A Drosophila melanogaster poszt-meiotikus spermatogenezisében szerepet játszó gének vizsgálata. Ph.D. értekezés tézisei.

Hasonló dokumentumok
AZ E3 LIGÁZOK SZEREPE AZ INDIVIDUALIZÁLÓDÓ CISZTÁKBAN A DROSOPHILA SPERMATOGENEZIS SORÁN

A Drosophila melanogaster poszt-meiotikus spermatogenezisében szerepet játszó gének vizsgálata. Vedelek Viktor

TDK lehetőségek az MTA TTK Enzimológiai Intézetben

Az anafázis promoting complex (APC/C) katalitikus modulja Drosophila melanogasterben. Nagy Olga

Molekuláris biológiai eljárások alkalmazása a GMO analitikában és az élelmiszerbiztonság területén

Egy új, a szimbiotikus gümőfejlődésben szerepet játszó ubiquitin ligáz funkcionális jellemzése

NÖVÉNYGENETIKA. Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP /1/A

Dr. Máthéné Dr. Szigeti Zsuzsanna és munkatársai

Többgénes jellegek. 1. Klasszikus (poligénes) mennyiségi jellegek. 2.Szinte minden jelleg több gén irányítása alatt áll

Genomadatbázisok Ld. Entrez Genome: Összes ismert genom, hierarchikus szervezésben (kromoszóma, térképek, gének, stb.)

Jelutak. Apoptózis. Apoptózis Bevezetés 2. Külső jelút 3. Belső jelút. apoptózis autofágia nekrózis. Sejtmag. Kondenzálódó sejtmag

A DAAM formin alcsalád szerepe az izomfejlődésben. A Ph.D. értekezés tézisei. Molnár Imre. Témavezető: Dr. Mihály József

A genetikai lelet értelmezése monogénes betegségekben

A gidrán fajta genetikai változatosságának jellemzése mitokondriális DNS polimorfizmusokkal Kusza Szilvia Sziszkosz Nikolett Mihók Sándor,

A felgyorsult fehérje körforgás szerepe a transzlációs hibákkal szembeni alkalmazkodási folyamatokban

A DmUsp5 dezubikvitiláz fiziológiai funkciójának meghatározása Drosophila melanogasterben. Kovács Levente

A doktori értekezés tézisei. A növényi NRP fehérjék lehetséges szerepe a hiszton defoszforiláció szabályozásában, és a hőstressz válaszban.

Egy Polycomb Response Element (PRE) in situ vizsgálata Drosophila melanogaster-ben génkonverzió segítségével. Kozma Gabriella

A C. elegans TRA-1/GLI/Ci szex-determinációs faktor célgénjeinek meghatározása és analízise. Doktori értekezés tézisei.

Zárójelentés. Állati rotavírusok összehasonlító genomvizsgálata. c. OTKA kutatási programról. Bányai Krisztián (MTA ATK ÁOTI)

A Drosophila mir-282 mikrorns gén szerkezeti és funkcionális jellemzése. Bujna Ágnes

KIS GTP-KÖTŐ FEHÉRJE SZEREPE A NÖVÉNYI CIRKADIÁN ÓRA, STRESSZ-VÁLASZOK ÉS A FÉNYFÜGGŐ ENDOREDUPLIKÁCIÓ SZABÁLYOZÁSÁBAN

A szamóca érése során izolált Spiral és Spermidin-szintáz gén jellemzése. Kiss Erzsébet Kovács László

Apoptózis. 1. Bevezetés 2. Külső jelút 3. Belső jelút

Növényvédelmi Tudományos Napok 2014

Algaközösségek ökológiai, morfológiai és genetikai diverzitásának összehasonlítása szentély jellegű és emberi használatnak kitett élőhelykomplexekben

Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen

Mutagenezis és s Karcinogenezis kutatócsoport. Haracska Lajos.

Tudománytörténeti visszatekintés

Prof. Dr. Szabad János Tantárgyfelelős beosztása

transzláció DNS RNS Fehérje A fehérjék jelenléte nélkülözhetetlen minden sejt számára: enzimek, szerkezeti fehérjék, transzportfehérjék

Az ADA2b adaptor fehérjéket tartalmazó hiszton acetiltranszferáz komplexek szerepének vizsgálata Drosophila melanogaster-ben

A Caskin1 állványfehérje vizsgálata

Ivarplazmában tárolt RNS-ek azonosítása teljes genom DNS microarray segítségével

A kromoszómák kialakulása előtt a DNS állomány megkettőződik. A két azonos információ tartalmú DNS egymás mellé rendeződik és egy kromoszómát alkot.

Fehérje interakciók az ecetmuslica telomerének retrotranszpozonjain. Takács Sándor

A plazma membrán mikrodomének szabályzó szerepe a sejtek növekedési és stressz érzékelési folyamataiban. Csoboz Bálint

Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen

In Situ Hibridizáció a pathologiai diagnosztikában és ami mögötte van.

A Huntington kór patogenezisének vizsgálata Drosophila modell felhasználásával

TUMORSEJTEK FENOTÍPUS-VÁLTOZÁSA TUMOR-SZTRÓMA SEJTFÚZIÓ HATÁSÁRA. Dr. Kurgyis Zsuzsanna

KERINGŐ EXTRACELLULÁRIS VEZIKULÁK ÁLTAL INDUKÁLT GÉNEXPRESSZIÓS MINTÁZAT VIZSGÁLATA TROPHOBLAST SEJTVONALBAN

Téma 2: Genetikai alapelvek, a monogénes öröklődés -hez szakirodalom: (Plomin: Viselekedésgenetika 2. fejezet) *

A termesztett búza diploid őseinek molekuláris citogenetikai elemzése: pachytén- és fiber-fish.

Ph.D. értekezés tézisei. A c-típusú citokrómok biogenezisében résztvevő fehérjék. szerepe és génjeik szabályozása Sinorhizobium meliloti-ban

Hátterükben egyetlen gén áll, melynek általában számottevő a viselkedésre gyakorolt hatása, öröklési mintázata jellegzetes.

A TATA-kötő fehérje asszociált faktor 3 (TAF3) p53-mal való kölcsönhatásának funkcionális vizsgálata

Cserző Miklós Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban. Integrált biológiai adatbázisok

Búza tartalékfehérjék mozgásának követése a transzgénikus rizs endospermium sejtjeiben

A T sejt receptor (TCR) heterodimer

A határsejtvándorlás szabályozásában résztvevœ gének azonosítása és jellemzése ecetmuslicában

DNS-szekvencia meghatározás

Különböző Capsicum annuum var. grossum paprikafajták endofita baktériumainak izolálása, jellemzése és molekuláris biológiai vizsgálata

(1) A T sejtek aktiválása (2) Az ön reaktív T sejtek toleranciája. α lánc. β lánc. V α. V β. C β. C α.

PROGRAMFÜZET. "GENETIKAI MŰHELYEK MAGYARORSZÁGON" XIII. Minikonferencia SZEPTEMBER 12.

Az X kromoszóma inaktívációja. A kromatin szerkezet befolyásolja a génexpressziót

Molekuláris genetikai vizsgáló. módszerek az immundefektusok. diagnosztikájában

Egy 10,3 kb méretű, lineáris, a mitokondriumban lokalizált DNS-plazmidot izoláltunk a

Az agy betegségeinek molekuláris biológiája. 1. Prion betegség 2. Trinukleotid ripít betegségek 3. ALS 4. Parkinson kór 5.

Bakteriális identifikáció 16S rrns gén szekvencia alapján

1b. Fehérje transzport

A Drosophila melanogaster ivarvonal-fejlődésében. szerepet játszó gének azonosítása és vizsgálata

Molekuláris biológiai módszerek alkalmazása a biológiai környezeti kármentesítésben

A lézer-szkenning citometria lehetőségei. Laser-scanning cytometer (LSC) Pásztázó citométer. Az áramlási citometria fő korlátai

In vivo szövetanalízis. Különös tekintettel a biolumineszcens és fluoreszcens képalkotási eljárásokra

A Headcase a Drosophila melanogaster vérsejtképződésének szabályozó faktora. Varga Gergely István. Doktori értekezés tézisei

Klónozás: tökéletesen egyforma szervezetek csoportjának előállítása, vagyis több genetikailag azonos egyed létrehozása.

DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI AZ OPPORTUNISTA HUMÁNPATOGÉN CANDIDA PARAPSILOSIS PATOMECHANIZMUSÁNAK MOLEKULÁRIS SZABÁLYOZOTTSÁGA TÓTH RENÁTA TÉMAVEZETŐ:

Molekuláris biológiai technikák

A Drosophila telomer védelmét szolgáló fehérjék fajképzésben betöltött lehetséges szerepének vizsgálata

Kromoszómák, Gének centromer

Jelentés A sebzáródásban szerepet játszó gének azonosítása Drosophila melanogaster embrióban

Új genetikai stratégia kidolgozása az Arabidopsis stressz válaszát szabályzó gének azonosítására

A C1 orf 124/Spartan szerepe a DNS-hiba tolerancia útvonalban

sejt működés jovo.notebook March 13, 2018

Sejtmag forgolódás és pozícionálás bökögető mikrotubulusokkal. Ph.D. értekezés tézisei. Szikora Szilárd

A Drosophila melanogaster kalpainok és a sejtvándorlás

Egy új genetikai módszerrel azonosított Arabidopsis A4A hősokk faktor funkcionális jellemzése

TEMATIKA Biokémia és molekuláris biológia IB kurzus (bb5t1301)

A herpes simplex vírus és a rubeolavírus autofágiára gyakorolt in vitro hatásának vizsgálata

ADATBÁNYÁSZAT I. ÉS OMICS

A humán P53 fehérje transzkripció elongációban betöltött, eddig nem azonosított szerepének jellemzése

Citrátkör, terminális oxidáció, oxidatív foszforiláció

Balázs Anna. Az importin-béta 1 szerepe a kromatin 2 szerveződésében. Abstract

Bioinformatika előadás

Fehérje expressziós rendszerek. Gyógyszerészi Biotechnológia

A DOHÁNYZÁS OKOZTA DNS KÁROSODÁSOK ÉS JAVÍTÁSUK VIZSGÁLATA EMBERI CUMULUS ÉS GRANULOSA SEJTEKBEN. Sinkó Ildikó PH.D.

AZ ÖSZTROGÉN ÉS A DEHIDROEPIANDROSZTERON SZEREPE A SZINAPTIKUS ÁTRENDEZŐDÉSBEN

AZ EMBERI MIKROBIOM: AZ EGYÉN, MINT SAJÁTOS ÉLETKÖZÖSSÉG Duda Ernő

Darvas Zsuzsa László Valéria. Sejtbiológia. Negyedik, átdolgozott kiadás

Energiatermelés a sejtekben, katabolizmus. Az energiaközvetítő molekula: ATP

RÉSZLETES SZAKMAI BESZÁMOLÓ

Opponensi Vélemény Dr. Nagy Bálint A valósidejű PCR alkalmazása a klinikai genetikai gyakorlatban ' című értekezéséről

Összehasonlító környezetmikrobiológiai. Böddi-szék vizében egy alga tömegprodukció idején

Bioinformatika 2 10.el

TRANSZGENIKUS BIOMARKER ZEBRADÁNIÓ (DANIO RERIO) VONALAK POTENCIÁLIS ALKALMAZÁSA A TOXIKOLÓGIÁBAN

A preventív vakcináció lényege :

Két kevéssé ismert humán ABCG fehérje expressziója és funkcionális vizsgálata: ABCG1 és ABCG4 jellemzése

RNS-ek. 1. Az ősi RNS Világ: - az élet hajnalán. 2. Egy már ismert RNS Világ: - a fehérjeszintézis ben résztvevő RNS-ek

3. Sejtalkotó molekulák III.

Átírás:

A Drosophila melanogaster poszt-meiotikus spermatogenezisében szerepet játszó gének vizsgálata Ph.D. értekezés tézisei Vedelek Viktor Témavezető: Dr. Sinka Rita Biológia Doktori Iskola Szegedi Tudományegyetem Természettudományi és Informatikai Kar Genetikai Tanszék Szeged 2016

A kutatás előzményeinek összefoglalása A Drosophila melanogaster (ecetmuslica) genetikai modellszervezet jó lehetőséget nyújt fejlődésbiológiai folyamatok, azon belül is a spermatogenezis tanulmányozására. Feltekert, vakon végződő csőre emlékeztető heréiben a spermatogenezis minden szakasza egyszerre megfigyelhető. A Drosophila spermiuma ugyan harminckétszer hosszabb az ember spermiumához viszonyítva, viszont ugyanazokból a sejtalkotókból áll, szerkezete konzervált. A Drosophila poszt-meiotikus fejlődése során a spermatidák megnyúlnak, a megnyúláshoz nélkülözhetetlen a fuzionált mitokondriumokból kialakuló két mitokondrium származék. A mitokondrium származékok végigfutnak a spermatidák farki részének teljes hosszában. A megnyúlás során differenciálódnak, kialakítják a nagy mitokondrium származékot, ami parakrisztallint halmoz fel, valamint a kis mitokondrium származékot. A spermatidák szinkronizált fejlődését plazmahidak biztosítják, amik a spermiumok egyedivé válásáig megmaradnak. Az individualizáció folyamán a sejtmagok körül kialakul az individualizációs komplex, melynek aktinban gazdag kúp alakú struktúrái szinkronizált vándorlásuk során kiszorítják a feleslegessé vált sejtalkotókat és kialakítják a spermiumok egyedi sejtmembránjait. Az individualizáció folyamatában aktív lebontó folyamatok figyelhetőek meg; az ubikvitin proteaszóma rendszer több eleme szükséges az individualizációs komplex szabályos vándorlásához, valamint a nem apoptotikus kaszpáz kaszkád aktiválásához. A nem 2

apoptotikus kaszpáz kaszkád hiányában a spermatidák nem képesek egyedivé válni. Az ecetmuslica egy genetikailag jól jellemzett modellszervezet, ahol a klasszikus és modern genetika és molekuláris biológia gazdag eszköztára áll rendelkezésünkre. A transzpozon inszerciós törzsgyűjtemények remek lehetőséget biztosítanak az ivarsejtfejlődésben szükséges gének azonosításához. Csoportunk több lépcsős szűrésen keresztül számos hím- és nősténysteril allélt azonosított. Dolgozatomban az általunk kiszűrt bb8 és ago génekkel és hímsteril mutáns alléljeikkel foglalkoztam. Kutatásunknak célja volt, hogy meghatározzuk a bb8 és az ago gének spermatogenezisben betöltött szerepét. Célul tűztük ki, hogy genetikai módszerekkel jellemezzük a bb8 és ago gének eddig nem jellemzett hímsteril alléljeit. Célunk volt meghatározni, hogy a spermatogenezis mely stádiumai hibásak a mutáns legyekben, továbbá a mutáns fenotípusok menekítése és a Bb8 és az Ago fehérjék szubcelluláris lokalizációjának meghatározása. 3

Alkalmazott módszerek 1. Klasszikus genetikai módszerek: -fertilitási tesztek -komplementációs tesztek -P és Minos transzpozon remobilizálás -mutáns allélok rekombinálása -transzgenikus törzsek előállítása, jellemzése és azok mutáns háttéren történő vizsgálata 2. Molekuláris biológiai és mikroszkópos módszerek: - genomiális és plazmid DNS izolálás -transzgének előállítása klasszikus klónozással -qrt-pcr -RNS izolálás és cdns szintézis külöböző Drosophila szövetekből -DIG jelölt RNS próba készítése -élő minták, sejtszervek in vivo festése tesztisz preparátumokon -immunfestés tesztisz preparátumon -RNS in situ hibridizáció tesztisz preparátumon -TUNEL jelölés tesztisz preparátumon -fázis kontraszt mikroszkópia -fluoreszcens mikroszkópia -konfokális mikroszkópia -elektronmikroszkópia (kooperációban) 3. Bioinformatika: -online adatbázisok és eszközök használata -primerek, próbák, klónozások tervezése 4

-képek elemzése (GIMP, ImageJ) -többszörös szekvencia illesztés (Ugene, ClustalW) -filogenetikai fa építése (Mega 6) -3D molekula modellek kezelése (Chimera, MODELLER) -qrt-pcr adatok elemzése (Bio Rad CFX manager) -statisztikai elemzések (R) 5

Elért eredmények és következtetések A bb8 ms mutáns hímsteril allél azonosítása, Minos elem inszerciós törzsgyűjteményből történő szűrést követően. A komplementációs analízis, revertálás és menekítési kísérletek segítségével bebizonyítottuk, hogy a hímsteril fenotípusért a bb8 génbe épült Minos elem a felelős. A bb8 ms mutáns tesztiszekben a bb8 transzkript szintje körülbelül 80% csökkenést mutatott, aminek következtében 100% hímsterilitást tapasztaltunk. Megállapítottuk, hogy a bb8 gén egy glutamát dehidrogenázt kódol. Drosophilában két glutamát dehidrogenázt kódoló gén található a Gdh és a bb8 (CG4434). Aminosav szekvencia elemzéseink és 3D molekula modellek alapján arra jutottunk, hogy nagy valószínűség szerint a Bb8 fehérje egy funkcionális glutamát dehidrogenáz, amelynek szabályozása eltérő lehet a Gdh enzimétől. A glutamát dehidrogenázokon végzett filogenetikai elemzéseink kimutatták, hogy a Bb8 kevésbé konzervált szerkezetű, mint a Gdh. A Bb8 a szekvenált Drosophila fajok mindegyikében előfordul, amiből megállapítottuk, hogy a Bb8 a Drosophila félék korai evolúciójában bekövetkezett génduplikáció eredménye. Megállapítottuk, hogy míg a Gdh expressziója általános, a bb8 tesztisz specifikusan, a 8 sejtes cisztáktól kezdődően fejeződik ki és jelentősen felhalmozódik a meiotikus, poszt-meiotikus stádiumokban. A bb8 ms mutáns tesztiszekben a korai fejlődési stádiumoknál nem figyelhető meg rendellenes fenotípus. A meiózist követően azonban a ciszták megnyúlása sérül, és az 6

individualizáció folyamata is hibás, ami a spermatogenezis leállását eredményezi. A bb8 ms mutánsban nem alakulnak ki érett spermiumok. Megállapítottuk, hogy a Bb8 fehérje a mitokondriumokba lokalizálódik a spermatogenezis korai stádiumaiban, és a meiózist követően is. A bb8 ms mutánsban mitokondriális rendellenességeket mutattunk ki a meiózist követően. A bb8 ms mutáns megnyúló cisztákban a mitokondrium származékok elvesztik identitásukat, mind a kettő hibás szerkezetű parakrisztallint halmoz fel. Kimutattuk, hogy a bb8 ms mutáns cisztákban megamitokondriumok képződnek. Kimutattuk, hogy a megamitkondriumok egy része membrán potenciállal rendelkezik. Feltételezzük, hogy a hibás mitokondrium szerkezet okozza a ciszták hibás megnyúlását. A fenotípus alapján úgy véljük, hogy a glutamát és glutamin szint meghatározó a parakrisztallin kialakulása szempontjából valamint hozzájárul a megamitokondriumok képződéséhez. A mitokondriális hibák a spermatidák megnyúlását és a normális individualizációt gátolják 7

Azonosítottuk az archipelago gén egy P-elem inszerciós hímsteril allélját (ago ms ). Genetikailag jellemeztük az ago ms allélt komplementációs analízissel, a transzpozon revertálásával, valamint a vad típusú cdns-t tartalmazó transzgén kifejeztetésével. Megállapítottuk, hogy az ago génről képződő transzkriptek szintje ago ms tesztiszekben lecsökken, és eredményeink arra utalnak, hogy a hímsterilitás kialakításáért nagy valószínűséggel az ago-rb és ago-rc transzkript csökkenése a felelős. Az ago ms mutáns vizsgálata során megállapítottuk, hogy a spermatogenezis korai stádiumai normálisan lezajlanak, de a meiózist követően az ago ms mutáns ciszták individualizációja hibát szenved. Megállapítottuk, hogy az mcherry-ago fehérje a spermatogenezis korai szakaszában a sejtmagokban, a meiózist követően pedig citoszolikusan halmozódik fel a ciszták farki végén, valamint az individualizáció során a cisztikus hólyagban figyelhetjük meg. Az ago ms mutánsban az individualizációs komplex szétcsúszik, eltérő méretű aktin kúpokat figyelhetünk meg, amiknek az irányultsága is megváltozhat. Az mcherr-ago transzgenikus fehérje jelenlétét kimutattuk a vándorló individualizációs komplexek aktin kúpjainak bazális végén, amely felvetette a nem apoptotikus kaszpáz útvonal érintettségét. Eredményeink alapján megállapítottuk, hogy a nem apoptotikus kaszpáz kaszkád az ago ms mutáns tesztiszekben aktiválódik, a ciszták teljes hosszában megfigyelhető. Nem 8

tapasztaltunk rendellenességet az ago ms mutánsban a kaszpáz aktivitást gátló, dbruce és Soti fehérjék elhelyezkedésében. A ciszták farki végén az mcherry-ago fehérje kolokalizációt mutat az Imp-GFP fehérjével. Az Imp-GFP hibás elrendeződését mutattuk az ago ms mutáns ciszták farki végén, amely azt sugallja, hogy az Ago funkciója szükséges az Imp fehérje lokalizációjának kialakításához. Az ago ms mutáns megnyúlt cisztáiban a sejtmagok rendezetlenül helyezkednek el. TUNEL jelöléssel kimutatnunk a magi DNS aprózódását, amely a hibás ciszták apoptózisára utalhat. 9

Összefoglalásként elmondhatjuk, hogy azonosítottunk kettő a poszt-meiotikus fejlődés során nélkülözhetetlen gént. Kimutattuk, hogy a bb8 glutamát dehidrogenázt kódoló gén terméke szükséges a megnyúló spermatidákban a mitokondrium származékok szabályos fejlődéséhez. A Bb8 hiányában a mitokondrium származékok elvesztik azonosságukat és megamitokondriumokat képeznek, feltehetőleg az anyagcsere útvonalban bekövetkezett változások miatt. Megállapítottuk, hogy az Ago F-box fehérje többféle szerepet játszhat a spermatidák egyedivé válása folyamán. Az Ago fehérjének szerepe lehet a megnyúlt ciszták farki végén, az Imp fehérjével interakcióban. A fluoreszcensen jelölt Ago fehérjét az individualizáció során sikerült kimutatnunk az individualizációs komplex aktin kúpjainak bazális végein, valamint kimutattuk, hogy az Ago fehérje hiánya az individualizáció hibáihoz vezet. Ezek az eredmények valószínűsítik az Ago fehérjének a cisztikus hólyagban történő protein lebontással való kapcsolatát. 10

Publikáció referált folyóiratban: Vedelek Viktor MTMT azonosító: 10030587 Vedelek V., Laurinyecz B., Kovács AL., Juhász G, Sinka R. Testis-Specific Bb8 Is Essential in the Development of Spermatid Mitochondria Plos One 2016 11 (8): e0161289. doi:10.1371/journal.pone.0161289. Laurinyecz B., Péter M., Vedelek V., Kovács A. L., Juhász G., Maróy P., Vígh L., Balogh G., Sinka R. Reduced expression of CDP-DAG synthase changes lipid composition and leads to male sterility in Drosophila. Open biology 2016. 6 (1). doi:10.1098/rsob.150169. 11

12

13