Eötvös Lóránd Tudomány Egyetem Természettudományi Kar Környezettudományi Doktori Iskola

Hasonló dokumentumok
Patogén amőbák és szimbiontáiknak vizsgálata magyarországi termál- és gyógyfürdőkben

Különböző Capsicum annuum var. grossum paprikafajták endofita baktériumainak izolálása, jellemzése és molekuláris biológiai vizsgálata

Barna Zsófia. Eötvös Loránd Tudományegyetem - Természettudományi Kar Környezettudományi Doktori Iskola. Országos Környezetegészségügyi Intézet

Összehasonlító környezetmikrobiológiai. Böddi-szék vizében egy alga tömegprodukció idején

A Legionella jelenlétének kimutatása

a NAT /2012 nyilvántartási számú akkreditált státuszhoz

Algaközösségek ökológiai, morfológiai és genetikai diverzitásának összehasonlítása szentély jellegű és emberi használatnak kitett élőhelykomplexekben

Patogén mikroorganizmusok vizsgálata molekuláris biológiai módszerekkel

RÉSZLETEZŐ OKIRAT (1) a NAH /2018 nyilvántartási számú akkreditált státuszhoz

MÓDOSÍTOTT RÉSZLETEZŐ OKIRAT (1) a NAH / nyilvántartási számú akkreditált státuszhoz

a NAT /2012 nyilvántartási számú akkreditált státuszhoz

Korszerű eleveniszapos szennyvízkezelési eljárások, a nitrifikáció hatékonyságának kémiai, mikrobiológiai vizsgálata

Magyarországi fürdők mikrobiológiai vízminősége

Nemzeti Akkreditáló Hatóság. RÉSZLETEZŐ OKIRAT a NAH /2016 nyilvántartási számú akkreditált státuszhoz

Hatályosság:

Nemzeti Akkreditáló Testület. MÓDOSÍTOTT RÉSZLETEZŐ OKIRAT (3) a NAT /2011 nyilvántartási számú akkreditált státuszhoz

Várandós nők Streptococcus agalactiaeszűrése

Molekuláris biológiai eljárások alkalmazása a GMO analitikában és az élelmiszerbiztonság területén

Nemzeti Akkreditáló Hatóság. RÉSZLETEZŐ OKIRAT a NAH /2016 nyilvántartási számú akkreditált státuszhoz

MÓDOSÍTOTT RÉSZLETEZŐ OKIRAT (3) a NAT /2013 nyilvántartási számú akkreditált státuszhoz

Nemzeti Akkreditáló Testület. MÓDOSÍTOTT RÉSZLETEZŐ OKIRAT (2) a NAT /2011 nyilvántartási számú akkreditált státuszhoz

Az Országos Epidemiológiai Központ. BMPT Főosztályának Bakteriológiai, Parazitológiai, Mikológiai és Tipizáló Továbbképzése

Kőolaj- és élelmiszeripari hulladékok biodegradációja

a NAT /2011 nyilvántartási számú akkreditált státuszhoz

a NAT /2013 nyilvántartási számú akkreditált státuszhoz

Humán használatú vizek egészségkockázatának előrejelzése

Természetes és medencés fürdővíz mikrobiológiai körvizsgálatok értékelése. Schuler Eszter, dr. Vargha Márta

MÓDOSÍTOTT RÉSZLETEZŐ OKIRAT (1) a NAH / nyilvántartási számú akkreditált státuszhoz

JAVÍTÁSI-ÉRTÉKELÉSI ÚTMUTATÓ. Orvosi laboratóriumi technikai asszisztens szakképesítés Mikrobiológiai vizsgálatok modul. 1.

RÉSZLETEZŐ OKIRAT (1) a NAH /2017 nyilvántartási számú akkreditált státuszhoz

a NAT /2007 számú akkreditálási ügyirathoz

RÉSZLETEZŐ OKIRAT a NAH /2016 nyilvántartási számú akkreditált státuszhoz

Nemzeti Akkreditáló Testület. RÉSZLETEZŐ OKIRAT a NAT /2014 nyilvántartási számú akkreditált státuszhoz

In Situ Hibridizáció a pathologiai diagnosztikában és ami mögötte van.

Nemzeti Akkreditáló Testület. MÓDOSÍTOTT RÉSZLETEZŐ OKIRAT (1) a NAT /2013 nyilvántartási számú akkreditált státuszhoz

Nemzeti Akkreditáló Testület. SZŰKÍTETT RÉSZLETEZŐ OKIRAT (2) a NAT /2013 nyilvántartási számú akkreditált státuszhoz

a NAT /2013 nyilvántartási számú akkreditált státuszhoz

Mikroszkopikus gombák szerepe a parlagfű pollenszezon terminációjában

Staphylococcus haemolyticus törzsek antibiotikum rezisztenciájának. nak lis megoszlása. sa alapján. Kardos Szilvia,

Nemzeti Akkreditáló Testület. SZŰKÍTETT RÉSZLETEZŐ OKIRAT (1) a NAT /2013 nyilvántartási számú akkreditált státuszhoz

VIZSGÁLÓLABORATÓRIUM ÁRJEGYZÉK

Továbbadása, sokszorosítása írásos engedélyhez kötött.

RÉSZLETEZŐ OKIRAT a NAH /2017 nyilvántartási számú akkreditált státuszhoz

MÓDOSÍTOTT RÉSZLETEZÕ OKIRAT (1)

Tipizálási módszerek alkalmazása methicillin-rezisztens Staphylococcus aureus (MRSA) törzsek molekuláris epidemiológiai vizsgálatai során

Nemzeti Akkreditáló Testület. RÉSZLETEZŐ OKIRAT a NAT /2015 nyilvántartási számú akkreditált státuszhoz

Biomassza alapú bioalkohol előállítási technológia fejlesztése metagenomikai eljárással

A PNP kóroktanának molekuláris vizsgálata Dán Ádám és Rónai Zsuzsanna

A nitrifikáció folyamatát befolyásoló tényezők vizsgálta ivóvízelosztó rendszerekben

Városi talajok jellemzésének lehetőségei Sopron példáján

RÉSZLETEZŐ OKIRAT (2) a NAH /2014 nyilvántartási számú 1 akkreditált státuszhoz

RÉSZLETEZŐ OKIRAT (1) a NAH /2017 nyilvántartási számú akkreditált státuszhoz

RÉSZLETEZŐ OKIRAT (2) a NAH /2016 nyilvántartási számú akkreditált státuszhoz

REGIONÁLIS BAKTERIOLÓGIAI LABORATÓRIUM. Klinikai bakteriológiai és kórházhigénés részleg

MÓDOSÍTOTT RÉSZLETEZŐ OKIRAT (1) a NAH / nyilvántartási számú akkreditált státuszhoz

A Hárskúti- fennsík környezetterhelésének vizsgálata az antropogén hatások tükrében

SZÛKÍTETT RÉSZLETEZÕ OKIRAT (1)

BESZIVÁRGÓ VIZEK VIZSGÁLATA A BUDAI-HEGYSÉG EGYIK

A ferrát-technológia klórozással szembeni előnyei a kommunális szennyvizek utókezelésekor

MÓDOSÍTOTT RÉSZLETEZŐ OKIRAT (1) a NAH /2015 nyilvántartási számú 2 akkreditált státuszhoz


RÉSZLETEZŐ OKIRAT (5) a NAH /2015 nyilvántartási számú 2 akkreditált státuszhoz

Ferrát-technológia alkalmazása biológiailag tisztított szennyvizek kezelésére

Nemzeti Akkreditáló Testület. RÉSZLETEZŐ OKIRAT a NAT /2015 nyilvántartási számú akkreditált státuszhoz

Legionella baktériumok előfordulása természetes és mesterséges vízi környezetekben, monitorozás

A Gömör-Tornai-karszt vízrendszerének vizsgálata kémiai és matematikai módszerek felhasználásával

Feketéné Dr. Zeke Ildikó megyei tisztifőorvos. Nógrád Megyei Államigazgatási Kollégium ülése Salgótarján december 13.

a NAT /2006 számú akkreditálási ügyirathoz

a NAT /2008 számú akkreditálási ügyirathoz

UV-sugárzást elnyelő vegyületek vizsgálata GC-MS módszerrel és kimutatásuk környezeti vízmintákban

Országos Szakfelügyeleti Módszertani Központ

Nosocomialis infekciókat okozó baktériumok tipizálásának jelentősége a kórházi járványok felderítésében

RÉSZLETEZŐ OKIRAT a NAH /2018 nyilvántartási számú akkreditált státuszhoz

Szerv- és szövet-specifikus Myxobolus fajok elkülönítése molekuláris biológiai módszerek segítségével

RÉSZLETEZŐ OKIRAT (5) a NAH /2014 nyilvántartási számú (4) akkreditált státuszhoz

SZÛKÍTETT RÉSZLETEZÕ OKIRAT (1)

MÓDOSÍTOTT RÉSZLETEZÕ OKIRAT (2)

Bakteriális identifikáció 16S rrns gén szekvencia alapján

A Multi Locus Sequence Typing (MLST) alkalmazhatósága az élelmiszermikrobiológiában

Nemzeti Akkreditáló Hatóság. BŐVÍTETT RÉSZLETEZŐ OKIRAT (1) a NAT /2014 nyilvántartási számú akkreditált státuszhoz

Minta száma. Szín, szag, íz. Mintavétel ideje. oxigénigény vezetőképesség ph. zavarosság* ammónium nitrit. mangán. kémiai. arzén

KUTATÁS-FEJLESZTÉSI EREDMÉNYEK HATÉKONY FELHASZNÁLÁSI LEHETŐSÉGEI ÉS EREDMÉNYEI A PILZE-NAGY KFT-NÉL SOMOSNÉ DR. NAGY ADRIENN SZEGED,

Talaj- és vízmintavétel. A mintavétel A minták csomagolása A minták tartósítása

Magyar Tejgazdasági Kísérleti Intézet Kft., Biológiai K+F+I Osztály, Mosonmagyaróvár

a NAT /2007 számú akkreditálási ügyirathoz

Nemzeti Akkreditáló Testület. MÓDOSÍTOTT RÉSZLETEZŐ OKIRAT (1) a NAT /2014 nyilvántartási számú akkreditált státuszhoz

Adszorbeálható szerves halogén vegyületek kimutatása környezeti mintákból

a NAT /2012 nyilvántartási számú akkreditált státuszhoz

MH HOVÉDKÓRHÁZ Egészségügyi Hatósági és Haderővédelmi Igazgatóság Honvéd Közegészségügyi és Járványügyi Intézet HATÓSÁGI LABORATÓRIUMI OSZTÁLY

Minta száma. Szín, szag, íz. Mintavétel ideje. oxigénigény vezetőképesség ph. zavarosság* ammónium nitrit. mangán. kémiai. arzén

A MALDI-TOF tömegspektrometria alkalmazási és fejlesztési lehetőségei a patogén mikroorganizmusok vizsgálatában

A mintavételek időpontjait az 1. sz., a mintavételi helyeket a 2. sz táblázat tartalmazza. 1.sz. táblázat Mintavételi időpontok

További paraméterek a következő lapon

További paraméterek a következő lapon

Adszorbeálható szerves halogén vegyületek koncentráció változásának vizsgálata kommunális szennyvizek eltérő módszerekkel történő fertőtlenítése során

További paraméterek a következő lapon

Nemzeti Akkreditáló Testület. RÉSZLETEZŐ OKIRAT a NAT /2013 nyilvántartási számú akkreditált státuszhoz

További paraméterek a következő lapon

További paraméterek a következő lapon

2011. január április 10. IPK Gatersleben (Németország) május 17. Kruppa Klaudia

Átírás:

Eötvös Lóránd Tudomány Egyetem Természettudományi Kar Környezettudományi Doktori Iskola Kiss Csaba ÁNTSZ Nyugat-dunántúli Reg. Intézete Témavezetık: Dr. Márialieti Károly ELTE Mikrobiológiai Tanszék Dr. Vargha Márta OKI Vízmikrobiológiai osztály

Bevezetés Magyarország termál- és gyógyfürdıi tekintetében nagyhatalomnak számít Hatályos magyar rendeletek szerinti egészségügyi kockázatot csökkentı rendszerek a. visszaforgatott rendszerek b. töltı-ürítı rendszerek Az ÁNTSZ által végzett hatósági és az üzemeltetıi vizsgálatok nem tárnak fel minden kockázati tényezıt

Bevezetés Naegleria sp.: Primer amıbás meningitis (PAM) 6 fajból egy humán patogén (N.flowerii) Egészséges, fiatal felnıtt férfiakat támad elsısorban Édesvizekben bárhol elıfordulhatnak Termotoleránsak Acanthamoeba sp.: Amıbás keratitist (AK) 8 faj okozhat Granulomás amıbás enkefalitiszt 1 faj okoz GAE-t immunszupresszáltaknál AK-t egészségeseknél is Édesvízi termotoleráns fajok Termotoleráns patogén prokarióták Mycobacterium sp. Burkholderia sp. Chlamydia sp. Rickettsia sp. Legionella sp.

Célkitűzések Patogén amıbák és Legionellák győjtése törzsgyőjtemény létrehozása céljából Hatékony győjtési és tenyésztési módszerek beállítása amıbák és Legionellák kimutatására medencés fürdıkbıl Molekuláris biológiai azonosító és tipizáló módszerek (16S rdns,18s rdns PCR, mtdns RFLP) beállítása Amıbák azonosítására szolgáló molkuláris biológiai módszerek fejlesztése Szimbiózis vizsgálata mesterséges körülmények közt teszésztéses, FISH, PCR és TEM technikákkal A víz biotikus és abiotikus hatásainak vizsgálata a két élılénycsoportra és szimbiózisukra Kolonizáció vizsgálata fürdıkön belül (amıbák fajszintő, Legionellák szerotípus szintő meghatározása molkuláris biológiai eszközökkel) Összefüggések keresése a termál-, ill. gyógyvíz tulajdonságai és az amıba, Legionella szennyezettsége közt Szimbiózis vizsgálata a fürdıkben: víz minıségének hatása a szimbiózisra, szimbiózis hatásának vizsgálata a túlélésre a fürdıken alkalmazott fertıtlenítések mellett

Mintavétel Amıbák Biofilmbıl törletminták alkalmazásával a. medence fal b. túlfolyó rács Víztestbıl 1 liter merített víz vétele steril palackba Legionellák Biofilmbıl vett törletminták alkalmazása a. medence fal b. túlfolyó rács Víztestbıl vett minták alkalmazása a. 1 liter merített víz vétele szőrıpapírról történı DNS kivonáshoz b. 500 ml merített minta vétele hagyományos tenyésztéhez

Tenyésztési módszerekek Legionellák 0,5 liter vízminta szőrése GVPC szelektív táptalajra Amıbák - PYG tápoldat alkalmazása - NNA agar hıvel inaktivált E.coli-val szélesztve

Módszer beállítás Amıbák azonosítására szolgáló módszerek fejlesztése Mikroszkópos és genus specifikus PCR módszerek Cél: Primer páros Hıfok Eredmény SSU1 ; SSU2 60 C Negatív WormI. ; sb 54 C Negatív SSU1 ; P1R 59 C Negatív SSU1 ; sb 61 C Negatív P1F; sb 59 C Pozitív Egy univerzális primerrel molekuláris biológiai eszközökkel faji szintő azonosítás

Módszer beállítás Amıbák azonosítására szolgáló módszerek fejlesztése P1F;sb primer párossal kapott szakasz szekvencia analízise: Hartmannella vermiformis 92%-os egyezéssel További 13 minta elemzése

Módszer beállítás Amıbák azonosítására szolgáló módszerek fejlesztése Szekvencia analízis eredménye A szekvenciák összehasonlító elemzése nagyon heterogén eredményt hozott A szekvenciákat törzsfába illesztettük, de teljesen elkülönülı csoportot adott A módszer további finomítása szükéges!

Módszer beállítás Amıbák genus szintő azonosítására Genus-specifikus 18S rdns alapján történı azonosítás 3 amıba genus kiválasztása identifikálás céljából (Hartmannella, Acanthamoeba, Naegleria) A módszer elınye, hogy relatív specifikus eredményt kapunk A módszer hátránya, hogy az összes mintára le kell futtatni mind a 3 PCRreakciót

Legionella izolátumok azonosítása Genus szintő identifikálás klasszikus mikrobiológiai eszközökkel tenyésztéses módszerrel azonosítás cisztein auxotrófia és telepmorfológia alapján Molekuláris biológiai azonosítás 16S rdns alapján történı azonosítás (JFP/JRP) genus szintő ERIC PCR faj alatti szintő törtüveg telepmorfológia Szerológiai azonosítás Faj és faj alatti szintő Cisztein auxotrófia vizsgálata cisztein mentes ciszteint tartalmazó Marker Fürdıvízbıl izolált törzsek Filterrıl izolált törzsek +kont. -kont. Legionella neg. L. pneumophila Legionella 2-14 386bp nagyságú PCR termék

Módszer beállítás Legionellák faji szint alatti azonosítása molekuláris biológiai eszközökkel Az ERIC-PCR a genom konzervatív, ismétlıdı szekvenciáira nézve specifikus. Ezek száma és elhelyezkedése faji szint alatti felbontást tesz lehetıvé Az eddig izolált minták vizsgálata során jól elkülönülnek az egyes fürdık és esetenként markáns különbségek vannak a szerotípusok közt is. A módszer alakalmasnak tőnik a törzsek faj alatti szintő azonosításához és a szerotipizálással együtt az esetleges epidemiológiai vonatkozások tisztázására fürdık vonatkozásában is A fürdı B fürdı C fürdı

Helyszíni mintavételek eredményei Eddig 21 fürdıben végeztünk mintavételt, melyekben különbözı egyéb elemekkel (jodid ion, kovasav, fluor, kálcium, magnézium) dúsított alkálihidrogénkarbonátos használnak a medencékhez Ezen fürdık közül tizenkettı nagyobb volt 5-25 medencével és kilenc kisebb 1-3 medencével A medencék 31% töltı-ürítı rendszerő volt, a maradék 69% pedig fertıtlenített medence

Helyszíni mintavételek eredményei 21 fürdıben 152 medencét mintáztunk meg melybıl 105 fertıtlenített és 47 töltı-ürítı rendszerő volt Legionellára 125 mintát dolgoztunk fel Amıbára 138 mintát dolgoztunk fel Rutin bakteriológiai vizsgálatok: E.coli, P.aeruginosa, S.aureus, Coccus-szám (408 vizsgálat) Rutin kémiai vizsgálatok: KOI, Klorid, Nitrát, Nitrit, Ammónium,Keménység, Lúgosság,pH,H 2 O 2, Dewan50, Szabad és kötött klór, Fe, Mn, Al (1277 vizsgálat)

Helyszíni mintavételek eredményei Legionella minták megoszlása medence típusok közt Amıba minták megoszlása medence típusok közt

Helyszíni mintavételek eredményei Literenkénti csíraszám Töltı-ürítı és forgatott medencék csíraszámának alakulása 22000 Min-Max 25%-75% 18000 Medián 14000 10000 6000 2000-2000 TU VF 200 180 160 140 120 100 80 60 40 20 0 VF medencék coccus-számai és amıbák jelenléte Pozitív amıbára: 21 Negatív amıbára: 58 1 4 7 10 13 16 19 22 25 28 31 34 37 40 43 46 49 52 55 58 20000 18000 16000 14000 12000 10000 8000 6000 4000 2000 0 TÜ medencék coccus-számai és amıbák jelenléte Pozitív amıbára: 13 Negatív amıbára: 23 1 3 5 7 9 11 13 15 17 19 21 23 25 27 29 31 33 35 Coccusz-szám Coccusz-szám pozitív amıba mintánál 7000 6000 5000 4000 3000 2000 1000 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20

További lépések További mintákkal bıvíteni a törzsgyőjteményeket és az elemzett minták számát a 2009-as nyári fürdıszezonban Mesterséges körülmények közt a szimbiózis kialakítása a két élılény csoport közt (FISH, TEM, PCR vizsgálatok) Vizsgálni kívánjuk a víz paraméterinek mesterséges változtatásának hatását a két élılény csoportra, valamint szimbiózisukra (ph, hımérséklet, vezetıképesség baktériumszám)

Összefoglalás Mind a két csoportra beállítottuk a mintavételi és tenyésztéses eljárásokat Legionellák esetében genus, faji és faj szint alatti identifikáló módszereket állítottunk be és alkalmaztunk Amıbák tekintetében mikroszkópos módszerrel vizsgáljuk az izolátumokat, a 18S rdns alapján történı identifikálás eredményei kiértékelés alatt vannak Amıbák azonosítása során megpróbáltuk egy új módszer kidolgozásával, ám ez további fejlesztésre szorul Összesen 21 fürdıben vettünk mintát (12 fürdıben volt amıba, 7- ben Legionella, minták 36 %-a pozitív amıbára, 18 % Legionellára, Mind a két csoport a töltı-ürítıs rendszerekben vannak leginkább elterjedve, s az amıbák terjedésében antropogén hatás figyelhetı meg jelen adatok alapján 23 Legionella és 50 amıba törzset izoláltunk Legionellák faji szint alatti azonosítására beállított ERIC-PCR módszer eddigi vizsgálataink alapján alkalmas fürdık Legionella közösségeinek elkülönítésére is

Köszönetnyílvánítás Dr. Török Júliának az amıba vizsgálatok terén nyújtott tengernyi szakmai segítséghez Barna Zsófiának és az OKI Vízmikrobiológiai Osztály valamennyi dolgozójának a szakmai segítséget, valamint a lehetıséget, hogy az Osztályon dolgozzak Az ÁNTSZ Ny-d. R. I.-nek Laboratóriumi Osztályán dolgozó valamennyi kollegámnak Témavezetıimnek dr. Vargha Mártának és dr. Márialigeti Károlynak az egész témámhoz nyújtott segítséget

Köszönöm a figyelmet!