Diagnosztikai célú molekuláris biológiai vizsgálatok



Hasonló dokumentumok
10. CSI. A molekuláris biológiai technikák alkalmazásai

ZÁRÓJELENTÉS A MOLEKULÁRIS ONKOGENEZIS MECHANIZMUSAI GYAKORI DAGANATOKBAN C. PÁLYÁZAT TELJESÍTÉSÉRŐL

Az emberi erőforrás értéke

A genetikai vizsgálatok jelene, jövője a Ritka Betegségek vonatkozásában

Veleszületett rendellenességek etiológiai csoportjai

10. Genomika 2. Microarrayek és típusaik

A HUMÁN GENOM PROJEKT Sasvári-Székely Mária* Semmelweis Egyetem, Orvosi Vegytani, Molekuláris Biológiai és Pathobiokémiai Intézet

VIII. Magyar Sejtanalitikai Konferencia Fény a kutatásban és a diagnosztikában

3. Sejtalkotó molekulák III.

++ mm. +m +m +m +m. Hh,fF Hh,fF hh,ff hh,ff. ff Ff. Hh hh. ff ff ff ff. Hh Hh hh hh

Dr. Ottó Szabolcs Országos Onkológiai Intézet

Doktori (Ph.D.) értekezés tézisei. dr. Klein Izabella 2000.

Humán genom variációk single nucleotide polymorphism (SNP)

Nagy áteresztő képességű SNP mérések hasznosítása. Dr. Szalai Csaba

VÁLASZ OPPONENSI VÉLEMÉNYRE

Genetikai polimorfizmus vizsgálatok 1-es típusú cukorbetegségben

Gyógyszerek és DNS mutációk kimutatása vérből

Posztvakcinációs rotavírus surveillance Magyarországon,

Molekuláris terápiák

A replikáció mechanizmusa

HAPMAP Nemzetközi HapMap Projekt. SNP GWA Haplotípus: egy kromoszóma szegmensen lévő SNP mintázat

A proteomika új tudománya és alkalmazása a rákdiagnosztikában

A genetikai lelet értelmezése monogénes betegségekben

Bayesi relevancia és hatáserősség mértékek. PhD tézisfüzet. Hullám Gábor. Dr. Strausz György, PhD (BME)

Közös stratégia kifejlesztése molekuláris módszerek alkalmazásával a rák kezelésére Magyarországon és Norvégiában

Az öröklődés legfontosabb alapfogalmai Genotípus X környezet interakció. A környezet meghatározó. Genetika & szelekció a vadgazdálkodásban

Hazai méhészeti genomikai és genetikai vizsgálatok

DNS molekulák elválasztása agaróz gélelektroforézissel és kapilláris elektroforézissel

20 éves a Mamma Klinika

II. Glukokortikoid receptor gén polimorfizmusok fiziologiás és pathofiziologiás szerepének vizsgálata

ÖNÉLETRAJZ. Gyermekei: Lőrinc (1993), Ádám (1997) és Árpád (1997) Középiskola: JATE Ságvári Endre Gyakorló Gimnáziuma,

Klinikai kémia. Laboratóriumi diagnosztika. Szerkesztette: Szarka András. Írta: Budapesti Műszaki és Gazdaságtudományi Egyetem Semmelweis Egyetem

II./3.3.2 fejezet:. A daganatok célzott kezelése

Genomadatbázisok Ld. Entrez Genome: Összes ismert genom, hierarchikus szervezésben (kromoszóma, térképek, gének, stb.)

Molekuláris biológiai diagnosztika alkalmazása

Molekuláris biológiai módszerek m. hibridizációs s technikák

A funkcionális genomikai eszköztár szerepe az onkológiai kutatásokban

Dr. Tárnoki Ádám Domonkos PhD Semmelweis Egyetem, Budapest Radiológiai és Onkoterápiás Klinika Magyar Ikerregiszter

KÓROKI MUTÁCIÓK AZONOSÍTÁSA ÖRÖKLETES ANGIOÖDÉMÁBAN ÉS A C1-INH GÉN MUTÁCIÓS ADATBÁZISÁNAK LÉTREHOZÁSA

III./5. GIST. Bevezetés. A fejezet felépítése. A.) Panaszok. B.) Anamnézis. Pápai Zsuzsanna

Tartalomjegyzék TARTALOMJEGYZÉK

Jelátviteli uatk és daganatképződés

Transzláció. Leolvasás - fehérjeszintézis

Herediter Nonpolipózis Kolorektális Karcinóma elıfordulásával szerzett tapasztalataink. Igazolt mutáció hordozó családok családfa analízise.

Temperamentum, kognitív teljesítmény és hipnábilitás pszichogenetikai asszociációvizsgálatai

Genomika. Mutációk (SNP-k) és vizsgálatuk egyszerű módszerekkel. DNS szekvenálási eljárások. DNS ujjlenyomat (VNTR)

1) Invazív pneumococcus populáció komplex epidemiológiai felmérése

Molekuláris genetikai vizsgáló. módszerek az immundefektusok. diagnosztikájában

A géntechnológia genetikai alapjai (I./3.)

A tremor elektrofiziológiai vizsgálata mozgászavarral járó kórképekben. Doktori tézisek. Dr. Farkas Zsuzsanna

3. HPV típusok meghatározása RFLP analízissel, típus-specifikus PCR módszerrel és blot assay módszerrel.

DNS-szekvencia meghatározás

Bioinformatika az élelmiszergyártásban és a táplálkozástudományban

1. Célkitűzésem a praeeclampsiában és HELLP szindrómában eltérő expresszivitást mutató

CzB Élettan: a sejt

A gidrán fajta genetikai változatosságának jellemzése mitokondriális DNS polimorfizmusokkal Kusza Szilvia Sziszkosz Nikolett Mihók Sándor,

Doktori (Ph.D.) értekezés tézisei. Dr. Bártfai Zoltán. Semmelweis Egyetem, Általános Orvostudományi Kar, Pulmonológiai Klinika

Az eddigi szakmai, vezetői, oktatói és tudományos munka ismertetése

Méhes Károly Genetikai Továbbképző Napok

Zárójelentés. Állati rotavírusok összehasonlító genomvizsgálata. c. OTKA kutatási programról. Bányai Krisztián (MTA ATK ÁOTI)

T Zárójelentés

Hátterükben egyetlen gén áll, melynek általában számottevő a viselkedésre gyakorolt hatása, öröklési mintázata jellegzetes.

Genetikai panel kialakítása a hazai tejhasznú szarvasmarha állományok hasznos élettartamának növelésére

(11) Lajstromszám: E (13) T2 EURÓPAI SZABADALOM SZÖVEGÉNEK FORDÍTÁSA

(McCune- Albright szindróma)

Animal welfare, etológia és tartástechnológia

Mangalica specifikus DNS alapú módszer kifejlesztés és validálása a MANGFOOD projekt keretében

A VÉZETT MUKKA ÉS A MUNKATERV MEGVALÓSTÁSA ÉVENKÉNTI BONTÁSBAN

BELGYÓGYÁSZAT. Factor V.Leiden genotípus súlyos, poplitealis restenosissal járó atherosclerosisban

Molekuláris biológiai vizsgálatok

XIII. DOWN SZIMPÓZIUM: TUDOMÁNYOS TOVÁBBKÉPZÉS A MAGZATI ORVOSTAN AKTUÁLIS FEJEZETEIBŐL PROGRAM ÁPRILIS 21. CSÜTÖRTÖK

A humán papillomavírusok prognosztikai szerepe a méhnyak rákmegel z elváltozásaiban

Engedélyszám: /2011-EAHUF Verziószám: Humángenetikai vizsgálatok követelménymodul szóbeli vizsgafeladatai

SZOMATIKUS ÉS Y KROMOSZÓMÁN LOKALIZÁLÓDÓ STR MARKEREK POPULÁCIÓGENETIKAI VIZSGÁLATA

dr Borza Erzsébet Csolnoky Ferenc Kórház, Veszprém Konzulens: dr Bartal Alexandra

A D-vitamin receptor génpolimorfizmusainak jelentosége krónikus betegségek kialakulásában

OTKA zárójelentés

Melyik gén mutáns egy betegségben? Tory Kálmán Semmelweis Egyetem, I. sz. Gyermekklinika

A basidiomycota élesztőgomba, a Filobasidium capsuligenum IFM törzse egy olyan

HAJLAMOSÍTÓ GÉNEK VIZSGÁLATA MAGYAR MORBUS CROHNOS ÉS COLITIS ULCEROSÁS BETEGPOPULÁCIÓBAN

Genomiális eltérések és génexpressszió közötti kapcsolat vizsgálata, melanomák metasztázisképzésére jellemző genetikai markerek kutatása

A multiplex endokrin neoplasia 1-es típusának klinikai és genetikai vizsgálata

Az ABCG2 multidrog transzporter fehérje szerkezetének és működésének vizsgálata

Egyetemi doktori (PhD) értekezés tézisei

Minőségbiztosítás, validálás

Kappelmayer János. Malignus hematológiai megbetegedések molekuláris háttere. MOLSZE IX. Nagygyűlése. Bük, 2005 szeptember

cobas TaqScreen MPX Test for use on the cobas s 201 system

2.1. Multifaktoriális betegségek általános jellemzői

XIII. DOWN SZIMPÓZIUM Tudományos továbbképzés a magzati orvostan aktuális fejezeteiből április 21. CSÜTÖRTÖK

Nagy Emese: Polimorfizmus és rokonsági körök vizsgálata kukoricában (Zea mays) Témavezetők: Cs. L. Marton G Gyulai

MOLEKULÁRIS GENETIKA A LABORATÓRIUMI MEDICINÁBAN. Laboratóriumi Medicina Intézet 2017.

Támogatóink: Neurogenetikai Társaság. X. Konferenciája. Budapest December 2-3. Genzyme Europe B.V. Képviselet. Társrendező:

OTKA Zárójelentés 2006: Beszámoló OTKA szám: Genetikai és vasoaktív mechanizmusok, valamint az obesitás szerepének vizsgálata serdülők és

cobas TaqScreen MPX Test, version 2.0 for use on the cobas s 201 system

Molekuláris biológiai technikák

cobas TaqScreen MPX Test, version 2.0 for use on the cobas s 201 system

EPIDEMIOLÓGIAI ALAPFOGALMAK ÉS STANDARDIZÁLÁS

Real time PCR módszerrel végzett patogén vizsgálatok tapasztalati

Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP /1/A projekt

Többgénes jellegek. 1. Klasszikus (poligénes) mennyiségi jellegek. 2.Szinte minden jelleg több gén irányítása alatt áll

Átírás:

Diagnosztikai célú molekuláris biológiai vizsgálatok Dr. Patócs Attila, PhD MTA-SE Molekuláris Medicina Kutatócsoport, Semmelweis Egyetem II. sz. Belgyógyászati Klinika Laboratóriumi Medicina Intézet

Genetikai vizsgálatok megközelítése Monogénes betegségek: - ismert öröklődésmenet - egy gén felelős - mutációk: ritka genetikai variánsok - kimutatás: DNS vizsgálómódszerek (SSCP, TTGE, DGGE, szekvenálás) Komplex öröklődésű betegségek: - nem ismert öröklődésmenet - több gén - Polimorfizmusok (SNP): gyakori genetikai variánsok - Vizsgálatok: több, akár 500000-1000000 SNP egyidejű vizsgálata (microarray)

Transzkripció-transzláció, örökítő anyag Mi a gén? Molekuláris genetikai laboratórium feladata Gén Promoter Start kodon Exonok Intronok Stop kodon 5 -UTR Pre-mRNS Transzkripció 3 -UTR N Érett mrns 5 Splicing 5 AAAA3 Riboszómák Sejtmagmembrán Polipeptid AAAA 3 Részlet a készülő Endokrinológiai genetika című könyvből (Igaz P, Patócs A, Rácz K) C

Öröklődés menet Genotípus Fenotípus Domináns öröklődés Recesszív öröklődés AA Aa aa AA Aa aa Beteg Beteg Egészséges Egészséges Egészséges (tünetmentes hordozó) Beteg

Autoszomális domináns öröklődés

Autoszomális recesszív öröklődés

A családfa szerkesztés során használt egyezményes jelek

Genetikai vizsgálatok célja 1. Molekuláris diagnosztikai labor feladata Ismert géneltérések kimutatása beteganyagunkban (mutáció-szűrés, polimorfizmusok gyakoriságának meghatározása): -betegség-okozó mutációk azonosítása -MEN1: -MEN2: -CYP21A2: -GR receptor polimorfizmusok kimutatása: Szűrőmódszerek: TTGE SSCP, majd restrikciós enzim emésztés allél-specifikus amplifikálás allél specifikus PCR restrikciós enzim emésztés Szűrőmódszerek alkalmazása után a beazonosított eltérés megerősítése egy másik módszerrel, általában DNS szekvenálás

Genetikai vizsgálatok célja 2. Betegség, vagy valamilyen fenotípus hátterében álló genetikai eltérés azonosítása (genomikai kutatások) Jellemzők: - Nincs ismert gén - Teljes genom vizsgálata szükséges - Case-control vizsgálatok -Kapcsoltsági vizsgálatok -Asszociációs vizsgálatok - Nagy volumenű, relatív olcsó módszer szükséges - Elsősorban kutató laboratóriumok feladata

Mutáció: a DNS bizonyos részeinek spontán elváltozásai, melyek megváltoztatják a kódolt utasításokat, hibás fehérjét vagy hibás funkciót eredményeznek Epidemiológiai definició: 1. mutáció, melynek gyakorisága az átlag populációban kisebb mint 1 %, 2. polimorfizmus (SNP): gyakorisága > 6 %, 3. genetikai variáns: gyakorisága 1-6 % A mutációk osztályozása: Vizsgálandó genetikai eltérések terjedelem alapján pontmutációkról (egy bázis vagy bázispár érintett) kromoszóma-mutációkról (egész gén, vagy kromoszómaszakasz érintett) minőségi tulajdonságok alapján szerkezeti mutációk: helyettesítő - szubsztituciós, deléciós, inszerciós mutációk átrendező (génen belül, kromoszómán belül-inverziók, kromoszómák között-transzlokációk) eredet szerint: spontán, genetikai kontroll (un. mutátorok) indukált (kémiai ágensek, ionizációs sugárzások, nem ionizációs-uv sugárzás) mutációkról.

Pontmutációk jellegzetességei A legtöbb betegség-okozó mutáció pontmutáció. Pontmutációkat: - samesense mutációk (szinonim mutációk): ezek az un. néma mutációk, általában semmiféle eltérést nem okoznak. Ebbe a csoportba tartoznak a gén polimorfizmusok legnagyobb hányada is - nonsense mutációk: ilyen típusú mutáció során az egyik kodon stop kodonná változik, ami fehérje rövidülését eredményezi. - missense mutációk: az aminosav sorrend megváltozását okozza, az által, hogy az aminosavat kódoló triplet egyik bázisa egy másikra cserélődik, és így a normális aminosav helyett egy másik épül be a fehérjeláncba (pl. MEN2-t okozó RET protoonkogén mutációk ebbe a csoportba tartoznak)

Pontmutációk kimutatása Polimeráz láncreakció (PCR): a vizsgálni kívánt génszakasz felsokszorozása Kivitelezése: DNS mennyisége, minősége (alvadásgátolt vérből) Primerek: a kívánt DNS szakaszra specifikus oligonukleotidek Minőségi jellemző: melting hőmérséklet Polimeráz enzim (Taq, Pfu ) dntp mix puffer, DMSO Szűrővizsgálati módszerek: Jellemzője: nagy volumen, kis költség Módszerek: allél specifikus amplifikáció restirikciós enzim emésztés SSCP DGGE TTGE Pontos szekvencia meghatározás DNS szekvenálás

PCR-termék mennyisége és a ciklusszám közötti összefüggés Valós idejű (real-time) detektálás során a mérést a lineáris fázisban kell elvégezni Alkalmazása: deléciók, inszerciók kimutatása mivel a hagyományos PCR során a heerozigóta deléciók kimutatása nem lehetséges pl. heterozigóta deléciók igazolása: CYP21A2, vhl, SDHB, SDHD, menin

Restrikciós fragment hosszpolimorfizmus (RFLP) Az ER22/23 EK polimorfizmus kimutatása PCR amplifikációt követő restrikciós endonukleáz enzimemmel történt emésztés módszerével. Balról jobbra L: DNS létra, 1. minta: homozigóta vad egyén; 2. minta: heterozigóta egyén

Szűrővizsgálati módszerek Egy láncú konformációs polimorfizmus analízis (single strand conformation analízis: SSCP) Denaturáló gradiens gél (denaturant gradient gel electrophoresis, DDGE) elektroforézis Hőmérséklet gradiens gél-elektroforézis (temporal temperature gradient electrophoresis, TTGE)

Single strand conformation polymorphism (SSCP) analízis

Egy láncú konformációs polimorfizmus analízis (single strand conformation analízis: SSCP) Futtatás: 5 és fél óra 325 V, poliakril-amid gélben, 0,5 X TBE pufferben, 45 C-on Multiplex Neoplázia 2-es típus, 11-es exon 634-es kodon mutáció analízise Vad: TGC Mutáció: TAC, TTC, CGC

Denaturáló gél elektroforézis alapú szűrőmódszerek Denaturáló gradiens gél (denaturant gradient gel electrophoresis, DDGE) Hőmérséklet gradiens gél-elektroforézis (temporal temperature gradient electrophoresis, TTGE) Alapelv: kétszálú DNS hőmérséklet vagy denaturáló ágens (pl. urea) hatására denaturálódik, és a heterozigóta eltérést hordozó allél melting hőmérséklete eltér a vad típustól, amit a gélben történő futtatás során detektálni tudunk. PTEN gén mutáció szűrése mellékvese daganatokban

Olvadáspont analízisen alapuló szűrőmódszer a) GC-clamp-el kiegészített PCR termék olvadáspontja, b) hőmérséklet gradiens gélben végzett elektroforézis, c) az abnormális futási mintázatot mutató minta DNS szekvenálási képe

Allél specifikus PCR Alapelv: Ismert mutációk eseteiben a mutációknak megfelelő primerekkel kell a PCR reakciót elvégezni, melynek során mind a normál, mind pedig a mutáns allélra specifikus amplifikációt végzünk. -Human genomban kb. 1000 (újabb adatok szerint mindegy 800) bázisonként vannak SNP-k -Géntérképezés, betegségekkel való összefüggések vizsgálatára multiplex formában, gene hunt (Illumina System, Affymetrix)-ra is használatos módszer Egyszerű, egy mutáció vizsgálatának kivitelezése - allél specifikus amplifikáció után agaróz gélelektroforézissel értékeljük. A vizsgált mutációra pozitív esetekben lesz PCR termék míg negatív esetekben nem. - belső standard primert (belső kontrol), egy harmadik primer, ami a génem belül nem a mutációra specifikus hanem a mutációtól eltérő helyen tapad (a PCR reakció kontrollja). Endokrinológiai alkalmazása: CYP21A2 gén 8 leggyakoribb mutációjának vizsgálata

Allél specifikus PCR alapelve

Allél specifikus amplifikáció A glukokortikoid receptor gén 363-as kodon vizsgálata A 11 β-hydroxiszteroid Dehidrogenáz 1-es típusát kódoló gén rs846910 és rs846911 polymorfizmusok együttes vizsgálata multiplex allél-specifikus PCR-rel

Polimorfizmus vizsgálat allél-specifikus PCR valós időben (RT-PCR) Light Cycler Roche ABI 7500PCR 96-os plate Próbák ( 6 féle jelölés) Taqman Kapillárisban Roche próbák Taqman Sybergreen IVD 96/382-es plate Többféle jelölés IVD Sybergreen Research Use Only

Taqman kémia és jelképződés alapja Általában egy polimofizmus (SNP) esetében a két nukleotid különböző színű próbával van jelölve (FAM, Vic) Jel csak onnan detektálható ahol megtörtént a hivridizáció

Sybergreen technológia alapja és a jelképződés alapja DNS két szála közé interkaládó festék Etidium bromidot kiváltja DE PCR esetén az aspecifikus amplifikáció során pl. a primer dimér estén is ad jelet.

Jelenleg elérhető alkalmazások IVD minősített Hemosztázis: Leiden, protrombin, MTHFR SNP-ek Mikrobiológia: LighCycleren: szepszis panel, vancomycin rezisztencia, MRSA, Herpesz panel, Taqman tesztek: HBV, HCV, HIV-1

Nagy áteresztő képességű, automatizált allél specifikus amplifikáció Affymetrix Technológiai háttér GeneChip Human Mapping Array Set Illumina 100K, 500K SNP Platforms 1M SNP Platform (early 2007) HumanHap Genotyping BeadChip 250K, 350K, 550K SNP Platforms 650K SNP Platform (150K Yoruba-HapMap) (International HapMap Consortium (2005) A haplotype map of the human genome. Nature 437, 1299 1320, www.hapmap.org)

Teljes genomot lefedő SNP detektáláshoz használatos technológia Affymetrix 6.0 SNP - 906.600 SNP - szükséges DNS 500 ng - genom lefedettség: > 0,96 Illumina Human1M-Duo BeadChip (2008 februári Genom adabázis alapján) -1.1 millió SNP per minta - szükséges DNS 400 ng - genom lefedettség: > 0,96 - felbontás 2,4 kb -21877 nem szinonim, 137 mitokondrium genom SNP

Hátrány, Affymetrix-el ellentétben Illumina képviselet még Európában is csak két helyen van

Saját (custom-made) tervezésű platform Bizonyos számú SNP-ek vizsgálatával egyidejű multiplex analízis is megvalósítható Kiválasztatott SNP jellegzetessége: Allél gyakorisága (minor allel frequency, MAF) a vizsgált populációnkban legyen 0.25-0.30 körül Beazonosítható (rs szám) legyen, amennyiben lehetséges, már Affymetrix vagy Illumina array-ken szerepelt (gyakoriságára az adatok elérhetőek) (dbsnp, HapMap adatbázisok) Intragénikus lokalizáció (lehetőleg kódoló vagy promoter szakaszokon)

Adatbázisok: Hogyan válasszuk ki a jó SNP-t? http://gvs.gs.washington.edu/gvs/ 1 lépés 2. lépés

Eredmény lekérdezése Fizikailag lehet keresni és megjeleníteni a vizsgálni kívánt régiót SNP sűrűség Gén SNP-k adatai Folytatódik a lista, összesen 55 SNP-t ismert a HSD11B1 gén területén..

A HapMap adatbázisban található HSD11B1 SNP-kre genotipizált egyének adatait felhasználva készített kapcsoltsági vizsgálat

Az eredmények elemzése Teljes genomra kiterjedő vizsgálatok statisztikai megközelítése Kapcsoltsági vizsgálatok (Genome-Wide Linkage using SNPs) alapvetően család vizsgálatok korábban, mikroszatellita markereket használó teljes genomos vizsgálatok majd ~5-10K SNP alapú gyenge felbontó képesség (a linkage csúcsok még mindig túl nagy tartományra voltak specifikusak) SNP-k használatával számos statisztikai probléma (családi adatok helyesítése független esetekkel, többszörös vizsgálatokra történő korrekció: pl. Bonnferoni) Genome-wide asszociációs vizsgálatok (association studies using SNPs) teljes adathalmazt lehet használni hatékonyabb az ún. módosíto gének felfedezéséhez: komplex (poligénes) öröklődésmenetű betegségek kovariáns vizsgálatok, interakciók, több gén együttes hatásának vizsgálata hátrány: a statisztikai próbák megfelelő alkalmazásának kidolgozása

Automatizált mutáció szűrőrendszer Denaturáló, nagy nyomású folyadékkromatrográfia (DHPLC: denature, highpressure liquid chromatography) Ismeretlen és nagy méretű gének esetén ideális szűrőmódszer Homo és heteroduplex-ek eltérő olvadás pontján alapul Nagy szenzitivitás Gyors (kb 192 minta /h) A PCR reakció után más előkészítés nem igényel Kis méretű fragmensek (ideálisan <200 bp) elemzése DE A készülék drága Pozitív esetekben szekvenálást igényel

A géndefektus megerősítése Szűrőmódszer, sem a specificitása sem a szenzitivitása nem éri el a 100%-ot A szűrővizsgálattal kapott eredményt meg kell erősíteni Azokban az esetekben, melyekben a klinikum nem korrelál a szűrővizsgálat eredményével további vizsgálatok szükségesek DNS szekvenálás: mint minden szűrővizsgálat kontrollja, a mutáció azonosítás leghatékonyabb módszere

DNS szekvenálás Li-Cor szekvenáló készülékkel A RET protoonkogén 14-es exonjának 804-es kodonjában igazolható CGT-CTT, Val-Leu

Genetikai tanácsadás, lelet Ki végezhet? Magyarország/Europa USA/Ausztrália Klinikai genetikus szakvizsgával rendelkező - genetikai tanácsadó (genetic orvos counselor, főiskolai végzettség) - orvosgenetikus Célja: - Betegek tájékoztatása, vizsgálatok szervezése Genetikai szűrővizsgálatokat az USA-ban is csak orvosi végzettségűek indikálhatnak - genetikai betegségben szenvedők - genetikai betegség kialakulására hajlamosak - géndefektust hordozó családokban a családtervezésben (prenatális diagnosztika) - Genetikai adat, vizsgálati eredmény kezelése, tájékoztatás, adatszolgáltatás (etikai és jogi kérdések)

Genetikai tanácsadás Monogénesen öröklődő betegségek esetében Diagnózis felállítása: genetikai tesztek alapján, mind a betegekben, mind pedig a tünetmentes családtagok esetében Differenciáldiagnosztika Betegek nyomonkövetése Terápia megválasztása Családtervezés Komplex öröklődésű betegségek esetében -Rizikó becslés, ún. hajlamosító tényezők ismertetése -Terápia eredményességének becslése (génexpressziós mintázatok alapján a kemoterápia) -Gyógyszermetabolizmus, pl azathioprin kezelés, a tiopurin-s-metiltranszferáz TPMT*3A homozigótákban életveszélyes mieloszuppresszió

Monogénes betegségek, a patogenetikai ok feltárása Genetikai tanácsadás folyamata 1. Családfa elemzés: -öröklődésmenet tisztázása: domináns vagy recessziv, autoszom vagy nemi kromoszómához kötött öröklődés 2. A felelős genetikai eltérés vizsgálata hozzáférhető-e? 3. Genetikai vizsgálati eredmény birtokában - Kapcsoltsági vizsgálatok: - fenotipus szegregálódik-e a genotipussal? - az azonosított genetikai eltérés nem egy egyszerű polimorfizmus-e? (funkcionális tesztelés) - Családszűrés szervezése, terápia megválasztása

Monogénes betegségek esetén Összefoglalás Genetikai ismeret Klinikai jelleg Segíti, pontosítja a diagnózist, nemzetközi ajánlások alapján szűrővizsgálat, beavatkozások, hosszútávú nyomonkövetés biztosított (MEN1, MEN2, VHL, PGL) Komplex öröklődés esetén Genetikai ismeret Klinikai jelleg Rizikóbecslés, az egyértelmű összefüggések kiderítése érdekében homogén betegcsoportok vizsgálata elengedhetetlen