Kis Petik Katalin. Semmelweis Egyetem. Biofizikai és Sugárbiológiai Intézet

Hasonló dokumentumok
A biológiai anyag vizsgálatának mikroszkópi módszerei

Biomolekuláris rendszerek. vizsgálata. Semmelweis Egyetem. Osváth Szabolcs. A mikroszkópok legfontosabb típusai

Biomolekuláris rendszerek. vizsgálata. Semmelweis Egyetem. Osváth Szabolcs

Biomolekuláris rendszerek. vizsgálata. Semmelweis Egyetem. Osváth Szabolcs

Biomolekuláris rendszerek vizsgálata

Biomolekuláris rendszerek vizsgálata

Áttekintés 5/11/2015 MIKROSZKÓPIAI MÓDSZEREK 1 FÉNYMIKROSZKÓPIA FLUORESZCENCIA MIKROSZKÓPIA. Mikroszkópia, fénymikroszkópia

d z. nsin

Modern mikroszkópiai módszerek

Fény- és fluoreszcens mikroszkópia. A mikroszkóp felépítése Brightfield mikroszkópia

Rövid ismertető. Modern mikroszkópiai módszerek. A mikroszkóp. A mikroszkóp. Az optikai mikroszkópia áttekintése

Ragyogó molekulák: dióhéjban a fluoreszcenciáról és biológiai alkalmazásairól

Biofizika 2 Fizika-Biofizika

2008 Small World contest -18th Prize - Dr. Tamily Weissman (Harvard University - Cambridge, Massachusetts, United States) Specimen: Brainbow

A fluoreszcencia orvosibiológiai. alkalmazásai. Fluoreszcencia forrása I. Fluoreszcencia alkalmazások. Kellermayer Miklós

Bevezetés a fluoreszcenciába

BIOFIZIKA. Metodika- 2. Liliom Károly. MTA TTK Enzimológiai Intézet

BIOFIZIKA. Metodika- 1. Liliom Károly. MTA TTK Enzimológiai Intézet

5/11/2015 MIKROSZKÓPIAI MÓDSZEREK 2 FLUORESZCENCIÁN ALAPULÓ MODERN MIKROSZKÓPIAI MÓDSZEREK. Fluoreszcencia mikroszkópia

Mozgékony molekulák vizsgálata modern mikroszkópiával

Modern mikroszkópiai technikák

Az elektromágneses spektrum

Modern mikroszkópiai módszerek

FONTOS! a március 14-i előadás március 19-én (szombat) 9 h-kor lesz

Speciális fluoreszcencia spektroszkópiai módszerek

MIKROSZKÓPIA. "mikrosz" (kicsiny) "szkopeo" (nézek)

Fluoreszcencia módszerek (Kioltás, Anizotrópia, FRET)

6. Fehérjék kimutatása. Biokémiai és sejtszintű vizsgálatok

Fluoreszcencia módszerek (Kioltás, Anizotrópia, FRET) Modern Biofizikai Kutatási Módszerek

6. Fehérjék kimutatása. Biokémiai és sejtszintű vizsgálatok

Laterális feloldás és képminőség javítása vonalpásztázó tomográfiás optikai mikroszkópban

ALKÍMIA MA Az anyagról mai szemmel, a régiek megszállottságával.

Szentjánosbogár, trópusi halak, sarki fény Mi a közös a természet fénytüneményeiben?

MIKROSZKÓPIA. "mikrosz" (kicsiny) "szkopeo" (nézek)

In vivo szövetanalízis. Különös tekintettel a biolumineszcens és fluoreszcens képalkotási eljárásokra

6. Fehérjék kimutatása. Biokémiai és sejtszintű vizsgálatok

Fluoreszcencia 2. (Kioltás, Anizotrópia, FRET)

OLYMPUS Hungary Kft. Mikroszkóp Divízió. A mikroszkópia alapjai

Lumineszcencia. Lumineszcencia. Molekulaszerkezet. Atomszerkezet

Feloldóképesség Mikroszkópos módszerek. DIC mikroszkópia. Fáziskontraszt mikroszkópia. Barkó Szilvia A MIKROSZKÓPIA RÖVID TÖRTÉNETE

OPTIKA. Vozáry Eszter November

Szalay Péter (ELTE, Kémia Intézet) Szentjánosbogár, trópusi halak, sarki fény Mi a közös a természet fénytüneményeiben?

MIKROSZKÓPIA. "mikrosz" (kicsiny) "szkopeo" (nézek)

Fény- és fluoreszcens mikroszkópia. Optikai szeletelés

Mikroszkóp vizsgálata Lencse görbületi sugarának mérése Folyadék törésmutatójának mérése

Mikroszerkezeti vizsgálatok

TANULÓI KÍSÉRLET (45 perc)

Kémiai Nobel-díj 2014: Nanoszkópia

MODERN MIKROSZKÓPIAI MÓDSZEREK 1-2

Világító molekulák: Új típusú, szolvatokróm fluorofórok előállítása, vizsgálata és alkalmazásaik

Atomi és molekuláris kölcsönhatások. Pásztázó tűszondás mikroszkópia.

Lumineszcencia spektrometria összefoglaló

Nanodiagnosztika: Nanopartikulum alapú in vivo képalkotás

KÉSZÍTETTE: BALOGH VERONIKA ELTE IDEGTUDOMÁNY ÉS HUMÁNBIOLÓGIA SZAKIRÁNY MSC 2015/16 II. FÉLÉV


Tartalomjegyzék. Emlékeztetõ. Emlékeztetõ. Spektroszkópia. Fényelnyelés híg oldatokban A fény; Abszorpciós spektroszkópia

Az elektromágneses sugárzás kölcsönhatása az anyaggal

Az áramlási citométer és sejtszorter felépítése és működése, diagnosztikai alkalmazásai

11.3. Az Achilles- ín egy olyan rugónak tekinthető, amelynek rugóállandója N/m. Mekkora erő szükséges az ín 2 mm- rel történő megnyújtásához?

Mikroszkóp vizsgálata Folyadék törésmutatójának mérése

ADATÉRTÉKEL ELJÁRÁSOK SEJTFELSZÍNI FEHÉRJEMINTÁZATOK ANALÍZISÉRE SZENTESI GERGELY

Alapvető eljárások Roncsolásmentes anyagvizsgálat

LÁTÁS FIZIOLÓGIA I.RÉSZ

Sejtalkotók a évi kémiai Nobel-díj fényében

Atomszerkezet. Fehérjék szerkezetvizsgáló módszerei. Molekulaszerkezet. Molekula energiája. Lumineszcenciás technikák. E e > E v > E r. + E v.

mintasepcifikus mikrokapilláris elektroforézis Lab-on-Chip elektroforézis / elektrokinetikus elven DNS, RNS, mirns 12, fehérje 10, sejtes minta 6

Kötőanyagok habarcsok. a mikroszkóp rt?

Abszorpciós spektroszkópia

Abszorpció, emlékeztetõ

Tartalomjegyzék. Emlékeztetõ. Emlékeztetõ. Spektroszkópia. Fényelnyelés híg oldatokban 4/11/2016. A fény; Abszorpciós spektroszkópia

OPTIKA. Fénykibocsátás mechanizmusa fényforrás típusok. Dr. Seres István

Nusser Zoltan. Celluláris Idegélettani Laboratórium MTA Kísérleti Orvostudományi Kutatóintézet Budapest

Milyen simaságú legyen a minta felülete jó minőségű EBSD mérésekhez

Dekonvolúció a mikroszkópiában. Barna László MTA Kísérleti Orvostudományi Kutatóintézet Nikon-KOKI képalkotó Központ

Fotogerjesztett biofizikai rendszerek. Barócsi Attila

SEMMELWEIS EGYETEM DOKTORI ISKOLA. Ph.D. értekezések BARNA LÁSZLÓ

A mikroszkópok felépítése és használata

A digitális képfeldolgozás alapjai

-Két fő korlát: - asztrogliák rendkívüli morfológiája -Ca szignálok értelmezési nehézségei

Lumineszcencia spektroszkópia

Speciális fluoreszcencia spektroszkópiai alkalmazások. Emlékeztető: az abszorpció definíciója. OD = A = - log (I / I 0 ) = ε (λ) c x

Lumineszcencia spektrometria összefoglaló

Optikai mikroszkópia. Bereznai Miklós SZTE Optika és Kvantumelektronikai Tanszék

V. A MIKROSZKÓP. FÉNYMIKROSZKÓPOS VIZSGÁLATOK A MIKROSZKÓP FELÉPÍTÉSE ÉS MŐKÖDÉSE

Mikroszkóp vizsgálata Lencse görbületi sugarának mérése Folyadék törésmutatójának mérése

Kémiai Nobel-díj 2008

Élettani folyamatok vizualizálása; Multi-foton fluoreszcens lézer szkenning mikroszkóp. Prókai Ágnes SE 1.számú Gyermekklinika PhD kurzus

A szubmikronos anyagtudomány néhány eszköze. Havancsák Károly ELTE TTK Központi Kutató és Műszer Centrum július.

Optika és Relativitáselmélet II. BsC fizikus hallgatóknak

Búza tartalékfehérjék mozgásának követése a transzgénikus rizs endospermium sejtjeiben

E (total) = E (translational) + E (rotation) + E (vibration) + E (electronic) + E (electronic

Lumineszcencia. Lumineszcencia. mindenütt. Lumineszcencia mindenütt. Lumineszcencia mindenütt. Alapjai, tulajdonságai, mérése. Kellermayer Miklós

Daganat immunterápia molekuláris markereinek tanulmányozása biofizikai módszerekkel. Áramlási és képalkotó citometria

Biokémiai kutatások ma

Fényérzékeny amorf nanokompozitok: technológia és alkalmazásuk a fotonikában. Csarnovics István

Biomolekuláris szerkezet és dinamika vizsgálata. Gerjesztés során elnyelt energia sorsa. Fluoreszcencia és különleges alkalmazásai

Gamma-röntgen spektrométer és eljárás kifejlesztése anyagok elemi összetétele és izotópszelektív radioaktivitása egyidejű elemzésére

MRI áttekintés. Orvosi képdiagnosztika 3. ea ősz

Módszer az ASEA-ban található reaktív molekulák ellenőrzésére

ÚJ FÉNYMIKROSZKÓPOS MÓDSZER KIDOLGOZÁSA A MIKROSZERVEZETEK TÉRBELI REKONSTRUKCIÓ- JÁRA

Átírás:

Kis Petik Katalin Semmelweis Egyetem Biofizikai és Sugárbiológiai Intézet 2012.április 23

makro Hiszem, ha látom! szem (CT, MRI, UH, PET,...) fénymikroszkópok elektronmikrosz kópok pásztázó módszerek (AFM, STM,...) további trükkös fényt használó módszerek

A nano és mikro tartomány méretei elektronmikroszkóp molekulák érdekes, de nehezen látható molekulák 2nm fénymikroszkóp 200nm sejtek, szövetek

A fénymikroszkóp egyszerű: nagyító, lupe összetett: objektív és okulár speciális kontraszt: sötétlátótér, fáziskontraszt, polarizáció, fluoreszcencia, DIC,... modern: optikai szeletelő (konfokális, multifoton) egyedi molekulák még újabb: szuperfelbontás (STORM, PALM, STED)

Antoni van Leeuwenhoek (Thonis Philipszoon) 1632-1723 1674-ben egyszerű mikroszkópot készít mikróbákat figyelt meg

Ernst Karl Abbe (1840-1905) Fizikus és társadalomreformer is volt. Az optikai eszközök gyártását tudományos alapokra helyezte. a felbontóképesség fizikai határa

Abbe elv A mikroszkópban akkor és csak akkor tudunk feloldani két tárgypontot, ha a diffraktálódott fényhullámból a főmaximumon kívül legalább az első rendben elhajlott fény is részt vesz a képalkotásban. δ = 0,61 λ / (n sinω) Airy korongok point spread function Hallgatólagos feltevések: a minta különböző részeiről egyszerre alkotunk képet; a minta részleteit úgy különböztetjük meg, hogy a róluk jövő fény a létrejövő képben megkülönböztethető képpontokat (foltokat) ad.

PSF:point spread function konvolúció a mikroszkóp átviteli függvénye

Numerikus apertúra

Mikroszkóp objektív lencsék

Numerikus apertura

Fluoreszcencia mikroszkóp HeLasejtek: peroxiszóma EGFP, mitokondrium, magok: Hoechst egér veseszövet molekuláris kifestőkönyv

Az ideális fluorofor (festék) kicsi hidrofil megfelelő helyen nyel el és emittál nagy Stokes eltolódás specifikus kötődés (biotin/avidin, His-tag/Ni, antitest/antigén NH2, SH) fényes (abszorpció*fluoreszcencia hatásfok) nem, vagy lassan ég ki nem csinál fotokémiai reakciókat nem pislog

Fluoreszcens kvantumpöttyök (a) CdSe-ből ZnS borítással készült knavtumpöttyök fluoreszcenciamikroszkópos képe A kvantumpöttyök mérete határozza meg az emittált fluoreszcencia színét. (b) tíz eltérő méretű, ezeért elérő színben fluoreszkáló CdSe/ZnS kvantumpötty

Fluoreszcens kvantumpöttyökkel jelölt rákos daganatok

Fluoreszcens fehérjék Aequorea victoria (meduza) Acropora millepora (korall)

GFP (Green Fluorescent Protein) 2008. évi kémiai Nobel díj Osamu Shimomura a '60 as években izolálta és elkezdte tanulmányozni Martin Chalfie 1994-ben génkifejeződés indikátoraként használta Roger Y. Tsien 1995-ben előállított az első javított változatot

GFP (Green Fluorescent Protein) emisszió: 507 nm EGFP: a S65T pontmutáció a nem UV közeli 488 nm-es gerjesztést eredményezte viszont ph érzékeny... EYFP: a RTG diffrakciós szerkezetből látszik, hogy a Thr203 közel van a kromofórhoz, Trp-ra cserélve sárga lesz

GFP (Green Fluorescent Protein) génkifejeződés sejtekben egyes sejtalkotókra specifikus jelölés

A fluoreszcens fehérjék sokfélesége A kép teljes egészében fluoreszcens fehérjéket kifejező baktériumokkal van festve.

Fluoreszcens jelölő módszerek párhuzamos alkalmazása Öt különböző módszerrel megfestett HeLa sejtek. A vonal 20 µm hosszú.

Fluoreszcenciát használó módszerek egyedi molekulák: lézeres szkennelő: optikai szeletelő pl. TIRF konfokális mikroszkóp multifoton mikroszkóp még újabb: szuperfelbontás lokalizáció STORM, PALM PSF-alakítás STED letapogatás: NSOM

TIRF csak egy vékony szelet, a minta alja látható

FRET (Förster Resonance Energy Transfer) Az energiatranszfer hatásfoka: KT = (1/τD) [R0/r]6 AholτD és R0 a festékpárra jellemző állandók, r a festékek közötti távolság.

Fluoreszcens indikátorok Ioncsatorna működése a helyi ionkoncentráció mérése alapján Ionkoncentráció és konformációs változások együttes mérése

FLIM- fluoreszcencia élettartam kép idő alapú mérés frekvencia alapú mérés

Konfokális és multifoton mikroszkóp Z stack

Egyfotonos és kétfotonos gerjesztés Miért jobb a kétfoton gerjesztés? -csak a fókuszban gerjeszt (femtoliternyi!) -kevésbé szóródik a hosszabb hullámhosszú gerjesztés (szövetbe bejut) -beépített szelekció, optikai szeletelés, 3D rekonstrukció -a szórt fluoreszcencia fényt is össze lehet gyűjteni (csak a fókuszból származhat) -kevésbé ég a minta - autofluoreszcencia (festék nélkül is látszik)

Élő vesébe látunk! 0 μm >100 μm 10-20 mm funkciót lehet tanulmányozni IN VIVO

GREEN: autofluorescence from NADH RED: 70 kda rhodamin dextrane (blood vessels) YELLOW: Lucifer Yellow (extracellular area) BLUE: Hoechst (nuclei) glomerulus 80 μm deep 20 μm deep 0 μm deep, the capsule

Renin termelődés a vesében immunoszupresszáns kezelést követően multifoton mikroszkópia kontroll Tac kezelt glomerulus + JGA gyűjtőcsatorna Piros: 70kDa rhodamin dextran (ér); zöld: quinacrin (renin); sárga: lucifer yellow (tubulus); kék: Hoechest (mag) CyA kezelt RAS gatlok

A festékek eloszlása

Z stack a fókusztávolságot változtatva

Véráramlás sebességének mérése line scan 1 ms/line, 0.05 μm/pixel V~ 1-2 mm/s, diameter: 7-11 μm

Mozgókép

Élőlények fluoreszcencia mikroszkópos tanulmányozása, nanosebészet Caenorhabditis elegans 302 neuronja közül egyetlen idegsejt axonjának átvágása

FRAP

Korrelációs módszerek FCS diffúziós állandó fényesség-aggregáció

Raszter képben is van információ vonal mentén, kör mentén is lehet szkennelni

Szuperrezolúció (nanoszkóp) LOKALIZÁCIÓ akár nm pontosan! fotonszám, pixelméret, háttér

Szuperrezolúció (nanoszkóp) STORM-stochastic optical reconstruction microscopy véletlenszerűen megvilágított szubpopuláció PALM-Photoactivated localization microscopy fotoaktivált szubpopuláció, mérés, inaktiválás ciklusok FIONA fluorescence imaging with one-nanometer accuracy SHRImP single-molecule high-resolution imaging SHREC single molecule high-resolution colocalization PAINT point accumulation for imaging in nanoscale topography

STED (stimulated emission depletion)

STED (stimulated emission depletion)

Irodalomjegyzék ZEISS zeiss-campus.magnet.fsu.edu/ NIKON www.microscopyu.com/ OLYMPUS LEICA lab/ www.olympusmicro.com/primer/ www.leica-microsystems.com/science- Invitrogen www.probes.com SE Biofizikai és Sugárbiológiai Intézet biofiz.sote.hu/