Az igazságügyi genetikai vizsgálatok elméleti és gyakorlati háttere. Hülberné Dobos Ágota Bűnügyi Szakértői és Kutatóintézet november 20.
|
|
- Benjámin Király
- 9 évvel ezelőtt
- Látták:
Átírás
1 Az igazságügyi genetikai vizsgálatok elméleti és gyakorlati háttere Hülberné Dobos Ágota Bűnügyi Szakértői és Kutatóintézet november 20.
2 A biológiai minták típusai Folyékony vér és vérfoltok Ondó és hüvelyváladék Nyál Köröm Csont és fog Vizelet Testnedvek Hajhagymával rendelkező hajszál Egyéb szövetek és szervek
3 Humán személyazonosítási vizsgálatok Bűnügyekben gyanúsított és helyszíni minta lehetséges kapcsolatának vizsgálata Apasági vizsgálatok -- biol. apaság megállapítása Eltűnt személyek maradványainak vizsgálata Tömegszerencsétlenségek -- kegyeleti célú vizsgálatok Történelmi jelentőségű vizsgálatok DNS-profil nyilvántartások
4 Fő kérdések 1. Az élő anyag mely összetevője bír információtartalommal a személyazonosítás szempontjából? 2. Ez az összetevő megváltozik-e az idő folyamán, ha igen milyen mértékben? 3. Ha összehasonlításra kerül sor, akkor a megállapított típusok egyezése milyen mértékben bizonyítja a biológiai nyom adott személytől való származását?
5 BIOLÓGIAI MINTÁK VIZSGÁLATA TÖRTÉNETI ÁTTEKINTÉS Kémiai módszerek Szerológiai módszerek (vércsoport meghatározás) Elektroforetikus módszerek (fehérje-polimorfizmus) Molekuláris biológiai módszerek (DNS-polimorfizmus) RFLP első humán DNS marker felfedezése Alec Jeffreys: első igazságügyi célú DNS vizsgálat, PCR technika feltalálása (Mullis) FBI: DNS azonosítás bűnügyekben első humán STR marker leírása 1992-első magyarországi igazságügyi DNS laboratórium: BSzKI 2000-Új DNS labor: mitokondriális DNS vizsgálat: BSZKI
6 Igazságügyi szerológia Biológiai anyagmaradványokból (vér, vérfolt, haj, ondó stb.) történő személyazonosítás Az ABO- vércsoport-rendszer, az Rh fenotípus rendszerbe való besorolás ABO: A 42% B 18% O 31% AB 8.8% Fehérjékben, enzimekben, immonológiai markerekben rejlő polimorfizmust (sokféleséget) használja fel; pl: Alacsony polimorfizmus Emberi vérsavók használata; megszűnése Egyéb készítmények megbízhatatlansága -Fehérjeszerkezet érzékeny a környezeti hatásra
7 PCR technika előnyei az igazságügyi személyazonosításban Szubanalitikus mennyiségű DNS-t az analitikai vizsg. érzékenységi szintje fölé emeli nagyon kevés DNS-t tartalmazó mintákból is: low copy number DNA Bomlott állapotú DNS-t tartalmazó mintákból is Viszonylag gyorsan és egyszerűen kivitelezhető Jól azonosítható (diszkrét) allélek: kevert minták analízise és statisztikai interpretáció differenciált DNS extrakció
8 A DNS vizsgálat korlátai, befolyásoló tényezők A biztosított minta DNS tartalma (mennyiség és minőség: detektálási küszöb) A biztosított minta degradálódása, bomlási folyamatok - enzimatikus (endogén és exogén) - ultraibolya sugárzás - természetes hordozók (pl. cser- és huminsavak) Kontamináció (detektálási küszöb csökkenése!!!) Feltételrendszer (anyag, eszköz, személy, költség)
9 DNS az emberi sejtben Kromoszóma Sejtmag Kettős szálú DNS-molekula PCR célterület Egyedi nukleotidok
10 Definíciók Nukleotid: DNS alegysége (dezoxiriboz, foszforsav, N-tartalmú bázisok: adenin/a, Timin/T, Guanin/G,Citozin/C) A DNS által kódolt információ a nukleotidok sorrendjében rejlik, ez a DNS-szekvencia Genom: szervezet teljes örökítő információját jelenti, amely a DNS-ben van kódolva Gének: olyan nukleinsav-szakaszok a sejtek magjainak kromoszómáiban, melyek a szervezet működését és növekedését befolyásoló fehérjék szabályozásához és előállításához szükséges információkat tartalmazzák Allél: a DNS-lánc egy kitüntetett helye Polimorfizmus: A DNS-lánc egy kitüntetett helyén mutatkozó egyedi változat Lókusz vagy marker: A polimorfizmust mutató DNS-szakasz DNS- profil: A személy/egyed vagy biológiai minta örökítő anyagának polimorf genetikai lokuszain (markerein) megállapított allélok összessége (DNS-mintázat, genotípus, haplotípus)
11 Mit tudunk a DNS-ről? Dezoxiribonukleinsav
12 Hossz-polimorfizmus a kromoszómákon A lókusz Allél 1 Allél 2 Homológ kromoszómapár 4 5 Allél 1 Allél 2 Homológ kromoszómap 3 B lókusz Figure 2.6, J.M. Butler (2005) Forensic DNA Typing, 2 nd Edition 2005 Elsevier Academic Press 6
13 de/ A humán genom 23 pár kromoszóma + mtdns Sejtmagban Autoszómák 2 példány sejtenkén t Mitokondriumokba n (több példány sejtenként) mtdns 16,569 bp X Y sejtmagi DNS 3.2 milliárd bp Ivari kromoszómá k Mitokondriális DNS Sejtenként több 100 molekula! Figure 2.3, J.M. Butler (2005) Forensic DNA Typing, 2 nd Edition 2005 Elsevier Academic Press
14 Genetikai állományunk öröklődése Mitokondriális DNS: kizárólag anyai öröklődés!
15 DNS-profilok öröklődési mintázata
16 Nyomkutatás és mintabiztosítás bűnügyekben Sokféle bűnjelminta: sértett bcs. idején vagy után viselt ruházata, gyanúsított bcs. idején viselt ruházata, ágynemű, szőnyeg, gépjármű, textilhuzat, tisztálkodás céljára használt anyagok (pl. törlőkendő, zsebkendő), egészségügyi ill. tisztasági betét, tampon, óvszer, törletminták (pl. testüregek, testfelszín, egyéb tárgyak), natív ill. festett kenetek, hüvelymosó folyadék, körömnyiradék, szőrképlet, hám- illetve izzadmány, vérszennyeződés, izom, csont, abortum, stb. Nyomkutatás: szabad szemmel természetes fényben, alternatív fényforrás segítségével sötét helyiségben (fluoreszcencia), kémiai elővizsgálat (pl. savanyú foszfatáz) Mintabiztosítás: minta típusának legmegfelelőbb hordozó, lehető legtöbb információ kinyerésére való törekvés
17 Mintabiztosítási megoldások Stb.
18 Anti-kontaminációs útmutatók I. Extrém elővigyázatosság (szájmaszk, gumikesztyű) Munkafelület rendszeres tisztítása (Hypo, Microsol) Steril (ha lehetséges) egyszerhasználatos eszközök Egyes bűnjelek között kesztyűcsere Használd minimálisan használd ki legjobban! Egy időben egy tárgy és egy minta Eszköz a mintához és nem fordítva Mintákat, tárgyakat más személy ne érintse!
19 Anti-kontaminációs útmutatók II. Már biztosított mintát nem bolygatjuk Sértetti és gyanúsítotti minták, bűnjelek szétválasztása Csomagolás és címkézés rögtön a biztosítás után Ne csomagoljunk egybe több mintát, bűnjelet Megfelelő méretű bűnjelzsák, szélein leragasztva Mintatárolót ne használjuk újra Ne együnk, igyunk, dohányozzunk közben Mintabiztosító személyek DNS mintái
20 Nukleáris DNS vizsgálat elvégzésére alkalmas biológiai anyagok Vér és vérnyomok Ondó, ondófolt, gumióvszer tartalom Hüvelyváladék, hüvelykenet Nyál, nyálfolt, cigarettavég Orrváladék Csontszövet, fogak, egyéb szövet Hajszál gyökérrel
21 Vizsgálati stratégia bűnügyekben Elővizsgálatok: Bűnjelszemle alkalmával Laboratóriumi megerősítő vizsgálatok: vér (FOB-teszt), nyál (amiláz), ondó (PSA-teszt), szőrképlet, hámszövet (fénymikroszkóp), faji eredet meghatározása nem emberi szennyeződések esetén DNS-kinyerés: a hordozó anyagának és a minta szöveti típusának figyelembe vételével kiválasztott egyszerű vagy frakcionált preparálási eljárás (pl. kevert szennyeződés spermium frakció + laphám frakció) Alkalmazása Koncentráció meghatározás: valamennyi minta esetében kötelező a szennyeződés lehetőség szerinti minél pontosabb interpretálása érdekében STR vizsgálatok: számításba vehető hipotézisek és minta típusa alapján meghatározott vizsgálati stratégia Eredmények értékelése Szakértői vélemény
22 Vérelőpróbák I. Mikor és melyiket használjuk? előpróbák (prezumptív, nem specifikus) vérspecifikus tesztek pozitív és negatív kontrollok Vérelőpróbák: a hemoglobin hem csoportjának katalitikus peroxidáz aktivitásán alapszanak (pszeudo-peroxidáz) H 2 O 2 2 (OH - ) Érzékenység: 1 : (min. mennyiség is elég!) Aspecifikus reakciók: egyéb növényi és állati hem növényi peroxidázok (hagyma, káposzta) rozsda?, stb.
23 Vérelőpróbák Benzidin reakció pillanatszerű sötétkék színreakció preparálás: rövid- és hosszútávra (benzidin + ecetsav + etanol + 3% H 2 O 2 ) érzékenység: 1 : karcinogén o-tolidin 3,5,3,5 -tetrametilbenzidin
24 Vérelőpróbák Leucomalachit zöld reakció a leuko komponens színtelen, a malachit sötétzöld preparálás: hagyományos és Na 2 BO 4 +ecetsav+up érzékenység: 1 : nem karcinogén
25 Vérelőpróbák Fenolftalein reakció színtelen redukált forma Zn jelenlétében élénk rózsaszín preparálás: fenolftalein + NaOH + Zn + UP + H 2 O 2 érzékenység: 1 : ??? nem karcinogén egyéb peroxidázok kevésbé befolyásolják???
26 Vérelőpróbák Luminol teszt minimális mennyiségű, nem látható vérszennyeződések chemilumineszcens reakció: vér esetén kékes-fehér fény preparálás: luminol + Na 2 CO 3 + H 2 O 2 v. Na 2 BO 4 utólagos DNS vizsgálatot nem befolyásolja érzékenység: 1 : idősebb, degradált vérnyomok szenzitivitása fals pozitív reakció Cu és Zn vegyületek jelenlétében permanens video dokumentáció Egyéb tesztek: tesztcsíkok (Helostix, Combi-teszt)
27 Előnyök: Vérelőpróbák II. extrém kis mennyiségű vér kimutatására is alkalmasak könnyen kivitelezhetők akár a helyszínen is gyors eredmény hozzávaló reagensek relatíve olcsók negatív eredmény kizárásként értékelhető (kivételek!!!) Hátrányok: nem specifikusak a vérre (Cu, Zn és nehézfémsók, rozsda, növényi peroxidázok, jód, stb.) megerőstíő vizsgálatokat igényel humán és állati eredetű vér között nem tesz különbséget
28 NYÁLSZENNYEZŐDÉS KIMUTATÁSA
29 Nyálszennyeződések kimutatása Nyálhordozó anyagok, nyálminták biztosítása: cigarettavég ruházat, ágynemű (kevert szennyeződések) bőrfelszín, poharak, üvegek, stb. (double-swab) A nyál -amiláz (ptyalin) kimutatása: a nyál szárazanyagtartalmának 60%-a amiláz mucin egyéb biol. anyagban is (vérszérum, tej, ondó, hüvelykenet, verejték, széklet, de igen kis menny.!!!) keményítő és glikogén: D-glükóz molekulák (1-4) kötésével amilóz hélix alakul ki. A Lugol-oldat I 2 molekulái a hélixbe bediffundálva sötétkék színűek. Az amiláz enzim az (1-4) kötéseket bontja. A hélix szerkezet felbomlik dextrin -amiláz + keményítő + Lugol-oldat = sárga kék pozitív és negatív kontroll! higítási sorral spektrofotometriásan mérhető
30 Ondószennyeződések I. Hordozóanyagok, mintabiztosítás: tárgylemezen natív, festett hüvelykenet vattatamponra biztosított hüvelyminta hüvelymosó folyadék ágyneműn, ruházati anyagon ondófolt gumióvszer Kevert biológiai minta: különböző eredetű sejtek abszolút és relatív mennyiségének eltérése Ondógyanús szennyeződésből közvetlen elővizsgálatot nem végzünk!!! Kivétel: UV-fény vizsgálat acriflavin: kék-fehér fluoreszcencia
31 Ondószennyeződések II. Ondóalkotók: foszforil-kolin, savanyú-foszfatáz, citromsav, fruktóz, spermium (kivéve sterilitás esetén) Savanyú-foszfatáz (ACP) vizsgálat: nem specifikus! az enzim nagyságrendekkel nagyobb koncentrációban van jelen az ondóban (prosztata eredetű), mint egyéb testváladékban (pl. hüvelyváladék) érzékenység 1 : 1000 alifás és aromás ortofoszforsav-észtereket hidrolizálja gyengén savanyú (ph=5) közegben szubsztrát: naftil-acetát; reagens: diazóniumsók; vízben oldhatatlan vörös-lila azofesték képződik pozitív és negatív kontroll Phosphatesmo KM tesztcsík (DNS vizsgálathoz is)
32 Ondószennyeződések III. Prosztata specifikus antigén (PSA, p30 fehérje): a prosztata epithelium sejtekben termelődő glikoproteid prosztatába választódik ki ondó folyóssá tétele ondóra specifikus ( ng PSA/ml) egyéb szövetekben nem választódik ki (kivétel: prosztata daganatban szenvedő férfiak vérszéruma) azoospermiás ondó (férfiak 1-9 %-a) kimutatása
33 Ondószennyeződések III. folyt. PSA kimutatása ma: immunkromatográfiás membránteszt: adszorbens, migrációs és teszt membránterülettel, mobilis monoklonális anti-humán PSA antitestfesték konjugátum, immobilizált poliklonális anti-humán PSA antitestek, immobilizált anti-ig antitestek érzékenység: 4 ng PSA/ml
34 Ondószennyeződés biztosítása Hordozó: Ruházat, bőr, ágynemű stb. Észlelés: Vizuális észlelés sárgásfehér szinű Alternativ: Bűnügyi fényforrás, Polilight lámpa Vérfoltok: 415nm elnyelési max. Ondófolt: széles tartoményban gerjeszthető, fluoreszkál.
35 SPERMIUM MIKROSZKÓPOS VIZSGÁLATA Spermium sejt
36 SPERMIUM MIKROSZKÓPOS VIZSGÁLATA Megerősitő teszt Karácsanyfa festés (sperm sejt) A festett preparátum megjelenése: Spermasejt: Fej eleje gyenge rózsaszíntől átlátszóig Fej hátsó része sötétvörös Középrész zöld Ostor zöld Epitheliális sejt: Mag rózsaszín Citoplazma világos kékeszöldtől zöldig
37 Humánspecifikus vérpróbák FOBteszt Egylépéses immunkromatográfiás vizsgálat Humán hemoglobinra specifikus (HbAo, HbA2, HbF, HbS) jelölt monoklonális anti-humán Hb antitest konjugátum Immobilizált poliklonális anti-humán Hb mint elfogó Immobilizált anti-ig antitest mint kontroll Nincs keresztreakció állati hemoglobinnal és növényi peroxidázokkal (főemlősök!) Nagyfokú érzékenység 1 : = 1 l vér 1 l vízben 2000 g/ml koncentrációig nincs Hook-effekt Többéves vérfoltok esetén hosszabb extrakció idő!
38 Fajspecifitási vizsgálatok Hagyományos szerológiai módszerek: antigénantitest prec. gyűrű próba Ouchterlony géldiffúzió elektroforetikus technikák (immunelektroforézis, counter, rocket elektroforézis) Immunkromatográfiás membrán tesztcsíkok DNS-alapú fajmeghatározás: Fajspecifikus hibridizációs próbák: QuantiBlot mtdns szekvencia alapján (cytb gén) PCR-RFLP DNS-chip
39 DNS tisztítás - szerves extr. és ultraszűrés
40 Amit a DNS-profilról tudni kell 1. Minden személy genomja egyedi (egypetéjű ikreket kivéve) és a szülőktől örököljük. 2. Genetikai variációkat mutatunk ki annak érdekében, hogy az egyedeket megkülönböztessük egymástól (statisztikai számítások minden esetben!). 3. Jelenleg alkalmazott standard DNS tesztek nem géneket vizsgálnak egyáltalán nem vagy csak kevés információt adnak a vizsgált személy rasszbeli, etnikai hovatartozásáról, betegségre való hajlamról, vagy egyéb külső tulajdonságáról (szemszín, magasság, hajszín, stb.). 4. DNS tipizálásnak hatékonynak és reprodukálhatónak kell lennie (bíróság előtt is ellenőrizhető legyen!).
41 A humán nukleáris genom Kódoló DNS (a humán nukleáris genom ~ 25 %) Protein kódoló (gén) szabályozó szekvenciák Gén: (< 30 ezer db) - monomorf - polimorf (vér- és szérumcsoportok, enzim polimorfizmusok) szekvenciapolimorf: HLA- DQ, GYPA, GC, LDLR, HBGG, Repetitív DNS (a humán nukleáris genom ~60 %) szétszórt elemek tandem ism. elemek (a genom ~45 %) (a genom ~15 %) - SINEs 500 bp - Szatellit DNS (Alu-repeat, 13 %) (Alphoid repeatek) (~ kópia) (171 bp centromer) - LINEs 500 bp - VNTRs (Kpn-repeat, 21 %) (miniszatellitek) (~ kópia) (D1S80, ApoB) - STRs (mikroszatellitek) (TH01, VWA, stb.)
42 A DNS polimorfizmus főbb típusai (A) Szekvencia polimorfizmus AGACTAGACATT AGATTAGGCATT (B) Hossz-polimorfizmus -----(AATG)(AATG)(AATG) (AATG)(AATG)
43 Mit tudunk a DNS-ről? Örökítő anyag Kódoló szakaszok Nem kódoló, szemét DNS Pl.
44 Igazságügyi genetikai aspektusból validált DNS markerek DNS MARKER Szekvenciapolimorfizmus HLA-DQA1 LDLR GYPA HBGG D7S8 GC VNTR Apo B D1S80 Autoszóma Nemi kromoszóma mt DNS Hosszpolimorfizmus Amelogenin HPRTB DYS STRs STR HV-I HV-II HV-III D3S1358, TH01, D21S11, D18S51, D5S818, D13S317, D7S820, D16S539, CSF1PO, VWA, D8S1179, TPOX, FGA, D2S1338, D19S433, Penta E, Penta D PowerPlex16 és Identifiler multiplex PCR rendszerek
45 Eltérő öröklődési mintázat Leszármazási markerek Autoszómás marker (az összes felmenőnktől örököljük részletekben) Y-kromoszóma (csak a fiú gyermekek öröklik apjuktól) Mitokondriális DNS (minden gyermek az édesanyjától örökli) Figure 9.1, J.M. Butler (2005) Forensic DNA Typing, 2 nd Edition 2005 Elsevier Academic Press
46 Biológiai minták DNS tartalma* Folyékony vér ng/ml Vérfolt ng/cm 2 Ondó ng/ml Hüvelykenet ng/kenet Gyökeres hajszál - kitépett ng/hajszál - kihullott 1-10 ng/hajszál Folyékony nyál ng/ml - szájtörlet ng/törlet Vizelet 1-20 ng/ml Csont 1-10 ng/mg * A vizsgálatok össz. DNS igénye a minta állapotától függően: 0,3-1 ng
47 DNS vizsgálat lépésről lépésre Helyszíni v. összehasonlító DNS minta DNS tisztítás Biológia DNS kvantálás Több STR marker PCR felsokszorozása Felsokszorozott DNS elválasztása és detektálása (STR Allélek) Technológia Minta genotipizálás Mintákból nyert genotípusok összehasonlítása Genetika Egyezés esetén a DNS profil összevetése populációs adatbázissal Szakértői vélemény statisztikai interpretációval
48 Az izolálás fő lépései: -sejtlízis, sejtfeltárás -endogén nukleázok inaktiválása -nukleinsav elválasztása a sejttörmeléktől, fehérjéktől és az egyéb szennyezőktől -nukleinsav tisztítása
49 DNS izolálás csoportosítása: A minta típusa: Az extrakció típusa: Folyékony vér Vérfolt, cigaretta Kevert váladékok Körömminta Csont Egyéb szövetek speciális Szerves (fenol-kloroformizoamil alkohol) Chelex 100 (kelátképző gyanta) Anorganikus (pl.alkálihidroxidok; NaCl) Egyéb (Kit, FTA-papír)
50 DNS tisztítás különböző minta típusokból Szerves extrakció vérfolt SDS, DTT, EDTA és proteináz K Inkubálás (56 o C, 12h) Centrifugálá s VORTEX DNS kvantálás Phenol, chloroform, isoamyl alcohol Centrifugálá Vizes fázis átvitele új csőbe s PCR reakció TE buffer DNS koncentrálás (Centricon/Microcon-100) Centrifugálá s vérfolt CHELEX Víz Inkubálás (szobahő) Centrifugálá s Felülúszó eltávolítása 5% Chelex Inkubálás (56 o C) Inkubálás (100 o C) DNS kvantálás PCR reakció Centrifugálá s FTA papír PUNCH Mosás extrakciós pufferben PCR reakció Vércsepp az FTA-papíron beszárítva Felülúszó eltávolítása PCR reagensek Nincs DNS kvantálás: tipikusan egyforma mintákon (pl. adatbázis) végezhető Figure 3.1, J.M. Butler (2005) Forensic DNA Typing, 2 nd Edition 2005 Elsevier Academic Press
51 Kevert biológiai nyom, váladék biztosítása Kevert biológiai nyomok DNS tisztítása SDS, EDTA és proteináz K (sejt lízis buffer) Inkubálás 37 o C-on Elkövető spermium sejtjei az áldozat hámsejtjeivel keveredve SDS, EDTA és proteináz K + DTT Centrifugálá s DTT: a spermiu m sejtfal lebontás a spermiu m üledék Felülúszó Férfi Frakció spermiu m üledék Női Frakció Figure 3.2, J.M. Butler (2005) Forensic DNA Typing, 2 nd Edition 2005 Elsevier Academic Press
52 DNS kvantálás - Célok Bűnjelminta tartalmaz-e DNS-t? (van/nincs) Bűnjelminta tartalmaz-e humán/állati/stb. DNS-t? (van/nincs) DNS állagának, minőségének meghatározása (tisztaság) Koncentráció meghatározása további reakciók optimális kivitelezése érdekében PCR-termék koncentrációjának megállapítása EtBr SYBR Gold
53 Célok Bűnjelminta tartalmaz-e DNS-t? (van/nincs) Bűnjelminta tartalmaz-e humán/állati/stb. DNS-t? (van/nincs) Bűnjelminta tartalmaz-e bizonyos (pl. mitokondriális) DNS-t? (van/nincs) DNS állagának meghatározása Koncentráció meghatározása az optimális PCR érdekében Koncentráció meghatározása egyéb reakciók (pl. szekvenálás) optimális kivitelezése érdekében Egyszálú DNS (ssdna) pl. primer cc. meghatározása PCR-termék koncentrációjának megállapítása
54 Agaróz gélelektroforézis ng/ l ng/ l EtBr SYBR Gold
55 Szükséges? Referencia minták (pl. vér, vérfolt, szájnyálka-hártya-törlet) standardizált feldolgozása esetén nem feltétlenül szükséges osztrák nemzeti bűnügyi DNS-nyilvántartás Bizonyos esetekben nincs is mód rá: minimális mennyiségű DNS-extraktum DNS-tisztítás FTA kártyáról
56 Technikai feltételek... D8S1179 D21S11 D7S820 CSF1PO D3S1358 TH01 D13S317 D16S539 D2S1338 D19S433 VWA TPOX D18S51 Amel D5S818 FGA
57 PCR definíciója: in vitro folyamat DNS egy tetszőleges szakaszáról milliómilliárd másolatot készít. ciklikus enzimatikus reakció ismételt módon másolja a DNS-t adott ciklus termékei a következő ciklusok templátjaiként szolgálnak szub-analitikai mennyiségű DNS mennyiségét a vizsgálati küszöbszint fölé emeli
58 A Polimeráz láncreakció Kiinduló DNS templát Forward primer 5 3 Szálak szétválása (denaturálás) Primerek tapadása Reverse primer Másolás (primerkiterjesztés) Ciklusok ismétlése, Exponenciális DNS másolás Figure 4.2, J.M. Butler (2005) Forensic DNA Typing, 2 nd Edition 2005 Elsevier Academic Press
59 Hőmérséklet A Polimeráz láncreakció 94 o C 94 o C 94 o C 94 o C 72 o C 72 o C 72 o C 60 o C 60 o C Egy Ciklus 60 o C Az első ciklusban a DNS denaturálás ~10 percre beállítva AmpliTaq Gold DNS-polimeráz hot-start PCR-hez Idő Általában ciklus a PCR típusától függően Figure 4.1, J.M. Butler (2005) Forensic DNA Typing, 2 nd Edition 2005 Elsevier Academic Press
60 Multiplex - PCR (A) Három lokusz szimultán amplifikálása egy reakcióban Locus A Locus B Locus C (B) PCR termékek elválasztása fragmens méret alapján A B C small large Figure 4.3, J.M. Butler (2005) Forensic DNA Typing, 2 nd Edition 2005 Elsevier Academic Press
61 Multiplex PCR előnyei 10 vagy több STR lokusz egyidejű felsokszorozása kereskedelemben beszerezhető, validált STR kitek A multiplex PCR előnyei: megnövelt információnyerés egységnyi idő alatt csökkent mennyiségű labormunka csökkent mintaigény
62 Mitokondriális DNS vizsgálat mintatípusok Bizonyíték minta Hajszálak Csontok Fogak Vizelet Ürülék Hányadék Low Copy Number DNA Ha az STR vizsgálat nem járt eredménnyel!
63 A humán mitokondriális DNS ND5 ND4 ND4L HV1 Kontroll Régió (D-loop) cyt b ND6 O H 1/16569 HV S rrns bp O L 16S rrns ND1 ND2 Sejten belüli nagy kópiaszám (~1000) Maternális öröklésmenet: nincs rekombináció! Nagy mutációs ráta: DNA repair? Kódoló Régió: 37 gén Hipervariábilis szakaszok (HV1, HV2) Cambridge referencia szekvencia ND3 COIII ATP6 ATP8 COII COI Szekvencia adatbázisok: EMPOP
64 Mitokondriális DNS: Tulajdonságok Néhány sejt is elegendő a vizsgálathoz, mivel a sejt citoplazma akár 1000 példányban is tartalmazhat mtdns-t Kis mennyiségű vagy erősen degradálódott mintákból is kivonható (pl. csont, fog, hajszál) és PCR-rel felsokszorozható. Az amplifikált termékből szekvenálással határozzuk meg a mtdns típust Testvérek és az összes anyai ági leszármazott ugyanazzal a mtdns szekvenciával rendelkezik mert a mtdns kizárólag anyai ágon öröklődik mtdns szekvenciákból nyert információ segíthet eltűnt személyek azonosításában és bizonyos esetekben kizárhat gyanús személyeket
65 Élelmiszer azonosítás
66 Y-kromoszómás polimorfizmusok Az autoszómás STR markerek nagyobb megkülönböztető erővel (PD), és azonosító hatékonysággal rendelkeznek, ezért alkalmazásukat előnybe kell részesíteni amikor csak lehetséges. Az Y-kromoszóma STR markerek elsősorban extrém arányú nő és férfi eredetű kevert biológiai nyomok férfi komponensének azonosítására alkalmazható (pl. ha differenciált lízis nem alkalmazható, mint köröm-kaparékok esetében).
67 Az Y-kromoszóma tulajdonságai PAR1 X From David C. Page Y PAR2 2%-a a teljes humán genomnak (60 Mbp) A PAR régiók homológiát mutatnak az X- kromoszóma azonos régióival 95% nem homológ az X- kromoszómával (MSY)
68 Az Y-kromoszómás vizsgálatok előnye Nemi erőszakos ügyben előforduló DNS-profil:
69 Igazságügyi alkalmazásra hitelesített PCR-alapú DNS markerek Autoszóma Ivari kromoszóma mtdns Hossz-polimorf AMPFLP ApoB D1S80 STR LPL F13B FES/FPS F13A01 TH01 TPOX CSF1PO D3S1358 vwa FGA D8S1179 D21S11 D18S51 D5S818 D13S317 D7S820 D16S539 Szekvencia-polimorf HLA-DQA1 LDLR GYPA HBGG D7S8 GC Amelogenin X-Y spec. alfoid HPRTB DYS19 DYS385 DYS389 I-II DYS390 DYS391 DYS392 DYS393 HV I HV II
70 A vizsgált lokuszok jellemzői Lokusz Lokáció Repeat szerkezet TH01 11p15.5 (AATG) n TPOX 2p23-2pter (AATG) n CSF1PO 5q (AGAT) n D3S1358 3p TCTA (TCTG) 1-3 (TCTA) n vwa 12p12-pter TCTA (TCTG) 3-4 (TCTA) n FGA 4q28 (TTTC) 3 TTTT TTCT (CTTT) n CTCC (TTCC) n D8S (TCTR) n D21S11 21q11-q21 (TCTA) n (TCTG) n [(TCTA) 3 TA (TCTA) 3 TCA (TCTA) 2 TCCA TA] (TCTA) n D18S51 18q21.3 (AGAA) n D5S818 5q21-31 (AGAT) n D13S317 13q22-31 (GATA) n D7S820 7q11.23-q21 (GATA) n
71 Allélgyakorisági adatbázis D13S317 A 11,12 genotípus 54-szer fordult elő 302 személyben (604 vizsgált kromoszóma) Table 20.2, J.M. Butler (2005) Forensic DNA Typing, 2 nd Edition 2005 Elsevier Academic Press nyomán
72 Multiplex STR-vizsgálat 3 lokuszos elektroferogramja 1: allél-létra 2, 3, 5: három személy DNSprofilja 4: helyszíni nyom (cigarettacsikk) DNS-profilja D3S1358 vwa FGA 3: A személy 16/17 14/16 22/23 4: Cigarettacsikk 15/18 14/17 23/25 5: B személy 15/18 14/17 23/25 Különböző eredet = Kategorikus kizárás Azonos eredet? = Származás? Véletlen egyezés valószínűsége?
73 A DNS vizsgálat három lehetséges kimenetele Egyezés Az összevetett STR profilok csúcsai ugyanazt a genotípust mutatják és a profilok között nincsen megmagyarázhatatlan eltérés. A szakértői véleményben az egyezés fokát statisztikai értékeléssel, valószínűsítő véleményadással is alá kell támasztani. Kizárás (nincs egyezés) A mintákból kimutatott DNS-profilok összehasonlítása olyan genotípusbeli különbözőséget mutat, ami csak a minták különböző eredetével lehet megmagyarázni. Inkonkluzív Az adatok kiértékelése során nem állapítható meg, hogy a profilok megegyeznek-e egymással (pl. ha két szakértő ellentétes véleményre jut egy profil kapcsán és nincs egyéb információ bármelyik következtetés alátámasztására).
74 Nemzetközi DNS minőségi kontroll vizsgálatok # 1.1 GEDNAP (1994 -)
75 Populációs adatbázisok Mekkora a DNS-profil előfordulási gyakorisága a lehetséges bűnelkövetők populációjában? Mintavétel a népességből Kik a lehetséges bűnelkövetők? Az adott ügyben érintett lehetséges bűnelkövetők reprezentatív és releváns populációját (ún. random minta) a gyakorlatban lehetetlen pontosan definiálni és az összes lehetséges tettes személy DNS-profilját megállapítani Nincs is rá szükség. Gondosan kiválasztott ún. komfort (convenience) anonim minták (populációs adatbázisok) statisztikailag megfelelőek (N 100): vérbank minták kriminalisztikai / apasági tesztlaboratóriumokban vizsgált minták laboratóriumi személyzet földrajzi, néprajzi, antropológiai, etnikai alapon gyűjtött minták
76 CODIS indexek rendszere Gyanúsított Elítélt Helyszíni minta
77 A DNS-profil nyilvántartás technikai háttere A személyi- és bűnügyi adatok kezelése a Közigazgatási Elektronikus Közszolgáltatások Központi Hivatala (KEKKH) bűnügyi nyilvántartó rendszerében, a DNS-profil adatok jogszabályban előírt elkülönült kezelése pedig a Bűnügyi Szakértői és Kutatóintézet (BSZKI) Hemogenetikai Osztály informatikai rendszerében történik A DNS-profilokat nyilvántartó informatikai rendszer alapját az FBI által fejlesztett és ezidáig 34 ország 236 laboratóriumában telepített CODIS (Combined DNA Indexing System) képezi CODIS hazai működésének kezdete 2004 CODIS adatok (2010. június 30.): Hazai személyi DNS-profilok száma Hazai helyszíni DNS-profilok száma Külföldi DNS-profilok száma Összes kezelt DNS-profil
78 Szexuális bűncselekmények DNS-vizsgálata # 1 VWA TH01 TPOX CSF1PO Gyanúsított Ondófolt
79 Szexuális bűncselekmények DNS-vizsgálata # 2 LPL F13B FES F13A01 Sértett Abortum Gyanúsított
80 Halálos közúti baleset gondatlan okozása vérszennyeződések vizsgálata én körüli időben Szekszárd és Hőgyész között egy Ford Transit tehergépkocsi letért a jobb oldali útpadkára, árokba hajtott majd egy fának ütközött. Ennek következtében T.L. kisebb sérüléseket szenvedett, míg társa K.G. életét vesztette. A helyszínre elsőként érkező tanuk elmondása alapján a baleset következtében mindkét személy kiesett a tehergépkocsiból. Biztosításra került az érintett személyek vérmintája valamint a tehergépkocsi szélvédőjének vérgyanús szennyeződéses jobb oldali része
81 Ismeretlen holttestek vizsgálata Tiszalök (1) Sz. Lné N. N. női holttest Többszörös kizárás!
82 Ismeretlen holttestek vizsgálata Gönyü (1) N. N. férfi holttest S. G G. Cs Valószínűségi érték: 99,999994%
83 Interpol szerepe a DNS-profil adatok nemzetközi összehasonlításában Interpol évi felmérés eredménye: Interpol keretében együttműködő tagállamok száma: 187 DNS-vizsgálati lehetőséggel rendelkező tagállamok száma: 118 (63%) Nemzeti DNS-adatbázissal rendelkező tagállamok száma: 57 (30%) Interpol DNS-adatbázist használó tagállamok száma: 48 (lsd. térkép)
84 Egyéb lehetőségek... A Forensic Science Service által kidolgozott, rokoni kapcsolatok keresésén alapuló ún. familial searching eljárás egyes kiemelt ügyekben jelenthet megoldást. A helyszíni mintából meghatározott teljes gyanúsítotti DNSprofil birtokában lehetőség van olyan személyek adatbázisból történő leválogatására, akik az ismeretlen elkövető esetleges rokonai lehetnek. Ilyen módon sikerült azonosítani pl. egy 1973-ban elkövetett hármas nemi erőszakos gyilkosság elkövetőjét (Joe Kappen, 2002). Az angol rendőrség által között lefolytatott 185 familial searching eddig összesen 33 esetben sikerült olyan családtagot találni a DNS-profil nyilvántartásban, akinek révén el lehetett jutni az elkövetőhöz. Az íly módon megoldott ügyek eddigi végeredménye a következő: 5 elhunyt, 28 vádemelés, amelyből 1 személy felmentésre került míg 27 vádlott elítélésre került (kb. 18% sikerességi ráta).
85 Köszönöm megtisztelő figyelmüket!
Igazságügyi Genetikai vizsgálatok. Szemes Áfonya Bűnügyi Szakértői és Kutatóintézet
Igazságügyi Genetikai vizsgálatok Szemes Áfonya Bűnügyi Szakértői és Kutatóintézet 2014.10.07. DNS összehasonlító vizsgálati módszer Helyszíni minták: Vér Ondó Nyál Köröm (alatti hám) Hajhagymás haj Egyéb
Igazságügyi genetika alapjai
Nyomok - Death Valley, CA 2007 / 10 / 11 Igazságügyi genetika alapjai Molekuláris orvostudomány - molekuláris bűnjelek genetikai analízise Pádár Zsolt Igazságügyi genetika vannak az ÉLET dolgai és vannak
Bűnügyi DNS adatbázisok 20110920 1
DNS-adatbázisok szerepe a modern bűnüldözésben Woller János Bűnügyi Szakértői és Kutatóintézet 2012. november 24. Humán személyazonosítási vizsgálatok bűnügyekben -- gyanúsított és helyszíni minta lehetséges
Molekuláris biológiai eljárások alkalmazása a GMO analitikában és az élelmiszerbiztonság területén
Molekuláris biológiai eljárások alkalmazása a GMO analitikában és az élelmiszerbiztonság területén Dr. Dallmann Klára A molekuláris biológia célja az élőlények és sejtek működésének molekuláris szintű
A humán mitokondriális genom: Evolúció, mutációk, polimorfizmusok, populációs vonatkozások. Egyed Balázs ELTE Genetikai Tanszék
A humán mitokondriális genom: Evolúció, mutációk, polimorfizmusok, populációs vonatkozások Egyed Balázs ELTE Genetikai Tanszék Endoszimbiotikus gén-transzfer (Timmis et al., 2004, Nat Rev Gen) Endoszimbiotikus
RÉSZLETEZŐ OKIRAT (1) a NAH /2017 nyilvántartási számú akkreditált státuszhoz
RÉSZLETEZŐ OKIRAT (1) a NAH-1-1826 /2017 nyilvántartási számú akkreditált státuszhoz 1) Az akkreditált szervezet neve: Nemzeti Szakértői és Kutató Központ Bűnügyi Igazságügyi Szakértői Igazgatóság Genetikai
Engedélyszám: 18211-2/2011-EAHUF Verziószám: 1. 2460-06 Humángenetikai vizsgálatok követelménymodul szóbeli vizsgafeladatai
1. feladat Ismertesse a gyakorlaton lévő szakasszisztens hallgatóknak a PCR termékek elválasztása céljából végzett analitikai agaróz gélelektroforézis során használt puffert! Az ismertetés során az alábbi
In Situ Hibridizáció a pathologiai diagnosztikában és ami mögötte van.
In Situ Hibridizáció a pathologiai diagnosztikában és ami mögötte van. Kneif Józsefné PTE KK Pathologiai Intézet Budapest 2017. 05. 26 Kromoszóma rendellenesség kimutatás PCR technika: izolált nukleinsavak
Országos Igazságügyi Orvostani Intézet 22. számú módszertani levele
1. oldal Országos Igazságügyi Orvostani Intézet 22. számú módszertani levele polgári perekben és büntetőügyekben végzett DNS-vizsgálatokhoz és szakvéleményadáshoz1 Készítette: Az Országos Igazságügyi Orvostani
10. CSI. A molekuláris biológiai technikák alkalmazásai
10. CSI. A molekuláris biológiai technikák alkalmazásai A DNS mint azonosító 3 milliárd bázispár az emberi DNS-ben (99.9%-ban azonos) 0.1%-nyi különbség elegendő az egyedek megkülönböztetéséhez Genetikai
SZOMATIKUS ÉS Y KROMOSZÓMÁN LOKALIZÁLÓDÓ STR MARKEREK POPULÁCIÓGENETIKAI VIZSGÁLATA
SZEGEDI TUDOMÁNYEGYETEM TERMÉSZETTUDOMÁNYI KAR SZOMATIKUS ÉS Y KROMOSZÓMÁN LOKALIZÁLÓDÓ STR MARKEREK POPULÁCIÓGENETIKAI VIZSGÁLATA PhD dolgozat Készítette: Beer Zsuzsanna Szakvezető: Prof. Dr. Varga Tibor
Az Egészségügyi Minisztérium módszertani levele Polgári perekben és büntetőügyekben végzett DNS vizsgálatokhoz és szakvéleményadáshoz
Az Egészségügyi Minisztérium módszertani levele Polgári perekben és büntetőügyekben végzett DNS vizsgálatokhoz és szakvéleményadáshoz Készítette: Az Országos Igazságügyi Orvostani Intézet és az Igazságügyi
DNS viszgálatok, számítási módszerek
DNS viszgálatok, számítási módszerek Apasági vizsgálatok Kizárás: -a gyereknél az apától örökölt allél nem egyezik a feltételezett apáéval - 3 kizárás esetén az apaság kizárható -100% Anya: 12-13, kk.
DNS-szekvencia meghatározás
DNS-szekvencia meghatározás Gilbert 1980 (1958) Sanger 3-1 A DNS-polimerázok jellemzői 5'-3' polimeráz aktivitás 5'-3' exonukleáz 3'-5' exonukleáz aktivitás Az új szál szintéziséhez kell: templát DNS primer
Kromoszómák, Gének centromer
Kromoszómák, Gének A kromoszóma egy hosszú DNS szakasz, amely a sejt életének bizonyos szakaszában (a sejtosztódás előkészítéseként) tömörödik, így fénymikroszkóppal láthatóvá válik. A kromoszómák két
Horváth András vegyészszakértő BSZKI. Horváth András - BSZKI 1
Horváth András vegyészszakértő BSZKI Horváth András - BSZKI 1 A büntetőeljárás - feladata és célja: a bűncselekmények felderítése, a büntetőjogi felelősségről való döntés bizonyítási eljárás keretén belül.
A rendőrség keresi a tettest
A rendőrség keresi a tettest Az ügy: Police released surveillance image of the suspect. A rendőrség keresi azt a személyt, aki hétfőn reggel betört az Intézetbe és dulakodás közben több késsel megölt egy
Humán polimorf mikroszatellita (short tandem repeat) lokuszok igazságügyi genetikai vizsgálata magyar populációkban
* BUDAPESTI EÖTVÖS LORÁND * TUDOMÁNYEGYETEM Humán polimorf mikroszatellita (short tandem repeat) lokuszok igazságügyi genetikai vizsgálata magyar populációkban DOKTORI ÉRTEKEZÉS Készítette: Füredi Sándor
A géntechnológia genetikai alapjai (I./3.)
Az I./2. rész (Gének és funkciójuk) rövid összefoglalója A gének a DNS információt hordozó szakaszai, melyekben a 4 betű (ATCG) néhány ezerszer, vagy százezerszer ismétlődik. A gének önálló programcsomagként
Genetikai panel kialakítása a hazai tejhasznú szarvasmarha állományok hasznos élettartamának növelésére
Genetikai panel kialakítása a hazai tejhasznú szarvasmarha állományok hasznos élettartamának növelésére Dr. Czeglédi Levente Dr. Béri Béla Kutatás-fejlesztés támogatása a megújuló energiaforrások és agrár
A kromoszómák kialakulása előtt a DNS állomány megkettőződik. A két azonos információ tartalmú DNS egymás mellé rendeződik és egy kromoszómát alkot.
Kromoszómák, Gének A kromoszóma egy hosszú DNS szakasz, amely a sejt életének bizonyos szakaszában (a sejtosztódás előkészítéseként) tömörödik, így fénymikroszkóppal láthatóvá válik. A kromoszómák két
Bakteriális identifikáció 16S rrns gén szekvencia alapján
Bakteriális identifikáció 16S rrns gén szekvencia alapján MOHR ANITA SIPOS RITA, SZÁNTÓ-EGÉSZ RÉKA, MICSINAI ADRIENN 2100 Gödöllő, Szent-Györgyi Albert út 4. info@biomi.hu, www.biomi.hu TÖRZS AZONOSÍTÁS
Az élő szervezetek felépítése I. Biogén elemek biomolekulák alkotóelemei a természetben előforduló elemek közül 22 fordul elő az élővilágban O; N; C; H; P; és S; - élő anyag 99%-a Biogén elemek sajátosságai:
A gidrán fajta genetikai változatosságának jellemzése mitokondriális DNS polimorfizmusokkal Kusza Szilvia Sziszkosz Nikolett Mihók Sándor,
1 A gidrán fajta genetikai változatosságának jellemzése mitokondriális DNS polimorfizmusokkal Kusza Szilvia Sziszkosz Nikolett Mihók Sándor, (Debreceni Egyetem Állattenyésztéstani Tanszék) A bármilyen
DNS munka a gyakorlatban. 2012.10.12. Természetvédelmi genetika
DNS munka a gyakorlatban 2012.10.12. Természetvédelmi genetika Munka fázisok DNS kivonás elektroforézis (fakultatív lépés) PCR Elektroforézis Szekvenálás Szekvencia elemzés faji azonosítás; variabilitás,
Tudománytörténeti visszatekintés
GENETIKA I. AZ ÖRÖKLŐDÉS TÖRVÉNYSZERŰSÉGEI Minek köszönhető a biológiai sokféleség? Hogyan történik a tulajdonságok átörökítése? Tudománytörténeti visszatekintés 1. Keveredés alapú öröklődés: (1761-1766,
Mitokondriális DNS és mikroszatellita polimorfizmusok igazságügyi genetikai aspektusú vizsgálata a magyar népességben
* BUDAPESTI EÖTVÖS LORÁND * TUDOMÁNYEGYETEM Mitokondriális DNS és mikroszatellita polimorfizmusok igazságügyi genetikai aspektusú vizsgálata a magyar népességben DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI Készítette: Egyed
Gyógyszerrezisztenciát okozó fehérjék vizsgálata
Gyógyszerrezisztenciát okozó fehérjék vizsgálata AKI kíváncsi kémikus kutatótábor 2017.06.25-07.01. Témavezetők : Telbisz Ágnes, Horváth Tamás Kutatók : Dobolyi Zsófia, Bereczki Kristóf, Horváth Ákos Gyógyszerrezisztencia
Molekuláris genetikai vizsgáló. módszerek az immundefektusok. diagnosztikájában
Molekuláris genetikai vizsgáló módszerek az immundefektusok diagnosztikájában Primer immundefektusok A primer immundeficiencia ritka, veleszületett, monogénes öröklődésű immunhiányos állapot. Családi halmozódást
Patogén mikroorganizmusok vizsgálata molekuláris biológiai módszerekkel
Patogén mikroorganizmusok vizsgálata molekuláris biológiai módszerekkel Rohonczy Kata, Zoller Linda, Fodor Andrea, Tabajdiné, dr. Pintér Vera FoodMicro Kft. Célkitűzés Élelmiszerekben és takarmányokban
Mangalica specifikus DNS alapú módszer kifejlesztés és validálása a MANGFOOD projekt keretében
Mangalica specifikus DNS alapú módszer kifejlesztés és validálása a MANGFOOD projekt keretében Szántó-Egész Réka 1, Mohr Anita 1, Sipos Rita 1, Dallmann Klára 1, Ujhelyi Gabriella 2, Koppányné Szabó Erika
Algaközösségek ökológiai, morfológiai és genetikai diverzitásának összehasonlítása szentély jellegű és emberi használatnak kitett élőhelykomplexekben
Algaközösségek ökológiai, morfológiai és genetikai diverzitásának összehasonlítása szentély jellegű és emberi használatnak kitett élőhelykomplexekben Duleba Mónika Környezettudományi Doktori Iskola I.
A genetikai lelet értelmezése monogénes betegségekben
A genetikai lelet értelmezése monogénes betegségekben Tory Kálmán Semmelweis Egyetem, I. sz. Gyermekklinika A ~20 ezer fehérje-kódoló gén a 23 pár kromoszómán A kromoszómán található bázisok száma: 250M
Biomassza alapú bioalkohol előállítási technológia fejlesztése metagenomikai eljárással
Biomassza alapú bioalkohol előállítási technológia fejlesztése metagenomikai eljárással Kovács Zoltán ügyvezető DEKUT Debreceni Kutatásfejlesztési Közhasznú Nonprofit Kft. Problémadefiníció Első generációs
12/4/2014. Genetika 7-8 ea. DNS szerkezete, replikáció és a rekombináció. 1952 Hershey & Chase 1953!!!
Genetika 7-8 ea. DNS szerkezete, replikáció és a rekombináció 1859 1865 1869 1952 Hershey & Chase 1953!!! 1879 1903 1951 1950 1944 1928 1911 1 1. DNS szerkezete Mi az örökítő anyag? Friedrich Miescher
NÖVÉNYGENETIKA. Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP /1/A
NÖVÉNYGENETIKA Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP-4.1.2-08/1/A-2009-0010 A citológia és a genetika társtudománya Citogenetika A kromoszómák eredetét, szerkezetét, genetikai funkcióját,
Johann Gregor Mendel Az olmüci (Olomouc) és bécsi egyetem diákja Brünni ágostonrendi apát (nem szovjet tudós) Tudatos és nagyon alapos kutat
10.2.2010 genmisk1 1 Áttekintés Mendel és a mendeli törvények Mendel előtt és körül A genetika törvényeinek újbóli felfedezése és a kromoszómák Watson és Crick a molekuláris biológoa központi dogmája 10.2.2010
NUKLEINSAVAK. Nukleinsav: az élő szervezetek sejtmagvában és a citoplazmában található, az átöröklésben szerepet játszó, nagy molekulájú anyag
NUKLEINSAVAK Nukleinsav: az élő szervezetek sejtmagvában és a citoplazmában található, az átöröklésben szerepet játszó, nagy molekulájú anyag RNS = Ribonukleinsav DNS = Dezoxi-ribonukleinsav A nukleinsavak
HAPMAP -2010 Nemzetközi HapMap Projekt. SNP GWA Haplotípus: egy kromoszóma szegmensen lévő SNP mintázat
HAPMAP -2010 Nemzetközi HapMap Projekt A Nemzetközi HapMap Project célja az emberi genom haplotípus* térképének(hapmap; haplotype map) megszerkesztése, melynek segítségével katalogizálni tudjuk az ember
A keringı tumor markerek klinikai alkalmazásának aktuális kérdései és irányelvei
A keringı tumor markerek klinikai alkalmazásának aktuális kérdései és irányelvei A TM vizsgálatok alapkérdései A vizsgálatok célja, információértéke? Az alkalmazás területei? Hogyan válasszuk ki az alkalmazott
Mitokondriális DNS és mikroszatellita polimorfizmusok igazságügyi genetikai aspektusú vizsgálata a magyar népességben
* BUDAPESTI EÖTVÖS LORÁND * TUDOMÁNYEGYETEM Mitokondriális DNS és mikroszatellita polimorfizmusok igazságügyi genetikai aspektusú vizsgálata a magyar népességben DOKTORI ÉRTEKEZÉS Készítette: Egyed Balázs
A Hardy-Weinberg egyensúly. 2. gyakorlat
A Hardy-Weinberg egyensúly 2. gyakorlat A Hardy-Weinberg egyensúly feltételei: nincs szelekció nincs migráció nagy populációméret (nincs sodródás) nincs mutáció pánmixis van allélgyakoriság azonos hímekben
Tipizálási módszerek alkalmazása methicillin-rezisztens Staphylococcus aureus (MRSA) törzsek molekuláris epidemiológiai vizsgálatai során
Tipizálási módszerek alkalmazása methicillin-rezisztens Staphylococcus aureus (MRSA) törzsek molekuláris epidemiológiai vizsgálatai során Ungvári Erika, Tóth Ákos Magyar Infektológiai és Klinikai Mikrobiológiai
BIOLÓGIA HÁZIVERSENY 1. FORDULÓ BIOKÉMIA, GENETIKA BIOKÉMIA, GENETIKA
BIOKÉMIA, GENETIKA 1. Nukleinsavak keresztrejtvény (12+1 p) 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. 10. 11. 12. 1. A nukleinsavak a.-ok összekapcsolódásával kialakuló polimerek. 2. Purinvázas szerves bázis, amely az
Az adaptív immunválasz kialakulása. Erdei Anna Immunológiai Tanszék ELTE
Az adaptív immunválasz kialakulása Erdei Anna Immunológiai Tanszék ELTE NK sejt T Bev. 1. ábra Immunhomeosztázis A veleszületett immunrendszer elemei nélkül nem alakulhat ki az adaptív immunválasz A veleszületett
A tananyag felépítése: A BIOLÓGIA ALAPJAI. I. Prokarióták és eukarióták. Az eukarióta sejt. Pécs Miklós: A biológia alapjai
A BIOLÓGIA ALAPJAI A tananyag felépítése: Környezetmérnök és műszaki menedzser hallgatók számára Előadó: 2 + 0 + 0 óra, félévközi számonkérés 3 ZH: október 3, november 5, december 5 dr. Pécs Miklós egyetemi
Immunológiai módszerek a klinikai kutatásban
Immunológiai módszerek a klinikai kutatásban 8. előadás Immunszerológia, immunkémia Az immunoassay-k érzékenysége A fő szérumfehérje frakciók és az ahhoz tartozó fehérjék Az Ig valencia és aviditás viszonya
A nukleinsavak polimer vegyületek. Mint polimerek, monomerekből épülnek fel, melyeket nukleotidoknak nevezünk.
Nukleinsavak Szerkesztette: Vizkievicz András A nukleinsavakat először a sejtek magjából sikerült tiszta állapotban kivonni. Innen a név: nucleus = mag (lat.), a sav a kémhatásukra utal. Azonban nukleinsavak
Az ELISA módszerek kihívásai és azok kezelése az élelmiszerallergének vizsgálata során. Tanyi Ervin, Romer Labs
Az ELISA módszerek kihívásai és azok kezelése az élelmiszerallergének vizsgálata során Tanyi Ervin, Romer Labs Globális partner 2 kiemelt technológia Immunkromatográfiás teszt Tömegspektroszkópia 5 szakterület
Többgénes jellegek. 1. Klasszikus (poligénes) mennyiségi jellegek. 2.Szinte minden jelleg több gén irányítása alatt áll
Többgénes jellegek Többgénes jellegek 1. 1. Klasszikus (poligénes) mennyiségi jellegek Multifaktoriális jellegek: több gén és a környezet által meghatározott jellegek 2.Szinte minden jelleg több gén irányítása
A termesztett búza diploid őseinek molekuláris citogenetikai elemzése: pachytén- és fiber-fish.
OTKA K67808 zárójelentés 2012. A termesztett búza diploid őseinek molekuláris citogenetikai elemzése: pachytén- és fiber-fish. A fluoreszcens in situ hibridizáció (FISH) olyan technikai fejlettséget ért
Szent István Egyetem Állatorvos-tudományi Doktori Iskola. Kutya eredetű anyagmaradványok igazságügyi genetikai vizsgálata
Szent István Egyetem Állatorvos-tudományi Doktori Iskola Kutya eredetű anyagmaradványok igazságügyi genetikai vizsgálata PhD értekezés Készítette: Pádár Zsolt 2006 Szent István Egyetem Állatorvos-tudományi
Hátterükben egyetlen gén áll, melynek általában számottevő a viselkedésre gyakorolt hatása, öröklési mintázata jellegzetes.
Múlt órán: Lehetséges tesztfeladatok: Kitől származik a variáció-szelekció paradigma, mely szerint az egyéni, javarészt öröklött különbségek között a társadalmi harc válogat? Fromm-Reichmann Mill Gallton
Prenatalis diagnosztika lehetőségei mikor, hogyan, miért? Dr. Almássy Zsuzsanna Heim Pál Kórház, Budapest Toxikológia és Anyagcsere Osztály
Prenatalis diagnosztika lehetőségei mikor, hogyan, miért? Dr. Almássy Zsuzsanna Heim Pál Kórház, Budapest Toxikológia és Anyagcsere Osztály Definíció A prenatális diagnosztika a klinikai genetika azon
PrenaTest Újgenerációs szekvenálást és z-score
PrenaTest Újgenerációs szekvenálást és z-score számítást alkalmazó, nem-invazív prenatális molekuláris genetikai teszt a magzati 21-es triszómia észlelésére, anyai vérből végzett DNS izolálást követően
A Legionella jelenlétének kimutatása
A Legionella jelenlétének kimutatása Diagnosztikai lehetőségek Kari András Budapest 2016. 04.07. Legionella nemzetség: aerob coccoid-pálca Gram (gyengén festődik) kataláz +, oxidáz +, hippurátot hidrulizálja
Dr. Nemes Nagy Zsuzsa Szakképzés Karl Landsteiner Karl Landsteiner:
Az AB0 vércsoport rendszer Dr. Nemes Nagy Zsuzsa Szakképzés 2011 Az AB0 rendszer felfedezése 1901. Karl Landsteiner Landsteiner szabály 1901 Karl Landsteiner: Munkatársai vérmintáit vizsgálva fedezte fel
Poligénes v. kantitatív öröklődés
1. Öröklődés komplexebb sajátosságai 2. Öröklődés molekuláris alapja Poligénes v. kantitatív öröklődés Azok a tulajdonságokat amelyek mértékegységgel nem, vagy csak nehezen mérhetők, kialakulásuk kevéssé
Rh VÉRCSOPORT RENDSZER GENETIKÁJA. Rh ANTIGÉNEK ÉS ANTITESTEK. EGYÉB VÉRCSOPORTRENDSZEREK
Rh VÉRCSOPORT RENDSZER GENETIKÁJA. Rh ANTIGÉNEK ÉS ANTITESTEK. EGYÉB VÉRCSOPORTRENDSZEREK HISTORY Antitestet találtak egy koraszülött gyermek anyjának szérumában; ez lenne felelős a gyermek haláláért?
TRIPSZIN TISZTÍTÁSA AFFINITÁS KROMATOGRÁFIA SEGÍTSÉGÉVEL
TRIPSZIN TISZTÍTÁSA AFFINITÁS KROMATOGRÁFIA SEGÍTSÉGÉVEL Az egyes biomolekulák izolálása kulcsfontosságú a biológiai szerepük tisztázásához. Az affinitás kromatográfia egyszerűsége, reprodukálhatósága
Antigén, Antigén prezentáció
Antigén, Antigén prezentáció Biológiai Intézet Immunológiai Tanszék Bajtay Zsuzsa ELTE, TTK Biológiai Intézet Immunológiai Tanszék ORFI Klinikai immunológia tanfolyam, 2019. február. 26 Bev. 2. ábra Az
KEDVEZMÉNYES VIZSGÁLATI CSOMAGOK
C-1 es ár Élni jó csomag Páros csomag D-vitamin csomag Manager csomag Egészség 50+ csomag hölgyeknek Egészség 50+ csomag férfiaknak Vérkép automatával (kvalitatív vérképpel) (GGT), Alkalikus foszfatáz
Biológiai módszerek alkalmazása környezeti hatások okozta terhelések kimutatására
Szalma Katalin Biológiai módszerek alkalmazása környezeti hatások okozta terhelések kimutatására Témavezető: Dr. Turai István, OSSKI Budapest, 2010. október 4. Az ionizáló sugárzás sejt kölcsönhatása Antone
3. Általános egészségügyi ismeretek az egyes témákhoz kapcsolódóan
11. évfolyam BIOLÓGIA 1. Az emberi test szabályozása Idegi szabályozás Hormonális szabályozás 2. Az érzékelés Szaglás, tapintás, látás, íz érzéklés, 3. Általános egészségügyi ismeretek az egyes témákhoz
Immunszerológia I. Agglutináció, Precipitáció. Immunológiai és Biotechnológiai Intézet PTE-KK
Immunszerológia I. Agglutináció, Precipitáció Immunológiai és Biotechnológiai Intézet PTE-KK Antigén Antitest Alapok Antigén: vvt,, baktérium, latex gyöngy felszínén (µm( m nagyságú partikulum) Antitest:
Intelligens Rendszerek Elmélete. Párhuzamos keresés genetikus algoritmusokkal
Intelligens Rendszerek Elmélete Dr. Kutor László Párhuzamos keresés genetikus algoritmusokkal http://mobil.nik.bmf.hu/tantargyak/ire.html login: ire jelszó: IRE0 IRE / A természet általános kereső algoritmusa:
Genetika 3 ea. Bevezetés
Genetika 3 ea. Mendel törvényeinek a kiegészítése: Egygénes öröklődés Többtényezős öröklődés Bevezetés Mendel által vizsgált tulajdonságok: diszkrétek, két különböző fenotípus Humán tulajdonságok nagy
Kontrollok a szerológiában. Dr. Toldi József OVSZ Szegedi Regionális Vérellátó Központ
Kontrollok a szerológiában Dr. Toldi József OVSZ Szegedi Regionális Vérellátó Központ A kontrollok szerepe A kontrollok szerepe, hogy a szerológiai vizsgálatok eredményeit helyesen értékeljük és meggyőződjünk,
AZ ÉLET KÉMIÁJA... ÉLŐ ANYAG SZERVEZETI ALAPEGYSÉGE
AZ ÉLET KÉMIÁJA... ÉLŐ ANYAG SZERVEZETI ALAPEGYSÉGE A biológia az élet tanulmányozásával foglalkozik, az élő szervezetekre viszont vonatkoznak a fizika és kémia törvényei MI ÉPÍTI FEL AZ ÉLŐ ANYAGOT? HOGYAN
Domináns-recesszív öröklődésmenet
Domináns-recesszív öröklődésmenet Domináns recesszív öröklődés esetén tehát a homozigóta domináns és a heterozigóta egyedek fenotípusa megegyezik, így a három lehetséges genotípushoz (példánkban AA, Aa,
11. Dr. House. Biokémiai és sejtbiológiai módszerek alkalmazása az orvoslásban
11. Dr. House. Biokémiai és sejtbiológiai módszerek alkalmazása az orvoslásban HIV fertőzés kimutatása - (fiktív) esettanulmány 35 éves nő, HIV fertőzöttség gyanúja. Két partner az elmúlt időszakban. Fertőzött-e
11. Dr. House. Biokémiai és sejtbiológiai módszerek alkalmazása az orvoslásban
11. Dr. House. Biokémiai és sejtbiológiai módszerek alkalmazása az orvoslásban HIV fertőzés kimutatása (fiktív) esettanulmány 35 éves nő, HIV fertőzöttség gyanúja. Két partner az elmúlt időszakban. Fertőzött-e
Kevéssé fejlett, sejthártya betüremkedésekből. Citoplazmában, cirkuláris DNS, hisztonok nincsenek
1 A sejtek felépítése Szerkesztette: Vizkievicz András A sejt az élővilág legkisebb, önálló életre képes, minden életjelenséget mutató szerveződési egysége. Minden élőlény sejtes szerveződésű, amelyek
mintasepcifikus mikrokapilláris elektroforézis Lab-on-Chip elektroforézis / elektrokinetikus elven DNS, RNS, mirns 12, fehérje 10, sejtes minta 6
Agilent 2100 Bioanalyzer mikrokapilláris gélelektroforézis rendszer G2943CA 2100 Bioanalyzer system forgalmazó: Kromat Kft. 1112 Budapest Péterhegyi u. 98. t:36 (1) 248-2110 www.kromat.hu bio@kromat.hu
DNS molekulák elválasztása agaróz gélelektroforézissel és kapilláris elektroforézissel
DNS molekulák elválasztása agaróz gélelektroforézissel és kapilláris elektroforézissel Gyakorlat helye: BIOMI Kft. Gödöllő, Szent-Györgyi A. u. 4. (Nemzeti Agrárkutatási és Innovációs Központ épülete volt
Biológus MSc. Molekuláris biológiai alapismeretek
Biológus MSc Molekuláris biológiai alapismeretek A nukleotidok építőkövei A nukleotidok szerkezete Nukleotid = N-tartalmú szerves bázis + pentóz + foszfát N-glikozidos kötés 5 1 4 2 3 (Foszfát)észter-kötés
A nukleinsavak polimer vegyületek. Mint polimerek, monomerekből épülnek fel, melyeket nukleotidoknak nevezünk.
Nukleinsavak Szerkesztette: Vizkievicz András A nukleinsavakat először a sejtek magjából sikerült tiszta állapotban kivonni. Innen a név: nucleus = mag (lat.), a sav a kémhatásukra utal. Azonban nukleinsavak
Élelmiszerek. mikroszennyezőinek. inek DR. EKE ZSUZSANNA. Elválasztástechnikai Kutató és Oktató Laboratórium. ALKÍMIA MA november 5.
Élelmiszerek mikroszennyezőinek inek nyomában DR. EKE ZSUZSANNA Elválasztástechnikai Kutató és ktató Laboratórium ALKÍMIA MA 2009. november 5. Kémiai veszélyt lytényezők Természetesen előforduló mérgek
Klinikai és Bírósági Alkalmazások Valószínűségszámítási Modellek BREUER-LÁBADY PÉTER
Klinikai és Bírósági Alkalmazások Valószínűségszámítási Modellek BREUER-LÁBADY PÉTER KLINIKAI ALKALMAZÁSOK GYÓGYSZER TESZTELÉS MIK LEHETNEK A PROBLÉMÁK? STATISZTIKAI ALAPKÖVEK GYÓGYULÁSI ESÉLYEK TARTALOM
BD Vacutainer Molekuláris Diagnosztikai termékei
BD Vacutainer Molekuláris Diagnosztikai termékei Andrea Süle, PhD Termékspecialista BD Diagnostics, Preanalytical Systems MOLSZE XI. Nagygyőlés, Pécs, 2009 augusztus 27-29. BD A BD egy orvostechnológiai
GENOMIKA TÖBBFÉLE MAKROMOLEKULA VIZSGÁLATA EGYIDŐBEN
GENOMIKA TÖBBFÉLE MAKROMOLEKULA VIZSGÁLATA EGYIDŐBEN Strukturális genomika Genomkönyvtárak DNS szekvenálás Genom programok Polimorfizmusok RFLP DNS könyvtár készítés humán genom 1. Emésztés RE-kal Emberi
ADATBÁNYÁSZAT I. ÉS OMICS
Az élettudományi-klinikai felsőoktatás gyakorlatorientált és hallgatóbarát korszerűsítése a vidéki képzőhelyek nemzetközi versenyképességének erősítésére TÁMOP-4.1.1.C-13/1/KONV-2014-0001 ADATBÁNYÁSZAT
Antigén szervezetbe bejutó mindazon corpuscularis vagy solubilis idegen struktúra, amely immunreakciót vált ki Antitest az antigénekkel szemben az
Antigén szervezetbe bejutó mindazon corpuscularis vagy solubilis idegen struktúra, amely immunreakciót vált ki Antitest az antigénekkel szemben az immunválasz során termelődött fehérjék (immunglobulinok)
Esettanulmányok. Dr. Toldi József OVSZ Szegedi Regionális Vérellátó Központ
Esettanulmányok Dr. Toldi József OVSZ Szegedi Regionális Vérellátó Központ Esetismertetések: ABO vércsoport meghatározással kapcsolatos nehézségek és megoldások RhD bizonytalanság kivizsgálása Antitest-azonosítással
Humán polimorf mikroszatellita (short tandem repeat) lokuszok igazságügyi genetikai vizsgálata magyar populációkban
* BUDAPESTI EÖTVÖS LORÁND * TUDOMÁNYEGYETEM Humán polimorf mikroszatellita (short tandem repeat) lokuszok igazságügyi genetikai vizsgálata magyar populációkban DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI Készítette: Füredi
A Multi Locus Sequence Typing (MLST) alkalmazhatósága az élelmiszermikrobiológiában
A Multi Locus Sequence Typing (MLST) alkalmazhatósága az élelmiszermikrobiológiában Sipos Rita, Lukács Alena, Simon Janka, Szántó-Egész Réka, Micsinai Adrienn 2100 Gödöllő, Szent-Györgyi Albert út 4. info@biomi.hu,
SALMONELLA SSP. GYORS, MOLEKULÁRIS BIOLÓGIAI MÓDSZEREKKEL TÖRTÉNŐ DETEKTÁLÁSA
SALMONELLA SSP. GYORS, MOLEKULÁRIS BIOLÓGIAI MÓDSZEREKKEL TÖRTÉNŐ DETEKTÁLÁSA Nyirő-Fekete B., Tabajdi-Bajza N., Kovácsné Kis É., Pocklán E., Zoller L., Micsinai A., Gasparikné Reichardt J. Hungalimentaria
EGYSEJTŰ REAKTOROK BIOKATALÍZIS:
EGYSEJTŰ REAKTOROK BIOKATALÍZIS: A GÉNMÓDOSÍTÁSTÓL AZ IPARI FERMENTÁCIÓIG SZAMECZ BÉLA BIOKATALÍZIS - DEFINÍCIÓ szerves vegyületek átalakítása biológiai rendszer a katalizátor Enzim: élő sejt vagy tisztított
A PKU azért nem hal ki, mert gyógyítják, és ezzel növelik a mutáns allél gyakoriságát a Huntington kór pedig azért marad fenn, mert csak későn derül
1 Múlt órán: Genetikai alapelvek, monogénes öröklődés Elgondolkodtató feladat Vajon miért nem halnak ki az olyan mendeli öröklődésű rendellenességek, mint a Phenylketonuria, vagy a Huntington kór? A PKU
Intelligens Rendszerek Elmélete. Párhuzamos keresés genetikus algoritmusokkal. A genetikus algoritmus működése. Az élet információ tárolói
Intelligens Rendszerek Elmélete dr. Kutor László Párhuzamos keresés genetikus algoritmusokkal http://mobil.nik.bmf.hu/tantargyak/ire.html login: ire jelszó: IRE07 IRE 5/ Természetes és mesterséges genetikus
A tumor-markerek alkalmazásának irányelvei BOKOR KÁROLY klinikai biokémikus Dr. Romics László Egészségügyi Intézmény
A tumor-markerek alkalmazásának irányelvei BOKOR KÁROLY klinikai biokémikus Dr. Romics László Egészségügyi Intézmény 2016.10.17. 1 2016.10.17. 2 2016.10.17. 3 A TUMORMARKEREK TÖRTÉNETE I. ÉV FELFEDEZŐ
Elválasztástechnikai és bioinformatikai kutatások. Dr. Harangi János DE, TTK, Biokémiai Tanszék
Elválasztástechnikai és bioinformatikai kutatások Dr. Harangi János DE, TTK, Biokémiai Tanszék Fő kutatási területek Enzimek vizsgálata mannozidáz amiláz OGT Analitikai kutatások Élelmiszer analitika Magas
Nukleinsavak. Szerkezet, szintézis, funkció
Nukleinsavak Szerkezet, szintézis, funkció Nukleinsavak, nukleotidok, nukleozidok 1869-ben Miescher a sejtmagból egy savas természetű, lúgban oldódó foszfortartalmú anyagot izolált, amit később, eredetére
AZ EURÓPAI UNIÓ TANÁCSA. Brüsszel, november 13. (18.11) (OR. en) 15870/09 ENFOPOL 287 CRIMORG 170
AZ EURÓPAI UNIÓ TANÁCSA Brüsszel, 2009. november 13. (18.11) (OR. en) 15870/09 ENFOPOL 287 CRIMORG 170 FELJEGYZÉS AZ I/A NAPIRENDI PONTHOZ Küldi: a Főtitkárság Címzett: a COREPER/a Tanács Előző dok. sz.:
Mivel korábban már végeztünk mikroszatellit elemzést (Liker et al 2009), a kiértékeléshez szükséges szoftverek és tapasztalat rendelkezésre áll.
Genetikai változatosság (állat csoportok) Pénzes Zsolt, Bihari Péter és Raskó István SZBK Genetika Intézet A pályázati munkatervnek megfelelően első évben elsősorban a részletes elemzésre kiválasztott
Toxikológiai Vizsgálatok a PTE Laboratóriumi Medicina Intézetében. Lajtai Anikó és Lakatos Ágnes PTE Laboratóriumi Medicina Intézet
Toxikológiai Vizsgálatok a PTE Laboratóriumi Medicina Intézetében Lajtai Anikó és Lakatos Ágnes PTE Laboratóriumi Medicina Intézet Bevezetés A toxikológiai vizsgálatok szerepe az akut intoxikációk felismerésében
Human genome project
Human genome project Pataki Bálint Ármin 2017.03.14. Pataki Bálint Ármin Human genome project 2017.03.14. 1 / 14 Agenda 1 Biológiai bevezető 2 A human genome project lefolyása 3 Alkalmazások, kitekintés
A műanyag csomagolóanyagok nem szándékosan hozzáadott összetevőinek kioldódásvizsgálata
Budapest, 2017.04.26. A műanyag csomagolóanyagok nem szándékosan hozzáadott összetevőinek kioldódásvizsgálata Kosdi Bence WESSLING Hungary Kft. Amiről szó lesz A vizsgálat áttekintése Analitikai módszer
Az X kromoszóma inaktívációja. A kromatin szerkezet befolyásolja a génexpressziót
Az X kromoszóma inaktívációja A kromatin szerkezet befolyásolja a génexpressziót Férfiak: XY Nők: XX X kromoszóma: nagy méretű több mint 1000 gén Y kromoszóma: kis méretű, kevesebb, mint 100 gén Kompenzációs
A HUMÁNGENETIKA LEGÚJABB EREDMÉNYEI Péterfy Miklós
A HUMÁNGENETIKA LEGÚJABB EREDMÉNYEI Péterfy Miklós Összefoglalás A humángenetika korunk egyik legdinamikusabban fejlődő tudományága. Ennek a fejlődésnek legfőbb mozgatórugója az, hogy a humángenetika,