TÉMAKÖRÖK. Ősi RNS világ BEVEZETÉS. RNS-ek tradicionális szerepben

Méret: px

Mutatás kezdődik a ... oldaltól:

Download "TÉMAKÖRÖK. Ősi RNS világ BEVEZETÉS. RNS-ek tradicionális szerepben"

Petra Hegedüs
8 évvel ezelőtt
Látták:

1 esirna mirtron

2 BEVEZETÉS TÉMAKÖRÖK Ősi RNS világ RNS-ek tradicionális szerepben

3 bevezetés

4 BIOLÓGIAI MOLEKULÁK FEHÉRJÉK NUKLEINSAVAK DNS-ek RNS-ek

5 BIOLÓGIAI MOLEKULÁK FEHÉRJÉK NUKLEINSAVAK DNS-ek RNS-ek

6 DNS RNS szerkezet Nukleinsavak: bázis, cukor, foszfát

7 DNS RNS szerkezet

8 DNS RNS szerkezet Timin Uracil Adenin Guanin Citozin

9 Mi az RNS? A modern sejtekben az RNS DNS templátról keletkezik, s fehérjét produkál.

10 Francis Crick A centrális dogma

11 A centrális dogma Kibővített verzió Francis Crick DNS replikáció (DNS->DNS) Reverz transzkripció DNS transzkripció (DNS->RNS) RNS replikáció (RNS->RNS) (+) Szensz RNS (-) Szensz RNS transzláció (RNS->fehérje) RNS függő RNS polimeráz fehérje

transzkripció (DNS->RNS) RNS replikáció (RNS->RNS) (+)

12 ŐSI RNS VILÁG

13 TYÚK TOJÁS PARADOXON

14 RIBOZIM

15 AZ RNS VILÁG HIPOTÉZIS Régmúlt átmenet Jelen fehérje Walter Gilbert

16 KÉT SZÉK KÖZÖTT

17 RNS-ek TRADICIONÁLIS SZEREPBEN

18 RNS-ek

19 mrns 4-5% TRANSZKRIPCIÓ

20 mrns érés foszfohidroláz Cap-képződés lépései guanilil transzferáz 5 trifoszfál lehasítása Guanozin származék kapcsolódása (5-5 ) Guanil-7- metiltranszferáz Cap guanozin metilálás Az első néhány bázis metilálása 2 -O-metil transzferáz capping

kapcsolódása (5-5 ) Guanil-7- metiltranszferáz Cap guanozin

21 mrns érés poliadenilát polimeráz komlex enzim komplex Poliadeniláció

22 U1 mrns érés SPLICING - snrns U2 U4 U5 U6

23 trns Transzfer RNS legkisebb(60-95 nukleotid, 76!) AS szállítás 20% módosult bázis D hurok Aminosav kötő hely TΨC hurok Variábilis hurok Antikodon: templát felismerő hely

24 rrns Leggyakoribb Legnagyobb

26 * aorns RNS-ek

27 Kis rns-ek

28 Kis rns-ek Emberben > 700 mirns Vírus-elleni védekezés Transzkripciós szintű génszabályozás Poszt-transzkripciós génszabályozás több száz sirns Vírus-elleni védekezés Transzpozon elcsendesítés Kromatin átrendezés Poszt-transzkripciós génszabályozás több millió egyedi pirns szekvencia Transzpozonok elcsendesítése

29 Nem-kódoló rns-ek irodalma year year 2009 augusztus

30 Kis rns-ek Hogyan működnek? kisrns-mrns duplex közti hasítás 100%-os komplemenaritás esetén sirns pirns mirns növényeben mirns néhány típusa állatokban Transzláció represszió Nem tökéletes homológia mirns állatokban

31 mirns Az emlős genom kb 1000 egyedi mirns-t kódol Ahumán fehérje-kódoló gének jelentős hányadát mirns-ek szabályozzák Egy mirns több gént képes szabályozni Egy gén expresszióját sok mirns szabályozhatja A kombinációk száma gyakorlatilag korlátlan. Konzervatív szekvenciák -> evolúció OnkomiR-ek: rák kialakulás

32 mirns biogenezis

33 kis interferáló rns-ek kialakulása

34 RNS interferencia

35 Drosha & dicer Rnáz III

36 Argonaute fehérjék 1. Ago a. mirns b. sirns 2. Piwi a. pirns ~ RNase H Ago fehérje domének

37 irnas (PIWI-interacting RNS) Dicer-független ~24 30 nt PIWI-fehérjékkel alkot komlexet Ivari őssejtek képzése retrotranspozon elcsendesítés SPERMATOGENESIS!!! Repeat associated small interfering RNS (Rasi-RNA)

38 PiRNS Biogenesis MIWI MILI PIWIL1 PIWIL2

39 Ping-Pong Effekt Transzpozonok és egyéb RNS-ek Szensz transzkript Vágás és metiláció?? Vágás és metiláció pirns klaszter transzkript Antiszensz transzkript

40 Small nucleolar RNS-ek (snorns-ek) Promoter-associated RNS-ek (PARs) Transcription initiated RNS-ek (tirnas) X-inactive specific transcript (xist-rna): x kromoszóma inaktiváció Sno-derived RNS-ek (sdrna-ek): transzláció szabályozás microrna-offset RNS-ek (morns-ek): nem ismert trns-ből származó RNS-ek: transzláció gátlás MSY2-associated RNS-ek (MSY-RNAs): nem ismert Telomeráz kis RNS-ek (tel-srnas): telomer régió fenntartása Centroszóma- associaált RNS-ek (crasirna-ek): kromatin módosítás

41 Antiszensz rnas Transz antiszensz RNS-ek nem tökéletes homológia -Mikro RNS-ek -Endogén sirns-ek??? -Piwi RNS-ek Cisz antiszensz RNS-ek 100%-os homológia -Hosszú, nem kódoló (lnc) RNS-ek -Átfedő RNS-ek

42 LncRNAs > 200 nt kategóriák Szensz Antiszensz Kétirányú Intronikus Intergénikus

43 cisz antiszensz RNS-ek

44 LncRNS-ek Funkciója kromatin modifikáció/átalakítás transzkripció poszt-transzkripciós szabályozás

45 TRANSzkripciós INTERFERENCia Karambol vagy kollízió

46 Rns MASzkírozás

47 dsrns-függő MECHANIzmusok

48 Antiszensz indukálta metiláció

49 kromatin átalakítás

50 Aujeszky-féle vírus Génszabályozás modellje

51 mindkét dns szál transzkripcionálisan aktív DNS mrns mrns asrns

52 Antiszensz RNS-ek: LLT1 & LLT2 Time (h) Time (h) 3 5 ep0 ie

53 Antiszensz RNS-ek: összefüggések 0,6 0,5 ul50 mrns ul50 asrns R(t+1)-Rt 0,4 0,3 0,2 5 ul ul50 0,1 0,0-0, Idő (h) 0,8 0,6 ul51 mrns ul51 asrns 0,4 R(t+1)-Rt 0,2 0,0 5 ul ul50-0,2-0, Idő (h)

54 R(t+1)-Rt 0,6 Antiszensz RNS-ek: összefüggések 2D Graph 3 0,2 0,4 1,4 0,6 0,0 2D Graph ,4 Time (h) R(t+1)-Rt R(t+1)-Rt 1,2 1,0 0,8 0,6 0,4 0,2 0,2 0,0-0,2 ul30 AS RNA ul31 mrna 5 ul ul31 0,0-0, D 3 Graph Time 4(h) Time (h) 0,6 0,4 ul30 AS RNA ul31 mrna ul50 mrna ul51 AS RNA Time (h) R(t+1)-Rt 0,2 0,0 5 ul ul50-0,2-0, Idő (h)

55 Antiszensz RNS-ek: összefüggések 5 ul38 ul39 ul phcmv Gene Time R AS /R S (Ka) R AS /R S (VHS) R AS /R S (Ka/VHS) ul38 1h 0,093 0,181 1,951 2h 0,032 2,025 63,257 4h 0,212 0,291 1,375 6h 0,323 1,514 4,694 8h 0,146 0,624 4,258 12h 0,240 0,303 1,263 Gene Time R AS /R S (Ka) R AS /R S (VHS) R AS /R S (Ka/VHS ul39 1h 0,044 0,072 1,638 2h 0,062 0,048 0,781 4h 0,137 0,654 4,783 6h 0,141 0,972 6,896 8h 0,197 0,870 4,420 12h 0,153 0,676 4,425 Gene Time R AS /R S (Ka) R AS /R S (VHS) R AS /R S (Ka/VHS ul40 1h 0,023 0,036 1,554 2h 0,015 0,021 1,366 4h 0,085 0,407 4,761 6h 0,152 0,854 5,604 8h 0,180 0,746 4,136 12h 0,155 0,358 2,311

56 TIN Hipotézis Génklaszterek kompetíciója transzkripciós faktorokért

57 Paralel read-through átfedések Vízesés Modell

58 Libikóka Modell Divergens átfedések Konvergens átfedések Konvergens fehérje kódoló gének read-through átfedései Egy fehérje kódoló gén és egy RNS gén konvergens átfedése ep0

59 Libikóka Modell mrns - asrns interakciók IE E E/L L

Hasonló dokumentumok

RNS-ek. 1. Az ősi RNS Világ: - az élet hajnalán. 2. Egy már ismert RNS Világ: - a fehérjeszintézis ben résztvevő RNS-ek

RNS-ek. 1. Az ősi RNS Világ: - az élet hajnalán. 2. Egy már ismert RNS Világ: - a fehérjeszintézis ben résztvevő RNS-ek RNS-ek RNS-ek 1. Az ősi RNS Világ: - az élet hajnalán 2. Egy már ismert RNS Világ: - a fehérjeszintézis ben résztvevő RNS-ek 3. Egy újonnan felfedezett RNS Világ: - szabályozó RNS-ek 4. Transzkripció Ősi