A szamóca érése során izolált Spiral és Spermidin-szintáz gén jellemzése. Kiss Erzsébet Kovács László

Hasonló dokumentumok
Klónozás: tökéletesen egyforma szervezetek csoportjának előállítása, vagyis több genetikailag azonos egyed létrehozása.

TRANSZGÉNIKUS NIKUS. GM gyapot - KÍNA. GM szója - ARGENTÍNA

Fehérje expressziós rendszerek. Gyógyszerészi Biotechnológia

Transzgénikus növények előállítása

Egy új, a szimbiotikus gümőfejlődésben szerepet játszó ubiquitin ligáz funkcionális jellemzése

Új genetikai stratégia kidolgozása az Arabidopsis stressz válaszát szabályzó gének azonosítására

Zárójelentés. Gabonafélék stresszadaptációját befolyásoló jelátviteli folyamatok tanulmányozása. (K75584 sz. OTKA pályázat)

Transzgénikus növények alkalmazása a funkcionális genomikai kutatásokban

A genetikai lelet értelmezése monogénes betegségekben

Különböző Capsicum annuum var. grossum paprikafajták endofita baktériumainak izolálása, jellemzése és molekuláris biológiai vizsgálata

Transzgénikus növények alkalmazása a funkcionális genomikai kutatásokban

1.ábra Az intront tartalmazó génkonstrukció felépítése.

Biomassza alapú bioalkohol előállítási technológia fejlesztése metagenomikai eljárással

NÖVÉNYNEMESÍTÉS. Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP /1/A

A növény inváziójában szerepet játszó bakteriális gének

Molekuláris biológiai eljárások alkalmazása a GMO analitikában és az élelmiszerbiztonság területén

A transzgén és funkciói

Szakmai zárójelentés. 1. Strukturális genomika Az RPS13 gén szekvenciájához homológ régió deléciója M. sativa-ban

c. Doktori (Ph.D.) értekezés tézisei BUKOVINSZKI ÁGNES Eötvös Loránd Tudományegyetem, Természettudományi Kar Biológia Doktori Iskola

SZENT ISTVÁN EGYETEM

NÖVÉNYÉLETTAN. Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP /1/A

Molekuláris biológiai technikák

I. A sejttől a génekig

A doktori értekezés tézisei. A növényi NRP fehérjék lehetséges szerepe a hiszton defoszforiláció szabályozásában, és a hőstressz válaszban.

Gelencsér Tímea. Peszticidek alkalmazása helyett ellenálló GMO-k létrehozásának lehetőségei. Készítette: Budapest, 2004

SZENT ISTVÁN EGYETEM. Termesztett szamócából származó, bhlh transzkripciós faktort kódoló SPATULA gén jellemzése. Doktori értekezés tézisei

A nehézségek leküzdése tesz minket egyedivé!

Molekuláris genetikai vizsgáló. módszerek az immundefektusok. diagnosztikájában

(11) Lajstromszám: E (13) T2 EURÓPAI SZABADALOM SZÖVEGÉNEK FORDÍTÁSA

Génkifejeződési vizsgálatok. Kocsy Gábor

NÖVÉNYGENETIKA. Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP /1/A

Cím: Az ozmotikus stresszválasz szabályozása magasabbrendű növényekben.

Bioinformatika előadás

NÖVÉNYÉLETTAN. Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP /1/A

BMGE, Alkalmazott biokémia, transzgénikus organizmusok, 2009 Transzformációs módszerek

Egy új genetikai módszerrel azonosított Arabidopsis A4A hősokk faktor funkcionális jellemzése

Növényvédelmi Tudományos Napok 2014

Zárójelentés. A szkizofrénia diagnosztizálására alkalmas perifériás genetikai marker azonosítása c. T számú OTKA témáról

Az X kromoszóma inaktívációja. A kromatin szerkezet befolyásolja a génexpressziót

Részletes zárójelentés PD-75169

13. RNS szintézis és splicing

A VASFELVÉTELBEN SZEREPET JÁTSZÓ GÉNEK MOLEKULÁRIS. Nyilasi Ildikó DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI

TÉMAKÖRÖK. Ősi RNS világ BEVEZETÉS. RNS-ek tradicionális szerepben

Bioinformatika előadás

A TATA-kötő fehérje asszociált faktor 3 (TAF3) p53-mal való kölcsönhatásának funkcionális vizsgálata

NÖVÉNYÉLETTAN. Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP /1/A

TDK lehetőségek az MTA TTK Enzimológiai Intézetben

A HupSL és Hox1 NiFe hidrogenáz enzimek összehangolt szabályozásának vizsgálata Thiocapsa roseopersicina baktériumban. Ph.D.

A felgyorsult fehérje körforgás szerepe a transzlációs hibákkal szembeni alkalmazkodási folyamatokban

CzB Élettan: a sejt

Ivarplazmában tárolt RNS-ek azonosítása teljes genom DNS microarray segítségével

Az anafázis promoting complex (APC/C) katalitikus modulja Drosophila melanogasterben. Nagy Olga

Kromoszómák, Gének centromer

Szakmai beszámoló Az Arabidopsis foszfoprotein foszfatáz enzimcsalád 1. ábra.

Juhász Angéla MTA ATK MI Alkalmazott Genomikai Osztály SZEKVENCIA ADATBÁZISOK

Kappelmayer János. Malignus hematológiai megbetegedések molekuláris háttere. MOLSZE IX. Nagygyűlése. Bük, 2005 szeptember

Bevezetés-Acinetobacter

A termesztett búza diploid őseinek molekuláris citogenetikai elemzése: pachytén- és fiber-fish.

In memoriam. Tisztelt Olvasó! S eldönti, ami nem az

A búza fagyállóságban szerepet játszó Cbf gének szerepének bizonyítása transzformációval

NÖVÉNYGENETIKA. Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP /1/A

Klinikai kémia. Laboratóriumi diagnosztika. Szerkesztette: Szarka András. Írta: Budapesti Műszaki és Gazdaságtudományi Egyetem Semmelweis Egyetem

ADATBÁNYÁSZAT I. ÉS OMICS

Az AGO-kötő silencing szupresszorok jellemzése és az első mesterséges silencing szupresszor létrehozása. Doktori tézisek. Szabó Edit Zsuzsanna

TRANSZGENIKUS BIOMARKER ZEBRADÁNIÓ (DANIO RERIO) VONALAK POTENCIÁLIS ALKALMAZÁSA A TOXIKOLÓGIÁBAN

A pseudoxanthoma elasticum öröklődő betegség kialakulásáért felelős ABCC6/MRP6 gén transzkripciós szabályozásának vizsgálata F48684.

GENOMIKA TÖBBFÉLE MAKROMOLEKULA VIZSGÁLATA EGYIDŐBEN

A preventív vakcináció lényege :

Nemzeti Onkológiai Kutatás-Fejlesztési Konzorcium a daganatos halálozás csökkentésére

A géntechnikák alkalmazási területei leltár. Géntechnika 3. Dr. Gruiz Katalin

PÉCSI TUDOMÁNYEGYETEM. Természetes és mesterséges agrobaktérium rezisztencia vizsgálata szőlőben. Galambos Anikó

Transzgénikus. nikus állatok. Transzgénikus nikus minden olyan állat, melynek genomja emberi közremk bejuttatott DNS-t t tartalmaz.

Zárójelentés OTKA T

RNS-ek. 1. Az ősi RNS Világ: - az élet hajnalán. 2. Egy már ismert RNS Világ: - a fehérjeszintézis ben résztvevő RNS-ek

A genomikai oktatás helyzete a Debreceni Egyetemen

Ph.D. Tézis. Új módszerek a transzgénes egér technológiában. Dr Bélteki Gusztáv

ZÁRÓJELENTÉS A MOLEKULÁRIS ONKOGENEZIS MECHANIZMUSAI GYAKORI DAGANATOKBAN C. PÁLYÁZAT TELJESÍTÉSÉRŐL

TRANSZFORMÁCIÓVAL LÉTREHOZOTT ÁRPAFAJTÁK HIDEG- ÉS SZÁRAZSÁGTŰRÉSI STRESSZ-TOLERANCIÁJÁNAK ELŐZETES VIZSGÁLATAI

Preeclampsia-asszociált extracelluláris vezikulák

A gyümölcs érésének és a virág vázaélettartamának géntechnológiai módosítása

A C. elegans TRA-1/GLI/Ci szex-determinációs faktor célgénjeinek meghatározása és analízise. Doktori értekezés tézisei.

A LISZTHARMAT ÉS A FOGÉKONY SZŐLŐ KÖZÖTTI MOLEKULÁRIS KAPCSOLAT. Tóth Zsófia 1 -Kiss Erzsébet 2

A replikáció mechanizmusa

Transzgenikus módszerek fejlesztése és alkalmazása a NORK gén szimbiotikus kapcsolatok kialakulásában betöltött szerepének vizsgálatára

Egy 10,3 kb méretű, lineáris, a mitokondriumban lokalizált DNS-plazmidot izoláltunk a

Escherichia coli aminosav-transzporterek vizsgálata

SZENT ISTVÁN EGYETEM. Termesztett szamócából származó, bhlh transzkripciós faktort kódoló SPATULA gén jellemzése. Doktori értekezés.

Norvég Finanszírozási Mechanizmus által támogatott projekt HU-0115/NA/2008-3/ÖP-9 ÚJ TERÁPIÁS CÉLPONTOK AZONOSÍTÁSA GENOMIKAI MÓDSZEREKKEL

Az ADA2b adaptor fehérjéket tartalmazó hiszton acetiltranszferáz komplexek szerepének vizsgálata Drosophila melanogaster-ben

A Notch receptor-kódoló lin-12 és glp-1 gének cisz-szabályozó régióinak meghatározása Caenorhabditis elegansban - konzervált HOX kontroll?

TRANSZGENIKUS BIOMARKER ZEBRADÁNIÓ (DANIO RERIO) VONALAK ALKALMAZÁSÁNAK LEHETŐSÉGEI AZ ÖKOTOXIKOLÓGIÁBAN

Növényvédelmi Tudományos Napok 2015

SZENT ISTVÁN EGYETEM

KOAGULÁCIÓS FAKTOROK BIOTECHNOLÓGIAI ELŐÁLLÍTÁSA

Elcsendesített RNS-ek vagy a genom immunrendszere

2011. január április 10. IPK Gatersleben (Németország) május 17. Kruppa Klaudia

Az élelmiszeripar és az egészségmegőrzés lehetséges kapcsolódási pontjai

AZ ELÉRT EREDMÉNYEK Új mutáns allélek ismert óragénekben

Cserző Miklós Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban. Integrált biológiai adatbázisok

PÉCSI TUDOMÁNYEGYETEM. Agrobacterium rezisztencia térképezése szőlőben. Kuczmog Anett

Átírás:

A szamóca érése során izolált Spiral és Spermidin-szintáz gén jellemzése Kiss Erzsébet Kovács László

Bevezetés Nagy gazdasági gi jelentıségük k miatt a gyümölcs lcsök, termések fejlıdésének mechanizmusát t intenzíven kutatták A gyümölcscs lcscsérésneksnek két t fıf típusa van Klimaktérikus (utóé óérı) Nem- klimaktérikus (Nem utóé óérı)

Gyümölcsérés Klimaktérikus Etilén-függı Nem-klimaktérikus Etiléntıl független (?)

Univerzális vagy eltérı biokémia és génexpresszió a két érési típusban? Etiléntıl független érési mechanizmust találtak paradicsomban (rin, nor) A rin gén homológját megtalálták szamócában is Etilén-függı jelmolekulákat kódoló géneket azonosítottak szamócában

Az érés során eltérı transzkripciót mutató géneket azonosítottunk cdns-aflp módszerrel A gyümölcsfejl lcsfejlıdés s során n 277 génnek g változott az expressziója Spiral és s a Spermidin-szint szintáz gének

A gének kódoló és promoter szakaszát is izoláltuk In silico elemzés

Kódoló szakasz Promoter szakasz Az ORF-ek meghatározása Bináris vektorba ligálása szensz és antiszensz orientációban Agrobacterium tumefaciens transzformációja Paradicsom (MikroTom) és szamóca transzformációja Riportergént (GFP) tartalmazó vektorba építése Agrobacterium tumefaciens transzformációja Tesztelés tranziens expresszióval

A Spiral gének A termés s végsv gsı méretét t a magházban virágny gnyíláskor már m r jelen levı sejtek száma határozza meg A paradicsom termései példp ldául virágny gnyílás s után n teljes egész szében sejtmegnyúlással ssal növekednek A Spiral gének a sejtmegnyúlás szabályoz lyozói

Spiral gének Az Arabidopsis thaliana 6 Spiral génje ismert A Spiral1 1 mutánsok gyökerei mindig jobbra helikálisan lisan növekednek Egy 110 130 aminosavból álló fehérj rjét t kódolnakk Auxin hatására csökken a gén g expressziója

Spiral gének Szamócában auxin hatására csökken a gén g expressziója Relatív Expresszió 102 100 98 96 94 92 90 88 86 84 82 Kontroll Auxin kezelt kezelt

A Spermidin szintáz gén A poliamin metabolizmus egyik kulcsenzimét kódolja Az almában 3 változatát azonosították A megnövekedett poliamin szint a sejtekben növeli a növény abiotikus stresszekkel szembeni a ellenállóságát

A Spermidin-szintáz gén Szamócában csak egy változatát sikerült azonosítani A gén 9 exonból és 8 intronból áll Egy 340 aminosavból álló fehérjét kódol

A Spermidin szintáz gén Az almában azonosított spermidin szintáz gének mérete, exon-intron szerkezete A poliaminok szerepe az érésben, illetve az abiotikus stressz toleranciában

Eredmények A két gén in silico analízise Spiral gének in silico analízise Spermidin-szintáz gének in silico analízise

Eredmények Az ORF-ek azonosítása után génspecifikus primerekkel felszaporítottuk a genomi és cdns klónokat Hasonló módon felszaporítottuk a gének promoterrégióit

Eredmények A DNS szakaszokat vektorokba építettük és Agrobacterium tumefaciens-t transzformáltunk velük A transzformáció sikerességét bizonyítottuk

Eredmények A Spiral gént szensz és antiszensz orientációban tartalmazó Agrobacterium C58C1-es törzsével MikroTom paradicsomot és szamóca Elvira fajtát transzformáltunk

Eredmények A Spiral szensz orientációjú konstrukciójával sem a paradicsomban sem a szamócában nem kaptunk regeneránst Az antiszensz konstrukcióval viszont mindkét esetben regeneráltunk növényeket

Eredmények A növénytranszformáció eredményességét PCR technikával bizonyítottuk Csak a szamócák között tudtunk transzformánsokat azonosítani

Eredmények Promoter-elemzés Tranziens expressziós vizsgálatok A Spiral, Spermidin-szintáz gén promoterrégióját a pgwb604 plazmidba építettük Ez a plazmid sgfp nevő riportergént tartalmaz: UV fényben egy zölden fluoreszkáló fehérjét kódol A Spiral gén promoterével még nem, de Spermidin-szintáz gén promoterével meggyızı eredményt kaptunk

Eredmények Tranziens expressziós vizsgálatok

Összefoglalás Meghatároztuk a Spiral, Spermidin-szintáz gén genomi ORF-jét és promoterrégióit A két gén kódoló szakaszát szensz és antiszensz orientációban bináris vektorokba ligáláltuk Megépítettük a két gén promoterrégióját tartalmazó bináris vektorokat Közvetett géntranszfer céljából a 6 konstrukcióval Agrobacterium tumefaciens C58C1 törzset transzformáltunk

Összefoglalás A Spiral gén szensz és antiszensz orientációjú konstrukcióival transzformáltunk MikroTom paradicsomot és szamócát Szamóca esetében DNS szinten bizonyítottuk a transzformáció sikerességét Tranziens expresszióval vizsgáltuk a két gén promoterrégióját A GFP zöld fluoreszcenciája bizonyította, hogy a Spermidin-szintáz gén promoterrégiója valóban promoter

Köszönetünket fejezzük ki a TÁMOP 4.2.2.B-10/1-2010-0011 programnak A Növénytudományi Doktori Iskola kutatásainak támogatásáért Kovács László predoktori ösztöndíjáért

Köszönöm a megtisztelı figyelmet!