A lézer-szkenning citometria lehetőségei. Laser-scanning cytometer (LSC) Pásztázó citométer. Az áramlási citometria fő korlátai



Hasonló dokumentumok
(

Az áramlási citométer és sejtszorter felépítése és működése, diagnosztikai alkalmazásai

Modern Biofizikai Kutatási Módszerek Kereskedelmi forgalomban kapható készülékek. Áramlási citometria (flow cytometry)

Tóth Mónika Ágnes PTE ÁOK Biofizikai Intézet Kereskedelmi forgalomban kapható készülékek

Áramlási citometria / 4. Immunológiai és Biotechnológiai Intézet PTE KK

Áramlási citometria, sejtszeparációs technikák. Immunológiai és Biotechnológiai Intézet ÁOK, PTE


Az áramlási citométer és sejtszorter felépítése és működése, diagnosztikai alkalmazásai

Az áramlási citometria gyakorlati alkalmazása az ondó rutin analízisben. Hajnal Ágnes, Dr Mikus Endre, Dr Venekeiné Losonczi Olga

Biológiai módszerek alkalmazása környezeti hatások okozta terhelések kimutatására

Antigén ellenanyag kapcsolódás kimutatásán alapuló analitikai módszerek II. Áramlási citofluorimetria Konfokális lézerpásztázó mikroszkópia

Áramlási citometria elve

Használati útmutató a Cell Lab Quanta SC (Beckman Coulter) áramlási citométerhez

Röntgendiffrakció. Grama László május

Az áramlási citometria - fogalmak. Áramlási citometria. TörténeZ há]ér 5/21/12. Az áramlási citometria alapjai. alkalmazhatósága.

Áramlási citométerek klinikai alkalmazása

In Situ Hibridizáció a pathologiai diagnosztikában és ami mögötte van.

Jelutak. Apoptózis. Apoptózis Bevezetés 2. Külső jelút 3. Belső jelút. apoptózis autofágia nekrózis. Sejtmag. Kondenzálódó sejtmag

Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen

6. Fehérjék kimutatása. Biokémiai és sejtszintű vizsgálatok

Rövid ismertető. Modern mikroszkópiai módszerek. A mikroszkóp. A mikroszkóp. Az optikai mikroszkópia áttekintése

Apoptózis. 1. Bevezetés 2. Külső jelút 3. Belső jelút

6. Fehérjék kimutatása. Biokémiai és sejtszintű vizsgálatok

TUMORSEJTEK FENOTÍPUS-VÁLTOZÁSA TUMOR-SZTRÓMA SEJTFÚZIÓ HATÁSÁRA. Dr. Kurgyis Zsuzsanna

A módszerek jelentősége. Gyors-kinetika módszerek. A módszerek közös tulajdonsága. Milyen módszerekről tanulunk?

A patológiai vizsgálatok metodikája. 1. Biopsziástechnikák 2. Speciális vizsgálatok

6. Fehérjék kimutatása. Biokémiai és sejtszintű vizsgálatok

OTKA ZÁRÓJELENTÉS

Lymphoma sejtvonalak és gyerekkori leukémia (ALL) sejtek mikro RNS (mir) profiljának vizsgálata

Részletes szakmai beszámoló Az erbb proteinek asszociációjának kvantitatív jellemzése című OTKA pályázatról (F049025)

Röntgen-gamma spektrometria

Daganat immunterápia molekuláris markereinek tanulmányozása biofizikai módszerekkel. Áramlási és képalkotó citometria

A Földön előforduló sejtek (pro- és eukarioták) közös és eltérő tulajdonságai. A sejtes szerveződés evolúciója.

Mozgékony molekulák vizsgálata modern mikroszkópiával

Jelátvitel az idegrendszerben:

Áramlási citométerek: klinikai és kutatási alkalmazás

Az áramlási citometria elve

Keringő daganatsejtek kimutatása vastagbéldaganatos betegek mintáiból digitális fluoreszcens mikroszkópiával és képalkotó citometriával

BUDAPEST május 4-6. V. Magyar Sejtanalitikai Konferencia Molekuláris medicina: Sejtanalitika Innováció Alkalmazás ÉRTESÍTÔ

Az áramlási citométer és sejtszorter felépítése és működése. Az áramlási citométer diagnosztikai alkalmazásai

Preeclampsia-asszociált extracelluláris vezikulák

A Telomerase-specific Doxorubicin-releasing Molecular Beacon for Cancer Theranostics

-Két fő korlát: - asztrogliák rendkívüli morfológiája -Ca szignálok értelmezési nehézségei

Haematológiai automatizáció: tapasztalataink az új Sysmex XT-2000 automatával az elmúlt 5 hónap során. Nagy Nóra Gróf Esterházy Kórház Laboratórium

Extracelluláris vezikulák

2. Az élet egységei és a mikroszkóp A sejtek vizsgálati módszerei

Kvantitatív immunhisztokémia a patológiában

A herpes simplex vírus és a rubeolavírus autofágiára gyakorolt in vitro hatásának vizsgálata

Kappelmayer János. Malignus hematológiai megbetegedések molekuláris háttere. MOLSZE IX. Nagygyűlése. Bük, 2005 szeptember

Mannich-ketonok antifungális hatásának vizsgálata. és antimikotikum-érzékenység meghatározása. chip-alapú módszerekkel.

A T sejt receptor (TCR) heterodimer

A FISH technika alkalmazása az előnemesítésben

(1) A T sejtek aktiválása (2) Az ön reaktív T sejtek toleranciája. α lánc. β lánc. V α. V β. C β. C α.

GLUKOKORTIKOID-INDUKÁLT APOPTÓZIS VIZSGÁLATA ÉRETLEN ÉS ÉRETT T SEJT ALCSOPORTOKBAN. DOKTORI (PhD) ÉRTEKEZÉS TÉZISEI. Dr.

Debreceni Egyetem Általános Orvostudományi Kar Patológiai Intézet

Az ellenanyagok orvosbiológiai. PhD kurzus 2011/2012 II. félév

Doktori értekezés tézisei

Biomolekuláris rendszerek. vizsgálata. Semmelweis Egyetem. Osváth Szabolcs. A mikroszkópok legfontosabb típusai

TANULÓI KÍSÉRLET (45 perc)

Immunológia alapjai előadás. A humorális immunválasz formái és lefolyása: extrafollikuláris reakció és

Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen

A tumorsejtek által kiválasztott galektin-1 T-sejtekre kifejtett apoptotikus hatásának mechanizmusa

VIII. Magyar Sejtanalitikai Konferencia Fény a kutatásban és a diagnosztikában

OPTIKA. Vozáry Eszter November

Hipotézis STATISZTIKA. Kétmintás hipotézisek. Munkahipotézis (H a ) Tematika. Tudományos hipotézis. 1. Előadás. Hipotézisvizsgálatok

A glukokortikoid hormon indukálta jelátviteli mechanizmusok vizsgálata T-sejt alcsoportokon

Száloptika, endoszkópok

Molekuláris biológiai eljárások alkalmazása a GMO analitikában és az élelmiszerbiztonság területén

A minta feldolgozásának alternatívái malignus lymphomák molekuláris diagnosztikájában

Typotex Kiadó. Tartalomjegyzék

Mikroszerkezeti vizsgálatok

Adatelemzési eljárások az idegrendszer kutatásban Somogyvári Zoltán

Platina bázisú kemoterápia hatása különböző biomarkerek expressziójára tüdőrákokban

VIZSGÁLATA FLOWCYTOMETRIA

IX. Alkalmazott Informatikai Konferencia Kaposvári Egyetem február 25.

Áramlási citometria használata az andrológiában Infertilitási kivizsgálások támogatása

Abszorpciós spektroszkópia

[S] v' [I] [1] Kompetitív gátlás

Az áramlási citometria alkalmazási területei

HLA-B27 pozitivitás vizsgálati lehetőségei

Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen

Szerkezetvizsgálat ANYAGMÉRNÖK ALAPKÉPZÉS (BSc)

1. ábra: Geldanamycin gátolja az ERK-foszforilációt PC12 sejtekben (24 h geldanamycin előkezelés, 10 perc NGF kezelés).

Sejttenyésztési alapismeretek

Sejtkultúra előállítása, steril munka feltételei Immunsejtek izolálása és funkcionális vizsgálata április 15. Kremlitzka Mariann, PhD

Engedélyszám: /2011-EAHUF Analitika követelménymodul szóbeli vizsgafeladatai

Ezzel kapcsolatosan kérdezem, hogy tud-e a jelölt az LCS mikroszkópia/citometria mai rutinszerű alkalmazásáról a diagnosztikus patológiában?

Új, sejthalált befolyásoló tumor-asszociált fehérjék azonosítása. Dr. Szigeti András. PhD tézis. Programvezető: Dr. Balázs Sümegi, egyetemi tanár

mintasepcifikus mikrokapilláris elektroforézis Lab-on-Chip elektroforézis / elektrokinetikus elven DNS, RNS, mirns 12, fehérje 10, sejtes minta 6

Egyéb citológiai vizsgálatok követelménymodul szóbeli vizsgafeladatai

Darvas Zsuzsa László Valéria. Sejtbiológia. Negyedik, átdolgozott kiadás

A klinikai citológia alapjai

Vérsejtszámlálás. Bürker kamra

Algaközösségek ökológiai, morfológiai és genetikai diverzitásának összehasonlítása szentély jellegű és emberi használatnak kitett élőhelykomplexekben

Fény- és fluoreszcens mikroszkópia. A mikroszkóp felépítése Brightfield mikroszkópia

Havancsák Károly Nagyfelbontású kétsugaras pásztázó elektronmikroszkóp az ELTÉ-n: lehetőségek, eddigi eredmények

A patológiai vizsgálatok metodikája. 1. Biopsziás technikák 2. Speciális vizsgálatok

Mérési jegyzőkönyv. Coulter számláló és áramlási citometria. 1. mérés: Semmelweis Egyetem, Elméleti Orvostudományi Központ Biofizika laboratórium

3/11/2015 SZEDIMENTÁCIÓ ELEKTROFORÉZIS. Szedimentáció, elektroforézis. Alkalmazások hematológia - vér frakcionálása

Immunológiai Gyakorlatok II április

Átírás:

Az áramlási citométer bevezetésének fontosabb állomásai A lézer-szkenning citometria lehetőségei Bacsó Zsolt Coulter, 1949 Coulter számláló szabadalmaztatása Crosland-Taylor, 1953 sejtek hidrodinamikai fókuszálása Van Dilla, 1962, 1966 sejtek térfogateloszlásának mérése, DNS mérések: sejtciklus Kamentsky, 1965 sejtek UV abszorbciójának és fényszórásának kétváltozós ábrázolása (dot plot) Fulwyler, 1965 sejtek elválasztása térfogatuk alapján (cell sorting) Az áramlási citometria fő korlátai szövetekből származó sejtszuszpenziók nem megbízhatóan vizsgálhatók sejtszuszpenzió készítése során sejtpopulációk vesznek el, torzítva így a minta valós információ tartalmát nincsenenek jól azonosítható FSC/SSC paraméterek kis számú sejt nem vizsgálható Laser-scanning cytometer (LSC) Pásztázó citométer Kamentsky, 1991

A pásztázó citométer nem összetévesztendő a konfokális lézer-szkenning mikroszkóppal A pásztázó citométer optikai felépítése LSC: sejtpopulációk vizsgálata fluoreszcencia és fényszórás paraméterek alapján (hasonlóan az áramlási citométerhez, de tárgylemezen!) CLSM: egyedi sejtekről nagyfelbontású képek készítése A pásztázó citométer működése objektív lencse lézer nyaláb Mérhető a magból, a teljes sejtből vagy csak a citoplazmából származó fluoreszcencia intenzitás vizsgált terület minta tárgylemezen, motorizált tárgyasztalon

Pásztázó citometriával vizsgálható paraméterek elsődleges paraméterek előre fényszórás (oldal szórás nincsen) integrált fluoreszcencia intenzitás (teljes és/vagy perifériás) legfényesebb pixel intenzitása (MaxPixel) helykoordináta (relokalizáció) idő (kinetika) származtatott paraméterek terület, kerület, pixel-intenzitás mintázat aritmetikai számolások paraméterek között FISH pontok száma Az áramlási citometria (FC) és a pásztázó citometria (LSC) összehasonlítása I. Sejtek festése és mérése Sejtparaméterekhez morfológia rendelése Festékek i.c.eloszlásának vizsgálata (mag-citoplazma) FC Szuszpenzióban Sejtek elválasztása után Praktikusan nem LSC Tárgylemezen Mérés közben lehetséges Mérés közben lehetséges Az áramlási citometria (FC) és a pásztázó citometria (LSC) összehasonlítása II. Az áramlási citometria (FC) és a pásztázó citometria (LSC) összehasonlítása III. Ugyanazon sejten szekvenciális mérés (kinetika) Ugyanazon sejten szekvenciális mérés más próbákkal Szövettani metszet, letapadó sejtek, kölcsönható sejtek vizsgálata, FISH FC LSC FC LSC Fényszórás analízis FSC, SSC FSC Sejtek/kromoszómák szortírozása Sebesség (sejt/sec) kb. 10000-ig kb. 100-ig Mérés érzékenysége Nagyobb <1000 MESF

A pásztázó citometria fontosabb alkalmazásai Immunfenotipizálás Kis mennyiségű sejtes minta, pl. vékonytű biopszia esetén Ritka események vizsgálata Mikrometasztatizáló sejtek azonosítása keringésben, csontvelőben Sejtciklus analízis Mitotikus sejtek azonosítása DNS-MaxPixel és DNS mennyiség alapján Apoptózis vizsgálata Morfológia és DNS-MaxPixel mérés alapján, DNS-comet, DNS-halo, TUNEL Enzimkinetika, gyógyszerfelvétel, ligandkötődés vizsgálata Intracelluláris fehérjék transzlokációjának vizsgálata (p53, NF-kB, Bax) FISH analízis Gyors, félautomatikus Supravitális funkcionális sejtparaméterek korrelálása morfológiai paraméterekkel Élő sejtek vizsgálata után ugyanazok fixálás utáni mérése Szövettani metszetek objektív kvantitatív vizsgálata DNS-tartalom (ploiditás), Ki-67 expresszió Bax transzlokációja a citoszolból a mitokondriumba Del Bino et al. Cell Proliferation 32:25-37, 1999 Relokációs analízis a lokális caspase aktivitás kimutatására Enzimkinetika vizsgálata LSC-vel Telford et al. Cytometry 47:81 88, 2002 Bedner et al. Cytometry 33:1 9, 1998

Anti-CD95 kezelt Jurkat sejtek morfológiája, annexin V festődése és korrelált komet analízise 3 4 5 1 2 6 7 8 9 10 11 A B C Jelegzetes DNS mintázatok az annexin V pozitív apoptotizáló Jurkat sejtekben komet és DNS-halo esszével detektálva. Bacso et al. Cancer Research 60:4623 4628, 2000 D E F Apoptotikus DNS degradáció kvantitatív becslése pásztázó citometria és DNS-halo módszerek együttes alkalmazásával Apoptotikus DNS-károsodás becslése DNS-halo mintázatnak pásztázó citometriával történő kiértékelése alapján

Apoptotikus DNS fragmentáció egyedi Jurkat sejteken anti-cd95 kezelés után 0 (A, D), 2 (B, E) és 4 (C, F) órával. AV kötődés és DNS fragmentáció gátlása caspase-8, -9 or -3 inhibitorokkal (IETD-fmk, LEHD-fmk, DEVD-fmk). LSC-vel kapcsolatos publikációk számának változása 90 80 70 60 50 40 30 20 10 0 83 43 11 1 1991 1992-1994 1995-1998 1999-2001