reporter tagging point mutations bármely törzs Kész patkány KO modellek

TALEN

Xanthomonas sp. Transcriptional activator like effectors TALE 34 aminosav modulok (repeat variable diresidues RVD) 12., 13. aminosav a nukleotid kötésért felelős aminosavak NI = A, HD = C, NG = T, NN = G or A)

TRESK mutáns egerek szekvenciája Wt CTGAGGAGCCACCTGAGGCCAGGAGATGCTGTCCTGAGGCCCTGGGGAAGGCCAGGGGATGCTGCCCCG Tm48 CTGAGGAGCCACCTGAGGCCAGGAGATGCT-TCCTGAGGCCCTGGGGAAGGCCAGGGGATGCTGCCCCG Tm57 CTGAGGAGCCACCTGAGGCCAGGAGATGCT--CCTGAGGCCCTGGGGAAGGCCAGGGGATGCTGCCCCG Tm7 CTGAGGAGCCACCTGAGGCCAGGAGATGCT--CCTGAGGCCCTGGGGAAGGCCAGGGGATGCTGCCCCG Tm57 CTGAGGAGCCACCTGAGGCCAGGAGATG--GTCCTGAGGCCCTGGGGAAGGCCAGGGGATGCTGCCCCG Tm60 CTGAGGAGCCACCTGAGGCCAGGAAGC----TCCTGAGGCCCTGGGGAAGGCCAGGGGATGCTGCCCCG Tm51 CTGAGGAGCCA---------------------CCTGAGGCCCTGGGGAAGGCCAGGGGATGCTGCCCCG Tm49 CTGAGGAGCCA---------------------CCTGAGGCCCTGGGGAAGGCCAGGGGATGCTGCCCCG Tm44 CTGAGGAGCCA---------------------CCTGAGGCCCTGGGGAAGGCCAGGGGATGCTGCCCCG Tm38 CTGAGGAGCCA---------------------CCTGAGGCCCTGGGGAAGGCCAGGGGATGCTGCCCCG Tm43 CTGAGGAGCCACCTGAGGCCAGG---------------------------------GGATGCTGCCCCG Tm61 CTGAGGAGCCACCTGAGGCCAGGAGA---------------------------------TGAGGCCCCG TALEN felismerő hely Nucleotid mutáció --- deléció 9bp hosszú repeat

CRISPR/Cas

Lehetséges történések

Target specifikus nukleázok Cink finger TALEN CRISPR/Cas Tervezés közepes könnyű könnyű Konstruálás közepes könnyű nagyon könnyű Hatékonyság alacsony 80-90% magas Aktivitás Off-targeting vágás alacsony/ változó magas magas változó alacsony magas Toxikusság változó alacsony alacsony Költség magas közepes alacsony

ES sejt vs target specifikus nukleázok ES Csak dedikált laborokban Folyamatos ES sejt ellenőrzés Egy konstrukció 1 vonal Egy sejtvonal még nem garantálja az egész egeret és a továbbörökítés sem 100% ~40.000 40 hét TSN Nem igényel nagy befektetést RNS munka Egy konstrukció több féle vonal (knock-out, potenciális knockdown és knockin) Vonal kialakítás közel 100% ~4-6.000 16-20 hét

Konstitutív - indukálható Korai megnyilvánulás, vagy korai génhiány sok esetben káros A szervezet gyakorta kompenzál, így egy gén hiányát más, hasonló funkcióval bíró gének veszik át Egy gén sok szövet - és sejtféleségben nyilvánulhat meg, az általános génkiütés elfedheti a specifikus működést.

Indukálható promóterek I. indukálható endogén promoterek használata: transzgén expresszió szabályozása endogén kontrol szekvenciákkal heat shock promoter; metallothionein MAF kötődik a MRE-hez Cd/Zn jelenlétében; interferon aktiválható promoter; steroid regulált promoterek; GRE (glukokortikoid- MMTV) indukálhatóság nem túl magas, mellékhatások

Indukálható promóterek II. Mesterségesen indukálható génexpresszió: indukálható transzgenezis Szövetspecifikus promóter TRANSZKRIPCIÓS faktor Reszponzív promóter RNS pol Target transzgén

Szövetspecifikus promóter rtta-vp16 teto CMV IE RNS pol Target transzgén

Térbeli szabályozás Cre rekombinázzal

Cre mediált génkifejezés

Brainbow egér

1. Konstrukció elkészítése 2. Génbevitel 3. founder kiválasztása genotipizálás 4. Transzgenikus vonal kialakítása 5. Kísérletezés 6. Egyéb állattechnológiai eljárások

Transzgenikus egyedek azonosítása és jellemzése Genomiális DNS izolálás farok mintákból 2-3 mm darab - Proteináz K feltárás fenol-kloroform extrakció - etanol/izopropanol kicsapás Előny: nagy mennyiségő tiszta DNS, olcsó Hátrány: munkaigényes, veszélyes szerves oldószer magas ionerő mellett szilikátos megkötés - mosás guanidin izo tiocianát hidroklorid oldattal - elúció alacsony ionerő mellett Előny: automatizálható Hátrány: rossz kitermelés, drága

Transzgenikus egyedek azonosítása és jellemzése II. Génexpresszió alapján RNS - Northern hibridizáció - RT-PCR Fehérje - Western blot - enzim aktivitás - fenotípus Homozigóta egyedekben a transzgén expresszió szintje magasabb lehet.

1. Konstrukció elkészítése 2. Génbevitel 3. founder kiválasztása genotipizálás 4. Transzgenikus vonal kialakítása 5. Kísérletezés 6. Egyéb állattechnológiai eljárások

Transzgenikus egyedeket nem transzgenikus egyedekkel keresztezik, felszaporított heterozigóta egyedek keresztezésével homozigóta vonalakat alakítanak ki.

1. Konstrukció elkészítése 2. Génbevitel 3. founder kiválasztása genotipizálás 4. Transzgenikus vonal kialakítása 5. Kísérletezés 6. Egyéb állattechnológiai eljárások

Kísérletezés Mit használjunk, és hogyan?

Egér fajok elterjedése

Laboratóriumi egerek eredete

Kedvtelésből tartott egerek - Ázsia, Európa (XVIII-XX. Sz.) Abbie Lathrop összegyűjtötte és tenyésztette őket Granby, MA 1900 W.E. Castle C.C. Little Castle, Little és Mások folytatták Lathrop munkáját és alakították ki Az első inbred törzseket (1908-tól)

Egér Családfa Castle s egerek Kína Japán Swiss Egyéb törzsek C57- leszármazott vad eredetű

Felhasznált egértörzsek C57/BL6 129 FVB/N NMRI

Inbred Outbred/F1

A genetikai háttér hatása a genetikai módosítás fenotípusos megjelenésére Magatartás Szív és érrendszer élettana Fejlődési defektek Diabetes Immunitás and gyulladás Metabolizmus Tumor képzés és gyakoriság

100 200 300 400 500 15 10 129 B6 n 5 0 Blood glucose (mg/dl) Adapted from Almind et al., Diabetes 52:1535, 2003

2 típusú diabetes Diabetes db/db (Lepr db ) C57BL/6 (B6.Cg-m +/+ Lepr db /J) elhízás tranziens diabetes-szel Obese ob/ob (Lep ob ) C57BL/6 (B6.V-Lep ob /J) elhízás tranziens diabetes-szel C57BLKS (BKS.Cg- m +/+ Lepr db /J) elhízás megnyilvánuló diabetes-szel C57BLKS (BKS.V-Lep ob /J) elhízás megnyilvánuló diabetesszel

Episztatikus faktorok hatása a transzgén megnyilvánulásra Body weight (g) 50 45 40 35 30 WT HDC -/- 25 5 10 15 20 25 30 35 weeks Fülöp et al. Endocrinology 2003

FVB/N-FVB/Ant

Congenic Co-isogenic 1 2 3 4 5 1 2 3 4 5

Strain B b/b Strain B b/b A. Hagyományos B. SPEED CONGENIC Háttér specifikus genotipizálás nélkül Strain B b/b Strain A a/a mt Strain B b/b b/a mt Strain B b/b % loci A/B b/a mt 100% Strain B b/b b/a mt b/a mt Generation F1 50% b/a mt 25% F1N1 b/a mt N5-N11 b/a mt % loci A/B 100% F1N2 12.5% Strain A 6.25% <0.2% a/a mt <30% Szelektált tenyészpárokkal <5% F1N3 b/a mt F1N4 F1N12 Strain B <0.2% b/b b/a mt Strain B b/b Strain B b/a mt b/b b/a mt Strain B b/b Strain B b/b Beltenyésztett Kongenikus törzs Átlagos elvégzési idő: 5 generáció X 3 hónap/generáció => 1.25 év Minimum idő: 13 generáció X 3hónap/generáció => 3.25 év N12F1 a mt /a mt N12F1 a mt /a mt N12F1 a/a mt N12F1 a/a mt N12F1 a/a N12F1 a/a Beltenyésztett kongenikus törzs Strain B-a mt Strain B

Alom kontrol cb1z cb1 cypd D2R net +/+ 29% 27% 31% 30% 31% +/- 50% 50% 47% 48% 56% -/- 21% 23% 22% 22% 13% utódszám 288 2145 221 330 327 tenyészpár 16 78 7 12 13

1. Konstrukció elkészítése 2. Génbevitel 3. founder kiválasztása genotipizálás 4. Transzgenikus vonal kialakítása 5. Kísérletezés 6. Egyéb állattechnológiai eljárások Rederiválás Embrió mélyhűtés

Rederiválás Befogadó állatház Szuperovuláció kiváltása hormoninjekcióval Fertőzött kolónia SPF space Kórokozó mentes kolónia X zigóta/hólyagcsíra állapotú embrió preparálás barrier Tripszin kezelés SPF béranya Elválasztás után higiéniai státusz ellenőrzése

1. Konstrukció elkészítése 2. Mikroinjektálás 3. founder kiválasztása genotipizálás 4. Transzgenikus vonal kialakítása 5. Kísérletezés 6. Egyéb állattechnológiai eljárások Rederiválás Embrió mélyhűtés

Technológiai sor 1. Konstrukció elkészítése 2. Génbeviteli eljárás 3. founder kiválasztása genotipizálás 4. Transzgenikus vonal kialakítása 5. Kísérletezés 6. Egyéb állattechnológiai eljárások Rederiválás Embrió mélyhűtés