Részletes szakmai beszámoló Az erbb proteinek asszociációjának kvantitatív jellemzése című OTKA pályázatról (F049025)

Hasonló dokumentumok
Daganat immunterápia molekuláris markereinek tanulmányozása biofizikai módszerekkel. Áramlási és képalkotó citometria


Az ErbB receptorok konstitutív és ligand indukált asszociációinak kvantitatív jellemzése

Speciális fluoreszcencia spektroszkópiai módszerek

Ragyogó molekulák: dióhéjban a fluoreszcenciáról és biológiai alkalmazásairól

Az ErbB receptorok konstitutív és ligand indukált asszociációinak kvantitatív jellemzése

AKADÉMIAI DOKTORI ÉRTEKEZÉS

Bírálat. Nagy Péter: Az ErbB fehérjék klaszterizációjának biofizikai karakterizálása és biológiai jelentősége című MTA doktori értekezésére

Receptor-orientált daganatterápia vizsgálata ErbB fehérjéket kifejező humán tumorokban

Egyetemi doktori (Ph.D.) értekezés tézisei. Receptor-orientált daganatterápia vizsgálata ErbB fehérjéket kifejező humán tumorokban

Fluoreszcencia módszerek (Kioltás, Anizotrópia, FRET)

ZÁRÓJELENTÉS. Összefoglalás

Fluoreszcencia módszerek (Kioltás, Anizotrópia, FRET) Modern Biofizikai Kutatási Módszerek

Fluoreszcencia 2. (Kioltás, Anizotrópia, FRET)

Válasz Dr. Kellermayer Miklós egyetemi tanár bírálatára:

Módszer az ASEA-ban található reaktív molekulák ellenőrzésére

Zárójelentés. A) A cervix nyújthatóságának (rezisztencia) állatkísérletes meghatározása terhes és nem terhes patkányban.

A lézer-szkenning citometria lehetőségei. Laser-scanning cytometer (LSC) Pásztázó citométer. Az áramlási citometria fő korlátai

Kutatási beszámoló ( )

Immunológiai módszerek a klinikai kutatásban

Az ABCG2 multidrog transzporter fehérje szerkezetének és működésének vizsgálata

G-fehérjéhez kapcsolt receptorok dimerizációjának vizsgálata eukarióta sejtekben

A T sejt receptor (TCR) heterodimer

(1) A T sejtek aktiválása (2) Az ön reaktív T sejtek toleranciája. α lánc. β lánc. V α. V β. C β. C α.

Mozgékony molekulák vizsgálata modern mikroszkópiával

OTKA ZÁRÓJELENTÉS

Speciális fluoreszcencia spektroszkópiai alkalmazások. Emlékeztető: az abszorpció definíciója. OD = A = - log (I / I 0 ) = ε (λ) c x

Egyetemi doktori (Ph.D.) értekezés tézisei. Fluoreszcencia rezonancia energiatranszfer mérések optimalizálása. Dr. Fábián Ákos István

Natív antigének felismerése. B sejt receptorok, immunglobulinok

Hemoglobin - myoglobin. Konzultációs e-tananyag Szikla Károly

Biológiai módszerek alkalmazása környezeti hatások okozta terhelések kimutatására

A harkányi gyógyvízzel végzett vizsgálataink eredményei psoriasisban között. Dr. Hortobágyi Judit

Immunológia alapjai. 10. előadás. Komplement rendszer

EGYETEMI DOKTORI (Ph.D.) ÉRTEKEZÉS TÉZISEI. Áramlási citometriás FRET mérések optimalizálása és alkalmazása a majdnem teljes

Biomolekuláris rendszerek. vizsgálata. Semmelweis Egyetem. Osváth Szabolcs. A mikroszkópok legfontosabb típusai

Norvég Finanszírozási Mechanizmus által támogatott projekt HU-0115/NA/2008-3/ÖP-9 ÚJ TERÁPIÁS CÉLPONTOK AZONOSÍTÁSA GENOMIKAI MÓDSZEREKKEL

Az ellenanyagok orvosbiológiai. PhD kurzus 2011/2012 II. félév

Az Oxidatív stressz hatása a PIBF receptor alegységek összeszerelődésére.

Doktori értekezés tézisei

Az áramlási citométer és sejtszorter felépítése és működése, diagnosztikai alkalmazásai

A módszerek jelentősége. Gyors-kinetika módszerek. A módszerek közös tulajdonsága. Milyen módszerekről tanulunk?

ErbB receptor tirozin kinázok és β1-integrin molekuláris kölcsönhatásai: tumor terápiás vonatkozások. Dr. Petrás Miklós

Receptorok és szignalizációs mechanizmusok

FEHÉRJE VAKCINÁK BIOTECHNOLÓGIAI ELŐÁLLÍTÁSA III.

Modern mikroszkópiai módszerek

B-sejtek szerepe az RA patológiás folyamataiban

Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen

Immunológia I. 2. előadás. Kacskovics Imre

Az áramlási citometria gyakorlati alkalmazása az ondó rutin analízisben. Hajnal Ágnes, Dr Mikus Endre, Dr Venekeiné Losonczi Olga

Immunológiai módszerek a klinikai kutatásban

A fluoreszcencia orvosibiológiai. alkalmazásai. Fluoreszcencia forrása I. Fluoreszcencia alkalmazások. Kellermayer Miklós

Bevezetés a fluoreszcenciába

Jelutak. 2. A jelutak komponensei Egy tipikus jelösvény sémája. 2. Ligandok 3. Receptorok 4. Intracelluláris jelfehérjék

Immunológia alapjai előadás Az immunológiai felismerés molekuláris összetevői. Az antigén fogalma. Antitestek, T- és B-sejt receptorok:

Áramlási citometria, sejtszeparációs technikák. Immunológiai és Biotechnológiai Intézet ÁOK, PTE

NÖVÉNYÉLETTAN. Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP /1/A

Egyetemi doktori (PhD) értekezés tézisei. IL-2 és -15 receptorok kölcsönhatásainak vizsgálata humán T limfóma sejteken.

Tüdő adenocarcinomásbetegek agyi áttéteiben jelenlévő immunsejtek, valamint a PD-L1 és PD-1 fehérjék túlélésre gyakorolt hatása

Dr. Várnai Péter: MOLEKULÁRIS KÖLCSÖNHATÁSOK SZEREPE EMLŐS SEJTEK JELÁTVITELI OLYAMATAIBAN c. MTA doktori értekezésének bírálata

2. A jelutak komponensei. 1. Egy tipikus jelösvény sémája 2. Ligandok 3. Receptorok 4. Intracelluláris jelfehérjék

Mikroszkóp vizsgálata Folyadék törésmutatójának mérése

Immunológia alapjai előadás. Az immunológiai felismerés molekuláris összetevői.

Szerves oldott anyagok molekuláris spektroszkópiájának alapjai

II./3.3.2 fejezet:. A daganatok célzott kezelése

Kalcium, D-vitamin és a daganatok

Két kevéssé ismert humán ABCG fehérje expressziója és funkcionális vizsgálata: ABCG1 és ABCG4 jellemzése

Gyors-kinetikai módszerek

TDK lehetőségek az MTA TTK Enzimológiai Intézetben

(

Hatékony tumorellenes készítmények előállítása target és drug molekulák kombinációjával (Zárójelentés)

Elválasztástechnikai és bioinformatikai kutatások. Dr. Harangi János DE, TTK, Biokémiai Tanszék

Immunológia alapjai előadás. Az immunológiai felismerés molekuláris összetevői

Áramlási citometria / 4. Immunológiai és Biotechnológiai Intézet PTE KK

Abszolút és relatív aktivitás mérése

A jel-molekulák útja változó hosszúságú lehet. A jelátvitel. hírvivő molekula (messenger) elektromos formában kódolt információ

ALKÍMIA MA Az anyagról mai szemmel, a régiek megszállottságával.

Célzott terápiás diagnosztika Semmelweis Egyetem I.sz. Pathologiai és Kísérleti Rákkutató Intézet, Budapest Tamási Anna, Dr.

Immunológia alapjai előadás MHC. szerkezete és genetikája, és az immunológiai felismerésben játszott szerepe. Antigén bemutatás.

Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen

[S] v' [I] [1] Kompetitív gátlás

K68464 OTKA pályázat szakmai zárójelentés

Új terápiás lehetőségek (receptorok) a kardiológiában

6. Fehérjék kimutatása. Biokémiai és sejtszintű vizsgálatok

Tartalomjegyzék. Emlékeztetõ. Emlékeztetõ. Spektroszkópia. Fényelnyelés híg oldatokban A fény; Abszorpciós spektroszkópia

Rosszindulatú daganatok célzott, molekuláris gyógyszeres kezelése

Biokémiai kutatások ma

Mérési struktúrák

ÖSSZ-TARTALOM. 1. Az alapok - 1. előadás 2. A jelutak komponensei 1. előadás 3. Főbb jelutak 2. előadás 4. Idegi kommunikáció 3.

Modern Fizika Labor. A mérés száma és címe: A mérés dátuma: Értékelés: Infravörös spektroszkópia. A beadás dátuma: A mérést végezte:

6. Fehérjék kimutatása. Biokémiai és sejtszintű vizsgálatok

Válasz Dr. Szőllősi János opponensi véleményére

Dózis-válasz görbe A dózis válasz kapcsolat ábrázolása a legáltalánosabb módja annak, hogy bemutassunk eredményeket a tudományban vagy a klinikai

A tumor-markerek alkalmazásának irányelvei BOKOR KÁROLY klinikai biokémikus Dr. Romics László Egészségügyi Intézmény

Biomolekuláris szerkezeti dinamika

Tartalomjegyzék. Emlékeztetõ. Emlékeztetõ. Spektroszkópia. Fényelnyelés híg oldatokban 4/11/2016. A fény; Abszorpciós spektroszkópia

Tartalom. A citoszkeleton meghatározása. Citoszkeleton. Mozgás a biológiában A CITOSZKELETÁLIS RENDSZER 12/9/2016

Immunológia alapjai. 16. előadás. Komplement rendszer

Mikroszkóp vizsgálata és folyadék törésmutatójának mérése (8-as számú mérés) mérési jegyzõkönyv

6. Fehérjék kimutatása. Biokémiai és sejtszintű vizsgálatok

Gyógyszerrezisztenciát okozó fehérjék vizsgálata

Átírás:

Részletes szakmai beszámoló Az erbb proteinek asszociációjának kvantitatív jellemzése című OTKA pályázatról (F049025) A pályázat megvalósítása során célunk volt egyrészt a molekulák asszociációjának tanulmányozására FRET módszerek fejlesztése (1 3), másrészt a molekuláris asszociációk biológiai hatásának tanulmányozása (4 8). 1. Kalibrációs módszer kidolgozása a GFP analógok közötti FRET mérésekhez A GFP variánsokkal történő fluoreszcens jelzést széleskörűen alkalmazzák fehérjék intracelluláris eloszlásának és kölcsönhatásainak vizsgálatára. Bizonyos GFP variáns párok (pl. CFP YFP vagy BFP GFP) alkalmasak fluoreszcencia rezonancia energiatranszfer (FRET) mérésekhez donor akceptor párnak, de korábban a kalibráció megoldatlansága miatt nem lehetett a méréseket kvantitatívan elvégezni. Kidolgoztunk egy módszert, amelyben a donor (pl. CFP) és akceptor (pl. YFP) GFP analóg közé három különféle összekötő részt klónoztunk. A kalibrációs sorozat segítségével meg tudtuk határozni a FRET mérésekhez szükséges α paramétert, amely egy gerjesztett állapotú akceptor és donor molekula fluoreszcencia intenzitásának hányadosát adja meg. A módszerrel sikeresen szeparáltunk kölcsönható, tehát FRET et mutató fehérjéket tartalmazó élesztősejteket olyan sejtektől, melyben FRET nem volt mérhető (Cytometry, 67A: 86 96., 2005). 2. Kétoldali FRET mérések két molekulapár kölcsönhatásának korrelációjának vizsgálatára Hagyományosan FRET mérésekkel egy molekulapár (dimer) jelenlétét lehet kimutatni. A projekt céljai között szerepelt a FRET módszer alkalmazása molekula trimerek kimutatására. Ennek első lépéseként kidolgoztunk egy módszert, amellyel két molekulapár (pl. A B és B C) között külön külön mérhető FRET hatásfokokat egyszerre lehet meghatározni. A módszer alkalmazhatóságát konfokális mikroszkópos mérésekkel igazoltuk, ahol a két FRET érték (FRET A B és FRET B C ) közötti térbeli korrelációt is vizsgáltuk (Cytometry A 73A: 209 219, 2008). A munka jelenleg is folyó fázisában a kétlépcsős FRET jelenség kimutatásával a trimerek tényleges kimutatását tűztük ki célul. A kétlépcsős FRET során az A molekula gerjesztése után a B, majd a C molekula kerül FRET segítségével gerjesztett állapotba, és ezen kölcsönhatás detektálása az ABC molekulatrimer jelenlétét bizonyítja.

3. Áramlási citometriás anizotrópia mérések molekula homoklaszterek tanulmányozására A hagyományos FRET méréseket két, spektroszkópiailag különböző molekula között hajtják végre (hetero FRET). Van a FRET nek egy olyan változata, amikor két azonos típusú molekula között történik energiaátadás. Ez a jelenség a homo FRET, aminek egyetlen manifesztációja a fluoreszcencia anizotrópia csökkenése. A homo FRET et csak molekulák homoasszociációjának mérésére lehet használni, de ott alkalmas a molekulaklaszter méretének kvantitatív meghatározására. Levezettünk egy képletet, amely a fluoreszcencia anizotrópia (r) és a molekulaklaszter mérete (N), valamint a klaszterben nem levő, monomer molekulák aránya (mon) közötti összefüggést írja le: r skn,, = k ( 1 ) ( 1 ) ( 1+ d ) ( 1) N 6 6 N N kk k d mon s s r + r + s mon r k = 0 k N 1 + k d 1 + k d N N k N k k ( 1 mon) s ( 1 s) + s mon k = 0 k N 1 6 FRET 6 1 A módszer alkalmazása során a vizsgált fehérjét fluoreszcensen jelölt és jelöletlen antitest keverékével jelöltük meg. A fluoreszcens antitest arányát (telítettség, a képletben s sel jelölve) folyamatosan változtatva megmértük az anizotrópia változását, és a fenti egyenletet az anizotrópia telítettség pontsorozatra illesztettük az N és mon paraméterek változtatásával (1. ábra). A módszert sikeresen alkalmaztuk áramlási citometriás mérések során az ErbB1 és ErbB2 fehérjék klaszterméretének meghatározására (l. 4. pont, Biophys. J., 95:2086 2096, 2008). 1. ábra Reprezentatív anizotrópia mérési pontok és illesztett görbe heregulin stimulált SKBR 3 sejtek ErbB2 homoklasztereinek vizsgálata során. Az görbe akkor mutatott legjobb illeszkedést a mérési pontokra, ha 60% os monomer arányt és 30 molekulát tartalmazó klasztereket tételeztünk fel. (1)

4. Az ErbB1 és ErbB2 molekulák homoklasztereinek eltérő viselkedése A 3 as pontban ismertetett módszer segítségével megmértük stimulálatlan és EGF stimulált sejtek felszínén az EGF receptor (ErbB1) klaszterképződését. Tapasztalataink szerint az ErbB1 molekula nyugvó sejtek felszínén nagyrészt monomer állapotban van, EGF stimuláció hatására azonban az ErbB1 nemcsak a már jól ismert dimereket alkotja, hanem olyan homoklasztereket is, amelyben kb. 10 ErbB1 protein található. Az ErbB2 viselkedése a fentiekkel ellentétes volt: nyugvó sejtek felszínén az ErbB2 igen nagyfokú homoasszociációs hajlamot mutatott, hiszen egy homoklaszterben 100 ErbB2 molekulát találtunk. EGF és heregulin stimuláció hatására az ErbB2 homoklaszterek mérete igen jelentősen csökkent. Úgy gondoljuk, hogy az ErbB2 homoklaszterekben aktiválatlan ErbB2 található, amely növekedési faktor stimuláció hatására elhagyja a homoklasztereket, hogy az EGF és heregulin receptoraival (ErbB1 és ErbB3) heterodimerizáljon (2. ábra). Így az ErbB2 homoklaszterek az aktiválatlan ErbB2 raktározó helyének tekinthetők. Az utóbbi feltételezést támasztja alá az a megfigyelésünk, hogy az ErbB2 klaszterméret fordított arányosságot mutatott az ErbB2 tirozinfoszforiláció mértékével (2. ábra; Biophys. J., 95:2086 2096, 2008). A B 2. ábra A: Az ErbB2 klaszterméret fordítottan arányos az ErbB2 aktiváltsági szintjét jellemző tirozin foszforiláció mértékével. B: Modellünk szerint a növekedési faktor (EGF vagy heregulin) stimuláció hatására az ErbB2 heterodimereket alkot az elsődleges EGF és heregulin receptorokkal (ErbB1 és ErbB3), és ezért eltávolítódik az ErbB2 homoklaszterekből.

5. Fluoreszcensen jelzett EGF kötődésének vizsgálata Fluoreszcensen jelölt EGF segítségével megjelöltük az EGF receptort (ErbB1) három különböző sejtvonalon. Az egyik az ErbB molekulacsaládból szinte kizárólag az ErbB1 et fejezte ki, míg a másik kettő az ErbB1 et az ErbB2 vel vagy az ErbB3 mal koexpresszálta. Az ErbB1 EGF által kiváltott konformációváltozását és homo, ill. heterodimerizációját is magába foglaló matematikai modellt alkottunk, amely alkalmasnak bizonyult a fluoreszcensen jelzett ErbB1 molekula EGF kötésének kvantitatív jellemzésére. A mérések során áramlási citometria segítségével vizsgáltuk az EGF kötődését a növekedési faktor koncentrációjának függvényében, és a modellt a telítési görbékre illesztettük. Az illesztések kiértékelése még jelenleg is tart. Előzetes eredményeink szerint az ErbB1 molekula hajlamosabb heterodimerizációra, mint homodimerizációra, és az ErbB2 t szívesebben választja partnerül, mint az ErbB3 at. 6. A trastuzumab elsősorban ADCC reakción keresztül fejti ki hatását A trastuzumab hatásmechanizmusát illetőn hosszú évek óta vita folyik az irodalomban. Az egyik elképzelés szerint a trastuzumab az ErbB2 re gyakorolt közvetlen hatásával gátolja az onkoprotein működését, mások szerint viszont a tumorsejtek felszínéhez kötődő trastuzumab antitestfüggő celluláris citotoxicitási reakciót (ADCC) vált ki. Egérbe oldott humán emlőtumor sejtvonalból (JIMT 1) xenograftokat hoztunk létre, és trastuzumab antitesttel vagy trastuzumab F(ab) 2 vel kezeltük őket. Tapasztalataink szerint az F(ab) 2 teljesen hatástalan volt, ami arra utal, hogy az Fc rész által kiváltott reakció (valószínűleg ADCC) áll hatásának hátterében (Mol. Cancer Ther. 6: 2065 2072, 2007). 7. A CD44 ErbB2 kölcsönhatás, ill. annak biológiai hatásának vizsgálata Az ErbB2 nemcsak az ErbB családon belüli molekulákkal hat kölcsön. Ilyen családon kívüli asszociációs partner a CD44, a sejtek elsődleges hialuronsav receptora. Koprecipitációs és FRET méréseink szerint az ErbB2 és a CD44 többféle emlőtumor sejtvonalban dimerizálódik. A kölcsönhatásnak számos biológiai következménye van. Egyrészt a CD44 serkenti az ErbB2 antitest (pl. trastuzumab) által kiváltott internalizációját, hiszen a CD44 expresszió RNS interferenciával történő gátlása az ErbB2 internalizációját csökkentette. A fenti összefüggést megfigyeltük trastuzumabbal kezelt egerek emlőtumor xenograftjainak vizsgálata során is. E témában talán legfontosabb megfigyelésünk az, hogy a trastuzumab

iránti rezisztencia kifejlődésében a trastuzumab kötő epitóp maszkírozása is szerepet játszik. Mivel emlőtumor xenograftokban a hialuronsav pericelluláris mennyisége fordított arányban állt a sejtekhez kötődő trastuzumab mennyiségével, a maszkírozás egyik legfontosabb kiváltója maga a hialuronsav, melyet a tumor és stróma sejtek termelnek. Ha az egereket a hialuronsav szintézisét gátló 4 metilumbelliferonnal (4 MU) kezeltük, akkor a trastuzumab rezisztencia kifejlődése sokkal lassabban ment végbe (3. ábra; Eur. J. Cancer, 43: 2423 2433, 2007). 3. ábra Emlőtumor xenograftok növekedését a fiziológiás sóval történő kezeléshez képest a trastuzumab jelentősen gátolta, azonban a tumorok a 30. nap körül növekedésnek indultak a trastuzumab rezisztencia kialakulása miatt. Ha a trastuzumab kezelést 4 MU val kombináltuk, a rezisztencia kialakulását gátolni tudtuk. Az egerek trastuzumabbal és sóval történő oltását a nyilaknak megfelelő időpontokban, hetente végeztük. A 4 MU kezelés per os történt naponta. 8. Az ErbB1 és az ErbB2 a CD44 gyel funkcionálisan aktív komplexet alkot Az EGF és a heregulin növekedési faktorokról kimutattuk, hogy a CD44 intracelluláris proteolízisét és sheddingjét váltják ki. Méréseink szerint a CD44 shedding jelentősen fokozta a sejtek motilitását. Az EGF és heregulin által kiváltott CD44 shedding és motilitás növekedés blokkolható volt pertuzumab kezeléssel. A pertuzumab egy ErbB2 ellenes antitest, amely az ErbB2 heterodimerizációját gátolja. Így az eredmények arra utalnak, hogy a folyamatban valószínűleg részt vevő metalloproteázt az ErbB2 aktiválja. CD44 sheddinget és motilitás fokozódást hialuronsav kezeléssel is el tudtunk érni, amit viszont trastuzumab kezeléssel lehetett gátolni. Ez a trastuzumab egy nem várt hatásmechanizmusára utal, hiszen eredményeink szerint a tumorsejtekre gyakorolt közvetlen, az ADCC reakciótól független hatásával gátolja a tumorsejtek motilitását, ami a metasztázisképződés egyik fontos lépése. Elméletünket alátámasztja azon megfigyelésünk, hogy a trastuzumabbal kezelt, emlőtumor xenografttal rendelkező egerekben csökkent a keringő daganatsejtek száma (Cancer Lett. 260: 198 208, 2008; Cancer Lett. 263:231 242, 2008).