H 2 N CH COOH - H 2 O + + H 2 N CH CO HN CH COOH Q NH CH C NH 2 CH C OQ 2 -HX NH CH COOQ 2 NH CH COOH

Hasonló dokumentumok
9. Szilárdfázisú szintézisek. oligopeptidek, oligonukleotidok

9. Előadás. Peptidek,fehérjék

9. Szilárdfázisú szintézisek. oligopeptidek, oligonukleotidok

Peptidek (savamidok) szintézise. feladat: a szintéziskor elvben csak egy mól vizet kell elvonni peptidkötésenként, ám az ördög a részletekben rejlik.

Aminosavak általános képlete NH 2. Csoportosítás: R oldallánc szerkezete alapján: Semleges. Esszenciális aminosavak

Szilárd fázisú peptidszintézis polisztirol-divinilbenzol gyantán


CHO CH 2 H 2 H HO H H O H OH OH OH H

A bórsavtól a lipofil karboránt tartalmazó peptidomimetikumokig

A fehérjék hierarchikus szerkezete

Több oxigéntartalmú funkciós csoportot tartalmazó vegyületek

MEDICINÁLIS ALAPISMERETEK AZ ÉLŐ SZERVEZETEK KÉMIAI ÉPÍTŐKÖVEI AZ AMINOSAVAK ÉS FEHÉRJÉK 1. kulcsszó cím: Aminosavak

AMINOK. Aminok rendűsége és típusai. Levezetés. Elnevezés. Alkaloidok (fiziológiailag aktív vegyületek) A. k a. primer RNH 2. szekunder R 2 NH NH 3

Mez Gábor. Peptidkémia

Oligo- és polipeptidek:

Szerves Kémiai Problémamegoldó Verseny

Transzláció. Szintetikus folyamatok Energiájának 90%-a

Szerves Kémiai Problémamegoldó Verseny

Biológiailag aktív peptidek oldékonyságának növelése oligoetilénglikol származékokkal

Versenyző rajtszáma: 1. feladat

HALOGÉNEZETT SZÉNHIDROGÉNEK

ALKOHOLOK ÉS SZÁRMAZÉKAIK

2. SZÉNSAVSZÁRMAZÉKOK. Szénsav: H 2 CO 3 Vízvesztéssel szén-dioxiddá alakul, a szén-dioxid a szénsav valódi anhidridje.

KARBONSAVAK. A) Nyílt láncú telített monokarbonsavak (zsírsavak) O OH. karboxilcsoport. Példák. pl. metánsav, etánsav, propánsav...

ACO burkolható fedlapok. ACO műszaki katalógus ACO Burkolható fedlapok UNIFACE PAVING SOLID

Új szintézis stratégia kidolgozása a szilárdfázisú peptidszintézisben

Nitrogéntartalmú szerves vegyületek. 6. előadás

Oligo- és polipeptidek:

1. feladat (3 pont) Írjon példát olyan aminosav-párokra, amelyek részt vehetnek a következő kölcsönhatásokban

CH 2 =CH-CH 2 -S-S-CH 2 -CH=CH 2

szerotonin idegi mûködésben szerpet játszó vegyület

9. Előadás. Fehérjék

KARBONSAV-SZÁRMAZÉKOK

AROMÁS SZÉNHIDROGÉNEK

IV. Elektrofil addíció

A fehérjék hierarchikus szerkezete

Fág könyvtárból kiválasztott peptidek alkalmazása irányító molekulaként a célzott tumorterápiában

Biológiailag aktív peptidek oldékonyságának növelése oligoetilénglikol származékokkal

Doktori (Ph.D.) értekezés tézisei N-PEPTID-6-AMINO-D-LUCIFERIN KONJUGÁTUMOK OPTIMALIZÁLT SZINTÉZISMÓDSZEREI ÉS BIOLÓGIAI FELHASZNÁLÁSUK

Szemináriumi feladatok (alap) I. félév

Helyettesített karbonsavak

Szemináriumi feladatok (alap) I. félév

Az enzimek katalitikus aktivitású fehérjék. Jellemzőik: bonyolult szerkezet, nagy molekulatömeg, kolloidális sajátságok, alakváltozás, polaritás.

Alzheimer-kór diagnosztikájára alkalmas β-amiloid epitóp peptidet tartalmazó konjugátumok szintézise

Intra- és intermolekuláris reakciók összehasonlítása

Szerződéses kutatások/contract research

Helyettesített Szénhidrogének

Aminosavak, peptidek, fehérjék. Szerkezet, előállítás, kémiai tulajdonság

Aminosavak, peptidek, fehérjék

ZÁRÓJELENTÉS. OAc. COOMe. N Br

A fehérjék harmadlagos vagy térszerkezete. Még a globuláris fehérjék térszerkezete is sokféle lehet.

1. feladat. Versenyző rajtszáma: Mely vegyületek aromásak az alábbiak közül?

MÓDOSÍTOTT PEPTIDEK SZINTÉZISE DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI. Szolomájer-Csikós Orsolya. Témavezető: Prof. Dr. Tóth Gábor K. intézetvezető egyetemi tanár

Név: Pontszám: 1. feladat (3 pont) Írjon példát olyan aminosav-párokra, amelyek részt vehetnek a következő kölcsönhatásokban

Peptidek LC-MS/MS karakterisztikájának javítása fluoros kémiai módosítással, proteomikai alkalmazásokhoz

Tumorellenes hatóanyagok irányított célbajuttatása peptidekkel

AMINOKARBONILEZÉS ALKALMAZÁSA ÚJ SZTERÁNVÁZAS VEGYÜLETEK SZINTÉZISÉBEN

3. Sejtalkotó molekulák III. Fehérjék, enzimműködés, fehérjeszintézis (transzkripció, transzláció, poszt szintetikus módosítások)

Célcsoportok. + Ser, -NH 2. + (N-glikozid) α(n), Lys. etanol amin. + Ser, -COOH/-PO(OH) 2 Glu, Asp. zsírsavak. + primer, szekunder (O-glikozid)

AMINOSAVAK, PEPTIDEK, FEHÉRJÉK

3. Sejtalkotó molekulák III.

Szerves kémiai szintézismódszerek

Szerves kémiai szintézismódszerek

Szerves kémiai szintézismódszerek

Zárójelentés a Sonogashira reakció vizsgálata című 48657sz. OTKA Posztdoktori pályázathoz. Novák Zoltán, PhD.

OXOVEGYÜLETEK. Levezetés. Elnevezés O CH 2. O R C H aldehid. O R C R' keton. Aldehidek. propán. karbaldehid CH 3 CH 2 CH 2 CH O. butánal butiraldehid

Vajsavval módosított GnRH-I és GnRH-II hatóanyag konjugátumok szintézise és in vitro tumorellenes hatásuk vizsgálata

Hemoglobin - myoglobin. Konzultációs e-tananyag Szikla Károly

Új alternatív módszer fenol származékok vizsgálatára felszíni és felszín alatti víz mintákban

1. feladat. Versenyző rajtszáma:

A sejtek élete. 5. Robotoló törpék és óriások Az aminosavak és fehérjék R C NH 2. C COOH 5.1. A fehérjeépítőaminosavak általános

KOVÁCS Anita Kármen PhD hallgató, Dr. HETÉNYI Anasztázia egyetemi tanársegéd, Prof. Dr. TÓTH Gábor egyetemi tanár

A glükóz reszintézise.

Szénhidrogének III: Alkinok. 3. előadás

Opioid peptidanalógok szintézise szerkezet-hatás összefüggések vizsgálatára

Kutatási programunk fő célkitűzése, az 2 -plazmin inhibitornak ( 2. PI) és az aktivált. XIII-as faktor (FXIIIa) közötti interakció felderítése az 2

Aminosavak, peptidek, fehérjék

Részletes tematika: I. Félév: 1. Hét (4 óra): 2. hét (4 óra): 3. hét (4 óra): 4. hét (4 óra):

Sipos Ferenc. Új PNS oligomerek és P-királis mononukleotidok szintézise és szerkezetvizsgálata. Doktori (Ph.D.) értekezés

Tienamicin-analóg 2-izoxacefémvázas vegyületek sztereoszelektív szintézise

Fág könyvtárból kiválasztott irányító peptid szerkezetének optimálása célzott tumorterápiához

Szintetikus antigének és tumorellenes hatású biokonjugátumok szintézise és vizsgálata

transzláció DNS RNS Fehérje A fehérjék jelenléte nélkülözhetetlen minden sejt számára: enzimek, szerkezeti fehérjék, transzportfehérjék

Fémorganikus vegyületek

Szabó Andrea. Ph.D. értekezés tézisei. Témavezető: Dr. Petneházy Imre Konzulens: Dr. Jászay M. Zsuzsa

Toluol (Bruckner II/1 476) µ= 0.33 Debye

Modellpeptidek szintézise Hg(II) ion által katalizált bomlás vizsgálatához

Szerves Kémia II. Dr. Patonay Tamás egyetemi tanár E 405 Tel:

O 2 R-H 2 C-OH R-H 2 C-O-CH 2 -R R-HC=O

O S O. a konfiguráció nem változik O C CH 3 O

Ciklohexán alapú molekuláris triskelionok szintézise és jellemzése

Phenotype. Genotype. It is like any other experiment! What is a bioinformatics experiment? Remember the Goal. Infectious Disease Paradigm

Új szintézis stratégia kidolgozása a szilárdfázisú peptidszintézisben

1. Gyakorlat: Telepítés: Windows Server 2008 R2 Enterprise, Core, Windows 7

Osztályozó vizsgatételek. Kémia - 9. évfolyam - I. félév

Bevezetés a biokémiába fogorvostan hallgatóknak Munkafüzet 4. hét

Bioinformatika előad

HORDOZÓS KATALIZÁTOROK VIZSGÁLATA SZERVES KÉMIAI REAKCIÓKBAN

124 Dust-proof for block. Kocsi porvédelme

KARBONSAVSZÁRMAZÉKOK

Átírás:

8. Előadás Peptidek

Peptid szintézis: a koncepció 1. Probléma 2 2 ' - 2 2, 2 2 2, ' ' Keverék, alacsony konverzió 2. Megoldás Q X 2 ' Q 2 -X Q Q 2 2 ' ' Egyféle termék, magas konverzió 3. Követelmények 3.1. Védőcsoportok, egyszerű beépítés, egyszerű eltávolítás 3.2. atékony kapcsolási reakció

égy lépés 4.1. Védett (-, - és oldallánc) aminosavszármazékok 2 2 ' Q 2 Q ' 4.2. A -terminálison aktivált aminosavszármazék szintézise vagy 2 ' Q X 4.3. Kapcsolás Q Q vagy Q ' ' 4.4. Védőcsoportok eltávolítása 2 '

1. Védőcsoportok All modern work in Peptide synthesis employs the following approach: the amino group of one amino acid is first stabilized by the introduction of a protecting group, the carboxy group is modified so that it is capable of coupling, and finally the group is removed to produce the finished peptide. The difficulty lies in finding a suitable group, which can be removed so gently that the peptide is not significantly attacked. Bergman, M., Zervas, L.: Berichte hem. 65, 1192 (1932) soportosítás 1. α - védőcsoport 2. α - védőcsoport 3. ldallánc védőcsoport

1.1.1. Benziloxi-karbonil (Z) Bergman, M., Zervas, L. : Berichte hem. 65,1192 (1932) 1.1. α -Amino csoport védelme Beépítés 2 l 2 -l 2 Benziloxikarbonil klorid Benziloxikarbonil aminosav Eltávolítás sav bázis 2 /kat Br Lewis sav (Me 3 SiI) 2 2 2 Br 2 2 I 2 2

asítási mechanizmus Benziloxi-karbonil (a) 2 Br 2 2 2 (b) Me3 SiI (Lewis sav) (a) Br Me (b) 2 I SiMe 3 Me 2 2 Me 3 SiMe

1.1.2. t-butiloxi-karbonil (Boc) arpino, L.A. et al. JAS (1957) Beépítés 3 3 3 3 2 3 3 3 terc-butiloxikarbonil azid 3 terc-butiloxikarbonil aminosav Eltávolítás 2 /kat TFA bázis 2 3 3 2 2

asítási mechanizmus terc-butyloxycarbonyl 3 (Boc) 3 3 3 3 2 2 3 3 3 3 ( 3 ) 3 3 2 3

1.1.3. 9-Fluorenilmetoxi-karbonil arpino, L.A. et al. JAS 92, 5748 (1970) Beépítés 2 l 2 -l 2 ' ' Eltávolítás részleges 2 /kat sav bázis (20% piperidin/dmf) 2 2 2 '

asítási mechanizmus 9-Fluorenilmetiloxikarbonil (Fmoc) 2-2 2 2-2

Észter kötés kialakítása 1.2. Karboxi védelem Beépítés 2 l 2 2-2 -l 2 2 2 Eltávolítás 2 /kat. sav (F) bázis (pl. 3 ) 2 2 2 F 2 2 2

1.3. ldallánc védelem 1.3.1. Glu, Asp 1.3.2. Lys 1.3.3. Ser, Thr, Tyr 1.3.4. Arg 1.3.5. is 1.3.6. Trp 1.3.7. ys

- védőcsoport 2 Benzil(éter) (Bzl) 3 3 Eltávolítás 3 terc-butil (éter) (t-bu) Tritil* (Trt) 2 2 * csak Ser/Thr

-S védőcsoport Eltávolítás Tritil (Trt) I I - I S S Trt S S Trt I S redukció S (erős sav)

Imidazol védőcsoport 2 π τ (τ) 3 3 Tritil (Trt) 4-Metiltritil (Mtt) 4-Metoxitritil (Mmt)

Guanidino védőcsoport 3 3 3 3 3 S 2 S 2 4-Toluolszulfonil* (Tos) * F vagy a/ 3 4-Metoxi-2,3,6-trimetilbenzolszulfonil (Mtr)

Eltávolítás 3 3 2 S 3 TFA 2 2 S 3 3 3 2 S 3 2 3 elektrofil

Az optimális védőcsoport összegzés 1. Könnyű és hatékony beépülés. 2. A peptidkötés érintetlensége a beépítés/eltávolítás alatt. 3. Több mint egyféle eltávolítási lehetőség. 4. incs racemizáció. 5. A melléktermékek egyszerű és könnyű eltávolítása. 6. A reakciók szobahőmérsékleten menjenek végbe.

2. lépés: Az aminosav aktiválása 2.1. A karbonsav származékok aktivitása > > > > > l 3 ' 2

2.2. A karbonsav származékok aktiválása 2.2.1. Acil azid (T. urtius, Berichte hem. 35, 3226,1902) Q ' 2 2 a 2 -, - Q 2 Q 3 2.2.2. Actív észter (M. Bodanszky, ature, 175, 685, 1955; J. Kovacs, JAS, 89, 183, 1967; L. Kisfaludy, Liebigs Ann. 1421, 1973) 2 l l Q l F l F l Q 2 F F F

2.2.3. Anhidrid (vegyes) (E. Fischer, Berichte hem. 36, 2094,1903; T. Wieland, Liebigs Ann. 569, 122, 1950) ' Q - 2 ' Q 2.2.4. Anhidrid (szimmetrikus) (F. Weygand et al., Z. aturf. 22, 1084, 1967) ' ' Q Q - 2 ' ' Q Q

2.2.5. Karbodiimid (J.. Sheenan, G.P. ess, JAS, 77, 1067, 1955) Q Q D

3. lépés: A peptidkötés kialakítása 3.1. Acil azid (nincs racemizáció) 2 ' ' ' 3 3.2. Aktív észter (S ) 2 ' - 6 5 '

3.3. Anhidrid szimmetrikus 2 '' '' - aszimmetrikus δ 2 '' '- ' '' Térgátlás

3.4. Karbodiimid δ közvetlen -acilizourea közvetett 2 2 2 anhidrid 2 2 2

acemizáció Az enantiomer átalakulása enantiomer keverékké sp 3 - bázis sp 2 L D

A racemizáció mechanizmusa B a: direkt enolizáció α X - B X X B b: oxazolon képződés* α.. X - B X - X - α.. X X * :B nélkül : iniciálja a reakciót

Poláros fény

A racemizáció és a kormeghatározás alál után alál után

Stratégiák: Szegmens kondenzáció Q - -X Q, 2 Q - -X - Q, 2 Q - - Q, Q - - Q, észleges hasítás / aktiválás észleges hasítás Prot - -X Q, 2 Q - Q, asítás 2

A) -terminálison Stratégiák: Lépésenkénti hosszabbítás Q - -X 2 Q, Q - Q, észleges hasítás / aktiválás Q - -X 2 Q, Q - Q, etc. B) -terminálison Q - -X 2 -Q, Q - -Q, -terminalis hasítás Q - -X 2 -Q, etc.

There is a need for rapid, quantitative, automatic method for the synthesis of long peptides. A possible approach may be the use of chromatographic columns, where the peptide is attached to the polymer packing and added to an activated amino acid followed by removal of protecting group, with repetition of the process until the desire peptide is built up. Finally the peptide must be removed from the supporting medium..b.merrifield Laboratory note book (1959) JAS 85, 2149 (1963) Bruce. Merrifield

A szilárd fázisú peptidszintézis elve Funkcionalizálás Módosítás Gyanta X Gyanta. Gyanta Kapcsolás 2 S S asítás, tisztítás. Gyanta Láncnövekedés élpeptid...... Gyanta

A szilárd fázisú peptid szintézis főbb szempontjai A. A szilárd felszín 1. Tartalmazzon reaktív csoportokat funkcionalizálásra 2. Peptid-polimer kötés hasítható legyen 3. Stabil legyen a szintézis körülményei között 4. A peptidlánc hozzáférhető legyen az oldószer és a reagensek számára B. Védőcsoport kombinációk 1. Peptid-polimer kötés stabil legyen a szintézis alatt 2. Átmeneti védőcsoport az α-amino csoporton 3. Állandó védőcsoport az oldalláncokon 4. atékony hasítás.

Védőcsoport típusok a szilárd fázisú szintézisben a b c a. α - védőcsoport ( átmeneti") b. ldallánc védőcsoportok ( állandó") c. Gyanta-peptid kötés

Boc/benzil stratégia - Merrifield módszer 3 3 3-2 2 P közepesen savérzékeny (TFA / 2 l 2 ) Erős savakra érzékeny (F, TFMSA) Fmoc/t-butil stratégia - Sheppard módszer - 2 2 P 2 Bázisra érzékeny (piperidin / DMF) 3 3 3 TFA érzékeny

Lineáris szintézis Anchoring of first amino acid X α Deprotection Amino acid coupling 2 X X α Deprotection 2 X Amino acid coupling epetitive cycles of α deprotection and amino acid coupling X esin-bound fully protected peptide X Acidolysis Free peptide 2 X X= for peptide acids X= for peptide amides

Konvergens szintézis Detachment of protected peptide segment from resin, and purification 2 Segment coupling on a solid support 2 Fully protected peptide on solid support Free peptide 2

Szilárd fázisú peptid szintézis: Összegzés Functionalized polymer Solid phase peptide synthesis Fully protected peptide-resin deprotection haracterization AAA PL PE enzyme digestion MS Purified peptide purification (control by PL, AAA, etc.) * rude free peptide peptide-resin cleavage Mit találhatunk a szintézis nyers termékében? The desired peptide (!) Peptide Wrong peptides Terminated Ac-DEFGIK Ac-IK Deleted ABDEFIK (minus G) ABDFGIK (minus E) ABEFGIK (minus D) ADEFGIK (minus B) on-peptide Deprotection scavengers Protecting group derivatives Anything else... Incompletely deprotected peptide products

Szintézis formák Multiple Keverék Párhuzamos Kombinatorikus vegyület tárak T-bag szintézis Tűhegy módszer Folt szintézis (1988) Fotolitográfia/csip

Kombinatorikus szintézis: keverés-osztás elv T- Furka et al. Int. J.Pept. Prot. es. (1991) 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 A D E F G I K L M P Q S T V W Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 X 1 T- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 A D E F G I K L M P Q S T V W Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 X 2 X 1 T - X 2 X 1 T

A TX 1 TX 2 T peptidtár kombinatorikus szintézise T- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 A D E F G I K L M P Q S T V W Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 X 2 T- T TX 2 T- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 A D E F G I K L M P Q S T V W 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 T T T T T T T T T T T T T T T T T T Y T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T X X X X X X X X X X X X X X X X X X X T T T T T T T T T T T T T T T T T T T A D E F G I K L M P Q S T V W Y T T T T T T T T T T T T T T T T T T T 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2

A TQTX 2 T alpeptid tárak szintézise T- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 A D E F G I K L M P Q S T V W 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 T T T T T T T T T T T T T T T T T T 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T A D E F G I K L M P Q S T V W Y T T T T T T T T T T T T T T T T T T T Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q Q T T T T T T T T T T T T T T T T T T T Y T Q T

Folt (spot) peptidszintézis

Alkalmazások

éhány fontos peptid 2 2 2 2 Karnozin (-b-alanilhisztidin) Glutation Glu Izolálás: 1921 opkins ys-gly Szerkezet: 1930 Szintézis: 1935 γ-l-glutamil-l-ciszteinil-glicin isztin isztein xitocin ys-tyr-ile-gln-asn-ys-pro-leu-gly- 2 Peptidhormon: tejelválasztás, uterus kontrakció Szerkezet: 1953 Duvigneaud (obel díj 1955) Szintézis: 1954 Duvigneau Vazopresszin ys-tyr-phe-gln-asn-ys-pro-lys-gly- 2 Vérnyomás szabályozása, Duvigneau

Inzulin asnyálmirigy hormonja A lánc B-lánc 1 6-7 11 20-21 1 7 19 30 Izolálás: 1922 Banting Primer Szerkezet: 1953 Sanger Szintézis: 1969 Zahn, Wang, Katsoyannis Térszerkezet: 1965 odgkin AT 39 aminosav Sertés: szintézis Schwitzer, 1963 umán: szintézis Bajusz, Kisfaludy, Medzihradszky 1971