Mozgékony molekulák vizsgálata modern mikroszkópiával



Hasonló dokumentumok
Rövid ismertető. Modern mikroszkópiai módszerek. A mikroszkóp. A mikroszkóp. Az optikai mikroszkópia áttekintése

Modern mikroszkópiai módszerek

Áttekintés 5/11/2015 MIKROSZKÓPIAI MÓDSZEREK 1 FÉNYMIKROSZKÓPIA FLUORESZCENCIA MIKROSZKÓPIA. Mikroszkópia, fénymikroszkópia

Fény- és fluoreszcens mikroszkópia. A mikroszkóp felépítése Brightfield mikroszkópia

Speciális fluoreszcencia spektroszkópiai módszerek

d z. nsin

A fluoreszcencia orvosibiológiai. alkalmazásai. Fluoreszcencia forrása I. Fluoreszcencia alkalmazások. Kellermayer Miklós

Az áramlási citométer és sejtszorter felépítése és működése, diagnosztikai alkalmazásai

Fluoreszcencia módszerek (Kioltás, Anizotrópia, FRET) Modern Biofizikai Kutatási Módszerek

Modern mikroszkópiai módszerek

6. Fehérjék kimutatása. Biokémiai és sejtszintű vizsgálatok

ÖSSZ-TARTALOM. 1. Az alapok - 1. előadás 2. A jelutak komponensei 1. előadás 3. Főbb jelutak 2. előadás 4. Idegi kommunikáció 3.

Mikroszerkezeti vizsgálatok

6. Fehérjék kimutatása. Biokémiai és sejtszintű vizsgálatok

Biomolekuláris rendszerek. vizsgálata. Semmelweis Egyetem. Osváth Szabolcs. A mikroszkópok legfontosabb típusai

ÖSSZ-TARTALOM 1. Az alapok - 1. előadás 2. A jelutak komponensei 1. előadás 3. Főbb jelutak 2. előadás

Jelutak ÖSSZ TARTALOM. Jelutak. 1. a sejtkommunikáció alapjai

2008 Small World contest -18th Prize - Dr. Tamily Weissman (Harvard University - Cambridge, Massachusetts, United States) Specimen: Brainbow

Modern Biofizikai Kutatási Módszerek Kereskedelmi forgalomban kapható készülékek. Áramlási citometria (flow cytometry)

Fluoreszcencia módszerek (Kioltás, Anizotrópia, FRET)

Ragyogó molekulák: dióhéjban a fluoreszcenciáról és biológiai alkalmazásairól

Jelátvitel az idegrendszerben:

Biomolekuláris rendszerek. vizsgálata. Semmelweis Egyetem. Osváth Szabolcs

Lumineszcencia Fényforrások

Daganat immunterápia molekuláris markereinek tanulmányozása biofizikai módszerekkel. Áramlási és képalkotó citometria

Szalay Péter (ELTE, Kémia Intézet) Szentjánosbogár, trópusi halak, sarki fény Mi a közös a természet fénytüneményeiben?

TANULÓI KÍSÉRLET (45 perc)

A LÉZERSUGÁRZÁS ALAPVETŐ ISMÉRVEI SPONTÁN VS. INDUKÁLT EMISSZIÓ A FÉNYERŐSÍTÉS FELTÉTELE A POPULÁCIÓ INVERZIÓ FELTÉTELE

6. Fehérjék kimutatása. Biokémiai és sejtszintű vizsgálatok

In vivo szövetanalízis. Különös tekintettel a biolumineszcens és fluoreszcens képalkotási eljárásokra

Pásztázó elektronmikroszkóp. Alapelv. Szinkron pásztázás

Részletes szakmai beszámoló Az erbb proteinek asszociációjának kvantitatív jellemzése című OTKA pályázatról (F049025)

Intelligens molekulákkal a rák ellen

Fluoreszcencia 2. (Kioltás, Anizotrópia, FRET)

Az élő sejt fizikai Biológiája:

(

Az elektromágneses sugárzás kölcsönhatása az anyaggal

Bevezetés a fluoreszcenciába

Lumineszcencia spektrometria összefoglaló

Digitális tananyag a fizika tanításához

5/11/2015 MIKROSZKÓPIAI MÓDSZEREK 2 FLUORESZCENCIÁN ALAPULÓ MODERN MIKROSZKÓPIAI MÓDSZEREK. Fluoreszcencia mikroszkópia

TDK lehetőségek az MTA TTK Enzimológiai Intézetben

Röntgen-gamma spektrometria

Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen

Az immunrendszer működésében résztvevő sejtek Erdei Anna Immunológiai Tanszék ELTE

Műszeres analitika II. (TKBE0532)

Abszorpció, emlékeztetõ

Az ellenanyagok orvosbiológiai. PhD kurzus 2011/2012 II. félév

2. Az élet egységei és a mikroszkóp A sejtek vizsgálati módszerei

Biofizika 2 Fizika-Biofizika

A szubmikronos anyagtudomány néhány eszköze. Havancsák Károly ELTE TTK Központi Kutató és Műszer Centrum július.

BIOFIZIKA. Metodika- 1. Liliom Károly. MTA TTK Enzimológiai Intézet

NUKLEINSAVAK. Nukleinsav: az élő szervezetek sejtmagvában és a citoplazmában található, az átöröklésben szerepet játszó, nagy molekulájú anyag

Biológiai módszerek alkalmazása környezeti hatások okozta terhelések kimutatására

Antigén, Antigén prezentáció

Optikai mikroszkópia. Bereznai Miklós SZTE Optika és Kvantumelektronikai Tanszék

Tartalomjegyzék. Emlékeztetõ. Emlékeztetõ. Spektroszkópia. Fényelnyelés híg oldatokban A fény; Abszorpciós spektroszkópia

A lézer-szkenning citometria lehetőségei. Laser-scanning cytometer (LSC) Pásztázó citométer. Az áramlási citometria fő korlátai

A T sejt receptor (TCR) heterodimer

Fényérzékeny amorf nanokompozitok: technológia és alkalmazásuk a fotonikában. Csarnovics István

transzláció DNS RNS Fehérje A fehérjék jelenléte nélkülözhetetlen minden sejt számára: enzimek, szerkezeti fehérjék, transzportfehérjék

(1) A T sejtek aktiválása (2) Az ön reaktív T sejtek toleranciája. α lánc. β lánc. V α. V β. C β. C α.

Tartalomjegyzék. Emlékeztetõ. Emlékeztetõ. Spektroszkópia. Fényelnyelés híg oldatokban 4/11/2016. A fény; Abszorpciós spektroszkópia

A Földön előforduló sejtek (pro- és eukarioták) közös és eltérő tulajdonságai. A sejtes szerveződés evolúciója.

BIOKÉMIA. Simonné Prof. Dr. Sarkadi Livia egyetemi tanár.

Havancsák Károly Nagyfelbontású kétsugaras pásztázó elektronmikroszkóp az ELTÉ-n: lehetőségek, eddigi eredmények

A nanotechnológia mikroszkópja

A biológiai anyag vizsgálatának mikroszkópi módszerei

Havancsák Károly Az ELTE TTK kétsugaras pásztázó elektronmikroszkópja. Archeometriai műhely ELTE TTK 2013.

Tóth Mónika Ágnes PTE ÁOK Biofizikai Intézet Kereskedelmi forgalomban kapható készülékek

100 kérdés Optikából (a vizsgára való felkészülés segítésére)

FONTOS! a március 14-i előadás március 19-én (szombat) 9 h-kor lesz

Egyetemi doktori (PhD) értekezés tézisei. IL-2 és -15 receptorok kölcsönhatásainak vizsgálata humán T limfóma sejteken.

Immunológia I. 4. előadás. Kacskovics Imre

Nagyműszeres vegyész laboratórium programja. 8:15-8:25 Rövid vizuális ismerkedés a SEM laborral. (Havancsák Károly)

sejt működés jovo.notebook March 13, 2018

Az intraorális lenyomatvételi eljárások matematikai / informatikai háttere

Mézerek és lézerek. Berta Miklós SZE, Fizika és Kémia Tsz november 19.

Biomolekuláris rendszerek. vizsgálata. Semmelweis Egyetem. Osváth Szabolcs

-Két fő korlát: - asztrogliák rendkívüli morfológiája -Ca szignálok értelmezési nehézségei

AZ ÉLET KÉMIÁJA... ÉLŐ ANYAG SZERVEZETI ALAPEGYSÉGE

Immunológia alapjai. 10. előadás. Komplement rendszer

Az áramlási citometria gyakorlati alkalmazása az ondó rutin analízisben. Hajnal Ágnes, Dr Mikus Endre, Dr Venekeiné Losonczi Olga

Poligénes v. kantitatív öröklődés

A nukleinsavak polimer vegyületek. Mint polimerek, monomerekből épülnek fel, melyeket nukleotidoknak nevezünk.

Szerves oldott anyagok molekuláris spektroszkópiájának alapjai

Biomolekuláris rendszerek vizsgálata

Történeti áttekintés

Quanta 3D SEM/FIB Kétsugaras pásztázó elektronmikroszkóp. Havancsák Károly

VIII. Magyar Sejtanalitikai Konferencia Fény a kutatásban és a diagnosztikában

f r homorú tükör gyűjtőlencse O F C F f

A citoszol szolubilis fehérjéi. A citoplazma matrix (citoszol) Caspase /Kaszpáz/ 1. Enzimek. - Organellumok nélküli citoplazma

A mikroszkópok felépítése és használata

ALKÍMIA MA Az anyagról mai szemmel, a régiek megszállottságával.

Lumineszcencia alapjelenségek

Receptorok és szignalizációs mechanizmusok

Fényérzékeny molekulák, fényenergia hasznosítás


A fény mint elektromágneses hullám és mint fényrészecske

Biofizika I

Átírás:

Dr. Vámosi György Mozgékony molekulák vizsgálata modern mikroszkópiával Debreceni Egyetem ÁOK Biofizikai és Sejtbiológiai Intézet Debrecen, 2015. nov. 25. www.meetthescientist.hu 1 26

Fulbright ösztöndíj 2014-15 Prof. Nagy László Sanford Burnham Prebys Orvosi Kutatóintézet, Lake Nona (Orlando) Florida www.meetthescientist.hu 2 26

DNS kódtól a fehérjékig DNS Fehérje Génátíródás (mrns) gén A sejtek genetikai anyaga, a sejtmagban elhelyezkedő DNS hordozza a sejt felépítését és működését irányító információkat A DNS egységei a gének, melyek fehérjéket kódolnak (meghatározzák aminosav sorrendjüket, ezáltal felépítésüket) Egy gén DNS-éről másolat készül (mrns), majd fehérje A fehérjék a sejt működésében különféle feladatokat látnak el, pl. biokémiai folyamatokat katalizálnak (enzimek), a sejt vázát építik fel, külső ingerekre reagálnak (receptorok), a gének működését szabályozzák (transzkripciós faktorok), stb. A különböző sejttípusokban (ideg, izom, hám, stb.) részben más-más fehérjék vannak jelen A fehérjék termelődése szigorúan szabályozott, a sejt típusának és pillanatnyi igényeinek, állapotának megfelelően 3 26

Jelátvitel a sejtekben Jel molekula (ligandum, pl. hormon) Jelfogó antenna Receptor Sejtplazma Sejtmag DNS Sejtmembrán Fehérje szintézis Génátíródás (mrns) A sejt mint automata: külső jelekre, ingerekre (input) megváltozott működéssel (output) válaszol Jel: ligandum, pl. egy hormon Jelfogó: sejtfelszíni receptor fehérje Jel továbbítás: - kölcsönható fehérjék láncolatán keresztül - gén átíródás, mrns másolat keletkezése adott génekről fehérjék előállítása az mrns templát alapján Sejtválasz: megváltozott sejtműködés, pl. sejtosztódás beindulása, sejthalál, sejt aktiváció, stb. 4 26

Fő kutatási területeink A jelátviteli folyamatokban résztvevő különféle fehérjék nem magányosan, hanem egymással összekapcsolódva, ún. komplexeket alkotva működnek Biofizikai, mikroszkópos módszerekkel vizsgáljuk a jelátvitelben szerepet játszó fehérje-komplexek összeszerelődését, működését a sejtmembránban és a sejtmagban Vizsgált fehérjék: Az immunrendszer T sejtjeinek működését szabályozó membrán receptorok (interleukin-2/15 receptor) A gének működését szabályozó fehérjék (transzkripciós faktorok: pl. cfos-cjun, magreceptorok) 5 26

Mikroszkópia mikrosz = kicsi, szkopeo = nézni Mikroszkópia célja: láthatóvá tegye a vizsgált minta szabad szemmel nem kivehető részleteit. nagyított kontrasztos jó felbontású (részletgazdag) képet állítson elő legkisebb feloldható távolság fénymikroszkópnál kb. 200 nm (0,2 μm) A hagyományos fénymikroszkópia láthatóvá tudja tenni a baktériumokat, az eukarióta sejtek sejtszervecskéit (organellumokat), de a biológiai makromolekulák szerkezetét nem Szabad szemmel fénymikroszkóppal elektronmikroszkóppal 6 26

A mikroszkóp nagyítása és felbontása: mi a különbség? Nagyítás: hányszor nagyobb a kép, mint a tárgy eredeti mérete? Felbontás: mekkora annak a két tárgypontnak a távolsága, melyeket még éppen meg tudunk különböztetni egymástól? Hasznos nagyítás: a kép részletgazdagabb 7 26 Üres nagyítás: nem látunk több részletet

Mikroszkóp képalkotása f ob f ob tárgy d Valódi kép Fényérzékeny detektor, pl. CCD kamera objektív Képalkotás: a minta egy pontjából kiinduló fénysugarakat az objektív lencse egy pontban foltban gyűjti össze, létrehozva a tárgy képét a fényérzékeny detektoron 8 26

A mikroszkóp felbontásának korlátja pontszerű tárgy f f és képe A fény hullámtermészete miatt a fénynyaláb nem fókuszálható egyetlen pontba a pontszerű tárgy képe nem pontszerű, hanem kiterjedt mintázat ez határt szab a felbontásnak Objektív lencse Két tárgypont képe akkor különül le, ha a mintázatok középső maximumai nem fednek át d~200 nm d<200 nm Legkisebb feloldható távolság: d min λ 200 nm = 0.2µ m 2 ez a milliméter 5000-ed része λ: a fény hullámhossza (~400 nm), a két pont még éppen elkülöníthető a két pont nem különíthető el 9 26

Fluoreszcencia A vizsgálandó molekulákat festékkel megjelöljük, így azok fluoreszcens mikroszkóppal megjeleníthetőek fluoreszcein molekula Fluoreszcencia: foton (fény) kibocsátása foton elnyelését követően zöld fluoreszcens fehérje (GFP) Aqueora victoria (2008 kémiai Nobel-díj) 10 26

Fluoreszcencia mikroszkóppal készített kép Konfokális lézer pásztázó mikroszkóppal készített kép Hagyományos fluoreszcens mikroszkóp: A minta különböző z mélységeiből érkező fotonok egymásra vetülnek Mélységélesség: 2-3 μm elmosódott kép Oldalirányú felbontás: 0,2 μm Konfokális lézer pásztázó mikroszkóp: A minta pontonkénti pásztázása Egy tűlyuk apertúra csak a fókuszsíkból származó fényt engedi a detektorra vékony szelet leképezése Mélységélesség: 0.5 μm élesebb kép Oldalirányú felbontás: 0,2 μm 11 26

3D rekonstrukció az optikai szeletekből Kék: ölő sejt Zöld: célsejt www.meetthescientist.hu 12 26

3D rekonstrukció az optikai szeletekből Kék: ölő sejt Zöld: célsejt www.meetthescientist.hu 13 26

3D rekonstrukció az optikai szeletekből Kék: ölő sejt Zöld: célsejt ölő T sejt T sejt receptor Antigén Antigént bemutató célsejt http://biweb2.bi.technion.ac.il/faculty_websites /reiter/tcr-peptide-mhc%20interaction.htm www.meetthescientist.hu 14 26

A konfokális mikroszkóp felbontása (200 nm) nem elegendő a molekulakomplexek szerkezetének vizsgálatára Hogyan javítható a felbontás? 15 26

A szuperfelbontású mikroszkópiák kifejlesztői: 2014 kémiai Nobel-díjasai Eric Betzig Howard Hughes Medical Institute Stefan W. Hell Max-Planck-Institut William E. Moerner Stanford University A 2014-es kémiai Nobel-díjat Eric Betzig, Stefan W. Hell és William E. Moerner kapta a szuperfelbontású fluoreszcencia mikroszkópia kifejlesztéséért. 16 26

A szuperfelbontású STED mikroszkópia elve: stimulált fényemisszión alapuló kiürítés A gerjesztett folt méretének csökkentése gerjesztés 200 nm STED nyaláb Kiürítés (STED) gerjesztés kiürítés Megmaradó folt: 20 nm SW Hell, 1994, Optics Letters alapján http://zeiss-campus.magnet.fsu.edu alapján www.meetthescientist.hu 17 26

Interleukin-15 receptor α eloszlása T sejt felszínén Konfokális kép STED kép Mocsár Gábor 1 μm Volkó Julianna www.meetthescientist.hu 18 26

Távolságok mérése molekuláris vonalzóval: fluoreszcencia rezonancia energia transzfer (FRET) Energiaátadás két festék között, ha a R < 10 nm molekuláris kölcsönhatások térképezése, távolságbecslés Donorral jelzett fehérje eloszlása hν hν D FRET A hν Akceptorral jelzett fehérje eloszlása 2-10 nm E 0 100% FRET térkép 0.5 R 0 R 19 26

Molekulák mozgékonyságságának mérése: Fluoreszcencia korrelációs spektroszkópia (FCS) V 0.2 μm 3 Megvilágított térfogat A fókuszon áthaladó molekula fluoreszcencia ingadozást okoz Megméri, átlagosan mennyi idő alatt halad át a molekula a fókuszon F(t) Gyors szabad molekula Lassú kötött állapotú molekula idő 20 26

Egyedi molekula nyomkövetés aranygömb receptor sejtmembrán Akihiro Kusumi www.meetthescientist.hu 21 26

Mikroszkóp régen és ma van Leeuwenhoek mikroszkópja 1670 körül Olympus lézer pásztázó mikroszkóp, Debreceni Egyetem www.meetthescientist.hu 22 26

Alkalmazások A T sejt aktivációért és az immunológiai memória kialakításáért felelős membrán receptorok összeszerelődése cfos onkogén fehérje homodimerizációja (két azonos molekula összekapcsolódása), kötődése a DNS-hez Lehetséges szerep tumorok kialakulásában Génműködést szabályozó magreceptor fehérjék aktivációja www.meetthescientist.hu 23 26

Floridai őslakosok www.meetthescientist.hu 24 26

Kennedy Space Center www.meetthescientist.hu 25 26

www.meetthescientist.hu Karácsonyi hangulat Orlandóban

Köszönöm szépen a figyelmet! www.meetthescientist.hu 27 26