RÉSZLETES SZAKMAI BESZÁMOLÓ

Hasonló dokumentumok
A pályázat címe: Reaktív oxigén származékok szerepe a fibrózis kialakulásában

Kutatási beszámoló A p50gap intracelluláris eloszlásának és sejtélettani szerepének vizsgálata

A p50 Rho GTPáz aktiváló fehérje fehérjedoménjeinek jelátviteli szerepe a sejtek membrán forgalmában. Dr. Sirokmány Gábor

Kutatási beszámoló ( )

In vivo szövetanalízis. Különös tekintettel a biolumineszcens és fluoreszcens képalkotási eljárásokra

Immunológiai módszerek a klinikai kutatásban

A TATA-kötő fehérje asszociált faktor 3 (TAF3) p53-mal való kölcsönhatásának funkcionális vizsgálata

dc_250_11 1. Bevezetés 3

Az AT 1A -angiotenzinreceptor G-fehérjétől független jelátvitelének vizsgálata C9 sejtekben. Doktori tézisek. Dr. Szidonya László

Többgénes jellegek. 1. Klasszikus (poligénes) mennyiségi jellegek. 2.Szinte minden jelleg több gén irányítása alatt áll

Növényvédelmi Tudományos Napok 2014

Az Oxidatív stressz hatása a PIBF receptor alegységek összeszerelődésére.

Biológiai módszerek alkalmazása környezeti hatások okozta terhelések kimutatására

Gyógyszerrezisztenciát okozó fehérjék vizsgálata

avagy az ipari alkalmazhatóság kérdése biotechnológiai tárgyú szabadalmi bejelentéseknél Dr. Győrffy Béla, Egis Nyrt., Budapest

transzláció DNS RNS Fehérje A fehérjék jelenléte nélkülözhetetlen minden sejt számára: enzimek, szerkezeti fehérjék, transzportfehérjék

OTKA ZÁRÓJELENTÉS

MTA DOKTORI ÉRTEKEZÉS NADPH-OXIDÁZ ÉS PEROXIDÁZ ENZIMEK VIZSGÁLATA EMLŐS SEJTEKBEN GEISZT MIKLÓS

Semmelweis egyetem. A Vav2 fehérje szabályozásának vizsgálata az epidermális növekedési faktor jelpályájában TAMÁS PÉTER

Immunológia alapjai. 10. előadás. Komplement rendszer

~ 1 ~ Ezek alapján a következő célokat valósítottuk meg a Ph.D. munkám során:

Mit tud a genetika. Génterápiás lehetőségek MPS-ben. Dr. Varga Norbert

Apoptózis. 1. Bevezetés 2. Külső jelút 3. Belső jelút

Az ARHGAP25 - egy új GTPáz aktiváló fehérje - sejtélettani szerepének vizsgálata humán fagocitákban

Jelutak. Apoptózis. Apoptózis Bevezetés 2. Külső jelút 3. Belső jelút. apoptózis autofágia nekrózis. Sejtmag. Kondenzálódó sejtmag

A herpes simplex vírus és a rubeolavírus autofágiára gyakorolt in vitro hatásának vizsgálata

Dr. Nemes Nagy Zsuzsa Szakképzés Karl Landsteiner Karl Landsteiner:

ÖSSZ-TARTALOM 1. Az alapok - 1. előadás 2. A jelutak komponensei 1. előadás 3. Főbb jelutak 2. előadás

A téma címe: Mikroszómális glukóz-6-foszfát szerepe granulocita apoptózisában

Jelutak ÖSSZ TARTALOM. Jelutak. 1. a sejtkommunikáció alapjai

ÖSSZ-TARTALOM. 1. Az alapok - 1. előadás 2. A jelutak komponensei 1. előadás 3. Főbb jelutak 2. előadás 4. Idegi kommunikáció 3.

Molekuláris biológiai eljárások alkalmazása a GMO analitikában és az élelmiszerbiztonság területén

Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen

A T sejt receptor (TCR) heterodimer

A genetikai lelet értelmezése monogénes betegségekben

Jelátviteli folyamatok vizsgálata neutrofil granulocitákban és az autoimmun ízületi gyulladás kialakulásában

Immunológia alapjai 5-6. előadás MHC szerkezete és genetikája, és az immunológiai felismerésben játszott szerepe. Antigén bemutatás.

Natív antigének felismerése. B sejt receptorok, immunglobulinok

A PROTEIN KINÁZ C IZOENZIMEK SZEREPE HUMÁN HaCaT KERATINOCYTÁK SEJTM KÖDÉSEINEK SZABÁLYOZÁSÁBAN

(1) A T sejtek aktiválása (2) Az ön reaktív T sejtek toleranciája. α lánc. β lánc. V α. V β. C β. C α.

A tumor-markerek alkalmazásának irányelvei BOKOR KÁROLY klinikai biokémikus Dr. Romics László Egészségügyi Intézmény

Lymphoma sejtvonalak és gyerekkori leukémia (ALL) sejtek mikro RNS (mir) profiljának vizsgálata

Áramlási citometria / 4. Immunológiai és Biotechnológiai Intézet PTE KK

Immunológia alapjai előadás MHC. szerkezete és genetikája, és az immunológiai felismerésben játszott szerepe. Antigén bemutatás.

Újabb ismeretek a Graves-ophthalmopathia kórisméjében

A farnezol és a vörös pálmaolaj szerepe az iszkémiás/reperfúziós károsodás elleni védelemben

A peroxinitrit szerepe a késői prekondícionálással és posztkondícionálással kiváltott kardioprotekcióban. Pályázati téma összefoglalása

Peroxidáz és NADPH-oxidáz enzimek működésének vizsgálata. Doktori tézisek. Donkó Ágnes. Semmelweis Egyetem Molekuláris Orvostudományok Doktori Iskola

TDK lehetőségek az MTA TTK Enzimológiai Intézetben

Immunológia alapjai. 16. előadás. Komplement rendszer

OTKA nyilvántartási szám: K48376 Zárójelentés: A pályázat adott keretein belül az alábbi eredményeket értük el:

Ca 2+ Transients in Astrocyte Fine Processes Occur Via Ca 2+ Influx in the Adult Mouse Hippocampus

A szamóca érése során izolált Spiral és Spermidin-szintáz gén jellemzése. Kiss Erzsébet Kovács László

Az anti-apoptózis mechanizmus vizsgálata agyi ischaemia/hypoxia modellekben

A keringı tumor markerek klinikai alkalmazásának aktuális kérdései és irányelvei

Norvég Finanszírozási Mechanizmus által támogatott projekt HU-0115/NA/2008-3/ÖP-9 ÚJ TERÁPIÁS CÉLPONTOK AZONOSÍTÁSA GENOMIKAI MÓDSZEREKKEL

Szénhidrátok monoszacharidok formájában szívódnak fel a vékonybélből.

Molekuláris biológiai technikák

Kromoszómák, Gének centromer

Preeclampsia-asszociált extracelluláris vezikulák

Genetikai panel kialakítása a hazai tejhasznú szarvasmarha állományok hasznos élettartamának növelésére

Immunológiai módszerek a klinikai kutatásban

Fagyasztás, felolvasztás, preparálás hatása a humán DNS fragmentáltságára. Nagy Melinda. MART VII. kongresszusa Sümeg,

A határsejtvándorlás szabályozásában résztvevœ gének azonosítása és jellemzése ecetmuslicában

Immunológia alapjai. Az immunválasz szupressziója Előadás. A szupresszióban részt vevő sejtes és molekuláris elemek

A Caskin1 állványfehérje vizsgálata

DER (Felületén riboszómák találhatók) Feladata a biológiai fehérjeszintézis Riboszómák. Az endoplazmatikus membránrendszer. A kódszótár.

Debreceni Egyetem Orvos- és Egészségtudományi Centrum Biofizikai és Sejtbiológiai Intézet

A vér élettana III. Fehérvérsejtek és az immunrendszer

Ph.D. értekezés tézisei. A c-típusú citokrómok biogenezisében résztvevő fehérjék. szerepe és génjeik szabályozása Sinorhizobium meliloti-ban

Ellenanyag reagensek előállítása II Sándor Noémi

Immunológia Alapjai. 13. előadás. Elsődleges T sejt érés és differenciálódás

Tüdő adenocarcinomásbetegek agyi áttéteiben jelenlévő immunsejtek, valamint a PD-L1 és PD-1 fehérjék túlélésre gyakorolt hatása

Áramlási citometria, sejtszeparációs technikák. Immunológiai és Biotechnológiai Intézet ÁOK, PTE

TRANSZGENIKUS NYÚL ELŐÁLLITÁSA HUMÁN BETEGSÉGMODELL CÉLJÁBÓL BŐSZE ZSUZSANNA 2013

ANTICORPORA MONOCLONALIA AD USUM HUMANUM. Monoklonális antitestek, embergyógyászati célra

T-2 TOXIN ÉS DEOXINIVALENOL EGYÜTTES HATÁSA A LIPIDPEROXIDÁCIÓRA ÉS A GLUTATION-REDOX RENDSZERRE, VALAMINT ANNAK SZABÁLYOZÁSÁRA BROJLERCSIRKÉBEN

A Drosophila melanogaster poszt-meiotikus spermatogenezisében szerepet játszó gének vizsgálata. Ph.D. értekezés tézisei.

A tananyag felépítése: A BIOLÓGIA ALAPJAI. I. Prokarióták és eukarióták. Az eukarióta sejt. Pécs Miklós: A biológia alapjai

Immunbiológia 4. előadás MHC szerkezete és genetikája, és az immunológiai felismerésben játszott szerepe Antigénprezentáció Engelmann Péter

Nemszinaptikus receptorok és szubmikronos Ca2+ válaszok: A két-foton lézermikroszkópia felhasználása a farmakológiai vizsgálatokra.

Zárójelentés. A) A cervix nyújthatóságának (rezisztencia) állatkísérletes meghatározása terhes és nem terhes patkányban.

Alapfogalmak I. Elsősorban fehérjék és ezek szénhidrátokkal és lipidekkel alkotott molekulái lokalizációjának meghatározásának eszköze.

Az áramlási citometria gyakorlati alkalmazása az ondó rutin analízisben. Hajnal Ágnes, Dr Mikus Endre, Dr Venekeiné Losonczi Olga

Az áramlási citométer és sejtszorter felépítése és működése, diagnosztikai alkalmazásai

Egy új, a szimbiotikus gümőfejlődésben szerepet játszó ubiquitin ligáz funkcionális jellemzése

Immunológia alapjai előadás. Az immunológiai felismerés molekuláris összetevői.

FEJEZETEK AZ ÉLETTAN TANTÁRGYBÓL

A NADPH-oxidáz- és protoncsatornaműködés vizsgálata immunsejtekben

Doktori. Semmelweis Egyetem

Receptorok és szignalizációs mechanizmusok

A replikáció mechanizmusa

A humán tripszinogén 4 expressziója és eloszlási mintázata az emberi agyban

A peroxinitrit és a capsaicin-szenzitív érző idegek szerepe a szívizom stressz adaptációjában

Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen

A harkányi gyógyvízzel végzett vizsgálataink eredményei psoriasisban között. Dr. Hortobágyi Judit

A gázcsere alapjai, a légzési gázok szállítása

1b. Fehérje transzport

TEMATIKA Biokémia és molekuláris biológia IB kurzus (bb5t1301)

Két kevéssé ismert humán ABCG fehérje expressziója és funkcionális vizsgálata: ABCG1 és ABCG4 jellemzése

Átírás:

RÉSZLETES SZAKMAI BESZÁMOLÓ 1. A Renox (Nox4)-deficiens egérmodell létrehozása Az OTKA pályázat keretében végzett kutatások egyik legfontosabb eredménye, hogy sikerült létrehozni egy Nox4 (Renox)-deficiens egértörzset. Ezt a munkát Dr Thomas Leto (NIH) laboratóriumával együttműködésben végeztük. A Nox4-deficiens állatok fenotípusának analízise jelenleg is folyamatban van és egyelőre még nem tudtuk azonosítani a kieső Nox4 működés következményét. A Nox4-deficiens állatok életképesek és jól szaporodnak ami alapján kimondhatjuk, hogy a Nox4 enzim nem elengedhetetlen az élethez. Az OTKA pályázatom munkatervében vázoltam azt a hipotézist, hogy a vesében expresszálódó Nox4 oxigénérzékelőként működhet és fontos szerepe lehet az eritropoetin (EPO) termelés szabályozásában. Ezt az elképzelésünket arra alapoztuk, hogy korábban számos kísérleti adat utalt arra, hogy az EPO termelést szabályozó oxigén-érzékelő egy szabadgyök-termelő hemoprotein lehet. A Nox4-deficiens állatok hematológiai paramétereit vizsgálva megállapítottuk, hogy azok normálisak. Ez alapján elmondhatjuk, hogy a Nox4 nem játszik szerepet a konstitutív vérképzés szabályozásában. Fontos azonban megjegyezni, hogy a vesében folyó EPO termelés nyugalmi körülmények között szinte kimutathatalan, azonban különböző stressz helyzetekben (pl. hipoxia, vérzés) jelentősen fokozódik. Következő kísérleteinkben azt szeretnénk vizsgálni, hogy a Nox4-nek szerepe van-e ilyen körülmények között a vérképzés szabályozásában. Az elmúlt években kimutatták, hogy a Nox4 fehérje a vesén kívül még számos szervben, szövetben megfigyelhető. Ezek közül különösen izgalmasnak tűnik az endothel, ahol számos megfigyelés szerint a Nox4 tűnik az elsődleges reaktív oxigén forrásnak. Dr Benyó Zoltánnal (SE, Klinikai Kísérleti Kutató- és Humánélettani Intézet) együttműködésben azt kezdtük vizsgálni, hogy a Nox4 vajon szerepet játszik-e az artériás vérnyomás szabályozásában. Munkahipotézisünk szerint ugyanis az endothel sejtekben Nox4 által termelt szuperoxid anion reagálhat a nitrogen monoxiddal és mérsékelheti annak értágító hatását. A NADPH oxidázok kutatásában nagy nehézséget okoz a megfelelő antitestek hiánya. A Nox4 enzim ellen sem ismert olyan antitest amely alkalmas lenne a fehérje detektálására. Jelenleg több különböző stratégiával próbálunk olyan Nox4-ellenes antitestet előállítani amely megbízhatóan működhet Western blot kísérletekben és immunfestésre is alkalmas lehet. A Nox4-deficiens egér az antitest fejélesztésben is komoly segítséget nyújt, ugyanis az

állatokból származó szövetek kontrollként szerepelhetnek az antitest specifitását vizsgáló kísérletekben. 2. A p50 RhoGAP fehérje funkciójának jellemzése Rho GTPázok számos különböző sejtfolyamatban vesznek részt, mint például a sejtmozgás, génátírás, membránforgalom, szuperoxid termelés. A humán genom adatai alapján a Rho GTPázok számát 20-25 közöttire becsülhetjük, ugyanakkor szabályozó fehérjéik száma, mint pl. a kicserélő faktorok és a GTPáz aktiváló proteinek (GAP), legalább háromszorosa ennek. Ez a különbség azt sugallja, hogy egy GTPáz minden egyes sejten belüli funkcióját egy bizonyos szubcelluláris környezetben a szabályozó fehérjék egy adott, külön csoportja irányítja. Az ilyen szabályozó molekula komplexek kialakulása fehérje-fehérje és fehérje-lipid interakciókon keresztül jön létre. Célunk a számos szövetben expresszálódó p50rhogap fehérje tanulmányozása volt, mely N-terminálisan tartalmaz egy igen érdekes, ismeretlen funkciójú Sec14 homológ domént. A sejten belüli lokalizáció megállapításához poliklonális antitestet termeltettünk a fehérje ellen és GFP-fúziós formáját állítottuk elő. Azt találtuk, hogy erős kolokalizációt mutatott a korai és a reciklizáló endoszóma markerekkel (transzferrin-receptor és Rab11) és ezt a lokalizációt egyértelműen a Sec14 homológ domén határozta meg. A p50rhogap és a Rab11 között mért biolumineszcens rezonancia energia transzfer alapján úgy tűnik, hogy az endoszomális membránokon molekuláris komplexet képez a Rab11 kis G fehérjével és ez a kapcsolat is a Sec14 doméntől függ. Mindazonáltal in vitro GTPáz méréseink alapján a p50 egyértelműen nem hat GAP-ként a Rab fehérjékre. Immunfluoreszcencia jelöléses kísérleteket is végeztünk a p50rhogap és a Rho család tagjai lokalizációjának összevetésére. Eredményeink szerint a p50rhogap kapcsolatot teremthet a Rho és Rab család GTPázai között. Az endoszómális membránforgalomban részt vevő fehérjék funkciójának tanulmányozására széles körben alkalmazott a transzferrin felvétel és reciklizáció mérése, ezért fluoreszcens transzferrin assay-ket alkalmaztunk abból a célból, hogy a p50rhogap overexpressziójának hatásait vizsgáljuk az endoszómális körforgás folyamataiban. Összefoglalva eredményeink a GTPáz aktiváló fehérjék egyéb doménjeinek jelentőségét hangsúlyozzák, melyek meghatározóak lehetnek a GAP aktivitás tér- és időbeli szabályozásában. 3. A Rac1 fehérje szerepe a Nox enzimek szabályozásában

A fagocita sejtekben található NADPH oxidáz enzimkomplex fontos része a Rac kismólsúlyú GTP-kötő fehérje. Kísérleteinkben azt vizsgáltuk, hogy vajon a nem-fagocita sejtekben található NADPH oxidáz enzimek szabályozásában is szerepet játszhat-e a Rac1. A Nox1 és Nox3 fehérjékre azért esett a választásunk mert, részben saját eredményeink alapján, tudjuk, hogy ezek a membránfehérjék kölcsönhatásba lépnek citoszolikus szabályozó fehérjékkel. A Nox1 citoszolikus regulátorai a NOXO1 (Nox Organizer 1) és NOXA1 (Nox Activator 1). A Nox3 aktivitása kevésbé függ a citoszolikus fehérjéktől de valószínű, hogy a NOXO1 a Nox3-nak is fontos partnere. Kísérleteinkben Rac1 mutánsok és Rac1 expressziót spcifikusan csökkentő sirns technika segítségével kimutattuk, hogy a Rac1 szerepet játszik a Nox1 és a Nox3 aktivitásának szabályozásában. Azt is kimutattuk, hogy a Rac1 ezt a hatását a NOXA1 fehérjéhez kötve fejti ki és a kötődés mechanizmusa nagyon hasonló a Rac1 fehérje p67 phox - hoz való kötődéséhez, amely a fagocita oxidáz aktiválódásának fontos mozzanata. További kísérletekben azt találtuk, hogy ha a NOXA1-et egy irányító szekvencia segítségével a plazmamembránhoz visszük akkor a Nox1 szuperoxidtermelése függetlenné válik a NOXO1- től, vagyis a NOXO1 szerepe elsősorban a NOXA1 membránhoz történő irányítása. Érdekes módon azonban még ilyen körülmények között is függ a szuperoxidtermelés a Rac1-től, ami arra utal, hogy a Rac1 fehérjének szerepe van az enzim aktiválódás folyamatának végső lépéseiben is. Eredményeink arra utalnak, hogy a vastagbél epithel sejtjeiben funkcionáló Nox1 szabályozása nagyon hasonló a fagocita oxidáz szabályozásához (1. ábra), ami felveti annak a lehetőségét is hogy a két rendszer funkciója is igen hasonló lehet.

1. ábra A fagocita- és colon oxidáz aktivációjának mechanizmusa 4. Egy új emberi peroxidáz azonosítása A humán peroxidazin egy ismeretlen funkciójú peroxidáz, amely számos szövetben expresszálódik (2. ábra). (kb) AGY SZÍV VÁZIZOM VASTAGBÉL THYMUS LÉP VESE MÁJ VÉKONYBÉL PLACENTA TÜDŐ LEUKOCYTÁK 9.5 7.5 4.4 2. ábra A peroxidazin mrns expressziója különböző humán szövetekben

A humán peroxidazinnal nagymértékben homológ, új emberi peroxidázt azonosítottunk, amelyet peroxidazin 2-nek, vagy szív peroxidáznak (cardiac peroxidase, CPO) neveztünk el (Génbank szám: AAX70929). Ennek egy részét kódoló humán DNSszekvenciát génbankban történt homológiakeresés során találtuk. Ennek a szekvenciának egy darabját próbaként felhasználva Northern blot analízist végeztünk. Ugyanazokat a szöveteket vizsgáltuk, mint a humán peroxidazin 1 esetében, és meglepő eredményt kaptunk. Amint az ennek nyomán adott név is mutatja, a CPO mrns-ét kizárólag a szívben detektáltuk (3. ábra). Nem volt megtalálható a vázizomban, a vastagbélben, a thymusban, a lépben, a vesében, a májban, a vékonybélben, a placentában, a tüdőben, az agyban és a fehérvérsejtekben sem. További Northern blottal végzett vizsgálataink alapján a peroxidazin 2 az aortát kivéve a felnőtt humán szív minden részében megtalálható, azaz a szívcsúcsban, a bal és jobb pitvarban, a bal és a jobb kamrában. A magzati teljes szívből származó mintában is detektálható a peroxidazin2 mrns-e, azonban sokkal kisebb mennyiségben (ábra). A kísérletek alapján a teljes mrns valószínű mérete kb. 4,5 kb-nak adódott. (kb) AGY SZÍV VÁZIZOM VASTAGBÉL THYMUS LÉP VESE MÁJ VÉKONYBÉL PLACENTA TÜDŐ LEUKOCYTÁK MAGZATI SZÍV FELNŐTT SZÍV AORTA SZÍVCSÚCS BAL PITVAR JOBB PITVAR BAL KAMRA JOBB KAMRA 9.5 7.5 4.4 3. ábra A peroxidazin 2 (CPO) mrns expressziója humán szövetekben A legnagyobb, ehhez a génhez tartozó cdns-darab is, amelyet az adatbázisokban találtunk, jóval kisebb volt ennél a feltételezett méretnél. Az így talált szekvenciarészlet az mrns 3, azaz a fehérje C-terminálisan található darabját kódolta, tartalmazta a peroxidáz domén nagy részét és a stop kodont is. Az 5 -vég keresése során az addig ismert szekvencia

helyét a humán genomon belül a 8. kromoszómán azonosítottuk. Itt az 5 véget feltételezhetően kódoló régiót minden lehetséges leolvasási keretben lefordítva kapott aminosavsorrendet homológiába állítottuk a peroxidazin1-vel. A homológ részek nagy valószínűséggel kódoló szekvenciaszigeteketnek felelnek meg. Ezek peroxidazin 1-en belüli elhelyezkedése és konzervált doménekhez való viszonya alapján azonosítottuk a peroxidáz domén hiányzó részét, és további, az 5 vég irányába eső doménrészeket. A teljes kódoló szekvenciát SMART RACE (= rapid amplification of cdna ends) technika segítségével azonosítottuk. A kódoló szekvencia alapján meghatároztuk az aminosavsorrendet, majd ennek segítségével a fehérje másodlagos szerkezetét ( 4. ábra). 4. ábra A peroxidazin 2 (CPO) szerkezete Ez a szerkezet nagymértékben hasonló a peroxidazin 1 felépítéséhez, szintén tartalmazza az arra jellemző fő doméneket: az extracelluláris szignál peptidet, a leucingazdag-régiót, a négy Ig-hurkot, a peroxidáz domént és a C-terminális cisztein-gazdag részt. Az ezekre a peroxidazin 1 esetében leírt jellemzők és valószínűsített szerepek a peroxidazin 2- re is érvényesek. A fehérje ellen antitestet termeltettünk és jelenleg a fehérje szíven belüli lokalizációját vizsgáljuk.