A HIV eredete(i)!!! Több független átugrás 4 sikeres csoport: " HIV-1 M és O csoportja " HIV-2 A és B csoportja Több sikertelen csoport
Járványos törzsek: szűk időablak! Az összes sikeres HIVcsoport a 20. század első felében ugrott át emberre. HIV-csoport Utolsó közös ős References 1920 (1902-39) Salemi et al. 1937 (1925-49) (2000) Korber et al. 1931 (1915-41) HIV-1 group M (2000) 1921 (1908-33) Worobey et al. 1902 (1873-1922) (2008) 1908 (1884-1924) HIV-1 group O Lemey et al. 1920 (1890-1940) (2004) 1905 (1866-1938) Wertheim & Worobey (2009) Wertheim & HIV-1 group N 1963 (1948-77) Worobey (2009) HIV-2 group A Lemey et al. 1940 (1924-56) (2003) Wertheim & 1932 (1906-55) Worobey (2009) HIV-2 group B Lemey et al. 1945 (1931-59) (2003) Wertheim & 1935 (1907-61) Worobey (2009)
Az időzítés problémája! Miért nem előbb? Bushmeat vadászat: vírusforrás a történelem előtti idők óta! Urbanizáció, megnövekedett mobilitás, stb.! Parenterális átvitel? Source: Nature 455, 605.
Később miért nem? HIV emergence HIV-1-O HIV-1-M HIV-2-A and B Cities Living wild chimps Global syringe production Treatments in Belgian Congo # of people Jenner. vacc. treated in in millions millions 400k 200k 40k 2 million 300k 10 8 10 7 10 6 10 5 10 4 1910 1930 1950 1970 Time
Hipotézis A HIV-járványok epicentrumai különlegesen kedvező körülményeket kínáltak a vírus heteroszexuális terjedéséhez.! A jelenlegi terjedést befolyásoló tényezők: Kapcsolati háló (partnercsere, párhuzamos kapcsolatok) Akut fertőzés Körülmetélés Genitális fekélyek (Genital ulcer disease, GUD)! Ugyanezek a tényezők játszhattak szerepet a HIV korai terjedésében.
Esettanulmány: Kinshasa! A HIV-1 M csoportjának epicentruma! Adatgyűjtés Tudományos irodalom (orvosi, virológiai, néprajzi, stb.) Eredeti archívum-feldolgozás
Esettanulmány: Kinshasa
Esettanulmány: Kinshasa! GUD csúcs a 20. század elején! A mainál alacsonyabb körülmetélési ráta
Szimulációs modell! Egyed alapú modell HIV státusz (a fertőzés kora) GUD státusz (a fekély kora) Körülmetélt státusz! Kategóriák: Egyedülálló férfi/nő Házas férfi/nő Femmes libres Prostituált (Commercial sex worker, CSW)! Rögzített populációméret! Dinamikus kapcsolati háló! Időlépés: 1 hét, időtartam: 1 év.! Sztochasztikus folyamatok.
Szimulációs modell: szexuális háló
Szimulációs modell: szexuális háló! Stabil linkek
Szimulációs modell: szexuális háló! Stabil linkek! Rövid távú linkek
Szimulációs modell: szexuális háló! Stabil linkek! Rövid távú linkek! CSW linkek! Paraméterek: Yaoundé, friss adatok
Szimulációs modell: szexuális háló 1. HÉT
Szimulációs modell: szexuális háló 2. HÉT
Szimulációs modell: szexuális háló 3. HÉT
Szimulációs modell: a HIV terjedése 1. HÉT
Szimulációs modell: a HIV terjedése 2. HÉT
Szimulációs modell: a HIV terjedése 3. HÉT
Szimulációs lépés 1. Szexuális linkek felbomlása és keletkezése 2. Szexuális kontaktusok generálása 3. HIV átadása a kontaktusokon keresztül 4. GUD és HIV státusz, fertőzött időtartam frissítése
Szimulációs lépés 1. Szexuális linkek felbomlása és keletkezése 2. Szexuális kontaktusok generálása 3. HIV átadása a kontaktusokon keresztül 4. GUD és HIV státusz, fertőzött időtartam frissítése! A szexuális hálózat szimulációja, amíg beáll az egyensúlyi struktúra.
Szimulációs lépés 1. Szexuális linkek felbomlása és keletkezése 2. Szexuális kontaktusok generálása 3. HIV átadása a kontaktusokon keresztül 4. GUD és HIV státusz, fertőzött időtartam frissítése! A szexuális hálózat szimulációja, amíg beáll az egyensúlyi struktúra.! HIV-fertőzés indítása egyetlen férfiben.
Szimulációs modell: paraméterek A heteroszexuális terjedést befolyásoló tényezők:! Kapcsolati háló (partnercsere, párhuzamos kapcsolatok)! Genitális fekélyek (GUD)! Akut fertőzés! Körülmetélés! Kezdetben alacsony hatékonyság
A kapcsolati háló paraméterei
Kinshasa: történeti szcenáriók! Prekoloniális falu: kis népesség, kiegyensúlyozott ivararány, nincs GUD.! 1919: növekvő populáció, torzult ivararány, tomboló GUD-járványok, körülmetéletlen népcsoportok.! 1929: további népességnövekedés! 1958: további népességnövekedés, általános körülmetéltség, GUD-kontroll, normalizálódó ivararány
Eredmények#1: történeti szcenáriók 1000 futtatás minden szcenárióra! 1919-ben és 1929-ben különösen kedveztek a feltételek a HIV terjedésének.
Érzékenységi vizsgálat Az eredmények robusztusak voltak! a kapcsolati háló paraméterei! az alap átviteli ráta! a körülmetélés védőhatása! a krónikus stádium fertőzőképessége tekintetében.
Eredmények#2: mely tényezők voltak fontosak? Az 1919-es beállításokból kiindulva teszteltük:! 10-szeresen csökkentett populációméret! kiegyensúlyozott ivararány! GUD hiánya! általános körülmetélés hatását.
Eredmények#2: mely tényezők voltak fontosak?! A GUD-prevalencia volt messze a legerősebb tényező.
Összegzés! A HIV-járvány elindulásában kulcsszerepe lehetett a gyarmati központokban kialakult GUD-járványoknak.! Az időablakot valószínűleg a GUD-járványok visszaszorítására indított kezelési kampányok zárták be a 30-as évek közepén.! A körülmetélés és a populációméret/szerkezet valószínűleg a GUD-gyakoriságon keresztül közvetett hatást fejtett ki.! A nemi fekélyt okozó betegségek kontrollja kulcsfontosságú újabb HIV-törzsek kialakulásának megakadályozásában.! (a GUD-járványok szerepe a többi járványos HIV-csoport kialakulásában is fontos lehetett: HIV-1 O Doualában (Kamerun), HIV-2 A és B Abidjanban (Elefántcsontpart)).
Mire jók még a modellek?