Mária. A pirimidin-nukleotidok. nukleotidok anyagcseréje



Hasonló dokumentumok
Purin nukleotidok bontása

Nukleotid anyagcsere

A nukleinsavak polimer vegyületek. Mint polimerek, monomerekből épülnek fel, melyeket nukleotidoknak nevezünk.

CHO H H H OH H OH OH H CH2OH HC OH HC OH HC OH CH 2

A nukleinsavak polimer vegyületek. Mint polimerek, monomerekből épülnek fel, melyeket nukleotidoknak nevezünk.

1. A nitrogén körforgása

CHO H H H OH H OH OH H CH2OH CHO OH H HC OH HC OH HC OH CH 2 OH

Citrátkör, terminális oxidáció, oxidatív foszforiláció

4. Előadás. Nukleozidok, nukleotidok, nukleinsavak

NUKLEINSAVAK. Nukleinsav: az élő szervezetek sejtmagvában és a citoplazmában található, az átöröklésben szerepet játszó, nagy molekulájú anyag

,:/ " \ OH OH OH / \ O / H / H HO-CH, O, CH CH - OH ,\ / "CH - ~(H CH,-OH \OH. ,-\ ce/luló z 5zer.~ezere

Az aminosav anyagcsere orvosi vonatkozásai Csősz Éva

a III. kategória ( évfolyam) feladatlapja

Nukleinsavak. Szerkezet, szintézis, funkció


a DNS-hibajavítás és az apoptózis folyamatában

A dutpáz kifejeződés hatása a DNS bázisösszetételére és a genom épségére

A METABOLIZMUS ENERGETIKÁJA

A METABOLIZMUS ENERGETIKÁJA

A dezoxicitidin-kináz aktiválódásának lehetséges szerepe a DNS-hibajavítás és az apoptózis folyamatában

(neutrális lipidek) glicerofoszfolipidek szfingolipidek galactolipidek

ZSÍRSAVAK OXIDÁCIÓJA. FRANZ KNOOP német biokémikus írta le először a mechanizmusát. R C ~S KoA. a, R-COOH + ATP + KoA R C ~S KoA + AMP + PP i

A piruvát-dehidrogenáz komplex. Csala Miklós

2. Sejtalkotó molekulák II. Az örökítőanyag (DNS, RNS replikáció), és az öröklődés molekuláris alapjai (gén, genetikai kód)

A gyakorlat elméleti háttere A DNS molekula a sejt információhordozója. A DNS nemzedékről nemzedékre megőrzi az élőlények genetikai örökségét.

Dezoxinukleozid-kinázok szerepe a DNS-repair és az apoptózis folyamatában

ENZIMSZINTŰ SZABÁLYOZÁS

A glükóz reszintézise.

Glikolízis. emberi szervezet napi glukózigénye: kb. 160 g

Heterociklusos vegyületek

Glükoproteinek (GP) ELŐADÁSVÁZLAT ORVOSTANHALLGATÓK RÉSZÉRE

09. A citromsav ciklus

Az AS nitrogénjének eltávolítása

3. Sejtalkotó molekulák III.

Nukleinsavak építőkövei

ALLOSZTÉRIKUSAN SZABÁLYOZÓ METABOLITOK HATÁSA A PIRUVÁT-KINÁZ L és M IZOENZIMRE

AZ ÉLET KELETKEZÉSE egy kis kémia a biológiához

A biokémiai folyamatokat enzimek (biokatalizátorok) viszik véghez. Minden enzim. tartalmaz fehérjét. Két csoportjukat különböztetjük meg az enzimeknek

Az anyag- és energiaforgalom alapjai

Kémiai Intézet Kémiai Laboratórium. F o t o n o k k e r e s z tt ü z é b e n a D N S

A szénhidrátok lebomlása

A pillangóktól a folsavon és a metotrexáton át a programozott sejthalálig

Fehérjék. SZTE ÁOK Biokémiai Intézet

Glikolízis. Csala Miklós

Kollokviumi vizsgakérdések biokémiából humánkineziológia levelező (BSc) 2015

Szénhidrátanyagcsere. net

Több oxigéntartalmú funkciós csoportot tartalmazó vegyületek

A felépítő és lebontó folyamatok. Biológiai alapismeretek

Bevezetés a biokémiába fogorvostan hallgatóknak

transzláció DNS RNS Fehérje A fehérjék jelenléte nélkülözhetetlen minden sejt számára: enzimek, szerkezeti fehérjék, transzportfehérjék

A szénhidrátok anyagcseréje. SZTE AOK Biokémiai Intézet Gyógyszerész hallgatók számára 2014.

A KOLESZTERIN SZERKEZETE. (koleszterin v. koleszterol)

MEDICINÁLIS ALAPISMERETEK AZ ÉLŐ SZERVEZETEK KÉMIAI ÉPÍTŐKÖVEI AZ AMINOSAVAK ÉS FEHÉRJÉK 1. kulcsszó cím: Aminosavak

Kun Ádám. Növényrendszertani, Ökológiai és Elméleti Biológiai Tanszék, ELTE MTA-ELTE-MTM Ökológiai Kutatócsoport. Tudomány Ünnepe,

Az elemek szintézise. Környezeti kémia. Elemgyakoriságok az univerzumban Elemgyakoriságok az univerzumban: lineáris ábrázolás

2. Sejtalkotó molekulák II. Az örökítőanyag (DNS, RNS replikáció), és az öröklődés molekuláris alapjai (gén, genetikai kód)

Hiperammonémiák. Támpontok az egyes célkitűzések tárgyalásához

A minimális sejt. Avagy hogyan alkalmazzuk a biológia több területét egy kérdés megválaszolására

LIPID ANYAGCSERE (2011)

Nitrogéntartalmú szerves vegyületek. 6. előadás

CIÓ A GENETIKAI INFORMÁCI A DNS REPLIKÁCI

Számolási feladatok. A = 17,5 % T = 17,5 % 32,5 % G és ugyanennyi C

folsav, (a pteroil-glutaminsav vagy B 10 vitamin) dihidrofolsav tetrahidrofolsav N CH 2 N H H 2 N COOH

Zsírsav szintézis. Az acetil-coa aktivációja: Acetil-CoA + CO + ATP = Malonil-CoA + ADP + P. 2 i

A nukleinsavkémia koronázatlan királyai, kémiai és orvosi Nobel-díjak:

Aminosav anyagcsere. Dr. Vér Ágota Egyetemi docens 2012

Uracil a DNS-ben: hiba vagy jel? A dutpáz szabályozása és egy újonnan azonosított U-DNS nukleáz a Drosophila melanogaster fejlődésében.

FEHÉRJÉK, BIOENERGETIKA

A kémiai energia átalakítása a sejtekben

Biotranszformáció. Csala Miklós. Semmelweis Egyetem Orvosi Vegytani, Molekuláris Biológiai és Patobiokémiai Intézet

alanin (Ala, A) valin (Val, V) leucin (Leu, L) izoleucin (Ile, I) szerin (Ser, S) treonin (Thr, T)

A TRICHODERMA REESEI GOMBA ÉS S GENETIKÁJA

DER (Felületén riboszómák találhatók) Feladata a biológiai fehérjeszintézis Riboszómák. Az endoplazmatikus membránrendszer. A kódszótár.

BIOLÓGIA VERSENY 10. osztály február 20.

A bioenergetika a biokémiai folyamatok során lezajló energiaváltozásokkal foglalkozik.

Intelligens molekulákkal a rák ellen


Növényélettani Gyakorlatok A légzés vizsgálata

MEDICINÁLIS ALAPISMERETEK BIOKÉMIA A SZÉNHIDRÁTOK ANYAGCSERÉJE 1. kulcsszó cím: A szénhidrátok anyagcseréje

VIZSGAKÉRDÉSEK A FELKÉSZÜLÉSHEZ* Biokémia és molekuláris biológia IB kurzus

Szénhidrátok monoszacharidok formájában szívódnak fel a vékonybélből.

FEHÉRJESZINTÉZIS: a transzláció mechanizmusa és a polipeptidlánc további sorsa. Gergely Pál 2009

7. évfolyam kémia osztályozó- és pótvizsga követelményei Témakörök: 1. Anyagok tulajdonságai és változásai (fizikai és kémiai változás) 2.

A génterápia genetikai anyag bejuttatatása diszfunkcionálisan működő sejtekbe abból a célból, hogy a hibát kijavítsuk.


Az újszülöttkori galactosaemia szűrés eredményei és differenciáldiagnosztikai lehetőségei

A nukleinsavkémiai kisszótár:

DOKTORI ÉRTEKEZÉS ÚJ L-NUKLEOZIDOK MINT POTENCIÁLIS ANTIVIRÁLIS ÉS TUMORGÁTLÓ SZEREK SZINTÉZISE. Sendula Róbert

MEDICINÁLIS ALAPISMERETEK BIOKÉMIA AZ AMINOSAVAK ANYAGCSERÉJE 1. kulcsszó cím: Az aminosavak szerepe a szervezetben

Dr. Komáry Zsófia MITOKONDRIUMOK REAKTÍV OXIGÉNSZÁRMAZÉK SZENTÁGOTHAI JÁNOS IDEGTUDOMÁNYI DOKTORI A KÁLCIUM HATÁSA AZ IZOLÁLT SEMMELWEIS EGYETEM

A biokémia alapjai. Typotex Kiadó. Wunderlich Lívius Szarka András

1. A nitrogén körforgása

fogalmak: szerves és szervetlen tápanyagok, vitaminok, esszencialitás, oldódás, felszívódás egészséges táplálkozás:

CzB Élettan: a sejt

3. Sejtalkotó molekulák III. Fehérjék, enzimműködés, fehérjeszintézis (transzkripció, transzláció, poszt szintetikus módosítások)

Energiaforrásaink Szénvegyületek forrása

Molekuláris terápiák

FEHÉRJESZINTÉZIS: a transzláció mechanizmusa és a polipeptidlánc további sorsa. Bay Péter

DOKTORI (Ph D) ÉRTEKEZÉS

TÉMAKÖRÖK. Ősi RNS világ BEVEZETÉS. RNS-ek tradicionális szerepben

Átírás:

Prof.. Sasvári Mária A pirimidin-nukleotidok nukleotidok anyagcseréje 1

A nukleobázisok szerkezete Nitrogéntartalmú, heterociklusos vegyületek; szubsztituált purin- és pirimidin-származékok purin Adenin (6-amino purin) Guanin (2-amino, 6-oxo purin) pirimidin Citozin (2-oxo, 4-amino-pirimidin) Uracil (2,4-dioxo-pirimidin) Timin (5-metil-uracil) RNS DNS 2

A pirimidin-nukleotidok nukleotidok anyagcseréje (áttekintés) de novo szintézis CTP UTP CMP UMP VÉR citidin uridin lebontás PRPP mentő reakciók CO 2, NH 3, β-alanin KoA 3

A ppirimidin-nukleotidok nukleotidok bioszintézise zise (áttekintés) de novo szintézis UMP-S Py 5,6 CAD Py 1-3 UTP UDP UMP OS H 2 OS Asp Gln CO 2 Py 4 mito CTP mentő reakciók nukleozidok 4

de novo szintézis PRPP CTP UTP C CAD Py 1-3 de novo pirimidin-szintézis zis Karbamil-P-szintetáz (citoplazmatikus) Py1 H 2 OS Asp Gln CO 2 O 1. CO 2 NH 2 C O - P karbamil-p Gln 2 ATP 2 ADP + P i Glu A Asp-transzkarbamiláz Py2 2. Asp 5

CAD Py 1-3 H 2 OA Asp Gln CO 2 de novo pirimidin-szintézis zis O COO - NH 2 C COO - N H karbamil-asp D Dihidroorotáz Py3 3. O H 2 O HN O N H COO - Dihidroorotát (H 2 OS) 6

OS H 2 OA Py 4 mito de novo pirimidin-szintézis zis Dihidroorotátdehidrogenáz Py4 4. O NAD + NADH + H + HN O COO - N H orotát (OS) 7

UMP-S Py 5,6 UMP OA UMPszintáz Orotátfoszforiboziltranszferáz Py5 de novo pirimidin-szintézis zis 5. O PRPP PP i Py6 OMP-dekarboxiláz HN O N COO - R- P Orotidilát (OMP) 6. CO 2 UMP 8

UTP UDP UMP CTP UMPkináz Pirimidin-difoszfátkináz CTP-szintetáz UMP ATP 7. ADP UDP ATP 8. ADP UTP (2,4-dioxo) Gln 9. ATP ADP + P i Glu CTP (2-oxo-4 amino) 9

A pirimidin de novo szintézis zis szabályozása sa CAD Py 1-3 CAD-komplex: egyetlen polipeptid három aktív centrum + allosztérikus helyek UTP + PRPP, ATP UMP-S Py 5,6 UMP OA UMP 10

A karbamil-foszfát szintetáz (CPS) izoenzimek összehasonlítása sa CPSI CPSII szerep ureaciklus de novo pirimidin-bioszintézis lokalizáció mitokondriális citoplazmatikus N-donor szabad NH 3 glutamin szabályzás + N-acetil-glutamát + PRPP, - UTP 11

UMP-S Py 5,6 CAD Py 1-3 UTP UDP UMP OS H 2 OS Asp Gln Py 4 mito CTP Az orotsavuriao lehetséges okai 1. UMP-szintáz-hiány Kezelés: uridintartalmú diéta 2. UMP-szintáz gátlása Allopurinol-kezelés (köszvény) 6-azauridin-kezelés (tumor) NH 3 és karbamil-p (CP) 3. Ornitin-transzkarbamiláz-hiány: A CAD-komplex felhasználja a mitokondriumból kiáramló CP-ot orotsav-túltermelés 12

de novo szintézis CTP CMP UTP UMP VÉR citidin uridin lebontás Pirimidin nukleotidok lebontása PRPP Mento reakciók CO 2, NH 3, β-alanin KoA UMP (TMP) B r -p CMP P i 5 nukleotidáz P i uridin (timidin) B r citidin deamináz citidin NH 3 H 2 O 13

lebontás Pirimidin nukleotidok lebontása uridin (timidin) P i uridin/timidin foszforiláz CO 2, NH 3, β-alanin KoA NADH ri-1-p uracil (timin) Dihidropirimidin dehidrogenáz NAD + DHP-DH dihidrouracil (dihidrotimin) Klinikai vonatkozások DHP-DH hiány (timin/uracil uria) 5-F-uracil TOXICITÁS! 14

lebontás O HN O NH dihidrouracil (dihidrotimin) +H 2 O dihidropirimidináz Deffektus: H 2 Timin/ H 2 uracil uria Neurológiai zavarok, epilepszia CO 2, NH 3, β-alanin KoA N-karbamil-β-alanin (N-karbamil-β-amino-izovajsav) O H 2 N-C-NH-CH 2 -CH 2 -COOH CO 2 + NH 3 + β-alanin +H 2 O ureidopropionáz koenzim A 15

de novo szintézis CTP UTP CMP UMP VÉR citidin uridin Pirimidin mentő reakciók PRPP Mento Mentő reakciók ATP ADP uridin UMP B r uridin-citidin-kináz B r -p citidin CMP ATP ADP citidilát-dezamináz NH 3 H 2 O 16

de novo szintézis CTP UTP PRPP CMP UMP VÉR citidin uridin Mento Mentő reakciók Gyógyszermetabolizmus uridin-citidin-kináz Széles specifitású enzim Pirimidin-nukleozidok/nukleozid-analógok intracelluláris aktiválása pl: 6-aza-uridin 6-aza-UMP HN O O N N Ribóz 6-azauridin UMP-analóg UMP-szintáz gátlása RNS/DNS-szintézis gátlása sejtosztódás gátlása 17

Dezoxinukleozidok mentő reakciói Dezoxicitidin kináz (dck) limfoid specifikus Széles szubsztrát specifitás dcit dcmp ATP ADP dade dgua dcit dck damp dgmp dcmp dump dtmp 2-klór-dAde arabinozilcit 2-klór-dAMP aracmp 18

A Cladribin a hajas sejtes leukémia gyógyszere gyszere 2-klór-2 -dezoxiadenozin (CdA, Cladribine ) hajas sejtes leukémia (HCL) 19

Módosított cukrokat tartalmazó pirimidin-analógok arabinozil-citozin (arac; AML kezelésére) 2, 3 -didezoxi-citidin 2 -dezoxi-2, 2 - -difluorcitidin (dfdc, Gemcitabine) 20

Antivirális nukleozid-analógok Acyclovir Stavudine Didanosine 9-hidroxiethoximetil-guanin, egy aciklusos nukleozid A virális DNS (RNS)-szintézis gátlószerei (herpeszvírusok, HIV: retrovirális reverz transzkriptáz gátlása) 21

Dezoxinukleozidok mentő reakciói Timidin kináz (dtk) S-fázis függő enzim Szűk szubsztrát specifitás timidin dtmp ATP ADP Herpes Simplex Vírus (HSV) dtk: széles szubsztrát specifitás Pl. aciklovír, ganciklovír (dezoxinukleozid analógok) HSV-dTK tudja csak aktiválni, humán-dtk nem HSV-dTK tartalmú sejtek elpusztulnak Felhasználás: Herpes vírus elleni gyógyszerek (Aciklovír) Öngyilkos génterápia (Ganciklovír, AIDS) 22

Nukleotid anyagcsere Összefoglalás s 1. de novo szintézis purin pirimidin szabad bázis nincs van (orotsav) PRPP alloszterikus aktivátor igen igen C 1 -THF-donor igen nem (kiv. timidin!) Asp szerepe N-donor beépül a gyűrűbe aminocsoportok eredete Asp, Gln Gln a gyűrű atomjainak eredete Gly, Asp, Gln, C 1 -THF, CO 2 Asp CO 2, Gln 23

Nukleotid anyagcsere Összefoglalás s 2. salvage (mentő) útvonal purin pirimidin főleg bázisok mentése igen nem főleg nukleozidok mentése nem igen Ko-szubsztrát- szükséglet PRPP ATP 24

Nukleotid anyagcsere Összefoglalás s 3. Lebontás purin pirimidin teljes gyűrű kiválasztása igen nem dezaminálás igen igen betegségek hiperuricemia SCID orotsavas aciduria 25