A SERTÉSEK VÁLASZTÁSI HASMENÉSÉBŐL SZÁRMAZÓ 2173-AS ENTEROTOXIKUS ESHERICHIA COLI (ETEC) TÖRZS VIRULENCIA PLAZMIDJAINAK ANALÍZISE
|
|
- Veronika Fodorné
- 8 évvel ezelőtt
- Látták:
Átírás
1 A SERTÉSEK VÁLASZTÁSI HASMENÉSÉBŐL SZÁRMAZÓ 2173-AS ENTEROTOXIKUS ESHERICHIA COLI (ETEC) TÖRZS VIRULENCIA PLAZMIDJAINAK ANALÍZISE Doktori értekezés tézisei Fekete Péter Zsolt Eötvös Lóránd Tudományegyetem Természettudományi Kar Biológia Doktori Iskola vezető: Prof. Dr. Erdei Anna, MTA levelező tagja Klasszikus és molekuláris genetika doktori program vezető: Prof. Dr. Orosz László, MTA levelező tagja Témavezető: Prof. Dr. Nagy Béla, MTA rendes tagja MTA Állatorvostudományi Kutatóintézete Budapest, 2004.
2 BEVEZETÉS A sertések és szarvasmarhák kólibaktériumok okozta enterális fertőzései között az enterotoxikus Escherichia coli (ETEC) által előidézett megbetegedések a legelterjedtebbek, de gyakran szerepelnek ETEC törzsek humán hasmenéses esetek okozójaként is. A választott malacok hasmenését okozó ETEC baktériumok fimbriális adhezinjeik (F4, F18) révén a vékonybél hámsejtjeinek mikrobolyhaihoz képesek tapadni, ugyanakkor enterotoxinokat (STa, STb és/vagy LT)termelnek, melyek közvetlenül a felszívó bélhámsejtek folyadékszekrécióját erőteljesen serkentik.. Az ETEC virulencia tényezők (adhezinek és enterotoxinok) termelését többnyire plazmidokon található gének, géncsoportok irányítják. Az első leírt plazmidkódolt virulencia gének a humán-, sertés-, és szarvasmarha eredetű ETEC virulenciafaktor gének voltak. A patogén kólibaktériumok horizontális evolúciójában, változatosságának kialakításában több mobilis virulencia-elem: patogenitási sziget (PAI), bakteriofág, plazmid és transzpozon vesz részt. Az ETEC törzsek evolúciójának fontos tényezője, hogy a hőstabil enterotoxinok génjei többnyire transzpozonok (STa Tn1681; STb Tn4521) részei, valamint LT toxin esetében is leírtak a toxingén átvitelét segítő, IS elem közvetítette folyamatot. Szemben a Shigella és Yersinia törzsek virulenciaplazmidjaival, ETEC plazmidokon eddig nem írtak le olyan kb méretű nagyobb DNS szakaszokat, melyek több virulenciafaktorral járulnak hozzá a patogenitáshoz. A plazmidok fennmaradását két fontos tényező határozza meg: hány példányban van jelen (kópiaszám) és milyen más plazmidokkal együtt képes fennmaradni a citoplazmában (inkompatibilitás). Egyesek (pl. virulenciaplazmidok) akár csak egy kópiában vannak jelen, míg a nagy kópiaszámúakból baktériumsejtenként akár több száz is lehet. A patogenitási sziget meghatározás létrejöttéhez azon megfigyelés vezetett, hogy patogén baktériumok virulenciához köthető génjei a kromoszóma meghatározott részén a horizontális terjedést lehetővé tevő génekkel együtt külön régiót alkotnak. Patogenitási szigeteket (PAI) először extraintesztinális (közelebbről uropatogén) E. coli törzsekből írtak le, később azonban több enterális patotípusról, valamint egyéb baktérium fajról is kiderült, hogy a virulenciagénjeik ilyen patogenitási szigeteket alkotva helyezkednek el, többnyire a kromoszomán. A patogenitási szigetek olyan virulencia faktor géneket hordozó nagy méretű (10 kb-tól egészen 200 kb) DNS szakaszok melyek hiányoznak az ugyanazon vagy rokon baktériumfaj nem-patogén tagjaiból. G + C tartalmuk, kodon használatuk gyakran különbözik a környező régiókétól. Először kromoszomális elhelyezkedésben írták le, de egyre több adat szól amellett, hogy virulencia plazmidok egyes részei is patogenitási szigetként határozhatóak meg. A patogenitási szigeteket határoló direct repeat (azonos irányultságú) DR elemek a gazda genomba való rekombinációs 1
3 beépülés során képződnek, s az újabb átvitelt segítik. A patogenitási szigetek többnyire trns génekhez kapcsolódnak Gyakran hordoznak kriptikus vagy működő mobilitási faktor géneket: integrázokat, transzpozázokat, IS elem részeket. A patogenitási szigetek instabil régiók: átvitelük és/vagy deléciójuk könnyen bekövetkezhet a direct repeat végek, vagy más mobilis genetikai elemek segítségével. A választott malacok ETEC okozta hasmenése elleni védekezés terén igéretes új irányzatot képviselnek az élő orális vakcinák, Ahhoz, hogy egy orálisan alkalmazható vakcina sikeres legyen, szükséges, hogy a vakcina törzs a kórokozó törzsekhez hasonlóan a bélcsatornában jól el tudjon szaporodni (megtelepedjen), és hogy toxikus, vagy egyéb (bélboholy károsító) virulencia faktoroktól mentes legyen. Ilyen vakcina-jelölt törzsek előállításához pedig feltétel az ún. vad (virulens) törzsek virulencia génjeinek és az azokat hordozó mobilis genetikai elemek részletes ismerete. CÉLOK Munkám általános célja volt a 2173-as (O147:NM, Hly, F18ac, STa, STb) ETEC törzs (Nagy, B és mtsai J. Clin. Microbiol. 28, ) valamint más, választott sertések hasmenését okozó ETEC és ödéma betegséget okozó verotoxin-termelő Escherichia coli (VTEC) törzsek virulencia plazmidjainak analízise. Ezen belül célok voltak: 1. Az F18 fimbria géneket hordozó plazmidok jellemzése és genotipizálása az ún. replikontipizálás módszerével. 2. A 2173 törzs sta és stb enterotoxin génjeit valamint egy tetb tetraciklin rezisztenciagént hordozó ptc jelű plazmidjának genetikai analízise: elsősorban a ptc replikációs origójának és környezetének szekvenálása és molekuláris biológiai analízise. 3. A ptc plazmid sta és stb enterotoxin génjei közötti kapcsolat vizsgálata: annak felderítése, hogy rendelkezeik-e a ptc plazmid egy nagyobb -több virulenciagént magába foglaló- mobilis elemmel, amely a kromoszomálisan elhelyezkedő patogenitási szigetekhez mutat hasonlóságot? ANYAGOK ÉS MÓDSZEREK A nem részletezett molekuláris biológiai módszereket Maniatis, T., Fritsch, E. F., Sambrook, J., Molecular cloning: a laboratory manual. Cold Spring Harbor Laboratory Press, Second Edition, Cold Spring Harbor, New York, szerint végeztük. 2
4 F18 fimbriát kódoló plazmidok jellemzése és replikontipizálása A választási hasmenés vagy ödéma betegség következtében elhullott malacból származó 17 E. coli törzs kettő kivételével magyarországi izolátum volt. (Nagy és mtsai. 1990, 1997). A két külföldi törzs közül a 107/86 jelűt H. Bertschinger (Svájc), a 2228-as törzset pedig A. O Brien (USA) bocsátotta rendelkezésünkre. A törzsek patotípusát, O szerocsoportját valamint enterotoxin-, vero- (Shiga-) toxin génjeit és F18 fimbriáit Nagy és munkatársai (1990, 1997) határozták meg. Módosított Kado-Liu plazmid izolálás után a minták 40µl-ét 0,5% TAE garaóz gélben 40 V feszültségen legalább 16 óra elektroforetizáltuk. Elektroforézis után 0.25 M HCl oldattal 15 depurináltuk majd denaturálás (0,4 M NaOH és 0,6 M NaCl) és neutralizálás (0,1 M TRIS és 1,5 M NaCl ph=7) következett. Az előkészített gélt PHARMACIA gélszárító berendetéssel 10 alatt mintegy 2 mm vastagságúra szárítottuk a hibridizációt a szárított gélben végeztük. Előhibridizálást (15 ml 20x SSC, 1 ml (10mg/ml) heringsperma DNS, 1 g sovány tejpor, 0.5 ml 20% SDS 100 ml desztillált vízben) 1 órán keresztül 60 Cº-on végeztünk, majd ehhez az oldathoz adtuk hozzá a rep-próbákat (PHARMACIA Ready to Go DNA Labelling Kit -tel P 32 tartalmazó dctp-vel jelölve) és éjszakán át 60 Cº-on hibridizáltattuk. -Hibridizáció után a gélt desztillált vízzel öblítettük, majd röntgenfilmen (AGFA) 24 (48 illetve 72) órán keresztül -80 Cº-on exponáltunk. A 2173 ETEC törzs F18 fimbria plazmidjának konjugációs vizsgálata Az F18ac fimbria plazmid konjugációjakor a 2173 ETEC törzs NB 2/11 jelű származéka szolgált donorként. Recipiensként az XL1blue jelű K12 E. coli törzset használtuk. A donor és recipiens törzseket LB táplevesben egy éjszakán át növesztettük, majd mindkét tenyészetből µl-t LB agar lemezre cseppentve szélesztettünk és egy éjszakán át 37C o on növesztettük. A kinőtt baktériumszőnyeget lemezenként 5ml steril fiziológiás sóoldattal kémcsőbe átmosva és hígitási sort készítve szelektív LB agar lemezekre szélesztettünk. A transzkonjugánsokat tetraciklin tartalmú 5% juhvér tartalmú lemezeken szelektáltuk. A 2173 ETEC törzs ptc plazmidjának konjugációs vizsgálata TG1, HB101 és S17-1 E. coli K12 baktériumokat transzformáltunk CaCl 2 -os módszer szerint a ptc plazmiddal a konjugációs képességének vizsgálata céljából. A HB101 sem plazmid-mobilizációs sem plazmid átviteli funkciókat nem kódol, a TG1 kromoszómáján F plazmidot hordoz, konjugációs képesség hiányával, az S17-1 pedig a plazmid-mobilizációs funkciókért felelős géneket a kromoszómájára beépülve hordozza. Recipiens törzsekként a 2173 ptc mentes derivátumait (NB- 1/36, 2/2 és 2/11) használtuk. A transzkonjugánsokat tetraciklin tartalmú minimál (GTS) táptalajon szelektáltuk. 3
5 A ptc plazmid replikációs origójának klónozása A replikációs origó meghatározásához a ptc plazmidot BamHI restrikciós enzimmel emésztettük, majd az így nyert fragmenteket megtisztítva véletlenszerűen a paw302 plazmid szintén BamHI. enzimmel kivágott cat (kloramfenikol acetiltranszferáz) génjéhez ligáltuk. Az így nyert deléciós ptc származékokat TG1 K12 törzsbe transzformáltuk. A transzformáns baktériumok csak abban az esetben szaporodtak, ha a cat gén a ptc replikációs origóját hordozó szakaszhoz kapcsolódott. A kloramfenikol tartalmú LB agaron nőtt telepből plazmid DNS-t tisztítottunk; a plazmidkonstrukció a ppfe1 jelölést kapta. Restrikciós enzimekkel végzett fizikai térképezés után megkezdtük az origót tartalmazó fragment szekvenálását. A megszekvenált 4761 bp-nyi szakasz nukleotid sorrendjét az EMBL Nucleotide Sequence Database adatbázisban AJ szám alatt helyeztük el. A ptc plazmid stabilitásának vizsgálata Plazmid-szegregációs kisérleteink során HB101 baktériumokat transzformáltunk cole1 típusú replikációs origóval rendelkező plazmidokkal az alábbi kombinációk szerint: pembl19 (Amp R ), pfol5 (Cm R ) ptc (Tc R ), pembl19 (Amp R ), pfol5 (Cm R ) ppfe2 (Km R ), pembl19 (Amp R ), pfol5 (Cm R ) ppfe2 (Km R ), ptc (Tc R ), pembl19 (Amp R ) A plazmidokat tartalmazó baktériumok egy-egy telepét LB levesbe oltottuk, majd 5-ször 37C o -os éjszakán át tartó tenyésztés után továbboltottuk. Az adott plazmidot hordozó telepek számát minden passzálási lépés után meghatároztuk (antibiotikumtartalmú LB agar lemezeken). A plazmidokra jellemző antibiotikum-rezisztencia mintázat eltűnését szegregációs eseményként értelmeztük. Toxin specifikus lókusz (TSL) meghatározása a ptc plazmidon DNS szekvencia meghatározást mind a ptc-, mind a pakr2 plazmid esetében a (QIAGEN Plasmid Maxi kit segítségével tisztított) emésztetlen teljes plazmidon végeztünk ABI PRISM 310 Genetic Analyzer valamint LI-COR DNA Sequencer model 400 automated sequencer készülékek felhasználásával primer walking módszerrel. Szekvencia analízisre az NCBI BLAST szoftvercsomag blastx (BLAST Nucleotide query - Protein db), blastn (standard nucleotidenucleotide BLAST) és BLAST 2 Sequences similarity search szoftvereket használtunk. A szekvenálási adatokból a TSL ptc konszenzus szekvenciáját a BioEdit szoftver csomag CAP Contig assembly illetve ClustalW programjaival állítottuk össze. Nyílt leolvasási keretek (ORF) keresésére valamint a 9872bp hosszú TSL ptc fizikai térképének megszerkesztésére a Vector NTI6 programot használtuk. A TSL ptc teljes nukleotid sorrendjét az EMBL Nucleotide Sequence Database adatbázisban AJ szám alatt helyeztük el. A TSL ptc transzpozíciójának vizsgálata Kisérleteink során TG1 K12 törzset transzformáltunk előbb a ptc (cole1 replikációs origó) majd a pacyc177 (p15 replikációs origó) plazmiddal. A Tc R, Amp R, Km R fenotípust mutató telepek közül 4
6 egyet 3ml LB levesbe oltva azt rázatás nélkül 37C o -on egy éjszakán át inkubáltuk, mely időtartam alatt a két plazmid közötti véletlenszerű transzpozíciós esemény bekövetkeztét vártuk. A konjugációs donorként használt hibrid -plazmidokat is tartalmazó TG1 törzset ampicillin és kanamicin tartalmú, valamint a recipiens J5-3 egy éjszakás tenyészetének µl-ét antibiotikummentes LB agar lemezen összecsöppentve szélesztettük, majd 37 C -on egy éjszakán át növesztettük. A kinőtt baktérium szőnyeget 5ml fiziológiás sóoldattal lemostuk, majd ebből közötti hígitásokat készítettünk. A hígitási lépések µl-ét ampicillin, kanamicin és rifampicin tartalmú LB agar lemezekre szélesztettük. Egy éjszakás 37 C -os növesztés után az Amp R, Km R, Rif R telepeket vizsgálva azok között tetraciklin érzékeny (Tet S ) fenotípusúakat kerestünk. A további vizsgálatokra az AKR1, AKR2, AKR3 jelű telepeket találtuk alkalmasnak. A pakr2 transzpozíciós termék részleges szekvenálásával (AO1 ill. OK2 primerek alkalmazásával) a 40kb-nyi mobilis genetikai elem mindkét végén IS10 elemet azonosítottunk, jelezvén, hogy a vizsgált elem végeit IS10 inszerciós szekvenciák határolják. Ezen adataink alátámasztják azon feltételezésünket, hogy a TSL ptc egy nagyobb (40kb) patogenitási sziget része. A TSL ptc elterjedésének vizsgálata F4(K88 + ) és F18 + ETEC törzsekben A TSL stb gén és annak 5 határoló régiójának vizsgálatára az is1rev és stbrev jelű primerpárt alkalmaztuk. A vizsgált törzsek részben Magyarországról és Ausztriából (12) részben az Amerikai Egyesült Államokból (12) származtak EREDMÉNYEK ÉS MEGVITATÁS Patogén E. coli baktériumok számos virulencia génjét az F inkompatibilitási komplexbe tartozó univagy multireplikon plazmid kódolja. Az F18 fimbriát termelő enterotoxikus valamint verotoxikus E. coli törzsek adhéziós faktor génje plazmidokon található, de ezen plazmidok replikációs tulajdonságait még kevéssé vizsgálták. Vizsgálatainkal megerősítettük a F18 gének plazmidon történő kódolását, és első ízben határoztuk meg replikációs origójukat. A vizsgált törzsek többsége 3 nagy molekulatömegű plazmidot hordozott. Minden esetben egy nagy (>36 kb) plazmid sáv hibridizált a 107/86 törzsből PCR-el felerősített és radioaktívan jelölt (P 32 ) F18 próbával, jelezve, hogy mind az ETEC (F18ac) mind a VTEC (F18ab) törzsek adhezinjének génjét plazmidok hordozzák, beleértve a 107/86-os F18ab referencia törzset is. Az F18ab és F18ac plazmidok mérete nem volt egyforma. A különböző szerocsoportokba tartozó ETEC törzsek F18ac plazmidjaira hasonló méret volt jellemző (150 kb körül), mely hasonlóság felveti ezen adhezin plazmidok klonális eredetét, horizontális terjedésének lehetőségét. Ezzel szemben a VTEC törzsek adhezin plazmidjainak mérete ugyanazon szerocsoporton belül is kb között változott, jelezve, hogy a horizontális terjedés során esetenként nem teljes plazmidok, hanem csak az F18ab operont hordozó 5
7 egyes szakaszok juthattak át ezen törzsek különböző őshonos plazmidjaira. A replikontipizálási eredmények, melyek szerint az adhezin plazmidok a RepFI (vagy ezzel rokon) csoportba sorolhatók, az F18ac plazmidok közös eredetét támasztották alá. Az NB2/11 törzzsel végzett konjugációs vizsgálatok eredményei szerint a többnyire kromoszomális elhelyezkedésben vizsgált α-hemolizint az F18ac operonnal kapcsolva ugyanazon a nagy méretű, és kisérleteink szerint konjugatív plazmidon találtuk meg. Amíg a 2173 adhéziós tulajdonságáért valamint a hemolízisért az pf18 plazmid felelős, a választási hasmenést kialakító sta és stb enterotoxin géneket ezen ETEC törzs másik (ptc) jelű 120kb méretű virulenciaplazmidja hordozza. A ptc plazmid megismeréséhez szükséges volt megvizsgálni, hogy mennyire stabilan marad fenn a 2173 baktériumban, illetve, hogy stabilitásában milyen plazmidkompatibilitási mechanizmusok érvényesülnek. Ezért a ptc-ből két plazmid konstrukciót állítottunk elő: a ppfe1-et valamint a ppfe2-t. A ptc replikációs origóját a ppfe1 plazmidon szekvenáltuk, és megállapítottuk, hogy az módosult cole1 típusú, melynek Rom (szabályozó) fehérje génjében deléció van. Feltételezve, hogy a ptc origójának ezen rövidülése szerepet játszik a 2173 plazmid-háztartásának fenntartásában, szegregációs kisérletekkel vizsgáltuk a ptc, a ppfe2 illetve más, hibátlan cole1 origójú plazmidok (pembl19, pfol5) fennmaradását a HB101-es K12 törzsben. A baktériumtelepek rezisztenciaképe alapján összehasonlítva a teljes Rom fehérjét kódoló hagyományos cole1 origójú plazmidokkal, mintegy 50 osztódás után a ptc illetve kanamicin rezisztenciát kódoló ppfe2 származéka volt többségben. A ptc erősebb inkompatibilitási hatást mutatott: a telepek 97,55%-a a ptc-re jellemzően tetraciklin rezisztens volt. A ppfe2 plazmid esetében enyhébb az inkompatibilitási hatás. Mindazonáltal még így is a cole1 ptc origót hordozó plazmid maradt fenn, bár alacsonyabb számban. Ha a pembl19 mellé mindkét cole1 ptc origójú plazmidot bejuttattuk, akkor érdekes módon a ptc és ppfe2 együttes fennmaradását tapasztaltuk a pembl19 elvesztése mellett. Ez a úgy értelmezhető, hogy a ptc plazmidon található replikációt szabályozó gének termékei a ppfe2 origóját is, mint saját, ptc origót ismerik fel, s annak replikációjában mint transz regulátorok vesznek részt. Feltételezésünket, hogy a ptc nagyfokú stabilitását a rom génben észlelt deléció okozhatja, további kisérletekkel lehetne bizonyítani. Mint ismeretes az STa enterotoxin génje a Tn1681 jelű transzpozon része, az STb enterotoxin génje pedig a Tn4521 transzpozon része. Korábbi megfigyeléseink alapján, -ahol egyazon ETEC törzs STa és STb enterotoxint is termelt- feltételezhető volt a genetikai kapcsolat a két toxin gén, továbbá a toxin- és az adhezin géneket hordozó plazmidok között. Ezen genetikai kapcsolatra példa a ptc plazmid enterotoxin génjeinek szekvenálása során meghatározott 10kb méretű TSL ptc. A 9872 nukleotidnyi TSL szakasz szekvencia analízise alapján az sta és stb gének szekvenciája majdnem teljesen megegyezik a korábban leírtakkal. mindkét oldalán az irodalmi adatoknak megfelelően 6
8 Tn1681 transzpozonra specifikus szakaszokat találtunk, ezzel szemben az stb gént határoló szekvenciák teljesen különböztek a korábban megismertektől, mivel a TSL ptc stb génjének környezetében a Tn4521 transzpozonra jellemző defektív IS2 inszerciós elemekre utaló szekvenciákat nem találtunk. Az stb géntől upstream irányban közvetlenül teljes IS1 elem helyezkedik el, mely szoros kapcsoltság arra utal, hogy a TSL ptc stb génje egy IS1-alapú virulencia-transzpozon része, szemben a Tn4521 transzpozonnal. Vizsgálatainkkal a tetraciklin rezisztenciáért felelős tetb gén és a TSL között funkcionális kapcsolatot nem találtunk. Az stb től downstream irányban deléciós phev gén van, mely trns gén részleges deléciója utal a patogenitási szigetek integrációjakor végbemenő rekombinációra. Az sta és stb géneket hordozó TSL ptc szerkezete alapján szembetűnik a virulenciagéneket mindkét oldalról határoló több (teljes illetve defektív) mobilis genetikai elem melyek korábbi interbakteriális génkapcsolatokra utalnak. Ezek eredményeként a TSL szerkezete a patogenitási szigetek szerkezetével hasonlítható. A TSL-ben pl. más E. coli patotípusból illetve más Enterobacteriaceae fajból eredő gének is találhatók: az 536 UPEC törzs PAI I 536 patogenitási szigetének bizonyos részeivel és EHEC törzsek po157 virulenciaplazmidjának fragmentjeivel homológ szakaszok valamint Shigella flexneri sena génjének downstream szekvenciáival valamint a pwr100 virulencia plazmiddal homológ szakaszok. A ptc plazmid stb génjének analízise két pontmutációt tárt fel: a termelődő STb molekula 35. (az aktiv STb 12. -) aminosav pozíciójában hisztidin helyett aszparagin, valamint a 46. (az aktiv STb 23. -) helyén a lizin helyett izoleucin állna. Bár a 2173 törzs mutatja az STb-re jellemző toxinhatást, e két mutáció a toxin aktivitását befolyásolhatja. E pontmutációk toxin aktivitásra gyakorolt hatásának vizsgálatára együttműködést kezdtünk az STb molekula receptorát szulfatid molekulaként meghatározó kanadai kutatócsoporttal. Mobilzálási kisérleteink során a ptc plazmid mintegy 40 kb-nyi szakaszát sikeresen transzponáltuk pacyc177 plazmidra és a transzpozíciós termék (pakr2) hordozta a TSL ptc t. A TSL sikeres transzpozíciója megerősítette feltevésünket, hogy a ptc enterotoxin génjei mobilis genetikai elemen helyezkednek el,. Vizsgálataink szerint a TSL egy nagyobb, mintegy 40 kb nagyságú elem részeként helyeződött át a pacyc177-re. Ez a szakasz nemcsak az sta, stb enterotoxin gént, valamint a phev gént tartalmazta, hanem a cole1 replikációs origót és a plazmid mobilizációért felelős mob régiót is. A 40kb méretű fragment mobilitását viszont a két végét alkotó IS10 szekvenciák magyarázzák. Ennek alapján igazolható feltevésünk, miszerint a TSL ptc -t hordozó elem egy új enterotoxikus plazmidon kódolt patogenitási sziget (PAI I 2173 ). A 40 kb PAI I 2173 szekvenciájának meghatározása mely a vizsgálataink következő lépése lesz minden bizonnyal további ismeretekkel szolgál majd annak horizontális terjedését és jelentőségét illetően is. 7
9 Feltevésünk igazolására több, malacok választott hasmenéséből izolált, különböző földrajzi eredetű (Magyarország, Ausztria, Egyesült Államok), F4(K88) fimbriát hordozó ETEC, F18 fimbriát hordozó ETEC valamint F18 fimbriát hordozó ETEC/VTEC törzset vizsgáltunk, hogy az stb gén mely mobilis virulencia elem (Tn4521 vagy a TSL ptc ) részeként található meg bennük? Azt tapasztaltuk, hogy a Tn4521 stb-transzpozon (a földrajzi származástól függetlenül) inkább az F4(K88) fimbriált törzsekre volt jellemző, míg az F18 fimbriát expresszáló ETEC illetve ETEC/VTEC törzsek többnyire (11/13) a TSL részeként hordozták az stb gént. PCR vizsgálataink szerint a Tn4521 az F4(K88) fimbriát hordozó törzsek több mint a felénél (6/10) jelen volt. Mindkét csoportban néhányszor tapasztaltuk nem specifikus amplikonok megjelenését is. Tekintettel arra, hogy ismereteink szerint az F18 és K88 fimbria gének eltérő tulajdonságú plazmidokon találhatóak, eredményeink nem csak egy új, plazmidkódolt, enterotoxikus patogenitási szigetre mutatnak rá, hanem az enterotoxin és fimbria géneket hordozó plazmidok közötti kapcsolatok feltételezését is megengedik. Munkánk során a vakcinafejlesztésben is felhasználható információkat nyertünk az ETEC törzsek virulencia plazmidjairól, a virulencia gének működéséről. KÖVETKEZTETÉSEK - TÉZISEK 1. Plazmid analízis- és replikontipizálási vizsgálataink során megállapítottuk, hogy Magyarországi választott sertések hasmenése- ill. ödéma betegségének eseteiből izolált ETEC ill. VTEC törzsek jellegzetesen 2-3 nagy (>30 kb) plazmidot hordoznak. A törzsek F18 fimbria (és hemolizin) géneket hordozó ún. F18 plazmidjai az FIc inkompatibilitási csoporton belül annak FIIa vagy I1 alcsoportjába tartoznak, s ilyen szempontból az eddig megismert ETEC virulencia plazmidokra csak részben hasonlítanak. Az ETEC törzsek jellegzetes képviselőjeként kiválasztott 2173-as törzs F18ac plazmidját >200 kb molekulatömegűnek határoztuk meg. 2. A 2173-as ETEC törzs enterotoxin génjeit (sta, stb) egy 120kb méretű plazmidon azonosítottuk, mely egyúttal tetraciklin rezisztenciát (tetb) is kódolt (ptc). A ptc plazmid replikációs origóját megszekvenálva, azt az enterotoxin plazmidokra is jellemző, cole1 típusúnak találtuk, melynek mob régiójában azonban egy kb. 400 bp-nyi deléció van. 3. Az ptc plazmid sta és stb génjeinek kapcsolatát valamint környezetüket vizsgálva leírtunk egy 40 kb plazmidon kódolt enterotoxikus, patogenitási szigetet (PAI I 2173 ), azon belül egy ún. toxin specifikus lókuszt (TSL ptc ), melynek mobilizálását és részletes jellemzését is elvégeztük. 4. Megállapítottuk, hogy a TSL a választott malacokra nézve hatékony hőstabil toxin (sta és stb) géneknek egy újabb közös vektora lehet. Ezen belül az sta gént a korábbi leírásnak megfelelő Tn1681 transzpozonon, az stb gént viszont az eddig ismert Tn4521 transzpozontól eltérő 8
10 szekvencia környezetben találtuk. Vizsgálataink alapján úgy tűnik, hogy a TSL a horizontális géntranszfernek az eddig megismert transzpozonok mellett egy ugyancsak széles geográfiai elterjedtségű, az F18 + ETEC törzsekre jellemző eszköze. 5. A 2173 törzs (az F18 és ptc plazmidokról szerzett ismereteinken alapuló) atoxikus variánsa kiegészítve K88 fimbriát kódoló plazmiddal, egy, a sertések választási hasmenésének megelőzését célzó vakcinatörzs jelölt létrehozásának kiindulópontja lehet. TÉZISEK ALAPJÁUL SZOLGÁLÓ KÖZLEMÉNYEK Fekete, P. Z., Gerardin, J., Jacquemin, E., Mainil, J. G., Nagy, B., Replicon typing of F18 fimbriae encoding plasmids of enterotoxigenic and verotoxigenic Escherichia coli strains from porcine postweaning diarrhoea and oedema disease. Vet. Microbiol. 22, (IF: 1,65) Fekete, P. Z., Schneider, G., Olasz, F., Blum-Oehler, G., Hacker, J. H., Nagy, B Detection of a plasmid-encoded pathogenicity island in F18+ enterotoxigenic and verotoxigenic Escherichia coli from weaned pigs. Int. J. Med. Microbiol. 293(4), (IF: 1,362) Olasz, F., Feketel, P. Z., Blum-Oehler, G., Boldogkői, Z., Nagy, B Characterization of an F18+ enterotoxigenic Escherichia coli strain from post weaning diarrhoea of swine, and of its conjugative virulence plasmid ptc. FEMS Microbiol. Lett. nyomtatás alatt (IF: 1,932) A DOLGOZAT TÉMÁJÁBAN MEGJELENT EGYÉB PUBLIKÁCIÓK Nagy, B., Fekete, P. Zs., Enterotoxigenic Escherichia coli (ETEC) in farm animals. Vet. Res. 30, (IF: 1.49) TUDOMÁNYOS KÖNYVFEJEZETEK Nagy, B., Tóth, I., Fekete, P. Zs Adhesins and receptors for colonisation by different pathotypes of Escherichia coli in calves and young pigs. In: Holzapfel, W. and Naughton P. eds.: Microbial ecology of the growing animal Elsevier Science, Amsterdam, The Netherlands, megjelenés alatt SZABADALOM Élő, szájon át adható Escherichia coli vakcina készítésére alkalmas törzs a sertések választási hasmenésének megelőzésére és a törzs készítésére alkalmas eljárás. Lajstromszám: (P ügyszámú bejelentés alapján) Szabadalmi bejelentés napja és az oltalmi idő kezdete: 1999 március 31. Szabadalom jogosultja: MTA Állatorvostudományi Kutatóintézete, Budapest. Feltalálók: dr. Nagy Béla, Budapest 50%; Olasz Ferenc, Gödöllő, 30%; Fekete Péter Zsolt, Dunaharaszti, 15%; Tóthné Szekrényi Márta, Budapest 5% 9
11 A strain suitable for producing a live, orally applicable Escherichia coli vaccine for the prevention of post-weaning diarrhoea in pigs, and the procedure suitable for producing that strain. Nemzetközi Szabadalom leadva 2000 március 29-én, PCT/HU00/00026 szám alatt KONFERENCIA KIADVÁNYOK Fekete, P. Zs., Olasz, F., Szeverényi, I., Nagy, B., Az EC2173 enterotoxikus E. coli törzs ptc plazmidjának jellemzése, előadás, Magyar Mikrobiológiai Társaság évi nagygyűlése előadásainak és posztereinek összefoglalói, Szekszárd, p23 Fekete, P. Zs., Olasz, F., Szeverényi, I., Blum-Oehler, G., Nagy, B., ptc (EC2173) deléciós plazmidszármazékok vizsgálata, poszter, Magyar Mikrobiológiai Társaság évi nagygyűlése előadásainak és posztereinek összefoglalói, Miskolc, p32 Fekete, P. Zs., Gerardin, J., Mainil. J. G., Nagy, B., Hazai F18 fimbriát hordozó enterotoxikus és verotoxikus E. coli törzsek plazmidjainak jellemzése és replikontipizálása Magyar Mikrobiológiai Társaság évi nagygyűlése előadásainak és posztereinek összefoglalói, Szekszárd, p34 Fekete, P. Zs., Bluhm-Oehler, G., Hacker, J., Nagy, B., Plazmidon lokalizált enterotoxikus patogenitási sziget részleges jellemzése. Magyar Mikrobiológiai Társaság évi nagygyűlése előadásainak és posztereinek összefoglalója, Balatonfüred, p49 Fekete, P. Z., Schneider, G., Olasz, F., Blum-Oehler, G., Hacker, J. H., Nagy, B Detection of a plasmid-encoded pathogenicity island in F18 + enterotoxigenic Escherichia coli (ETEC) and verotoxigenic E. coli (VTEC) from weaned pigs. Scientific program & abstracts of the 11 th European Conference on Bacterial Protein Toxins (ETOX11), Čelakovice, Czech Republic,Poster Abstract number: P46 FEMS 2003 Fekete, P. Z., Schneider, G., Olasz, F., Blum-Oehler, G., Hacker, J. H., Nagy, B Plasmid borne pathogenicity island of F18 + enterotoxic Escherichia coli. Abstract book of the 1st FEMS Congress of European Microbiologists, Ljubljana, Slovenia, P13-5 Nagy, B., Olasz, F., Fekete, P. Zs., Blum-Oehler, G., Hacker, J Peculiarities of virulence plasmids of F18 + enterotoxigenic Escherichia coli causing postweaning diarrhoea. Proceedings of the 18 th IPVS Congress, Hamburg, Germany, 2004 Volume 1. p.259 IDÉZETTSÉG (2004. június 30.) Fekete Péter Zsolt tudományos közleményeire való hivatkozások száma SCI folyóiratokban: 30 10
A növény inváziójában szerepet játszó bakteriális gének
A növény inváziójában szerepet játszó bakteriális gének merisztéma korai szimbiotikus zóna késői szimbiotikus zóna öregedési zóna gyökér keresztmetszet NODULÁCIÓ növényi jel Rhizobium meliloti rhizobium
RészletesebbenDoktori (PhD) értekezés tézisei. Mohamed Ahmed Dow. Eötvös Loránd Tudományegyetem, Budapest
GYERMEKEK ÉS NYULAK ENTERÁLIS MEGBETEGEDÉSEIBİL SZÁRMAZÓ KÓROKOZÓ ESCHERICHIA COLI TÖRZSEK ÖSSZEHASONLÍTÓ ELEMZÉSE Doktori (PhD) értekezés tézisei Mohamed Ahmed Dow Eötvös Loránd Tudományegyetem, Budapest
RészletesebbenTipizálási módszerek alkalmazása methicillin-rezisztens Staphylococcus aureus (MRSA) törzsek molekuláris epidemiológiai vizsgálatai során
Tipizálási módszerek alkalmazása methicillin-rezisztens Staphylococcus aureus (MRSA) törzsek molekuláris epidemiológiai vizsgálatai során Ungvári Erika, Tóth Ákos Magyar Infektológiai és Klinikai Mikrobiológiai
RészletesebbenÉter típusú üzemanyag-adalékok mikrobiális bontása: a Methylibium sp. T29 jelű, új MTBE-bontó törzs izolálása és jellemzése
Éter típusú üzemanyag-adalékok mikrobiális bontása: a Methylibium sp. T29 jelű, új MTBE-bontó törzs izolálása és jellemzése Doktori értekezés tézisei Szabó Zsolt Témavezető: Dr. Bihari Zoltán vezető kutató
RészletesebbenSZAKMAI ZÁRÓJELENTÉS
OTKA nyilvántartási szám: T 037890 SZAKMAI ZÁRÓJELENTÉS A téma címe: Egy új citotoxinnak, a cytholethalis distending toxinnak (CDT) magyarországi előfordulása és molekuláris biológia jellemzése A kutatás
RészletesebbenSzent István Egyetem Állatorvos-tudományi Doktori Iskola
Szent István Egyetem Állatorvos-tudományi Doktori Iskola Multirezisztens E. coli törzsek antibiotikum rezisztencia és virulencia génjeinek molekuláris epidemiológiai elemzése PhD értekezés Szmolka Annamária
RészletesebbenAZ IS30 BAKTERIÁLIS INSZERCIÓS ELEM CÉLSZEKVENCIA VÁLASZTÁSÁNAK MOLEKULÁRIS TÉNYEZŐI DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI SZABÓ MÓNIKA
AZ IS30 BAKTERIÁLIS INSZERCIÓS ELEM CÉLSZEKVENCIA VÁLASZTÁSÁNAK MOLEKULÁRIS TÉNYEZŐI DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI SZABÓ MÓNIKA Gödöllő 2007. 1 A Doktori Iskola megnevezése: Szent István Egyetem Biológia Tudományi
RészletesebbenMIKROSZKÓPIKUS GOMBÁK MIKOTOXIN-BONTÓ KÉPESSÉGÉNEK. Péteri Adrienn Zsanett DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI
DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI MIKROSZKÓPIKUS GOMBÁK MIKOTOXIN-BONTÓ KÉPESSÉGÉNEK VIZSGÁLATA Péteri Adrienn Zsanett Témavezetők: Dr. Varga János, Egyetemi docens Dr. Vágvölgyi Csaba, Tanszékvezető egyetemi
RészletesebbenA Globális regulátor mutációknak mint az attenuálás lehetőségének vizsgálata Escherichia coli-ban
A Globális regulátor mutációknak mint az attenuálás lehetőségének vizsgálata Escherichia coli-ban című támogatott kutatás fő célja az volt, hogy olyan regulációs mechanizmusoknak a virulenciára kifejtett
RészletesebbenNANOTECHNOLOGIA 6. előadás
NANOTECHNOLOGIA 6. előadás A plazmid: Ha meg akarjuk ismerni egy fehérje működését, akkor sokat kell belőle előállítanunk. Ezt akár úgy is megtehetjük, hogy a kívánt géndarabot egy baktérumba ültetjük
RészletesebbenA PENICILLIUM CHRYSOGENUM LAKTÓZ HASZNOSÍTÁSÁNAK VIZSGÁLATA
EGYETEMI DOKTORI (PH.D.) ÉRTEKEZÉS TÉZISEI A PENICILLIUM CHRYSOGENUM LAKTÓZ HASZNOSÍTÁSÁNAK VIZSGÁLATA Nagy Zoltán Témavezet : Dr. Biró Sándor Debreceni Egyetem Mikrobiológiai és Biotechnológiai Tanszék
RészletesebbenE. coli. Intesztinális E. coli fertőzések. E. coli. Enterobacteriaceae II. Extraintesztinális E. coli fertőzések
E. coli Enterobacteriaceae II. A törzsek többsége normál bélflóra alkotó, extraintesztinálisan betegségeket okozhat Egyes izolátumok további virulencia faktorokat hordoznak, amelyek fokozzák az extraintesztinális
RészletesebbenÖsszehasonlító környezetmikrobiológiai. Böddi-szék vizében egy alga tömegprodukció idején
Összehasonlító környezetmikrobiológiai vizsgálatok a Böddi-szék vizében egy alga tömegprodukció idején Czeibert Katalin Témavezető: Dr. Borsodi Andrea Eötvös Loránd Tudományegyetem, Mikrobiológiai Tanszék
RészletesebbenEvolúció ma: az antibiotikum rezisztencia a baktériumoknál
Evolúció ma: az antibiotikum rezisztencia a baktériumoknál Dr. Jakab Endre, adjunktus Magyar Biológia és Ökológia Intézet, Babeş-Bolyai Tudományegyetem ejakab@hasdeu.ubbcluj.ro Tartalom az antibiotikum
RészletesebbenSertés újszülött kori coli hasmenése. Kórfejlődés, vakcinázás
Sertés újszülött kori coli hasmenése Kórfejlődés, vakcinázás ETEC (enterotoxikus E. coli) Naposkori (első héten jelentkező) megbetegedésekért felelős Fontosabb antigének: Adhesinek: Pilusok, fimbriák Toxinok:
RészletesebbenKülönbözı Mycoplasma gallisepticum törzsek összehasonlító vizsgálata több, döntıen PCR alapú molekuláris biológiai módszer segítségével
SZENT ISTVÁN EGYETEM ÁLLATORVOS-TUDOMÁNYI DOKTORI ISKOLA Különbözı Mycoplasma gallisepticum törzsek összehasonlító vizsgálata több, döntıen PCR alapú molekuláris biológiai módszer segítségével Doktori
RészletesebbenBiomassza alapú bioalkohol előállítási technológia fejlesztése metagenomikai eljárással
Biomassza alapú bioalkohol előállítási technológia fejlesztése metagenomikai eljárással Kovács Zoltán ügyvezető DEKUT Debreceni Kutatásfejlesztési Közhasznú Nonprofit Kft. Problémadefiníció Első generációs
RészletesebbenFehérje expressziós rendszerek. Gyógyszerészi Biotechnológia
Fehérje expressziós rendszerek Gyógyszerészi Biotechnológia Expressziós rendszerek Cél: rekombináns fehérjék előállítása nagy tisztaságban és nagy mennyiségben kísérleti ill. gyakorlati (therapia) felhasználásokra
RészletesebbenA baktériumok genetikája
6. előadás A baktériumok genetikája A baktériumoknak fontos szerep jut a genetikai kutatásokban Előny: Haploid genom Rövid generációs idő Olcsón és egyszerűen nagy populációhoz juthatunk A prokarióták
RészletesebbenNövényvédelmi Tudományos Napok 2014
Növényvédelmi Tudományos Napok 2014 Budapest 60. NÖVÉNYVÉDELMI TUDOMÁNYOS NAPOK Szerkesztők HORVÁTH JÓZSEF HALTRICH ATTILA MOLNÁR JÁNOS Budapest 2014. február 18-19. ii Szerkesztőbizottság Tóth Miklós
RészletesebbenA basidiomycota élesztőgomba, a Filobasidium capsuligenum IFM 40078 törzse egy olyan
A basidiomycota élesztőgomba, a Filobasidium capsuligenum IFM 40078 törzse egy olyan fehérjét (FC-1 killer toxint) választ ki a tápközegbe, amely elpusztítja az opportunista patogén Cryptococcus neoformans-t.
RészletesebbenBakteriális identifikáció 16S rrns gén szekvencia alapján
Bakteriális identifikáció 16S rrns gén szekvencia alapján MOHR ANITA SIPOS RITA, SZÁNTÓ-EGÉSZ RÉKA, MICSINAI ADRIENN 2100 Gödöllő, Szent-Györgyi Albert út 4. info@biomi.hu, www.biomi.hu TÖRZS AZONOSÍTÁS
RészletesebbenHAPMAP -2010 Nemzetközi HapMap Projekt. SNP GWA Haplotípus: egy kromoszóma szegmensen lévő SNP mintázat
HAPMAP -2010 Nemzetközi HapMap Projekt A Nemzetközi HapMap Project célja az emberi genom haplotípus* térképének(hapmap; haplotype map) megszerkesztése, melynek segítségével katalogizálni tudjuk az ember
RészletesebbenFiatal kutatói beszámoló
Talajbiológiai- és biokémiai osztály Fiatal kutatói beszámoló Gazdag Orsolya tudományos segédmunkatárs Témavezető: Dr. Ködöböcz László 2013.12.03. Témacím: Különböző gazdálkodási módok hatása a talaj baktérium-közösségeinek
RészletesebbenSzent István Egyetem Állatorvos-tudományi Doktori Iskola. Háziállatokból izolált Histophilus somni törzsek összehasonlító vizsgálata
Szent István Egyetem Állatorvos-tudományi Doktori Iskola Háziállatokból izolált Histophilus somni törzsek összehasonlító vizsgálata PhD értekezés tézisei Készítette: Dr. Jánosi Katalin Témavezet : Dr.
RészletesebbenA humán mitokondriális genom: Evolúció, mutációk, polimorfizmusok, populációs vonatkozások. Egyed Balázs ELTE Genetikai Tanszék
A humán mitokondriális genom: Evolúció, mutációk, polimorfizmusok, populációs vonatkozások Egyed Balázs ELTE Genetikai Tanszék Endoszimbiotikus gén-transzfer (Timmis et al., 2004, Nat Rev Gen) Endoszimbiotikus
RészletesebbenDNS-szekvencia meghatározás
DNS-szekvencia meghatározás Gilbert 1980 (1958) Sanger 3-1 A DNS-polimerázok jellemzői 5'-3' polimeráz aktivitás 5'-3' exonukleáz 3'-5' exonukleáz aktivitás Az új szál szintéziséhez kell: templát DNS primer
RészletesebbenA termesztett búza diploid őseinek molekuláris citogenetikai elemzése: pachytén- és fiber-fish.
OTKA K67808 zárójelentés 2012. A termesztett búza diploid őseinek molekuláris citogenetikai elemzése: pachytén- és fiber-fish. A fluoreszcens in situ hibridizáció (FISH) olyan technikai fejlettséget ért
RészletesebbenA Multi Locus Sequence Typing (MLST) alkalmazhatósága az élelmiszermikrobiológiában
A Multi Locus Sequence Typing (MLST) alkalmazhatósága az élelmiszermikrobiológiában Sipos Rita, Lukács Alena, Simon Janka, Szántó-Egész Réka, Micsinai Adrienn 2100 Gödöllő, Szent-Györgyi Albert út 4. info@biomi.hu,
RészletesebbenMikroorganizmusok patogenitása
Mikroorganizmusok patogenitása Dr. Maráz Anna egyetemi tanár Mikrobiológia és Biotechnológia Tanszék Élelmiszertudományi Kar Budapesti Corvinus Egyetem Mikroorganizmusok kölcsönhatásai (interakciói) Szimbiózis
RészletesebbenA PNP kóroktanának molekuláris vizsgálata Dán Ádám és Rónai Zsuzsanna
A PNP kóroktanának molekuláris vizsgálata Dán Ádám és Rónai Zsuzsanna XXVI. Derzsy Napok 2018. június 7-8. Hajdúszoboszló 1 Marek betegség vírusa Vakcina vírustörzs Alphaherpesvirinae Mardivirus Gallid
RészletesebbenMolekuláris genetikai vizsgáló. módszerek az immundefektusok. diagnosztikájában
Molekuláris genetikai vizsgáló módszerek az immundefektusok diagnosztikájában Primer immundefektusok A primer immundeficiencia ritka, veleszületett, monogénes öröklődésű immunhiányos állapot. Családi halmozódást
RészletesebbenELTE Doktori Iskola Evolúciógenetika, evolúciós ökológia, konzervációbiológia program Programvezető: Dr. Szathmáry Eörs, akadémikus, egyetemi tanár
ELTE Doktori Iskola Evolúciógenetika, evolúciós ökológia, konzervációbiológia program Programvezető: Dr. Szathmáry Eörs, akadémikus, egyetemi tanár A CSIRKÉK FERTŐZŐ BURSITISÉT OKOZÓ VÍRUSTÖRZSEK GENETIKAI
RészletesebbenAlgaközösségek ökológiai, morfológiai és genetikai diverzitásának összehasonlítása szentély jellegű és emberi használatnak kitett élőhelykomplexekben
Algaközösségek ökológiai, morfológiai és genetikai diverzitásának összehasonlítása szentély jellegű és emberi használatnak kitett élőhelykomplexekben Duleba Mónika Környezettudományi Doktori Iskola I.
RészletesebbenGénszerkezet és génfunkció
Általános és Orvosi Genetika jegyzet 4. fejezetének bővítése a bakteriális genetikával 4. fejezet Génszerkezet és génfunkció 1/ Bakteriális genetika Nem szükséges külön hangsúlyoznunk a baktériumok és
RészletesebbenMikroorganizmusok patogenitása
Mikroorganizmusok patogenitása Dr. Maráz Anna egyetemi tanár Mikrobiológia és Biotechnológia Tanszék Élelmiszertudományi Kar Budapesti Corvinus Egyetem Mikroorganizmusok kölcsönhatásai (interakciói) Szimbiózis
Részletesebben2.6.16. VIZSGÁLATOK IDEGEN KÓROKOZÓKRA HUMÁN ÉLŐVÍRUS-VAKCINÁKBAN
2.6.16. Vizsgálatok idegen kórokozókra Ph.Hg.VIII. - Ph.Eur.7.0 1 2.6.16. VIZSGÁLATOK IDEGEN KÓROKOZÓKRA HUMÁN ÉLŐVÍRUS-VAKCINÁKBAN 01/2011:20616 Azokhoz a vizsgálatokhoz, amelyekhez a vírust előzőleg
RészletesebbenSzent István Egyetem Állatorvos-tudományi Doktori Iskola
Szent István Egyetem Állatorvos-tudományi Doktori Iskola Szarvasmarha eredetű atípusos Escherichia coli O157 törzsek virulenciafaktorainak genetikai háttere PhD értekezés Sváb Domonkos László 2013 Témavezető
RészletesebbenTöbbgénes jellegek. 1. Klasszikus (poligénes) mennyiségi jellegek. 2.Szinte minden jelleg több gén irányítása alatt áll
Többgénes jellegek Többgénes jellegek 1. 1. Klasszikus (poligénes) mennyiségi jellegek Multifaktoriális jellegek: több gén és a környezet által meghatározott jellegek 2.Szinte minden jelleg több gén irányítása
RészletesebbenEgy 10,3 kb méretű, lineáris, a mitokondriumban lokalizált DNS-plazmidot izoláltunk a
Egy 10,3 kb méretű, lineáris, a mitokondriumban lokalizált DNS-plazmidot izoláltunk a Fusarium proliferatum (Gibberella intermedia) ITEM 2337-es törzséből, és a plazmidot pfp1- nek neveztük el. Proteináz
RészletesebbenSzent István Egyetem Állatorvos-tudományi Doktori Iskola
Szent István Egyetem Állatorvos-tudományi Doktori Iskola A baromfi Salmonella Enteritidis elleni korai védelmet szolgáló törzsek előállítása virulencia plazmidra és flagellin rendszerre irányuló mutagenezissel
RészletesebbenMolekuláris biológiai eljárások alkalmazása a GMO analitikában és az élelmiszerbiztonság területén
Molekuláris biológiai eljárások alkalmazása a GMO analitikában és az élelmiszerbiztonság területén Dr. Dallmann Klára A molekuláris biológia célja az élőlények és sejtek működésének molekuláris szintű
RészletesebbenEgy multideléciós Escherichia coli törzs előállítása és jellemzése
Egy multideléciós Escherichia coli törzs előállítása és jellemzése Fehér Tamás doktori értekezési tézisei Témavezető: Dr. Pósfai György Magyar Tudományos Akadémia Szegedi Biológiai Központja Biokémiai
Részletesebbenavagy az ipari alkalmazhatóság kérdése biotechnológiai tárgyú szabadalmi bejelentéseknél Dr. Győrffy Béla, Egis Nyrt., Budapest
Iparilag alkalmazható szekvenciák, avagy az ipari alkalmazhatóság kérdése biotechnológiai tárgyú szabadalmi bejelentéseknél Dr. Győrffy Béla, Egis Nyrt., Budapest Neutrokin α - jelentős kereskedelmi érdekek
RészletesebbenVÁLASZ OPPONENSI VÉLEMÉNYRE
VÁLASZ OPPONENSI VÉLEMÉNYRE Dr. Taller János Tudományos főmunkatárs Pannon Egyetem, Georgikon Kar, Növénytudományi és Biotechnológiai Tanszék Biotechnológiai Kutatócsoport Farkas Valéria Tejtermelést és
RészletesebbenBiológiai biztonság: Veszély: - közvetlen - közvetett
Biológiai biztonság Biológiai biztonság: Minden biológiai anyag potenciálisan kórokozó és szennyező; a biológiai biztonság ezen biológiai anyagok hatásaira (toxikus hatások, fertőzések) koncentrál és célja
RészletesebbenA szamóca érése során izolált Spiral és Spermidin-szintáz gén jellemzése. Kiss Erzsébet Kovács László
A szamóca érése során izolált Spiral és Spermidin-szintáz gén jellemzése Kiss Erzsébet Kovács László Bevezetés Nagy gazdasági gi jelentıségük k miatt a gyümölcs lcsök, termések fejlıdésének mechanizmusát
RészletesebbenA preventív vakcináció lényege :
Vakcináció Célja: antigénspecifkus immunválasz kiváltása a szervezetben A vakcina egy olyan készítmény, amely fokozza az immunitást egy adott betegséggel szemben (aktiválja az immunrendszert). A preventív
RészletesebbenVélemény. Dr. Szabó Dóra Béta-laktám rezisztens Gram-negatív baktériumok vizsgálata című doktori értekezéséről.
Vélemény Dr. Szabó Dóra Béta-laktám rezisztens Gram-negatív baktériumok vizsgálata című doktori értekezéséről. Dr. Szabó Dóra MTA doktori értekezésében összefoglalt tudományos eredmények egyenes folytatását
Részletesebbentranszláció DNS RNS Fehérje A fehérjék jelenléte nélkülözhetetlen minden sejt számára: enzimek, szerkezeti fehérjék, transzportfehérjék
Transzláció A molekuláris biológia centrális dogmája transzkripció transzláció DNS RNS Fehérje replikáció Reverz transzkriptáz A fehérjék jelenléte nélkülözhetetlen minden sejt számára: enzimek, szerkezeti
RészletesebbenNosocomialis infekciókat okozó baktériumok tipizálásának jelentősége a kórházi járványok felderítésében
Nosocomialis infekciókat okozó baktériumok tipizálásának jelentősége a kórházi járványok felderítésében Pászti Judit OEK Fágtipizálási és molekuláris epidemiológiai osztály Tipizálás - általában Bakteriológiai
RészletesebbenIII/3. Gének átvitele vektorokkal
III/3. Gének átvitele vektorokkal Vektor: (molekuláris) biológiai rendszer, amely képes új/idegen genetikai információt bejuttatni egy sejtbe. Független szaporodásra képes. Fajtái: Plazmidok (1-10 kb)
RészletesebbenKromoszómák, Gének centromer
Kromoszómák, Gének A kromoszóma egy hosszú DNS szakasz, amely a sejt életének bizonyos szakaszában (a sejtosztódás előkészítéseként) tömörödik, így fénymikroszkóppal láthatóvá válik. A kromoszómák két
RészletesebbenSzent István Egyetem Állatorvos-tudományi Doktori Iskola
Szent István Egyetem Állatorvos-tudományi Doktori Iskola Szarvasmarha eredetű atípusos Escherichia coli O157 törzsek virulenciafaktorainak genetikai háttere PhD értekezés Sváb Domonkos László 2013 Témavezető
RészletesebbenA malacok fontosabb felnevelési betegségei
A malacok fontosabb felnevelési betegségei Varga János egyetemi tanár az MTA tagja Szent István Egyetem Állatorvos-tudományi Kar Mikrobiológia és Járványtan Tanszék 1581 Budapest, 146 Pf. 22. A szopós
RészletesebbenA doktori értekezés tézisei. A növényi NRP fehérjék lehetséges szerepe a hiszton defoszforiláció szabályozásában, és a hőstressz válaszban.
A doktori értekezés tézisei A növényi NRP fehérjék lehetséges szerepe a hiszton defoszforiláció szabályozásában, és a hőstressz válaszban. Bíró Judit Témavezető: Dr. Fehér Attila Magyar Tudományos Akadémia
RészletesebbenHazai természetesvízi és tógazdasági halakból származó Aeromonas veronii törzsek összehasonlító vizsgálata
Hazai természetesvízi és tógazdasági halakból származó Aeromonas veronii törzsek összehasonlító vizsgálata Sellyei Boglárka, Varga Zsuzsanna, Papp Melitta, Paulus Petra, Molnár Kálmán, Székely Csaba MTA
RészletesebbenÉlő metapneumovírus vakcina fejlesztése tojóállományok részére: ártalmatlansági és hatékonysági vizsgálatok. Hajdúszoboszló, június 2-3.
Élő metapneumovírus vakcina fejlesztése tojóállományok részére: ártalmatlansági és hatékonysági vizsgálatok Dr. Kollár Anna, Dr. Soós Pál, Antalné Szalkai Teodóra, Dr. Tóth Ádám, Dr. Nagy Zoltán, Gubucz-Sombor
RészletesebbenBevezetés-Acinetobacter
Bevezetés-Acinetobacter Gram negatív coccobacillusok opportunista patogének főleg nozokomiális infekciók klinikailag legjelentősebb: Acinetobacter baumannii fajkomplex Bevezetés-Acinetobacter fertőzések
RészletesebbenDER (Felületén riboszómák találhatók) Feladata a biológiai fehérjeszintézis Riboszómák. Az endoplazmatikus membránrendszer. A kódszótár.
Az endoplazmatikus membránrendszer Részei: DER /durva (szemcsés) endoplazmatikus retikulum/ SER /sima felszínű endoplazmatikus retikulum/ Golgi készülék Lizoszómák Peroxiszómák Szekréciós granulumok (váladékszemcsék)
RészletesebbenA 2012/5. SZÁM TARTALMA. Pajor F., Weidel, W., Németh Sz., Gulyás L., Bárdos L., Polgár J. P.,
A 2012/5. SZÁM TARTALMA SZARVASMARHA Ózsvári L., Muntyán J., Berkes Á.: A légzőszervi betegségek (BRD) által okozott veszteségek a szarvasmarhatartásban / 259 KECSKE Pajor F., Weidel, W., Németh Sz., Gulyás
RészletesebbenKülönböző Capsicum annuum var. grossum paprikafajták endofita baktériumainak izolálása, jellemzése és molekuláris biológiai vizsgálata
Élelmiszertudományi Kar, Mikrobiológiai és Biotechnológiai Tanszék, Budapest Különböző Capsicum annuum var. grossum paprikafajták endofita baktériumainak izolálása, jellemzése és molekuláris biológiai
RészletesebbenKUTATÁSI JELENTÉS. DrJuice termékek Ezüstkolloid Hydrogél és Kolloid oldat hatásvizsgálata
KUTATÁSI JELENTÉS A Bay Zoltán Alkalmazott Kutatási Közalapítvány Nanotechnológiai Kutatóintézet e részére DrJuice termékek Ezüstkolloid Hydrogél és Kolloid oldat hatásvizsgálata. E z ü s t k o l l o
RészletesebbenAZ EMBERI MIKROBIOM: AZ EGYÉN, MINT SAJÁTOS ÉLETKÖZÖSSÉG Duda Ernő
AZ EMBERI MIKROBIOM: AZ EGYÉN, MINT SAJÁTOS ÉLETKÖZÖSSÉG Duda Ernő Az NIH, az Egyesült Államok Nemzeti Egészségügyi Hivatala (az orvosi- és biológiai kutatásokat koordináló egyik intézmény) 2007 végén
RészletesebbenKlónozás: tökéletesen egyforma szervezetek csoportjának előállítása, vagyis több genetikailag azonos egyed létrehozása.
Növények klónozása Klónozás Klónozás: tökéletesen egyforma szervezetek csoportjának előállítása, vagyis több genetikailag azonos egyed létrehozása. Görög szó: klon, jelentése: gally, hajtás, vessző. Ami
RészletesebbenEnteropathogen Escherichia coli (EPEC) baktériumok genotípusa/fenotípusa és pathogenezise választott malacokban
SZENT ISTVÁN EGYETEM ÁLLATORVOS-TUDOMÁNYI DOKTORI ISKOLA Enteropathogen Escherichia coli (EPEC) baktériumok genotípusa/fenotípusa és pathogenezise választott malacokban PhD értekezés Készítette: Dr. Malik
Részletesebben2011. január április 10. IPK Gatersleben (Németország) május 17. Kruppa Klaudia
2011. január 10. 2011. április 10. IPK Gatersleben (Németország) Gatersleben (G-life) Country State District Town Administration Germany Saxony-Anhalt Salzlandkreis Seeland Basic statistics Area 16.00
RészletesebbenGenomika. Mutációk (SNP-k) és vizsgálatuk egyszerű módszerekkel. DNS szekvenálási eljárások. DNS ujjlenyomat (VNTR)
Genomika (A genom, génállomány vizsgálata) Mutációk (SNP-k) és vizsgálatuk egyszerű módszerekkel DNS szekvenálási eljárások DNS ujjlenyomat (VNTR) DNS chipek statikus és dinamikus információk vizsgálata
RészletesebbenÁLLATTENYÉSZTÉSI TUDOMÁNYOK DOKTORI ISKOLA Doktori Iskola vezető: Dr. Bánszki Tamás, MTA doktora. Témavezetők: mezőgazdaság-tudomány kandidátusa
DEBRECENI EGYETEM AGRÁRTUDOMÁNYI CENTRUM MEZŐGAZDASÁGTUDOMÁNYI KAR ÁLLATTENYÉSZTÉS- ÉS TAKARMÁNYOZÁSTANI TANSZÉK ÁLLATTENYÉSZTÉSI TUDOMÁNYOK DOKTORI ISKOLA Doktori Iskola vezető: Dr. Bánszki Tamás, MTA
RészletesebbenA Hardy-Weinberg egyensúly. 2. gyakorlat
A Hardy-Weinberg egyensúly 2. gyakorlat A Hardy-Weinberg egyensúly feltételei: nincs szelekció nincs migráció nagy populációméret (nincs sodródás) nincs mutáció pánmixis van allélgyakoriság azonos hímekben
RészletesebbenSzabadság tér 1, tel , fax ,
Génkiütés λ-red rekombinációval Escherichia coli-ban Gene Knockout using λ-red Recombination System in Escherichia Coli Eliminarea genelor în Escherichia coli folosind sistemul de recombinare λ-red FAZAKAS
RészletesebbenSzent István Egyetem Állatorvos-tudományi Doktori Iskola. Sertés circovírusok járványtani vizsgálata
Szent István Egyetem Állatorvos-tudományi Doktori Iskola Sertés circovírusok járványtani vizsgálata PhD dolgozat tézisei Készítette: Dr. Cságola Attila Témavezet : Dr. Tuboly Tamás 2009 Szent István Egyetem
RészletesebbenScan 1200 teljesítmény-értékelés evaluation 1/5
evaluation 1/5 interscience Feladat Összefoglalónk célja a Scan 1200 teljesítmény-értékelése manuális és automata telepszámlálások összehasonlításával. Az összehasonlító kísérleteket Petri-csészés leoltást
RészletesebbenMolekuláris biológiai módszerek alkalmazása a biológiai környezeti kármentesítésben
Molekuláris biológiai módszerek alkalmazása a biológiai környezeti kármentesítésben Dr. Kovács Tamás, Kovács Árpád László Kármentesítés Aktuális Kérdései 2013 Budapest, 2013.03.21-22 Bioremediáció során
RészletesebbenA kromoszómák kialakulása előtt a DNS állomány megkettőződik. A két azonos információ tartalmú DNS egymás mellé rendeződik és egy kromoszómát alkot.
Kromoszómák, Gének A kromoszóma egy hosszú DNS szakasz, amely a sejt életének bizonyos szakaszában (a sejtosztódás előkészítéseként) tömörödik, így fénymikroszkóppal láthatóvá válik. A kromoszómák két
RészletesebbenHátterükben egyetlen gén áll, melynek általában számottevő a viselkedésre gyakorolt hatása, öröklési mintázata jellegzetes.
Múlt órán: Lehetséges tesztfeladatok: Kitől származik a variáció-szelekció paradigma, mely szerint az egyéni, javarészt öröklött különbségek között a társadalmi harc válogat? Fromm-Reichmann Mill Gallton
RészletesebbenVirulencia gének regulációja uropathogén Escherichia coli-ban
Doktori (Ph.D.) értekezés tézisei Virulencia gének regulációja uropathogén Escherichia coli-ban Dr. Nagy Gábor Pécsi Tudományegyetem Orvosi Mikrobiológiai és Immunitás tani Intézete Témavezető: Dr. Emődy
RészletesebbenTranszgénikus növények előállítása
Transzgénikus növények előállítása Növényi biotechnológia Területei: A növények szaporításának új módszerei Növényi sejt és szövettenyészetek alkalmazása Mikroszaporítás Vírusmentes szaporítóanyag előállítása
RészletesebbenEgy új toxin-antitoxinszerű modul nem tipikus transzkripciós szabályozása és funkciója Bradyrhizobium japonicumban. Miclea Sebastian Paul
Ph.D disszertáció tézisei Egy új toxin-antitoxinszerű modul nem tipikus transzkripciós szabályozása és funkciója Bradyrhizobium japonicumban Miclea Sebastian Paul Témavezető: Dr. Dusha Ilona Genetikai
RészletesebbenA C faktor termelő Streptomyces griseus 45H törzs spóraképzésének, patogenitásának és taxonómiai besorolásának vizsgálata
EGYETEMI DOKTORI (Ph.D.) ÉRTEKEZÉS TÉZISEI A C faktor termelő Streptomyces griseus 45H törzs spóraképzésének, patogenitásának és taxonómiai besorolásának vizsgálata Kiss Zsuzsanna Témavezető: Dr. Biró
RészletesebbenOszvald Mária. A búza tartalékfehérjék tulajdonságainak in vitro és in vivo vizsgálata rizs modell rendszerben
Budapesti Műszaki és Gazdaságtudományi Egyetem Alkalmazott Biotechnológia és Élelmiszertudományi Tanszék PHD ÉRTEKEZÉS TÉZISEI Készítette: Oszvald Mária A búza tartalékfehérjék tulajdonságainak in vitro
RészletesebbenKappelmayer János. Malignus hematológiai megbetegedések molekuláris háttere. MOLSZE IX. Nagygyűlése. Bük, 2005 szeptember
Kappelmayer János Malignus hematológiai megbetegedések molekuláris háttere MOLSZE IX. Nagygyűlése Bük, 2005 szeptember 29-30. Laboratóriumi vizsgálatok hematológiai malignómákban Általános laboratóriumi
RészletesebbenPÉCSI TUDOMÁNYEGYETEM. Természetes és mesterséges agrobaktérium rezisztencia vizsgálata szőlőben. Galambos Anikó
PÉCSI TUDOMÁNYEGYETEM Biológiai Doktori Iskola Genetika program Természetes és mesterséges agrobaktérium rezisztencia vizsgálata szőlőben PhD értekezés tézisei Galambos Anikó Témavezető: Dr. Putnoky Péter
Részletesebben5. Molekuláris biológiai technikák
5. Molekuláris biológiai technikák DNS szaporítás kémcsőben és élőben. Klónozás, PCR, cdna, RT-PCR, realtime-rt-pcr, Northern-, Southernblotting, génexpresszió, FISH 5. Molekuláris szintű biológiai technikák
RészletesebbenHa nem akarsz mellé-nyúl-ni, használj Nobivac Myxo-RHD-t! MSDay-MOM park, 2013.02.21. dr. Schweickhardt Eszter
Ha nem akarsz mellé-nyúl-ni, használj Nobivac Myxo-RHD-t! MSDay-MOM park, 2013.02.21. dr. Schweickhardt Eszter Áttekintés Miért éppen a nyuszik? Védekezés módja Vakcina jellemzői Vakcina működése Ráfertőzési
RészletesebbenDOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI. Hepatitiszt okozó vírusok molekuláris vizsgálata. N. Szomor Katalin. Budapest 2009.
DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI Hepatitiszt okozó vírusok molekuláris vizsgálata N. Szomor Katalin Budapest 2009. 2 1. BEVEZETÉS A világ legjelentősebb népegészségügyi problémái közé tartozik a vírusok által
RészletesebbenNÖVÉNYGENETIKA. Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP /1/A
NÖVÉNYGENETIKA Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP-4.1.2-08/1/A-2009-0010 A citológia és a genetika társtudománya Citogenetika A kromoszómák eredetét, szerkezetét, genetikai funkcióját,
RészletesebbenA C1 orf 124/Spartan szerepe a DNS-hiba tolerancia útvonalban
Ph.D. tézisek A C1 orf 124/Spartan szerepe a DNS-hiba tolerancia útvonalban Írta: Juhász Szilvia Témavezető: Dr. Haracska Lajos Magyar Tudományos Akadémia Szegedi Biológiai Kutatóközpont Genetikai Intézet
RészletesebbenSzemélyi adatok: Név: Dr. Sóki József Telefon: (62) , (20) Cím: 6726 Szeged, Traktor u. 28.
Személyi adatok: Név: Dr. Sóki József Telefon: (62)-438712, (20)-5708341 Cím: 6726 Szeged, Traktor u. 28. Kor: 51 év Születési hely és idő: Makó, 1965. május 16. Állampolgárság: magyar Anyja neve: Keresztúri
RészletesebbenA bioinformatika gyökerei
A bioinformatika gyökerei 1944: Avery a transforming principle a DNS 1952: Hershey és Chase perdöntő bizonyíték: a bakteriofágok szaporodásakor csak a DNS jut be a sejtbe 1953: Watson és Crick a DNS szerkezete
RészletesebbenA zsírszövet mellett az agyvelő lipidekben leggazdagabb szervünk. Pontosabban az agy igen gazdag hosszú szénláncú politelítetlen zsírsavakban
BEVEZETÉS ÉS A KUTATÁS CÉLJA A zsírszövet mellett az agyvelő lipidekben leggazdagabb szervünk. Pontosabban az agy igen gazdag hosszú szénláncú politelítetlen zsírsavakban (LCPUFA), mint az arachidonsav
RészletesebbenDOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI AZ OPPORTUNISTA HUMÁNPATOGÉN CANDIDA PARAPSILOSIS ÉLESZTŐGOMBA ELLENI TERMÉSZETES ÉS ADAPTÍV IMMUNVÁLASZ VIZSGÁLATA
DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI AZ OPPORTUNISTA HUMÁNPATOGÉN CANDIDA PARAPSILOSIS ÉLESZTŐGOMBA ELLENI TERMÉSZETES ÉS ADAPTÍV IMMUNVÁLASZ VIZSGÁLATA TÓTH ADÉL TÉMAVEZETŐ: DR. GÁCSER ATTILA TUDOMÁNYOS FŐMUNKATÁRS
RészletesebbenTranszgénikus állatok előállítása
Transzgénikus állatok előállítása A biotechnológia alapjai Pomázi Andrea Mezőgazdasági biotechnológia A gazdasági állatok és növények nemesítése új biotechnológiai eljárások felhasználásával. Cél: jobb
RészletesebbenA mikrobiológiai diagnosztika, a ribotipizálás és a binary toxin vizsgálat jelentősége a CDI hazai epidemiológiai jellemzésében
OKI Klinikai és Járványügyi Mikrobiológiai Igazgatóság A mikrobiológiai diagnosztika, a ribotipizálás és a binary toxin vizsgálat jelentősége a CDI hazai epidemiológiai jellemzésében Pászti Judit, Hajdu
RészletesebbenBaktérium- és fággenetika
Baktérium- és fággenetika Baktériumok A prokarióták egysejtű organizmusok haploid, cirkuláris dsdns genom 70 S riboszóma plazmamembrán, citoplazma nincs mag, ER, Golgi, mitokondrium aszexuális szaporodás
RészletesebbenHuman genome project
Human genome project Pataki Bálint Ármin 2017.03.14. Pataki Bálint Ármin Human genome project 2017.03.14. 1 / 14 Agenda 1 Biológiai bevezető 2 A human genome project lefolyása 3 Alkalmazások, kitekintés
RészletesebbenHumán megbetegedéseket okozó Escherichia coli törzsek patogenetikai jellemzése
Humán megbetegedéseket okozó Escherichia coli törzsek patogenetikai jellemzése Doktori (Ph.D.) értekezés Mag Tünde Semmelweis Egyetem Patológiai Tudományok Doktori Iskola Témavezetők: Dr. Rozgonyi Ferenc
RészletesebbenSzent István Egyetem Állatorvos-tudományi Doktori Iskola
Szent István Egyetem Állatorvos-tudományi Doktori Iskola Enteropathogen Escherichia coli (EPEC) baktériumok genotípusa/fenotípusa és pathogenitása választott malacokban PhD értekezés Készítette: Dr. Malik
RészletesebbenBiológus MSc. Molekuláris biológiai alapismeretek
Biológus MSc Molekuláris biológiai alapismeretek A nukleotidok építőkövei A nukleotidok szerkezete Nukleotid = N-tartalmú szerves bázis + pentóz + foszfát N-glikozidos kötés 5 1 4 2 3 (Foszfát)észter-kötés
RészletesebbenA géntechnológia genetikai alapjai (I./3.)
Az I./2. rész (Gének és funkciójuk) rövid összefoglalója A gének a DNS információt hordozó szakaszai, melyekben a 4 betű (ATCG) néhány ezerszer, vagy százezerszer ismétlődik. A gének önálló programcsomagként
Részletesebben