Intelligens orvosi műszerek VIMIA023

Hasonló dokumentumok
Mesterséges Intelligencia MI

Intelligens orvosi műszerek (VIMIA023) Gyakorló feladatok, megoldással (2016 ősz)

Diagnosztikus tesztek értékelése

Adatbányászati feladatgyűjtemény tehetséges hallgatók számára

Nagy adathalmazok labor

Módszertani áttekintés

Eredmények kiértékelése

Nagy adathalmazok labor

Mesterséges Intelligencia MI

Adatelemzés őszi félév ,26,27 1. Bevezetés 2. Osztályozás és klaszterezés feladata 3. Numpy és Ipython 4. Logisztikus regresszió

Diagnosztikus tesztek értékelése

LOGIT-REGRESSZIÓ a függő változó: névleges vagy sorrendi skála

Súlyos infekciók differenciálása a rendelőben. Dr. Fekete Ferenc Heim Pál Gyermekkórház Madarász utcai Gyermekkórháza

Kapcsolat vizsgálat II: kontingencia táblák jelentősége és használata az epidemiológiában, diagnosztikában: RR, OR. ROC analízis.

Dinamikus modellek szerkezete, SDG modellek

Adatbányászati, data science tevékenység projektmenedzsmentje

4. LECKE: DÖNTÉSI FÁK - OSZTÁLYOZÁS II. -- Előadás Döntési fák [Concepts Chapter 11]

Adatbányászati, data science tevékenység

Kabos: Statisztika II. ROC elemzések Szenzitivitás és specificitás a jelfeldolgozás. és ilyenkor riaszt. Máskor nem.

Alkalmazott Matematikai Lapok 32 (2015), SÜDY BARBARA. Az adatelemzés egyik legizgalmasabb ága a sportadatokohoz köthető prediktív

1. ábra: Magyarországi cégek megoszlása és kockázatossága 10-es Rating kategóriák szerint. Cégek megoszlása. Fizetésképtelenné válás valószínűsége

Csima Judit február 19.


Képfeldolgozás haladóknak Lovag Tamás Novák Gábor 2011

Id sorok elemzése adatbányászati módszerekkel

1. Adatok kiértékelése. 2. A feltételek megvizsgálása. 3. A hipotézis megfogalmazása

I S R G Gépi tanulás, neuronhálók

Új típusú döntési fa építés és annak alkalmazása többtényezős döntés területén

11.Négymezős táblázatok. Egyezés mérése: kappa statisztika Kockázat becslés: esélyhányados (OR) Kockázat becslés: relatív kockázat (RR)

Csima Judit február 26.

Laboratórium biomarkereknélkül nincs korszerű szívgyógyászat. Tomcsányi János Budai Irgalmasrendi Kórház Kardiológiai Osztály 2015.

GYORSTESZTEK ALKALMAZÁSA A

Intelligens orvosi műszerek (VIMIA023) Gyakorló feladatok a vizsgára 2015 Nem pontosan ezek lesznek a vizsgafeladatok, csak jellegükre hasonlók!

Klinikai és Bírósági Alkalmazások Valószínűségszámítási Modellek BREUER-LÁBADY PÉTER

Készítette: Hadházi Dániel

Többgénes jellegek. 1. Klasszikus (poligénes) mennyiségi jellegek. 2.Szinte minden jelleg több gén irányítása alatt áll

5-6. ea Created by mrjrm & Pogácsa, frissítette: Félix

Mikroszkóp vizsgálata Folyadék törésmutatójának mérése

BBTE Matek-Infó verseny mintatételsor Informatika írásbeli vizsga

Rácsok Exkluzív széria

ALÁÍRÁS NÉLKÜL A TESZT ÉRVÉNYTELEN!

Modern Fizika Labor. 11. Spektroszkópia. Fizika BSc. A mérés dátuma: dec. 16. A mérés száma és címe: Értékelés: A beadás dátuma: dec. 21.

Kövérség és vakbélgyulladás gyermekkorban

Kőzetállapot-előrejelzés mélyfúrás-geofizikai mérések alapján vágathajtás irányítás céljából. Tartalom

A szupraszegmentális jellemzők szerepe és felhasználása a gépi beszédfelismerésben. Szaszák György

Szélsőérték-számítás

A Termelésmenedzsment alapjai tárgy gyakorló feladatainak megoldása

Matematikai geodéziai számítások 10.

A mérés problémája a pedagógiában. Dr. Nyéki Lajos 2015

Sportági teljesítmény diagnosztika, méréseredmények feldolgozása, alkalmazása az edzéstervezés folyamatában.

Név: RV 1. ZH. Számítógépes Modellezés (Mathematica) A csoport Okt. 15. csütörtök

PrenaTest Újgenerációs szekvenálást és z-score

FEGYVERNEKI SÁNDOR, Valószínűség-sZÁMÍTÁs És MATEMATIKAI

Modern Fizika Labor. 5. ESR (Elektronspin rezonancia) Fizika BSc. A mérés dátuma: okt. 25. A mérés száma és címe: Értékelés:

Bevezetés az e-magyar programcsomag használatába

2. Hozzárendelt azonosítók alapján

Elektronikus kereskedelem. Automatikus azonosító rendszerek

A khi-négyzet próba és alkalmazásai: illeszkedésés függetlenségvizsgálat. khi-(χ 2 )-négyzet próba

Gépi tanulás és Mintafelismerés

CFX számítások a BME NTI-ben

Zener dióda karakterisztikáinak hőmérsékletfüggése

Alapfogalmak a Diszkrét matematika II. tárgyból

IoT, ehealthcare, hol tart a világ, mire számíthatunk, mire készül az ELTE IK

Orvosi szociológia (1. szeminárium) KUTATÁSMÓDSZERTAN

Biológiai rendszerek modellellenőrzése bayesi megközelítésben

A digitális analóg és az analóg digitális átalakító áramkör

Hash-alapú keresések

Diagnosztikai eszközök technológiai értékelésének keretei

Rendezések. A rendezési probléma: Bemenet: Kimenet: n számot tartalmazó (a 1,a 2,,a n ) sorozat

Forgalmi modellezés BMEKOKUM209

Szoftverminőségbiztosítás

A kálium-permanganát és az oxálsav közötti reakció vizsgálata 9a. mérés B4.9

Makroökonómia. 11. hét

JAVÍTÁSI-ÉRTÉKELÉSI ÚTMUTATÓ

Eredmény POSZTANALITIKA. értelmezése. Vizsgálatkérés Eredmény. Fekete doboz: a labor. Mintavétel

Analóg-digitál átalakítók (A/D konverterek)

Szinkronizmusból való kiesés elleni védelmi funkció

[Biomatematika 2] Orvosi biometria

[Biomatematika 2] Orvosi biometria

X. PANGEA Matematika Verseny II. forduló 10. évfolyam. 1. Az b matematikai műveletet a következőképpen értelmezzük:

Kioldóköri ellenőrzés EuroProt+ készülékekben

Óbudai Egyetem. Doktori (PhD) értekezés. Adatpárhuzamos sejtmagkeresési eljárás fejlesztése és paramétereinek optimalizálása Szénási Sándor

KÖSZÖNTJÜK HALLGATÓINKAT! Önök Dr. Zakariás Géza: Wellness, fittness Hitek és tévhitek az egészséges életmódról

Ellenanyagok kimutatása diagnosztikai/prognosztikai célból

[Biomatematika 2] Orvosi biometria. Visegrády Balázs

Szivárgás és lopás érzékelő rendszer bemutatása

Eredmény POSZTANALITIKA. értelmezése. Vizsgálatkérés Eredmény. Fekete doboz: a labor. Mintavétel

ÉLETMINŐSÉG ÉS KÖLTSÉGEK A KÖZÉP- ÉS SÚLYOS FOKÚ PSORIASISOS BETEGEK KÖRÉBEN

Az információelmélet alapjai, biológiai alkalmazások. 1. A logaritmusfüggvény és azonosságai

Másodfokú egyenletek, egyenlőtlenségek

A magyarázóváltozók kezelésének egyes kérdései regressziós modellezés során

Intelligens technikák k a

A mérési eredmény megadása

HORVÁTH ZSÓFIA 1. Beadandó feladat (HOZSAAI.ELTE) ápr 7. 8-as csoport

HIBAJEGYZÉK az Alapvető fizikai kémiai mérések, és a kísérleti adatok feldolgozása

Statisztika, próbák Mérési hiba

Biometria az orvosi gyakorlatban. Regresszió Túlélésanalízis

A biostatisztika alapfogalmai, valószínűségszámítási alapok. Dr. Boda Krisztina PhD SZTE ÁOK Orvosi Fizikai és Orvosi Informatikai Intézet

RhT Léghőmérséklet és légnedvesség távadó

Adatok statisztikai értékelésének főbb lehetőségei

Átírás:

Intelligens orvosi műszerek VIMIA023 Diagnózistámogatás = döntéstámogatás A döntések jellemzése (ROC, AUC) 2018 ősz http://www.mit.bme.hu/oktatas/targyak/vimia023 dr. Pataki Béla pataki@mit.bme.hu (463-)2679

Az észleléseink alapján térjünk át injekcióról tablettára! Ez jó döntés??

Jó döntést szeretnénk hozni. De mi a jó döntés? Általában nincs tökéletesen jó döntés, csak az egyik jobb, a másik rosszabb! Ahhoz, hogy össze tudjunk hasonlítani két alternatívát (döntési módszert), kell legyen a döntés jóságát jellemző (skalár) mérőszámunk Először a döntések minősítésével, értékelésével foglalkozunk Alapvetően bináris (jó/rossz, igaz/hamis, beteg/egészséges, ártatlan/bűnös) döntéseken mutatjuk be a módszereket

A döntések értékelése: melyik a jó döntés? Osztályozás itt, most bináris döntés igazi állapot f(x) feltételezett állapot h(x) helyzet tény hipotézis. paciens beteg felismerjük kezeljük, helyesen tesszünk f(x) = I h(x) = I Valós Pozitív, True Positive TP paciens egészséges felismerjük nem kezeljük, most is jól f(x) = H h(x) = H teszünk, Valós Negatív, True Negative TN paciens beteg nem ismerjük fel nem kezeljük, nem járunk el jól, Hamis Negatív, f(x) = I h(x) = H False Negative FN, ( elnézett támadás, 2. tip. hiba) paciens egészséges nem ismerjük fel kezeljük fölöslegesen, nem járunk el jól, Hamis Pozitív, f(x) = H h(x) = I False Positive FP, ( hamis riadó, 1. tip. hiba)

true positive rate (TPR) valódi pozitív arány, érzékenység (hit rate, recall, sensitivity) TPR = TP/P = TP / (TP+FN) true negative rate (TNR) valódi negatív arány, specificitás (specificity) TNR = TN/N = TN / (TN+FP) false positive rate (FPR) fals pozitív arány, FPR = FP/N = FP / (TN+FP) és sok egyéb más mérőszám Az ábrán vázolt esetben: Döntéseink: TP = 5, TN = 11, FP = 4, FN = 10 Tények: P = 15, N = 15 betegek döntés: belül pozitív kívül - negatív egészségesek TPR = TP / (TP+FN) = 5/15 =.33 FPR = FP / (FP+TN) = 4/15 =.26 ACC = (TP+TN)/(P+N) = 1/2 =.5

Néhány más javaslatra is kipróbáltuk Melyik jobb? betegek betegek egészségesek TP = 10, TN = 9, FP = 6, FN = 5 egészségesek TP = 9, TN = 12, FP = 3, FN = 6

A döntésünk modellje Az esetre jellemző érték Küszöbérték Komparátor < =? > például (lehetne fordítva is): ha >, akkor kimenet=1 pozitív esetnek vesszük ha <=, akkor kimenet= 0 negatív esetnek vesszük Példa: Ha a mért testhőmérséklet 38 o C küszöbnél nagyobb, akkor láz (betegség), ha kisebb vagy egyenlő, akkor nem lázas (egészséges). TPR=TP/P Küszöbérték2 esetén kialakuló arány Küszöbérték1 esetén kialakuló arány FPR=FP/N

Mi van, ha egy érdektelen (irreleváns) paraméterre alapozzuk a döntésünket? Testhőmérséklet Küszöbérték Testhőm. [ o C] 35,0 36,0 Komparátor < =? > 36,0 37,0 37,0 38,0 38,0 39,0 ha hőmérséklet > küszöb, akkor szőke hajú ha hőmérséklet <= küszöb, akkor barna hajú Megvizsgáltunk 6396 embert, köztük 2460 volt szőke, a többi barna. 39,0 40,0 40,0 41,0 41,0 42,0 42,0 43,0 43,0 44,0 SZŐKE 5 1000 800 600 40 10 5 0 0 BARNA 8 1600 1280 960 64 16 8 0 0 küszöb1 küszöb2 Milyen ROC görbe alakul ki? küszöb9 küszöb10

Probléma: döntést kell hoznunk, egy numerikus paraméter értéke alapján arról, hogy milyen esettel állunk szemben. (pl. testhőmérséklet alapján, hogy egészséges vagy beteg?) Cél: rájönni, mi a teszt (optimális) küszöb értéke.

ROC: Vevő működési karakterisztika Receiver Operating Characteristic B A C D E A B C D E A küszöb fölött betegnek tekintjük, alatta egészségesnek

Döntés Hiba (confusion) mátrix true positive rate (TPR) TPR = TP/P = TP / (TP+FN) false positive rate (FPR) FPR = FP/N = FP / (FP+TN) Beteg Beteg TP FP Egészséges Egészséges Tények FN TN ROC: Vevő működési karakterisztika Receiver Operating Characteristic AUC: Görbe alatti terület Area Under Curve

Összefoglaló táblázat különböző szokásos paraméterek https://en.wikipedia.org/wiki/confusion_matrix