Búzanemesítési információs rendszer

HTML
DOWNLOAD

Méret: px

Mutatás kezdődik a ... oldaltól:

Download "Búzanemesítési információs rendszer"

Csongor Alajos Boros
6 évvel ezelőtt
Látták:

1 Búzanemesítési információs rendszer Kuti Csaba MTA Mezőgazdas gazdasági gi Kutatóint intézete Martonvásár 2007

2 Bevezetés mikro számítógépek megjelenése és elterjedése adatéhs hség - öngerjesztő folyamat elindulása gyors technológiai generáci cióváltás hatékony adatkezelés és informáci ció- feldolgozás új j szoftver- technológi giák közvetítése a felhasználók irány nyába

Új technológiák Információs Rendszer Szükség van olyan

Leegyszerűsítik bizonyos feladatok elvégzését 2.

formalizáljuk ADAT ERŐFOR FOR- RÁSOK SZOFTVER ERŐFOR FOR- RÁSOK

3 Új technológiák Információs Rendszer Szükség van olyan megoldásokra, amelyek: 1. Leegyszerűsítik bizonyos feladatok elvégzését 2. Felhasználónak nem kell törődnie azzal, hogy mi történik a háttérben 3. Az adott közösség kommunikációjának egy részét szabályozzuk, formalizáljuk ADAT ERŐFOR FOR- RÁSOK SZOFTVER ERŐFOR FOR- RÁSOK HARDVER ERŐFOR FOR- RÁSOK HUMÁN ERŐFOR FOR- RÁSOK KOMMUNI- KÁCIÓS ERŐFOR FOR- RÁSOK 4. Az információcsere minél nagyobb része a számítástechnikai rendszer közbeiktatásával történjen

4 Célkitűzések Egységes, ges, integrált adatstruktúra ra llétrehozása Input adatok automatizált gyűjtése Változó szerkezetű listák, outputok előállítása llítása Tevékenységszervező modulok llétrehozása Általános lekérdező funkciók k beépítése Teljeskörű pedigré-és s génbanki g nyilvántartás ntartás Alapanyagcsere (címlista) szervezése se Alapvető statisztikai modul llétrehozása Csoportmunka lehetővé tétele tele

5 Relációs adatmodell megtervezése és létrehozása Célja: a nemesítéssel ssel kapcsolatos összes adat egységes, ges, integrált nyilvántart ntartása döntéstámogató informáci ciók, jelentések csoportosításának és s teljes körűk megjelenítésének nek lehetővé tételetele nemesítési si adatok kapcsolatának biztosítása sa a geneológiai giai génbanki alapanyagcsere adatokkal

6 Rendelkezésre álló adatforrások Papír alapú adatbázisok Hagyaték adatbázisok

7 Adat1999 Adat1999 Adat2000 Adat2000 Adat2001 Adat2001 Adat2002 Adat2002 Adat2003 Adat2003 Adat2004 Adat2004 Adat2005 Adat2005 Adat4994 Adat4994 Adat4995 Adat4995 Adat1986 Adat szer szer szer szer szer szer összesen: sszesen: Adat2006 Adat2006 BASA/DF333 BASA/DF333-77// 77// M374/SX//2897/PRSK/ M374/SX//2897/PRSK/ E E 7 2 BASA/DF333 BASA/DF333-77// 77// M374/SX//2897/PRSK/ M374/SX//2897/PRSK/ B B 5 1 Miért kell struktúrálnunk adatainkat? Miért kell struktúrálnunk adatainkat?

8 Táblaszerkezetek kialakítása Adat1984 Adat2007 Adat1984 Adat2007 Pedigre

9 Táblák közötti kapcsolatok Adat1986 Adat4995 Adat4994 Adat1999 Adat2000 Adat2001 Adat2002 Adat2003 Adat2004 Adat2005 Adat2006 Pedigre B B 1 5 M374/SX//2897/PRSK/ BASA/DF333-77// E E 2 7 M374/SX//2897/PRSK/ BASA/DF333-77//

10 Speciális adatszerkezetek A x B F1 F2 F3 LR 821 SR 821 FUZ 821 LR 868 SR 868 FUZ 868 Rezisztencia kísérletek Fajtafenntartás Fagykísérletek TA 501 SZAP TA 563 SZAP FGY FGY 216 Ev 2

11 Adatmennyiség I. Évről-évre létrejövő adatbázisok Adat1984 Adat2006 (28501) Adat2007 (21786) (Adat Adat2007) II. Állandó adatbázisok Geneológia ( ) Génbank (12561) MagPosta (23.980)

12 Információs Rendszer Genealógia PEDIGRÉ FELBONTÁS N e m z e t k ö z i A d a t b á z i s o k Pheno Pedigré Cross Genes Törzsek KERESZTEZŐ Ev 1 ÚJ FELVITEL KERESZTEZŐ SZELEKCIÓ Magküld ldés Címlista Mag küldés/érkezés MAGÉRKEZÉS / KÜLDÉS Ev 2 GenAnal PedParts Vetésjegyzék Felv. füzet Cimke PARCELLÁZÓ Statisztikai Csomag Génbank Koll Breeder.inf (Stnd, Auxflag) On-line adatgyűjtő eszközök Kézi adatgyűjtő eszközök Helyi Statisztika

Keresztező Statisztika Parcellázó Magküld ldés

13 Tevékenységszervező programmodulok Kézi adatbevitel Adatbevitel fájlbf jlból Szelekció Keresztező Statisztika Parcellázó Magküld ldés Magérkez rkezés Vonalkód d (tervező/nyomtat /nyomtató)

14 Keresztezés

15 Parcellázás

16 Adatgyűjtés Automata (vonalkód) Infratec 1241 Inframatic 8611 Mettler mérlegcsalm rlegcsalád Polycorder Minolta CR-300 Falling Number 1500 Szoftveres interfész közbeiktatk zbeiktatásával (vonalkód) SKCS 4100 Alveograph és s Alveolink Farinograph Manuális Glutomatic Farinograph E Texture Analyser HPLC

17 Vonalkódok alkalmazása a rendszerben 1. Tervezés, nyomtatás 2. Kihelyezés: parcella, zacskó 3. Felvételezés: humán olv. szánt rész 4. Aratás után: zsák szájára, zacskókra

középark parányos - változó adatainak: legnagyobb (Max), legkisebb (Min) értéke, összege (Sum) - szóródás s mutatói: szórásn snégyzet, szórás, s, átlagos hibaszórás, s, variáci ciós koeff.

18 Cél: 1. Leíró statisztika Statisztikai modul - átlag mutatósz számai: számtani átlag, középsk pső érték k (Median) mértani m (Geom( Geom), Szántóföldi kísérletek harmonikus (Harm( gyors kiértékelése Harm) ) középark parányos - változó adatainak: legnagyobb (Max), legkisebb (Min) értéke, összege (Sum) - szóródás s mutatói: szórásn snégyzet, szórás, s, átlagos hibaszórás, s, variáci ciós koeff., átlag konfidencia intervalluma Adatbázisból közvetlenül futtathatók legyenek 2. a Véletlenblokk statisztikák varianciaanalízis - egytényez nyezős Adatok - kéttt tttényezős elérhetővé tétele általánosan elfogadott formátumokban 3. Osztott parcellás (split-plot) elrendezés A 4. Lineáris kötelező regresszióanalízis statisztikai elemzésekhez ne - egyszeres legyen - többszörös szükség külön statisztikai csomag használatára 5. Korrelációs mátrix számítása Elrendezések rugalmas kezelése

19 Génbanki modul

számából l blokkok súly adatokat tartalmazó

20 Outputok 1. Kiegész szítő anyagok kísérleti k tervek gyakorlati kivitelezéséhez a. Vetéstervek rögzített formátum tumú sorok számából l blokkok súly adatokat tartalmazó rugalmas szerkezetű (előáll llítás: ált. lek.. funkciók) k) b. Felvételez telező füzetek rögzített formátum tumú (blokkosított szerkezet) 2. Általános lekérdez rdező funkciók mérési adatokkal (előáll llítás: ált. lek.. funkciók) k) speciális formátum (kéthas thasábos TA, FB típus)

21 Lekérdez rdezés Adatlekérdező funkciók (Outputok)

22 Következtetések (I.) Cél: Kutatási Program Informáci ciós Rendszer Kutatási Program Méretének növeln velése Versenyképess pesség javítása

23 Következtetések (II.) Nagyméret retű kutatási programhoz tervezett rendszer: - sok külsk lső és s belső tényező együttes hatása alakítja ki a végsv gső formát - nem lehet a tevékenys kenységeket a legapróbb részletekig r előre megtervezni - megkezdett tevékenys kenységek folytatásának lehetősége - csapatok egymásra épülő tevékenys kenységet folytatnak A tevékenys kenységszervező modulok alapvető szempontja a rugalmasság: g: - sok kísérlet k esetében nem tudjuk előre a végsv gső méretet - nem tudjuk előre a genotípusok sorrendjét - nem kell tudnunk hány h termőhelyen lesz elvetve (randomizáci ciót t is később k rendelünk nk hozzá) Adatgyűjt jtési szempontok: - adatokat a lehető leggyorsabban eljuttatni a központi k adatbázisba (csúcsid csidény) - kevés s hibalehetőség g a gyűjt jtés s során - a létrejl trejövő összes mért m adat rögzr gzítése Kísérletek szánt ntóföldi beüzemel zemelésének támogatt mogatása: - a lehetőségeket nem korlátozza az adatbázisba épített jelentésk skészítő - vetéstervek - felvételez telező füzetek

24 Pedigré és s génbanki g nyilvántart ntartás: Következtetések (III.) - új j pedigrék k szerkesztése se és s ellátása azonosítósz számmal automatikusan törtt rténik - az új j törzsazonost rzsazonosítókat úgyszintén n automatikusan generálja a rendszer - testvért rtörzsek rzsek kezelése megoldott - szoros kapcsolatban áll a párhuzamosan p működőm génbankkal Informáci ciócsere csere a rendszeren belül: l: - egy része r a számítástechnikai stechnikai és s kommunikáci ciós s (hálózat) rendszer közbeiktatk zbeiktatásával törtt rténik - tevékenys kenységek monitorizálása (mérések)

25 Köszönöm a megtisztelő figyelmet

Hasonló dokumentumok

SZENT ISTVÁN EGYETEM BÚZANEMESÍTÉSI INFORMÁCIÓS RENDSZER DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI KUTI CSABA

SZENT ISTVÁN EGYETEM BÚZANEMESÍTÉSI INFORMÁCIÓS RENDSZER DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI KUTI CSABA GÖDÖLLŐ 2007 A doktori iskola Megnevezése: Növénytudományi Doktori Iskola Tudományága: Növénytermesztési és