Körte tájfajták jellemzése mikroszatellit alapú molekuláris markerezéssel Anyag és módszer 164

Hasonló dokumentumok
KÁRPÁT-MEDENCEI ALMAFAJTÁK JELLEMZÉSE POMOLÓGIAI VIZSGÁLATOKKAL ÉS MIKROSZATELLIT ALAPÚ MOLEKULÁRIS MARKEREZÉSSEL. Király Ildikó

A SZIE, MKK GENETIKA ÉS BIOTECHNOLÓGIAI INTÉZETÉNEK EREDMÉNYEI A NÖVÉNYNEMESÍTÉS TUDOMÁNYOKBAN ÉS A NEMESÍTÉS UTÁNPÓTLÁS NEVELÉSBEN

Nagy Emese: Polimorfizmus és rokonsági körök vizsgálata kukoricában (Zea mays) Témavezetők: Cs. L. Marton G Gyulai

MIKROSZATELIT DNS- VIZSGÁLATOK A MOCSÁRI TEKNŐS NÉGY DUNÁNTÚLI ÁLLOMÁNYÁN

ÁLLATTENYÉSZTÉSI TUDOMÁNYOK DOKTORI ISKOLA Doktori Iskola vezető: Dr. Bánszki Tamás, MTA doktora. Témavezetők: mezőgazdaság-tudomány kandidátusa

2011. január április 10. IPK Gatersleben (Németország) május 17. Kruppa Klaudia

BEVEZETÉS CÉLKITŰZÉS

Animal welfare, etológia és tartástechnológia

Intézmény neve Székhely Génmegőrzési téma

ALMAFAJTÁK MOLEKULÁRIS ELKÜLÖNÍTÉSE ÉS

PANNON EGYETEM GEORGIKON KAR, KESZTHELY. Növénytermesztési és Kertészeti Tudományok Doktori Iskola. Iskolavezető: Dr. Kocsis László egyetemi tanár

NYÁR GENOTÍPUSOK AZONOSÍTÁSA DNS UJJLENYOMATUK ALAPJÁN

BÁLINT András Beszámoló az AGRISAFE által támogatott tanulmányútról 2008 november 2009 február. 1. Az IPK bemutatása 2.

Mangalica specifikus DNS alapú módszer kifejlesztés és validálása a MANGFOOD projekt keretében

KÁRPÁT-MEDENCEI ALMAFAJTÁK JELLEMZÉSE POMOLÓGIAI VIZSGÁLATOKKAL ÉS MIKROSZATELLIT ALAPÚ MOLEKULÁRIS MARKEREZÉSSEL. Király Ildikó

Conserved ortholog set (COS) markerek térképezése Aegilops kromoszómákon

Többgénes jellegek. 1. Klasszikus (poligénes) mennyiségi jellegek. 2.Szinte minden jelleg több gén irányítása alatt áll

Szent István Egyetem ŐSHONOS MAGYAR TYÚKÁLLOMÁNYOK GENETIKAI DIVERZITÁSÁNAK VIZSGÁLATA KÜLÖNBÖZŐ MOLEKULÁRIS GENETIKAI MARKEREK SEGÍTSÉGÉVEL

A PE AC SzBKI, Badacsony évi szakmai és pénzügyi beszámolója

Bakteriális identifikáció 16S rrns gén szekvencia alapján

A Genetikai polimorfizmus és földrajzi variabilitás kárpát-medencei endemikus lepke taxonok populációiban c. OTKA pályázat (T ) zárójelentése

III. ATK Tudományos Nap

Néhány horvátországi pontyfajta genetikai jellemzése és visszatelepítése eredeti tógazdaságaikba. Kivonat. Bevezető

A Növényi Diverzitás Központ tevékenységei

A gidrán fajta genetikai változatosságának jellemzése mitokondriális DNS polimorfizmusokkal Kusza Szilvia Sziszkosz Nikolett Mihók Sándor,

Doktori értekezés tézisei

Oktatói önéletrajz Dr. Pedryc Andrzej Piotr

10. CSI. A molekuláris biológiai technikák alkalmazásai

T sz. OTKA-projekthez kapcsolódó nemzetközi kiegészítő támogatás ZÁRÓJELENTÉSE. és genetikai változékonysága

Prenatalis diagnosztika lehetőségei mikor, hogyan, miért? Dr. Almássy Zsuzsanna Heim Pál Kórház, Budapest Toxikológia és Anyagcsere Osztály

Algaközösségek ökológiai, morfológiai és genetikai diverzitásának összehasonlítása szentély jellegű és emberi használatnak kitett élőhelykomplexekben

Szent István Egyetem. Az ivarérés idejét maghatározó QTL-ek genetikai térképezése tyúkban. Szabó Gyula Doktori értekezés

Populációgenetikai. alapok

DOKTORI (Ph.D.) ÉRTEKEZÉS TÉZISEI VESZPRÉMI EGYETEM GEORGIKON MEZGAZDASÁGTUDOMÁNYI KAR KESZTHELY

Hazai méhészeti genomikai és genetikai vizsgálatok

Ökológiai igény. Növekedési sajátosságok. Birs fajtakutatás. Táplálkozásbiológiai érték Konstantinápolyi

A termesztett búza diploid őseinek molekuláris citogenetikai elemzése: pachytén- és fiber-fish.

Baktay Borbála, igazgató

Sebes pisztráng ivadékok Myxobolus cerebralis (Myxozoa) okozta kergekórra való fogékonysága a tenyészállomány genetikai diverzitásának függvényében

Országos kompetenciamérés eredményeinek kiértékelése 6. és 8. évfolyamokon 2012

Régi gyümölcsfajták szerepe a biodiverzitás fenntartásában

Szelekció. Szelekció. A szelekció típusai. Az allélgyakoriságok változása 3/4/2013

A basidiomycota élesztőgomba, a Filobasidium capsuligenum IFM törzse egy olyan

DNS-szekvencia meghatározás

Scan 1200 teljesítmény-értékelés evaluation 1/5

Természetvédelmi biológia

Mezőgazdasági biotechnológus MSc szak. dr. Kiss Erzsébet. SZIE Mezőgazdaság- és Környezettudományi Kar Genetika és Biotechnológiai Intézet

Doktori tézisek. Sedlák Éva. Semmelweis Egyetem Gyógyszertudományok Doktori Iskola

DNS molekulák elválasztása agaróz gélelektroforézissel és kapilláris elektroforézissel

A szamóca érése során izolált Spiral és Spermidin-szintáz gén jellemzése. Kiss Erzsébet Kovács László

A VÁGÁSI KOR, A VÁGÁSI SÚLY ÉS A ROSTÉLYOS KERESZTMETSZET ALAKULÁSA FEHÉR KÉK BELGA ÉS CHAROLAIS KERESZTEZETT HÍZÓBIKÁK ESETÉBEN

A Kárpát-medencében régóta termesztett gyümölcsfajták szerepe napjainkban

mintasepcifikus mikrokapilláris elektroforézis Lab-on-Chip elektroforézis / elektrokinetikus elven DNS, RNS, mirns 12, fehérje 10, sejtes minta 6

MIKROSZKÓPIKUS GOMBÁK MIKOTOXIN-BONTÓ KÉPESSÉGÉNEK. Péteri Adrienn Zsanett DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI

Zárójelentés. Állati rotavírusok összehasonlító genomvizsgálata. c. OTKA kutatási programról. Bányai Krisztián (MTA ATK ÁOTI)

SZAKMAI ZÁRÓJELENTÉS

Kertészeti Egyetem, Termesztési Kar, Budapest, Okleveles kertészmérnök

A PE AC SzBKI, Badacsony évben megjelentett, előadott publikációinak listája

A fontosabb kukorica hibridek minőségi tulajdonságainakai akulása földrajzi tájanként

A PE AC SzBKI, Badacsony évi szakmai és pénzügyi beszámolója

Téma 2: Genetikai alapelvek, a monogénes öröklődés -hez szakirodalom: (Plomin: Viselekedésgenetika 2. fejezet) *

A doktori értekezés tézisei. A növényi NRP fehérjék lehetséges szerepe a hiszton defoszforiláció szabályozásában, és a hőstressz válaszban.

DNS MIKROSZATELLITEK VIZSGÁLATA LÓ ÉS SZARVASMARHA FAJTÁKBAN

Bokor faiskola évi őszi ajánlata

Készítette: Pintér Zsuzsanna (Biológia környezettan V.)

Genetikai panel kialakítása a hazai tejhasznú szarvasmarha állományok hasznos élettartamának növelésére

cím: cím, telefonszám:

Fiatal kutatói beszámoló

A Leuce szekcióba tartozó hazai nyárak dunántúli természetes eredetű állományainak populációgenetikai vizsgálata

Fogyatékossággal élő emberek életminősége és ellátási költségei különböző lakhatási formákban

A genetikai lelet értelmezése monogénes betegségekben

1) MÁJER J. LAKATOS A. GYÖRRFYNÉ JAHNKE G: (2007): A Furmint fajta helyzete Magyarországon. Borászati Füzetek 2007/2, Kutatási rovat 1-4. p.

Biomassza alapú bioalkohol előállítási technológia fejlesztése metagenomikai eljárással

A nappali tagozatra felvett gépészmérnök és műszaki menedzser hallgatók informatikai ismeretének elemzése a Budapesti Műszaki Főiskolán

Őszi búzafajták magas hozamának megőrzése környezeti stressz hatása alatt

A Hardy Weinberg-modell gyakorlati alkalmazása

2. Fotometriás mérések II.

Szakmai zárójelentés A kutyaszemélyiség mint az emberi személyiségvizsgálatok modellje: etológiai, pszichológiai és genetikai megközelítés

Diagnosztikai célú molekuláris biológiai vizsgálatok

Rugalmas állandók mérése

Adatok statisztikai értékelésének főbb lehetőségei

Opponensi Vélemény Dr. Nagy Bálint A valósidejű PCR alkalmazása a klinikai genetikai gyakorlatban ' című értekezéséről

A évi országos kompetenciamérés iskolai eredményeinek elemzése

y ij = µ + α i + e ij

Molekuláris biológiai eljárások alkalmazása a GMO analitikában és az élelmiszerbiztonság területén

A 2014.évi országos kompetenciamérés értékelése Kecskeméti Bolyai János Gimnázium

Régi gyümölcsfajták szerepe a biodiverzitás fenntartásában

Dr. Máthéné Dr. Szigeti Zsuzsanna és munkatársai

Árendás Tamás MTA ATK Mezőgazdasági Intézet, Martonvásár

A SZENT ISTVÁN EGYETEM NÖVÉNYGENETIKAI ÉS -NEMESÍTÉSI TUDOMÁNYOS ISKOLA EREDMÉNYEI ( ) HESZKY LÁSZLÓ ÉS KISS ERZSÉBET

Az állományon belüli és kívüli hőmérséklet különbség alakulása a nappali órákban a koronatér fölötti térben május és október közötti időszak során

AZ ŐSHONOS KENDERMAGOS MAGYAR TYÚK TARTÁSA HÓDMEZŐVÁSÁRHELYEN A SZEGEDI TUDOMÁNYEGYETEM MEZŐGAZDASÁGI FŐISKOLAI KARÁNAK TANÜZEMÉBEN

A Hardy-Weinberg egyensúly. 2. gyakorlat

Genomikai Medicina és Ritka Betegségek Intézete Semmelweis Egyetem

Zárójelentés. OTKA NK72913 sz. pályázat

Kontrol kártyák használata a laboratóriumi gyakorlatban

HAPMAP Nemzetközi HapMap Projekt. SNP GWA Haplotípus: egy kromoszóma szegmensen lévő SNP mintázat

Doktori (PhD) értekezés tézisei BETEGSÉG-ELLENÁLLÓ ALMAFAJTÁK ÉS FAJTAJELÖLTEK VIRÁGZÁS-FENOLÓGIAI ÉS TERMÉKENYÜLÉS-BIOLÓGIAI SAJÁTOSSÁGAI

Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP /1/A projekt

Mivel korábban már végeztünk mikroszatellit elemzést (Liker et al 2009), a kiértékeléshez szükséges szoftverek és tapasztalat rendelkezésre áll.

Átírás:

Kocsisné M. Gitta 1 Bolla Dávid 2 Ulrike Anhalt 3 Astrid Forneck 3 Körte tájfajták jellemzése mikroszatellit alapú molekuláris markerezéssel Pear cultivars characterization of microsatellite-based molecular marker kmg@georgikon.hu 1 Pannon Egyetem, Georgikon Kar, Növénytudományi és Biotechnológiai Tanszék, egyetemi docens 2 Pannon Egyetem, Georgikon Kar, egyetemi hallgató 3 Universität für Bodenkultur Wien Department für Nutzpflanzenwissenschaften Abteilung Wein- und Obstbau Magyarországon a körte mindig jelentős gyümölcsfajnak számított. A hagyományos, népi termesztésben lévő, változatos ökológiai viszonyokhoz alkalmazkodó tájfajták a XX. század közepén lassan visszaszorultak. Helyüket átvették a Nyugat-Európából származó, páraigényes fajták. Termesztett fajtáink változatosságát, tűrőképességét és minőségét a génbankokban őrzött növényanyagra támaszkodva tudjuk növelni. Emiatt elengedhetetlen a növényanyag genetikai és pomológiai tulajdonságainak pontos ismerete. YAMAMOTO et al. (2001) almából izolált mikroszatellitek primerek körténél való alkalmazhatóságát vizsgálta. A méréseket P. communis, P. bretschneideri, P. ussuriensis, P. pyrifolia és P. calleryana fajok több fajtája, valamint a P. communis és P. pyrifolia két hibridje bevonásával végezte. Valahány primer jól elkülöníthető fragmenseket sokszorosított az összes mintánál. KIMURA et al. (2002) hat Pyrus fajról származó hatvan mintát vizsgált kilenc SSR marker segítségével. A vizsgálat során százharminchárom vélt allélt találtak. Ötvennyolc fajtát tudtak sikeresen megkülönböztetni, két minta klónnak bizonyult. GASI et al. (2013) hatvannégy körte genotípust vizsgált meg, melyek között a srebreniki génbankból származó hagyományos bosznia-hercegovinai, nemzetközi standard és Szarajevó környékén gyűjtött, feltételezett tájfajták is szerepeltek. Előbbi kettő csoport között szignifikáns genetikai különbséget állapítottak meg, míg a génbanki fajták és a begyűjtött tételek közt ilyen különbség nem állt fenn. Ez alapján a hazai állomány értékes génforrásnak bizonyult. STRACIERI et al. (2015) tizenkilenc brazíliai fajtát huszonegy SSR marker segítségévelt vizsgált. Segítségükkel egyértelműen elkülöníthetők voltak a P. communis, P. pyrifolia és P. betulaefolia fajtái, valamint ezek hibridjei. ERFANI et al. (2012) P. pyrifolia, P. communis és P. bretschneideri fajoktól származó negyvenhét genotípus, valamint a P. salicifolia és P. mazandaranica vad fajok rokonságát és diverzitását értékelte huszonnyolc mikroszatellit primer pár segítségével. A Pannon Egyetem Georgikon Kar keszthelyi körte génbankjában több, mint 200 fajta körte található. Köztük számos hazai tájfajta, melyeknek sem eredetét, származását, sem rokonsági kapcsolatait nem ismerjük. Vizsgálatainknál körtefajtákat jellemeztünk mikroszatellit alapú molekuláris markerezés segítségével. Anyag és módszer A vizsgálni kívánt genotípusok kiválasztásakor szempont volt, hogy legtöbbjük hazai tájfajta legyen, emellett legyen köztük néhány nemzetközi standard fajta az összehasonlításhoz. 81 saját mintánk mellett a BOKU saját telepéről származó 7 standard fajtát is bevontunk a vizsgálatba. A vizsgált fajták a következők voltak: 164

Magyar tájfajta Régi külföldi fajta Korai szagos, Kiss Margit, Fehérvári körte 1., Nyári körte Dunaföldvár, Piros nyári körte Bicske, Köcsög körte VK 3, Szűcsi II., Csákvári nyári 010, Őszi körte Leányfalu, Mézes körte, Citrom körte, Köcsög VK 2, Bikácsi nagy szegfű, Révész Bálint A, Köcsög körte, Nyári zöld kobak, Zsámbéki 214, Magyar kobak, Selmeci körte II., Fehérvári körte, Szentendrei császár, Császár körte, Leányfalusi piros, Macskafej, Szűcsi IV., Szűcsi szegfű típus, Szűcsi körte Bore típus, Erdélyi II., 1/7 Ráckeve, Őszi császár körte Törökbálint, Mandula vajkörte, Nagy szegfű körte, 395 Zöld Magdolna, Mezőkövesdi 3, Téli Kálmán, Nyári király körte, Móri császár, Erdélyi III., Fertődi rozsdás, Szűcsi III., Őszi pálinka, Szobi legkorábbi, Solymári cukor, Mezőkövesdi 2, Mosolygó, Miklós, Fujtós körte, Mogyoródi óriás, Piroska Hertich Bergamottja, Árpával érő, Nyári Kálmán, Bella di Giugno,,, Hóka, Nyári esperes, Tarjáni körte, Mária Lujza,, Totyakos császár, Favrené, Aromata de Bistrica, Amanlis vaj Pákozd, Melló bárónő, Pittmastoni hercegnő, Miniszter Lucius, Drouard elnök, Stössel Tábornok, Marianna hercegnő, Pap körte igen bőtermő Sárospatak, Orient, Moon Geon, Izambert, Malinéri Jozefin Standard fajta a Georgikonról Standard fajta a BOKU-ról 1. táblázat. A vizsgálatba vont körtefajták Bosc kobakja, Vilmos, Beurré d' Anjou, Hosui Abbe Fetel, Williams, Uta 12a, Packham s Triumph, Alexander Lucas, Bosc Flaschenbirne, Gute Louise A génbank 81 fajtájáról 2015. április 21-én gyűjtöttünk levélmintát, fajtánként 10-15 db levelet. Fontos volt, hogy a mintagyűjtés rügyfakadáskor történjen, mivel a fiatal levelek tartalmazzák a legtöbb intakt DNS-t. A területen hűtött táskába kerültek a bezacskózott és megjelölt levélminták, majd a laborban folyékony nitrogénnel (-196 C) sokkfagyasztottuk őket. A feldolgozás megkezdéséig a mintákat -70 C-on tároltuk. Az előkészítés első lépéseként a minták mindegyikét liofilizáltuk (CHRIST Beta 2-4 LD plus LT). A fagyasztva szárítás megkönnyítette a minták további feldolgozását, mivel így a levelek DNS tartalma hűtés nélkül is stabil maradt. A minták örlését golyós malommal (RETSCH MM 400) végeztük. Az így kapott őrleményből a DNS kivonáshoz kb. 50 mg mennyiséget 1,5 ml-es mikrocsőbe töltöttem. A DNS kivonás sikerességét és a DNS becsült mennyiségét agaróz gélelektroforézissel 1% 1 TBE agaróz gélen ellenőriztük. A DNS méretének becsléséhet DNS-létraként 1 kb GeneRulert (Thermo Fisher Scientific, Waltham, USA) használtunk. A mintákat ez alapján 2:3 arányban felhígítottam 0.05 TE pufferral, annak érdekében, hogy a PCR sikeres legyen. A PCR terméket 1%-os agaróz gélen, 100 bp GeneRuler létrával, előzetesen teszteltük. A fragmentumok detektálását Fragment Analyzer (Advanced Analytical, Heidelberg, Németország) géppel végeztem. 165

Marker Kapcsoltsági csoport forward szekvencia reverse szekvencia CH01d09 2 GCCATCTGAACAGAATGTGC CCCTTCATTCACATTTCCAG CH03d12 3 GCCCAGAAGCAATAAGTAAACC ATTGCTCCATGCATAAAGGG CH03g07 1a AATAAGCATTCAAAGCAATCCG TTTTTCCAAATCGAGTTTCGTT CH04e03 3 TTGAAGATGTTTGGCTGTGC TGCATGTCTGTCTCCTCCAT CH05c06 1b ATTGGAACTCTCCGTATTGTGC ATCAACAGTAGTGGTAGCCGGT EMPc11 1b GCGATTAAAGATCAATAAACCCATA AAGCAGCTGGTTGGTGAAAT EMPc117 1b GTTCTATCTACCAAGCCACGCT CGTTTGTGTTTTTACGTGTTG GD147 3 TCCCGCCATTTCTCTGC AAACCGCTGCTGCTGAAC 2. táblázat. A felhasznált markerek EREDMÉNYEK ÉS ÉRTÉKELÉSÜK 88 körtefajtát 8 SSR marker segítségével vizsgáltunk, így 8 88=704 kiértékelendő eredményt kaptunk. Ebből mindössze 11 nem volt értékelhető. Abban az esetben, ha csak egy fragmentumot tudtunk azonosítani, homozigótának tekintettük a fajtát az adott lókuszon. Mivel a null allélok jelenléte nem zárható ki, előfordulhat, hogy a heterozigótaság értékeket alábecsültük. A nyolc primerpárral összesen 216 polimorf fragmentumot amplifikáltunk. Az átlagos allélszám 27/lókusz. A legkevesebb allélt (11) a CH04e03 primerpárral kaptuk, míg a legtöbbet (44) a CH03g07-tel. A várt heterozigótaság (He) 0,72 (CH04e03) és 0,95 (CH03g07) között alakult, míg az átlag 0,88. A megfigyelt heterozigótaság (Ho) 0,01 (CH04e03) és 1,00 (GD147) között alakult, az átlag 0,80 volt. A null allélok becsült gyakorisága 3 lókusznál (CH04e03, CH03d12, CH03g07) adott pozitív értéket, ez azonban csak a null allélok jelenlétének lehetőségét mutatja, és nem szükségszerű jelenlétüket. SEHIC et al. (2012), GASI et al. (2013) és QUEIROZ et al. (2014) hasonló markereket alkalmazva eltérő eredményre jutottak az allélok száma tekintetében. A talált allélok száma esetükben 104, 159 és 68, az átlagos lókuszonkénti allélszám 10,4, 14,5 illetve 11,3. A várt heterozigótaság átlaga 0,78 és 0,806 (Gasi et al. nem adta meg) és a megfigyelt heterozigótaság átlaga 0,74, 0,81 és 0,852. A kapott allélméret intervallumokat PUSKÁS et al. (2015) munkájának értékeivel összehasonlítva látjuk, hogy négy lókusz (EMPc11, EMPc117, CH05c06, CH01d09) esetében hasonló értékeket kaptunk. A másik négy lókusznál (CH03g07, CH03d12, GD147, CH04e03) nagyobb eltérések tapasztalhatók. Lókusz Allélok száma Allélméret intervallumok Saját PUSKÁS et al. He Ho n CH04e03 11 114-205 169-229 0.7206 0.0114 0.4122 CH03d12 17 94-125 83-159 0.8628 0.6023 0.1399 GD147 17 114-131 123-167 0.8551 1.0000-0.0781 EMPc11 26 133-159 127-174 0.9138 0.9773-0.0332 166

CH05c06 28 78-118 76-128 0.8827 0.9545-0.0381 EMPc117 36 86-135 85-140 0.9296 0.9773-0.0247 CH01d09 37 124-170 120-179 0.9418 0.9886-0.0241 CH03g07 44 191-309 119-284 0.9458 0.9205 0.0130 3. táblázat. A nyolc SSR lókusz jellemzése 88 fajta alapján; az intervallumok összehasonlítása A mért fragmentumhosszok lókuszonkénti gyakoriságát is megfigyeltük. A legnagyobb gyakoriságú allél vagy allélok tekinthetők vad típusnak, a többi allél valószínűleg ezekből alakulhatott ki mutációval. A nagy, 0,1 feletti gyakoriságú allélokat kiemeltük. A nyolc lókuszon detektált allélok gyakoriságát négy kategóriába soroltuk. A nagyon gyakori kategóriába (0,2 és a feletti gyakoriságú) csak 6 (2,8%) allél tartozik. Gyakorinak a 0,05 és 0,2 közötti allél gyakoriságot tekintettük, amely kategóriába 40 allél (18,5%) tartozik. A 0,01 és 0,05 közötti gyakoriságkategóriába összesen 109 allél (50,5%) került, ezeket ritkának tekintettük A 261 polimorfizmus közül 68 allél egyedi volt, azaz összesen csak egyszer fordult elő. Ide soroljuk a 0,01 gyakoriság alatti, nagyon ritkának tekintett allélokat, melyek száma 61 (28,2%), illetve a CH04e03 lókusz esetében a 7 darab ritka allélt. Az egyedi allélok lókuszonkénti száma 3 és 20 között változik. SEHIC et al. (2012) munkájában 86 minta 10 markerrel való vizsgálata során 20 egyedi allélt talált. Az egyedi és ritka allélok nagy száma, és a fajták dendrogramon látható nagy távolsága alátámasztják, hogy a vizsgált fajták nagy értékkel bírnak a genetikai diverzitás szempontjából. Lókusz Nagyon gyakori (0,2=<) Gyakori (0,05-0,2) Ritka (0,01-0,05) Nagyon (0,01=>) EMPc11 0 7 15 4 GD147 2 4 8 3 CH03d12 1 6 6 4 CH04e03 2 2 7 0 CH05c06 1 4 12 11 EMPc117 0 4 25 7 CH01d09 0 6 19 12 CH03g07 0 7 17 20 Összesen 6 40 109 61 % 2,8 18,5 50,5 28,2 4. táblázat. A lókuszok gyakorisága A lókuszonként egy vagy kettő fragmentumot amplifikáló fajtákat diploidnak tekintettük. Ennek a feltételnek, mind a nyolc lókusz esetében, csupán 29 fajta felelt meg. Az allélösszetétele alapján 59 fajta mutatkozott triploidnak. Ezeknél 1-4 számú lókuszon három különböző allélt detektáltunk. A lókuszonkénti kettőnél több allél jelenléte nem feltétlenül jelenti azt, hogy a fajta poliploid. Ez adódhat mérési hibából és kiméra jelenlétéből is. A ploidszint pontos meghatározásához további vizsgálatok lennének szükségesek. ritka 167

A vizsgálat során mind a 88 genotípust eltérő allél-összetételűnek találtuk. Az értékelést, a fajták összehasonlítását a következő csoportosításban végeztük: o Standard fajták összevetése más szakirodalom adataival, illetve a két, mindkét egyetem standardja közt megtalálható fajta pár összevetése ( Vilmos - Williams ; Bosc kobakja - Bosc Flaschenbirne ) o Azonos nevű fajták összevetése: Korai szagos A és B, Melló bárónő A és B, Nyári esperes A és B, Fehérvári körte A és B, Császár körte A és B. o Fajtakörön belüli fajták összehasonlítása: Császár körte, Köcsög körte típusok. o Azok a fajták, melyek nevében a származási hely, vagy valamilyen más tulajdonság megnevezése közös. Ilyen megnevezések az erdélyi, mezőkövesdi, szűcsi, leányfalusi illetve szegfű. A dendrogram elágazásai a fajták egymáshoz viszonyított rokonságát fejezik ki, az egyes fajták törzstől való eltérő távolsága pedig azt, hogy az adott fajta mennyiben változott meg a közös őshöz viszonyítva, mennyiben különbözik attól. Minél távolabb van egy adott fajta a törzstől, annál több mutáció ment végbe benne így annál kevesebb allélja közös a többi fajtával. A dendrogram alatt található mérce ezt a különbözőséget mutatja. Így pl. megállapítható, hogy méréseink szerint a Nyári körte Dunaföldvár, amely a legtávolabb helyezkedik el a törzstől, alléljainak már csak hozzávetőlegesen 50%-a egyezik meg a közös ős alléljaival. Ugyanígy a többi fajta távolsága is leolvasható. A dendrogram három fő ágból épül fel, mindegyik fő ágban egyaránt megtalálhatók a magyar, a külföldi és a standard fajták is. A BOKU-ról származó standard fajták allélhosszait összevetettük PUSKÁS et al. (2015) adataival, és 1-9 bp különbséget tapasztaltunk. Ez az eltérő gyártótól származó vegyszerek és műszerek használatából adódhat. A későbbiekben ezeket a fajtákat belső standardként használtam, hogy a méréseimben szereplő allélhosszaikat összevessem a már ismert adatokkal. Méréseim hitelesnek mondhatók, mivel a belső standardhoz képest, egyes lókuszok 1-3 bp-os különbségével, azonos eredményeket kaptam. A magyar és az osztrák standard fajták közül két pár azonos fajtanévvel rendelkezett. A Williams Christ és a Vilmos allélösszetétele 1 bp-os különbségekkel azonosnak mutatkozik, közeli rokonságuk a dendrogramon is látható. Különbség a két fajta között, hogy a Vilmos esetében egy lókuszon egyel kevesebb, egy lókuszon pedig egyel több allélt találtam. Utóbbi kiértékelési hiba lehet, mivel utóbbi esetében triploid lenne a Vilmos. A Bosc kobakja és a Bosc Flaschenbirne alléljai is egyezést mutatnak, itt azonban három lókusznál találtam egyel több allélt. A dendrogramon közeli rokonságot mutatnak. A Korai szagos fajta két változata közt szoros rokonságot állapíthatunk meg a dendrogram alapján, alléljaik közt egy alkalommal 1 bp eltérés látható. Valószínűleg azonos fajtáról van szó, az eltérés oka az A változat két lókuszának hiányzó értéke. A Nyári esperes, a Melló bárónő és a Császár körte A és B változatainál is hasonló 1 bp-os eltéréseket tapasztalunk. Az 1 és 2 bp eltérés mérés közbeni csúszás eredménye. Ez az eltérés annyira jelentéktelen, hogy e fajták változatait azonos fajtának tekinthetjük. A Fehárvári körte A és B változata viszont a dendrogram két külön főcsoportjába tartoznak, a B változat három lókuszon is 1 bp-nál nagyobb eltéréseket mutat, és két lókuszon három alléllal rendelkezik. Azért ezek a változatok külön fajtának tekintendők. A Császár körte mind a hat változata a dendrogam ugyanazon fő ágába tartozik. Szoros rokonság állapítható meg a Császár körte a Móri császár és a Szentendrei császár között. Ezektől eltérő mellékágon található a másik két szoros rokonságban lévő fajta, a Totyakos császár és az Őszi császár körte Törökbálint. SZANI (2015) szerint a Császár körte megnevezés régi keletű, az évszázadok során a jó minőségű körte márkajegyévé vált, ilyen módon számos fajtára használt név. A Köcsög körte három fajtája is szoros rokonságot mutat, eltérés köztük csak két lókusz esetében az allélok számában mutatkozott. Az Erdélyi körte II. és az Erdélyi körte III. a dendrogram két külön fő ágában foglalnak helyet, így szoros rokonság nem áll fenn köztük. A Mezőkövesdi 2 és Mezőkövesdi 3 bár ugyanabban a fő ágban található, távolságuk nagyobb, közös alléljaik száma kevesebb, mint a két Erdélyi körte esetében, így rokonságuk 168

távolabbi. A szűcsi megnevezésű fajták közül a Szűcsi II., Szűcsi III. és Szűcsi szegfű típus egyazon főágban található, rokonságuk közeli. A Szűcsi IV. és a Szűcsi körte Bore típus a fa egy-egy külön fő ágában található, ezért ezek rokonság sem egymással, sem az első három fajtával nem mondható közelinek. A két leányfalusi fajta nem közeli rokon, mivel két külön főágban helyezkednek el. A szegfű típusú körték közül a Bikácsi nagy szegfű és a Nagy szegfű körte egymás mellett foglal helyet, rokonságuk szoros. A Szűcsi szegfű típus egy másik fő ágban található, ezekkel kevéssé rokon fajta. Szokatlan eredmény, hogy a Hosui fajta nem képez külön csoportot a dendrogramban, annak ellenére, hogy nem a P. communis, hanem a P. pyrifolia fajtája. 169

1. ábra A fajták rokonsági viszonyai az SSR fragmentumok súlyozatlan Neighbor -Joining módszer elemzése által. Forrás: Bolla 0 0.1 Szentendrei császár Császár körte B Fehérvári körte B Császár körte A Móri császár Alexander Lucas Miniszter Lucius Moon Geon Gute Louise Szucsi szegfu típus Leányfalusi piros Mogyoródi óriás Szucsi II Orient Erdélyi II Totyakos császár Vilmos Fertodi rozsdás Williams Oszi császár körte Törökbálint Szucsi III Selmeci körte II Mezokövesdi 2 Aromata de Bistrica Mária Lujza Nyári esperes B Nyári esperes A Beurré d' Anjou Amanlis vaj Pákozd Mandula vajkörte Mezokövesdi 3 1/7 Ráckeve Köcsög körte VK 3 Csákvári nyári 010 Köcsög körte Köcsög VK 2 Hóka Zsámbéki 214 Kiss Margit Erdélyi III Izambert Bosc kobakja Szucsi körte Bore típus Bosc Flaschenbirne Fehérvári körte A Fehérvári körte 1 Korai szagos B Korai szagos A Árpával éro Téli Kálmán Mosolygós Hertich Bergamottja Szobi legkorábbi Fujtós körte Mézes körte Révész Bálint A Solymári cukor Nagy szegfu körte Hosui Bikácsi nagy szegfu Piroska Nyári zöld kobak Stössel Tábornok Melló báróno B Uta 12a Melló báróno A 395 Zöld Magdolna Oszi körte Leányfalu Oszi pálinka Drouard elnök Marianna hercegno Abbe Fetel Favrené Malinéri Jozefin Packham's Triumph Citrom körte Szucsi IV. Pittmastoni hercegno Miklós Piros nyári körte Bicske Bella di Giugno Macskafej Magyar kobak Nyári király körte Tarjáni körte Pap körte igen botermo Sárospatak Nyári Kálmán Nyári körte Dunaföldvár 170

KÖVETKEZTETÉSEK A markeranalízis során tapasztalt ritka és igen ritka allélok nagy száma mutatja, hogy a régi fajták óriási értékkel bírnak a genetikai diverzitás szempontjából. Ezeket a régi fajtákat, mint génforrásokat, fel lehet és fel kell használni a fajtanemesítés során, mivel a fajtahasználat beszűkülése a termesztésben ökológiai katasztrófához vezethet. A pontos eredmények elérése érdekében célszerű lenne a vizsgálat biológiai és technikai megismétlése. Előbbi alatt egy fajta két különböző egyedéről történő mintavételt, utóbbi alatt ugyanazon minta kétszeri bemérését értjük. Javasoljuk a genetikai markerezés eredményeit a fajták pomológiai vizsgálatának eredményeivel összevetni. A fajták fenológiai és morfológiai tulajdonságai az UPOV számkulcsos módszerével értékelhetőek és statisztikai módszerekkel összehasonlíthatók. Az UPOV és SSR eredmények korrelációja is megállapítható. A fajták ploidszintjének pontos meghatározásához flow citometriás vizsgálat elvégzése javasolt. Ugyanehhez a pomológiai leírások is segítségül szolgálnak, mivel a késői érés, a nagy gyümölcs és a léha magvak jelenléte a triploid fajták jellemzői. Irodalom 1. Erfani, J., Ebadi, A., Abdollahi, H., Fatahi, R. (2012): Genetic Diversity of Some Pear Cultivars and Genotypes Using Simple Sequence Repeat (SSR) Markers. Plant Molecular Biology Reporter. 30: 1065-1072. 2. Gasi, F., Kurtovic, M., Kalamujic. B., Pojskic, N., Grahic, J., Kaiser, C., Meland, M. (2013): Assessment of European pear (Pyrus communis L.) genetic resources in Bosnia and Herzegovina using microsatellite markers. Scientia Horticulturae. 157: 74-83. 3. Kimura, T., Shi, Y. Z., Shoda, M., Kotobuki, K., Matsuta, N., Hayashi, T., Ban, Y., Yamamoto, T. (2002): Identification os Asian pear varieties by SSR Analysis. Breeding Science 52: 115-121. 4. Puskás, M., Höfer, M., Sestraş, R. E., Peil, A., Sestraş, A. F., Hanke M-V., Flachowsky, H. (2015): Molecular and flow cytometric evaluation of pear (Pyrus L.) genetic resources of the German and Romanian national fruit collections. Genet. Resour. Crop Evol. pp. 1-11. 5. Queiroz, A., Assuncao, A., Ramadas, I., Viegas, W., Veloso, M. M. (2015): Molecular characterization of Portuguese pear landraces (Pyrus communis L.) using SSR markers. Scientia Horticulturae 183: 72-76. 6. Queiroz, A., Assuncao, A., Ramadas, I., Viegas, W., Veloso, M. M. (2015): Molecular characterization of Portuguese pear landraces (Pyrus communis L.) using SSR markers. Scientia Horticulturae 183: 72-76. 7. Stracieri, J., Magalhaes H. M., Resende, L. V., Carvalho, L. C. C. (2015): Simple sequence repeat (SSR) markers are effective for identifying pear cultivars and selections. African Journal of Biotechnology. 14: 68-75. 8. Szani, Zs. (2012): Főbb tájfajtáink. in: Nyéki, J., Szabó, T., Soltész, M. (szerk.): Körtefajták vizsgálata génbankokban. Debreceni Egyetem AGTC MÉK Kertészettudományi Intézet, Debrecen. p. 58. 9. Yamamoto, T., Kimura, T., Sawamura, Y., Kotobuki, K., Ban, Y., Hayashi, T., Matsuta, N. (2001): SSRs isolated from apple can identify polymorphism and genetic diversity in pear. Theoretical and Applied Genetics. 102: 865-870. 171