Genetikai panel kialakítása a hazai tejhasznú szarvasmarha állományok hasznos élettartamának növelésére

Méret: px

Mutatás kezdődik a ... oldaltól:

Download "Genetikai panel kialakítása a hazai tejhasznú szarvasmarha állományok hasznos élettartamának növelésére"

Zsigmond Dudás
8 évvel ezelőtt
Látták:

1 Genetikai panel kialakítása a hazai tejhasznú szarvasmarha állományok hasznos élettartamának növelésére Dr. Czeglédi Levente Dr. Béri Béla Kutatás-fejlesztés támogatása a megújuló energiaforrások és agrár innováció területén 211. Március 25.

2 A téma jelentősége, aktualitása a hazai szarvasmarha állomány 72%-a tejhasznosítású ezen belül a holstein-fríz fajta aránya 98% hazai éves tejtermelés 1,5-1,6 milliárd liter a magyar holstein-fríz életteljesítménye <2,3 laktáció ok: szaporodásbiológia, tejtermelés, lábhiba, tőgyhiba, anyagcserezavar.. Következmény: a két évig tartó felnevelési költségnek igen rövid idő alatt kell megtérülnie

holstein-fríz életteljesítménye <2,3 laktáció ok: szaporodásbiológia, tejtermelés, lábhiba,

3 Célkitűzés Vizsgálati panel kialakítása olyan génekre, melyek befolyásolják a holstein-fríz szarvasmarha hosszú hasznos élettartamát

4 Módszer biológiai markerek azonosítása molekuláris biológiai módszerekkel: GENETIKA - PROTEOMIKA

5 Vizsgálati állomány Projekt 1.: Hosszú hasznos élettartamú tehenek (termelés > 8. l tej) Kontroll (első/második laktációs selejtezett tehenek) Projekt 2.: Hosszú hasznos élettartamú tehenek (termelés > 8. l tej) Kontroll 1. csoport (kis tejtermelésű tehenek) Kontroll 2. csoport (nehezen vemhesülő tehenek) Egyedszám: 45 tehén

: Hosszú hasznos élettartamú tehenek (termelés > 8. l tej) Kontroll 1.

6 A három csoport átlagos termelési paraméterei Laktációs tejtermelés (kg, 35 nap) Zsír (kg) Fehérje (kg) 1. laktációs szap.biol. selejt laktációs termelési selejt hosszú hasznos élettartamú

laktációs szap.biol. selejt 111 347 321 1.

7 Vizsgált gének: - calpastatin gén (CAST) - proteáz inhibítor gén (PI) - lactoferrin gén - leptin gén - méh tej protein gén (UTMP) - fibroblast növekedési faktor 2 gén (FGF2) - agyalapi mirigy specifikus pozitív transzkripciós faktor 1 gén (POU1F1) Vizsgálat proteinek: a biológiai mintában expresszálódó összes fehérje

növekedési faktor 2 gén (FGF2) - agyalapi mirigy specifikus pozitív

8 Metodika: genetikai vizsgálatok Genomi DNS: szőrhagymából, vérből (lízis puffer + proteináz) Genotipizálás: oligo explorer grádiens PCR, touchdown PCR restrikciós emésztés, SSCP agaróz gélelektroforézis, gelred festés detektálás: UV, uvipro platinum TaqMan próba Értékelés: SAS PROC GLM, ANOVA PSMC1 grádiens PCR C

restrikciós emésztés, SSCP agaróz gélelektroforézis, gelred festés detektálás:

9 A specifikusan amplifikált DNS fragmentek

10 Metodika: proteomikai vizsgálatok Minta: vérplazma, tej Gél alapú technika: fehérjék izolálása nagy gyakoriságú fehérjék koncentrációjának csökkentése prefrakcionálás: pi, méret egy dimenziós poliakrilamid gélelektroforézis két dimenziós poliakrilamid gélelektroforézis

koncentrációjának csökkentése prefrakcionálás: pi, méret egy

11 Metodika: proteomikai vizsgálatok Festés: coomassie, ezüst-nitrát, fluoreszcens Értékelés: PDQuest software Nem gél alapú technika: MALDI - TOF/TOF nanolc-iontrap MS Mascot adatbázis-kereső

12 tejzsírcsepp proteinek = tőgyepithel sejt membrán+citoplazma proteinek

13 Eredmények

14 A csoportok közötti különbség statisztikailag nem szignifikáns

15 A csoportok közötti különbség statisztikailag nem szignifikáns

16 A csoportok közötti különbség statisztikailag nem szignifikáns

17 A csoportok közötti különbség statisztikailag szignifikáns

18 Vérplazma és MFGM proteomjának elemzése Vérplazma Tőgyepithel sejt membrán Termelt tej>1. liter Kontroll marker fehérje

20 MALDI TOF/TOF és nanolc-iontrap tömegspektrometria hosszú hasznos élettartam kis tejtermelés Intens. [a.u.] Intens. [a.u.] Intens. [a.u.] Intens. [a.u.] Intens. [a.u.] H8165kek\_P22\1\1SLin C89piros\_P1\1\1SLin A614\_P7\1\1SLin A144piros\_P14\1\1SLin A3321\_P17\1\1SLin m/z Intens. [a.u.] Intens. [a.u.] Intens. [a.u.] Intens. [a.u.] Intens. [a.u.] Intens. [a.u.] Intens. [a.u.] G79\_P16\1\1SLin G162\_P1\1\1SLin G314fekete\_P6\1\1SLin G314piros\_P15\1\1SLin G53\_P5\1\1SLin H156\_P9\1\1SLin H547\_P2\1\1SLin nehezen vemhesülő m/z Intens. [a.u.] Intens. [a.u.] H8165kekF\_O4\1\1SRef H8165kekF\_O4\1\1SRef m/z Intens. Intens. [a.u.] Intens. [a.u.] Intens. [a.u.] Intens. [a.u.] Intens. [a.u.] Intens. [a.u.] Intens. [a.u.] Intens. [a.u.] [a.u.] x x kek\_P3\1\1SLin G167\_P13\1\1SLin G179\_P12\1\1SLin G179\_P19\1\1SLin H771\_P18\1\1SLin G613\_P8\1\1SLin G958\_P11\1\1SLin G958\_P2\1\1SLin G1428\_P21\1\1SLin m/z

$422 C89piros\_P1\1\1SLin A614\_P7\1\1SLin A144piros\_P14\1\1SLin A3321\_P17\1\1SLin 86 88 9 92 94 96 98 m/z Intens. [a.u.] Intens. [a.u.] Intens. [a.u.] Intens. [a.u.] Intens. [a.u.] Intens. [a.u.] Intens. [a.u.] 4 2 4 2 2 1 1 1 2 1 1 5 9178.$

21 KÖSZÖNÖM A MEGTISZTELŐ FIGYELMET!

22 Protein name NCBI Accession number Match ed peptid es Theoretic al MW (kda) Masc ot score Sequence coverage (%) Lamin A/C gi: Tuftelin interacting protein gi: Zeta-chain (TCR) associated protein kinase isoform 2 gi: Fibronectin type III domain containing 3A isoform 1 gi: Similar to stomatin gi: Zinc finger protein 52 gi: oxoglutarate dehydrogenase, mitochondrial precursor gi: SLC25A3 protein gi: Phosphate carrier protein, mitochondrial precursor gi: Similar to serine/threonine-protein kinase Nek5 gi: Bovine F1-Atpase gi: Bovine F1-Atpase gi: Mitochrondrial ATP synthase beta subunit precursor gi: NADH:ubiquinone oxidoreductase gi: NADH dehydrogenase Fe-S protein 2 precursor gi: Cytochrome b-c1 complex subunit 2 gi: Canopy 2 homolog gi: Zinc finger protein 184 gi:

Hasonló dokumentumok

A bioüzemanyag-gyártás melléktermékeinek felhasználása, a tejtermelő tehenek takarmányozásában

A bioüzemanyag-gyártás melléktermékeinek felhasználása, a tejtermelő tehenek takarmányozásában Dr. Gergácz Zoltán Ügyvezető igazgató Agárdi Farm Kft. Seregélyes-Elzamajor Agárdi Farm Kft. Tehenészete Seregélyes-Elzamajor