9. Szilárdfázisú szintézisek. oligopeptidek, oligonukleotidok
|
|
|
- Tamás Dudás
- 6 évvel ezelőtt
- Látták:
Átírás
1 9. Szilárdfázisú szintézisek oligopeptidek, oligonukleotidok
2 Peptidszintézis Amidkötés kialakítása R H + H 2 Q R Q + H 2 H R H + H 2 Q R + H 3 Q sav-bázis reakció már nem nukleofil
3 Amidkötés kialakítása A karbonsavat aktiválni kell R X + H 2 Q R H Q + HX X = jó távozó csoport X = klorid, anhidrid, aktív észter
4 Dipeptid szintézis H 2 CH C H H 2 CH C H CH 3 H Alanin Glicin C ezeket összekeverve és aktiválószert hozzáadva Ala-Ala; Ala-Gly; Gly-Gly; Gly-Ala Az Ala-CH reagáljon az H 2 -Gly- vel Az H2-Ala és Gly-CH inert legyen védõcsoportok
5 Védőcsoportok -terminális és amino-védőcsoportok (a teljesség igénye nélkül) tercier-butil-oxi-karbonil (Boc) savra érzékeny pl. trifluorecet sav (TFA) fluorenil-metil-oxi-karbonil (Fmoc) bázisra érzékeny pl. piperidin
6 Védőcsoportok C-terminális és karboxil-védőcsoportok H tercier-butil-észter (tbu) savra érzékeny pl. trifluorecet sav (TFA) H benzil-észter (Bn) H 2 / Pd / C
7 Védőcsoportok Egyéb, oldallánc-védőcsoportok (Cys, Tyr, Ser, Thr) Trifenil-metil (Tritil, Trt) savra érzékeny pl. trifluorecet sav (TFA) benzil (Bn) tercier-butil (tbu) H 2 / Pd / C savra érzékeny pl. trifluorecet sav (TFA)
8 -CH aktiválás Aktív észterré alakítás (in situ)
9 -CH aktiválás Aktív észterré alakítás (in situ) Átészterezés hidroxibenztriazol okkal (kevesebb racemizáció)
10 Aktiválás a gyakorlatban karbodiimid + triazol együtt DCC DIC EDC (EDAC)
11 ldatfázisú vs. Szilárdfázisú szintézis oldat lcsóbb Homogén agyobb mennyiségekre, rövidebb peptidekre Lassú em automatizálható szilárd Drága, pazarló Heterogén Kisebb mennyiségre, hosszabb szekvenciákra Gyors Könnyű tisztítás automatizálható
12 Szilárd hordozók (gyanták) Két fő technika (Fmoc/tBu; Boc/Bn) Boc/Bn : Merrifield gyanta (polisztirol / divinil benzol) Fmoc/tBu : Wang gyanta (p-hidroxibenzil alkohol / polisztirol) egyéb gyanták : amid végű, hasíthatóság stb.
13 Szilárd hordozók (gyanták) Stabil legyen, kémiailag ellenálló Duzzadóképesség jól átjárható legyen Az első aminosavat rá lehessen kapcsolni A szintézis végén le lehessen hasítani
14 Az első aminosav kapcsolása Eltér a többitől (lánchosszabbítás) A CH-csoporton keresztül történik A szilárdfázisú peptidszintézis során C felé haladunk! A szintézis végén le lehessen hasítani
15 Szintézis első aminosav felkapcsolása -védett elsõ aminosav gyanta BocH CH 2 C H H KF BocH CH 2 C
16 Védőcsoport eltolítás (terminális) BocH CH 2 C 1. védõcsoport eltávolítás (TFA) H 2 CH 2 C szabaddá váló -terminális
17 Második aminosav felkapcsolása Gly-gyanta H 2 CH 2 C BocH CH C CH 3 H 2. Második, -terminálisán védett aminosav (Boc-Ala)+ aktiválószer (DIC / HBt) BocH CH C H CH 2 C CH 3 Boc-Ala-Gly-gyanta
18 1. Védőcsoport eltávolítás 2. Boc-aminosav kapcsolása 3. Egy-egy kapcsolás hatékonysága ~99% 4. Csak 20 aminosav után nő meg a rövidebb peptidek száma jelentősen 5. Kapcsolások hatákonysága színreakcióval ellenőrizhető Lánchosszabítás BocH BocH BocH BocH Lys Val Val Ala Asp Lys Val Ala Gly 1. TFA 2. Boc-Val Gly 1. TFA 2. Boc-Lys Ala Ala Gly 1. TFA 2. Boc-Asp Gly
19 Kész peptid a gyantán Boc/Bn stratégia a kész peptid lehasítása a gyantáról és az összes védőcsoport eltávolítása (HF speciális berendezés) Fmoc/tBu stratégia: -terminális Fmoc lehasítása utána a peptid és a többi oldallánc védőcsoport lehasítása egyben TFA-val A kész peptid tisztítása HPLC-vel, (HPLC-MS) Hosszabb peptidek szintézise fragmeskondenzációval (rövidebb szakaszok szilárd fázison, majd ezeket oldatban kapcsolják össze megfelelő védőcsoportok kombinációja szükséges)
20 em természetes aminosavak H 2 CH C H H 2 CH C H C CH 2 H 2 C CH 2 CH Propargil glicin 3 Azidoetil-glicin H 2 CH C H H 2 CH C H H 2 C CH 2 Fluoreszcens aminsoav CH 2 Me I I-Phe 20
21 ligopeptidek módosításai Zsírsavakat kapcsolhatunk hozzá (lipoproteinek, lipopeptidek) Biotint kapcsolhatunk hozzá Gyógyszerhatóanyagot Szerves csoportokat pl. fémionokat komplexáló ligandumokat (PET jelzés) Ciklizálás (akár gyantán is) Automatizálás
22 Peptidek felhasználása Membránfehérjék modellezése (lipopeptidekkel) Assay készítés (biotinilált peptidek) Szállítópeptidek (gyógyszerek irányított célbajuttatása) Gyógyszerhatóanyagok szintézise (epitópok) Kombinatorikus szintézis
23 Furka Árpád Kombinatorikus peptidszintézis
24 ligonukleotidok szintézise A nukleozid 3 / 5 foszfátok nem eléggé reaktívak 3 --foszforamidit származékok A többi funkciós csoportot inaktiválni kell (védőcsoportok) A származékok kereskedelmi forgalomban beszerezhetők
25 Védőcsoportok 5 -hidroxil csoport dimetoxi tritil (DMT) savérzékeny T (U) nem igényel védőcsoportot A, da aminocsoportját Bz védőcsoporttal C, dc aminocsoportját Bz, vagy Ac védőcsoporttal G, dg, aminocsoportját izobutiril csoporttal védik A foszfit csoportot cianoetillel védik A DMT kivételével bázisra érzékenyek A származékok kereskedelmi forgalomban beszerezhetők
26 Védőcsoportok
27 Védőcsoportok
28 Szintetikus ciklus 5 -véghez kapcsolódik a következő nukleotid 5 -DMT csoport eltávolítása, az 5 H szabaddá válik A következő, 5 -DMT nukleotid kapcsolása (tetrazol reagenssel) A kevés (<1%) elreagálatlan 5-H t deaktiválják (capping) Ac 2 -val Az új foszfit-triésztert (P(III)) oxidálni kell (nem stabil), meg nem is ez van a nukleinsavakban pl. I 2 /víz Hordozó: polisztirol (makropórusos), vagy üveg (controlled pore glass, CPG)
29 Szintetikus ciklus
30 LIGUKLETIDK UTÓKEZELÉSE Védőcsoportok eltávolítása, hordozóról való lehasítás A lúg hatására lehasad: -védőcsoportok a bázisokról - β-cianoetil csoport a fosztátról - oligo a hordozóról - Liofilezés, sómentesítés - Tisztítás: HPLC (méret szerint, ioncsere)
31 LIGUKLETIDK: FELHASZÁLÁSI TERÜLETEK - primerek: DS, RS szekvenálás, PCR, mutagenezis -linkerek: mesterséges hasítóhelyek bevitele - adapterek: különböző (nem-kompatibilis) ragadós DS végek összekötése, esetleg hasítóhely bevitelével - hibridizációs próbák, DS diagnosztika - géndarabok - egyéb, pl. DS affinitásoszlopok készítése, stb.
32 ligonukleotid módosítások - Azid / acetilén linkert tartalmazó (klikk-kémia) - Tiol-linker (pl. arany felszínhez) - Biotin linker - Fluoreszcens módosítások (pl. molecular beaconhez) - géndarabok - egyéb, pl. DS affinitásoszlopok készítése, stb. - nem természetes nukleotidok beépítése
33 ligonukleotid módosítások H Me 2 D1 3' G C G C T C A A X A T A A T T A T C G G 5' X = D1: DA1 A: DA5 5' C G C G A G T T Y T A T T A A T A G C C 3' Y = D2: DA3 D3: DA4 A: DA2 5' C G C G A G T T A Y A T T A A T A G C C 3' Y = D2: DA6 D3: DA7 5' C G C G A G T T A T A T Y A A T A G C C 3' Y = D2: DA8 D3: DA9 H Et 2 3 S D2 H 3 S D3 Et 2
9. Szilárdfázisú szintézisek. oligopeptidek, oligonukleotidok
9. Szilárdfázisú szintézisek oligopeptidek, oligonukleotidok Peptidszintézis Amidkötés kialakítása R O OH + H 2 N Q R O Q N + H 2 O H R O OH + H 2 N Q R O O + H 3 N Q sav-bázis reakció már nem nukleofil
Peptidek (savamidok) szintézise. feladat: a szintéziskor elvben csak egy mól vizet kell elvonni peptidkötésenként, ám az ördög a részletekben rejlik.
Peptidek (savamidok) szintézise feladat: a szintéziskor elvben csak egy mól vizet kell elvonni peptidkötésenként, ám az ördög a részletekben rejlik. 1 avamidok (peptidek) szintézise és hidrolízise megfigyelés:
9. Előadás Fehérjék Előzmények Peptidkémia Analitikai kémia Protein kémia 1901 E.Fischer : Gly-Gly 1923 F. Pregl : Mikroanalitika 1952 Stein and Moore : Aminosav analizis 1932 Bergman és Zervas : Benziloxikarbonil
Szilárd fázisú peptidszintézis polisztirol-divinilbenzol gyantán
zilárd fázisú peptidszintézis polisztirol-divinilbenzol gyantán funkcionalizálás x x x els aminosav felkapcsolása W-H-CH 1 -C W-H-CH 1 -C W-H-CH 1 -C hasítás semlegesítés H 2 -CH 1 -C H 2 -CH 1 -C H 2
CHO CH 2 H 2 H HO H H O H OH OH OH H
2. Előadás A szénhidrátok kémiai reakciói, szénhidrátszármazékok Áttekintés 1. Redukció 2. xidáció 3. Észter képzés 4. Reakciók a karbonil atomon 4.1. iklusos félacetál képzés 4.2. Reakció N-nukleofillel
H 2 N CH COOH - H 2 O + + H 2 N CH CO HN CH COOH Q NH CH C NH 2 CH C OQ 2 -HX NH CH COOQ 2 NH CH COOH
8. Előadás Peptidek Peptid szintézis: a koncepció 1. Probléma 2 2 ' - 2 2, 2 2 2, ' ' Keverék, alacsony konverzió 2. Megoldás Q X 2 ' Q 2 -X Q Q 2 2 ' ' Egyféle termék, magas konverzió 3. Követelmények
Oligo- és polipeptidek:
ligo- és polipeptidek: 1) Amid kötés hidrolízise és szintézise 2) Amid kötés kialakítása: preparatív lehetőségek 2.1) savkloridok 2.2) savanhidridek 2.3) aktívészterek 3) Aminosavak összekapcsolása 4)
Modellpeptidek szintézise Hg(II) ion által katalizált bomlás vizsgálatához
Tudományos Diákköri Dolgozat SENDULA RÓBERT Modellpeptidek szintézise Hg(II) ion által katalizált bomlás vizsgálatához Témavezető: Süliné Dr. Vargha Helga Készült a ELTE - MTA Peptidkémiai Kutatócsoportjában
Alzheimer-kór diagnosztikájára alkalmas β-amiloid epitóp peptidet tartalmazó konjugátumok szintézise
TUDMÁNYS DIÁKKÖRI DLGZAT PETHŐ LILLA Alzheimer-kór diagnosztikájára alkalmas β-amiloid epitóp peptidet tartalmazó konjugátumok szintézise Témavezető: Dr. Mező Gábor tudományos tanácsadó ELTE Kémiai Intézet,
A sejtek élete. 5. Robotoló törpék és óriások Az aminosavak és fehérjék R C NH 2. C COOH 5.1. A fehérjeépítőaminosavak általános
A sejtek élete 5. Robotoló törpék és óriások Az aminosavak és fehérjék e csak nézd! Milyen protonátmenetes reakcióra képes egy aminosav? R 2 5.1. A fehérjeépítőaminosavak általános képlete 5.2. A legegyszerűbb
Fág könyvtárból kiválasztott peptidek alkalmazása irányító molekulaként a célzott tumorterápiában
Tudományos Diákköri Dolgozat KISS KRISZTINA Fág könyvtárból kiválasztott peptidek alkalmazása irányító molekulaként a célzott tumorterápiában Témavezető: Dr. Mező Gábor MTA-ELTE Peptidkémiai Kutatócsoport
ALKOHOLOK ÉS SZÁRMAZÉKAIK
ALKLK ÉS SZÁRMAZÉKAIK Levezetés R R alkohol R R R éter Elnevezés Nyíltláncú, telített alkoholok általános név: alkanol alkil-alkohol 2 2 2 metanol etanol propán-1-ol metil-alkohol etil-alkohol propil-alkohol
Aminosavak általános képlete NH 2. Csoportosítás: R oldallánc szerkezete alapján: Semleges. Esszenciális aminosavak
Aminosavak 1 Aminosavak általános képlete N 2 soportosítás: oldallánc szerkezete alapján: Apoláris Poláris Bázikus Savas Semleges Esszenciális aminosavak 2 (apoláris) Glicin Név Gly 3 Alanin Ala 3 3 Valin
A bórsavtól a lipofil karboránt tartalmazó peptidomimetikumokig
A bórsavtól a lipofil karboránt tartalmazó peptidomimetikumokig Egy "új" elem" " a növényvédelmi kémiában? Ujváry István MTA Növényvédelmi Kutatóintézete Bruckner-termi előadások,, 1999. október 29. ELTE,
Több oxigéntartalmú funkciós csoportot tartalmazó vegyületek
Több oxigéntartalmú funkciós csoportot tartalmazó vegyületek Hidroxikarbonsavak α-hidroxi karbonsavak -Glikolsav (kézkrémek) - Tejsav (tejtermékek, izomláz, fogszuvasodás) - Citromsav (citrusfélékben,
Biológiailag aktív peptidek oldékonyságának növelése oligoetilénglikol származékokkal
Bartos Ádám Biológiailag aktív peptidek oldékonyságának növelése oligoetilénglikol származékokkal Doktori (Ph.D.) értekezés tézisei Témavezetők: Dr. Uray Katalin Dr. Hudecz Ferenc MTA-ELTE Peptidkémiai
1. feladat (3 pont) Írjon példát olyan aminosav-párokra, amelyek részt vehetnek a következő kölcsönhatásokban
1. feladat (3 pont) Írjon példát olyan aminosav-párokra, amelyek részt vehetnek a következő kölcsönhatásokban a, diszulfidhíd (1 példa), b, hidrogénkötés (2 példa), c, töltés-töltés kölcsönhatás (2 példa)!
Biológiailag aktív peptidek oldékonyságának növelése oligoetilénglikol származékokkal
Biológiailag aktív peptidek oldékonyságának növelése oligoetilénglikol származékokkal Doktori értekezés Bartos Ádám Témavezetők: Dr. Uray Katalin Dr. Hudecz Ferenc MTA-ELTE Peptidkémiai Kutatócsoport ELTE
Oligo- és polipeptidek:
ligo- és polipeptidek: 1) Amid kötés hidrolízise és szintézise 2) Amid kötés kialakítása: preparatív lehetőségek 2.1) savkloridok 2.2) savanhidridek 2.3) aktívészterek 3) Aminosavak összekapcsolása 4)
AMINOSAVAK, PEPTIDEK, FEHÉRJÉK
AMISAVAK, PEPTIDEK, FEÉJÉK Aminosavak szerkezete, fizikai, kémiai tulajdonságai, biokémiai szerepük. Konvenció szerinti rövidítések. Aminosavak szintézise. A kötés szerkezete. Peptidszintézisek, védőcsoportok,
2. SZÉNSAVSZÁRMAZÉKOK. Szénsav: H 2 CO 3 Vízvesztéssel szén-dioxiddá alakul, a szén-dioxid a szénsav valódi anhidridje.
2. ZÉAVZÁMAZÉKK 2.1. zénsavszármazékok szerkezete, elnevezése zénsav: 2 3 Vízvesztéssel szén-dioxiddá alakul, a szén-dioxid a szénsav valódi anhidridje. 2 + 1. ábra: A szénsav szén-dioxid egyensúly A szén-dioxid
Fág könyvtárból kiválasztott irányító peptid szerkezetének optimálása célzott tumorterápiához
Tudományos Diákköri Dolgozat KISS KRISZTINA Fág könyvtárból kiválasztott irányító peptid szerkezetének optimálása célzott tumorterápiához Témavezető: Dr. Mező Gábor MTA-ELTE Peptidkémiai Kutatócsoport
Név: Pontszám: 1. feladat (3 pont) Írjon példát olyan aminosav-párokra, amelyek részt vehetnek a következő kölcsönhatásokban
1. feladat (3 pont) Írjon példát olyan aminosav-párokra, amelyek részt vehetnek a következő kölcsönhatásokban a, diszulfidhíd (1 példa), b, hidrogénkötés (2 példa), c, töltés-töltés kölcsönhatás (2 példa)!
3. Sejtalkotó molekulák III.
3. Sejtalkotó molekulák III. Fehérjék, fehérjeszintézis (transzkripció, transzláció, posztszintetikus módosítások). Enzimműködés 3.1 Fehérjék A genetikai információ egyik fő manifesztálódása Számos funkció
ZÁRÓJELENTÉS. OAc. COOMe. N Br
ZÁRÓJELETÉS A kutatás előzményeként az L-treoninból kiindulva előállított metil-[(2s,3r, R)-3-( acetoxi)etil-1-(3-bróm-4-metoxifenil)-4-oxoazetidin-2-karboxilát] 1a röntgendiffrakciós vizsgálatával bizonyítottuk,
AMINOKARBONILEZÉS ALKALMAZÁSA ÚJ SZTERÁNVÁZAS VEGYÜLETEK SZINTÉZISÉBEN
AMIKABILEZÉS ALKALMAZÁSA ÚJ SZTEÁVÁZAS VEGYÜLETEK SZITÉZISÉBE A Ph.D. DKTI ÉTEKEZÉS TÉZISEI Készítette: Takács Eszter okleveles vegyészmérnök Témavezető: Skodáné Dr. Földes ita egyetemi docens, az MTA
Mez Gábor. Peptidkémia
Mez Gábor Peptidkémia Tartalom TÖTÉNETI IDALMI ÁTTEKINTÉS... 3 TÁGYALT TÉMAKÖÖK... 6 AMINSAVAK ELFDULÁSA ÉS SZINTÉZISE... 7 AZ AMINSAVAK ÖVID BEMUTATÁSA... 8 VÉDSPTK... 19 NEM UETÁN TÍPUSÚ NH VÉDSPTK...
H H 2. ábra: A diazometán kötésszerkezete σ-kötések: fekete; π z -kötés: kék, π y -kötés: piros sp-hibrid magányos elektronpár: rózsaszín
3. DIAZ- ÉS DIAZÓIUMSPRTT TARTALMAZÓ VEGYÜLETEK 3.1. A diazometán A diazometán ( 2 2 ) egy erősen mérgező (rákkeltő), robbanékony gázhalmazállapotú anyag. 1. ábra: A diazometán határszerkezetei A diazometán
Doktori (Ph.D.) értekezés tézisei N-PEPTID-6-AMINO-D-LUCIFERIN KONJUGÁTUMOK OPTIMALIZÁLT SZINTÉZISMÓDSZEREI ÉS BIOLÓGIAI FELHASZNÁLÁSUK
Doktori (Ph.D.) értekezés tézisei N-PEPTID-6-AMINO-D-LUCIFERIN KONJUGÁTUMOK OPTIMALIZÁLT SZINTÉZISMÓDSZEREI ÉS BIOLÓGIAI FELHASZNÁLÁSUK KOVÁCS ANITA KÁRMEN TÉMAVEZETŐK: Prof. Dr. Tóth Gábor Dr. Puskás
Versenyző rajtszáma: 1. feladat
1. feladat / 5 pont Jelölje meg az alábbi vegyület valamennyi királis szénatomját, és adja meg ezek konfigurációját a Cahn Ingold Prelog (CIP) konvenció szerint! 2. feladat / 6 pont 1887-ben egy orosz
Az élő anyag szerkezeti egységei: víz, nukleinsavak, fehérjék. elrendeződés, rend, rendszer, periodikus ismétlődés
Az élő anyag szerkezeti egységei: víz, nukleinsavak, fehérjék Agócs Gergely 2013. december 3. kedd 10:00 11:40 1. Mit értünk élő anyag alatt? Az élő szervezetet felépítő anyagok. Az anyag azonban nem csupán
9. Előadás. Fehérjék
9. Előadás Fehérjék Előzmények Peptidkémia Analitikai kémia Protein kémia 1901 E. Fischer : Gly-Gly 1932 Max Bergman és Leonidas Zervas : Benziloxi-karbonil csoport 1963 B. Merrifield : Szilárd fázisú
Sipos Ferenc. Új PNS oligomerek és P-királis mononukleotidok szintézise és szerkezetvizsgálata. Doktori (Ph.D.) értekezés
Sipos Ferenc Új PS oligomerek és P-királis mononukleotidok szintézise és szerkezetvizsgálata Doktori (Ph.D.) értekezés Témavezető: Sági Gyula, C.Sc. MTA Kémiai Kutatóközpont, Bioekuláris Kémiai Intézet
2/ A kutatás során elért eredmények ismertetése (elméletek, módszerek, eljárások)
2/ A kutatás során elért eredmények ismertetése (elméletek, módszerek, eljárások) a/ β-amiloid antagonista peptidek előállítása Szilárdfázisú peptid szintézis módszert és Boc-stratégiát alkalmaztunk az
O S O. a konfiguráció nem változik O C CH 3 O
() ()-butanol [α] D = a konfiguráció nem változik () 6 4 ()--butil-tozilát [α] D = 1 a konfiguráció nem változik inverzió Na () () ()--butil-acetát [α] D = 7 ()--butil-acetát [α] D = - 7 1. Feladat: Milyen
Zárójelentés a Sonogashira reakció vizsgálata című 48657sz. OTKA Posztdoktori pályázathoz. Novák Zoltán, PhD.
Zárójelentés a Sonogashira reakció vizsgálata című 48657sz. OTKA Posztdoktori pályázathoz Novák Zoltán, PhD. A Sonogashira reakciót széles körben alkalmazzák szerves szintézisekben acetilénszármazékok
Aminosavak, peptidek, fehérjék. Szerkezet, előállítás, kémiai tulajdonság
Aminosavak, peptidek, fehérjék Szerkezet, előállítás, kémiai tulajdonság Aminosavak Aminosavaknak nevezzük azokat a karbonsavakat, amelyekben a szénlánc egy vagy több hidrogénjét amino (NH 2 ) csoportra
Aminosavak, peptidek, fehérjék
Aminosavak, peptidek, fehérjék Aminosavak NH 2, NH, N, N C Amino- és karboxilcsoport egy molekulában. H Csoportosítás - az amin rendűsége szerint (első, másod, harmad, negyedrendű) - az amino- és karboxil-csoportok
szerotonin idegi mûködésben szerpet játszó vegyület
3 2 2 3 2 3 2 3 2 2 3 3 1 amin 1 amin 2 amin 3 amin 2 3 3 2 3 1-aminobután butánamin n-butilamin 2-amino-2-metil-propán 2-metil-2-propánamin tercier-butilamin 1-metilamino-propán -metil-propánamin metil-propilamin
Szerves Kémia II. Dr. Patonay Tamás egyetemi tanár E 405 Tel:
Szerves Kémia II. TKBE0312 Előfeltétel: TKBE03 1 Szerves kémia I. Előadás: 2 óra/hét Dr. Patonay Tamás egyetemi tanár E 405 Tel: 22464 tpatonay@puma.unideb.hu A 2010/11. tanév tavaszi félévében az előadás
PET radiofarmakonok. PET-Radiofarmakonok
ejlődés s a radiofarmakológi giában II. PET radiofarmakonok Tóth Gyula 2013 C: Kovalens kötéssel kapcsolható a vivőmolekulához, Az élő szervezet számára a jelzett tracer megkülönböztethetetlen az eredeti
Bevezetés a biokémiába fogorvostan hallgatóknak Munkafüzet 4. hét
Bevezetés a biokémiába fogorvostan hallgatóknak Munkafüzet 4. hét Szerves kémia ismétlése, a szerves kémiai ismeretek gyakorlása a biokémiához Írták: Agócs Attila, Berente Zoltán, Gulyás Gergely, Jakus
Hatóanyag-peptid konjugátumok szintézise, jellemzése és biológiai aktivitásának vizsgálata glióma kultúrákon
Hatóanyag-peptid konjugátumok szintézise, jellemzése és biológiai aktivitásának vizsgálata glióma kultúrákon Baranyai Zsuzsa 1, Martin Krátký 2, Jarmila Vinšová 2, Matkó János 3, Bősze Szilvia 1 1 MTA-ELTE
Nitrogéntartalmú szerves vegyületek. 6. előadás
Nitrogéntartalmú szerves vegyületek 6. előadás Aminok Funkciós csoport: NH 2 (amino csoport) Az ammónia (NH 3 ) származékai Attól függően, hogy hány H-t cserélünk le, kapunk primer, szekundner és tercier
Szerves Kémiai Problémamegoldó Verseny
Szerves Kémiai Problémamegoldó Verseny 2015. április 24. Név: E-mail cím: Egyetem: Szak: Képzési szint: Évfolyam: Pontszám: Név: Pontszám: / 3 pont 1. feladat Egy C 4 H 10 O 3 összegképletű vegyület 0,1776
SZERVES KÉMIA ANYAGMÉRNÖK BSc NAPPALI TÖRZSANYAG MAKKEM229B
SZERVES KÉMIA ANYAGMÉRNÖK BSc NAPPALI TÖRZSANYAG MAKKEM229B TANTÁRGYI KOMMUNIKÁCIÓS DOSSZIÉ MISKOLCI EGYETEM MŰSZAKI ANYAGTUDOMÁNYI KAR KÉMIAI INTÉZET 2013/14. II. félév 1 Tartalomjegyzék 1. Tantárgyleírás,
4.3. Az AcLysSerProValValGluGly heptapeptid Al(III)-kötő sajátságának jellemzése
4.3. Az AcLysProValValGly heptapeptid Al(III)-kötő sajátságának jellemzése Az Al(III)fehérje kölcsönhatás megismerése céljából olyan neurofilamentum peptidfragmenst vizsgáltunk, mely az oldalláncban oxigén
9. Előadás. Peptidek,fehérjék
9. Előadás Peptidek,fehérjék Előzmények Peptidkémia Analitikai kémia Protein kémia 1901 E. Fischer : Gly-Gly 1932 Max Bergman és Leonidas Zervas : Benziloxi-karbonil csoport 1963 B. Merrifield : Szilárd
MEDICINÁLIS ALAPISMERETEK AZ ÉLŐ SZERVEZETEK KÉMIAI ÉPÍTŐKÖVEI AZ AMINOSAVAK ÉS FEHÉRJÉK 1. kulcsszó cím: Aminosavak
Modul cím: MEDICINÁLIS ALAPISMERETEK AZ ÉLŐ SZERVEZETEK KÉMIAI ÉPÍTŐKÖVEI AZ AMINOSAVAK ÉS FEHÉRJÉK 1. kulcsszó cím: Aminosavak Egy átlagos emberben 10-12 kg fehérje van, mely elsősorban a vázizomban található.
3. Sejtalkotó molekulák III. Fehérjék, enzimműködés, fehérjeszintézis (transzkripció, transzláció, poszt szintetikus módosítások)
3. Sejtalkotó molekulák III. Fehérjék, enzimműködés, fehérjeszintézis (transzkripció, transzláció, poszt szintetikus módosítások) 3.1 Fehérjék, enzimek A genetikai információ egyik fő manifesztálódása
Tartalomjegyzék...1. Rövidítésjegyzék...3. 1. Bevezetés...5. 1.1. Kalpain...5. 1.1.1. Kalpain enzimcsalád szerkezet...5
Tartalomjegyzék Tartalomjegyzék...1 Rövidítésjegyzék...3 1. Bevezetés...5 1.1. Kalpain...5 1.1.1. Kalpain enzimcsalád szerkezet...5 1.1.2. A kalpain enzimek aktiválása és ennek szabályozása...7 1.1.3.
Tienamicin-analóg 2-izoxacefémvázas vegyületek sztereoszelektív szintézise
Ph. D. ÉRTEKEZÉS TÉZISEI Tienamicin-analóg -izoxacefémvázas vegyületek sztereoszelektív szintézise Készítette: Sánta Zsuzsanna okl. vegyészmérnök Témavezető: Dr. yitrai József egyetemi tanár Készült a
Tumorellenes hatóanyagok irányított célbajuttatása peptidekkel
Tudományos Diákköri Dolgozat HEGEDÜS RÓZSA Tumorellenes hatóanyagok irányított célbajuttatása peptidekkel Témavezető: Dr.Mező Gábor tudományos tanácsadó Szerves KémiaiTanszék Eötvös Loránd Tudományegyetem
Tartalomjegyzék. Szénhidrogének... 1
Tartalomjegyzék Szénhidrogének... 1 Alkánok (Parafinok)... 1 A gyökök megnevezése... 2 Az elágazó szénláncú alkánok megnevezése... 3 Az alkánok izomériája... 4 Előállítás... 4 1) Szerves magnéziumvegyületekből...
Szerves Kémiai Problémamegoldó Verseny
Szerves Kémiai Problémamegoldó Verseny 2015. április 24. Név: E-mail cím: Egyetem: Szak: Képzési szint: Évfolyam: Pontszám: Név: Pontszám: / 3 pont 1. feladat Egy C 4 H 10 O 3 összegképletű vegyület 0,1776
transzláció DNS RNS Fehérje A fehérjék jelenléte nélkülözhetetlen minden sejt számára: enzimek, szerkezeti fehérjék, transzportfehérjék
Transzláció A molekuláris biológia centrális dogmája transzkripció transzláció DNS RNS Fehérje replikáció Reverz transzkriptáz A fehérjék jelenléte nélkülözhetetlen minden sejt számára: enzimek, szerkezeti
Enyedi Kata Nóra. Témavezetı: Dr. Mezı Gábor tudományos tanácsadó. Szerves Kémiai Tanszék
Tudományos Diákköri Dolgozat Enyedi Kata Nóra Urokináz plazminogén aktivátor receptor blokkoló peptidek szintézise és konjugálása. Témavezetı: Dr. Mezı Gábor tudományos tanácsadó Szerves Kémiai Tanszék
(11) Lajstromszám: E 007 404 (13) T2 EURÓPAI SZABADALOM SZÖVEGÉNEK FORDÍTÁSA
!HU0000074T2! (19) HU (11) Lajstromszám: E 007 4 (13) T2 MAGYAR KÖZTÁRSASÁG Magyar Szabadalmi Hivatal EURÓPAI SZABADALOM SZÖVEGÉNEK FORDÍTÁSA (21) Magyar ügyszám: E 03 7796 (22) A bejelentés napja: 03.
O 2 R-H 2 C-OH R-H 2 C-O-CH 2 -R R-HC=O
Funkciós csoportok, reakcióik II C 4 C 3 C 2 C 2 R- 2 C- R- 2 C--C 2 -R C 2 R-C= ALKLK, ÉTEREK Faszesz C 3 Toxikus 30ml vakság LD 50 értékek alkoholokra patkányokban LD 50 = A populáció 50%-ának elhullásához
!!"#$"! %"! &!!!!! '!()**+
!!"#$"! %"! &!!!!! '!()**+ Tartalomjegyzék I. Bevezetés.1 II. Irodalmi áttekintés... 2 II.1. A tuberkulózis.2 II.1.1. A Mycobacterium tuberculosis baktérium... 5 II.1.2. Az antituberkulotikumok és a tuberkulózis
C-GLIKOZIL HETEROCIKLUSOK ELŐÁLLÍTÁSA GLIKOGÉN FOSZFORILÁZ GÁTLÁSÁRA. Kun Sándor. Témavezető: Dr. Somsák László
Egyetemi doktori (Ph.D.) értekezés tézisei C-GLIKOZIL HETEROCIKLUSOK ELŐÁLLÍTÁSA GLIKOGÉN FOSZFORILÁZ GÁTLÁSÁRA Kun Sándor Témavezető: Dr. Somsák László DEBRECENI EGYETEM Kémiai Tudományok Doktori Iskola
Kétfogú N-donor ligandumok által irányított C-H aktiválási reakciók vizsgálata
Tudományos Diákköri Dolgozat ZWILLINGER MÁRTON Kétfogú N-donor ligandumok által irányított C-H aktiválási reakciók vizsgálata Témavezetők: Dr. Novák Zoltán, egyetemi adjunktus Dr. Kovács Szabolcs, tudományos
Budapest, augusztus 22. Dr. Nagy József egyetemi docens
SZERVES KÉMIA II. B.Sc. képzés, kód: BMEVESZA401 Tantárgy követelményei 2018/2019 tanév I. félév Az alaptárgy heti 3 óra előadásból áll. A tárgy szóbeli vizsgával zárul. A vizsgára bocsáthatóság feltétele:
IPARI ENZIMEK 2. Proteázok. Alkalikus proteázok. Pécs Miklós: Biotermék technológia 1. 6. fejezet: Ipari enzimek 2.
IPARI ENZIMEK 2 Proteázok A proteázok az ipari enzimek egyik legfontosabb csoportja (6200 t tiszta E/év) Peptid kötéseket bont (létrehoz) (hidrolízis, szintézis) Fehérje lebontás: élelmiszer, tejalvadás,
A fehérjék hierarchikus szerkezete
Fehérjék felosztása A fehérjék hierarchikus szerkezete Smeller László Semmelweis Egyetem Biofizikai és Sugárbiológiai Intézet Biológiai funkció alapján Enzimek (pl.: tripszin, citokróm-c ) Transzportfehérjék
Aminosavak, peptidek, fehérjék
Aminosavak, peptidek, fehérjék Az aminosavak a fehérjék építőkövei. A fehérjék felépítésében mindössze 20- féle aminosav vesz részt. Ezek általános képlete: Az aminosavakban, mint arra nevük is utal van
Doktori értekezés. Aminokinazolin és aminopirimidin. vegyülettárak előállítása szilárd hordozón
Doktori értekezés Aminokinazolin és aminopirimidin vegyülettárak előállítása szilárd hordozón Wéber Csaba Témavezető: Dr. Greiner István Richter Gedeon Rt. Kémiai és Biológiai Kutatási és Fejlesztési Főosztály
4. FEHÉRJÉK. 2. Vázanyagok. Az izmok alkotórésze (pl.: a miozin). Inak, izületek, csontok szerves komponensei, az ún. vázfehérjék (szkleroproteinek).
4. FEÉRJÉK 4.0. Bevezetés A fehérjék elsısorban α-l-aminosavakból felépülı biopolimerek. A csak α-laminosavakat tartalmazó fehérjék a proteinek. evüket a görög proteios szóból kapták, ami elsırangút jelent.
Szintetikus antigének és tumorellenes hatású biokonjugátumok szintézise és vizsgálata
Szintetikus antigének és tumorellenes hatású biokonjugátumok szintézise és vizsgálata Doktori értekezés Jakab Annamária Eötvös Loránd Tudományegyetem Kémia Doktori Iskola Dr. Inzelt György Doktori iskola
Aminosavak, peptidek, fehérjék
Aminosavak, peptidek, fehérjék Jelentőség Protein (Berzelius: protos, proteios) ligo- és polipepitdek (hormonok) Önmagában hormon és neurotranszmitter Aminosav bifunkciós vegyület Aminocsoport Karboxilcsoport
Tuftsin és tuftsin antagonista alkalmazása irányított tumorterápiára alkalmas konjugátumokban
TUDOMÁNYOS DIÁKKÖRI DOLGOZAT Tuftsin és tuftsin antagonista alkalmazása irányított tumorterápiára alkalmas konjugátumokban CZAKÓ ÉVA KRAM NASSIMA DOROTTYA Témavezető: Dr. Mező Gábor MTA-ELTE Peptidkémiai
6. Előadás Oligonukleotidok szintézise, koenzimek, vitaminok
6. Előadás ligonukleotidok szintézise, koenzimek, vitaminok ligonukleotidok szintézise Elv: ( ) 1. Kondenzáció 3 5 ( ) 5 - + (3 ) 2. Vízmentes közeg 3. Védőcsoportok Módszerek 1. Karbodiimid módszer, oldatban
Véralvadásgátló hatású pentaszacharidszulfonsav származék szintézise
Véralvadásgátló hatású pentaszacharidszulfonsav származék szintézise Varga Eszter IV. éves gyógyszerészhallgató DE-GYTK GYÓGYSZERÉSZI KÉMIAI TANSZÉK Témavezető: Dr. Borbás Anikó tanszékvezető, egyetemi
Osztályozó vizsgatételek. Kémia - 9. évfolyam - I. félév
Kémia - 9. évfolyam - I. félév 1. Atom felépítése (elemi részecskék), alaptörvények (elektronszerkezet kiépülésének szabályai). 2. A periódusos rendszer felépítése, periódusok és csoportok jellemzése.
KARBONSAV-SZÁRMAZÉKOK
KABNSAV-SZÁMAZÉKK Karbonsavszármazékok Karbonsavak H X Karbonsavszármazékok X Halogén Savhalogenid l Alkoxi Észter ' Amino Amid N '' ' Karboxilát Anhidrid Karbonsavhalogenidek Tulajdonságok: - színtelen,
Doktori értekezés. Kiss András László 2007. Témavezető: Polgár László professzor. 1. oldal
Doktori értekezés Kiss András László 2007 Témavezető: Polgár László professzor 1. oldal Acylaminoacyl peptidáz enzimek katalízisének vizsgálata A dolgozatot készítette: Biológia Doktori Iskola Szerkezeti
KARBONSAVAK. A) Nyílt láncú telített monokarbonsavak (zsírsavak) O OH. karboxilcsoport. Példák. pl. metánsav, etánsav, propánsav...
KABNSAVAK karboxilcsoport Példák A) Nyílt láncú telített monokarbonsavak (zsírsavak) "alkánsav" pl. metánsav, etánsav, propánsav... (nem használjuk) omológ sor hangyasav 3 2 2 2 valeriánsav 3 ecetsav 3
Bevezetés. Szénvegyületek kémiája Organogén elemek (C, H, O, N) Életerő (vis vitalis)
Szerves kémia Fontos tudnivalók Tárgy neve: Kémia alapjai I. Neptun kód: SBANKE1050 Előadó: Borzsák István C121 szerda 11-12 e-mail: iborzsak@ttk.nyme.hu http://www.bdf.hu/ttk/fldi/iborzsak/dokumentumok/
Helyettesített karbonsavak
elyettesített karbonsavak 1 elyettesített savak alogénezett savak idroxisavak xosavak Dikarbonsavak Aminosavak (és fehérjék, l. Természetes szerves vegyületek) 2 alogénezett savak R az R halogént tartalmaz
Genomika. Mutációk (SNP-k) és vizsgálatuk egyszerű módszerekkel. DNS szekvenálási eljárások. DNS ujjlenyomat (VNTR)
Genomika (A genom, génállomány vizsgálata) Mutációk (SNP-k) és vizsgálatuk egyszerű módszerekkel DNS szekvenálási eljárások DNS ujjlenyomat (VNTR) DNS chipek statikus és dinamikus információk vizsgálata
MÓDOSÍTOTT PEPTIDEK SZINTÉZISE DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI. Szolomájer-Csikós Orsolya. Témavezető: Prof. Dr. Tóth Gábor K. intézetvezető egyetemi tanár
MÓDSÍTTT PEPTIDEK SZINTÉZISE DKTRI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI Szolomájer-Csikós rsolya Témavezető: Prof. Dr. Tóth Gábor K. intézetvezető egyetemi tanár Kémia Doktori Iskola rvosi Vegytani Intézet Szegedi Tudományegyetem
CH 2 =CH-CH 2 -S-S-CH 2 -CH=CH 2
10. Előadás zerves vegyületek kénatommal Példák: ZEVE VEGYÜLETEK KÉATMMAL CH 2 =CH-CH 2 ---CH 2 -CH=CH 2 diallil-diszulfid (fokhagyma olaj) H H H szacharin merkapto-purin tiofén C H2 H szulfonamid (Ultraseptyl)
Citrátkör, terminális oxidáció, oxidatív foszforiláció
Citrátkör, terminális oxidáció, oxidatív foszforiláció A citrátkör jelentősége tápanyagok oxidációjának közös szakasza anyag- és energiaforgalom központja sejtek anyagcseréjében elosztórendszerként működik:
Aminosavak és aminok meghatározása biológiai és természetes mintákban, HPLC eljárással
Aminosavak és aminok meghatározása biológiai és természetes mintákban, HPLC eljárással Doktori értekezés Kőrös Ágnes Semmelweis Egyetem Gyógyszertudományok Doktori Iskola Témavezető: Perlné Dr. Molnár
HALOGÉNEZETT SZÉNHIDROGÉNEK
ALOGÉNEZETT SZÉNIDOGÉNEK Elnevezés Nyíltláncú, telített általános név: halogénalkán alkilhalogenid l 2 l 2 2 l klórmetán klóretán 1klórpropán l metilklorid etilklorid propilklorid 2klórpropán izopropilklorid
Fémionok szerepe az élő szervezetben: a bioszervetlen kémia alapjainak megismerése
Fémionok szerepe az élő szervezetben: a bioszervetlen kémia alapjainak megismerése Előadó: Lihi Norbert Debreceni Egyetem Szervetlen és Analitikai Kémiai Tanszék Bioszervetlen Kémiai Kutatócsoport A bioszervetlen
II. Szintézis és biológiai vizsgálatok
I. Bevezetés A támogatott kutatások célja a biológiai szabályozási és felismerési folyamatokban fontos szerepet játszó, negatív töltésű szénhidrátok szulfonsav-tartalmú analóg vegyületeinek előállítása
A fehérjék hierarchikus szerkezete
Fehérjék felosztása A fehérjék hierarchikus szerkezete Smeller László Semmelweis Egyetem Biofizikai és Sugárbiológiai Intézet Biológiai funkció alapján Enzimek (pl.: tripszin, citokróm-c ) Transzportfehérjék
Bioinformatika 2 5.. előad
5.. előad adás Prof. Poppe László BME Szerves Kémia és Technológia Tsz. Bioinformatika proteomika Előadás és gyakorlat 2009. 03. 21. Fehérje térszerkezet t megjelenítése A fehérjék meglehetősen összetett
Ragyogó molekulák: dióhéjban a fluoreszcenciáról és biológiai alkalmazásairól
Ragyogó molekulák: dióhéjban a fluoreszcenciáról és biológiai alkalmazásairól Kele Péter egyetemi adjunktus Lumineszcencia jelenségek Biolumineszcencia (biológiai folyamat, pl. luciferin-luciferáz) Kemilumineszcencia
Lehetőségek a tumorspecifikus irányító peptidek hatékonyságának növelésére
Lehetőségek a tumorspecifikus irányító peptidek hatékonyságának növelésére Kiss Krisztina 1, Szabó Rita 1, Kovács-Biri Beáta 1, Orosz Ádám 2, Mező Gábor 1 1 MT-ELTE Peptidkémiai Kutatócsoport 1 SE-ÁOK
Bevezetés a biokémiába fogorvostan hallgatóknak
Bevezetés a biokémiába fogorvostan hallgatóknak Munkafüzet 14. hét METABOLIZMUS III. LIPIDEK, ZSÍRSAVAK β-oxidációja Szerkesztette: Jakus Péter Név: Csoport: Dátum: Labor dolgozat kérdések 1.) ATP mennyiségének
Szénsavszármazékok 1
Szénsavszármazékok 1 2 xidációs fok: 4 savklorid savklorid észter észter észter l l l l H foszgén (metaszénsavdiklorid) alkil(aril)karbonokloridát klórhangyasav-észter dialkilkarbonát (nem létképes) savamid
Oligonukleotid kimérák szintézise, termikus és enzimatikus stabilitása
ligonukleotid kimérák szintézise, termikus és enzimatikus stabilitása Ph.D. értekezés Készítette: Bajor Zoltán Témavezető: Prof. Dr. Ötvös László Magyar Tudományos Akadémia Kémiai Kutatóközpont Kémiai
1. Tömegszámváltozás nélkül milyen részecskéket bocsáthatnak ki magukból a bomlékony atommagok?
A 2004/2005. tanévi Országos Középiskolai Tanulmányi Verseny első (iskolai) fordulójának feladatlapja KÉMIÁBÓL I-II. kategória I. FELADATSOR Az I. feladatsorban húsz kérdés szerepel. Minden kérdés után
Célcsoportok. + Ser, -NH 2. + (N-glikozid) α(n), Lys. etanol amin. + Ser, -COOH/-PO(OH) 2 Glu, Asp. zsírsavak. + primer, szekunder (O-glikozid)
élcsoportok Funkciós csoport Fehérjék zénhidrátok ukleinsavak Lipidek 2 α(), Lys (glikozid) er, etanol amin /P() 2 α(), Glu, Asp 5 er, zsírsavak er, Thr primer, szekunder (glikozid) szekunder 3 glicerin,
KÉMIA. 10. évfolyamos vizsga
10. évfolyamos vizsga A vizsga leírása: A vizsga csak szóbeli részből áll. A vizsgán két tételt kell húzni. Az A tétel a 9. évfolyam ismeretanyagára, a B tétel a 10. évfolyam ismeretanyagának a vizsga
KÉMIA. Általános érettségi tantárgyi vizsgakatalógus Splošna matura
Ljubljana 2015 KÉMIA Általános érettségi tantárgyi vizsgakatalógus Splošna matura A tantárgyi vizsgakatalógus a 2017. évi tavaszi vizsgaidőszaktól érvényes az új megjelenéséig. A katalógus érvényességéről
Detektorok tulajdonságai
DETEKTOROK A detektor feladata a kiáramló eluensben mérni az összetevő pillanatnyi koncentrációját. A közvetlenül mért detektorjel általában nem maga a koncentráció, hanem annak valamilyen függvénye. Detektor
Fémorganikus kémia 1
Fémorganikus kémia 1 A fémorganikus kémia tárgya a szerves fémvegyületek előállítása, szerkezetvizsgálata és kémiai reakcióik tanulmányozása A fémorganikus kémia fejlődése 1760 Cadet bisz(dimetil-arzén(iii))-oxid