Transzportfolyamatok a mikroszkópikus méretskálán: Diffúzió, Brown-mozgás, ozmózis. A sejt méretskálája. Biomolekuláris rendszerek méretskálája

Hasonló dokumentumok
Az élő sejt fizikai Biológiája Kellermayer Miklós

Fizikai biológia. Modellépítés kiinduló szempontjai. Mitől élő az élő? Az élő sejt fizikai Biológiája

Biofizika szeminárium. Diffúzió, ozmózis

Fizika-Biofizika I. DIFFÚZIÓ OZMÓZIS Október 22. Vig Andrea PTE ÁOK Biofizikai Intézet

SEMMELWEIS EGYETEM. Biofizikai és Sugárbiológiai Intézet, Nanokémiai Kutatócsoport. Zrínyi Miklós

Az élő sejt fizikai Biológiája:

A diffúzió leírása az anyagmennyiség időbeli változásával A diffúzió leírása a koncentráció térbeli változásával

BIOFIZIKA I OZMÓZIS Bugyi Beáta (PTE ÁOK Biofizikai Intézet) OZMÓZIS

Biológiai membránok fizikája, diffúzió, ozmózis Dr. Nagy László

Orvosi Fizika 10. Biológiai membránok fizikája, diffúzió, ozmózis Dr. Nagy László

Transzportjelenségek

OZMÓZIS. BIOFIZIKA I Október 25. Bugyi Beáta PTE ÁOK Biofizikai Intézet

Biológiai membránok fizikája, diffúzió, ozmózis Dr. Nagy László

Biofizika I. OZMÓZIS. Dr. Szabó-Meleg Edina PTE ÁOK Biofizikai Intézet

SEMMELWEIS EGYETEM. Biofizikai és Sugárbiológiai Intézet, Nanokémiai Kutatócsoport. TRANSZPORTFOLYAMATOK biológiai rendszerekben.

DIFFÚZIÓ. BIOFIZIKA I Október 20. Bugyi Beáta

Biofizika 1 - Diffúzió, ozmózis 10/31/2018

Reakciókinetika és katalízis

Biofizika I. DIFFÚZIÓ OZMÓZIS

Transzportfolyamatok

Transzportfolyamatok

SEMMELWEIS EGYETEM. Biofizikai és Sugárbiológiai Intézet, Nanokémiai Kutatócsoport. TRANSZPORTFOLYAMATOK biológiai rendszerekben.

FIZIKA I. Ez egy gázos előadás lesz! (Ideális gázok hőtana) Dr. Seres István

A vérkeringés és szívműködés biofizikája

1. Feladatok a termodinamika tárgyköréből

Légköri termodinamika

FIZIKA I. Ez egy gázos előadás lesz! (Ideális gázok hőtana) Dr. Seres István

Követelmények: f - részvétel az előadások 67 %-án - 3 db érvényes ZH (min. 50%) - 4 elfogadott laborjegyzőkönyv

Diffúzió. Diffúzió sebessége: gáz > folyadék > szilárd (kötőerő)

Mozgásjeleségek mikrorendszerekben 1. Molekuláris transzportfolyamatok az élő szervezetben

Általános kémia képletgyűjtemény. Atomszerkezet Tömegszám (A) A = Z + N Rendszám (Z) Neutronok száma (N) Mólok száma (n)

Molekulák mozgásban a kémiai kinetika a környezetben

Gázok. 5-7 Kinetikus gázelmélet 5-8 Reális gázok (korlátok) Fókusz: a légzsák (Air-Bag Systems) kémiája

Diffúzió. Diffúzió. Diffúzió. Különféle anyagi részecskék anyagon belüli helyváltoztatása Az anyag lehet gáznemű, folyékony vagy szilárd

Orvosi Biofizika. A tudomány küldetése A valóság minél pontosabb megismerése - a tudományos igazságok feltárása. Orvosi Biofizika

Szívelektrofiziológiai alapjelenségek. Dr. Tóth András 2018

Anyagismeret 2016/17. Diffúzió. Dr. Mészáros István Diffúzió

Diffúzió 2003 március 28

2. A hőátadás formái és törvényei 2. A hőátadás formái Tapasztalat: tűz, füst, meleg edény füle, napozás Hőáramlás (konvekció) olyan folyamat,

a természet logikája

Gázok. 5-7 Kinetikus gázelmélet 5-8 Reális gázok (limitációk) Fókusz Légzsák (Air-Bag Systems) kémiája

Reológia Mérési technikák

Atomok. szilárd. elsődleges kölcsönhatás. kovalens ionos fémes. gázok, folyadékok, szilárd anyagok. ionos fémek vegyületek ötvözetek

Elektrofiziológiai alapjelenségek 1. Dr. Tóth András

Termodinamika (Hőtan)

A gáz halmazállapot. A bemutatót összeállította: Fogarasi József, Petrik Lajos SZKI, 2011

SEMMELWEIS EGYETEM. Biofizikai és Sugárbiológiai Intézet, Nanokémiai Kutatócsoport. Transzportfolyamatok. Zrínyi Miklós

Biomolekulák nanomechanikája A biomolekuláris rugalmasság alapjai

Az elektromos kettősréteg. Az elektromos potenciálkülönbség eredete, értéke és az azt befolyásoló tényezők. Kolloidok stabilitása.

Termodinamikai egyensúlyi potenciál (Nernst, Donnan). Diffúziós potenciál, Goldman-Hodgkin-Katz egyenlet.

Sejtek membránpotenciálja

Atomok. szilárd. elsődleges kölcsönhatás. kovalens ionos fémes. gázok, folyadékok, szilárd anyagok. ionos fémek vegyületek ötvözetek

1. előadás. Gáztörvények. Fizika Biofizika I. 2015/2016. Kapcsolódó irodalom:

Az előadás vázlata: Állapotjelzők: Állapotjelzők: Állapotjelzők: Állapotjelzők: nagy közepes kicsi. Hőmérséklet, T tapasztalat (hideg, meleg).

Hajdú Angéla

Kémiai reakciók sebessége

Hidrosztatika, Hidrodinamika

Transzportfolyamatok. összefoglalás, általánosítás Onsager egyenlet I V J V. (m/s) áramvonal. turbulens áramlás = kaotikusan gomolygó áramlás

Általános Kémia GY, 2. tantermi gyakorlat

Orvosi Biofizika I. 12. vizsgatétel. IsmétlésI. -Fény

Folyadékáramlás. Orvosi biofizika (szerk. Damjanovich Sándor, Fidy Judit, Szöllősi János) Medicina Könyvkiadó, Budapest, 2006

Transzportfolyamatok. Alapfogalmak. Lokális mérlegegyenlet. Transzportfolyamatok 15/11/2015

Fizika feladatok. 1. Feladatok a termodinamika tárgyköréből november 28. Hővezetés, hőterjedés sugárzással. Ideális gázok állapotegyenlete

Oldatok - elegyek. Elegyek: komponensek mennyisége azonos nagyságrendű

TRANSZPORTFOLYAMATOK ÉS SZIMULÁCIÓJUK (MAKKEM 242M)

Membránszerkezet Nyugalmi membránpotenciál

Mivel foglalkozik a hőtan?

2. (d) Hővezetési problémák II. főtétel - termoelektromosság

Termodinamikai bevezető

Digitális tananyag a fizika tanításához

Alkalmazás a makrókanónikus sokaságra: A fotongáz

3. Gyakorlat Áramlástani feladatok és megoldásuk

Speciális fluoreszcencia spektroszkópiai módszerek

Membránpotenciál, akciós potenciál

Műszaki termodinamika I. 2. előadás 0. főtétel, 1. főtétel, termodinamikai potenciálok, folyamatok

Folyadékok áramlása Folyadékok. Folyadékok mechanikája. Pascal törvénye

Oldatok - elegyek. Többkomponensű homogén (egyfázisú) rendszerek. Elegyek: komponensek mennyisége azonos nagyságrendű

Radioaktív nyomjelzés

Szedimentáció, elektroforézis. Biofizika előadás Talián Csaba Gábor

Folyadékáramlás vérkeringés

zis Brown-mozg mozgás Makromolekula (DNS) fluktuáci Vámosi György

Dr. Kopecskó Katalin

Energiatételek - Példák

Energia. Energia: munkavégző, vagy hőközlő képesség. Kinetikus energia: a mozgási energia

Modern Fizika Labor. 2. Elemi töltés meghatározása

Membránpotenciál. Nyugalmi membránpotenciál. Akciós potenciál

Művelettan 3 fejezete

5. Az adszorpciós folyamat mennyiségi leírása a Langmuir-izoterma segítségével

1. Mi a termodinamikai rendszer? Miben különbözik egymástól a nyitott és a zárt termodinamikai

PHYWE Fizikai kémia és az anyagok tulajdonságai

Molekuláris dinamika I. 10. előadás

DNS, RNS, Fehérjék. makromolekulák biofizikája. Biológiai makromolekulák. A makromolekulák TÖMEG szerinti mennyisége a sejtben NAGY

Javítókulcs (Kémia emelt szintű feladatsor)

Lendület. Lendület (impulzus): A test tömegének és sebességének szorzata. vektormennyiség: iránya a sebesség vektor iránya.

Ejtési teszt modellezése a tervezés fázisában

Adatgyőjtés, mérési alapok, a környezetgazdálkodás fontosabb mőszerei

Kollár Veronika A biofizika fizikai alapjai


Elegyek. Csonka Gábor 2008 Általános Kémia: oldatok 1 dia

Égés és oltáselmélet I. (zárójelben a helyes válaszra adott pont)

Átírás:

Transzportfolyamatok a mikroszkópikus méretskálán: Diffúzió, Brown-mozgás, ozmózis Kellermayer Miklós Cary and Michael Huang (http://htwins.net) Biomolekuláris rendszerek méretskálája A sejt méretskálája Termodinamika 10 23 Atom Sejt Egyszerűsített sejtmodell: kocka Mezoskála Kvantumkémia Poratka Vörösvértest, fehérvérsejt Hangya Emberi hajszál DS anoskála Mikroskála Milliskála 1 milliméter Látható spektrum 10 10 Atom 10 3 Atom 10 1 Atom Aktin filamentum (d=7 nm) G-aktin (monomer) (d=5 nm, cc~100 μm) Sejt: 20 μm oldalfalú kocka Analógia - Tanterem: 20 m oldalfalú kocka Aktinmolekula mérete 5 nm 5 mm Aktinmolekulák száma ~500 ezer ~500 ezer Aktin átlagos távolsága ~250 nm ~25 cm Kálium ion mérete 0.15 nm 0.15 mm Kálium ionok száma ~10 9 ~10 9 Kálium ionok átlagos távolsága 20 μm ~20 nm ~2 cm Vízmolekula mérete 0.29 nm 0.29 mm Kvantumfizika 5 db Si atom 10 0 Atom Kálium ion (d=0.15 nm, cc~150 mm) Vízmolekula (d=0.32 nm, cc~33 M) Vízmolekulák száma ~1.6x10 14 ~1.6x10 14 Vízmolekulák átlagos távolsága ~0.4 nm ~0.4 mm

Részecske átlagos energiája és sebessége Részecske átlagos kinetikai energiája (termikus egyensúlyban): 3 2 k B T Egy szabadsági fokra: 1 2 k T kb: Boltzmann állandó, B T: abszolut hőmérséklet, kbt: termikus energia (4.14 pn nm) A hőmozgást végző részecske útja random ütközésekkel tarkított Brown-mozgás jelensége Brown-mozgás magyarázata Brown-részecske útvonala (trajektória) m tömegű részecske átlagos kinetikai energiája az x-tengely mentén: 1 2 mv 2 x Átlagos sebesség: = 1 2 k B T v x 2 = k B T m l Részecske Tömeg (kg) Sebesség (m/s) Sejten való áthaladási idő (µs)* G-aktin (43 kda) 7.2x10-23 ~8 ~2.5 Kálium ion (39 Da) 6.5x10-26 ~240 ~0.08 Tejben szuszpendált zsírcseppek (0.5-3 μm) A mikroszkópikus részecske mozgása a molekulákkal való véletlenszerű ütközések következménye. Bolyongás ( random walk ) l = átlagos szabad úthosz (egymást követő ütközések közötti átlagos távolság) v = a termikus mozgást végző részecske átlagos sebessége Vízmolekula (18 Da) 3x10-26 ~374 ~0.05 *egyenes vonalú egyenletes mozgás vákuumban Robert Brown (botanikus, 1773-1858) Diffúzió: random hőmozgás miatt fellépő transzportfolyamat; szétterjedés. Egydimenziós bolyongás - gondolatkísérlet Szabályok: 1. Minden részecske τ időközönként jobbra vagy balra mozdul ±vx sebességgel, l=±vxτ távolságra. Ebből az n-edik lépés után megtett távolság kiszámítható: x i n -3l ( )= x i ( n 1)± l Kiindulási állapot: t=0, részecske, x=0-2l 2. Jobbra mozdulás valószínűsége = balra mozdulás valószínűsége = 1/2. A részecskéknek nincs memóriája (az egymást követő lépések függetlenek). 3. A részecskék nem hatnak kölcsön egymással (vagy az oldószerrel). -l 0 +l +2l +3l Megfigyelések: 1. A részecskék átlagos helyzete nem változik! ( ) = 1 xn i=1 2. A részecskék szétterjedése az idő négyzetgyökével nő! x 2 x i x ( n 1)± l ( n) = 1 x 2 i ( n 1)± 2lx i ( n 1)+ l 2 = x 2 i n 1 i=1 ( ) + l 2 ( ) = nl 2 A szétterjedés lépésenként l 2 -tel nő: x 2 n Mivel n az idővel arányos, n=t/τ, ezért: x 2 () t = l 2 t τ Vezessünk be egy ú.n. diffúziós állandót: D = l 2 x 2 = 2Dt és x 2 = 2Dt 2τ Diffúzió eredménye: a részecskék bejárják és kitöltik a rendelkezésre álló teret mikroszkopikus következmény: térfogat bejárása Koncentrációesés (grádiens): Δc/ Határfelületen (A): Idő ettó részecskevándorlás: Δ makroszkopikus következmény: koncentráció kiegyenlítődés Részecske-áramerősség: I = Δ Δt = 1 Δn va 2l = 1 Δn vla 6 3 határfelületi részecskeszám-különbség az átlagos szabad úthossz (l) tartományán Anyagáramerősség: A diffúziós állandó másfajta bevezetésével: Anyagáram sűrűség (Fick I. törvénye): I υ = 1 Δc vla 3 D = 1 3 vl I υ A = J υ = D Δc

A valóságban a koncentrációgrádiens alakja idővel változik Fick II. törvénye A diffúzió és bolyongó mozgás kapcsolata Brown-mozgás - random walk r R 2 R = l 2 = Ll A koncentrációesés idővel csökken (a határfelület elkenődik ) A koncentráció tér- és időbeli változása: Δ Δc DΔt + ct ()= ct+δt ( ) r1 Átlagos részecske sebesség: v = l τ Teljes bolyongási idő: t = τ R = l 2 = t τ l 2 = tvl = 3Dt R = elmozdulás = elemi lépések száma l = r i = átlagos szabad úthossz r i = elemi lépés l = L = teljes út Diffúziós együttható: Diffúziós állandó (m 2 /s) értelme: molekuláris mozgékonyság D = 1 3 vl Ha ismerjük a koncentráció (c) térbeli eloszlását egy adott t időpontban [c(x,t)], akkor egy Δt-vel későbbi időpontban is kiszámíthatjuk azt. Diffúziós állandó gömb alakú részecskére: D = k BT 6πηr Einstein-Stokes összefüggés: kb = Boltzmann-állandó η = oldat viszkozitása r = részecske sugara A diffúzió csak rövid méretsálán gyors A diffúzió speciális esete: reptáció Idő (s) égyzetes összefüggés: meredekség=2 Ioneloszlás a sejtben: filamentum a reptációs alagútban Reptáció: polimér hálóban történő kígyószerű diffúzió. (Reptilia: hüllők) Távolság (µm) Légzési gázcsere a tüdőkapillárisokban: polimér mátrix: entanglement (összegabalyodás) Aktin filamentumok metilcellulóz mátrixban. Egyenirányított diffúzió

A diffúzió speciális esete: Brown-féle kilincskerék Kilincs Kilincskerék potenciál A diffúzió speciális esete: ozmózis Diffúzió útján történő egyirányú oldószer áramlás Hajtóerők Kiindulási állapot Végállapot Brown-féle mozgás k be δ k ki Diffúzió F K(F) = erő jelenlétében fennálló disszociációs állandó - az a monomer koncentráció, amelynél a nettó filamentum növekedés 0. Kc = kritikus koncentráció (0 erőnél); F = erő; δ = diszkrét növekedés egyetlen monomer beépülésekor. kbt = termikus energia..b.: F lehet + vagy -. A folyamat lehet reakcióvezérelt (a kbe-hez képest túl gyors diffúzió) vagy diffúzióvezérelt (a kbe-hez képest lassú diffúzió). Listeria monocytogenes intracelluláris mozgása aktin polimerizációval Jv,be hajtóereje: oldószer koncentrációkülönbség Jv,ki hajtóereje: nyomáskülönbség Ozmotikus egyensúly: Ozmózis nyomás: J υ,be = J υ,ki p ozmózis = crt van t Hoff-törvény: c = oldott anyag koncentrációja R = egyetemes gázállandó Ozmózis jelentősége: sejt-duzzadás, ödémák, hemodialízis, hashajtás. Az ozmózis mechanizmusa Az ozmózis jelentősége van t Hoff s gáztörvény mechanizmus Féligáteresztő hártya jellemzője: reflexiós együttható (σ) Tökéletes féligáteresztő hártyára: Ekvivalens ozmotikus nyomás (ozmotikus koncentráció): heterogén oldatrendszerrel egyensúlyban levő nem-elektrolit oldat koncentrációja. Általános gáztörvény pv = RT p = 1 V RT Ozmotikus nyomás p osm = π = crt Példa: Mekkora az ozmotikus nyomása egy 0.1 M (0.1 mol/dm3) cukor oldatnak? ϖ = 8.3 (J/mol.K) x 293 (K) x 0.1 (mol/dm3) = 243 kpa ~ 2.4 atm. ΔP =Δπ A valóságban: ΔP <Δπ és és 0 < σ < 1 σ = ΔP Δπ = 1 σ = ΔP Δπ < 1 Mértékegység: mmol/kg = mosmol/kg = mosm A vérplazma ozmotikus nyomása ~ 300 mosm. Onkotikus nyomás: kolloid ozmózis nyomás Kolloid makromolekulák oldatának ozmotikus nyomása. Hipertóniás Izotóniás Hipotóniás p = nyomás V = térfogat R = gázállandó (8,3 J/mol.K) c = moláris koncentráció Megjegyzés: híg oldatokra érvényes Ozmotikus munka: L = nrt ln c 1 c 2 = nrt ln π 1 π 2 R = gázállandó n = toldott anyag móljainak száma c1 = oldat kezdeti moláris koncentrációja c2 = fvégső moláris koncentráció (egyensúly) ϖ1 = kezdeti ozmotikus nyomás ϖ2 = végső ozmotikus nyomás (egyensúly)

Termodinamikai áramok Ha a rendszer különböző pontjain különbségek vannak az intenzív mennyiségekben, áramok (termodinamikai áramok) lépnek fel. A termodinamikai áramok az egyensúly helyreállítására irányulnak. Termodinamikai áram Áramot fenntartó intenzív mennyiségkülönbség Áramsűrűség Törvény Hőáram Hőmérséklet (T) J E = λ ΔT Fourier Térfogati áram yomás (p) J V = R2 Δp Hagen-Poiseuille 8η Elektromos áram Elektromos potenciál (φ) J Q = 1 Δϕ ρ Ohm Anyagáram (diffúzió) Kémiai potenciál (µ) J Fick n = D Δc Onsager-féle lineáris törvény Áramló extenzív mennyiség áramsűrűsége (termodinamikai áram, J) J = ext AΔt Lars Onsager (1903-1976), obel-díj (1968) Transzportfolyamatok általános összefüggése. J = LX Vezetési együttható (termodinamikai = x koefficiens, L) Egy-egy termodinamikai áramot több intenzív mennyiség is befolyásolhat. Pl. termodiffúzió (hőmérséklet-különbség hatására fellépő anyagáram). J 1 = L 11 X 1 + L 12 X 2 J 2 = L 21 X 1 + L 22 X 2 L11, L22 = egyenes vezetési együtthatók L12, L21 = kereszt vezetési együtthatók Intenzív mennyiség esése ( grádiens, termodinamikai erő, X) X = Δy int