Speciális fluoreszcencia spektroszkópiai módszerek

Hasonló dokumentumok
Fluoreszcencia módszerek (Kioltás, Anizotrópia, FRET) Modern Biofizikai Kutatási Módszerek

Fluoreszcencia módszerek (Kioltás, Anizotrópia, FRET)

Fluoreszcencia 2. (Kioltás, Anizotrópia, FRET)

Speciális fluoreszcencia spektroszkópiai alkalmazások. Emlékeztető: az abszorpció definíciója. OD = A = - log (I / I 0 ) = ε (λ) c x

Abszorpció, emlékeztetõ

Szerves oldott anyagok molekuláris spektroszkópiájának alapjai

Lumineszcencia spektrometria összefoglaló

Lumineszcencia. Lumineszcencia. mindenütt. Lumineszcencia mindenütt. Lumineszcencia mindenütt. Alapjai, tulajdonságai, mérése. Kellermayer Miklós

Ragyogó molekulák: dióhéjban a fluoreszcenciáról és biológiai alkalmazásairól

Lumineszcencia spektrometria összefoglaló

Bevezetés a fluoreszcenciába

Lumineszcencia spektroszkópia

Műszeres analitika II. (TKBE0532)

Biomolekuláris szerkezeti dinamika

Reakciókinetika és katalízis

Lumineszcencia alapjelenségek

Lumineszcencia. Lumineszcencia. Molekulaszerkezet. Atomszerkezet

A fluoreszcencia orvosibiológiai. alkalmazásai. Fluoreszcencia forrása I. Fluoreszcencia alkalmazások. Kellermayer Miklós

Biomolekuláris szerkezeti dinamika

Sejt. Aktin működés, dinamika plus / barbed end pozitív / szakállas vég 1. nukleáció 2. elongáció (hosszabbodás) 3. dinamikus egyensúly

Lumineszcencia Fényforrások

DSC. DSC : differential scanning calorimetry. DSC : differential scanning calorimetry. ITC : isothermal titration calorimetry

Síkban polarizált fény Síkban polarizált fény

OPTIKA. Fénykibocsátás mechanizmusa fényforrás típusok. Dr. Seres István

Tartalomjegyzék. Emlékeztetõ. Emlékeztetõ. Spektroszkópia. Fényelnyelés híg oldatokban 4/11/2016. A fény; Abszorpciós spektroszkópia

Optikai spektroszkópiai módszerek

Tartalomjegyzék. Emlékeztetõ. Emlékeztetõ. Spektroszkópia. Fényelnyelés híg oldatokban A fény; Abszorpciós spektroszkópia

differenciális pásztázó kalorimetria DSC: differential scanning calorimetry ITC : isothermal titration calorimetry

DSC: differential scanning calorimetry. ITC : isothermal titration calorimetry. differenciális pásztázó kalorimetria

Név... intenzitás abszorbancia moláris extinkciós. A Wien-féle eltolódási törvény szerint az abszolút fekete test maximális emisszióképességéhez

Hogyan bírhatjuk szóra a molekulákat, avagy mi is az a spektroszkópia?

A fény keletkezése. Hőmérsékleti sugárzás. Hőmérsékleti sugárzás. Lumineszcencia. Lézer. Tapasztalat: a forró testek Hőmérsékleti sugárzás

Abszorpciós fotometria

Komplex egyszerű Aktin alapú mikrofilamentum rsz. Hogyan vizsgálhatunk folyamatokat? Komplex egyszerű S E J T

Lumineszcencia: a fényt kibocsátó rendszer nem a magas hőmérséklet miatt világít!!! Ez az ún. hideg emisszió

Atomszerkezet. Fehérjék szerkezetvizsgáló módszerei. Molekulaszerkezet. Molekula energiája. Lumineszcenciás technikák. E e > E v > E r. + E v.

Orvosi Biofizika I. 12. vizsgatétel. IsmétlésI. -Fény

Abszorpciós fotometria

Az elektromágneses spektrum

Abszorpciós fotometria

Rövid ismertető. Modern mikroszkópiai módszerek. A mikroszkóp. A mikroszkóp. Az optikai mikroszkópia áttekintése

Abszorpciós fotometria

FOTOKÉMIAI REAKCIÓK, REAKCIÓKINETIKAI ALAPOK

Biomolekuláris szerkezet és dinamika vizsgálata. Gerjesztés során elnyelt energia sorsa. Fluoreszcencia és különleges alkalmazásai

Abszorpciós spektrometria összefoglaló

ORVOSI BIOFIZIKA. Damjanovich Sándor Mátyus László QT Szerkesztette

Műszeres analitika. Abrankó László. Molekulaspektroszkópia. Kémiai élelmiszervizsgálati módszerek csoportosítása

Abszorpciós spektrumvonalak alakja. Vonalak eredete (ld. előző óra)

Fluoreszcencia spektroszkópia

Fluoreszcencia spektroszkópia

2.3. Az abszorpciós spektrum és mérése

Mézerek és lézerek. Berta Miklós SZE, Fizika és Kémia Tsz november 19.

Mozgékony molekulák vizsgálata modern mikroszkópiával

Dr. JUVANCZ ZOLTÁN Óbudai Egyetem Dr. FENYVESI ÉVA CycloLab Kft

2. Szerves anyagok oldatának fotolumineszcencia színképének meghatározása

A fény. Abszorpciós fotometria Fluoreszcencia spektroszkópia. A fény. A spektrumok megjelenési formái. A fény kettıs természete: Huber Tamás

Az elektromágneses hullámok

Abszorpciós spektroszkópia

Stokes-féle eltolódási törvény

Szervetlen komponensek analízise. A, Atomspektroszkópia B, Molekulaspektroszkópia C, Elektrokémia D, Egyéb (radiokémia, termikus analízis, stb.

Atomfizika. Fizika kurzus Dr. Seres István

PÉCSI TUDOMÁNYEGYETEM. Fluoreszcens módszerek alkalmazása nanostruktúrák vizsgálatában. Jánosi Tibor Zoltán

Koherens fény (miért is különleges a lézernyaláb?)

In vivo szövetanalízis. Különös tekintettel a biolumineszcens és fluoreszcens képalkotási eljárásokra

Az élő sejt fizikai Biológiája Kellermayer Miklós

Adatgyőjtés, mérési alapok, a környezetgazdálkodás fontosabb mőszerei

Reakciókinetika és katalízis

ADATÉRTÉKEL ELJÁRÁSOK SEJTFELSZÍNI FEHÉRJEMINTÁZATOK ANALÍZISÉRE SZENTESI GERGELY

Koherens fény (miért is különleges a lézernyaláb?)

Optikai spektroszkópiai módszerek

Modern mikroszkópiai módszerek

Polarizált fény, polarizáció. Polarizáció fogalma. A polarizált fény. Síkban polarizált fény. A polarizátor

Tenzidek kritikus micellaképződési koncentrációjának és aggregációs számának meghatározása fluoreszcens spektroszkópiával

Tropomiozin és nehéz meromiozin hatása a formin által nukleált aktin filamentumok flexibilitására

Optika Gröller BMF Kandó MTI

ALKÍMIA MA Az anyagról mai szemmel, a régiek megszállottságával.

Atomfizika. Fizika kurzus Dr. Seres István

Orvosi Biofizika II. Szigorlati tételsor Korai atommodellek. Rutherford-féle kísérlet. Franck-Hertz kísérlet. Bohr-féle atommodell.

Röntgensugárzás az orvostudományban. Röntgen kép és Komputer tomográf (CT)

Fehérjeszerkezet, és tekeredés

Kémiai Intézet Kémiai Laboratórium. F o t o n o k k e r e s z tt ü z é b e n a D N S

Az áramlási citométer és sejtszorter felépítése és működése, diagnosztikai alkalmazásai

UV-VIS spektrofotometriás tartomány. Analitikai célokra: nm

Atommodellek de Broglie hullámhossz Davisson-Germer-kísérlet

Kémiai anyagszerkezettan

Adatgyőjtés, mérési alapok, a környezetgazdálkodás fontosabb mőszerei

Modern Fizika Labor. 11. Spektroszkópia. Fizika BSc. A mérés dátuma: dec. 16. A mérés száma és címe: Értékelés: A beadás dátuma: dec. 21.

Fizikai kémia és radiokémia labor II, Laboratóriumi gyakorlat: Spektroszkópia mérés

1. mérés: Benzolszármazékok UV spektrofotometriás vizsgálata

OPTIKA. Vozáry Eszter November

ATOMMODELLEK, SZÍNKÉP, KVANTUMSZÁMOK. Kalocsai Angéla, Kozma Enikő

-A homogén detektorok közül a gyakorlatban a Si és a Ge egykristályból készültek a legelterjedtebbek.

Szentjánosbogár, trópusi halak, sarki fény Mi a közös a természet fénytüneményeiben?

Tantárgy neve. Környezetfizika. Meghirdetés féléve 6 Kreditpont 2 Összóraszám (elm+gyak) 2+0

jelszó: geta5

Kvantumos információ megosztásának és feldolgozásának fizikai alapjai

Részletes szakmai beszámoló Az erbb proteinek asszociációjának kvantitatív jellemzése című OTKA pályázatról (F049025)

Modern Fizika Labor Fizika BSC

2. ZH IV I.

Gyors-kinetikai módszerek

Átírás:

Speciális fluoreszcencia spektroszkópiai módszerek Fluoreszcencia kioltás Fluoreszcencia Rezonancia Energia Transzfer (FRET), Lumineszcencia A molekuláknak azt a fényemisszióját, melyet a valamilyen módon (például fénnyel való besugárzással) gerjesztett molekula a hőmérsékleti sugárzáson kívül kibocsát, gyűjtőnéven lumineszcenciának nevezzük. Lumineszcencia típusai - fluoreszcencia - foszforeszcencia 1

Jablonski diagramm A gerjesztett állapotú elektron lecsengési lehetőségei Gerjesztés Fluoreszcencia 10-9 s k f Foszforeszcencia 10-3 s k ph 10-15 s E=hν Alap állapot Relaxáció Gerjesztett állapot k q k ic Kioltás vagy Energia transzfer Internal conversion (HŐ) 2

Fluoreszcencia alapfogalmak Kvantumhatásfok: a kibocsátott fotonok száma, osztva az elnyelt fotonok számával. Q f f k f knr Élettartam: az az időtartam ami alatt az intenzitás az e-ed részére csökken le. 1 k f k nr k Fluoreszcencia kioltás Azon lecsengési folyamatok esetén, amikor egy fluorofórokat tartalmazó oldatban, olyan molekulák vagy ionok (kioltók) vannak jelen, amelyek megfelelő elektronszerkezettel rendelkeznek ahhoz, hogy a gerjesztett molekulákkal találkozva, azok energiáját átvegyék, és valamilyen formában disszipálják (pl.hő) fluoreszcencia kioltásról beszélünk. A kioltás által új lecsengési út válik lehetővé Q= k f / k f +k ic +k q Q~F Fluoreszcencia intenzitás lecsökken! 3

Kioltás típusai Kioltás típusai Fluorofór + : Nincs emisszió Kioltó Sötét komplex h*υ (a gerjesztés előtt jön létre) Gerjesztés + : Fluorofór Kioltó h*υ Gerjesztés Ütközési komplex (a gerjesztés után jön létre) Fluorofór + Kioltó 4

Stern-Volmer egyenlet ( a kioltás mértékének kvantifikálása) Max Volmer (1885-1965) Otto Stern (1888-1969) Fizikai Nobel díj (1943) F 0 : fluoreszcencia intenzitás a kioltó hiányában F : fluoreszcencia intenzitás a kioltó jelenlétében K sv : Stern-Volmer állandó [Q] : kioltó koncentrációja Stern-Volmer egyenlet F 0 1 K [ Q sv ] F 0 5

Stern-Volmer állandó(k sv ) A fluorofór hozzáférhetőségéről ad információt! Dinamikus kioltás K sv =k q * τ 0 Hogyan dönthető el milyen típusú kioltásról van szó? k q : bimolekuláris sebességi állandó, ami a fluorofór és a kioltó diffúziós képességével, illetve a fluorofór hozzáférhetőségével áll összefüggésben Einstein-Stokes D=kT/6πhR k q = 1x10 10 M -1 s -1 k q < 1x10 10 M -1 s -1 k q > 1x10 10 M -1 s -1 diffúzió kontrollált sztérikus elfedettség kötés Dinamikus kioltás Statikus kioltás 6

Semleges kioltók: akrilamid, nitroxidok sztérikus viszonyok feltérképezése Töltéssel rendelkező kioltók: jodid, cézium, kobalt töltés viszonyok meghatározása Kioltók típusai Alkalmazás Fehérjék folding -jának vizsgálata Fehérjék konformációs állapotának és töltés viszonyainak feltérképezése Membránok permeabilitása Diffúziós állandók meghatározása Ld: később 7

FRET Förster típusú / fluoreszcencia rezonancia energia transzfer a gerjesztett állapotban lévő molekula (donor), valamint egy megfelelő spektroszkópiai paraméterekkel rendelkező molekula (akceptor) között, dipól-dipól kölcsönhatás révén, sugárzás nélküli energiaátadás formájában jön létre. Az energiatranszfer által új lecsengési út válik lehetővé Q= k f /(k f +k ic +k t ) Q~F Förster típusú energiatranszfer feltételei hν G hν D 1. Dipól-dipól kölcsönhatás 2. Donor-akceptor távolság 2-10nm 3. Megfelelő orientáció 4. Donor emissziós és az akceptor abszorpciós spektrumának átfedése - D + k t ~ 1/R 6 E R - A + hν A Fluoreszcencia intenzitás lecsökken! 8

A donor emissziós és az akceptor abszorpciós spektrumának átfedése Hullámhossz J= átfedési integrál n= közeg törésmutatója R= donor-akceptor távolság κ= orientációs faktor kt konst. J( )n 4 6 kfr κ 2 Hogyan határozható meg a transzfer hatásfok? τ DA : élettartam az akceptor jelenlétében τ D : élettartam az akceptor hiányában F DA : fluoreszcens intenzitás az akceptor jelenlétében F D : fluoreszcens intenzitás az akceptor hiányában Donor Floreszcencia emissziója energia csökken! transzfer Abszorpció Emisszió Donor Energia transzfer Akceptor Akceptor emissziója nő! 9

Energia transzfer hatásfok a donorakceptor távolság függvényében Förster féle kritikus távolság donor-akceptor pároknál E R 6 0 6 R0 R 6 Förster féle kritikus távolság (R 0 ): Az a donor-akceptor távolság aminél a transzfer hatásfok 0.5 10

Energia transzfer típusai Heterotranszfer: különböző fluorofórok között jön létre Homotranszfer: azonos fluorofórok között jön létre, melyeket kis Stokes eltolódás jellemez Távolság mérés (molekuláris mérőszalag) Fehérjék konformációs vizsgálat Alkalmazás Fehérjék interakciója Makromolekulák asszociációs vizsgálata (pl. DNS) Fehérjék interakciója Fehérjék konformációs változása 11

Aktin monomer Aktin filamentum - vég (nettó depolimerizáció) Milyen a nukleotid kötő zsebben található fluorofór hozzáférhetősége? Nukleotid kötőzseb Nukleotid kötőzseb εatp εatp + vég (nettó polimerizáció) Cofilin Profilin 12

F 0 / F Aktinkötő fehérjék hatása az ATP- kötőzseb konformációjára 3,00 2,75 2,50 2,25 2,00 1,75 Ksv profilin = 1.02 M -1 Ksv 1 = 0.28 M -1 Ksv cofilin = 0.09 M -1 1,50 = 20% (bound -ATP) 1,25 1,00 Ksv 2 = 53.6 M -1 (free -ATP) 0,0 0,1 0,2 0,3 0,4 0,5 Akrilamid (M) Profilin jelenlétében a fluorofor hozzáférhetősége nagyobb! Cofilin jelenlétében a fluorofor hozzáférhetősége kisebb! 13