BUDAPESTI MŰSZAKI ÉS GAZDASÁGTUDOMÁNYI EGYETEM VEGYÉSZMÉRNÖKI ÉS BIOMÉRNÖKI KAR OLÁH GYÖRGY DOKTORI ISKOLA Fordított fázisú folyadékkromatográfiás módszerek peptidek és fehérjék elválasztásában és izolálásában Tézisfüzet Szerző: Bobály Balázs Témavezető: Dr. Fekete Jenő Szervetlen és Analitikai Kémia Tanszék, HPLC laboratórium Konzulens: Dr. Vékey Károly MTA-TTK, Szerves Kémia Intézet, MS Proteomika Kutatócsoport 2014
1. Bevezetés és irodalmi háttér A peptidek és fehérjék vizsgálata fontos szerepet tölt be az analitikai kémiában. A fehérjék analízisére intakt, vagy peptidekre hasított - emésztmény - formában kerülhet sor. A kromatográfiás módszerek tömegspektometriával kapcsolva, és önállóan is fontos analitikai módszerré váltak a peptidek és polipeptidek analitikájában 1. A kromatográfiás módszereken belül a fordított fázisú kromatográfia ígéretes elválasztási módszer mind fehérjék, mind pedig peptidek analízisében 2. Az emésztmények még tiszta fehérje minták esetén is összetettek, így a komponensek elválasztása rendszerint nem oldható meg teljes mértékben. Az elválasztás minőségét alapvetően befolyásolja a töltet kinetikai hatékonysága. Többdimenziós on-line elválasztások második dimenziójában elengedhetetlen a gyors gradiensek alkalmazása, míg ujjlenyomat peptidtérképezés esetén a gyors és hatékony mérések az áteresztőképességet növelik. Az elvárások tehát a korszerű peptidtérképezési módszerekkel szemben, hogy gyorsak, hatékonyak és érzékenyek legyenek. A szemcseméret csökkentésével és héjszerű töltetek megjelenésével a kinetikai hatékonyság nagymértékben növekedett 3. Ezzel együtt a kis kolonna térfogatba (50*2,1 mm) töltött ultrahatékony töltetek kolonnán kívüli térfogatokra való érzékenysége is megmutatkozott 4. A makromolekulák diffúziója, így anyagátadása kismolekulákhoz képest lassabb. Az oszlopon megfigyelhető kinetikai hatékonyság a kolonnán kívüli hatékonyságvesztésre kevésbé érzékeny, mint kismolekulás elválasztásoknál. Peptidelválasztási feladatokban tehát kiemelt szerepet kaphatnak a kis térfogatba töltött, gyors, ultrahatékony kromatográfiás töltetek. A dolgozatban értékeljük peptidek elválasztásának lehetőségeit és korlátait gyors, ultranagy hatékonyságú, fordított fázisú, 2 μm alatti szemcseátmérőjű, héjszerű tölteteken 5. A kromatográfiás módszerek analitikai alkalmazásukon túl alkalmasak lehetnek peptidek és fehérjék komplex mintákból történő izolálására is. Az izolálási célnak megfelelő szelektivitású kromatográfiás módszer kiválasztásával az elúciót követően a kívánt komponensek diszkrét térfogatokban frakcionálhatók. 6 A frakcionálás során alapvető fontosságú a fehérjék lehető legtökéletesebb visszanyerése az állófázisról. Erős szorpciós tulajdonságaik miatt a fehérjék egyes esetekben nem eluálhatók teljes mértékben a fordított fázisú kromatográfiás töl- 1 A. Staub et al., Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis, 55 (2011) 810-822. 2 Sz. Fekete et al., Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis 69 (2012) 9-27. 3 Sz. Fekete et al., Journal of Chromatography A, 1228 (2012) 57-71. 4 Sz. Fekete et al., Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis, 87 (2014) 105-119. 5 B. Bobály et al., Journal of Separation Science, 37 (2014) 189-197. 6 E. Tóth et al., Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis, 98 (2014) 393-400. 2
tetről. A szorpciós tulajdonságok megismerése így kulcsfontosságú a sikeres frakcionálás szempontjából. Fehérjék fordított fázisú elválasztása során az állófázis, a mozgófázis összetétele, a mérési körülmények, a fehérje konformációs állapota és mikroheterogenitása is szerepet játszanak a molekula és az állófázis között kialakuló kölcsönhatásokban. Az irodalom több esetben leírta, hogy a visszanyerés értéke a kromatográfiás paraméterek változtatásával szabályozható. A mérési hőmérséklet 7, felületmódosítás minősége 8, és az alkalmazott nyomás 9, hatással vannak a visszanyerésre. Makromolekulák fordított fázisú kromatográfiája során a mozgófázisba általában savas karakterű ionpárképző adalékot tesznek. Több tanulmány leírta az ionpárképző adalékok retencióra és csúcsalakra gyakorolt hatását. Ezek alapján az adalék minőségének és koncentrációjának hatása van a makromolekula és az állófázis között kialakuló szorpciós tulajdonságokra. A gyakori alkalmazás ellenére nem tisztázott, hogy az ionpárképző minősége és mennyisége milyen hatással van a visszanyerésre 10. A visszanyerést befolyásoló eddig vizsgált és nem vizsgált paraméterek hatását és kölcsönhatásait modell fehérjékkel, centrumpontos kompozit kísérleti terv segítségével vizsgáltuk. A kísérleti terv végrehajtása után kiterjesztett visszanyerési kísérleteket végeztünk, melyek során több kromatográfiás töltet visszanyerési tulajdonságait vizsgáltuk kiválasztott modell fehérjékkel 11. A kiterjesztett visszanyerési kísérletek során az additívkoncentráció függvényében maximális visszanyerési görbéket kaptunk. Feltételeztük, hogy a maximális visszanyerési görbék különböző szorpciós kölcsönhatások eredőjeként adódnak. A szorpciós kölcsönhatások alakulásában mind a fehérje, mind az állófázis kölcsönható felületének változása szerepet játszhat. A szerkezet-szorpciós tulajdonságok tanulmányozására tömegspektrometriás és cirkuláris dikroizmus módszereket alkalmaztunk. Az ionpárképző koncentráció szerkezetre gyakorolt hatását egy általunk leírt új izolálási módszer, a konformációváltozáson alapuló póruskizárásban használtuk ki 12. 7 Sz. Fekete et al., Journal of Separation Science, 35 (2012) 3113-3123. 8 T. Hamada et al., Journal of Chromatography A 1043 (2004) 27-32. 9 J.W. Eschelbach, J.W. Jorgenson, Analytical Chemistry 78 (2006) 1697-1706. 10 X. Geng, F.E. Regnier, Journal of Chromatography A, 296 (1984) 15-30. 11 B. Bobály et al., Journal of Chromatographic Science, (2014) bírálat alatt 12 B. Bobály et al., Journal of Chromatography A, 1325 (2014) 155-162. 3
2. Kísérleti módszerek Az ultranagy hatékonyságú, 2 μm alatti szemcseátmérőjű, héjszerű töltetek (1,3 μm Kinetex C 18 50*2,1 mm; 1,6 μm Cortecs C 18 50*2,1 mm; 1,7 μm Kinetex C 18 50*2,1 mm) kinetikai hatékonyságát és alkalmazásuknak lehetőségeit izokratikus és gradiens elúciós módban hasonlítottuk össze. A hatékonyságot tesztpeptid (ChinaPeptides CH-870, 1295,5 g/mol) segítségével és valós peptidkeverék komponenseinek elválasztásával vizsgáltuk. A kísérletekhez Waters Acquity UPLC I-Class folyadékkromatográfot használtunk. A tesztpeptid segítségével izokratikus H-u görbéket vettünk fel, melyeket korrigáltunk a kolonnán kívüli zónaszélesedéssel. A kinetikus görbék a kolonna permeabilitásának meghatározást követően korrigált H-u görbékből számíthatóak. A gradiens hatékonyság értékeléséhez az izokratikus eredményekből számított gradiens kinetikus görbéket alkalmaztunk. A kolonnák érzékenységét a rendszer zónadiszperziójára a megmaradó hatékonyság módszerével határoztuk meg. Végül a töltetek teljesítményét valós peptid keveréken, Panitumumab triptikus peptidjeinek elválasztása során értékeltük. Fehérjék fordított fázisról történő visszanyerését befolyásoló kromatográfiás paraméterek vizsgálatára centrumpontos kompozit kísérleti tervet készítettünk. A tervben három faktor, a kolonnán ébredő nyomásesés (1300-6700 psi), a mérési hőmérséklet (36-63 C), valamint a mozgófázis trifluorecetsav koncentrációjának (0,01-0,29 v/v%) hatását vizsgáltuk a modell fehérjék (humán transzferrin, tojásfehérje lizozim) visszanyerésére Aeris Widepore XB-C 18 oszlopon. A viszszanyerést a kolonnán és a kolonna nélkül mért UV csúcsterületek arányából számítottuk. A kísérletek elvégzéséhez Waters Acquity UPLC készüléket alkalmaztunk. A kísérleti terv eredményeinek értékelését Statistica 12 szoftverrel végeztük. A kísérleti terv eredményeinek validálására kiterjesztett visszanyerési kísérleteket végezünk szélesebb trifluorecetsav koncentráció tartományban (0,001-0,3 v/v%) és több, különböző fordított fázisú tölteten (Waters Acquity UPLC BEH300 C 18 és C 4, Phenomenex Aeris Widepore XB-C 18, XB-C 8 és C 4 ) A kiterjesztett visszanyerési kísérletek során kapott eredmények alapján indokoltnak találtuk a kromatográfiás rendszerben jelen lévő fehérje szerkezetek vizsgálatát. A fehérjeszerkezet vizsgálatára UPLC-UV-MS mérőrendszert alkalmaztunk, melyben egy Waters Micromass QToF Premier tömegspektrométert kapcsoltunk a fent leírt kromatográfiás rendszerhez. ESI + ionizációt alkalmaztunk, mely során a töltésállapot-eloszlásokból nyertünk konformáció-változásra vonatkozó információt. A tömegspektrometriás eredmények helyességének ellenőrzése céljából ortogonális, közeli és távoli UV CD 4
t grad /P (min) spektroszkópiai kísérleteket végeztünk, melyhez egy Jasco J-715 spektropolarimétert alkalmaztunk. 3. Eredmények Makromolekulák fordított fázisú elválasztása során leggyakrabban alkalmazott gradiens elúciós mód esetén, ~250-nél kisebb csúcskapacitás (R s =1) esetén az egységnyi csúcskapacitás az 1,3 μm-es töltettel érhető el a leggyorsabban. Ha az elválasztás ennél nagyobb hatékonyságot kíván meg, akkor célszerű az 1,6 μmes töltetet választani. Az 1,6 μm-es töltet nyújtja az elérhető legrövidebb analízis időt P>250 esetén. Az 1,3 és 1,6 μm-es töltetek gradiens kinetikai hatékonysága a gyakorlati munkatartományban (P=200-400) rövidebb analízis időt tesz lehetővé, mint az 1,7 μm-es tölteté (1. ábra). 1 t grad = 10 min 0.1 t grad = 1 min 1.7 µm Kinetex 1.6 µm Cortecs 1.3 µm Kinetex 0.01 200 300 400 500 600 800 0 P 1. ábra. 2 μm alatti szemcseátmérőjű, héjszerű töltetek számított gradiens teljesítménye Az elméleti gradiens kinetikus eredmények alapján peptidek ultra gyors gradiens elválasztásához, például on-line 2D rendszer második dimenziójaként az 1,3 μm-es töltet, míg nagy áteresztő képességű és nagy felbontóképességű peptid térképezési feladatokban az 1,6 μm-es töltet javasolható. A 2. ábra alapján peptidek elválasztása során a kolonnák megmaradó hatékonysága nem tér el jelentős mértékben. A kolonnán kívüli zónaszélesedésre a makromolekulás elválasztások tehát kevésbé érzékenyek. Kisebb molekulák esetén, ahol gyors anyagátadás miatt nagyobb a kinetikai hatékonyság, a kisebb szemcseméretű, hatékonyabb oszlopok érzékenysége sokkal kifejezettebb. 5
megmaradó hatékonyság (%) 80 60 40 20 Kinetex 1.3 um (ECV=2 ul^2) Kinetex 1.7 um (ECV=2 ul^2) Cortecs 1.6 um (ECV=2 ul^2) Kinetex 1.3 um (ECV=8 ul^2) Kinetex 1.7 um (ECV=8 ul^2) Cortecs 1.6 um (ECV=8 ul^2) 0 0 3 6 9 12 retenciós tényező 2. ábra. 2 μm alatti szemcseátmérőjű, héjszerű töltetek megmaradó hatékonysága peptidek esetében. ECV: kolonnán kívüli csúcsvariancia A kolonnák hatékonyságának valós mintákon történő elemzése céljából peptidtérképezést hajtottunk végre egy IgG2 monoklonális antitest proteolíziséből származó peptid keveréken. A kapott csúcskapacitás és legfontosabb izokratikus kinetikai adatokat az 1. táblázat tartalmazza. d p (µm) P (t g =10min) H min (µm) h permeabilitás (cm 2 ) Cortecs 1,6 240 2,66 1,66 3,5*10-11 Kinetex 1,7 224 3,17 1,86 3,1*10-11 Kinetex 1,3 259 1,95 1,5 1,7*10-11 1. táblázat. 2 μm alatti szemcseátmérőjű, héjszerű töltetek kinetikai adatai Fehérjék visszanyerésének vizsgálatára a 3. ábra szerinti kísérleti tervet (A) hajtottuk végre, melynek eredménye a (B) válaszfelület. 6
Visszanyerés [%] AU A B 90 80 R [%] 70 60 0,04 0,08 C TFA [v/v%] 0,12 0,16 0,20 0,24 0,28 6000 5000 4000 3 00 20 0 ΔP [psi] 3. ábra. Visszanyerés vizsgálatára alkalmazott faktoros kísérleti terv (A) és a faktorok hatása lizozim visszanyerésére (B) az Aeris WP XB- C 18 oszlopon A visszanyerésre statisztikailag szignifikáns és többi faktorhoz képest nagy hatása van a mozgófázis TFA koncentrációjának. Az eredmények szerint a szokásos 0,1 v/v% TFA koncentráció csökkentése javítja a visszanyerést. Amennyiben a mozgófázis nem tartalmaz TFA-t, a fehérjék nem eluálhatóak kromatográfiás csúcsként, így visszanyerésük zérus. A fent leírtak értelmében a vizsgált tartományon kívül maximumos görbét vártunk az R(C TFA ) függvénytől. Több kolonnán vizsgálva a jelenséget a 4. ábra szerinti visszanyeréseket (A) és csúcsalakokat (B) kaptuk. A B B B 95 0.29 85 75 65 AWP C4 AWP C8 BEH C4 AWP C18 BEH C18 0.19 0.09 0,005 v/v% 0,01 v/v% 0,05v/v% 0,1 v/v% 0,3 v/v% 55 0 0.05 0.1 0.15 0.2 0.25 0.3 C TFA [v/v%] -0.01 5 6 7 8 9 10 Idő [min] 4. ábra. Lizozim visszanyerése (A) különböző töltetekről és a csúcsalak változása az Aeris WP XB-C 18 oszlopon (B). 7
A görbék maximumának helye és értéke kolonna és proteinfüggő. Az átlagos maximum visszanyerés lizozim esetében 98,8%, transzferrin esetében pedig 90,4 %. 0,05 v/v% TFA alatt a csúcsok kiszélesednek. Ez arra enged következtetni, hogy alacsony additív koncentráció esetén erős kölcsönhatások alakulnak ki a fehérje és az állófázis között. A csúcsok retenciós ideje a TFA koncentráció függvényében növekedést mutat. A megfigyelt maximumos görbék feltehetően több, különböző erősségű és természetű, visszanyerést csökkentő szorpciós kölcsönhatás eredői. Alacsony TFA koncentrációk esetében (kb. 0,05 v/v% alatt) erős, ioncserés kölcsönhatások alakulhatnak ki a fehérje protonált, bázikus csoportjai és a savas, deprotonált szilanolcsoportok között. A TFA koncentráció növekedésével az erős kölcsönhatások a csúcsalak változása szerint megszűnnek. A retenciós idő növekedése 0,05 v/v% TFA felett arra enged következtetni, hogy az additív koncentráció növekedésével egyre erősebb hidrofób kölcsönhatás alakul ki. A visszanyerést elsődlegesen az szorpciós tulajdonságok határozzák meg. Látható, hogy a TFA koncentráció változásával változnak az szorpciós tulajdonságok, így feltehetően a fehérje kölcsönható felülete is. Egyéb esetlges oldószerhatások elkerülése érdekében izokratikus körülmények között nagyobb eluenserősség mellett végeztük el a szerkezetvizsgálatra irányuló LC-UV-MS vizsgálatokat. A töltéseloszlások változásából az 5. ábra szerint egy alacsony TFA koncentrációnál jelen lévő kiterjedtebb savdenaturált konformáció (magasabb töltésállapotok) nagyobb TFA koncentrációnál gombolyodott ionpárrá alakul (alacsonyabb töltésállapotok, fehérje-tfa adduktok). Alacsony TFA koncentráció mellett az állófázis savas szilanol csoportjai ioncserés kölcsönhatást létesíthetnek a töltött fehérjelánccal. A kialakuló erős kölcsönhatás torzítja a csúcsalakot és rontja a visszanyerést (4. ábra). Feltehetően savas, ionizálható szilanolokkal kialakuló ioncserés kölcsönhatás során a negatívan töltött állófázis felületen megkötődnek a pozitívan töltött fehérjeláncok. Az állófázisra szorbeálódott, kifelé pozitívan töltött fehérjeláncok elektromos taszítás miatt kiszorítják a pórusokból a nem szorbeálódott fehérjeláncokat (elúció holtidő előtt). A TFA koncentrációjának növekedésével az anion és a töltött fehérjelánc közti ionpárképződés megindul. Az ionpárképzés során kialakuló rendezetlen gombolyag hidrofóbabb a savdenaturált konformációhoz képest. Ez a konformáció már nem záródik ki az állófázis pórusaiból. TFA koncentráció további növelésével (>0,1 v/v%) valószínűleg erősödik az állófázis és a hidrofóbabb karakterű fehérjelánc közötti molekuláris kölcsönhatás, amely csökkenti a visszanyerést. 8
% AU % AU AU AU % % % A B 2.5e-1 0.97 0.08 v/v% TFA 1.25e-1 7 + 0.0 2.5e-1 0.50 1.00 1.50 Idő Time [perc] (min) 0.96 0.05 t 0 után v/v% TFA 5 + 11 + 9 + 0 m/z 0 1500 2000 2500 3000 t 0 után 1.25e-1 t 0 előtt 0.76 0 t 0 előtt 0.0 2.25e-1 0.50 1.00 1.50 Idő Time [perc] (min) 0.70 0.01 v/v% TFA 0 m/z 0 1500 2000 2500 3000 1.25e-1 0.0 2.0e-1 0.50 1.00 1.50 Idő Time [perc] (min) 0.69 0.001 v/v% TFA 0 m/z 0 1500 2000 2500 3000 9 + 1.0e-1 11 + 0.95 * 13 + 7 + 0.0 0.50 1.00 1.50 Idő Time [perc] (min) 5 + 0 m/z 0 1500 2000 2500 3000 5. ábra. Lizozim konformáció-változása és póruskizáródása az Aeris WP XB-C 18 oszlopon. (A) UV-kromatogramok, (B) a kromatogramokhoz tartozó tömegspektrumok. *holtidő A kapott MS eredményeket a CD mérés eredményei alátámasztják (6. ábra). A kromatográfiás körülményeket beállítva a CD spektrumokban jól látszik, amint a fehérje a TFA koncentráció növekedésével elveszti aszimmetrikus harmadlagos környezetét (közeli UV CD, 250-320 nm), míg másodlagos szerkezetét csaknem teljes mértékben megtartja (távoli UV-CD, 185-250nm). Ez jellemző a lizozim rendezetlen gombolyag (molten globule) konformációjára. 9
AU Ellipticitás [m ] Ellipticitás [m ] Hullámhossz [nm] Hullámhossz [nm] 6. ábra. Lizozim CD spektrumai a TFA koncentráció függvényében Transzferrin esetén analóg eredményeket kaptunk. A két fehérje esetében a konformáció-változást, így a póruskizáródást kiváltó TFA koncentráció különbözik. Ez kísérleteink alapján kihasználható a fehérjék konformációs állapotán alapuló elválasztásában. A 7. ábra szerinti kromatográfiás körülmények között elérhető, hogy az egyik fehérje kizáródjon az állófázis pórusaiból (holtidő előtti elúció), míg a másik holtidő után eluálódik. 0.28 0.1 v/v% TFA lizozim 0.005 v/v% TFA 0.18 transzferrin 0.08-0.02 0 1 2 3 4 5 Idő [min] 7. ábra. Lizozim és transzferrin konformációs állapotán alapuló elválasztása (gradiens: 30-60% acetonitril (B), 5%B/min, 50 C) 10
A módszer alkalmas lehet fehérjék gyors izolálására (elúció holtidő előtt), egymástól nehezen elválasztható fehérjék közötti csúcsfelbontás növelésére, valamint fehérjék kismolekuláktól történő elválasztására. Míg a fehérje holtidő előtt eluálódik, addig a kismolekulák a pórusokba diffundálva holtidőben, vagy az után eluálhatóak. 4. Tézispontok 1. Átfogó, összehasonlító kinetikai értékelést adtam a piacon lévő, új, 1,6 µm szemcseátmérőjű, héjszerű töltetre. Az értékelés során feltártam a 2 µm alatti szemcseátmérőjű héjszerű töltetek előnyeit és hátrányait, valamint kinetikai szempontból célszerű alkalmazásukat [B. Bobály, D. Guillarme, S. Fekete, Journal of Separation Science 37 (2014) 189-197. IF: 2,591]. 2. Leírtam, hogy az irodalomban közölt kromatográfiás paraméterek, mint hőmérséklet, nyomás, felületmódosító alkillánc hossza mellett a mozgófázis ionpárképző additív (TFA) koncentrációja maximumos összefüggés mellett befolyásolja a fehérjék visszanyerését fordított fázisú töltetekről, ahol a visszanyerés függ a töltet felületi minőségétől és fehérje minőségétől. [B. Bobály, V. Mikola, E. Sipkó, Z. Márta, J. Fekete, Journal of Chromatographic Science, közlésre beküldve (2014), IF: 1,024] 3. Tömegspektrometriás és cirkuláris dikroizmus módszerekkel támasztottam alá a visszanyerési maximum körül lejátszódó konformáció-változást. Megállapítottam, hogy a kis savkoncentráció mellett kitekeredett ( acid unfolded ) és a nagyobb savkoncentráció hatására kialakuló rendezetlen gombolyag ( molten globule ) szerkezetek a fordított fázisú kromatográfiás rendszerben egymásba átalakulhatnak, valamint azt, hogy a kromatográfiás rendszerben egyidőben mind a két konformáció jelen lehet. [B. Bobály, E. Tóth, L. Drahos, F. Zsila, J. Visy, J. Fekete, K. Vékey, Journal of Chromatography A 1325 (2014) 155-162. IF: 4,612] 4. Az ionpárképző koncentrációtól függő konformáció-változást kihasználva elsőként írtam le fehérjék fordított fázisú rendszerben történő póruskizáródáson alapuló elválasztásának lehetőségét, amely alkalmas lehet fehérjék egymástól való elválasztására, valamint fehérjék kismolekuláktól való elválasztására. [B. Bobály, E. Tóth, L. Drahos, F. Zsila, J. Visy, J. Fekete, K. Vékey, Journal of Chromatography A 1325 (2014) 155-162. IF: 4,612] 11
5. Fordított fázisú kromatográfiás módszert optimáltam fehérjék komplex mintákból történő izolálására. A kísérletekben alkalmazott kolonnán optimáltam a visszanyerési hatásfokot. Az módszer gyakorlati alkalmazhatóságát biomarker kutatás során bizonyítottuk [E. Tóth et al., Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis, 98 (2014) 393-400. IF: 2,947] 5. Közlemények I. A doktori dolgozat témájához kapcsolódó publikációk Impakt faktorral rendelkező, angol nyelvű folyóiratban közlésre elküldve: 1. B. Bobály, V. Mikola, E. Sipkó, Z. Márta, J. Fekete, Recovery of proteins affected by mobile phase trifluoroacetic acid concentration in reversed phase chromatography, Journal of Chromatographic Science, 2014, IF: 1.026 Impakt faktorral rendelkező, angol nyelvű folyóiratban megjelent közlemények: 2. E. Tóth, O. Ozohanics, B. Bobály, Á. Gömöry, A. Jekő, L. Drahos, K. Vékey, HPLC enrichment/isolation of proteins for post-translational modification studies from complex mixtures, Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis, 98 (2014) p. 393., IF: 2.829 3. B. Bobály, D. Guillarme, Sz. Fekete, Systematic comparison of a new generation of columns packed with sub-2 μm superficially porous particles, Journal of Separation Science, 37 (2014) p. 189., IF: 2.594 4. B. Bobály, E. Tóth, L. Drahos, F. Zsila, J. Visy, J. Fekete, K. Vékey, Influence of acid-induced conformational variability on protein separation in reversed phase high performance liquid chromatography, Journal of Chromatography A, 1235 (2014) p. 155., IF: 4.258 Előadások: 1. Bobály B., Fekete Sz., Fekete J., Új, 2 µm alatti szemcsátmérőjű héjszerű töltetetek lehetőségei és korlátai, 1 st Innovation in Science Doctoral Student Conference, Szeged, 2014 2. Bobály B., Tóth E., Vékey K., Drahos L., Zsila F., Visy J., Fekete J., Proteinek konformációja a fordított fázisú kromatográfiás rendszerben, Oláh György Doktori Iskola Konferenciája, Budapest, 2014 12
3. Bobály B., Fekete Sz., Fekete J., Új, héjszerű töltetek összehasonlítása és alkalmazása, XLV. Kromatográfiás Továbbképző Tanfolyam, Szeged, 2014 4. Bobály B., Tóth E., Vékey K., Drahos L., Zsila F., Visy J., Fekete J., Proteinek konformációja a fordított fázisú kromatográfiás rendszerben, Oláh György Doktori Iskola Konferenciája, Budapest, 2014 5. Bobály B., Tóth E., Ozohanics O., Drahos L., Fekete J., Vékey K., Proteinek konformációja a fordított fázisú kromatográfiás rendszerben, 15. Labortechnika Szakkiállítás, Tömegspektromteriai Szakmai Nap, Budapest, 2013 6. Bobály B., Tóth E., Ozohanics O., Drahos L., Fekete J., Vékey K., Fordított fázisú kromatográfiás töltetek összehasonlítása proteinek izolálására, Kálmán Erika Doktori Konferencia, Mátraháza, 2012 Poszterek: 1. Bobály B., D. Guillarme, Fekete J., Fekete Sz., Új, 2μm alatti szemcseátmérőjű, héjszerű töltetek összehasonlítása - Lehetőségek, korlátok, Oláh Görgy Doktori Iskola Konferenciája, Budapest, 2014 2. B. Bobály, E. Tóth, F. Zsila, J. Fekete, J. Visy, K. Vékey, L. Drahos, How TFA effects protein conformation and separation in RP-HPLC, 7th Central and Eastern European Proteomics Conference, Jena, 2013 3. B. Bobály, D. Guillarme, Sz. Fekete, Effect of Temperature and Pressure on Protein Aggregates in Ultra-High Pressure Size Exclusion Chromatography, Balaton Symposium, Siófok, 2013 4. B. Bobály, E. Tóth, J. Fekete, K. Vékey, L. Drahos, A novel TFA effect on protein separation in RP-HPLC, Balaton Symposium, Siófok, 2013 5. Bobály B., Tóth E., Ozohanics O., Drahos L., Fekete J., Vékey K., Fordított fázisú kromatográfiás töltetek összehasonlítása proteinek izolálására, az izolálás optimálása kompozit kísérleti tervvel, Elválasztástudományi Vándorgyűlés, Hajdúszoboszló, 2012 6. B. Bobály, E. Tóth, O. Ozohanics, L. Drahos, J. Fekete, K. Vékey, Challenges in proteomics how silica reversed phase effects protein isolation, 6th Central and Eastern European Proteomics Conference, Budapest, 2012 II. A doktori dolgozat témájához nem kapcsolódó publikációk Impakt faktorral rendelkező, angol nyelvű folyóiratban megjelent közlemény: 13
1. G. Várhegyi, B. Bobály, E. Jakab, H. Chen, Thermogravimetric Study of Biomass Pyrolysis Kinetics. A Distributed Activation Energy Model with Prediction Tests, Energy & Fuels, 2011, 25, 24-32, IF: 2,853 Előadások: 1. Bobály B., Várhegyi G., Pekkerné Jakab E., Biomassza anyagok termogravimetriás vizsgálata és hőbomlásuk kinetikai modellezése, MKE Termoanalitikai, valamint Szerves- és Gyógyszeranalitikai Szakcsoportjának Tudományos Ülése, Budapest, 2008 2. Bobály B. Biomassza anyagok termogravimetriás vizsgálata és hőbomlásuk kinetikai modellezése, BME-VBK Tudományos Diákköri Konferencia, Budapest, 2008, dícséret Poszter: 1. B. Bobály, G. Várhegyi, E. Jakab, H. Chen, Kinetics of the thermal decomposition of agricultural by-products, 10. Conference on Calorimetry and Thermal Analysis, Zakopane, 2009 Köszönetnyilvánítás Hálásan köszönöm Feleségem és Családom támogatását, szeretetét és türelmét. Szeretném megköszönni Dr. Fekete Jenő és Dr. Vékey Károly szakmai támogatását és türelmét, amellyel doktori tanulmányaimat kísérték. Köszönet illeti a BME-VBK HPLC Laboratóriumának és az MTA-TTK MS Proteomikai Kutatócsoportjának valamennyi munkatársát a segítségükért. Köszönöm Társszerzőim és Doktori Értekezés Bírálóinak áldozatos munkáját. Doktori tanulmányait a Richter Gedeon Talentum Alapítvány és a Balassi Intézet finanszírozta. 14