Biomolekuláris szerkezeti dinamika

Hasonló dokumentumok
Biomolekuláris szerkezeti dinamika

Biomolekuláris szerkezet és dinamika vizsgálata. Gerjesztés során elnyelt energia sorsa. Fluoreszcencia és különleges alkalmazásai

NMR, MRI. Magnetic Resonance Imaging. Times, október 9 MRI

Speciális fluoreszcencia spektroszkópiai módszerek

Times, október 9 MRI

Dóczy-Bodnár Andrea október 3. Magmágneses rezonancia (NMR) és elektronspinrezonancia (ESR) alapjai

Mágneses rezonanciás képalkotás AZ MRI elve, fizikai alapok

Fluoreszcencia módszerek (Kioltás, Anizotrópia, FRET)

Műszeres analitika II. (TKBE0532)

Magmágneses rezonancia (NMR) és elektronspinrezonancia (ESR) alapjai

Fluoreszcencia módszerek (Kioltás, Anizotrópia, FRET) Modern Biofizikai Kutatási Módszerek

Morfológiai képalkotó eljárások CT, MRI, PET

M N. a. Spin = saját impulzus momentum vektor: L L nagysága:

Mágneses módszerek a műszeres analitikában

Mágneses módszerek a mőszeres analitikában

Fluoreszcencia 2. (Kioltás, Anizotrópia, FRET)

24/04/ Röntgenabszorpciós CT

Rádióspektroszkópiai módszerek

MRI áttekintés. Orvosi képdiagnosztika 3. ea ősz

Abszorpció, emlékeztetõ

Az NMR spektroszkópia a fehérjék szolgálatában. Bodor Andrea. ELTE Szerkezeti Kémia és Biológia Laboratórium Visegrád

Hogyan bírhatjuk szóra a molekulákat, avagy mi is az a spektroszkópia?

Műszeres analitika II. (TKBE0532)

MÁGNESES MAGREZONANCIA A KÉMIÁBAN, GYÓGYSZERÉSZETBEN, ORVOSTUDOMÁNYBAN

Elektronspinrezonancia (ESR) - spektroszkópia

MÁGNESES MAGREZONANCIA A KÉMIÁBAN, GYÓGYSZERÉSZETBEN, ORVOSTUDOMÁNYBAN

A nehézfémek növényi vízháztartásra gyakorolt hatásának vizsgálata Mágneses Rezonancia készülékkel. Készítette: Jakusch Pál Környezettudós

Magmágneses rezonancia. alapjai. Magmágneses rezonanciához kapcsolódó Nobel-díjak. γ N = = giromágneses hányados. v v

Sohár Pál Varázslat, amitől láthatóvá válnak és életre kelnek a molekulák: Az NMR spektroszkópia

Az NMR képalkotás alapjai. Bányai István Kolloid- és Környezetkémiai Tanszék DE, TEK

A fény és az anyag kölcsönhatása

Lumineszcencia. Lumineszcencia. mindenütt. Lumineszcencia mindenütt. Lumineszcencia mindenütt. Alapjai, tulajdonságai, mérése. Kellermayer Miklós

Műszeres analitika. Abrankó László. Molekulaspektroszkópia. Kémiai élelmiszervizsgálati módszerek csoportosítása

Az MR(I) módszer elve. Dr.Fidy Judit 2012 március 7

Az MR(I) módszer elve. Az MR(I) módszer. (Nuclear) Magnetic Resonance Imaging mag (atommag) mágneses rezonancia alapu képalkotó módszer

Szerves oldott anyagok molekuláris spektroszkópiájának alapjai

Stern Gerlach kísérlet. Készítette: Kiss Éva

Alkalmazott spektroszkópia Serra Bendegúz és Bányai István

Szerves vegyületek szerkezetfelderítése NMR spektroszkópia

Alkalmazott spektroszkópia

Az (N)MR(I) módszer elve

Medical Imaging Mágneses rezonancia (MR, MRI, NMR) x B. Makroszkopikus tárgyalás

Speciális fluoreszcencia spektroszkópiai alkalmazások. Emlékeztető: az abszorpció definíciója. OD = A = - log (I / I 0 ) = ε (λ) c x

Bevezetés a fluoreszcenciába

Lumineszcencia spektrometria összefoglaló

Fizikai kémia 2. ZH V. kérdések I. félévtől

Az elektromágneses hullámok

Lumineszcencia. Lumineszcencia. Molekulaszerkezet. Atomszerkezet

Röntgensugárzás az orvostudományban. Röntgen kép és Komputer tomográf (CT)

Tartalomjegyzék. Emlékeztetõ. Emlékeztetõ. Spektroszkópia. Fényelnyelés híg oldatokban 4/11/2016. A fény; Abszorpciós spektroszkópia

ATOMMODELLEK, SZÍNKÉP, KVANTUMSZÁMOK. Kalocsai Angéla, Kozma Enikő


Modern Fizika Labor. 5. ESR (Elektronspin rezonancia) Fizika BSc. A mérés dátuma: okt. 25. A mérés száma és címe: Értékelés:

Fizikai kémia Részecskék mágneses térben, ESR spektroszkópia. Részecskék mágneses térben. Részecskék mágneses térben

Fontos fogalmak. A pörgettyűmodell

Tartalomjegyzék. Emlékeztetõ. Emlékeztetõ. Spektroszkópia. Fényelnyelés híg oldatokban A fény; Abszorpciós spektroszkópia

Mézerek és lézerek. Berta Miklós SZE, Fizika és Kémia Tsz november 19.

Orvosi Biofizika I. 12. vizsgatétel. IsmétlésI. -Fény

Lumineszcencia spektrometria összefoglaló

Ragyogó molekulák: dióhéjban a fluoreszcenciáról és biológiai alkalmazásairól

OPTIKA. Fénykibocsátás mechanizmusa fényforrás típusok. Dr. Seres István

Modern Fizika Labor Fizika BSC

Adatgyőjtés, mérési alapok, a környezetgazdálkodás fontosabb mőszerei

Abszorpciós fotometria

palkotás alapjai Bányai István Kolloid- és Környezetkémiai Tanszék DE, TEK

Abszorpciós spektrometria összefoglaló

Drug design Képalkotó eljárások a gyógyszerkutatásban Dr. Kengyel András GK, SPECT, PET, fmri, UH, CT, MRI Doppler UH

A fluoreszcencia orvosibiológiai. alkalmazásai. Fluoreszcencia forrása I. Fluoreszcencia alkalmazások. Kellermayer Miklós

Atomfizika. Fizika kurzus Dr. Seres István

m ág n e ses momentum É T ö ltés elektro n vagy atommag

Modern Fizika Labor. Fizika BSc. Értékelés: A mérés dátuma: A mérés száma és címe: 5. mérés: Elektronspin rezonancia március 18.

Atomfizika. Fizika kurzus Dr. Seres István

Az ionizáló sugárzások fajtái, forrásai

Elektronspin rezonancia

A lézer alapjairól (az iskolában)

Sugárzások kölcsönhatása az anyaggal

Név... intenzitás abszorbancia moláris extinkciós. A Wien-féle eltolódási törvény szerint az abszolút fekete test maximális emisszióképességéhez

Lumineszcencia spektroszkópia

Dr. JUVANCZ ZOLTÁN Óbudai Egyetem Dr. FENYVESI ÉVA CycloLab Kft

5.4. Elektronspektroszkópia

I. Az NMR spektrométer

1D multipulzus NMR kísérletek

Spektroszkópiai módszerek 2.

Radiokémia vegyész MSc radiokémia szakirány Kónya József, M. Nagy Noémi: Izotópia I és II. Debreceni Egyetemi Kiadó, 2007, 2008.

WOLFGANG PAULI ÉS AZ ANYAGTUDOMÁNY KROÓ NORBERT MAGYAR TUDOMÁNYOS AKADÉMIA ÓBUDAI EGYETEM,

Elektronspinrezonancia (ESR) - spektroszkópia

Atommodellek de Broglie hullámhossz Davisson-Germer-kísérlet

Fizikai kémia és radiokémia labor II, Laboratóriumi gyakorlat: Spektroszkópia mérés

A testek részecskéinek szerkezete

Az anyagok kettős (részecske és hullám) természete

A különböző anyagok mágneses térrel is kölcsönhatásba lépnek, ugyanúgy, ahogy az elektromos térrel. Ez a kölcsönhatás szintén kétféle lehet.

MRI m ködése és képalkotása

Bevezetés a modern fizika fejezeteibe. 4. (a) Kvantummechanika. Utolsó módosítás: november 15. Dr. Márkus Ferenc BME Fizika Tanszék

Koherens lézerspektroszkópia adalékolt optikai egykristályokban

Szilárdtestek mágnessége. Mágnesesen rendezett szilárdtestek

Modern Fizika Labor. Értékelés: A mérés dátuma: A mérés száma és címe: Az optikai pumpálás. A beadás dátuma: A mérést végezte:

Szentjánosbogár, trópusi halak, sarki fény Mi a közös a természet fénytüneményeiben?

Szalay Péter (ELTE, Kémia Intézet) Szentjánosbogár, trópusi halak, sarki fény Mi a közös a természet fénytüneményeiben?

CT/MRI képalkotás alapjai. Prof. Bogner Péter


Átírás:

Kísérletek, mérések célja Biomolekuláris szerkezeti dinamika Kellermayer Miklós Biomolekuláris szerkezet és működés pontosabb megismerése (folyamatok, állapotok, átmenetek, kölcsönhatások, mozgások, stb.) Gerjesztés során elnyelt energia sorsa Fluoreszcencia Rezonancia Energia Transzfer Belső konverzió (hő) Rendszerek közötti átmenet S T Fluoreszcencia (ns) Foszforeszcencia (ms) k isc k ic k Q ENERGIA k k FRET f Fluoreszcencia kioltás FRET Általánosan: A gerjesztett állapotban lévő molekula (donor), valamint egy megfelelő spektroszkópiás követelményeket kielégítő molekula (akceptor) között dipól-dipól kölcsönhatás révén, sugárzás nélküli energiaátadás formájában jön létre. Fluoreszcencia Rezonancia Energia Transzfer (FRET): ha az energiatranszfer szereplői fluorofórok. Sugárzásos és nem sugárzásos átmenetek!

FRET A gerjesztett donor (D) relaxációjához hozzájárul az akceptor (A) molekula emissziója! hν hν + - D E ~ k FRET ~ 1/R 6 A - + R hν A FRET feltételei Fluoreszcens donor és akceptor molekula. A donor és akceptor molekula közötti távolság (R) 2-10 nm! Átfedés a donor emissziós spektruma és az akceptor abszorpciós spektruma között. Fl intenzitás ill. OD Hullámhossz (nm) A FRET távolságfüggése A FRET alkalmazása E = R 0 6 R 0 6 + R 6 E Förster-távolság (Az a távolság melyen a FRET hatásfok felére csökken: transzferhatásfok 0.5) Molekuláris mérőszalag: távolságmérés a nm-es (10-9 m) tartományban. Nagyon érzékeny! Alkalmazás: Molekulák közötti kölcsönhatások tanulmányozása. Molekulákon belüli szerkezeti változások tanulmányozása. A fluorofórok közötti aktuális távolság FRET microscopy R 0

Rádióspektroszkópiák : forradalmasították a fizikát, kémiát, biológiát és orvostudományt Atomi, molekuláris rendszerek elemi mágnesként viselkedhetnek Elektronspin rezonancia (ESR, elektron paramágneses rezonancia - EPR) Mágneses magrezonancia (NMR, MRI) EPR spektroszkópia NMR spektroszkópia Ferhérje molekuláris dinamika NMR-rel Nagyfelbontású, anatómiai MRI Stern-Gerlach kísérlet (1922) Az eredő mágneses dipólmomentumot az 5s 1 elektron adja (pályaperdület=0) A nyaláb két részre hasad Otto Stern (1888-1969) Walther Gerlach (1889-1979) Inhomogén mágneses térben nemcsak forgatónyomaték, hanem eredő erő is hat a mágneses dipólra: A spin mágneses momentum két értéket vehet fel. MRI spektroszkópia MRI angiográfia Funkcionális MRI (fmri) Diffúziós MRI (tractographia) Musculoskeletalis MRI Mágneses magrezonancia ( nuclear magnetic resonance, NMR) Nobel-díj, 1952 Isidor Rabi (1898-1988) Felix Bloch (1905-1983) Edward Mills Purcell (1912-1997) Mágneses rezonancia: Mágneses térbe helyezett minta általi, rezonancia-abszorpció jellegű elektromágneses energia elnyelés. Eredő spinnel rendelkező rendszerek: elemi mágnesek Elemi részecskék (p, n, e) saját spinnel rendelkeznek. Az elemi részecskék száma és bizonyos rendező elvek (pl. Pauli-elv) miatt a rendszerben eredő spin léphet fel. Atommag: páratlan tömegszám - feles magspin ( 1 H, 13 C, 15 N, 19 F, 31 P); páros tömegszám, páratlan rendszám - magspin egész; páros tömegszám és rendszám - magspin zérus. Elektron: eredő elektronspin stabil párosítatlan elektront tartalmazó rendszerekben (pl. szabad gyökök). Töltés és eredő spin miatt mágneses momentum lép fel. Magmágneses momentum: γ N = atommag giromágneses hányadosa (mágneses momentum és perdület aránya) L = magspin ( ), ahol l=eredő spinkvantumszám. Elektronspin mágneses momentuma: Mágneses tér hiányában: elemi mágnesek orientációja random Paramágnesség: külső mágneses tér hatására fellépő mágnesezettség (mágneses dipólok orientációja). Mágneses térben: elemi mágnesek orientálódnak parallel E energiaszintek felhasadnak ΔE Rezonanciafeltétel: ΔE=hf Pörgettyűmodell g = elektron g-faktora (a mágneses momentum és giromágneses hányados kapcsolatát leíró dimenziónélküli arányszám) μ β = Bohr magneton (az elektron mágneses dipólmomentumának egysége) S = spinkvantumszám antiparallel B

Precesszió NMR és EPR spektroszkópia Klasszikus ( pörgettyű ) modell szerint - Precessziós vagy Larmor frekvencia: ω 0 =γ f Larmor = γ 2π Rezonanciafeltétel: NMR spektrum: elnyelt elektromágneses sugárzás intenzitása frekvencia függvényében. NMR-vonal görbe alatti területe az abszorbeáló atommagok számával arányos. Elektronfelhő (i.e., annak szerkezete) befolyásolja a lokális mágneses teret: frekvenciafeltétel elhangolódik ( kémiai eltolódás ). Kémiai szerkezetmeghatározás lehetősége. Acetaldehid NMR spektruma Pörgettyű, giroszkóp Felix Bloch, 1946 EPR spektrum: elnyelt elektromágneses sugárzás intenzitása a mágneses tér függvényében. NMR-énél alacsonyabb mágneses tér, de nagyobb elektromágneses sugárzási frekvenciák (mikrohullám). Spin-jelölés: stabil párosítatlan elektront tartalmazó vegyülettel való jelölés. Mozgási (rotációs) sebességek mérési lehetősége a 10-4 - 10-2 s időtartományban. Mágneses tér (G) Spinjelölt citokróm-c ESR spektruma Makroszkópos mágnesezettség különböző energiaszinteken spintöbblet miatt Gerjesztés rádiófrekvenciás elektromágneses sugárzással M = mágneses tér M = makroszkópos mágnesezettség Rezonancia feltétel: Larmor frekvencia μ i Alacsony energia állapot proton esetében parallel M B 1 Magas energia állapot proton esetében antiparallel = mágneses tér M = makroszkópos mágnesezettség B 1 = besugárzott rádiófrekvenciás elektromágneses tér

Spin-rács relaxáció T1 vagy longitudinális relaxáció Spin-spin relaxáció T2 vagy tranzverzális relaxáció M z M xy free induction decay (FID) T1 relaxációs idő: elemi mágnes (proton) és környezete közötti kölcsönhatásra utal t t T2 relaxációs idő: elemi mágnesek (protonok) közötti kölcsönhatásra utal MRI: non-invazív tomográfiás módszer MRI: az emberi test makroszkópos mágnesezettségét hozza létre Nobel-díj (2003) Raymond V. Damadian (1936-) Paul C. Lauterbur (1929-) Ábra Damadian szabványügyi bejelentéséből indomitable : a rettenthetetlen Peter Mansfield (1933-)

MRI képalkotás I: Térbeli felbontás NMR jel térbeli kódolása: a precesszió frekvenciaváltozására épül voxel: térfogatelem pixel: felületelem, elemi képpont Kép B z Elemi 3D képpontok (voxel) definiálása és címezhetősége: grádiens tér segítségével B y RF tekercs Fourier transzformáció B x MRI képalkotás II: színfelbontás (kontraszt) relaxációs idők alapján MRI összefoglalás A szövet B szövet Tranzverzális jelveszteség Zsír Liquor Gerjesztő impulzus Tekercs Rövid T1 Hosszú T1 Idő (ms) A proton RF hullámot emittál gerjesztést követően. Kriogén mágnes Grádiens tekercs Rádiofrekvenciáns tekercs Vízmolekula Képanalízis (2D-FFT) NMR berendezés T1-súlyozás protonsűrűségsúlyozás T2-súlyozás

MRI: képi információ manipulálása I MRI: Non-invazív angiográfia Újraszeletelés merőleges síkban képszelet telített spinek véráram telítetlen spinek Térbeli projekció ( volume rendering ) MRI mozgókép Nagy időfelbontású felvételek alapján Funkcionális MRI (fmri) Élettani folyamattal szinkron felvett Nagy időfelbontású képsorozat Aortabillentyű nyílása-záródása Villogó fény hatása a látókéregre

Szuperponált MRI és PET képsorozat PET aktivitás: szemmozgatás során Térbeli rekonstrukció