PANNON EGYETEM GEORGIKON KAR
|
|
- Rebeka Fodorné
- 7 évvel ezelőtt
- Látták:
Átírás
1 PANNON EGYETEM GEORGIKON KAR NÖVÉNYTERMESZTÉSI ÉS KERTÉSZETI TUDOMÁNYOK DOKTORI ISKOLA NÖVÉNY NEMESÍTÉS, GENETIKA ÉS AGRÁRBIOTECHNOLÓGIA PROGRAM ISKOLAVEZETŐJE: DR GÁBORJÁNYI RICHARD, DSC A BURGONYA REZISZTENCIA NEMESÍTÉS HATÉKONYSÁGÁNAK NÖVELÉSE HAGYOMÁNYOS ÉS MOLEKULÁRIS GENETIKAI MÓDSZEREKKEL DOKTORI (PHD) ÉRTEKEZÉS TÉZISEI KÉSZÍTETTE: AHMAD MOUSAPOUR GORJI TÉMAVEZETŐ DR. POLGÁR ZSOLT, PHD TÁRSTÉMAVEZETŐ DR. TALLER JÁNOS, PHD KESZTHELY, MAGYARORSZÁG 2011
2 Tartalomjegyzék 1. Bevezetés Célkitűzések ANYAGOK ÉS MÓDSZEREK Növényanyag Hetero-multiplex vizsgálatok A vírus fertőzöttség értékelése Double Sandwich ELISA (DAS-ELISA) technikával Ozmotikus stressz vizsgálat Genomi DNS izolálás A növényi sejtek lízise és a fehérjék denaturálása RNS izolálás Molekuláris marker vizsgálatok Intron targeting (IT) Az EST szekvenciák azonosítása IT elemzés IT-SCoT markerek SSCP analízis SCOT analízis SCAR analízis SSR analízis ISSR analízis RAPD analízis Kapcsoltsági térkép szerkesztése Szubtraktív hibridizáció Adat elemzés Új tudományos eredmények Irodalomjegyzék Publikációs lista
3 1. Bevezetés A modern értelemben vett burgonyanemesítés 1807-ben kezdődött Angliában, mely során gondosan tervezett mesterséges pollenkeresztezéseket végeztek, amit a korai nemesítési szakirodalmak is alátámasztanak (Knight, 1807; Bradshaw és Mackey, 1994). A mai mezőgazdaság számára elsődleges cél a termésstabilitás elérése termésnövelő anyagok, növényvédőszerek és a vízigény egyidejű csökkentésével (Epso, 2005). Egy modern burgonyafajta sikeres termesztéséhez nem csupán a kártevőkkel szembeni ellenállóság elengedhetetlen, de a különböző betegségek ellen is magas rezisztenciával kell rendelkeznie, amit leggyakrabban a különböző Solanum fajokból eredeztethető allélek biztosítanak, továbbá magas terméshozamot kell produkálnia úgy, hogy mindeközben megőrizze a kiváló termésminőséget (Bradshaw és Mackey, 1994; Gorji et al., 2011). Ahhoz, hogy a burgonyatermesztést szélesebb körben változó környezeti tényezőknek megfelelően hosszabb vegetációs periódusokhoz alkalmazkodva kiterjeszthessük, kiemelt jelentőségű az is, hogy az adott burgonyafajta abiotikus stressz rezisztenciával rendelkezzen, így növelve a termés stabilitását, valamint számos termesztési körülményhez alkalmazkodva a termés mennyiségét és minőségét is. A burgonya genotípusok (Solanum spp.) ozmotikus stressz toleranciájának szabadföldi vizsgálata idő és 2
4 laborigényes folyamat, valamint az eredményeket számos környezeti és szabadföldi tényező zavarhatja (Ingram et al., 1994; Erusha et al., 2002; Iwama és Yamaguchi 2006; Georgieva et al., 2004). Az in vitro szövettenyészetekben elvégzett ozmotikus stressz szimulációk a különböző összetételű táptalajoknak köszönhetően minimalizálják a környezeti tényezőből adódó variabilitást és biztosítják a stressz kiváltás egyenletességét ellenőrzött körülmények között. Leport et al. (1993) tanulmányukban azt jósolták, hogy az in vitro alapú stressz tolerancia vizsgálatoknak a jövőben meghatározó szerepe lesz az optimális stressz-válasz reakciós stratégiai növényi rendszerek kialakításában. Szárazságtűrésre történő szelekció esetében a legalkalmasabb módszernek a regenerációs fázisban kiváltott ozmotikus stresszt találták (Hsissou and Bouharmont, 1994). Gopal és Iwama (2007) az ozmotikus stresszt burgonya esetében in vitro vizsgálatokban szorbitol és mannitol hozzáadása segítségével vizsgálta. Eredményeik azt mutatják, hogy a tenyészetekben kiváltott ozmotikus faktorok hátrányosan befolyásolják a növények növekedését, melyek genotípusonként eltérnek. Arra a következtetésre jutottak, hogy a burgonya célzott és korlátozott ozmotikus stressz körülmények között végzett in vitro vizsgálata egy olyan rendszert eredményezhet, amely segítségével effektíven elkülöníthetjük a genotípusokat és meghatározhatjuk a szabadföldi körülmények között várt gyökértömegüket. 3
5 A növények esetében ismeretes, hogy az ozmotikus stressz tolerancia egy kvantitatív úton öröklődő tulajdonság. Általában több kisebb kvantitatív tulajdonságért felelős lókusz (QTL) együttesen kontrolálja. Az azonosított QTLekhez kapcsolt markerek alléljeire alapozott marker alapú szelekcióval értékesebb fenotípusos tulajdonsággal rendelkező genotípusokat azonosíthatunk, melyek segíthetnek a magasabb ozmotikus stressz toleranciával rendelkező fajták nemesítésében (Bálint et al., 2008). Nemrég jelentős előrelépést értek el kvantitatív tulajdonságok térképezésének és kapcsoltságuk elemzésének elméleti hátterének fejlesztésében autotetraploid fajok esetében, ahol a két szülő keresztezéséből származó teljes testvér (full-sib) utódnemzedéket használtak (Luo et al. 2001; Hackett et al., 2001). Az olyan genetikai vagy DNS alapú marker technikákat, mint az RFLP (restriction fragment length polymorphism), RAPD (random amplified polymorphic DNA), SSR (simple sequence repeats), AFLP (amplified fragment length polymorphism) és ISSR (inter simple sequence repeats) rutinszerűen alkalmazzák a genetikai és kvantitatív tulajdonságok (QTL) térképezése és diagnosztikai genetikai ujjlenyomatok készítésére is. Továbbá sikeresen alkalmazzák a populáció genetikai, ökológiai, evolúció genetikai és molekuláris taxonómiai vizsgálatok során, valamint az olyan különböző szintekre kiterjedő növénytudományt érintő genetikai tanulmányokban is, mint a távolság- és parszimónia alapú filogenetikai 4
6 szisztematikai kutatások (Gupta et al., 1999; Bussell et al., 2005; Semagen et al., 2006; Mark et al., 2007; Agarwal et al., 2008). Ezek a technikák széles körben ismertek, mint ahogy előnyeik és hátrányaik is egyaránt. A molekuláris markerek számos előnnyel szolgálnak a konvencionális fenotípus alapú markerekkel szemben, mivel stabilak és minden szövetben detektálhatóak a növekedéstől függetlenül úgy, hogy a sejt differenciáltságát, fejlődését és védekezési állapotát nem zavarják a környezeti, pleiotrópikus és episztatikus hatások. Az utóbbi években új korszerűbb technikák egy csoportja alakultak ki, melyek elsődlegesen a korábbi alap módszerek kombinációján alapultak. Ezek a korszerűbb technikák számos alap technika előnyét egyesítik magukban. Ezek az újabb technikák az alap technikák metodikai módosításait is magukba foglalják azért, hogy növeljék a szenzitivitást, a genetikai diszkontinuitás és a különbségtétel detektálásának felbontóképességét. A korszerű marker technikák új DNS elemek sorát hasznosítják, mint a retrotranszpozonok, mitokondriális és kloroplasztisz alapú mikroszatellitek, így növelve a genetikai variabilitás felfedésének képességét a genom lefedésének növelésével egyetemben. A génexpresszió mintázatának és biológiai válaszreakciók genetikai alapjainak tanulmányozása során az olyan technikák, mint az RAPD és AFLP szintén használatosak cdns alapú templátok esetében. 5
7 2. Célkitűzések A jelenlegi tanulmány célkitűzései a következők voltak: 1) Olyan burgonya genotípusok létrehozása, amelyek a PVY rezisztencia gént (Ry) hetero multiplex formában hordozzák. 2) Az ISSR, RAPD és SCOT technikák polimorfizmus detektáló képességének összehasonlítása burgonyafajták és F1 genotípusok esetében. 3) Kapcsoltsági térkép szerkesztése tetraploid burgonyában különböző típusú markerek alapján. 4) Gént-célzó (intron-targeting) markerek azonosítása, melyek kapcsoltak a PVY NTN rezisztencia génnel (RY sto ) és alkalmazhatóak a burgonyanemesítési programokban 5) Genetikai markerek fejlesztése melyek kapcsoltak az ozmotikus stressz toleranciához tetraploid burgonyán végzett in vitro kísérletek során. 6) Új, IT-SCOT-nak nevezett gént-célzó markerek fejlesztése. 7) PVY NTN fertőzés során indukált gének részleges izolációja. 3. ANYAGOK ÉS MÓDSZEREK 3.1. Növényanyag Vizsgálataink során huszonnégy burgonyafajtát (1. táblázat) és 85 egy F 1 populációból véletlenszerűen kiválasztott - genotípust használtunk. Az F 1 genotípusokat a White Lady burgonyafajta (anyai partner) és az S440 vonal (apai partner) keresztezésével állítottuk elő a Burgonyakutatási Központban (Pannon Egyetem, Keszthely, Magyarország). A 6
8 szántóföldi megfigyelések alapján a szülőpartnerek eltérnek mind a szárazságtűrő képességükben (natural heat), mint a PVY NTN el szembeni rezisztenciájuk tekintetében. A WL rezisztens a PVY NTN törzsével szemben és toleráns a természetes hőséggel valamint a szárazság stresszel szemben is. Ellenben az S440 fogékony a PVY NTN törzsével szemben és alacsony toleranciát mutat a természetes hő és szárazság stresszekkel szemben is. 1. táblázat. A vizsgálatok során használt burgonya fajták, és eredetük. Cultivar Cultivar Cultivar Cultivar Gülbaba (HU) Sante (NL) Lorett (HU) Panda (G) Somogyi kifli (HU) Snowden (USA) S440 (USA) Lvovjanka (RU) Atlantic (USA) Franzi (G) WL (HU) Kennebec (USA) Desiree (NL) Agria (G) Irga (P) Linzer delicate (AU) Shepody (CA) Rioja (HU) Kondor (NL) Saturna (NL) Swiss (USA) Katica (HU) Cleopatra (NL) Vénusz Gold (HU) (G = Németország, HU = Magyarország, NL = Hollandia, CA = Kanada, P = Lengyelország, AU = Ausztria, RU = Oroszország és USA = Egyesült Államok) 3.2. Hetero-multiplex vizsgálatok Hét PVY rezisztens nemesítési vonalat ( , , , , , , ) kereszteztünk a PVY-al szemben fogékony S440 nemesítési vonallal. A pedigré adatok alapján a hét nemesítési vonal mindegyike valamilyen Ry 7
9 gént hordoz (S. stoloniferum (S.sto), S. hougasii (S.hou) and. S. andigena (S.and) feltehetően hetero-multiplex formában. A rezisztencia vizsgálatok során mindegyik család mintegy 200 genotípusát vizsgáltuk három ismétlésben, mechanikai inokulációval, melyet a PVY NTN törzsének D10 izolátumával végeztünk el. A vírus szintet a fertőzést követő 4. héten mértük DAS-ELISA technikával. Az Ry gén kópiaszámát a rezisztens és fogékony egyedek hasadási arányából határoztuk meg. Chi négyzet tesztet (X 2 ) használtuk a megfigyelt és a várt hasadási arány közötti hasonlóság bizonyítására A vírus fertőzöttség értékelése Double Sandwich ELISA (DAS-ELISA) technikával. Az inkubáció első lépésében a mikrotiter lemez felületét antigén specifikus antitesttel borítottuk. A második inkubációs lépés során az antigéneket kötöttük a már fixált antitestekhez, amelyek így egy antitest-antigén komplexet formáltak. A harmadik inkubációs lépés során az antitest-antigén komplexet reagáltattuk egy AP-jelölt antitesttel, amely így egy dupla antitest szendvicset formált. Pozitív és negatív kontrollt is használtunk a vizsgálataink során. Negatív kontrollként egy egészséges növény (White Lady) friss kivonatát használtuk. Az enzimatikus reakciót 405 nm-es hullámhosszon vizsgáltuk 2 óra elteltével. 8
10 3.4. Ozmotikus stressz vizsgálat A stresszre fogékony és toleráns szülők megkülönböztetéséhez először az in-vitro ozmotikus stressz körülményeit optimalizáltuk. Első lépésben 40 db három leveles hajtás csúcsot neveltünk alap MS táptalajon a WL-ből és az S440-ből is. Következő lépésben a növényeket egyedileg üvegekbe osztottuk szét, melyek 10 ml MS táptalajt tartalmaztak különböző mannitol koncentrációkkal (0 mint kontrol, 0,15 mol/dm3, 0,2 mol/dm3 and 0,3 mol/dm3, 10 növény/koncentráció) A növényeket 16/8 órás megvilágítási időtartammal neveltük 20oC-on. A vizsgálatokat teljesen véletlenszerű elrendezésben 10 ismétlésben és két faktorral végeztük. Tíz nap múlva felvételeztük a növényeken fejlődött gyökerek számát és a gyökér hosszt. A második kísérletben a WL és S440 keresztezésből származó 85 F1 genotípus stressz toleranciáját vizsgáltuk a fentebb leírt körülmények között, de csak 0,3 M mannitol koncentráción mivel ez a koncentráció okozott szignifikáns különbséget a két szülő között az első vizsgálatban Genomi DNS izolálás A genomi DNS-t in vitro növények 80 mg levél és szár szövetéből izoláltuk Walbot és Warren (1988) módosított eljárása (Gorji et al. nem publikált adat) alapján a következők szerint: 9
11 A növényi sejtek lízise és a fehérjék denaturálása 1. Dörzsmozsárban mg növényi szövetet összezúzunk folyékony nitrogén jelenlétében, vagy 1.5 ml-es centrifugacsőben kis mennyiségű kvarc homok hozzáadásával ml PCL ((100mM Tris HCL (ph 8), 50mM EDTA (ph 8), 1M NaCl and 1% PVP (polyvinyl- pyrrolidone)) oldatot és 80 µl 10 %-os SDS oldatot adunk az összezúzott mintákhoz. 3. A mintákat rövid ideig vortexeljük, majd 80 o C-on 45 percig inkubáljuk. Az inkubáció során 2-3 alkalommal megforgatjuk a mintákat. 4. Centrifugálás, rpm fordulaton 5 percig szobahőmérsékleten. 5. A felülúszót (600 µl) steril centrifuga csőbe pipettázzuk, majd 500µl izopropanolt és 150µl a fehérjék kicsapására szolgáló oldatot (7.5 M ammónium-acetát) adunk hozzá. A mintákat óvatosan megforgatva inkubáljuk őket -20 o C-on 30 percig. Az inkubáció 12 órára is kitolható. 6. Centrifugálás, rpm fordulaton, 10 percig. Tisztítás 7. A centrifugálást követően a felülúszót eltávolítjuk, majd a DNS pelletet 600µl TE pufferrel (10mM Tris- HCL, ph 8; 1mM EDTA, ph 8) visszaoldjuk. 10
12 8. 500µl CIA (chloroform : isoamyl alcohol = 24 : 1) adunk a mintákhoz, majd rázatjuk őket (10 perc, 90 rpm) 9. Centrifugálás, rpm fordulaton 5 percig ml 99.5%-os etanolt és 50µl 3M szódium acetátot adunk a mintához, majd óvatosan megforgatjuk a centrifugacsöveket. 11. Centrifugálás rpm fordulaton 10 percig. 12. A folyadékot eltávolítjuk majd a pelletet 400µl 70%- os etanollal feloldjuk. 13. Centrifugálás, rpm fordulaton, 5 percig. 14 A felülúszót leöntjük, a csapadékot megszárítjuk (a centrifuga csöveket szűrő papíron fejtetőre állítjuk) 15. A pelletet µl TE pufferrel visszaoldjuk RNS izolálás Az RNS és mikro RNS frakciók izolálásához az RNAzol RT oldatot használtuk. Az RNAzol RT fenol és guanidin segítségével, egyetlen lépésben választja el az RNS-t az egyéb sejtalkotóktól. A nem kloroform indukált fázis eltávolítása elengedhetetlen a tiszta RNS kinyeréséhez, ezért a növényi mintát homogenizáltuk és feltártuk az oldat segítségével. A DNS, fehérje, poliszacharid fázisok és egyéb növényi részek homogén mintából történő eltávolítását víz hozzáadásával és centrifugálással végeztük. A tiszta RNS-t alkoholos kicsapással 11
13 a felülúszó folyadékból nyertük, amit újabb tisztítási fázis és a kinyert anyag feloldása követett. Az RNS és mikro RNS frakciók szétválasztásának folyamata: 1. Homogenizáció- 1 ml RNAzol RT + max. 100 mg növényi szövet. 2. DNS/fehérje kicsapás - homogenizátum ml víz, 5 15 perc várakozási idő, centrifugálás 12,000 g x 15 min. 3. mrns kicsapás - 1 ml felülúszó ml 75%-os etanol, 10 perc várakozási idő, centrifugálás 12,000 g x 8 min. 4. mrns mosása ml 75% etanol, centrifugálás 8,000 g x 1 3 min; kétszer ismételve. 5. RNS visszaoldása vízben. 6. Mikro RNS kicsapás a 3. lépésben nyert mrns felülúszó egység izopropanol, 30 perc várakozási idő, centrifugálás 12,000 g x 15 min. 7. Mikro RNS tisztítása ml 70% izopropanol, centrifugálás 8,000 g x 3 min, kétszer ismételve. 8. RNS visszaoldása vízben Molekuláris marker vizsgálatok IT, IT-SCoT, SSCP, SCoT, SCAR, SSR, ISSR és RAPD primerek felhasználásával polimorf fragmentumokat kerestünk Eppendorf Mastercycler ep 384 (Eppendorf, Németország) és 12
14 Robocycler (Stratagene, USA) típusú PCR gépek segítségével. Az egyes módszerek rövid leírása a következőkben olvasható: Intron targeting (IT) Az EST szekvenciák azonosítása Összesen 700 S. tuberosum ismeretlen exon-intron összetételű EST szekvenciát, illetve 200 ismert rezisztencia mechanizmussal és tisztázott anyagcsere folyamatokkal rendelkező burgonya gén szekvenciát gyűjtöttünk ki a National Center for Biotechnology Information (NCBI) dbest adatbázisából blastx, blastn vagy tblastx keresők alkalmazásával. A génszekvenciák esetében elsősorban egy- vagy alacsony kópiaszámban előforduló géneket céloztunk meg. Azokban az esetekben, melyekben a gének exon-intron szerkezete ismert volt, primereket terveztünk az exonokból indulva úgy, hogy a közrefogott intronok szaporodjanak fel. Azokat a génszekvenciákat, melyeknek ismeretlen volt az exonintron struktúrája, és azokat a burgonya EST-ket melyek nagy hasonlóságot mutattak a más szervezetekben felfedezett génekkel (elsősorban paradicsom és Arabidopsis thaliana) további elemzés alá vetettünk. Az elemzéseket a 2010 augusztusában az NCBI nyilvános adatbázisában elérhető lehetséges (vélelmezett) exon-intron szekvenciákhoz igazítottuk. Ezt úgy valósítottuk meg, hogy sorba rendeztük az átíródott szekvenciákat, melyeket összehasonlítottunk a szülői genom 13
15 szekvenciákkal, annak érdekében, hogy azonosítsuk a tényleges exon-intron kapcsolódási pontokat. Előnyben részesítettük a bp hosszúságú termékeket, és ez alapján szűrtük az ennek megfelelő exonokat. Az intronok pontos pozícionálása után a PRIMER 3 nevű program segítségével oligonukleotidokat terveztünk az exon szekvenciákra. ( IT elemzés A PCR reakciókat 12 μl végtérfogatú oldattal végeztük. A PCR reakció elegy tartalma: 40 ng DNS templát, 1.2 μl mindegyik 10 M-os 12-mer primerből, 1.2 μl 2 mm-os dntp (Fermentas, Lithuania), 1.5 μl a 10x PCR buffer -ből(1 mm Tris-HCl, ph 8.8 at 25 C, 1.5 mm MgCl 2, 50 mm KCl and 0.1% Triton X-100) és 0.29U a DyNazyme II (Finnzymes, Finnország) polimeráz enzimből. A reakciókat a következő profillal indítottuk el: 3 perc 94 C-on, ezt követte 35 cikluson keresztül 94 C 1 min, 51 C 1 perc és 72 C 1 min. A végső extenziós lépés 72 C 10 min. A felszaporított PCR termékeket 5 μl BPB oldattal festettük meg (99.5% de-ionizált formamid, 10 mm EDTA ph 8, 0.05% brómfenol-kék, xylén-cyanol festék, 1 μl steril H 2 O) és 1,5%-o agaróz gélen (Promega, USA) választottuk szét, 0.5x TBE (Tris-HCl, Boric acid, EDTA) oldatban. Az elektroforézis után az amplifikálódott fragmenteket etídium-bromid festékkel tettük láthatóvá és GenGenius Bio 14
16 Imaging System (Syngene, UK) géldokumentációs rendszer segítségével dokumentáltuk IT-SCoT markerek Az IT-SCoT markereket laboratóriumunkban fejlesztettük úgy, hogy kombináltuk három markertípus - az IT, SCoT (Start Codon Targeted) és a TRAP (Target Region Amplified polymorphism) előnyeit. Negyven, ismert rezisztencia mechanizmusú, anyagcseréjű és kromoszómális helyzetű burgonya gént választottunk az IT primerek tervezéséhez. A lehetséges exon és intron szekvenciák azonosítása után primer párokat terveztünk a burgonya gének exon részének ATG start codon elnevezésű, rövid, konzervatív régiójára, melyek így csak egy vagy maximum két intron régiót céloztak. Ez a technika nevezhető SCoT-nak, ha a primereket egymagukban használjuk, IT-nek, ha párban használjuk és TRAP-nak is, ha az egyedülálló primert valamely más random primerrel állítjuk párba (pl. ISSRrel). A PCR reakcióelegy, az amplifikáció feltételei, az elemzés és a dokumentáció megegyezett az IT és SCoT primereknél említettekkel SSCP analízis Az SSCP vizsgálathoz azt a negyven IT primert használtuk, amelyek egy fragmentumot és monomorf mintázatot adtak az IT vizsgálat során. A PCR reakció profilja és az összetétele 15
17 megegyezik az IT primereknél alkalmazottakkal. A reakciót követően a PCR termékből 4 μl-t a következő összetételű oldattal (95% formamid, 10 mm NaOH és 0.05% os brómfenolkék) festettük meg. Az amplifikált PCR termékeket 95 C-on 5 percig denaturáltuk és azonnal 3 percig jégen hűtöttük. A denaturált minták elválasztásához 0.5 mm x 28.5 cm x 20cm denaturálatlan poli-akrilamid gélt alkalmaztunk. Az elektroforézist 1x TBE oldattal, szobahőmérsékleten, óra alatt végeztük el. A fragmentumokat módosított ezüst festéses eljárással (Bassam et al. 1991) tettük detektálhatóvá SCOT analízis A vizsgálat során 12 SCoT primerből, 15 véletlenszerűen összekombinált primer párt alkalmaztunk az ujjlenyomat készítéséhez. A primer párokat azokból a primerekből képeztük, amelyek az előzetes vizsgálatok során nagyfokú polimorfizmust mutattak. A PCR reakciót az Eppendorf Mastercycler 384-es készülékben végeztük el, mintánként 12 μl reakcióeleggyel, amely a következő komponenseket tartalmazta: 40 ng DNS templát, 1,2 μl a primer pár mindkét 10 μm-os tagjából, 1,2 μl 2 mm dntp (Fermentas,Lithuania), 1,5 μl 10xPCR puffer (1 mm Tris-HCl, ph 8.8, 1.5 mm MgCl 2, 50 mm KCl and 0.1% Triton X-100) és 0,29 U DynaZyme II (Finnzymes, Finland) polimeráz enzim. A PCR reakció profil a következő volt: 94 C 4 perc, 35 ciklus: 94 C 30 másodperc, 50 C 1 perc, 72 C 2 perc és a végső 16
18 extenzió 72 C 5 perc. A PCR termékeket mintánként 5 μl brómfenol-kék festékkel (99.5 % formamid, 10 mm EDTA ph 8, 0.05% brómfenol-kék, xilén-cyanol, 1 μl sterilizált víz) festettük meg és 1.5% agaróz gélen (Promega, USA) 0.5x TBE pufferben (Tris-HCl, Boric acid, EDTA) választottuk el. A géleket elektroforézis után etídium-bromiddal festettük, majd a kapott mintázatot a GenGenius Bio Imaging System (Syngene, UK) géldokumentációs rendszer segítségével detektáltuk és dokumentáltuk SCAR analízis A PCR reakció összetétele az amplifikálódott termékek dokumentálása és elemzése megegyezik a már leírt IT primerekével. A PCR reakció paraméterei a következőek voltak: 94 C 1 perc, 35 ciklus: 94 C 30 másodperc, 54 C 1 perc, 72 C 1 perc, majd egy végső extenziós lépés 72 C 10 percig. A primereket Cernák et al.(2008) tervezték SSR analízis A vizsgálat során a burgonya genom XI és XII kromoszómájára lokalizált SSR markereket (Milbourne et al., 1998) teszteltük le. A PCR reakciót a Robocycler (Stratagene, USA) készülékben végeztük el mintánként 25 μl reakció eleggyel, mely a következő komponenseket tartalmazta: 50 ng DNS, 0.5 μl 10 mm dntp (Fermentas, Litvánia), 2.5 μl 10x 17
19 Taq puffer, 2 μl 25mM MgCl 2, 1μl 10 μm primer páronként, 0.5 u Taq DNS polimeráz enzim. A PCR reakcióhoz a következő programot alkalmaztuk: 94 C 4 perc,35 ciklus: 94 C 30 másodperc, 51 C 30 másodperc,72 C 1 perc és a végső extenziós lépés 72 C 5 perc. A kapott termékeket 1.5% agaróz gélen (Promega, USA) 0.5x TBE pufferben választottuk el, majd etídium-bromiddal festettük ISSR analízis Az ISSR analízist 15 primerrel végeztük el. A PCR elegy összetétele megegyezett a SCoT analízisnél használtakkal, azzal az egy kivétellel, hogy a primerből 2.4 μl mennyiséget használtunk. A PCR reakció a következő beállításokkal zajlott le: 94 C 2 perc, 35 ciklus: 94 C 30 másodperc, 50 C 1 perc, 72 C 2 perc, majd 72 C 5 perc. A primerek kapcsolódási hőmérséklete az UBS835, UBS841, UBS842 és UBS844 primerek esetében 55 C volt. A PCR reakció során felszaporodott fragmentumokat 1.5%-os agaróz gélen TBE bufferben választottuk el, majd etídium-bromidos festéssel tettük detektálhatóvá és a GenGenius Bio Imaging System (Syngene, UK) géldokumentációs rendszerrel dokumentáltuk RAPD analízis A vizsgálatot megelőzően, azért hogy a legjobban alkalmazható primereket válasszuk ki, 50 RAPD primert 18
20 teszteltünk le a WL és S440 szülőkön, valamint keresztezésükből származó 6 egyeden (3 rezisztens és 3 fogékony a burgonya Y vírusra). Ennek eredményeképp olyan 15 primer párt választottunk ki amelyek megismételhető eredményt adtak. A reakció elegy mennyisége mintánként és az összetétele is megegyezik a SCoT analízisnél leírtakkal. A PCR profil a következő volt: 94 C 4 perc, 35 ciklus 94 C 30 másodperc, 37 C 1 perc, 72 C 2 perc, a végső lépés pedig, 72 C 5 perc. A PCR termékek detektálása és dokumentálása megegyezik a SCoT vizsgálatnál alkalmazottakkal Kapcsoltsági térkép szerkesztése Előzetesen klaszter vizsgálatot végeztünk a szülőkön a szimplexnek minősülő markerekkel. Ezután az összes szimplex, duplex és multiallélikus markerrel csoport analízist végeztünk kapcsoltsági csoportokba (LG) rendezés céljából (Luo et al., 2001). A markereket a két szülőn külön vizsgáltuk. Mindegyik LG rekombinánciós gyakoriságát és LOD értékét minden marker pár vonatkozásában kalkuláltuk a Luo és mtsai (2001) által leírt algoritmus segítségével. Permutációs teszttel (Churchill és Doerge, 1994) 99%-os küszöböt állítottunk fel a simlex és duplikált simplex kapcsolat megállapítására. A Tetraploidmap szoftverrel (Hackett és Luo, 2003) elemeztük az adatokat. 19
21 3.9. Szubtraktív hibridizáció Az RNS tisztítást, cdns szintézist, a szubtraktív hibridizálásokat és minden egyéb lépést a PCR-Select cdna subtraction kit gyártójának (Clontech, USA) útmutatása szerint végeztünk. A szubtraktált termékeket Clonejet PCR klónozó kittel (Fermentas, Litvánia) molekulárisan klónoztuk Adat elemzés A PCR termékeket az adott pozíciókban lévő jelenlétük (1) illetve hiányuk (0) alapján bináris mátrixban regisztráltuk. Csak a tisztán kivehető, egyértelműen értékelhető sávokat vettük számításba. Feltételeztük, hogy az együtt migráló fragmentumok analóg lókuszokból származnak. A Jaccard hasonlóság mátrix, Shannon log2 alapján kalkulált információs index, variancia (Bowman et al., 1969), AMOVA (analysis of molecular variance) és PCOA (principal coordinate analysis) vizsgálatokat FAMD 1.23β (Schluter és Harris, 2006) programmal végeztük. Dendrogram szerkesztéshez a távolság mátrixot a Neighbor- Joining módszerrel kalkuláltuk. A bootstrap vizsgálatot 2000 replikációban a Splits Tree4 program (Huson and Bryant, 2006) segítségével végeztük. A primerek polimorfizmus detektáló erejét (resolving power) (rp), a polimorf információs tartalmat (polymorphic information content) (pic), marker indexet (mi), és a diverzitás indexet (di) kalkuláltuk. A QTL vizsgálatot és a permutációs tesztet a Tetraploidmap szoftverrel végeztük 20
22 (Hackett és Luo, 2003). A statisztikai elemzéseket az SPS v11.5 és SAS v8 rendszerekkel hajtottuk végre. 21
23 4. Új tudományos eredmények 1) Azonosítottunk egy heterotriplex szülői vonalat, mely S. stoloniferum, S. tuberosum, ssp. andigena és a S. hougasii vad burgonya fajokból származó Ry gént hordoz. 2) A klaszter mintázat összehasonlítása azt muatta, hogy a SCoT marker hely specifitása (a fajta származási helye vonatkozásában) magasabb mint a többi markeré, mivel különbséget tudott tenni a fajták között nemcsak azok rokonsági foka, de a kibocsátás helye szerint is. 3) Eredményeink alapján megállapítható, hogy a SCoT, ISSR és RAPD markerek hatékonysága az F1 populáció vizsgálatában nagyjából azonos, azonban a burgonyafajták megkülönböztetésében a SCoT technika hatékonyabb a másik két eljárásnál. 4) Egy új markerezési eljárást, nevezetesen az IT-SCoT technikát fejlesztettük ki, mely az IT, SCoT és TRAP technikák előnyeit kombinálja. 5) A White Lady vonatkozásában 13, míg az S440 esetében 14 kapcsoltsági csoportot (LG) állítottunk fel a duplikált szimplex markerek kizárása után. A kapcsoltsági csoportok közül három, a VII, XI és XII burgonya 22
24 kromoszómákkal mutatott azonos markereket, míg két másik LG valószínűsíthetően a IX kromoszómához köthető. A XII kromoszómát azonosító kapcsoltsági csoport esetében egy IT és egy SSR marker is valószínűsíti az azonosságot. 6) Az in vitro ozmotikus stressz tolerancia vizsgálatok során 14 QTL-t (LOD>2) azonosítottunk. Ezek közül 6 darab (3 a gyökér hosszúsággal, 3 pedig a gyökér számmal kapcsolt) fő QTL-nek bizonyult a permutációs teszt alapján. A gyökér hosszra egy QTL-t azonosítottunk a XII kromoszómán mely a fenotipikus variancia 52.3%-át magyarázza. A gyökér számra egy, a fenotipikus variancia 19,2%-át magyarázó QTL-t azonosítottunk a IX kromoszómán, illetve a XII kromoszómán egy másik azonosított QTL a fenotipikus variancia 26,8%-át magyarázza (LOD=2.4). 7) Az azonosított fő QTL-ek mindegyivel 2-4 cm távolságra kapcsolt markereket azonosítottunk. E markerek az in vitro eredmények 40-55%-át igazolták. 8) A gyökér hossz és gyökér szám QTL-einek kapcsoltsága a két tulajdonság asszociációjára utal. 23
25 5. Irodalomjegyzék Agarwal, M., Neeta, S., and Harish, P. (2008) Advances in molecular marker techniques and their applications in plant sciences. Plant Cell Rep 27: Bálint, A. F., Szira, F., Börner, A., and Galiba, G. (2008) Segregation- and association based mapping of loci influencing osmotic tolerance in barley. Acta Biologica Szegediensis, 52 (1): Bassam, B.J., Caetano-Anolles, G., and Gresshoff, P.M. (1991) Fast and sensitive silver staining of DNA in polyacrylamide gels, Anal. Biochem Bowman, K.O., Hutcheson, K., Odum, E.P., and Shenton, L.R. (1969) Comments on the distribution of indices of diversity, Proc. Intl. Symp. Stat. Ecol 3: Bradshaw, J.E., and Mackay, G.R. (eds) (1994) Potato Genetics. CAB International, Wallingford, Bussell, J.D., Waycott, M., and Chappill, J.A. (2005) Arbitrarily amplified DNA markers as characters for phylogenetic inference. Persp Plant Ecol Evol Syst 7:3-26. Cernak, I., Decsi, K., Sandor, N., Istvan, W., Polgar, Z., Gergely, G., Yataka, H., and Taller, J. (2008) Development of a locusspecific marker and localization of the Ry sto gene based on 24
26 linkage to a catalase gene on chromosome XII in the tetraploid potato genome. Breeding Science, 58: Churchill, G.A., and Doerge, R.W. (1994) Empirical threshold values for quantitative trait mapping. Genetics 138: EPSO (2005) European plant science: a field of opportunities. Journal of Experimental Botany, 417: Erusha, K.S., Shearman, R.C., Roirdan, T.P., and Wit, L.A. (2002) Kentucky bluegrass cultivar root and top growth responses when grown in hydroponics. Crop Sci. 42: Georgieva, M., Djilianov, D., Konstantinova, T., and Parvanova, D. (2004) Screening of Bulgarian raspberry cultivars and elites for osmotic tolerance in vitro. Biotechnol. & Biotechnol. Eq Ghislain, M., Zhang, D., Fajardo, D., Huamann, Z., and Hijmans, R.H. (1999) Marker-assisted sampling of the cultivated Andean potato Solanum phureja collections using RAPD markers. Genet Resour. Crop Evol., 46, Gopal, J., and Iwama, K. (2007) In vitro screening of potato against water-stress mediated through sorbitol and polyethylene glycol. Plant Cell Rep, 26: Gorji, M.,A., Wolf, I., Decsi, K., Taller, J., Ahmadvand, R., and Polgár, Z. (2011) Development of hetero multiplex potato genotypes carrying PVY resistance genes, IX, Magyar Genetikai Kongresszus es XVI, Sejt-es Fejlődésbiológiai Napok, pp
27 Gupta, P.K., Varshney, R.K., Sharma, P.C., and Ramesh, B. (1999) Molecular markers and their application in wheat breeding. Plant breed 118: Hackett, C.A., Bradshaw, J.E., and McNicol, J.W. (2001) Interval mapping of QTLs in autotetraploid species. Genetics 159: Hackett, C.A., and Luo, Z.W. (2003) TetraploidMap: construction of a linkage map in autotetraploid species. J Hered 94: Hackett, C.A., Pande, B., and Bryan, G.J. (2003) Constructing linkage maps in autotetraploid species using simulated annealing. Theor Appl Genet 106: Hsissou, D., and Bouharmont, J. (1994) In vitro selection and characterization of drought-tolerant plants of durum wheat (Triticum durum Desf) Agronomy, 2: Huson, D.H., and Brayant, D. (2006) Application of phylogenetic networks in evolutionary studies, Molecular Biology and Evolution, 23 (2): Ingram, K.T., Bueno, F.D., Namuco, O.S., Yambao, E.B., and Beyrouty, C.A. (1994) Rice root traits for drought resistance and their genetic variation. In: KirkGJD (ed) Rice roots: nutrient and water use. IRRI, Manila, Philippines, pp
28 Iwama, K., and Yamaguchi, J. (2006) Abiotic stresses. In: Gopal J, Khurana SM Paul (eds) Handbook of potato production, improvement and postharvest management. Food Product Press, New York, pp Knight, T.A. (1807) On raising of new and early varieties of the potato (Solanum tuberosum). Trans Hort Soc Lond 1: Leport, L., Petrivalsky, M., and Chappart, M. (1993) Effectors for the osmoinduced proline response in higher plants. Plant Physiol Biochem 31: Luo, Z.W., Hackett, C.A., Bradshaw, J.E., McNicol, J.W., and Milbourne, D.M. (2001) Construction of a genetic linkage map in tetraploid species using molecular markers. Genetics 157: Mark, P.S., Li-Bing, Z., Colleen, T.W., and Kai, M. (2007) A penalty of using anonymous dominant markers (AFLPs, ISSRs, and RAPDs) for phylogenetic inference. Molecular phylogenetics and Evolution 42: Prevost, A., and Wilkinson, M. J. (1999) A new system of comparing PCR primers applied to ISSR fingerprinting of potato cultivars, Theor Appl Genet 98: Semagen, K., Bjornstad, A., and Ndjiondjop, M.N. (2006) An overview of molecular marker methods for plants. Afr J Biotechnol 5:
29 Schluter, P.M., and Harris, S.A. (2006) Analysis of multilucous fingerprinting data sets containing missing data. Mol. Notes: 6: Stam, P. (1993) Construction of integrated genetic linkage maps by means of a new computer package: Joinmap. Plant J 3: Walbot, V., and Werren, C. (1988) Regulation of Mu element copy number in maiz line with an active or inactive mutator transposonable element system. Mol Gen Genet 211: Publikációs lista Lektorált folyóirat cikkek: Gorji, M.A., Poczai, P., Polgar, Z., and Taller, J. (2011): Efficiency of arbitrarily amplified dominant markers (SCoT, ISSR and RAPD) for diagnostic fingerprinting in tetraploid potato. American Journal of Potato Research, pp Doi: /s Gorji, M.A., and Polgar Z. (2010) Application of genetic engineering in potato breeding, Acta Agronomica Hungarica, 58(4), pp
30 Poczai, P., Cernák, I., Gorji, M.A., Nagy, S., Taller, J., and Polgár, Z. (2010) Development of intron targeting (IT) markers for potato and cross-species amplification in Solanum nigrum (Solanaceae). American Journal of Botany, 97: e142-e145. Konferencia összefoglalók: Gorji, M.A., Wolf, I., Decsi, K., Taller, J., Ahmadvand, R., and Polgár, Z. (2011) Development of hetero multiplex potato genotypes carrying PVY resistance genes. IX., Magyar Genetikai Kongresszus és XVI.,Sejt-és Fejlődésbiológiai Napok, pp Decsi K., Gorji, M.A., Taller, J., Cernák, I., Wolf, I., and Polgár, Z. (2011) Burgonya fitoftóra rezsztencia gén molekuláris markerezése és térképezése. IX., Magyar Genetikai Kongresszus és XVI.,Sejt-és Fejlődésbiológiai Napok, pp
SZAKMAI ZÁRÓJELENTÉS
SZAKMAI ZÁRÓJELENTÉS a Solanum stoloniferum alapú PVY immunitás gén (Rysto) molekuláris genetikai vizsgálata című tematikus OTKA pályázatról Nyilvántartási szám: TO37827 Keszthely 2002-2005. Zárójelentés
RészletesebbenMarkerek alkalmazhatósága a burgonya X és Y vírus, valamint fonálféreg rezisztenciára történő szelekciójában
Esztergályos Ádám 1 Cernák István 2 Polgár Zsolt 3 Hoffmann Borbála 4 Markerek alkalmazhatósága a burgonya X és Y vírus, valamint fonálféreg rezisztenciára történő szelekciójában Marker applicability for
RészletesebbenAZ ALACSONY HŐMÉRSÉKLET HATÁSÁRA BEKÖVETKEZŐ REDOX ÉS GÉNEXPRESSZIÓS VÁLTOZÁSOK GABONAFÉLÉKBEN
A martonvásári agrárkutatások hatodik évtizede AZ ALAONY HŐMÉRSÉKLET HATÁSÁRA BEKÖVETKEZŐ REDOX ÉS GÉNEXPRESSZIÓS VÁLTOZÁSOK GABONAFÉLÉKBEN KOY GÁBOR, VÁGÚJFALVI ATTILA, TÓTH BALÁZS, SZALAI GABRIELLA,
RészletesebbenAZ ÁRPA SZÁRAZSÁGTŰRÉSÉNEK VIZSGÁLATA: QTL- ÉS ASSZOCIÁCIÓS ANALÍZIS, MARKER ALAPÚ SZELEKCIÓ, TILLING
Hagyomány és haladás a növénynemesítésben AZ ÁRPA SZÁRAZSÁGTŰRÉSÉNEK VIZSGÁLATA: QTL- ÉS ASSZOCIÁCIÓS ANALÍZIS, MARKER ALAPÚ SZELEKCIÓ, BÁLINT ANDRÁS FERENC 1, SZIRA FRUZSINA 1, ANDREAS BÖRNER 2, KERSTIN
RészletesebbenNagy Emese: Polimorfizmus és rokonsági körök vizsgálata kukoricában (Zea mays) Témavezetők: Cs. L. Marton G Gyulai
Nagy Emese: Polimorfizmus és rokonsági körök vizsgálata kukoricában (Zea mays) Témavezetők: Cs. L. Marton G Gyulai BEVEZETÉS A molekuláris biológiai és genetikai módszerek gyors fejlődése egyre inkább
RészletesebbenConserved ortholog set (COS) markerek térképezése Aegilops kromoszómákon
Conserved ortholog set (COS) markerek térképezése Aegilops kromoszómákon Rövid tanulmányút 2011. 01.03-03. 30., John Inn Centre, Dept. of Crop Genetics, Norwich Research Park, Norwich NR4 7UH, UK Supervisor:
RészletesebbenDiagnosztikai célú molekuláris biológiai vizsgálatok
Diagnosztikai célú molekuláris biológiai vizsgálatok Dr. Patócs Attila, PhD MTA-SE Molekuláris Medicina Kutatócsoport, Semmelweis Egyetem II. sz. Belgyógyászati Klinika Laboratóriumi Medicina Intézet Genetikai
RészletesebbenBakteriális identifikáció 16S rrns gén szekvencia alapján
Bakteriális identifikáció 16S rrns gén szekvencia alapján MOHR ANITA SIPOS RITA, SZÁNTÓ-EGÉSZ RÉKA, MICSINAI ADRIENN 2100 Gödöllő, Szent-Györgyi Albert út 4. info@biomi.hu, www.biomi.hu TÖRZS AZONOSÍTÁS
Részletesebben2011. január április 10. IPK Gatersleben (Németország) május 17. Kruppa Klaudia
2011. január 10. 2011. április 10. IPK Gatersleben (Németország) Gatersleben (G-life) Country State District Town Administration Germany Saxony-Anhalt Salzlandkreis Seeland Basic statistics Area 16.00
RészletesebbenDNS-szekvencia meghatározás
DNS-szekvencia meghatározás Gilbert 1980 (1958) Sanger 3-1 A DNS-polimerázok jellemzői 5'-3' polimeráz aktivitás 5'-3' exonukleáz 3'-5' exonukleáz aktivitás Az új szál szintéziséhez kell: templát DNS primer
RészletesebbenMivel korábban már végeztünk mikroszatellit elemzést (Liker et al 2009), a kiértékeléshez szükséges szoftverek és tapasztalat rendelkezésre áll.
Genetikai változatosság (állat csoportok) Pénzes Zsolt, Bihari Péter és Raskó István SZBK Genetika Intézet A pályázati munkatervnek megfelelően első évben elsősorban a részletes elemzésre kiválasztott
RészletesebbenDNS molekulák elválasztása agaróz gélelektroforézissel és kapilláris elektroforézissel
DNS molekulák elválasztása agaróz gélelektroforézissel és kapilláris elektroforézissel Gyakorlat helye: BIOMI Kft. Gödöllő, Szent-Györgyi A. u. 4. (Nemzeti Agrárkutatási és Innovációs Központ épülete volt
RészletesebbenBEVEZETÉS CÉLKITŰZÉS
BEVEZETÉS A molekuláris biológiai és genetikai módszerek gyors fejlődése egyre inkább tért hódít a növénynemesítés különböző területein, így a kukoricanemesítésben is. A növényi fenotípusos jellemzők és
RészletesebbenAlgaközösségek ökológiai, morfológiai és genetikai diverzitásának összehasonlítása szentély jellegű és emberi használatnak kitett élőhelykomplexekben
Algaközösségek ökológiai, morfológiai és genetikai diverzitásának összehasonlítása szentély jellegű és emberi használatnak kitett élőhelykomplexekben Duleba Mónika Környezettudományi Doktori Iskola I.
RészletesebbenGenetikai panel kialakítása a hazai tejhasznú szarvasmarha állományok hasznos élettartamának növelésére
Genetikai panel kialakítása a hazai tejhasznú szarvasmarha állományok hasznos élettartamának növelésére Dr. Czeglédi Levente Dr. Béri Béla Kutatás-fejlesztés támogatása a megújuló energiaforrások és agrár
Részletesebbenmintasepcifikus mikrokapilláris elektroforézis Lab-on-Chip elektroforézis / elektrokinetikus elven DNS, RNS, mirns 12, fehérje 10, sejtes minta 6
Agilent 2100 Bioanalyzer mikrokapilláris gélelektroforézis rendszer G2943CA 2100 Bioanalyzer system forgalmazó: Kromat Kft. 1112 Budapest Péterhegyi u. 98. t:36 (1) 248-2110 www.kromat.hu bio@kromat.hu
RészletesebbenMolekuláris biológiai eljárások alkalmazása a GMO analitikában és az élelmiszerbiztonság területén
Molekuláris biológiai eljárások alkalmazása a GMO analitikában és az élelmiszerbiztonság területén Dr. Dallmann Klára A molekuláris biológia célja az élőlények és sejtek működésének molekuláris szintű
RészletesebbenDOKTORI (PHD) ÉRTEKEZÉS CERNÁK ISTVÁN
DOKTORI (PHD) ÉRTEKEZÉS CERNÁK ISTVÁN KESZTHELY 2008 2 PANNON EGYETEM GEORGIKON MEZŐGAZDASÁGTUDOMÁNYI KAR Növénytudományi és Biotechnológia Tanszék Növénytermesztés és Kertészeti Tudományok Doktori Iskola
RészletesebbenUNIVERSITY OF PANNONIA GEORGIKON FACULTY OF AGRICULATURAL SCIENCES KESZTHELY. PhD SCHOOL OF CROP PRODUCTION AND HORTICULTURAL SCIENCES
UNIVERSITY OF PANNONIA GEORGIKON FACULTY OF AGRICULATURAL SCIENCES KESZTHELY PhD SCHOOL OF CROP PRODUCTION AND HORTICULTURAL SCIENCES SUMMARY OF PhD THESIS Development of molecular markers to the potato
RészletesebbenEvolúcióbiológia. Biológus B.Sc tavaszi félév
Evolúcióbiológia Biológus B.Sc. 2011. tavaszi félév A biológiában minden csak az evolúció fényében válik érthetővé Theodosius Dobzhansky : Nothing in biology makes sense except in the light of evolution.
RészletesebbenA kukorica vízfelhasználása. Összefoglalás. Summary. Bevezetés
A kukorica vízfelhasználása Rajkainé Végh Krisztina Rajkai Kálmán Talajtani és Agrokémiai Kutató Intézet, Budapest E-mail: krvegh@rissac.hu Összefoglalás Két kétvonalas hibridkukorica és négy beltenyésztett
Részletesebben10. CSI. A molekuláris biológiai technikák alkalmazásai
10. CSI. A molekuláris biológiai technikák alkalmazásai A DNS mint azonosító 3 milliárd bázispár az emberi DNS-ben (99.9%-ban azonos) 0.1%-nyi különbség elegendő az egyedek megkülönböztetéséhez Genetikai
RészletesebbenPANNON EGYETEM GEORGIKON KAR
PANNON EGYETEM GEORGIKON KAR NÖVÉNYTERMESZTÉSI ÉS KERTÉSZETI TUDOMÁNYOK DOKTORI ISKOLA Iskolavezető: Dr. Kocsis László, DSc DOKTORI (PhD) ÉRTEKEZÉS TÉZISEI BURGONYA REZISZTENCIAGÉNEK VIZSGÁLATA, KÜLÖNÖS
RészletesebbenÁLLATTENYÉSZTÉSI TUDOMÁNYOK DOKTORI ISKOLA Doktori Iskola vezető: Dr. Bánszki Tamás, MTA doktora. Témavezetők: mezőgazdaság-tudomány kandidátusa
DEBRECENI EGYETEM AGRÁRTUDOMÁNYI CENTRUM MEZŐGAZDASÁGTUDOMÁNYI KAR ÁLLATTENYÉSZTÉS- ÉS TAKARMÁNYOZÁSTANI TANSZÉK ÁLLATTENYÉSZTÉSI TUDOMÁNYOK DOKTORI ISKOLA Doktori Iskola vezető: Dr. Bánszki Tamás, MTA
RészletesebbenADATBÁNYÁSZAT I. ÉS OMICS
Az élettudományi-klinikai felsőoktatás gyakorlatorientált és hallgatóbarát korszerűsítése a vidéki képzőhelyek nemzetközi versenyképességének erősítésére TÁMOP-4.1.1.C-13/1/KONV-2014-0001 ADATBÁNYÁSZAT
RészletesebbenEngedélyszám: 18211-2/2011-EAHUF Verziószám: 1. 2460-06 Humángenetikai vizsgálatok követelménymodul szóbeli vizsgafeladatai
1. feladat Ismertesse a gyakorlaton lévő szakasszisztens hallgatóknak a PCR termékek elválasztása céljából végzett analitikai agaróz gélelektroforézis során használt puffert! Az ismertetés során az alábbi
RészletesebbenA szamóca érése során izolált Spiral és Spermidin-szintáz gén jellemzése. Kiss Erzsébet Kovács László
A szamóca érése során izolált Spiral és Spermidin-szintáz gén jellemzése Kiss Erzsébet Kovács László Bevezetés Nagy gazdasági gi jelentıségük k miatt a gyümölcs lcsök, termések fejlıdésének mechanizmusát
RészletesebbenAz Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP-4.1.2-08/1/A-2009-0010 projekt
Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP-4.1.2-08/1/A-2009-0010 projekt ÁLLATGENETIKA Debreceni Egyetem Nyugat-magyarországi Egyetem Pannon Egyetem A projekt az Európai Unió támogatásával, az
RészletesebbenÚj temékek az UD-GenoMed Kft. kínálatában!
Új temékek az UD-GenMed Kft. kínálatában! Műanyag termékek: SARSTEDT műanyag termékek teljes választéka Egyszer használats labratóriumi műanyag eszközök szövet és sejttenyésztéshez Vérvételi és diagnsztikai
RészletesebbenNÖVÉNYGENETIKA. Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP /1/A
NÖVÉNYGENETIKA Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP-4.1.2-08/1/A-2009-0010 A citológia és a genetika társtudománya Citogenetika A kromoszómák eredetét, szerkezetét, genetikai funkcióját,
RészletesebbenMIKROSZKÓPIKUS GOMBÁK MIKOTOXIN-BONTÓ KÉPESSÉGÉNEK. Péteri Adrienn Zsanett DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI
DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI MIKROSZKÓPIKUS GOMBÁK MIKOTOXIN-BONTÓ KÉPESSÉGÉNEK VIZSGÁLATA Péteri Adrienn Zsanett Témavezetők: Dr. Varga János, Egyetemi docens Dr. Vágvölgyi Csaba, Tanszékvezető egyetemi
RészletesebbenA basidiomycota élesztőgomba, a Filobasidium capsuligenum IFM 40078 törzse egy olyan
A basidiomycota élesztőgomba, a Filobasidium capsuligenum IFM 40078 törzse egy olyan fehérjét (FC-1 killer toxint) választ ki a tápközegbe, amely elpusztítja az opportunista patogén Cryptococcus neoformans-t.
RészletesebbenTöbbgénes jellegek. 1. Klasszikus (poligénes) mennyiségi jellegek. 2.Szinte minden jelleg több gén irányítása alatt áll
Többgénes jellegek Többgénes jellegek 1. 1. Klasszikus (poligénes) mennyiségi jellegek Multifaktoriális jellegek: több gén és a környezet által meghatározott jellegek 2.Szinte minden jelleg több gén irányítása
RészletesebbenBÁLINT András Beszámoló az AGRISAFE által támogatott tanulmányútról 2008 november 2009 február. 1. Az IPK bemutatása 2.
BÁLINT András Beszámoló az AGRISAFE által támogatott tanulmányútról 2008 november 2009 február 1. Az IPK bemutatása 2. A TILLING módszer Hol található az IPK? Gatersleben Általános adatok az IPK-ról Leibniz
RészletesebbenÚj temékek az UD- GenoMed Kft. kínálatában!
Új temékek az UD- GenoMed Kft. kínálatában! Szolgáltatásaink: Medical Genomic Technologies Kft. Betegtoborzás és biobanking Bioinformatika o Adatelemzés/adatbányászás o Integrált adatbázis készítés Sejtvonal
RészletesebbenA termesztett búza diploid őseinek molekuláris citogenetikai elemzése: pachytén- és fiber-fish.
OTKA K67808 zárójelentés 2012. A termesztett búza diploid őseinek molekuláris citogenetikai elemzése: pachytén- és fiber-fish. A fluoreszcens in situ hibridizáció (FISH) olyan technikai fejlettséget ért
RészletesebbenA SZIE, MKK GENETIKA ÉS BIOTECHNOLÓGIAI INTÉZETÉNEK EREDMÉNYEI A NÖVÉNYNEMESÍTÉS TUDOMÁNYOKBAN ÉS A NEMESÍTÉS UTÁNPÓTLÁS NEVELÉSBEN
A SZIE, MKK GENETIKA ÉS BIOTECHNOLÓGIAI INTÉZETÉNEK EREDMÉNYEI A NÖVÉNYNEMESÍTÉS TUDOMÁNYOKBAN ÉS A NEMESÍTÉS UTÁNPÓTLÁS NEVELÉSBEN Heszky László és Kiss Erzsébet Keszthely 2013 PARADIGMAVÁLTÁS AZ ÉLETTUDOMÁNYOKBAN
RészletesebbenA proteomika új tudománya és alkalmazása a rákdiagnosztikában
BIOTECHNOLÓGIAI FEJLESZTÉSI POLITIKA, KUTATÁSI IRÁNYOK A proteomika új tudománya és alkalmazása a rákdiagnosztikában Tárgyszavak: proteom; proteomika; rák; diagnosztika; molekuláris gyógyászat; biomarker;
RészletesebbenA GABONAFÉLÉK EGYEDFEJLŐDÉSÉT ÉS KALÁSZOLÁSÁT MEGHATÁROZÓ GENETIKAI KOMPONENSEK TANULMÁNYOZÁSA
A martonvásári agrárkutatások hatodik évtizede A GABONAFÉLÉK EGYEDFEJLŐDÉSÉT ÉS KALÁSZOLÁSÁT MEGHATÁROZÓ GENETIKAI KOMPONENSEK TANULMÁNYOZÁSA KARSAI ILDIKÓ 1, MÉSZÁROS KLÁRA 2, KŐSZEGI BÉLA 3, PATRICK
RészletesebbenPatogén mikroorganizmusok vizsgálata molekuláris biológiai módszerekkel
Patogén mikroorganizmusok vizsgálata molekuláris biológiai módszerekkel Rohonczy Kata, Zoller Linda, Fodor Andrea, Tabajdiné, dr. Pintér Vera FoodMicro Kft. Célkitűzés Élelmiszerekben és takarmányokban
RészletesebbenA búza (Triticum aestivum L.) glutamin szintetáz enzim viselkedése abiotikus stresszfolyamatok (a szárazság- és az alumíniumstressz) során
Doktori (PhD) értekezés tézisei A búza (Triticum aestivum L.) glutamin szintetáz enzim viselkedése abiotikus stresszfolyamatok (a szárazság- és az alumíniumstressz) során Készítette: Nagy Zoltán Témavezető:
RészletesebbenSALMONELLA SSP. GYORS, MOLEKULÁRIS BIOLÓGIAI MÓDSZEREKKEL TÖRTÉNŐ DETEKTÁLÁSA
SALMONELLA SSP. GYORS, MOLEKULÁRIS BIOLÓGIAI MÓDSZEREKKEL TÖRTÉNŐ DETEKTÁLÁSA Nyirő-Fekete B., Tabajdi-Bajza N., Kovácsné Kis É., Pocklán E., Zoller L., Micsinai A., Gasparikné Reichardt J. Hungalimentaria
RészletesebbenIn Situ Hibridizáció a pathologiai diagnosztikában és ami mögötte van.
In Situ Hibridizáció a pathologiai diagnosztikában és ami mögötte van. Kneif Józsefné PTE KK Pathologiai Intézet Budapest 2017. 05. 26 Kromoszóma rendellenesség kimutatás PCR technika: izolált nukleinsavak
RészletesebbenNövényi sejtek által előállított monoklonális antitesttöredékek jellemzése
BIOTECHNOLÓGIÁK MŰSZAKI HÁTTERE Növényi sejtek által előállított monoklonális antitesttöredékek jellemzése Tárgyszavak: idegen fehérje; monoklonális antitest; fehérjestabilitás; növényisejt-szuszpenzió;
RészletesebbenA KUKORICA STRESSZREZISZTENCIA KUTATÁSOK EREDMÉNYEIBŐL
A martonvásári agrárkutatások hatodik évtizede A KUKORICA STRESSZREZISZTENCIA KUTATÁSOK EREDMÉNYEIBŐL MARTON L. CSABA, SZŐKE CSABA ÉS PINTÉR JÁNOS Kukoricanemesítési Osztály Bevezetés Hazai éghajlati viszonyaink
RészletesebbenMangalica specifikus DNS alapú módszer kifejlesztés és validálása a MANGFOOD projekt keretében
Mangalica specifikus DNS alapú módszer kifejlesztés és validálása a MANGFOOD projekt keretében Szántó-Egész Réka 1, Mohr Anita 1, Sipos Rita 1, Dallmann Klára 1, Ujhelyi Gabriella 2, Koppányné Szabó Erika
RészletesebbenA Hardy-Weinberg egyensúly. 2. gyakorlat
A Hardy-Weinberg egyensúly 2. gyakorlat A Hardy-Weinberg egyensúly feltételei: nincs szelekció nincs migráció nagy populációméret (nincs sodródás) nincs mutáció pánmixis van allélgyakoriság azonos hímekben
Részletesebben10. Genomika 2. Microarrayek és típusaik
10. Genomika 2. 1. Microarray technikák és bioinformatikai vonatkozásaik Microarrayek és típusaik Korrelált génexpresszió mint a funkcionális genomika eszköze 2. Kombinált megközelítés a funkcionális genomikában
RészletesebbenALMAFAJTÁK MOLEKULÁRIS ELKÜLÖNÍTÉSE ÉS
Szent István Egyetem Gödöllő Növénytudományi Doktori Iskola Doktori Iskola vezetője: Dr. Heszky László Növénynemesítés genetikai és biotechnológiai módszerekkel Programvezető: Dr. Heszky László DOKTORI
Részletesebben3. A kutatások rövid bemutatása:
A burgonya -y vírus gumó nekrotikus gyűrűsfoltosság törzsével (PVY NTN ) szemben extrém rezisztenciát (immunitást) biztosító gének vizsgálata vad Solanum fajokban hagyományos és molekuláris módszerekkel
RészletesebbenÖsszehasonlító környezetmikrobiológiai. Böddi-szék vizében egy alga tömegprodukció idején
Összehasonlító környezetmikrobiológiai vizsgálatok a Böddi-szék vizében egy alga tömegprodukció idején Czeibert Katalin Témavezető: Dr. Borsodi Andrea Eötvös Loránd Tudományegyetem, Mikrobiológiai Tanszék
RészletesebbenA FISH technika alkalmazása az előnemesítésben
Linc Gabriella A FISH technika alkalmazása az előnemesítésben Czuczor Gergely Bencés Gimnázium és Kollégium Győr, 2016. április 13. www.meetthescientist.hu 1 26 - 1997-98 vendégkutató - növény genetikai
RészletesebbenA Leuce szekcióba tartozó hazai nyárak dunántúli természetes eredetű állományainak populációgenetikai vizsgálata
Nyugat-magyarországi Egyetem Erdőmérnöki Kar Doktori (PhD) értekezés tézisei A Leuce szekcióba tartozó hazai nyárak dunántúli természetes eredetű állományainak populációgenetikai vizsgálata Benke Attila
RészletesebbenA bioinformatika gyökerei
A bioinformatika gyökerei 1944: Avery a transforming principle a DNS 1952: Hershey és Chase perdöntő bizonyíték: a bakteriofágok szaporodásakor csak a DNS jut be a sejtbe 1953: Watson és Crick a DNS szerkezete
RészletesebbenOrvosi Genomtudomány 2014 Medical Genomics 2014. Április 8 Május 22 8th April 22nd May
Orvosi Genomtudomány 2014 Medical Genomics 2014 Április 8 Május 22 8th April 22nd May Hét / 1st week (9. kalendariumi het) Takács László / Fehér Zsigmond Magyar kurzus Datum/ido Ápr. 8 Apr. 9 10:00 10:45
RészletesebbenHAPMAP -2010 Nemzetközi HapMap Projekt. SNP GWA Haplotípus: egy kromoszóma szegmensen lévő SNP mintázat
HAPMAP -2010 Nemzetközi HapMap Projekt A Nemzetközi HapMap Project célja az emberi genom haplotípus* térképének(hapmap; haplotype map) megszerkesztése, melynek segítségével katalogizálni tudjuk az ember
RészletesebbenHazai méhészeti genomikai és genetikai vizsgálatok
AKÁCKÖRÚTON Hazai méhészeti genomikai és genetikai vizsgálatok Előző cikkünkben arról írtunk, milyen új eszköztárral rendelkezünk a XXI. században a genetikai vizsgálatok területén, és mit adhat a molekuláris
RészletesebbenKUTATÁSI JELENTÉS. DrJuice termékek Ezüstkolloid Hydrogél és Kolloid oldat hatásvizsgálata
KUTATÁSI JELENTÉS A Bay Zoltán Alkalmazott Kutatási Közalapítvány Nanotechnológiai Kutatóintézet e részére DrJuice termékek Ezüstkolloid Hydrogél és Kolloid oldat hatásvizsgálata. E z ü s t k o l l o
RészletesebbenA genetikai lelet értelmezése monogénes betegségekben
A genetikai lelet értelmezése monogénes betegségekben Tory Kálmán Semmelweis Egyetem, I. sz. Gyermekklinika A ~20 ezer fehérje-kódoló gén a 23 pár kromoszómán A kromoszómán található bázisok száma: 250M
RészletesebbenTRIPSZIN TISZTÍTÁSA AFFINITÁS KROMATOGRÁFIA SEGÍTSÉGÉVEL
TRIPSZIN TISZTÍTÁSA AFFINITÁS KROMATOGRÁFIA SEGÍTSÉGÉVEL Az egyes biomolekulák izolálása kulcsfontosságú a biológiai szerepük tisztázásához. Az affinitás kromatográfia egyszerűsége, reprodukálhatósága
RészletesebbenDNS munka a gyakorlatban. 2012.10.12. Természetvédelmi genetika
DNS munka a gyakorlatban 2012.10.12. Természetvédelmi genetika Munka fázisok DNS kivonás elektroforézis (fakultatív lépés) PCR Elektroforézis Szekvenálás Szekvencia elemzés faji azonosítás; variabilitás,
RészletesebbenNÖVÉNYGENETIKA. Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP /1/A
NÖVÉNYGENETIKA Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP-4.1.2-08/1/A-2009-0010 Az előadás áttekintése A tantárgy keretében megtárgyalandó ismeretkörök A félév elfogadásának feltételei, követelmények
RészletesebbenA nagy termés nyomában. Mezőhegyes, szeptember 11.
A nagy termés nyomában Mezőhegyes, 2014. szeptember 11. Időjárás Trágyázás, növénytáplálás, talaj- és növénykondícionálás Levegőből támadó rovarok Levegőből támadó gombák Herbicid-használat Vetésidő Talajlakó
RészletesebbenA doktori értekezés tézisei. A növényi NRP fehérjék lehetséges szerepe a hiszton defoszforiláció szabályozásában, és a hőstressz válaszban.
A doktori értekezés tézisei A növényi NRP fehérjék lehetséges szerepe a hiszton defoszforiláció szabályozásában, és a hőstressz válaszban. Bíró Judit Témavezető: Dr. Fehér Attila Magyar Tudományos Akadémia
RészletesebbenPANNON EGYETEM GEORGIKON KAR
PANNON EGYETEM GEORGIKON KAR NÖVÉNYTERMESZTÉSI ÉS KERTÉSZETI TUDOMÁNYOK DOKTORI ISKOLA Iskolavezető: Dr. Kocsis László, DSc DOKTORI (PhD) ÉRTEKEZÉS TÉZISEI A rezisztencia genetikai hátterének vizsgálata
RészletesebbenERD14: egy funkcionálisan rendezetlen dehidrin fehérje szerkezeti és funkcionális jellemzése
Doktori értekezés tézisei ERD14: egy funkcionálisan rendezetlen dehidrin fehérje szerkezeti és funkcionális jellemzése DR. SZALAINÉ ÁGOSTON Bianka Ildikó Témavezetők Dr. PERCZEL András egyetemi tanár és
RészletesebbenZáró Riport CR
Záró Riport CR16-0016 Ügyfél kapcsolattartója: Jessica Dobbin Novaerus (Ireland) Ltd. DCU Innovation Campus, Old Finglas Road, Glasnevin, Dublin 11, Ireland jdobbin@novaerus.com InBio Projekt Menedzser:
RészletesebbenPÉCSI TUDOMÁNYEGYETEM. Agrobacterium rezisztencia térképezése szőlőben. Kuczmog Anett
PÉCSI TUDOMÁNYEGYETEM Biológia Doktori Iskola Genetika program Agrobacterium rezisztencia térképezése szőlőben PhD értekezés Kuczmog Anett Témavezető: Dr. Putnoky Péter egyetemi tanár PÉCS, 2012. 1. BEVEZETÉS
RészletesebbenNövényvédelmi Tudományos Napok 2014
Növényvédelmi Tudományos Napok 2014 Budapest 60. NÖVÉNYVÉDELMI TUDOMÁNYOS NAPOK Szerkesztők HORVÁTH JÓZSEF HALTRICH ATTILA MOLNÁR JÁNOS Budapest 2014. február 18-19. ii Szerkesztőbizottság Tóth Miklós
RészletesebbenMINTAJEGYZŐKÖNYV A VÉRALVADÁS VIZSGÁLATA BIOKÉMIA GYAKORLATHOZ
MINTAJEGYZŐKÖNYV A VÉRALVADÁS VIZSGÁLATA BIOKÉMIA GYAKORLATHOZ Feladatok 1. Teljes vér megalvasztása rekalcifikálással 1.1 Gyakorlat kivitelezése 1.2 Minta jegyzőkönyv 2. Referenciasor készítése fehérjeméréshez
RészletesebbenAGROTECHNIKAI TÉNYEZŐK HATÁSA A KULTÚRNÖVÉNYEKRE ÉS A GYOMOSODÁSRA
PANNON EGYETEM GEORGIKON KAR NÖVÉNYVÉDELMI INTÉZET NÖVÉNYTERMESZTÉSI ÉS KERTÉSZETI TUDOMÁNYOK DOKTORI ISKOLA ISKOLA VEZETŐ DR. GÁBORJÁNYI RICHARD MTA DOKTORA AGROTECHNIKAI TÉNYEZŐK HATÁSA A KULTÚRNÖVÉNYEKRE
RészletesebbenA C1 orf 124/Spartan szerepe a DNS-hiba tolerancia útvonalban
Ph.D. tézisek A C1 orf 124/Spartan szerepe a DNS-hiba tolerancia útvonalban Írta: Juhász Szilvia Témavezető: Dr. Haracska Lajos Magyar Tudományos Akadémia Szegedi Biológiai Kutatóközpont Genetikai Intézet
RészletesebbenAnimal welfare, etológia és tartástechnológia
Animal welfare, etológia és tartástechnológia Animal welfare, ethology and housing systems Volume 4 Issue 2 Különszám Gödöllı 2008 468 EGYEDAZONOSÍTÁS ÉS SZÁRMAZÁSELLENİRZÉS HIPERPOLIMORF MIKROSZATELLITA
RészletesebbenOszvald Mária. A búza tartalékfehérjék tulajdonságainak in vitro és in vivo vizsgálata rizs modell rendszerben
Budapesti Műszaki és Gazdaságtudományi Egyetem Alkalmazott Biotechnológia és Élelmiszertudományi Tanszék PHD ÉRTEKEZÉS TÉZISEI Készítette: Oszvald Mária A búza tartalékfehérjék tulajdonságainak in vitro
RészletesebbenŐszi búzafajták magas hozamának megőrzése környezeti stressz hatása alatt
Őszi búzafajták magas hozamának megőrzése környezeti stressz hatása alatt CORNET_6_08_WHEATSTR OM-00887/2009 Beszámolási időszak: 2009. október 1-2010. szeptember 30. Támogatott szervezet: Projectvezető:
RészletesebbenEgy 10,3 kb méretű, lineáris, a mitokondriumban lokalizált DNS-plazmidot izoláltunk a
Egy 10,3 kb méretű, lineáris, a mitokondriumban lokalizált DNS-plazmidot izoláltunk a Fusarium proliferatum (Gibberella intermedia) ITEM 2337-es törzséből, és a plazmidot pfp1- nek neveztük el. Proteináz
RészletesebbenBALATONI NÁDASOK KLONÁLIS DIVERZITÁSÁNAK VIZSGÁLATA RAPD-PCR MÓDSZERREL
Bot. Közlem. 94(1 2): 133 140, 2007. BALATONI NÁDASOK KLONÁLIS DIVERZITÁSÁNAK VIZSGÁLATA RAPD-PCR MÓDSZERREL LUKÁCS VIKTÓRIA 1, HERODEK SÁNDOR 1, MAJOR ÁGNES 2 1 MTA Balatoni Limnológiai Kutatóintézet,
RészletesebbenDOKTORI ÉRTEKEZÉS. Molekuláris biológiai módszerek fejlesztése gluténmentesség ellenırzésére. Némedi Erzsébet
DOKTORI ÉRTEKEZÉS Molekuláris biológiai módszerek fejlesztése gluténmentesség ellenırzésére Némedi Erzsébet Központi Élelmiszer-tudományi Kutatóintézet Budapest 2009 TARTALOMJEGYZÉK JELÖLÉSEK ÉS RÖVIDÍTÉSEK
RészletesebbenA Telomerase-specific Doxorubicin-releasing Molecular Beacon for Cancer Theranostics
A Telomerase-specific Doxorubicin-releasing Molecular Beacon for Cancer Theranostics Yi Ma, Zhaohui Wang, Min Zhang, Zhihao Han, Dan Chen, Qiuyun Zhu, Weidong Gao, Zhiyu Qian, and Yueqing Gu Angew. Chem.
Részletesebben2.6.16. VIZSGÁLATOK IDEGEN KÓROKOZÓKRA HUMÁN ÉLŐVÍRUS-VAKCINÁKBAN
2.6.16. Vizsgálatok idegen kórokozókra Ph.Hg.VIII. - Ph.Eur.7.0 1 2.6.16. VIZSGÁLATOK IDEGEN KÓROKOZÓKRA HUMÁN ÉLŐVÍRUS-VAKCINÁKBAN 01/2011:20616 Azokhoz a vizsgálatokhoz, amelyekhez a vírust előzőleg
RészletesebbenA kvantitatív PCR alkalmazhatósága a fertőző bronchitis vakcinák hatékonysági vizsgálatában. Derzsy Napok, Sárvár, 2011 Június 2-3.
A kvantitatív PCR alkalmazhatósága a fertőző bronchitis vakcinák hatékonysági vizsgálatában Pénzes Zoltán PhD, Soós Pál PhD, Nógrády Noémi PhD, Varga Mária, Jorge Chacón PhD, Zolnai Anna PhD, Nagy Zoltán
RészletesebbenPOSEIDON DNS PRÓBÁK. Felhasználói Kézikönyv. Használati útmutató. Használati útmutató
POSEIDON DNS PRÓBÁK Felhasználói Kézikönyv Használati útmutató Használati útmutató A Poseidon fluoreszcensen jelölt próbáinak használata A fluoreszcens in situ hibridizáció (FISH) genomi célszekvenciákat
Részletesebben3. gyakorlat: nukleinsav-tisztítás, polimeráz láncreakció
3. gyakorlat: nukleinsav-tisztítás, polimeráz láncreakció A vírus genetikai anyagának vizsgálata (direkt víruskimutatási módszer) biztosítja a legrészletesebb és legspecifikusabb információkat a kimutatott
RészletesebbenAz Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP-4.1.2-08/1/A-2009-0010 projekt
Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP-4.1.2-08/1/A-2009-0010 projekt ÁlLATGENETIKA Debreceni Egyetem Nyugat-magyarországi Egyetem Pannon Egyetem A projekt az Európai Unió támogatásával, az
RészletesebbenA sertések lágyék- és heresérv tünetegyüttesének genetikai háttere
Nagy Szabolcs 1 Benedek Zsuzsanna 2 Polgár J. Péter 3 Magnus Andersson 4 A sertések lágyék- és heresérv tünetegyüttesének genetikai háttere Genetic background of scrotal and inguinal hernia in swine nagy.szabolcs@georgikon.hu
RészletesebbenDI-, TETRA- ÉS HEXAPLOID TRITICUM FAJOK GENOMJAINAK ELEMZÉSE ÉS AZOK ÖSSZEHASONLÍTÁSA FLUORESZCENS IN SITU HIBRIDIZÁCIÓVAL
Hagyomány és haladás a növénynemesítésben DI-, TETRA- ÉS HEXAPLOID TRITICUM FAJOK GENOMJAINAK ELEMZÉSE ÉS AZOK ÖSSZEHASONLÍTÁSA FLUORESZCENS IN SITU HIBRIDIZÁCIÓVAL VARGA MÓNIKA, MOLNÁR ISTVÁN ÉS KOVÁCS
Részletesebben4.3. Mikrofluidikai csipek analitikai alkalmazásai
367 4.3. Mikrofluidikai csipek analitikai alkalmazásai 4.3.1. DNS meghatározása A kettős szálú DNS példáján kiválóan demonstrálhatók a mikrofluidikai eszközökön (csip, lab-on-a-chip) elérhető gyors és
RészletesebbenSZÁRAZSÁGTŰRÉSI VIZSGÁLATOK GABONAFÉLÉKEN
A martonvásári agrárkutatások hatodik évtizede SZÁRAZSÁGTŰRÉSI VIZSGÁLATOK GABONAFÉLÉKEN BÁLINT ANDRÁS FERENC 1, SZIRA FRUZSINA 1, GALIBA GÁBOR 1, JÄGER KATALIN 2, FÁBIÁN ATTILA 2 ÉS BARNABÁS BEÁTA 2 1
RészletesebbenKülönböző Capsicum annuum var. grossum paprikafajták endofita baktériumainak izolálása, jellemzése és molekuláris biológiai vizsgálata
Élelmiszertudományi Kar, Mikrobiológiai és Biotechnológiai Tanszék, Budapest Különböző Capsicum annuum var. grossum paprikafajták endofita baktériumainak izolálása, jellemzése és molekuláris biológiai
RészletesebbenTipizálási módszerek alkalmazása methicillin-rezisztens Staphylococcus aureus (MRSA) törzsek molekuláris epidemiológiai vizsgálatai során
Tipizálási módszerek alkalmazása methicillin-rezisztens Staphylococcus aureus (MRSA) törzsek molekuláris epidemiológiai vizsgálatai során Ungvári Erika, Tóth Ákos Magyar Infektológiai és Klinikai Mikrobiológiai
RészletesebbenVÁLASZ OPPONENSI VÉLEMÉNYRE
VÁLASZ OPPONENSI VÉLEMÉNYRE Dr. Taller János Tudományos főmunkatárs Pannon Egyetem, Georgikon Kar, Növénytudományi és Biotechnológiai Tanszék Biotechnológiai Kutatócsoport Farkas Valéria Tejtermelést és
RészletesebbenKIS GTP-KÖTŐ FEHÉRJE SZEREPE A NÖVÉNYI CIRKADIÁN ÓRA, STRESSZ-VÁLASZOK ÉS A FÉNYFÜGGŐ ENDOREDUPLIKÁCIÓ SZABÁLYOZÁSÁBAN
KIS GTP-KÖTŐ FEHÉRJE SZEREPE A NÖVÉNYI CIRKADIÁN ÓRA, STRESSZ-VÁLASZOK ÉS A FÉNYFÜGGŐ ENDOREDUPLIKÁCIÓ SZABÁLYOZÁSÁBAN Doktori (Ph.D.) értekezés tézisei Terecskei Kata Témavezető: Dr. Kozma-Bognár László
RészletesebbenKészült: Módosítva: július
Tananyag címe: Transzaminázok vizsgálata Szerző: Dr. Mótyán János András egyetemi tanársegéd Biokémiai és Molekuláris Biológiai Intézet Általános Orvostudományi Kar Debreceni Egyetem Készült: 2014.12.01-2015.01.31.
RészletesebbenHátterükben egyetlen gén áll, melynek általában számottevő a viselkedésre gyakorolt hatása, öröklési mintázata jellegzetes.
Múlt órán: Lehetséges tesztfeladatok: Kitől származik a variáció-szelekció paradigma, mely szerint az egyéni, javarészt öröklött különbségek között a társadalmi harc válogat? Fromm-Reichmann Mill Gallton
RészletesebbenFotoszintézis. fotoszintetikus pigmentek Fényszakasz - gránum/sztrómalamella. Sötétszakasz - sztróma
Fotoszintézis fotoszintetikus pigmentek Fényszakasz - gránum/sztrómalamella Sötétszakasz - sztróma A növényeket érı hatások a pigmentösszetétel változását okozhatják I. Mintavétel (inhomogén minta) II.
RészletesebbenIn situ hibridizáció különböző módszereinek adaptálása és továbbfejlesztése búza genetikai alapanyagok elemzésére
OTKA F037331 Zárójelentés 2006. In situ hibridizáció különböző módszereinek adaptálása és továbbfejlesztése búza genetikai alapanyagok elemzésére Kísérleteinkben célul tűztük ki a transzgének kimutatására
RészletesebbenKromoszómák, Gének centromer
Kromoszómák, Gének A kromoszóma egy hosszú DNS szakasz, amely a sejt életének bizonyos szakaszában (a sejtosztódás előkészítéseként) tömörödik, így fénymikroszkóppal láthatóvá válik. A kromoszómák két
RészletesebbenBiológiai biztonság: Veszély: - közvetlen - közvetett
Biológiai biztonság Biológiai biztonság: Minden biológiai anyag potenciálisan kórokozó és szennyező; a biológiai biztonság ezen biológiai anyagok hatásaira (toxikus hatások, fertőzések) koncentrál és célja
RészletesebbenDr. Máthéné Dr. Szigeti Zsuzsanna és munkatársai
Kar: TTK Tantárgy: CITOGENETIKA Kód: AOMBCGE3 ECTS Kredit: 3 A tantárgyat oktató intézet: TTK Mikrobiális Biotechnológiai és Sejtbiológiai Tanszék A tantárgy felvételére ajánlott félév: 3. Melyik félévben
RészletesebbenMolekuláris genetikai vizsgáló. módszerek az immundefektusok. diagnosztikájában
Molekuláris genetikai vizsgáló módszerek az immundefektusok diagnosztikájában Primer immundefektusok A primer immundeficiencia ritka, veleszületett, monogénes öröklődésű immunhiányos állapot. Családi halmozódást
Részletesebben