SZAKMAI ZÁRÓJELENTÉS AZ NKTH-OTKA H07-B ES SZÁMÚ PROJEKTHEZ

Hasonló dokumentumok
Ragyogó molekulák: dióhéjban a fluoreszcenciáról és biológiai alkalmazásairól

Bioortogonális jelzésre alkalmas azid tartalmú fluorogén jelzővegyületek tervezése, előállítása és tesztelése

8. A kémiai biológia alapfogalmai. Jelzések bevitele, Bioortogonalitás. Stop kodon szupresszió

Zárójelentés a Sonogashira reakció vizsgálata című 48657sz. OTKA Posztdoktori pályázathoz. Novák Zoltán, PhD.

Proteinchip technológia - alkalmazások

PANNON EGYETEM. Rézkatalizált azid-alkin cikloaddíció: szintézis és katalizátorfejlesztés. A PhD értekezés tézisei

Speciális fluoreszcencia spektroszkópiai módszerek

Összefoglalók Kémia BSc 2012/2013 I. félév

ALKÍMIA MA Az anyagról mai szemmel, a régiek megszállottságával.

Kutatási programunk fő célkitűzése, az 2 -plazmin inhibitornak ( 2. PI) és az aktivált. XIII-as faktor (FXIIIa) közötti interakció felderítése az 2

Bioortogonális jelzésre alkalmas azid tartalmú fluorogén jelzővegyületek tervezése, előállítása és tesztelése

Fluoreszcencia módszerek (Kioltás, Anizotrópia, FRET)

Molekuláris biológiai eljárások alkalmazása a GMO analitikában és az élelmiszerbiztonság területén

Szerves Kémiai Problémamegoldó Verseny

Szerves Kémiai Problémamegoldó Verseny

transzporter fehérjék /ioncsatornák

Bevezetés a fluoreszcenciába

AMINOKARBONILEZÉS ALKALMAZÁSA ÚJ SZTERÁNVÁZAS VEGYÜLETEK SZINTÉZISÉBEN

Az áramlási citométer és sejtszorter felépítése és működése, diagnosztikai alkalmazásai

Klórbenzol lebontásának vizsgálata termikus rádiófrekvenciás plazmában

Fluoreszcencia módszerek (Kioltás, Anizotrópia, FRET) Modern Biofizikai Kutatási Módszerek

Bioortogonális jelzésre alkalmas kémiai hírvivők és fluoreszcens jelzővegyületek szintézise és alkalmazása

VILÁGÍTÓ GYÓGYHATÁSÚ ALKALOIDOK

A projekt rövidítve: NANOSTER A projekt időtartama: október december

Abszorpció, emlékeztetõ

Anaerob fermentált szennyvíziszap jellemzése enzimaktivitás-mérésekkel

Fluoreszcencia 2. (Kioltás, Anizotrópia, FRET)

Világító molekulák: Új típusú, szolvatokróm fluorofórok előállítása, vizsgálata és alkalmazásaik

ALKÍMIA MA Az anyagról mai szemmel, a régiek megszállottságával.

Alkinilezett kromonszármazékok előállítása Sonogashira reakcióval

HIDROFIL HÉJ KIALAKÍTÁSA

A KÉMIA ÚJABB EREDMÉNYEI

Biomolekuláris nanotechnológia. Vonderviszt Ferenc PE MÜKKI Bio-Nanorendszerek Laboratórium

A projekt rövidítve: NANOSTER A projekt idıtartama: október december

Proteinchip technológia - alkalmazások

1. Egyetértek Professzor asszony azon véleményével, hogy sok esetben az ábrák tömörítése a

6. Fehérjék kimutatása. Biokémiai és sejtszintű vizsgálatok

Korszerű tömegspektrometria a. Szabó Pál MTA Kémiai Kutatóközpont

Dr. JUVANCZ ZOLTÁN Óbudai Egyetem Dr. FENYVESI ÉVA CycloLab Kft

Módszer az ASEA-ban található reaktív molekulák ellenőrzésére

Az ellenanyagok orvosbiológiai. PhD kurzus 2011/2012 II. félév

EGYSEJTŰ REAKTOROK BIOKATALÍZIS:

1. feladat. Versenyző rajtszáma: Mely vegyületek aromásak az alábbiak közül?

Áramlási citometria, sejtszeparációs technikák. Immunológiai és Biotechnológiai Intézet ÁOK, PTE

OPTIKA. Fénykibocsátás mechanizmusa fényforrás típusok. Dr. Seres István

Peptidek LC-MS/MS karakterisztikájának javítása fluoros kémiai módosítással, proteomikai alkalmazásokhoz

Bioinformatika előad

Szerves oldott anyagok molekuláris spektroszkópiájának alapjai

NEHÉZFÉMEK ELTÁVOLÍTÁSA IPARI SZENNYVIZEKBŐL Modell kísérletek Cr(VI) alkalmazásával növényi hulladékokból nyert aktív szénen

PhD értekezés tézisei. Funkcionalizált β-aminosavak szintézisei gyűrűnyitó/keresztmetatézis reakcióval. Kardos Márton

Több oxigéntartalmú funkciós csoportot tartalmazó vegyületek

Bioortogonális jelölésre alkalmas fluoreszcens jelölőmolekulák előállítása és vizsgálata

HORDOZÓS KATALIZÁTOROK VIZSGÁLATA SZERVES KÉMIAI REAKCIÓKBAN

Mikrobiológiai üzemanyagcellák szervesanyag-eliminációs hatékonyságának vizsgálata

Fluorozott ruténium tartalmú katalizátorok előállítása és alkalmazása transzfer-hidrogénezési reakciókban

ZÁRÓJELENTÉS. OAc. COOMe. N Br

Mikrobiológiai üzemanyagcella alapvető folyamatainak vázlata. Két cellás H-típusú MFC

Kondenzált piridazinszármazékok funkcionalizálása és ligandumként való alkalmazása

Ciklodextrinek alkalmazási lehetőségei kolloid diszperz rendszerekben

1. feladat. Versenyző rajtszáma:




Királis aminoalkil-foszfin ligandumok platina(ii)- komplexeinek koordinációs kémiai vizsgálata

9. Szilárdfázisú szintézisek. oligopeptidek, oligonukleotidok

Funkcionalizált, biciklusos heterociklusok átalakításai sztereokontrollált gyűrűnyitó metatézissel

9. Szilárdfázisú szintézisek. oligopeptidek, oligonukleotidok

6. Fehérjék kimutatása. Biokémiai és sejtszintű vizsgálatok

SZERVES KÉMIAI REAKCIÓEGYENLETEK

szerotonin idegi mûködésben szerpet játszó vegyület

K68464 OTKA pályázat szakmai zárójelentés

Szabó Andrea. Ph.D. értekezés tézisei. Témavezető: Dr. Petneházy Imre Konzulens: Dr. Jászay M. Zsuzsa

A sejtek élete. 5. Robotoló törpék és óriások Az aminosavak és fehérjék R C NH 2. C COOH 5.1. A fehérjeépítőaminosavak általános

Hatóanyag-peptid konjugátumok szintézise, jellemzése és biológiai aktivitásának vizsgálata glióma kultúrákon

I. Bevezetés. II. Célkitűzések

Tartalmi követelmények kémia tantárgyból az érettségin K Ö Z É P S Z I N T

Zöld Kémiai Laboratóriumi Gyakorlatok. Oxidatív alkin kapcsolás

A MASP-1 dózis-függő módon vazorelaxációt. okoz egér aortában

C-GLIKOZIL HETEROCIKLUSOK ELŐÁLLÍTÁSA GLIKOGÉN FOSZFORILÁZ GÁTLÁSÁRA. Kun Sándor. Témavezető: Dr. Somsák László

Fluorogén azido-benztiazol származékok szintézise

Vezető kutató: Farkas Viktor OTKA azonosító: típus: PD

Adszorbeálható szerves halogén vegyületek kimutatása környezeti mintákból

,:/ " \ OH OH OH / \ O / H / H HO-CH, O, CH CH - OH ,\ / "CH - ~(H CH,-OH \OH. ,-\ ce/luló z 5zer.~ezere

Aminoflavon származékok, valamint flavon-aminosav hibridek előállítása Buchwald-Hartwig reakcióval. Pajtás Dávid

A Proteomika Szolgáltató Laboratóriumban elérhető szolgáltatások

Biokatalitikus Baeyer-Villiger oxidációk Doktori (PhD) értekezés tézisei. Muskotál Adél. Dr. Vonderviszt Ferenc

A PÁLINKÁK ETIL-KARBAMÁT TARTALMÁNAK ÉLELMISZERBIZTONSÁGI KOCKÁZATAI

6. Fehérjék kimutatása. Biokémiai és sejtszintű vizsgálatok

A GAMMA-VALEROLAKTON ELŐÁLLÍTÁSA

A hiperspektrális távérzékelés lehetőségei a precíziós mezőgazdaságban. Keller Boglárka Tudományos segédmunkatárs NAIK MGI

Lehetőségek a tumorspecifikus irányító peptidek hatékonyságának növelésére

FEHÉRJÉK A MÁGNESEKBEN. Bodor Andrea ELTE, Szerkezeti Kémiai és Biológiai Laboratórium. Alkímia Ma, Budapest,

SZENNYVÍZKEZELÉS NAGYHATÉKONYSÁGÚ OXIDÁCIÓS ELJÁRÁSSAL

mintasepcifikus mikrokapilláris elektroforézis Lab-on-Chip elektroforézis / elektrokinetikus elven DNS, RNS, mirns 12, fehérje 10, sejtes minta 6

Új alternatív módszer fenol származékok vizsgálatára felszíni és felszín alatti víz mintákban

Áramlási citometria / 4. Immunológiai és Biotechnológiai Intézet PTE KK

Ciklohexán alapú molekuláris triskelionok szintézise és jellemzése

Aromás: 1, 3, 5, 6, 8, 9, 10, 11, 13, (14) Az azulén (14) szemiaromás rendszert alkot, mindkét választ (aromás, nem aromás) elfogadtuk.


Távérzékelés. Modern Technológiai eszközök a vadgazdálkodásban

Átírás:

SZAKMAI ZÁÓJELETÉS AZ KT-TKA 07-B-7491-ES SZÁMÚ PJEKTEZ 1. Szekvenciálisan jelölhető enzimszubsztrátok A kutatás fő célja olyan mátrix-metalloproteináz enzim (MMP-) szubsztrátok előállítása volt, amelyek lehetővé teszik annak két fluoreszcens jelzővegyülettel való jelzését, Fluoreszcens ezonancia Energia Transzfer (FET) rendszerű szubsztrátok előállítása céljából. Ennek első lépéseként olyan peptid alapú enzimszubsztrátot készítettünk, melyet propargil-, és jódbenzol funkciós csoportokat tartalmazó, nem természetes aminosavakkal (propargil-glicin, jódtirozin) módosítottunk. Tervünk az volt, hogy az első azid-tartalmú jelzővegyületet Cu(I) katalizált azid-alkin 1,-dipoláris cikloaddícióval (ún. klikk reakcióval) vigyük be. Ezt követően az aril-jodid részen kivitelezett Sonogashira kapcsolással újabb acetiléncsoportot alakítsunk ki, majd a második jelzést az első jelzővegyülethez hasonlóan kapcsoljuk. Az ily módon kivitelezett, egy üstben szekvenciálisan végrehajtott Sonogashira-Klikk reakciósort modellvegyületeken teszteltük, és a jó hozamok fényében úgy ítéltük meg, hogy ezen eljárás ígéretesnek tűnik biomolekulák kettős jelölésére (Lőrincz et al, Synthesis 009, 57 5). Elgondolásunk működött is, sajnos azonban igen alacsony hozammal eredményezte a kettősen jelölt peptidet. Alternatív megoldásként a terminális acetilének és ciklooktinok reaktivitásbeli különbségét terveztük kiaknázni. Tudniillik, míg a terminális acetilének szobahőmérsékleten csak rézionok jelenlétében reagálnak azido csoport tartalmú vegyületekkel, addig a ciklooktinok a gyűrűfeszültség miatt nem igényelnek katalizátort. CyC CyC-Ala-PrGly- A Pep1 Et 1 CyC-Gly-Pro-Leu-Gly-Val-Arg-PrGly- Pep CyC: PrGly: C Et 1. Ábra. Szekvenciálisan jelölhető peptidek és az alkalmazott jelzővegyületek.

Fluorescence intensity / A.U. Előállítottunk tehát olyan szubsztrát-szekvenciát, melybe propargil-glicint, mint terminális acetilént tartalmazó aminosavat építettünk, illetve -terminálisát ciklooktintartalmú karbonsavszármazékkal acileztük (1. Ábra). Ezen elgondolásunk beváltotta a hozzáfűzött reményeket. Sikerrel valósítottuk meg az ily módon módosított szubsztrát kettős jelölését szekvenciális módon. Az első azidtartalmú fluorofórt a ciklooktinhoz kötöttük, majd teljes konverziót követően réz (I) ionok jelenlétében reagáltattuk az acetiléncsoportot a második azidtartalmú jelzővegyülettel. Az eljárás hatékonyságát jól jelzik a két lépés után megfigyelhető magas hozamok (1. Táblázat). 1. Táblázat. Dual labeling of model compounds [a] Entry Model compound Label 1 Yield 1 Label Yield [%] [b,c] [%] [b,c] 1 Pep1 96 1 71 Pep1 98 7 Pep1 76 (66) - - 4 Pep >99 (8) 1 >99 (65) 5 Pep 98 (89) 95 (60) 6 Pep 78 (68) - - 7 Pep 98 96 [a] Click reactions in solution [b] Determined by integration of the PLC traces of the crude products at 0, 410 and 500 nm after 1 h [c] numbers in parentheses indicate isolated yields A kettősen jelölt enzimszubsztrátot ezt követően MMP- hatásának vetettük alá és követtük a fluoreszcens spektrum-beli változásokat. A mérési eredmények rámutattak, hogy az enzimatikus hidrolízis mértékével arányosan a FET kommunikáció a két fluorofór közt megszűnik (. Ábra). 6 8 7 6 4 0-1 h I 470 / I 60 5 4 0 00 400 600 800 1000 100 Time / min 0-1 h 0 450 500 550 600 650 700 750 wavelength / nm. Ábra. Spectral changes of -Pep- (1 M) in the presence of activated MMP- (4 nm) in TCB buffer at 7 C; inset: changes in the ratio of the monitored wavelengths

A módszer hatékonyságát egyéb rendszerek esetében is demonstráltuk. Így sikerrel valósítottuk meg egy fehérje kettős jelölését, illetve a peptidek kettős jelölését fluoreszcens szilika nanorészecskékkel és szerves fluorofórral (. Ábra). (Az eredményekről bővebben ld. Kele et al Angew. Chem. Int. Ed. 009, 48(),44-47) A FET alkyne modified BSA Cu(I) : CyC- : terminal alkyne B Pep1 FET azido-modified shell-doped silica nanoparticles Cu(I) : CyC- : terminal alkyne. Ábra. BSA kettős jelölése (A); Peptid kettős jelölése nanorészecskével és szerves fluorofórral (B). Ez utóbbi módszert sikerrel alkalmaztuk olyan MMP- szubsztráttal módosított fluoreszcens szilika nanorészecske kettős jelölésében, amellyel képesek voltunk az MMP- kimutatására igen kis koncentrációkban (1 M). (Az eredményekről bővebben ld. Achatz et al ChemBioChem 009, 10, 16-0).. Klikk reakcióban alkalmazható fluorofórok előállítása Munkánk egyik mellékágaként a kettős jelölésben alkalmazható, klikk reakcióba vihető fluorofórok számát kívántuk gyarapítani. Ezen kísérletek eredményeként egy sor azid, acetilén, vagy ciklooktin-tartalmú fluoreszcens vegyületet állítottunk elő, melyeket sikerrel alkalmaztunk úgy modellvegyületek, mint sejtek membránjának jelzésére. Különös jelentőséggel bírnak azon jelzővegyületeink, melyek a távoli vörös, közeli I tartományban gerjeszthetők, illetve emittálnak. Ezek alkalmazásával ugyanis kiküszöbölhető az élő szervezetek ún. autofluoreszcenciája (háttérfluoreszcencia) ezáltal még jobb jel/zaj arányt

eredményezve. Előállítottunk olyan fluorofórokat is melyek az ún. megastokes fluorofórok családjába tartoznak. Ezekre jellemző, hogy a gerjesztési és emisziós hullámhosszuk közti távolság (Stokes eltolódás) 100 nm feletti. Az ilyen fluorofórok alkalmazása különösen FET alkalmazásokban jelentős, mivel az egyes fluorofórok gerjesztési és emissziós sávjai jól elválnak, ezáltal nagyobb detektálási érzékenységet eredményeznek. (Az eredményekről bővebben ld. Kele et al rg. Biomol. Chem 009, 7, 486 490, illetve agy et al. Chem. Asian J. elfogadva.). S Et B F F Et Cl Cl 4 Bu S Bu S = a: C C b: C C C 4. Ábra. Klikkelhető fluorofórok és alkalmazásuk sejtek jelölésében

5. Ábra. Klikk-megaStokes festékek és alkalmazásuk.. Összefoglalás Az eredeti terveket sikerrel megvalósítottuk. A kezdeti nehézségeket (alacsony hozamú Sonogashira-Klikk szekvencia) megoldottuk oly módon, hogy kihasználtuk az acetilének és cikloalkinek eltérő reaktivitását. Az ily módon előállított peptideket sikeresen jelöltük magas hozammal két fluorofórral. Módszerünk általános használhatóságát egyéb példákon is bemutattuk. Ezen kívül előállítottunk számos klikk reakcióra alkalmas fluoreszcens jelzővegyületet is. Ezek közül különösen jelentősek azok az ún megastokes festékek amelyek a távoli vörös, közeli I tartományban emittálnak. Eredményeinkről a fent említett 5 folyóiratban (Angew. Chem. Int. Ed; rg. Biomol. Chem; Synthesis; ChemBioChem, Chem. Asian J.) adtunk számot, illetve részt vettünk az MTA eterociklusos Munkabizottsági ülésén Balatonszemesen, és a thods and Applications in Fluorescence (MAF) 11-ik kongresszusán Budapesten. Budapest, 009. november. Kele Péter egyetemi adjunktus