1.) Meghatároztuk több, korábban vérsejtantigénként jellemzett molekula kódoló génjét és több vérsejtantigén funkcióját jellemeztük.

Hasonló dokumentumok
Az Immunológiai Csoport

A DROSOPHILA MELANOGASTER LAMELLOCITÁIRA JELLEMZİ MOLEKULÁK FUNKCIONÁLIS VIZSGÁLATA

A Nimród fehérje- és géncsalád szerepe a mikroorganizmusok felismerésében és bekebelezésében

A Headcase a Drosophila melanogaster vérsejtképződésének szabályozó faktora. Varga Gergely István. Doktori értekezés tézisei

A mézelő méh sejt-közvetítette immunitása

Válasz Prof. Dr. Berki Tímea bírálatára

Az elsődleges immunválasz tokképző reakciójának molekuláris genetikai alapjai Drosophila melanogasterben

Vérsejtleszármazási vonalak vizsgálata Drosophila melanogasterben

Az adaptív immunválasz kialakulása. Erdei Anna Immunológiai Tanszék ELTE

Antigén, Antigén prezentáció

A szamóca érése során izolált Spiral és Spermidin-szintáz gén jellemzése. Kiss Erzsébet Kovács László

A Headcase a Drosophila melanogaster vérsejtképződésének szabályozó faktora. PhD. értekezés. Varga Gergely István. Témavezető: Dr.

Az ADA2b adaptor fehérjéket tartalmazó hiszton acetiltranszferáz komplexek szerepének vizsgálata Drosophila melanogaster-ben

A C. elegans TRA-1/GLI/Ci szex-determinációs faktor célgénjeinek meghatározása és analízise. Doktori értekezés tézisei.

Mikrogliák eredete és differenciációja

Az X kromoszóma inaktívációja. A kromatin szerkezet befolyásolja a génexpressziót

Immunológia Alapjai. 13. előadás. Elsődleges T sejt érés és differenciálódás

A határsejtvándorlás szabályozásában résztvevœ gének azonosítása és jellemzése ecetmuslicában

Epigenetikus szabályozó faktorok azonosítása és jellemzése. Drosophila melanogaster-ben

A preventív vakcináció lényege :

Egy Polycomb Response Element (PRE) in situ vizsgálata Drosophila melanogaster-ben génkonverzió segítségével. Kozma Gabriella

Immunológia alapjai. 10. előadás. Komplement rendszer

Immunológiai módszerek a klinikai kutatásban

Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen

Az ellenanyagok szerkezete és funkciója. Erdei Anna Immunológiai Tanszék ELTE

Genetika 3 ea. Bevezetés

KERINGŐ EXTRACELLULÁRIS VEZIKULÁK ÁLTAL INDUKÁLT GÉNEXPRESSZIÓS MINTÁZAT VIZSGÁLATA TROPHOBLAST SEJTVONALBAN

A Drosophila melanogaster poszt-meiotikus spermatogenezisében szerepet játszó gének vizsgálata. Ph.D. értekezés tézisei.

Immunológia I. 4. előadás. Kacskovics Imre

Ivarplazmában tárolt RNS-ek azonosítása teljes genom DNS microarray segítségével

avagy az ipari alkalmazhatóság kérdése biotechnológiai tárgyú szabadalmi bejelentéseknél Dr. Győrffy Béla, Egis Nyrt., Budapest

A genetikai lelet értelmezése monogénes betegségekben

Immunológia alapjai előadás MHC. szerkezete és genetikája, és az immunológiai felismerésben játszott szerepe. Antigén bemutatás.

Lele Zsolt. MTA Kísérleti Orvostudományi Kutatóintézet

Kutatási beszámoló ( )

Biomassza alapú bioalkohol előállítási technológia fejlesztése metagenomikai eljárással

Sejtek - őssejtek dióhéjban február. Sarkadi Balázs, MTA-TTK Molekuláris Farmakológiai Intézet - SE Kutatócsoport, Budapest

A keringı tumor markerek klinikai alkalmazásának aktuális kérdései és irányelvei

Az anafázis promoting complex (APC/C) katalitikus modulja Drosophila melanogasterben. Nagy Olga

Genomikai Medicina és Ritka Betegségek Intézete Semmelweis Egyetem

Az immunrendszer működésében résztvevő sejtek Erdei Anna Immunológiai Tanszék ELTE

Genetikai modell állatok és transzgénia - genomikai megközelítések

Immunológia alapjai. Az immunválasz szupressziója Előadás. A szupresszióban részt vevő sejtes és molekuláris elemek

Immunológiai módszerek a klinikai kutatásban

Molekuláris genetikai vizsgáló. módszerek az immundefektusok. diagnosztikájában

Norvég Finanszírozási Mechanizmus által támogatott projekt HU-0115/NA/2008-3/ÖP-9 ÚJ TERÁPIÁS CÉLPONTOK AZONOSÍTÁSA GENOMIKAI MÓDSZEREKKEL

A tumor-markerek alkalmazásának irányelvei BOKOR KÁROLY klinikai biokémikus Dr. Romics László Egészségügyi Intézmény

Mit tud a genetika. Génterápiás lehetőségek MPS-ben. Dr. Varga Norbert

Immunológia alapjai. 16. előadás. Komplement rendszer

Immunológia alapjai 5-6. előadás MHC szerkezete és genetikája, és az immunológiai felismerésben játszott szerepe. Antigén bemutatás.

AZ ELÉRT EREDMÉNYEK Új mutáns allélek ismert óragénekben

Hátterükben egyetlen gén áll, melynek általában számottevő a viselkedésre gyakorolt hatása, öröklési mintázata jellegzetes.

Egy új, a szimbiotikus gümőfejlődésben szerepet játszó ubiquitin ligáz funkcionális jellemzése

A Drosophila mir-282 mikrorns gén szerkezeti és funkcionális jellemzése. Bujna Ágnes

Genomadatbázisok Ld. Entrez Genome: Összes ismert genom, hierarchikus szervezésben (kromoszóma, térképek, gének, stb.)

Bevezetés a rendszerbiológiába

Anyai eredet kromoszómák. Zigóta

2011. január április 10. IPK Gatersleben (Németország) május 17. Kruppa Klaudia

Szervezetünk védelmének alapja: az immunológiai felismerés

A DAAM formin alcsalád szerepe az izomfejlődésben. A Ph.D. értekezés tézisei. Molnár Imre. Témavezető: Dr. Mihály József

Domináns-recesszív öröklődésmenet

ADATBÁNYÁSZAT I. ÉS OMICS

Immunitás és evolúció

Xenobiotikum transzporterek vizsgálata humán keratinocitákban és bőrben

Immunológia 4. A BCR diverzitás kialakulása

Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen

BIOLÓGIA HÁZIVERSENY 1. FORDULÓ BIOKÉMIA, GENETIKA BIOKÉMIA, GENETIKA

A Huntington kór patogenezisének vizsgálata Drosophila modell felhasználásával

Humán genom variációk single nucleotide polymorphism (SNP)

Immunológia I. 2. előadás. Kacskovics Imre

ÁLLATGYÓGYÁSZATI IMMUNOLÓGIAI GYÓGYSZEREK ELŐÁLLÍTÁSÁRA SZÁNT ÁLLATI EREDETŰ ANYAGOK

Zárójelentés a Hisztamin hatása a sejtdifferenciációra, összehasonlító vizsgálatok tumor - és embrionális őssejteken című számú OTKA pályázatról

Natív antigének felismerése. B sejt receptorok, immunglobulinok

Tudománytörténeti visszatekintés

Összefoglalás első fejezete

Sodródás Evolúció neutrális elmélete

VIZSGÁLATOK IDEGEN KÓROKOZÓKRA HUMÁN ÉLŐVÍRUS-VAKCINÁKBAN

A Caskin1 állványfehérje vizsgálata

MODELLORGANIZMUSOK GENETIKÁJA. Drosophila melanogaster, muslica (borlégy)

NÖVÉNYÉLETTAN. Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP /1/A

A Globális regulátor mutációknak mint az attenuálás lehetőségének vizsgálata Escherichia coli-ban

Dr. Nemes Nagy Zsuzsa Szakképzés Karl Landsteiner Karl Landsteiner:

~ 1 ~ Ezek alapján a következő célokat valósítottuk meg a Ph.D. munkám során:

In vivo szövetanalízis. Különös tekintettel a biolumineszcens és fluoreszcens képalkotási eljárásokra

Bírálat Dr. Igaz Péter című MTA doktori értekezéséről

A dsaga SPECIFIKUS HISZTON ACETILÁCIÓ GÉNMŰKÖDÉS SZABÁLYOZÁSBAN BETÖLTÖTT FUNKCIÓJÁNAK VIZSGÁLATA. Zsindely Nóra

Ph.D. disszertáció tézisei

Kappelmayer János. Malignus hematológiai megbetegedések molekuláris háttere. MOLSZE IX. Nagygyűlése. Bük, 2005 szeptember

Immunológia alapjai előadás. Az immunológiai felismerés molekuláris összetevői.

Új genetikai stratégia kidolgozása az Arabidopsis stressz válaszát szabályzó gének azonosítására

Kromoszómák, Gének centromer

A veleszületett immunitás vizsgálata Drosophila melanogasterben

Fehérje interakciók az ecetmuslica telomerének retrotranszpozonjain. Takács Sándor

A HupSL és Hox1 NiFe hidrogenáz enzimek összehangolt szabályozásának vizsgálata Thiocapsa roseopersicina baktériumban. Ph.D.

A DmUsp5 dezubikvitiláz fiziológiai funkciójának meghatározása Drosophila melanogasterben. Kovács Levente

TUMORSEJTEK FENOTÍPUS-VÁLTOZÁSA TUMOR-SZTRÓMA SEJTFÚZIÓ HATÁSÁRA. Dr. Kurgyis Zsuzsanna

Immunológia alapjai előadás. Az immunológiai felismerés molekuláris összetevői

Túlérzékenységi reakciók Gell és Coombs felosztása szerint.

OTKA ZÁRÓJELENTÉS

A TATA-kötő fehérje asszociált faktor 3 (TAF3) p53-mal való kölcsönhatásának funkcionális vizsgálata

Átírás:

A Pályázat által biztosított keretek lehetővé tették a Drosophila melanogaster veleszületett immunitásának vizsgálatában kapott korábbi eredményeink értelmezését, valamint a vizsgálatok új irányokba történő kiterjesztését. 1.) Meghatároztuk több, korábban vérsejtantigénként jellemzett molekula kódoló génjét és több vérsejtantigén funkcióját jellemeztük. 2.) Azonosítottunk több, az embrióban, a lárvában és a kifejlett rovarban megnyilvánuló vérsejtantigént. 3.) Genomszintű genetikai screent kezdtünk in vivo, melynek segítségével a differeenciálódási vonalak és a vérsejtompartmentumok fejlődését szabályozó géneket azonosítottunk. 4.) A vérsejtantigének jellemzése, in vivo használató genetikai konstruktok létrehozása és a genetikai screen során kapott előzetes eredmények alapján egy eddig nem azonosított immunológiai kompartmentum létére következtetünk. 5.) A Drosophila antigének feltételezett gerinces megfelelőit vizsgáltuk in silico módszerekkel. Ad 1.: 1.1. P1 NimC1 Meghatároztuk az általunk korábban azonosított P1 antigén génje (nimród) környezetében és a Drosophila genomban másutt felismert homomológok megnyilvánulásának a mintázatát. A Drosophilában és az egyéb fajokban jellemzett homológok in silico analízise egy új típusú EGF-repeat, az un. nim- (Nimród) repeat leírását tette lehetővé, melynek alapján a molekulát nimc1-nek neveztük. Kimutattuk, hogy nimc1 molekula részt vesz fagocitózis folyamatának a szabályozásában A NimC1 molekulát kódoló gén környezetében azonosított molekulákról megállapítottuk, hogy egyedül a nima nem nyilvánul meg hemocitákon. A többi molekulát megkíséreltük E.coliban expresszáltatni. Miután valamennyi nim konstrukt a termeltető baktériumra nézve toxikusnak bizonyult, eukarióta expressziós rendszerben is megkíséreltük a gént expresszáltatni, azonban a konstrukt itt is toxikusnak bizonyult. A Nim repeatek részlesebb analízise fölvetette azt a lehetőséget, hogy a konstrukt toxicitását általános antimikróbiális hatás eredményezi. Ennek vizsgálatára a nimc1 gén kódoló régiójából egy Nim repeateet kódoló és egy, a repeatet nem kódoló régiót expresszáltattunk baktériumban. A nim repeatet tartalmazó konstrukt toxikusnak bizonyult, míg a repeatet nem tartalmazó konstrukt nem volt toxikus. Hazai együttműködés keretében megkezdtük a tesztelt régióknak megfelelő peptidek antimikróbiális/baktericid hatásának a tesztelését. 1.2. Meghatároztuk a sejt-közvetítette immunválasz tokképző reakciójában résztvevő sejtek, a lamellociták differenciálódásának minimális, de szükséges feltételeit.

1.3. A lamellocitákban specifikusan megnyilvánuló, korábban általunk azonosított L5 antigénről igazoltuk, hogy az a filamin magas molekulasúlyú izoformája és, hogy a molekula a lamellocita-differenciálódás szuppresszora. 1.4. A lamellocita-specifikus Hella/Atilla antigénnek 8 funkcióvesztéses allélját hoztuk létre, melyeknek biológiai tesztekben történő jellemzése folyamatban van. Egy, a leghosszabb deléciót hordozó allélt részletes genomikai analízisnek vetettünk alá. A microarray analízist a több mint 18500 transzkriptet tartalmazó Affymetrix GeneChip Drosophila 2.0 Array alkalmazásával végeztük. Összesen 3507 transzkript esetében kaptunk génexpressziós változást a vizsgált három időpont bármelyikében, melyek közül a jelentős expressziós különbséget mutató géntermékeket több csoportba soroltuk. A hella mutánsban mindhárom időpontban emelkedett, illetve csökkent expressziós szintet mutató gének egy része bizonyított vagy potenciális immunfunkcióval rendelkezik, valamennyien az Attacin antimikróbiális peptid családba tartoznak. Az eredmények a Drosophila humorális és sejt-közvetítette immunválaszának a kapcsolatára utalhatnak. Az atilla-géntől 3 irányban elhelyezkedő EP elem mobilizálásával sikeresen létrehoztunk nyolc, az atilla gént érintő deléciót, melyekből törzseket alapítottunk. A deléciós törzsek funkcionális vizsgálatával megállapítottuk, hogy valamennyi deléciós törzs azonos fenotípust mutatott, a kontroll perfekt excíziós törzsekkel. A deléciót homozigóta formában hordozó törzsek életképesek, egyedfejlődésükben nem tapasztaltunk élettel összeegyeztethetetlen, az immunválaszban vagy a vérsejtdifferenciálódás során megfigyelhető változást. Az atilla gén deléciós, funkcióvesztéses alléljeit genetikai interakciókban kezdtük vizsgálni; interakciós partnerként olyan mutációkat használunk, amelyek a vérsejtek, ezen belül is elsősorban a lamellociták differenciációjában és/vagy funkciójában a vad típustól eltérést mutatnak. Az első genetikai interakciót az l(3)mbn-1 mutációval hoztuk létre. További kettős mutánsok vizsgálata van folyamatban. Az atilla gén funkciónyerésének illetve ektopikus expressziójának vizsgálatára létrehoztuk az atilla gén teljes cdns-ét tartalmazó UAS-atilla konstruktot, amelyeknek legyekbe transzformálásával a kísérletekhez megfelelő transzformáns törzset hoztunk létre. Az UAS-atilla konstruktot hordozó legyekben az atilla expresszióját először a HemeseGal4 meghajtóelem használatával vizsgáltuk. A meghajtás következtében az Atilla fehérje a plazmatocitákon és kristálysejteken is kifejeződik. Az ektopikus expresszió élettani következményeit jelenleg vizsgáljuk. Eddigi eredményeink szerint a gén ektopikus expressziója plazmatocitákban nem befolyásolja a fagocitózist. Több adatunk arra utal, hogy a lárvában kizárólag a lamellocitákon megnyilvánuló atilla gén az embrión és az adultban is megnyilvánul, ezért az atilla gén expressziójának vizsgálatát kiterjesztettük az egyedfejlődés különböző stádiumaiban fejlődő egyéb szövetekre. Ez további érdekes kérdéseket vet fel az atilla gén stádium- és szövetspecifikus expresszióját illetően, amelynek megválaszolását is célul tűztük ki. Az ehhez szükséges kísérletek - az atilla expresszió pontos helyének és időbeni változásának vizsgálata - jelenleg folyamatban vannak.

Ad 2.: 2.1. A perikardiális sejteken, a lárva és az embrió vérsejtjein megnyilvánuló antigént (H1) azonosítottunk (Kurucz et al. Acta biol. Hungarica) 2.2. Az adult vérsejtjeire általánosan jellemző imunológiai markertként azonosítottuk az Ad1 antigént. Meghatároztuk a marker expressziójának a szintjét az egyedfejlődés különböző stádiumaiban valamint a különböző vérsejtpopulációkban. Megállapítottuk, hogy a molekula ez egyedfejlődés során a lárvában alacsony szinten expresszálódik, magas szinten a bábállapotban jelenik meg először a vérsejtek citoplazmájában, majd az adult stádiumot elérve a vérsejtek felszínén is megjelenik. A sejtmembránhoz kapcsolt molekula molekulatömege 10kDa. A molekula az immunológiai vizsgálatok és a Western-blot analízisek alapján a vérsejt eredetű S2 sejtvonalban is megnyilvánul, amely megkönnyíti izolálását és szekvenálását. Megállapítottuk továbbá, hogy a molekula megjelenésével párhuzamosan az általunk korábban azonosított Hemese-molekula eltűnik a sejtek felszínéről. Ezek az eredmények és a vérsejt-transzplantációs kísérletek arra utalnak, hogy az egyedfejlődés során a vérsejtek nem passzív túlélők, hanem a vérsejtekben az egyedfejlődés során egy finoman szabályozott genetikai program valósul meg az egyedfejlődés során. A program egyes lépéseinek a megértéséhez közelebb vihet a kódoló gén és a transcript és a fehérje részletesebb jellemzése. A molekula a vérsejteredetű S2 sejtvonalban is megnyilvánul, ezért S sejtekből cdns expressziós génkönyvtárat hozunk létre valamint MALDI analízis elvégzéséhez immunprecipitáljuk az antigént. 2.3. A posterior vérképző szövettel történt immunizálást követően lamellocita-specifikus markerket azonosítottunk (l. 3.1.) Ad 3.: 3.1. Funkcióvesztéses genetikai screenből azonosított, meghatározott, kis méretű deléción, a Df(2L)E-n, belül térképeződő 9 tagú letális komplementációs csoport (Pis118/4, Pis55B, Pis103, PisS2r49a/6, Pis94A, PisR19, PisR20,, Pis94E) analízisével igazoltuk, hogy a Piros szem (Pis) gén mutációi egy epigenetikus represszor gént azonosítanak, amelynek mind a homeotikus gének regulációjában, mind a vérsejtek determinációjában szerepe van. A funkcióvesztéses mutánsok korai bábletálisak. A mutánsok a klasszikus Polycomb-csoport génjeire jellemző homeotikus transzformációkat mutatnak. A homo-, és transz-heterozigóta harmadik stádiumú lárvákban erősen megnövekszik a vérsejtek száma. A különböző allél-kombinációkban háromtól akár tízszeres sejtszám növekedés történik. A homozigóta mutáns kombinációk egy részében a lárvák némelyikében a normálisnál nagyobb lymph gland-et találtunk. Általában jellemző viszont a szesszilis szövetben lévő sejtek számának erős megnövekedése. Azt tapasztaltuk, hogy a mutáns lárvákban a keringésben megemelkedik a speciális ellenanyaggal kimutatható kristálysejtek száma, ezzel párhuzamosan a kutikulához belülről kitapadt kristálysejtek száma viszont egyértelműen csökken. Különleges fenotípusként a Pis mutáns kombinációkban immunstimuláció nélkül is nagy

mennyiségben jelennek meg lamellociták. Van olyan Pis mutáció (Pis110), amely dominánsan, heterozygóta állapotban is képes lamellocita differenciálódást kiváltani. 3.2. Genomszintű funkcióvesztéses screent kezdtünk a vérsejtek differenciálódását szabályozó faktorok azonosítására. A kísérletéhez a NIG-Fly (National Institute of Genetics, Japan): RNAi Fly Stock Center által forgalmazott törzsgyűjteményt használjuk egy vérsejtspecifikus meghajtóelemet hordozó törzzsel kombinációban. A screen során eddig 2600 törzset kereszteztünk és elemeztünk az eddigi eredményeink szerint tíz, valamelyik vérsejtkompartmentum fenotípusát érintő gént találtunk, melyeket a következő táblázatban mutatunk be. Törzs Gén A szesszilis szövet fenotípusa száma 6476R-1 Su(var) 3-9; Suppresor of sejtszám növekedés variegation 6413R-3 Dis 3 sejtszám növekedés 6238R-4 ssh; slingshot keringő sejtek száma megnövekedett 6474R-1 e(y)1; enhancer of yellow sejtszám csökkenés 6452R-4 TwdlO; tweedle O sejtszám csökkenés 6233R-1 Ufd1-like; Ubiquitin fusion sejtszám csökkenés degradation 1-like 16720R-2 5HT 1A, serotonin receptor sejtszám csökkenés 1A 6620R-2 ial; Ipll-aurora like kinase sejtszám csökkenés és nagyméretű sejtek 9774R-1 rok; Rho kinase sejtszám csökkenés és nagyméretű sejtek x NimC1 homológ A szesszilis szövet szerkezete felbomlik, a keringésben nincsenek lamellociták A gének további jellemzése folyamatban van. Az alábbi képek mutatják be a két legmarkánsabb fenotipust, amelyet a szesszilis szövet elbomlása jellemez, immunstimuláció hiányában is.

Ad 4.: 4.1. A Drosophila lárvák vérsejtjeinek immunfestése (Kurucz et al. Acta Biol. Hungarica) valamint a korábban azonosított Hemse gén regulátor régiójának felhasználásával általunk létrehozott HeGAL4-UAS-GFP konstrukttal (Zettervall et al, PNAS) végzett kísérletek abba az irányba mutattak, hogy a lárvában létezik egy eddig nem azonosított, funkcióját tekintve egységesnek mondható vérsejt-kompartmentum, mely a lárva poszterior régiójában, a subepiteliális szövetrétegben helyezkedik el. A kompartmentum fejlődése a poszterior spirákulumok mellett elhelyezkedő sejtcsomókból (általunk poszterior vérképző szövetnek elnevezett Posterior Hematopoietic Tissue) indul és anterior irányba terjed. A kompartmentum szerkezete immunstimulációt követően felbomlik és a keringésben lamellociták jelennek meg. A poszterior vérképző szövet sejtjeivel történt immunizálást követően előállított panel elemzése folyamatban van, azonban már azonosítottunk olyan markereket, amelyek az érett vérsejteken vannak jelen, sőt egyesek kizárólag a lamellocitákon. Mindez azt sejteti, hogy a lamellociták előalakjai az eddigi feltételezésekkel ellentétben nem a központi nyirokszervből, hanem ebből a kompartmentumból származnak. Ezt a feltételezésünket a későbbiek során több kísérleti rendszerben igazoltuk (Mákus és mtsi. PNAS, 2009) Ad 5.: 5.1. A Drosophila antigének feltételezett gerinces megfelelőit vizsgáltuk in silico módszerekkel. Következtetések levonásához kísérletes munkára van szükség, melyet hazai együttműködés keretében tervezünk.

Megjegyzés: Az általunk azonosított markereket a Drosophila vérsejt-differenciálódását és funkcióit vizsgáló laboratóriumokban rutinszerűen használják (eddig 314 reagens mintát küldtünk).