9. Előadás. Peptidek,fehérjék
|
|
|
- Ottó Gál
- 4 évvel ezelőtt
- Látták:
Átírás
1 9. Előadás Peptidek,fehérjék
2 Előzmények Peptidkémia Analitikai kémia Protein kémia 1901 E. Fischer : Gly-Gly 1932 Max Bergman és Leonidas Zervas : Benziloxi-karbonil csoport 1963 B. Merrifield : Szilárd fázisú peptid szintézis 1988 Á. Furka : Kombinatorkus peptid szintézis 1923 Fritz Pregl : Mikroanalitika 1969 Cs. Horváth: Analitika/preparativ HPLC Elektroforézis öntgen (X-ray) krisztallográfia NM Tömeg spektrometria 1945 F. Sanger : Sanger reagens (N-treminális) 1948 W.Stein és S. Moore : Aminosav összetétel (ninhidrin) 1950 P. Edman : Protein szekvenálás 1952 F. Sanger : Inzulin primer szerkezete 1962 M. Perutz, A. Kendrew Mioglobin térszerkezet
3 A peptid kötés: amid kötés (E. Fischer, 1902) Emil Fischer John B. Fenn Nobel dij, 2002 N-terminális C-terminális Dipeptid: 2 ligopeptid : 2-15 Polipeptid: >15 Az aminosavakat összekapcsoló kötés a fehérjékben: karbonsav amid kötés. E. Fischer, Chem. Z. 26: 939 (1902) (peptid: a görög πεπτίδια, emészthető ) Nobel dij (1902) "in recognition of the extraordinary services he has rendered by his work on sugar and purine syntheses".
4 Peptid szintézis: a probléma H 2 N - CH - CH + H 2 N - CH - CH - H 2 H 2 N - CH - C - NH - CH - CH + H 2 N - CH - C - NH - CH - CH + H 2 N - CH - C - NH - CH - CH + H 2 N - CH - C - NH - CH - CH Keverék, alacsony konverzió, oldalláncok
5 Megoldás A koncepció: védőcsoportok és aktiválás Q 1 - NH - CH - C X + H 2 N - CH CQ 2 - HX Q 1 - NH - CH - C - NH - CH CQ 2 H - NH - CH - C - NH - CH CH Egyféle termék, magas konverzió Követelmények 1. Védőcsoportok - egyszerű beépítés, egyszerű eltávolítás 2. Hatékony aktiválás, kapcsolási reakció
6 Négy lépés 4.1. Védett (N-, C- és oldallánc) aminosavszármazékok H 2 N CH CH H 2 N CH CH ' Q HN CH CH H 2 N CH CQ vagy H 2 N CH C ' ' 4.2. A C-terminálison aktivált aminosavszármazék szintézise Q HN CH C X 4.3. Kapcsolás Q HN CH C HN CH CQ vagy ' Q HN CH C HN CH C ' 4.4. Védőcsoportok eltávolítása H 2 N CH C HN CH CH '
7 1. Védőcsoportok All modern work in Peptide synthesis employs the following approach: the amino group of one amino acid is first stabilized by the introduction of a protecting group, the carboxy group is modified so that it is capable of coupling, and finally the group is removed to produce the finished peptide. The difficulty lies in finding a suitable group, which can be removed so gently that the peptide is not significantly attacked. Bergman, M., Zervas, L.: Berichte Chem. 65, 1192 (1932) Követelmények 1. Könnyű és hatékony beépülés. 2. A peptidkötés érintetlensége a beépítés/eltávolítás alatt. 3. Több mint egyféle eltávolítási lehetőség. 4. Nincs racemizáció. 5. A melléktermékek egyszerű és könnyű eltávolítása. 6. A reakciók szobahőmérsékleten menjenek végbe. Csoportosítás 1. N a - védőcsoport 2. C a - védőcsoport 3. ldallánc védőcsoport
8 1. Benziloxi-karbonil (Z) N a -amino csoport védelme Bergman, M., Zervas, L. : Berichte Chem. 65,1192 (1932) Beépítés CH 2 C Benziloxikarbonil klorid Cl + H 2 N CH CH -HCl C H 2 C H N C H C H Benziloxikarbonil aminosav Eltávolítás bázis sav H 2 /kat HBr Lewis sav (Me 3 SiI) CH 2 H CH 2 Br CH 2 I + C 2 C 2 C H 2 N CH CH
9 2. t-butiloxi-karbonil (Boc) Carpino, L.A. et al. JACS (1957) Beépítés C H 3 C H 3 C C N 3 + H 2 N CH CH C H 3 terc-butiloxikarbonil azid C H 3 C H 3 C C H N C H C H + H N 3 Eltávolítás C H 3 terc-butiloxikarbonil aminosav H 2 /kat TFA bázis C 2 + H 3 C H 3 C C CH 2 + H 2 N CH CH 3. 9-Fluorenilmetoxi-karbonil Carpino, L.A. et al. JACS 92, 5748 (1970) Beépítés H CH 2 C Cl + H 2 N CH CH -HCl ' H Eltávolítás C H 2 C H N C H C H ' H 2 /kat bázis (20% piperidin/dmf) részleges sav + + CH 2 H 2 N CH CH C 2 '
10 Észter kötés kialakítása Karboxi védelem Beépítés H C H 2 - H 2 H 2 N CH CH + Cl C H 2 -HCl H 2 N C H 2 C C H 2 Eltávolítás H 2 /kat. sav (HF) bázis (pl. NH 3 ) H 2 N CH CH + H C H 2 toluol H 2 N CH CH + F C H 2 H 2 N CH CH + H C H 2 benzil alkohol
11 ldallánc védelem -H védőcsoport (Ser, Thr, Tyr) CH 2 H 3 C CH 3 CH 3 -SH védőcsoport (Cys) Benzil(éter) (Bzl) terc-butil (éter) (t-bu) Imidazol védőcsoport (His) Tritil (Trt) HN CH C CH 2 H 3 C p N t NH 4-Metiltritil (Mtt) Guanidino védőcsoport (Arg) CH 3 S 2 4-Toluolszulfonil (Tos)
12 2. A C-terminálison aktivált aminosavszármazék szintézise A karbonsav származékok aktivitása > C Cl > C > N 3 C > > > C Aktív észterek M. Bodanszky, 1955; J. Kovacs, 1967; L. Kisfaludy, 1973 H NH 2 Származék szintézis H N 2 Cl Cl Q 1 - NH - CH - C + H Cl Q 1 - NH - CH - C H Cl F Cl F X H F F F + H 2
13 Aktív észter (S N ) 3. A peptidkötés kialakítása C + H 2 N ' C + H-C 6 H 5 HN ' Acil azid (nincs racemizáció) C N + H 2 N ' C HN ' + H N 3 N N acemizáció: az enantiomer átalakulása enantiomer keverékké sp 3 H -H NH C bázis +H NH C sp 2 +H L NH H C NH D H C
14 acemizáció Az enantiomer átalakulása enantiomer keverékké sp 3 H -H NH C bázis NH C sp 2 +H +H Mechanizmus NH H C L a: direkt enolizáció NH H C D B H NH C C X NH C C X +H NH C C H X b: oxazolon képződés* C H H a N C.. X H C B - HB C H N H C C X - HX C a H N C C - H + C.. N C H HX C N C H H + C N C X C C C * :B nélkül :N iniciálja a reakciót
15 A racemizáció és a kormeghatározás Halál után Halál után
16 Szegmens kondenzáció Szintézis stratégiák Q - NH C-X H 2 N C Q, Q - NH C-X H 2 N C - Q, Q- NH C - Q, Q - NH C - Q, észleges hasítás / aktiválás észleges hasítás Prot - NH C-X H C Q, 2 N Q - NH C Q, Hasítás H 2 N CH Lépésenkénti hosszabbítás (a C-terminálison) Q - NH C-X H 2 N C Q, Q - NH C Q, észleges hasítás / aktiválás Q - NH C-X H 2 N C Q, Q - NH C Q, etc.
17 A szilárd fázisú peptid szintézis főbb szempontjai A. A szilárd felszín 1. Tartalmazzon reaktív csoportokat funkcionalizálásra 2. Peptid-polimer kötés hasítható legyen 3. Stabil legyen a szintézis körülményei között 4. A peptidlánc hozzáférhető legyen az oldószer és a reagensek számára B. Védőcsoport kombinációk 1. Peptid-polimer kötés stabil legyen a szintézis alatt 2. Átmeneti védőcsoport az a-amino csoporton 3. Állandó védőcsoport az oldalláncokon 4. Hatékony hasítás. Védőcsoport kombinációk a b c a. N a - védőcsoport ( átmeneti") b. ldallánc védőcsoportok ( állandó") c. Gyanta-peptid kötés
18 Boc/benzil stratégia - Merrifield módszer CH 3 CH 3 C-NH CH C CH 2 P CH 3 CH 2 Erős savakra érzékeny (HF, TFMSA) Fmoc/t-butil stratégia - Sheppard módszer H C-NH CH C CH 2 CH 2 P CH 2 Bázisra érzékeny (piperidin / DMF) CH 3 CH 3 CH 3 TFA érzékeny Összegzés Functionalized polymer Solid phase peptide synthesis Fully protected peptide-resin deprotection Characterization cleavage peptide-resin enzyme digestion AAA HPLC MS Purified peptide purification Crude free peptide (control by HPLC, AAA, etc.)
19 Nem-peptidek Peptid Szintézis formák Multiple Keverék Párhuzamos Kombinatorikus vegyület tárak T-bag szintézis Tűhegy módszer Folt szintézis (1988) Fotolitográfia/csip Mit találhatunk a szintézis nyers termékében? Célpeptid(!) Hibás peptidek övidebbek Ac-DEFGHIK Ac-HIK Hiányosak ABCDEFHIK (minus G) ABCDFGHIK (minus E) ABCEFGHIK (minus D) ACDEFGHIK (minus B) észlegese szabad peptidek Scavengers Védőcsoport származékok Minden más..
20 Kombinatorikus szintézis: keverés-osztás elv Furka et al. Int. J.Pept. Prot. es. (1991) Peptid keverékek (peptid-tár, peptide library ) T A D E F G H I K L M N P Q S T V W Y X 1 T A D E F G H I K L M N P Q S T V W Y X 2 X 1 T - X 2 X 1 T
21 Kombinatorikus szintézis: párhuzamos T A D E F G H I K L M N P Q S T V W T T T T T T T T T T T T T T T T T T Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T A D E F G H I K L M N P Q S T V W Y T T T T T T T T T T T T T T T T T T T Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q T T T T T T T T T T T T T T T T T T T Y T Q T Folt (spot) peptidszintézis
22 Bevezetett peptid gyógyszerek Első generáció Második generáció xytocin (L) ACTH (1-24) & (1-39) (L,S) Vasopressin (L,S) Insulin (E,SS, ) Glucagon (E,S,) Calcitonins (L,S,) TH (L) Gonadorelin (L,S) Somatostatin (L,S) GHH (1-29) & (1-44) (S) CF (Human & vine) (S) Cyclosporin (F) Thymopentin (L) Thymosin Alpha-1 (S) Secretins (Human & Porcine) (E,S) Parathyroid Hormone (1-34) & (1-84)(S) Vasoactive Intestinal Polypeptide (S) Brain Natriuretic Peptide () Cholecystokinin (L) Tetragastrin (L) Pentagastrin (L) Eledoisin (L) Carbetocin (S) Terlipressin (L,S) Felypressin (L,S) Buserelin (L,S) Deslorelin (L,S) Goserelin (L) Histrelin (L) Leuprolide (L,S) Nafarelin (S) Tryptorelin (L,S) Lecirelin (S) Lanreotide (S) ctreotide (L,S) Atosiban (L) Desmopressin (L,S) Lypressin (L) rnipressin Pitressin (L) ACE Inhibitors (Enalapril, Lisinopril) (L) HIV Protease Inhibitors (L) Új generáció Abarelix (L), Cetrorelix (L) Ganirelix (L) Eptifibatide Bivalirudin (L) Copaxone (L) Techtide P-289 (S) Cubicin (F) Fuzeon (H) Ziconotide (S) Pramlintide (S) Exenatide (S) Icatibant omiplostim Degarelix Mifamurtide Ecallantide Liraglutide Tesamorelin Surfaxin Peginesatide Carfilzomib, Linaclotide L = oldatban; S = szilárd hordozón; E = extrakció; F = fermentáció; H = hibrid szintézis; = recombináns szintézis; SS = semi-szintézis.
23 Első generáció: az elsők Hormonok: hipofizis V. du Vigneaud (Nobel díj 1955) Cys-Tyr-Ile-Gln-Asn-Cys-Pro-Leu-Gly-NH 2 xytocin Szerkezet: 1953 du Vigneaud Szintézis: 1954 du Vigneaud Cys-Tyr-Phe-Gln-Asn-Cys-Pro-Lys-Gly-NH 2 Vasopressin ACTH (Adrenocorticotropic hormone, corticotropin) (1-39, 1-24) H-Ser 1 -Tyr-Ser-Met-Glu-His-Phe-Arg-Trp-Gly- -Lys-Pro-Val-Gly-Lys-Lys-Arg-Arg-Pro-Val-Lys- -Val-Tyr-Pro-Asn-Gly-Ala-Glu-Asp-Glu-Leu-Ala- -Glu-Ala-Phe-Pro-Leu-Glu-Phe 39 -H Szintézis (1971): Bajusz, Kisfaludy, Medzihradszky
24 Új generáció Antibakteriális szerek: kölcsönhatás gátlók Enfuvirtide 36 aminosav, HIV fúziógátló, antivirális (kötődés a gp41 fehérjéhez) Ac-Tyr-Thr-Ser-Leu-Ile-His- Ser-Leu-Ile-Glu-Glu-Ser-Gln- Asn-Gln-Gln-Glu-Lys-Asn-Glu- Gln-Glu-Leu-Leu-Glu-Leu-Asp- Lys-Trp-Ala-Ser-Leu-Trp-Asn- Trp-Phe-NH 2 Daptomycin (Cubicin) Lipopeptid antibiotikum (Gram pozitiv) 13 aminosav, D-aminosav, nem természetes aminosav N-decanoyl-L-Trp-L-Asn-L-Asp-L-Thr-Gly-L-rn-L-Asp-D-Ala-L-Asp- Gly-D-Ser-threo -3-methyl-L-Glu-3-anthraniloyl-L-Ala[egr]1-lactone
25 Fehérjék 1. Kötéstípusok a fehérjékben 2. Fehérjék szerkezete 3. Fehérjék szerkezetének meghatározása 3.1 Izolálás, tisztítás homogén minta előállítása 3.2 Kimutatás, minőségi/mennyiségi meghatározás 3.3 Primer (elsődleges) szerkezet meghatározása - aminosavösszetétel - aminosavsorrend - N-terminális aminosav - C-terminális aminosav 3.4. Térszerkezet (3D) meghatározása - szekunder (másodlagos) - tercier (harmadlagos, szupermásodlagos) - kvaterner (negyedleges)
26 1. Kötéstípusok a fehérjékben Kovalens Nem kovalens Amid Diszulfid - C NH - - S S - Hidrofób, Van der Waals H-híd (inter és intra) Ionos
27 2. Fehérje szerkezet Primer Elsődleges (primer) Másodlagos Alfa-hélix Tercier Béta redőzött réteg Béta-kanyar Kvaterner hem csoport
28 3.1. Fehérje izolálás gélelektroforézis (egy- és kétdimenziós) egydimenziós kétdimenziós Salmonella thyphimurium SDS-PAGE, 200 mg protein, 3,5 x 0,8 cm Autoradigram, 2D, E. Coli proteinek, 10 mg, 14 C jelzett aminosav a táptalajban, 2,3 x 1,3 cm, exp. 825 h
29 Gélelektroforézis Gél készítés Mintaelőkészítés Elválasztás A komponensek kimutatása, dokumentálás Vegyület Képlet Feladat A reakció
30 Egydimenziós gélelektroforézis (méret szerint) HeLa sejtmag fehérjék Swiss-Prot
31 Kétdimenziós gélelektroforézis (HeLa sejtmag fehérjék) M t pi
32 3.2. Fehérjék kimutatása, mennyiségi meghatározása a) Amino csoport kimutatás b) Peptidkötés kimutatás b1) Biuret próba eagens: CuS 4 /NaH b2) Lowry-Hartree eagens: biuret + Folin-Ciocalteu-reagens (3 H 2 xp 2 5 x13 W 2 x5 Mo 3 x 10 H 2 ) l = nm l = nm Cu 2+ Cu 1+ NaH c) ldallánc kimutatás [Bradford reagens (trifenil-metion)] Bázikus vagy aromás aminosavat tartalmazó fehérje l = 465 nm l = 595 nm fehérje - festék
33 3.3. Primer szerkezet Diszulfid-híd felbontása merkaptoetanol ditiotreitol C módszer = peroxi-ecetsav mellékreakció --- Met oxidáció Met - szulfon
34 Aminosav összetétel meghatározása A. Hidrolizis NH 2 -CH 2 - C Gly-Ala H 2 / 6M HCl 105 o C NH-CH-CH CH 3 NH 2 -CH 2 - glicin C + H NH 2 -CH-CH CH 3 alanin B. Elválasztás, származékképzés Ioncserés (oszlop)kromatográfia, ockefeller Intézet, 1950 Gyanta: vízben nem oldódó polimer S 3 - csoportokkal Detektálás: ninhidrin reakció, l = 570 nm
35 B. Származékképzés és elválasztás Származékképzés: o-ftálaldehid Elválasztás: HPLC, Detektálás: l g = 360 nm l e = 455 nm Hunkapiller et al. Science, 1984
36 C. Származékképzés D/L-aminosav meghatározására N2 NH * CH CNH2 2N F 1-fluor-2,4-dinitrofenil- 5-L-Ala-amid (FDAA) CH3 + * H2N CH CH Q (D,L) ph 9,0; 10 perc N2 NH * CH CNH2 N2 NH * CH CNH2 CH3 CH3 2N * NH CH CH 2N * NH CH CH Q Q D,L-származék L,L-származék HPLC elválasztás
37 Aminosav sorrend meghatározása A. N-terminális A1. Sanger reakció, Nobel díj, 1958 (inzulin) és 1980 (oligonukleotid szekvenálás F. Sanger, P. Berg, W. Gilbert) F. Sanger (1918- ) N 2 N 2 2N 4 2 F + N H 2 C H C - NaHC 3 2 N N H C H C - + HF 1-fluor-2,4-dinitro benzol N 2 N H C H C - 6 M HCl N 2 NH CH CH 2 N 2N + aminosavak 2,4-dinitrofenil fehérje 2,4-dinitrofenil aminosav l=254 nm Mellékreakció: Lys e-aminocsoportja
38 A2. 1-dimetilamino-naftalin-5-szulfonil klorid (Dansyl-klorid, Hartley, 1963) H3C N CH3 S Cl + C H 3 NH 2 -L-K-A-D-P-N--F-G-A-D-L-CH N * C H 3 bázis ph 7,5-8,0 S +HCl NH-L-K-A-D-P-N--F-G-A-D-L-CH * C H 3 N C H 3 6 M HCl hidrolizis S NH-Leu-CH + K, A, D, P, N,, F, G-CH (Dansyl-aminosav) * * l g =360 nm l e =480 nm Mellékreakció: Lys e-aminocsoportja
39 B. C-terminális NH 2 -L-K-A-D-P-N--F-G-A-D-L-CH + H 2 N - NH 2 90 o C óra + NH 3 -L C -NH-NH 2, + NH 3 -K-C-NH-NH NH 3 -L-C - C. Edman lebontás (P. Edman, Lund, 1950) 1. lépés: eakció fenilizotiocianáttal (addició) 2. lépés: Hidrolizis 3. lépés: A feniltiohidantoin származék azonosítása
40 1. lépés: eakció fenilizotiocianáttal N = C = S NH 2 - CH C -... ph 8-9, 40 o C + S II NH - C - 2. lépés: Hidrolizis (H + /TFA) NH - CH C -... feniltiocarbamil származék anilinotiozolinon származék fenilhidantoin (PTH) aminosav
41 3. lépés: A feniltiohidantoin származék azonosítása
42 Fehérjék feldarabolása A. Kémiai hasítás a) eakció brómciánnal (BrCN), Met - Val-Gly-Ala-Met-Leu-Pro Hasítás helye Val-Gly-Ala lakton + H 2, H + NH 2 -CH-CH Leu-Pro (CH 2 ) 2 H homoszerin
43 b) eakció hidroxilaminnal (NH 2 - H) Asp - Gly c) eakció 2-nitro-4-tiociano - benzoesav - Cys 2 N 2 HC 4 N = C = S B. Enzimatikus hasítás Terminológia (Schechter, Berger) -S4 S3 S2 S1 S1 S2 - S3 S4 enzim - P4 P3 P2 P1 P1 P2 - P3 P4 szubsztrát - P4 P3 P2 P1 H + H- P1 P2 - P3 P4 Szerin proteázok: tripszin (Arg, Lys) P1, trombin, kimotripszin (Tyr, Trp, Phe) P1, elasztáz, kallikrein.. Cisztein proteáz: papain, actinidin... Karboxil proteáz: pepszin, katepszin D (lizoszoma), LysC (Lys) P1, GluC (Glu, Asp)... Aminoproteáz: AspN (Asp)P1... Metalloproteáz: temolizin, karboxipeptidáz A...
44 Primer szerkezet, aminosavsorrend - összegzés
45 3.4. Térszerkezet
46 Az amid kötés Delokalizáció, 2 elektron, 3 atom - Gyenge N bázis - Erős H-híd - észleges kettős kötés - Síkalkat - Cisz/transz izoméria Nomenklatúra
47 A amachandran térkép - bevezetés mega, w Pszi, y Fi, F
48 A amachandran térkép
49 Másodlagos szerkezet típusai
50 Helikális szerkezet 3 10 hélix, alfa a-hélix, pi p-hélix
51 Béta redőzőtt réteg szerkezet
52 Kanyar szerkezet
53 A amachandran térkép - összefoglalás
54 Szupermásodlagos szerkezetek Görög kulcs Béta kígyó Csoportosítás Alfa (a) Béta (b) csak alfa hélix csak béta réteg Alfa + béta ( a + b) hélix és réteg egymástól távol Alfa/béta (a/b) hélix és réteg egymással kölcsönhatásban
55 Negyedleges szerkezetek (homomerek) J. A. Marsh, S. A. Teichmann: Structure, Dynamics, Assembly, and Evolution of Protein Complexes. Ann. ev. Biochemistry 84(1), 2014 aaa
56 Negyedleges szerkezetek (heteromerek) J. A. Marsh, S. A. Teichmann: Structure, Dynamics, Assembly, and Evolution of Protein Complexes. Ann. ev. Biochemistry 84(1), 2014
57 Konformerek energiatartalma Források : kötéshossz (Ed) változatlan vegyértékszög (Eo) változatlan torziós szög (Ew) - változik Nem kötött atomok távolsága (Ew) Kötő elektronpárok kölcsönhatása (Eh) Elektrosztatikus kölcsönhatás ( Példa: DE = DEd + DEo + DEw + DEw + DEh + DEe Fehérje 100 aminosavból a) ha: 10 konformáció/as lehetséges akkor: konformer b) ha: 2 konformáció/as lehetséges akkor: konformer
58 A protemika alapjai Eredet (taxonómia) Fehérje expresszió lizis Sejtlizátum -nukleinsavak -fehérjék -lipidek -... Elválasztás (elektroforézis, UC...) Izolált fehérje Szerkezetvizsgálat (kémiai lebontás, MS.. Primer szerkezet (aminosavsorrend) Annotáció Alegységek Poszt-transzlációs Térszerkezet Lokalizáció Funkciók: fémion Kötődés, ATP kötés okonság más fehérjékhez Asszociáció betegséggel
59 A médium összetételének hatása az E coli fehérje összetételére Arg - Arg Farrell PH (1978)
60 Proteomikai munkafolyamat Minta összegyűjtése rganellumok szétválasztása Tisztítás ellenanyag segítségével 1 és 2D gélelektroforézis P-HPLC SCX HPLC (ioncserés) Fehérje gélek Fehérje(k) (pöttyök) kivágása minta Előkészítő lépések Szerkezeti vagy tömeg információk MS ESI-MS, MALDI-TF peptidek Fehérje(k) Keresés adatbázisban Fehérje azonosítás SWISS-PT TrEMBL efseq XPs Ensembl...
61 Nem fehérje alkotó természetes aminosavak A) H 2 N C H CH H 2 N C H 2 C H 2 C H 2 - C 2 Glu dekarboxiláz C H 2 C H 2 g-aminovajsav (GABA) HC HC Glu B) Lys/Met + C-vitamin (máj) C H 3 C H 3 N + C H 2 C H C H H 3 C H 2 Karnitin Zsiranyagcsere Mitokondrium transzport Sejtpermeabilitás HC C) Állat, ember + H2N b a CH2 CH2 CH Növény - béta-alanin C H 3 H C H 2 C C H C N H C H 2 C H 2 CH C H 3 H pantoténsav
62 D) H 2 N C H CH E) C H 2 S H cisztein 1. C 2 2. oxidáció (máj, B6) H 2 N C H 2 C H 2 S 3 H taurin Állat Ember epesav alkotórész Növény neurotranszmitter vérlemezke + - migrén? H 2 N C H CH (CH 2 ) 3 H N C N H 2 N H arginin argináz +H 2 H 2 N C H CH (CH 2 ) 3 N H 2 ornitin + H 2 N C H CH H 2 N C N H 2 +NH 3, + C 2 karbamid (urea) urea ciklus (máj) hagyma, fokhagyma detoxifikáció (CH 2 ) 3 H N C N H 2 citrullin (citrullus lat. görögdinnye)
63 F) C H 3 H N C H 2 CH szarkozin (izom) H 2 N-CN C H 3 N H 2 C N C H 2 CH N H kreatin. H 2 (N-metil-guanidino-ecetsav) op: 303 o C izom H 2 P 4 -NH - (kreatin-foszfát)
9. Előadás. Fehérjék
9. Előadás Fehérjék Előzmények Peptidkémia Analitikai kémia Protein kémia 1901 E. Fischer : Gly-Gly 1932 Max Bergman és Leonidas Zervas : Benziloxi-karbonil csoport 1963 B. Merrifield : Szilárd fázisú
9. Előadás Fehérjék Előzmények Peptidkémia Analitikai kémia Protein kémia 1901 E.Fischer : Gly-Gly 1923 F. Pregl : Mikroanalitika 1952 Stein and Moore : Aminosav analizis 1932 Bergman és Zervas : Benziloxikarbonil
H 2 N CH COOH - H 2 O + + H 2 N CH CO HN CH COOH Q NH CH C NH 2 CH C OQ 2 -HX NH CH COOQ 2 NH CH COOH
8. Előadás Peptidek Peptid szintézis: a koncepció 1. Probléma 2 2 ' - 2 2, 2 2 2, ' ' Keverék, alacsony konverzió 2. Megoldás Q X 2 ' Q 2 -X Q Q 2 2 ' ' Egyféle termék, magas konverzió 3. Követelmények
Több oxigéntartalmú funkciós csoportot tartalmazó vegyületek
Több oxigéntartalmú funkciós csoportot tartalmazó vegyületek Hidroxikarbonsavak α-hidroxi karbonsavak -Glikolsav (kézkrémek) - Tejsav (tejtermékek, izomláz, fogszuvasodás) - Citromsav (citrusfélékben,
A fehérjék hierarchikus szerkezete
Fehérjék felosztása A fehérjék hierarchikus szerkezete Smeller László Semmelweis Egyetem Biofizikai és Sugárbiológiai Intézet Biológiai funkció alapján Enzimek (pl.: tripszin, citokróm-c ) Transzportfehérjék
9. Szilárdfázisú szintézisek. oligopeptidek, oligonukleotidok
9. Szilárdfázisú szintézisek oligopeptidek, oligonukleotidok Peptidszintézis Amidkötés kialakítása R H + H 2 Q R Q + H 2 H R H + H 2 Q R + H 3 Q sav-bázis reakció már nem nukleofil Amidkötés kialakítása
MEDICINÁLIS ALAPISMERETEK AZ ÉLŐ SZERVEZETEK KÉMIAI ÉPÍTŐKÖVEI AZ AMINOSAVAK ÉS FEHÉRJÉK 1. kulcsszó cím: Aminosavak
Modul cím: MEDICINÁLIS ALAPISMERETEK AZ ÉLŐ SZERVEZETEK KÉMIAI ÉPÍTŐKÖVEI AZ AMINOSAVAK ÉS FEHÉRJÉK 1. kulcsszó cím: Aminosavak Egy átlagos emberben 10-12 kg fehérje van, mely elsősorban a vázizomban található.
Aminosavak általános képlete NH 2. Csoportosítás: R oldallánc szerkezete alapján: Semleges. Esszenciális aminosavak
Aminosavak 1 Aminosavak általános képlete N 2 soportosítás: oldallánc szerkezete alapján: Apoláris Poláris Bázikus Savas Semleges Esszenciális aminosavak 2 (apoláris) Glicin Név Gly 3 Alanin Ala 3 3 Valin
A fehérjék hierarchikus szerkezete
Fehérjék felosztása A fehérjék hierarchikus szerkezete Smeller László Semmelweis Egyetem Biofizikai és Sugárbiológiai Intézet Biológiai funkció alapján Enzimek (pl.: tripszin, citokróm-c ) Transzportfehérjék
3. Sejtalkotó molekulák III.
3. Sejtalkotó molekulák III. Fehérjék, fehérjeszintézis (transzkripció, transzláció, posztszintetikus módosítások). Enzimműködés 3.1 Fehérjék A genetikai információ egyik fő manifesztálódása Számos funkció
A sejtek élete. 5. Robotoló törpék és óriások Az aminosavak és fehérjék R C NH 2. C COOH 5.1. A fehérjeépítőaminosavak általános
A sejtek élete 5. Robotoló törpék és óriások Az aminosavak és fehérjék e csak nézd! Milyen protonátmenetes reakcióra képes egy aminosav? R 2 5.1. A fehérjeépítőaminosavak általános képlete 5.2. A legegyszerűbb
4. FEHÉRJÉK. 2. Vázanyagok. Az izmok alkotórésze (pl.: a miozin). Inak, izületek, csontok szerves komponensei, az ún. vázfehérjék (szkleroproteinek).
4. FEÉRJÉK 4.0. Bevezetés A fehérjék elsısorban α-l-aminosavakból felépülı biopolimerek. A csak α-laminosavakat tartalmazó fehérjék a proteinek. evüket a görög proteios szóból kapták, ami elsırangút jelent.
9. Szilárdfázisú szintézisek. oligopeptidek, oligonukleotidok
9. Szilárdfázisú szintézisek oligopeptidek, oligonukleotidok Peptidszintézis Amidkötés kialakítása R O OH + H 2 N Q R O Q N + H 2 O H R O OH + H 2 N Q R O O + H 3 N Q sav-bázis reakció már nem nukleofil
3. Sejtalkotó molekulák III. Fehérjék, enzimműködés, fehérjeszintézis (transzkripció, transzláció, poszt szintetikus módosítások)
3. Sejtalkotó molekulák III. Fehérjék, enzimműködés, fehérjeszintézis (transzkripció, transzláció, poszt szintetikus módosítások) 3.1 Fehérjék, enzimek A genetikai információ egyik fő manifesztálódása
A fehérjék szerkezete és az azt meghatározó kölcsönhatások
A fehérjék szerkezete és az azt meghatározó kölcsönhatások 1. A fehérjék szerepe az élõlényekben 2. A fehérjék szerkezetének szintjei 3. A fehérjék konformációs stabilitásáért felelõs kölcsönhatások 4.
Szerves Kémiai Problémamegoldó Verseny
Szerves Kémiai Problémamegoldó Verseny 2015. április 24. Név: E-mail cím: Egyetem: Szak: Képzési szint: Évfolyam: Pontszám: Név: Pontszám: / 3 pont 1. feladat Egy C 4 H 10 O 3 összegképletű vegyület 0,1776
Peptidek (savamidok) szintézise. feladat: a szintéziskor elvben csak egy mól vizet kell elvonni peptidkötésenként, ám az ördög a részletekben rejlik.
Peptidek (savamidok) szintézise feladat: a szintéziskor elvben csak egy mól vizet kell elvonni peptidkötésenként, ám az ördög a részletekben rejlik. 1 avamidok (peptidek) szintézise és hidrolízise megfigyelés:
Bioinformatika 2 5.. előad
5.. előad adás Prof. Poppe László BME Szerves Kémia és Technológia Tsz. Bioinformatika proteomika Előadás és gyakorlat 2009. 03. 21. Fehérje térszerkezet t megjelenítése A fehérjék meglehetősen összetett
Szerves Kémiai Problémamegoldó Verseny
Szerves Kémiai Problémamegoldó Verseny 2015. április 24. Név: E-mail cím: Egyetem: Szak: Képzési szint: Évfolyam: Pontszám: Név: Pontszám: / 3 pont 1. feladat Egy C 4 H 10 O 3 összegképletű vegyület 0,1776
A fehérjék harmadlagos vagy térszerkezete. Még a globuláris fehérjék térszerkezete is sokféle lehet.
A fehérjék harmadlagos vagy térszerkezete Még a globuláris fehérjék térszerkezete is sokféle lehet. A ribonukleáz redukciója és denaturálódása Chrisian B. Anfinsen A ribonukleáz renaturálódása 1972 obel-díj
A fehérjék hierarchikus szerkezete. Szerkezeti hierarchia. A fehérjék építőkövei az aminosavak. Fehérjék felosztása
Fehérjék felosztása A fehérjék hierarchikus szerkezete Smeller László Semmelweis Egyetem Biofizikai és Sugárbiológiai Intézet Biológiai funkció alapján Enzimek (pl.: tripszin, citokróm-c ) Transzportfehérjék
A bórsavtól a lipofil karboránt tartalmazó peptidomimetikumokig
A bórsavtól a lipofil karboránt tartalmazó peptidomimetikumokig Egy "új" elem" " a növényvédelmi kémiában? Ujváry István MTA Növényvédelmi Kutatóintézete Bruckner-termi előadások,, 1999. október 29. ELTE,
3. A kémiai kötés. Kémiai kölcsönhatás
3. A kémiai kötés Kémiai kölcsönhatás ELSŐDLEGES MÁSODLAGOS OVALENS IONOS FÉMES HIDROGÉN- KÖTÉS DIPÓL- DIPÓL, ION- DIPÓL, VAN DER WAALS v. DISZPERZIÓS Kémiai kötések Na Ionos kötés Kovalens kötés Fémes
Fehérjeszerkezet, és tekeredés. Futó Kinga
Fehérjeszerkezet, és tekeredés Futó Kinga Polimerek Polimer: hasonló alegységekből (monomer) felépülő makromolekulák Alegységek száma: tipikusan 10 2-10 4 Titin: 3,435*10 4 aminosav C 132983 H 211861 N
Hemoglobin - myoglobin. Konzultációs e-tananyag Szikla Károly
Hemoglobin - myoglobin Konzultációs e-tananyag Szikla Károly Myoglobin A váz- és szívizom oxigén tároló fehérjéje Mt.: 17.800 153 aminosavból épül fel A lánc kb 75 % a hélix 8 db hélix, köztük nem helikális
CH 2 =CH-CH 2 -S-S-CH 2 -CH=CH 2
10. Előadás zerves vegyületek kénatommal Példák: ZEVE VEGYÜLETEK KÉATMMAL CH 2 =CH-CH 2 ---CH 2 -CH=CH 2 diallil-diszulfid (fokhagyma olaj) H H H szacharin merkapto-purin tiofén C H2 H szulfonamid (Ultraseptyl)
ALKOHOLOK ÉS SZÁRMAZÉKAIK
ALKLK ÉS SZÁRMAZÉKAIK Levezetés R R alkohol R R R éter Elnevezés Nyíltláncú, telített alkoholok általános név: alkanol alkil-alkohol 2 2 2 metanol etanol propán-1-ol metil-alkohol etil-alkohol propil-alkohol
Név: Pontszám: 1. feladat (3 pont) Írjon példát olyan aminosav-párokra, amelyek részt vehetnek a következő kölcsönhatásokban
1. feladat (3 pont) Írjon példát olyan aminosav-párokra, amelyek részt vehetnek a következő kölcsönhatásokban a, diszulfidhíd (1 példa), b, hidrogénkötés (2 példa), c, töltés-töltés kölcsönhatás (2 példa)!
SZERVES KÉMIAI REAKCIÓEGYENLETEK
SZERVES KÉMIAI REAKCIÓEGYENLETEK Budapesti Reáltanoda Fontos! Sok reakcióegyenlet több témakörhöz is hozzátartozik. Szögletes zárójel jelzi a reakciót, ami más témakörnél található meg. Alkánok, cikloalkánok
Oligo- és polipeptidek:
ligo- és polipeptidek: 1) Amid kötés hidrolízise és szintézise 2) Amid kötés kialakítása: preparatív lehetőségek 2.1) savkloridok 2.2) savanhidridek 2.3) aktívészterek 3) Aminosavak összekapcsolása 4)
Aminosavak, peptidek, fehérjék
Aminosavak, peptidek, fehérjék Az aminosavak a fehérjék építőkövei. A fehérjék felépítésében mindössze 20- féle aminosav vesz részt. Ezek általános képlete: Az aminosavakban, mint arra nevük is utal van
Az élő anyag szerkezeti egységei: víz, nukleinsavak, fehérjék. elrendeződés, rend, rendszer, periodikus ismétlődés
Az élő anyag szerkezeti egységei: víz, nukleinsavak, fehérjék Agócs Gergely 2013. december 3. kedd 10:00 11:40 1. Mit értünk élő anyag alatt? Az élő szervezetet felépítő anyagok. Az anyag azonban nem csupán
Fehérjeszerkezet, és tekeredés
Fehérjeszerkezet, és tekeredés Futó Kinga 2013.10.08. Polimerek Polimer: hasonló alegységekből (monomer) felépülő makromolekulák Alegységek száma: tipikusan 10 2-10 4 Titin: 3,435*10 4 aminosav C 132983
Nitrogéntartalmú szerves vegyületek. 6. előadás
Nitrogéntartalmú szerves vegyületek 6. előadás Aminok Funkciós csoport: NH 2 (amino csoport) Az ammónia (NH 3 ) származékai Attól függően, hogy hány H-t cserélünk le, kapunk primer, szekundner és tercier
Szénhidrogének III: Alkinok. 3. előadás
Szénhidrogének III: Alkinok 3. előadás Általános jellemzők Általános képlet C n H 2n 2 Kevesebb C H kötés van bennük, mint a megfelelő tagszámú alkánokban : telítetlen vegyületek Legalább egy C C kötést
Aminosavak, peptidek, fehérjék. Szerkezet, előállítás, kémiai tulajdonság
Aminosavak, peptidek, fehérjék Szerkezet, előállítás, kémiai tulajdonság Aminosavak Aminosavaknak nevezzük azokat a karbonsavakat, amelyekben a szénlánc egy vagy több hidrogénjét amino (NH 2 ) csoportra
1. változat. 4. Jelöld meg azt az oxidot, melynek megfelelője a vas(iii)-hidroxid! A FeO; Б Fe 2 O 3 ; В OF 2 ; Г Fe 3 O 4.
1. változat z 1-től 16-ig terjedő feladatokban négy válaszlehetőség van, amelyek közül csak egy helyes. Válaszd ki a helyes választ és jelöld be a válaszlapon! 1. Melyik sor fejezi be helyesen az állítást:
Fehérjék elválasztására alkalmazható mikrofludikai rendszerek Bioanalyzer, LabChip rendszerek. A készülékek működési elve, felépítésük, alkalmazásuk.
Fehérjék elválasztására alkalmazható mikrofludikai rendszerek Bioanalyzer, LabChip rendszerek. A készülékek működési elve, felépítésük, alkalmazásuk. Kapilláris elektroforézis tömegspektrometriás detektálással
INFORMATIKA EMELT SZINT%
Szövegszerkesztés, prezentáció, grafika, weblapkészítés 1. A fényképezés története Táblázatkezelés 2. Maradékos összeadás Adatbázis-kezelés 3. Érettségi Algoritmizálás, adatmodellezés 4. Fehérje Maximális
1. Tömegszámváltozás nélkül milyen részecskéket bocsáthatnak ki magukból a bomlékony atommagok?
A 2004/2005. tanévi Országos Középiskolai Tanulmányi Verseny első (iskolai) fordulójának feladatlapja KÉMIÁBÓL I-II. kategória I. FELADATSOR Az I. feladatsorban húsz kérdés szerepel. Minden kérdés után
A kémiai kötés. Kémiai kölcsönhatás
A kémiai kötés Kémiai kölcsönhatás ELSŐDLEGES MÁSODLAGOS KOVALENS IONOS FÉMES HIDROGÉN- KÖTÉS DIPÓL- DIPÓL, ION- DIPÓL, VAN DER WAALS v. DISZPERZIÓS Ionos kötés Na Cl Ionpár képződése e - Na + Cl - Na:
Osztályozó vizsgatételek. Kémia - 9. évfolyam - I. félév
Kémia - 9. évfolyam - I. félév 1. Atom felépítése (elemi részecskék), alaptörvények (elektronszerkezet kiépülésének szabályai). 2. A periódusos rendszer felépítése, periódusok és csoportok jellemzése.
Élelmiszer-fehérjék átalakulása a feldolgozás és tárolás során
Élelmiszer-fehérjék átalakulása a feldolgozás és tárolás során Az aminosavak átalakulása a feldolgozás és tárolás során A fehérjék hőkezelése aminosavak deszulfurálódása, dezaminálódása, izomerizációja,
FEHÉRJÉK A MÁGNESEKBEN. Bodor Andrea ELTE, Szerkezeti Kémiai és Biológiai Laboratórium. Alkímia Ma, Budapest,
FEHÉRJÉK A MÁGNESEKBEN Bodor Andrea ELTE, Szerkezeti Kémiai és Biológiai Laboratórium Alkímia Ma, Budapest, 2013.02.28. I. FEHÉRJÉK: L-α aminosavakból felépülő lineáris polimerek α H 2 N CH COOH amino
Szerkesztette: Vizkievicz András
Fehérjék A fehérjék - proteinek - az élő szervezetek számára a legfontosabb vegyületek. Az élet bármilyen megnyilvánulási formája fehérjékkel kapcsolatos. A sejtek szárazanyagának minimum 50 %-át adják.
Az aminosav anyagcsere orvosi vonatkozásai Csősz Éva
Az aminosav anyagcsere orvosi vonatkozásai Csősz Éva E-mail: cseva@med.unideb.hu Általános reakciók az aminosav anyagcserében 1. Nitrogén eltávolítás: transzaminálás dezaminálás: oxidatív nem oxidatív
Az enzimek katalitikus aktivitású fehérjék. Jellemzőik: bonyolult szerkezet, nagy molekulatömeg, kolloidális sajátságok, alakváltozás, polaritás.
Enzimek Az enzimek katalitikus aktivitású fehérjék Jellemzőik: bonyolult szerkezet, nagy molekulatömeg, kolloidális sajátságok, alakváltozás, polaritás. Az enzim lehet: csak fehérje: Ribonukleáz A, lizozim,
Aromás: 1, 3, 5, 6, 8, 9, 10, 11, 13, (14) Az azulén (14) szemiaromás rendszert alkot, mindkét választ (aromás, nem aromás) elfogadtuk.
1. feladat Aromás: 1, 3, 5, 6, 8, 9, 10, 11, 13, (14) Az azulén (14) szemiaromás rendszert alkot, mindkét választ (aromás, nem aromás) elfogadtuk. 2. feladat Etil-metil-keton (bután-2-on) Jelek hozzárendelése:
3. változat. 2. Melyik megállapítás helyes: Az egyik gáz másikhoz viszonyított sűrűsége nem más,
3. változat z 1-től 16-ig terjedő feladatokban négy válaszlehetőség van, amelyek közül csak egy helyes. Válaszd ki a helyes választ és jelöld be a válaszlapon! 1. Jelöld meg az egyszerű anyagok számát
BIOGÉN ELEMEK MÁSODLAGOS BIOGÉN ELEMEK (> 0,005 %)
BIOGÉN ELEMEK ELSŐDLEGES BIOGÉN ELEMEK(kb. 95%) ÁLLANDÓ BIOGÉN ELEMEK MAKROELEMEK MÁSODLAGOS BIOGÉN ELEMEK (> 0,005 %) C, H, O, N P, S, Cl, Na, K, Ca, Mg MIKROELEMEK (NYOMELEMEK) (< 0,005%) I, Fe, Cu,
Részletes tematika: I. Félév: 1. Hét (4 óra): 2. hét (4 óra): 3. hét (4 óra): 4. hét (4 óra):
Részletes tematika: I. Félév: 1. Hét (4 óra): Szerves Vegyületek Szerkezete. Kötéselmélet Lewis kötéselmélet; atompálya, molekulapálya; molekulapálya elmélet; átlapolódás, orbitálok hibridizációja; molekulák
4. változat. 2. Jelöld meg azt a részecskét, amely megőrzi az anyag összes kémiai tulajdonságait! A molekula; Б atom; В gyök; Г ion.
4. változat z 1-től 16-ig terjedő feladatokban négy válaszlehetőség van, amelyek közül csak egy helyes. Válaszd ki a helyes választ és jelöld be a válaszlapon! 1. Melyik sor fejezi be helyesen az állítást:
Atomszerkezet. Atommag protonok, neutronok + elektronok. atompályák, alhéjak, héjak, atomtörzs ---- vegyérték elektronok
Atomszerkezet Atommag protonok, neutronok + elektronok izotópok atompályák, alhéjak, héjak, atomtörzs ---- vegyérték elektronok periódusos rendszer csoportjai Periódusos rendszer A kémiai kötés Kémiai
CHO CH 2 H 2 H HO H H O H OH OH OH H
2. Előadás A szénhidrátok kémiai reakciói, szénhidrátszármazékok Áttekintés 1. Redukció 2. xidáció 3. Észter képzés 4. Reakciók a karbonil atomon 4.1. iklusos félacetál képzés 4.2. Reakció N-nukleofillel
Atomszerkezet. Atommag protonok, neutronok + elektronok. atompályák, alhéjak, héjak, atomtörzs ---- vegyérték elektronok
Atomszerkezet Atommag protonok, neutronok + elektronok izotópok atompályák, alhéjak, héjak, atomtörzs ---- vegyérték elektronok periódusos rendszer csoportjai Periódusos rendszer energia szintek atomokban
MEDICINÁLIS ALAPISMERETEK BIOKÉMIA AZ AMINOSAVAK ANYAGCSERÉJE 1. kulcsszó cím: Az aminosavak szerepe a szervezetben
Modul cím: MEDICINÁLIS ALAPISMERETEK BIOKÉMIA AZ AMINOSAVAK ANYAGCSERÉJE 1. kulcsszó cím: Az aminosavak szerepe a szervezetben A szénhidrátokkal és a lipidekkel ellentétben szervezetünkben nincsenek aminosavakból
Kutatási programunk fő célkitűzése, az 2 -plazmin inhibitornak ( 2. PI) és az aktivált. XIII-as faktor (FXIIIa) közötti interakció felderítése az 2
Kutatási programunk fő célkitűzése, az -plazmin inhibitornak ( PI) és az aktivált XIII-as faktor (FXIIIa) közötti interakció felderítése az PI N-terminális szakaszának megfelelő különböző hosszúságú peptidek
6. változat. 3. Jelöld meg a nem molekuláris szerkezetű anyagot! A SO 2 ; Б C 6 H 12 O 6 ; В NaBr; Г CO 2.
6. változat Az 1-től 16-ig terjedő feladatokban négy válaszlehetőség van, amelyek közül csak egy helyes. Válaszd ki a helyes választ és jelöld be a válaszlapon! 1. Jelöld meg azt a sort, amely helyesen
Oligo- és polipeptidek:
ligo- és polipeptidek: 1) Amid kötés hidrolízise és szintézise 2) Amid kötés kialakítása: preparatív lehetőségek 2.1) savkloridok 2.2) savanhidridek 2.3) aktívészterek 3) Aminosavak összekapcsolása 4)
Transzláció. Szintetikus folyamatok Energiájának 90%-a
Transzláció Transzláció Fehérje bioszintézis a genetikai információ kifejeződése Szükséges: mrns: trns: ~40 Riboszóma: 4 rrns + ~ 70 protein 20 Aminosav aktiváló enzim ~12 egyéb enzim Szintetikus folyamatok
TAKARMÁNYOZÁSTAN. Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP-4.1.2-08/1/A-2009-0010
TAKARMÁNYOZÁSTAN Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP-4.1.2-08/1/A-2009-0010 Takarmányok fehérjetartalma Az állati szervezet létfontosságú vegyületei fehérje természetűek Az állati termékek
Szilárd fázisú peptidszintézis polisztirol-divinilbenzol gyantán
zilárd fázisú peptidszintézis polisztirol-divinilbenzol gyantán funkcionalizálás x x x els aminosav felkapcsolása W-H-CH 1 -C W-H-CH 1 -C W-H-CH 1 -C hasítás semlegesítés H 2 -CH 1 -C H 2 -CH 1 -C H 2
Peptid- és fehérjék másodlagos-, harmadlagos- és negyedleges szerkezete
Peptid- és fehérjék másodlagos-, harmadlagos- és negyedleges szerkezete Polipeptidek térszerkezete Tipikus (rendezett) konformerek em tipikus (rendezetlen) konformerek Periodikus vagy homokonformerek Aperiodikus
ПРОГРАМА ВСТУПНОГО ВИПРОБУВАННЯ З ХІМІЇ Для вступників на ІІ курс навчання за освітньо-кваліфікаційним рівнем «бакалавр»
ЗАКАРПАТСЬКИЙ УГОРСЬКИЙ ІНСТИТУТ ІМ. Ф. РАКОЦІ ІІ КАФЕДРА МАТЕМАТИКИ ТА ІНФОРМАТИКИ II. RÁKÓCZI FERENC KÁRPÁTALJAI MAGYAR FŐISKOLA MATEMATIKA ÉS INFORMATIKA TANSZÉK ПРОГРАМА ВСТУПНОГО ВИПРОБУВАННЯ З ХІМІЇ
KARBONSAV-SZÁRMAZÉKOK
KABNSAV-SZÁMAZÉKK Karbonsavszármazékok Karbonsavak H X Karbonsavszármazékok X Halogén Savhalogenid l Alkoxi Észter ' Amino Amid N '' ' Karboxilát Anhidrid Karbonsavhalogenidek Tulajdonságok: - színtelen,
1. feladat (3 pont) Írjon példát olyan aminosav-párokra, amelyek részt vehetnek a következő kölcsönhatásokban
1. feladat (3 pont) Írjon példát olyan aminosav-párokra, amelyek részt vehetnek a következő kölcsönhatásokban a, diszulfidhíd (1 példa), b, hidrogénkötés (2 példa), c, töltés-töltés kölcsönhatás (2 példa)!
TRIPSZIN TISZTÍTÁSA AFFINITÁS KROMATOGRÁFIA SEGÍTSÉGÉVEL
TRIPSZIN TISZTÍTÁSA AFFINITÁS KROMATOGRÁFIA SEGÍTSÉGÉVEL Az egyes biomolekulák izolálása kulcsfontosságú a biológiai szerepük tisztázásához. Az affinitás kromatográfia egyszerűsége, reprodukálhatósága
HŐ (q) és MUNKA (w): energia átmenet közben a rendszer és környezete között. A különböző energiafajták átalakulásukkor végső soron termikus energiává
TERMODINAMIKA 1 HŐ (q) és MUNKA (w): energia átmenet közben a rendszer és környezete között. A különböző energiafajták átalakulásukkor végső soron termikus energiává degradálódnak (disszipáció). BELSŐ
R nem hidrogén, hanem pl. alkilcsoport
1 Minimumkövetelmények C 4 metán C 3 - metilcsoport C 3 C 3 C 3 metil kation metilgyök metil anion C 3 -C 3 C 3 -C 2 - C 3 -C 2 C 3 -C 2 C 3 -C 2 C 2 5 - C 2 5 C 2 5 C 2 5 etán etilcsoport etil kation
1. feladat. Versenyző rajtszáma: Mely vegyületek aromásak az alábbiak közül?
1. feladat / 5 pont Mely vegyületek aromásak az alábbiak közül? 2. feladat / 5 pont Egy C 4 H 8 O összegképletű vegyületről a következő 1 H és 13 C NMR spektrumok készültek. Állapítsa meg a vegyület szerkezetét!
ZÁRÓJELENTÉS. OAc. COOMe. N Br
ZÁRÓJELETÉS A kutatás előzményeként az L-treoninból kiindulva előállított metil-[(2s,3r, R)-3-( acetoxi)etil-1-(3-bróm-4-metoxifenil)-4-oxoazetidin-2-karboxilát] 1a röntgendiffrakciós vizsgálatával bizonyítottuk,
A Ca 2+ szerepe a tormaperoxidáz enzim aktív szerkezetében. Szigeti Krisztián
A Ca 2+ szerepe a tormaperoxidáz enzim aktív szerkezetében Doktori értekezés Szigeti Krisztián Semmelweis Egyetem Gyógyszertudományok Doktori Iskola Témavezető: Hivatalos Bírálók: Szigorlati Bizottság
Alzheimer-kór diagnosztikájára alkalmas β-amiloid epitóp peptidet tartalmazó konjugátumok szintézise
TUDMÁNYS DIÁKKÖRI DLGZAT PETHŐ LILLA Alzheimer-kór diagnosztikájára alkalmas β-amiloid epitóp peptidet tartalmazó konjugátumok szintézise Témavezető: Dr. Mező Gábor tudományos tanácsadó ELTE Kémiai Intézet,
SZAK: KÉMIA Általános és szervetlen kémia 1. A periódusos rendszer 14. csoportja. a) Írják le a csoport nemfémes elemeinek az elektronkonfigurációit
SZAK: KÉMIA Általános és szervetlen kémia 1. A periódusos rendszer 14. csoportja. a) Írják le a csoport nemfémes elemeinek az elektronkonfigurációit b) Tárgyalják összehasonlító módon a csoport első elemének
A tejfehérje és a fehérjeellátás
A tejfehérje A tejfehérje és a fehérjeellátás Fejlődő országok: a lakosság 20 30%-a hiányosan ellátott fehérjével. Fejlett ipari országok: fehérje túlfogyasztás. Az emberiség éves fehérjeszükséglete: 60
Citrátkör, terminális oxidáció, oxidatív foszforiláció
Citrátkör, terminális oxidáció, oxidatív foszforiláció A citrátkör jelentősége tápanyagok oxidációjának közös szakasza anyag- és energiaforgalom központja sejtek anyagcseréjében elosztórendszerként működik:
Szerves Kémia II. Dr. Patonay Tamás egyetemi tanár E 405 Tel:
Szerves Kémia II. TKBE0312 Előfeltétel: TKBE03 1 Szerves kémia I. Előadás: 2 óra/hét Dr. Patonay Tamás egyetemi tanár E 405 Tel: 22464 tpatonay@puma.unideb.hu A 2010/11. tanév tavaszi félévében az előadás
Sillabusz orvosi kémia szemináriumokhoz 1. Kémiai kötések
Sillabusz orvosi kémia szemináriumokhoz 1. Kémiai kötések Pécsi Tudományegyetem Általános Orvostudományi Kar 2010-2011. 1 A vegyületekben az atomokat kémiai kötésnek nevezett erők tartják össze. Az elektronok
HALOGÉNEZETT SZÉNHIDROGÉNEK
ALOGÉNEZETT SZÉNIDOGÉNEK Elnevezés Nyíltláncú, telített általános név: halogénalkán alkilhalogenid l 2 l 2 2 l klórmetán klóretán 1klórpropán l metilklorid etilklorid propilklorid 2klórpropán izopropilklorid
Szerves kémia Fontosabb vegyülettípusok
Fontosabb vegyülettípusok Szénhidrogének: alifás telített (metán, etán, propán, bután, ) alifás telítetlen (etén, etin, ) aromás (benzol, toluol, naftalin) Oxigéntartalmú vegyületek: hidroxivegyületek
Detektorok tulajdonságai
DETEKTOROK A detektor feladata a kiáramló eluensben mérni az összetevő pillanatnyi koncentrációját. A közvetlenül mért detektorjel általában nem maga a koncentráció, hanem annak valamilyen függvénye. Detektor
Az AS nitrogénjének eltávolítása
AMINOSAV ANYAGCSERE Az AS nitrogénjének eltávolítása 1. Hidrolízis (NH 3 eltávolítás az Asn és Gln amid csoportjából) 2. Transzamináció (amino és oxo csoport cseréje; AS és ketosav párok, transzamináz
Bioinformatika 2 6. előadás
6. előadás Prof. Poppe László BME Szerves Kémia és Technológia Tsz. Bioinformatika proteomika Előadás és gyakorlat 2018.10.08. PDBj: http://www.pdbj.org/ Fehérjék 3D szerkezeti adatbázisai - PDBj 2 2018.10.08.
Bevezetés. Szénvegyületek kémiája Organogén elemek (C, H, O, N) Életerő (vis vitalis)
Szerves kémia Fontos tudnivalók Tárgy neve: Kémia alapjai I. Neptun kód: SBANKE1050 Előadó: Borzsák István C121 szerda 11-12 e-mail: iborzsak@ttk.nyme.hu http://www.bdf.hu/ttk/fldi/iborzsak/dokumentumok/
Versenyző rajtszáma: 1. feladat
1. feladat / 5 pont Jelölje meg az alábbi vegyület valamennyi királis szénatomját, és adja meg ezek konfigurációját a Cahn Ingold Prelog (CIP) konvenció szerint! 2. feladat / 6 pont 1887-ben egy orosz
KARBONSAVAK. A) Nyílt láncú telített monokarbonsavak (zsírsavak) O OH. karboxilcsoport. Példák. pl. metánsav, etánsav, propánsav...
KABNSAVAK karboxilcsoport Példák A) Nyílt láncú telített monokarbonsavak (zsírsavak) "alkánsav" pl. metánsav, etánsav, propánsav... (nem használjuk) omológ sor hangyasav 3 2 2 2 valeriánsav 3 ecetsav 3
Kötések kialakítása - oktett elmélet
Kémiai kötések Az elemek és vegyületek halmazai az atomok kapcsolódásával - kémiai kötések kialakításával - jönnek létre szabad atomként csak a nemesgázatomok léteznek elsődleges kémiai kötések Kötések
Korszerű tömegspektrometria a. Szabó Pál MTA Kémiai Kutatóközpont
Korszerű tömegspektrometria a biokémi miában Szabó Pál MTA Kémiai Kutatóközpont Tematika Bevezetés: ionizációs technikák és analizátorok összehasonlítása a biomolekulák szemszögéből Mikromennyiségek mintaelőkészítése
Minőségi kémiai analízis
Minőségi kémiai analízis Szalai István ELTE Kémiai Intézet 2016 Szalai István (ELTE Kémiai Intézet) Minőségi kémiai analízis 2016 1 / 32 Lewis-Pearson elmélet Bázisok Kemény Lágy Határestek H 2 O, OH,
Aminosavak és aminok meghatározása biológiai és természetes mintákban, HPLC eljárással
Aminosavak és aminok meghatározása biológiai és természetes mintákban, HPLC eljárással Doktori értekezés Kőrös Ágnes Semmelweis Egyetem Gyógyszertudományok Doktori Iskola Témavezető: Perlné Dr. Molnár
AMINOSAVAK, PEPTIDEK, FEHÉRJÉK
AMISAVAK, PEPTIDEK, FEÉJÉK Aminosavak szerkezete, fizikai, kémiai tulajdonságai, biokémiai szerepük. Konvenció szerinti rövidítések. Aminosavak szintézise. A kötés szerkezete. Peptidszintézisek, védőcsoportok,
Gyógyszerrezisztenciát okozó fehérjék vizsgálata
Gyógyszerrezisztenciát okozó fehérjék vizsgálata AKI kíváncsi kémikus kutatótábor 2017.06.25-07.01. Témavezetők : Telbisz Ágnes, Horváth Tamás Kutatók : Dobolyi Zsófia, Bereczki Kristóf, Horváth Ákos Gyógyszerrezisztencia
R nem hidrogén, hanem pl. alkilcsoport
1 Minimumkövetelmények C 4 metán C 3 - metilcsoport C 3 C 3 C 3 metil kation metilgyök metil anion C 3 -C 3 C 3 -C 2 - C 3 -C 2 C 3 -C 2 C 3 -C 2 C 2 5 - C 2 5 C 2 5 C 2 5 etán etilcsoport etil kation
Kémiai kötések és kristályrácsok ISMÉTLÉS, GYAKORLÁS
Kémiai kötések és kristályrácsok ISMÉTLÉS, GYAKORLÁS Milyen képlet adódik a következő atomok kapcsolódásából? Fe - Fe H - O P - H O - O Na O Al - O Ca - S Cl - Cl C - O Ne N - N C - H Li - Br Pb - Pb N
Peptidekkel a sejtekbe: peptidek mint transzport molekulák
Alkímia ma előadássorozat 2014 Február 20 Peptidekkel a sejtekbe: peptidek mint transzport molekulák Bánóczi Zoltán MTA-ELTE Peptidkémiai Kutatócsoport Aminosavak α-aminosavak Apoláris oldallánc N H 2
Aminosavak, peptidek, fehérjék
Aminosavak, peptidek, fehérjék Aminosavak NH 2, NH, N, N C Amino- és karboxilcsoport egy molekulában. H Csoportosítás - az amin rendűsége szerint (első, másod, harmad, negyedrendű) - az amino- és karboxil-csoportok
Az enzimműködés termodinamikai és szerkezeti alapjai
2017. 02. 23. Dr. Tretter László, Dr. Kolev Kraszimir Az enzimműködés termodinamikai és szerkezeti alapjai 2017. február 27., március 2. 1 Mit kell(ene) tudni az előadás után: 1. Az enzimműködés termodinamikai
Tartalmi követelmények kémia tantárgyból az érettségin K Ö Z É P S Z I N T
1. Általános kémia Atomok és a belőlük származtatható ionok Molekulák és összetett ionok Halmazok A kémiai reakciók A kémiai reakciók jelölése Termokémia Reakciókinetika Kémiai egyensúly Reakciótípusok
Javító vizsga követelményei kémia tantárgyból augusztus osztály
Javító vizsga követelményei kémia tantárgyból 2019. augusztus 29. 10. osztály I. Szerves kémia-bevezetés 1. A szerves kémia kialakulása, tárgya (Tk. 64-65 old.) - Lavoisier: organogén elemek (C, H, O,
Mez Gábor. Peptidkémia
Mez Gábor Peptidkémia Tartalom TÖTÉNETI IDALMI ÁTTEKINTÉS... 3 TÁGYALT TÉMAKÖÖK... 6 AMINSAVAK ELFDULÁSA ÉS SZINTÉZISE... 7 AZ AMINSAVAK ÖVID BEMUTATÁSA... 8 VÉDSPTK... 19 NEM UETÁN TÍPUSÚ NH VÉDSPTK...