([P2]: Eq.4) C N/[ [(+(discr(q 1 )) 1/2 -B)/(2A)] 3 dq 1 ],

Hasonló dokumentumok
A s r ségfunkcionál elmélet (Density Functional Theory)

8. Egyszerû tesztek sûrûség funkcionál módszerek minõsítésére

Kémiai kötés. Általános Kémia, szerkezet Dia 1 /39

Kémiai kötés. Általános Kémia, szerkezet Dia 1 /39

Molekuláris dinamika I. 10. előadás

A kémiai kötés eredete; viriál tétel 1

Atomok és molekulák elektronszerkezete

TÁMOP A-11/1/KONV WORKSHOP Június 27.

Idegen atomok hatása a grafén vezet képességére

Szilárdtestek el e ek e tr t o r n o s n zer e k r ez e et e e t

4. Fejezet Csonka Gábor István MTA Doktori Értekezés

Kémiai kötés. Általános Kémia, szerkezet Slide 1 /39

Atomszerkezet. Atommag protonok, neutronok + elektronok. atompályák, alhéjak, héjak, atomtörzs ---- vegyérték elektronok

Molekuláris dinamika. 10. előadás

Kötések kialakítása - oktett elmélet

Fermi Dirac statisztika elemei

Félmerev és flexibilis molekulák rezgési-forgási állapotainak kvantumkémiai számítása és jellemzése

A kémiai kötés magasabb szinten

Kutatási terület. Szervetlen és szerves molekulák szerkezetének ab initio tanulmányozása

Mátyus Edit. Prof. Dr. Császár Attila. Molekulaspektroszkópiai Laboratórium, Kémiai Intézet

Gabonacsíra- és amarant fehérjék funkcionális jellemzése modell és komplex rendszerekben

DR. LAKATOS ÁKOS PH.D PUBLIKÁCIÓS LISTÁJA B) TUDOMÁNYOS FOLYÓIRATBELI KÖZLEMÉNYEK

A kémiai kötés magasabb szinten

Protoncserélő membrános hidrogén - levegő tüzelőanyag-cellák működési elve, szabályozása és alkalmazása

January 16, ψ( r, t) ψ( r, t) = 1 (1) ( ψ ( r,

Elektronegativitás. Elektronegativitás

Kémiai kötés. Általános Kémia, szerkezet Slide 1 /39

Fügedi Balázs PhD. Szerz, cím, megjelenés helye, Szerz, cím, megjelenés. Szerz, cím, megjelenés helye, helye, PUBLIKÁCIÓ. Könyv, idegen nyelv

1 Műszaki hőtan Termodinamika. Ellenőrző kérdések-02 1

Adatfolyam alapú RACER tömbprocesszor és algoritmus implementációs módszerek valamint azok alkalmazásai parallel, heterogén számítási architektúrákra

Zárójelentés a "Mikro-kontinuumok képlékeny alakváltozása" című OTKA kutatási témához

Beszámoló OTKA T Nanoelektronikia kvantum-eszközök tér-idő dinamikájának szimulációja környezeti hatások figyelembevételével

Atomszerkezet. Atommag protonok, neutronok + elektronok. atompályák, alhéjak, héjak, atomtörzs ---- vegyérték elektronok

A kutatás eredményei (záró beszámoló)

FOTOKÉMIAI REAKCIÓK, REAKCIÓKINETIKAI ALAPOK

Kémiai reakciók mechanizmusa számítógépes szimulációval

PAPP DÓRA. Amiloid szerkezetek stabilitásvizsgálata fehérjékben

A testek részecskéinek szerkezete

Alapvető bimolekuláris kémiai reakciók dinamikája

Modern fizika laboratórium

3. A kémiai kötés. Kémiai kölcsönhatás

Császár Attila. Molekularezgések. kvantummechanikája

Differenciálegyenletek numerikus integrálása április 9.

13. Molekulamodellezés

Molekuláris dinamika: elméleti potenciálfelületek

Ponthibák azonosítása félvezető szerkezetekben hiperfinom tenzor számításával

Kémiai kötések. Kémiai kötések kj / mol 0,8 40 kj / mol

Közönséges differenciál egyenletek megoldása numerikus módszerekkel: egylépéses numerikus eljárások

A kémiai kötés. Kémiai kölcsönhatás

Sterilizálásra és felületkezelésre alkalmazható utókisülési plazmák modellezése. zárójelentés

List of Publications (Pánovics János)

FEGYVERNEKI SÁNDOR, Valószínűség-sZÁMÍTÁs És MATEMATIKAI

Doktori Tézisek. dr. Osman Fares

Elektrosztatikus számítások. Elektrosztatikus számítások. Elektrosztatikus számítások. Elektrosztatikus számítások Definíciók

Jegyzet. Kémia, BMEVEAAAMM1 Műszaki menedzser hallgatók számára Dr Csonka Gábor, egyetemi tanár Dr Madarász János, egyetemi docens.

AZ ELEKTRON MÁGNESES MOMENTUMA. H mágneses erœtérben az m mágneses dipólmomentummal jellemzett testre M = m H forgatónyomaték hat.

Sajátértékek és sajátvektorok. mf1n1a06- mf1n2a06 Csabai István

Magszerkezet modellek. Folyadékcsepp modell

Kémiai reakciók sebessége

Rádl Attila december 11. Rádl Attila Spalláció december / 21

Szén nanoszerkezetek grafén nanolitográfiai szimulációja

ÉLELMISZERTUDOMÁNYI KAR

Hajlított tartó elmozdulásmez jének meghatározása Ritz-módszerrel

Intergrált Intenzív Matematika Érettségi

Új típusú csillag kopolimerek előállítása és funkcionalizálása. Doktori értekezés tézisei. Szanka Amália

V É G E S E L E M M Ó D S Z E R M É R N Ö K I M E C H A N I K A I A L K A LM A Z Á S A I

A kutatás időtartama: október szeptember 30. stúdiumokat folytattunk. A kutatási terv két fő pillére a soktest kölcsönhatást

B/16. számú melléklet Önéletrajz sablon

Reakciókinetika és katalízis

Robotok inverz geometriája

Pósfay Péter. arxiv: [hep-th] Eur. Phys. J. C (2015) 75: 2 PoS(EPS-HEP2015)369

2015/16/1 Kvantummechanika B 2.ZH

Vízoldható foszfint tartalmazó ródium- és ruténium-katalizátorok működési mechanizmusának vizsgálata

Középfeszültségű gázszigetelésű kapcsolóberendezések villamos szilárdsági méretezése. Madarász Gy. - Márkus I.- Novák B.

Általános Kémia, BMEVESAA101

Példa: Tartó lehajlásfüggvényének meghatározása végeselemes módszer segítségével

Az elemeket 3 csoportba osztjuk: Félfémek vagy átmeneti fémek nemfémek. fémek

Hatékony programozási módszerek a soktestproblémában

I. A DIGITÁLIS ÁRAMKÖRÖK ELMÉLETI ALAPJAI

Publikációs lista. Dr. Molnárka-Miletics Edit Széchenyi István Egyetem Matematika és Számítástudományi Tanszék

Általános Kémia, BMEVESAA101 Dr Csonka Gábor, egyetemi tanár. Az anyag Készítette: Dr. Csonka Gábor egyetemi tanár,

DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI HÁROMFÁZISÚ MEGOSZLÁS ALKALMAZÁSA ÉLELMISZERFEHÉRJÉKVIZSGÁLATÁBAN

Szervetlen kémia I. kollokvium, (DEMO) , , K/2. Írják fel a nevüket, a Neptun kódjukat és a dátumot minden lapra!

Magyar Turizmus Zrt. - Kutatási Csoport / Hungarian National Tourist Office - Department for Market Research Statisztikai táblák / Statistical data

C-Glikozil- és glikozilamino-heterociklusok szintézise

Bevezetés a modern fizika fejezeteibe. 4. (b) Kvantummechanika. Utolsó módosítás: november 9. Dr. Márkus Ferenc BME Fizika Tanszék

Városi légszennyezettség vizsgálata térinformatikai és matematikai statisztikai módszerek alkalmazásával

TELJES PUBLIKÁCIÓS JEGYZÉK

OTKA nyilvántartási szám: T ZÁRÓJELENTÉS

és alkalmazások, MSc tézis, JATE TTK, Szeged, Témavezető: Dr. Hajnal Péter

I. Bevezetés. II. Célkitűzések

Ψ N (r 1 s 1, x 2 x N )Ψ * N(r 1 s 1, x 2 x N ) ds 1 dx 2 dx N (1) A sűrűségmátrixok

Teszt generálás webes alkalmazásokhoz

Kinetika. Általános Kémia, kinetika Dia: 1 /53

Módszer köztes tárolókat nem tartalmazó szakaszos működésű rendszerek ütemezésére

Platina alapú kétfémes katalizátorok jellemzése

Az egyensúly. Általános Kémia: Az egyensúly Slide 1 of 27

Energiaminimum- elve

Univerzalitási osztályok nemegyensúlyi rendszerekben, Ódor Géza

Finite Element Methods for Active Contour Models and Balloons for 2D and 3D Images

Átírás:

Kristyán Sándor ''Kohn-Sham formalizmustól eltérő (hatványsoros) sűrűség funkcionál algoritmus kidolgozása kémiai potenciálfelületek vizsgálatára'' című, KM1 zsűrihez tartozó OTKA-2007-K-68293-KM1 kutatás végső szakmai beszámolója a végzett munkáról (OTKA kezdete: 2007. szeptember, futamidő: 2 év) Kutatásom eredményeit relatíve nagy impact faktorú nemzetközi folyóiratokban publikáltam (3) és jelentős nemzetközi konferenciákon (5) mutattam be. Kiemelném, hogy mindhárom publikáció egyszerzős. Munkám első része a sűrűség funkcionálok (DFT) célirányosított, részletes analízisével kezdődött, amit egy szemleszerű (review-like, u.n. viewpoint article ) munkában publikáltam [P1], illetve szakkonferenciákon is bemutattam [K2, K3, K5]. Ebben a több-elektron sűrűség tulajdonságait és viselkedését analizáltam a két Hohenberg Kohn (HK) tétel tekintetében. Az analízis kiterjedt a sűrűség funkcionál és sűrűség differenciál-, illetve integrál operátorok formáira a dimenziók különböző szintjein a variációs elv (4N dimenzió) és a Hohenberg-Kohn tételek (3 dimenzió) között. Az ionizációs potenciálok eddig nem megmagyarázott trendjének miértjéről is említést tettem. Úgyszintén tárgyaltam a H-hasonló atomok egzakt sűrűség funkcionál operatorát az 1-elektron rendszerekkel és a 2-elektron rendszerekkel egyetemben, nemcsak mint egyszerű örök prototípusokat, de mint bizonyos projekcióit az egy-elektron sűrűség formalizmusnak az N 1 elektronos rendszereknek az N= 1 és 2 esetekre. E munkának a szemle része elsősorban a funkcionál analitikai tulajdonságokra koncentrált. E munkámban, a mellett hogy kimondtam az első és második HK tételek általánosítását magasabb dimenziókra (3 és 4N között, ahol N= elektronok száma) további fontosabb sűrűség funkcionálokat vezettem le: A D Rr nukleáris - elektron vonzás DFT integrál operátorára D Rr [ ] = (r 1 )v(r 1 ) + (N-1) b 2 (r 1,r 2 )v(r 2 )dr 2, ([P1]: Eq.27) és az elektron elektron taszítására D rr [ ] = (N-1) b 2 (r 1,r 2 )r -1 12 dr 2 + [N(N-1)/2 (N-1)] b 3 (r 1,r 2,r 3 )r -1 23 dr 2 dr 3. ([P1]: Eq.28) A H-hasonló atomok, ill. egy elektronos rendszerek DFT differenciál egyenlete: D[N=1, (r 1 )] -(1/4) 2 1 (r 1 ) + (1/8) (r 1 ) -1 1 (r 1 ) 2 + (r 1 )v(r 1 ) = E electr (r 1 ) ([P1]: Eq.31) és HK DFT funkcionálja 1

E electr,0 [(1/8) 0,trial (r 1 ) -1 1 0,trial (r 1 ) 2 + 0,trial (r 1 )v(r 1 )]dr 1. ([P1]: Eq.33) Az egy-elektron sűrűség egy fontos tulajdonsága, mely elméleti fejtetésekben fontos szerepet játszik: 2 1 r 1 dr 1 = 0. ([P1]: Eq.32) A két-elektronos rendszerek DFT differenciál egyenlete Slater determináns szinten: D,S [N=2, 0,S (r 1 )] 2 1 0,S (r 1 ) + (1/8) 0,S 1 0,S 2 B kin 0,S (r 1 ) ([P1]: Eq.34) D Rr,S [N=2, 0,S (r 1 )] = v(r 1 ) 0,S (r 1 ) + <s s> v(r 2 )f 2 1 f 2 2 dr 2 = = v(r 1 ) 0,S (r 1 ) + B Rr 0,S (r 1 ) ([P1]: Eq.35) D rr,s [N=2, 0,S (r 1 )] = (1/2) 0,S (r 1 ) 0,S (r 2 )r -1 12 dr 2 ([P1]: Eq.36) D[N=2, 0,S (r 1 )] D,S [N=2, 0,S (r 1 )] + D Rr,S [N=2, 0,S (r 1 )] + +D rr,s [N=2, 0,S (r 1 )] = 0,S (r 1 ) E electr,0,s ([P1]: Eq.37), és a HK DFT funkcionálja E electr,0,s [(1/8) 0,S,trial (r 1 ) 1 0,S,trial (r 1 ) 2 + v(r 1 ) 0,S,trial (r 1 ) + + (1/4) 0,S,trial (r 1 ) 0,S,trial (r 2 )r -1 12 dr 2 ]dr 1 ([P1]: Eq.38) Ezek az egyenletek azért fontosak, mert a DFT-vel alapvető célunk hogy a Schrödinger egyenletet 3 tér dimenzióra redukálhassuk. Ennek eléréséhez ad segítséget ez a munka, mert valószínű, hogy viszonylag rövid, egyszerű kifejezésekről van szó, de kis eltérés is a kémiai pontosságot (1 kcal/mol) veszélyeztetheti (ld. alábbiak). Vizsgáltam az elektronikus Schrödinger egyenlet lehetséges redukálásának útjait 3 dimenzióra, mely mint említettem - a sűrűség funkcionál elmélet egyik legfontosabb célkitűzése. A fenti bevezető tanulmány [P1] részben megalapozása a második [P2, K1, K4] publikációm számára ezen OTKA kutatásomban, melyben a Thomas-Fermi kinetikus energia (~ 5/3 dr 1 ) és Parr elektron elektron taszítás energia (~ 4/3 dr 1 ) funkcionál közelítések alapján egy algoritmust dolgoztam ki a molekulák egy-elektronos sűrűségének kompakt kifejezésére, valamit az alapállapot energia számolására. Egyik legfontosabb eredmény e munkában az egy-elektron sűrűség kompakt algebrai közelítése (ld. OTKA címe), ami az A c 10 c 1, B c 20 c 2, P(r 1 ) N A=1,,M Z A R -1 Ai, és discr(r 1 ) B 2 4A(P(r 1 )-E k ) kifejezésekkel: 0,k (r 1 )=C[(+(discr(r 1 )) 1/2 -B)/(2A)] 3, ([P2]: Eq.3) C N/[ [(+(discr(q 1 )) 1/2 -B)/(2A)] 3 dq 1 ], ([P2]: Eq.4) bármilyen mag konfigurációra (azaz molekuláris rendszerre). A közelítő funkcionál az alap állapotú elektronikus energiára: 5/3 E electr,0 (approx.,e k )= (1/N) (c 10 c 1,k + P(r 1 ),k + c 20 c 2 4/3,k )dr 1. ([P2]: Eq.5) 2

Ground state total electronic energy, E total electr,0 [hartree] LiF CH rad. BeH LiH A feladat így a funkcionál nehézkes minimalizálásáról egy egyváltozós függvény minimumának megkeresésére (E k változó szerint) redukálódik. Két szükségképpen bevezetett paramétert illesztettem semleges és ionos atomokra, amelyek így átvihetők molekuláris rendszerekre az alapállapot elektronikai energia számításában. A konvergencia arányos az atommagok számával (M) kis merevlemez szükséglettel, valamint numerikus integrálás szükséges. Atomokra tesztelve (Z< 11, 43 eset), több esetben jobb ionizációs energiát ad mint a híres HF-SCF/6-31G* vagy B3LYP/6-31G* módszerek. Molekulák esetén azonban előjöttek az alacsony hatványok ([P2]: Eq.5) problémái, elsősorban a fontosabb, relatív energiák tekintetében, bár az abszolút energiákra nézve meglehetősen bizalomgerjesztő a kép (1. ábra.). 25 0-25 -50-75 -100-125 -150-175 -200-225 -250 H 2 CH 4 NH 3 Empty circles: Error of this method from G3 N 2 O OH CN HCOOH H 2 C=C=O CH 2 O rad. -CH=C=CH 2 NO 2-275 0 5 10 15 20 25 30 35 N 2 Filled squares: G3 groud state total electronic energy Number of electrons, N 1. ábra Néhány figyelemre méltó egyszerűsége mellett érdekes elméleti szempontból is, és mint generátor függvény szolgálhat a pontosabb egy-elektron sűrűség modellekben. Ugyanis az ab inicio számítások a numerikus voltuk miatt nehezebben diszkutálhatók mint egy kompakt kifejezés (rendszer), főleg kémiai szempontból. Magasabb hatványok figyelembe vétele van folyamatban, mely ezen a gyengeségen hivatott segíteni. Részbeni alkalmazásként, olyan rendszerekre, mely fématomokat is tartalmaz, egy általam jól ismert rendszert választottam. Ez a metil-piruvát fő orientációinak vizsgálata cinkona alkaloidok (cinkonin és izo-cinkonin) erőterében (addukt képződés). Ezen az úton a különböző mechanisztikus modellek (2. ábra) eredete (kis számú ismert kutató csoport műhelyéből) az aktívált ketonok hidrogénezésére cinkona alkaloiddal módosított platina felületen közös rendszerbe foglalható volt [P3]. A modellek a két gyűrű rendszer forgásának, mint belső rotációnak eredményeként értelmezhetők. 3

2. ábra. A reakcióban a molekulapályák érdekes viszonyára is rávilágítottam (3. ábra). 3. ábra Ennek a reakció típusnak a vizsgálata alapkutatás szinten a gyógyszeripari költséges rezolválás művelet kiváltása miatt lehet fontos. Számos figyelemre méltó eredményt publikáltam [P1-P3] e munkában, és számos új gondolat, kutatási irány ébredt bennem, amiket a továbbiakban szeretnék megvalósítani akár az OTKA támogatásával. Köszönet az OTKA támogatásért, amiket a publikációimban [P1- P3] is jeleztem a munka végen. 4

Publikációk P3.: Sandor Kristyan: Origin of proposed mechanistic models in heterogeneous catalytic enantioselective hydrogenation of pyruvates comes from the conformation properties of internal rotation of cinchona alkaloids Journal of Physical Chemitry C, 2009 November accepted, under publication: jp-2009-064467 http://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/jp9064467 DOI: 10.1021/jp9064467 kb. 2.8 = 2008 impact factor / www.eisz.hu P2.: Sandor Kristyan: Interesting Properties of Thomas Fermi Kinetic and Parr Electron Electron-Repulsion DFT Energy Functional Generated Compact One-Electron Density Approximation for Ground-State Electronic Energy of Molecular Systems Journal Computational Chemistry, 30 (2009) 1445 1453 DOI: 10.1002/jcc.21161 3.390 = 2008 impact factor / www.eisz.hu P1.: Sandor Kristyan: Properties of the multi-electron densities "between" the Hohenberg Kohn theorems and variational principle Journal of Molecular Structure: THEOCHEM, 858 (2008) 1 11 doi:10.1016/j.theochem.2008.03.007 1.167 = 2008 impact factor / www.eisz.hu 5

Konferenciák K1.: Sandor Kristyan (Poszter p.146): SUCCESSIVE APPROXIMATION OF THE N-ELECTRON DENSITY OPERATOR IN REAL SPACE METHOD FOR CALCULATING GROUND STATE ELECTRONIC ENERGY OF MOLECULAR SYSTEMS: A DENSITY FUNCTIONAL APPROACH USING BASIS SET FREE COMPACT NON-LINEAR ALGEBRAIC ONE-ELECTRON DENSITY APPROXIMATION First International Conference on Functional Nanocoatings Host: Chemical Research Center of the Hungarian Academy of Sciences http://www.chemres.hu/nanocoatings 2008 March 30 - April 2, Budapest, Hungary K2.: Sandor Kristyan (Lecture p.68, July 10): PROPERTIES OF THE MULTI-ELECTRON DENSITIES "BETWEEN" THE HOHENBERG-KOHN THEOREMS AND VARIATIONAL PRONCIPLE VIII. Girona Seminar On Aromacity http://iqc.udg.edu/gsaba2008/ 2008 July 7-10, Girona, Spain K3.: Sandor Kristyan (Poszter P3): PROPERTIES OF THE MULTI-ELECTRON DENSITIES "BETWEEN" THE HOHENBERG-KOHN THEOREMS AND VARIATIONAL PRONCIPLE Electronic Structure: principles and applications (ESPA 2008) http://www.uibcongres.org/congresos/ficha.en.html?cc=140 2008 September 2-5, Palma de Mallorca, Spain K4.: Sandor Kristyan (POSTER SESSION A: A.66): Interesting properties of Thomas-Fermi kineticand Parr electron-electron repulsion DFT energy functional generated compact oneelectron density approximation for ground state electronic energy of molecular systems The XIIIth International Congress of Quantum Chemistry (13th ICQC) http://www.chem.helsinki.fi/cgi-bin/mailman/listinfo/icqc2009 http://www.helsinki.fi/kemia/icqc/index.htm 2009 June 22-27, Helsinki, Finland K5.: Sandor Kristyan (Poszter p17): PROPERTIES OF THE MULTI-ELECTRON DENSITIES BETWEEN THE HOHENBERG-KOHN THEOREMS 6

AND VARIATIONAL PRINCIPLE Conferentia Chemometrica 2009 (CC 2009) http://www.cc2009.mke.org.hu/ 2009 September 27-30, Siofok, Hungary 2009. VI. 24. ICQC-13 Conference, City Hall, Helsinki, Finnland [K4] 7