Biomolekuláris rendszerek. vizsgálata. Semmelweis Egyetem. Osváth Szabolcs

Hasonló dokumentumok
Biomolekuláris rendszerek. vizsgálata. Semmelweis Egyetem. Osváth Szabolcs

Biomolekuláris rendszerek. vizsgálata. Semmelweis Egyetem. Osváth Szabolcs. A mikroszkópok legfontosabb típusai

Biomolekuláris rendszerek vizsgálata

Biomolekuláris rendszerek vizsgálata

A biológiai anyag vizsgálatának mikroszkópi módszerei

Kis Petik Katalin. Semmelweis Egyetem. Biofizikai és Sugárbiológiai Intézet

Áttekintés 5/11/2015 MIKROSZKÓPIAI MÓDSZEREK 1 FÉNYMIKROSZKÓPIA FLUORESZCENCIA MIKROSZKÓPIA. Mikroszkópia, fénymikroszkópia

Fény- és fluoreszcens mikroszkópia. A mikroszkóp felépítése Brightfield mikroszkópia

Atomi és molekuláris kölcsönhatások. Pásztázó tűszondás mikroszkópia.

Ragyogó molekulák: dióhéjban a fluoreszcenciáról és biológiai alkalmazásairól

Modern mikroszkópiai módszerek

Pásztázó mikroszkópiás módszerek

OPTIKA. Vozáry Eszter November

d z. nsin

Rövid ismertető. Modern mikroszkópiai módszerek. A mikroszkóp. A mikroszkóp. Az optikai mikroszkópia áttekintése

Mikroszerkezeti vizsgálatok

2008 Small World contest -18th Prize - Dr. Tamily Weissman (Harvard University - Cambridge, Massachusetts, United States) Specimen: Brainbow

5/11/2015 MIKROSZKÓPIAI MÓDSZEREK 2 FLUORESZCENCIÁN ALAPULÓ MODERN MIKROSZKÓPIAI MÓDSZEREK. Fluoreszcencia mikroszkópia

Abszorpciós spektroszkópia

OPTIKA. Fénykibocsátás mechanizmusa fényforrás típusok. Dr. Seres István

Az elektromágneses hullámok

Abszorpció, emlékeztetõ

Nanotudományok vívmányai a mindennapokban Lagzi István László Eötvös Loránd Tudományegyetem Meteorológiai Tanszék

Speciális fluoreszcencia spektroszkópiai módszerek

Mozgékony molekulák vizsgálata modern mikroszkópiával

Abszorpciós fotometria

Tartalomjegyzék. Emlékeztetõ. Emlékeztetõ. Spektroszkópia. Fényelnyelés híg oldatokban A fény; Abszorpciós spektroszkópia

PÁSZTÁZÓSZONDÁS MIKROSZKÓPIA

Abszorpciós fotometria

Tartalomjegyzék. Emlékeztetõ. Emlékeztetõ. Spektroszkópia. Fényelnyelés híg oldatokban 4/11/2016. A fény; Abszorpciós spektroszkópia

Lézerek. A lézerműködés feltételei. Lézerek osztályozása. Folytonos lézerek (He-Ne) Impulzus üzemű lézerek (Nd-YAG, Ti:Sa) Ultrarövid impulzusok

Az elektromágneses spektrum

Név... intenzitás abszorbancia moláris extinkciós. A Wien-féle eltolódási törvény szerint az abszolút fekete test maximális emisszióképességéhez

A nanotechnológia mikroszkópjai. Havancsák Károly, január

Szentjánosbogár, trópusi halak, sarki fény Mi a közös a természet fénytüneményeiben?

ALKÍMIA MA Az anyagról mai szemmel, a régiek megszállottságával.

A szubmikronos anyagtudomány néhány eszköze. Havancsák Károly ELTE TTK Központi Kutató és Műszer Centrum július.

Atomi, illetve molekuláris kölcsönhatások és alkalmazásaik

1. Jegyzőkönyv AFM

Az elektron hullámtermészete. Készítette Kiss László

Modern mikroszkópiai technikák

Műszeres analitika. Abrankó László. Molekulaspektroszkópia. Kémiai élelmiszervizsgálati módszerek csoportosítása

Műszeres analitika II. (TKBE0532)

Abszorpciós fotometria

Röntgen-gamma spektrometria

A hőmérsékleti sugárzás

A fluoreszcencia orvosibiológiai. alkalmazásai. Fluoreszcencia forrása I. Fluoreszcencia alkalmazások. Kellermayer Miklós

Pásztázó elektronmikroszkóp. Alapelv. Szinkron pásztázás

ATOMI ERŐ MIKROSZKÓP OKTATÁSI MODELL ATOMIC FORCE MICROSCOPE MODEL IN SCHOOL

Bevezetés a fluoreszcenciába

Az áramlási citometria gyakorlati alkalmazása az ondó rutin analízisben. Hajnal Ágnes, Dr Mikus Endre, Dr Venekeiné Losonczi Olga

Szerkezetvizsgálat ANYAGMÉRNÖK ALAPKÉPZÉS (BSc)

E (total) = E (translational) + E (rotation) + E (vibration) + E (electronic) + E (electronic

Szalay Péter (ELTE, Kémia Intézet) Szentjánosbogár, trópusi halak, sarki fény Mi a közös a természet fénytüneményeiben?

Feloldóképesség Mikroszkópos módszerek. DIC mikroszkópia. Fáziskontraszt mikroszkópia. Barkó Szilvia A MIKROSZKÓPIA RÖVID TÖRTÉNETE

Röntgensugárzás az orvostudományban. Röntgen kép és Komputer tomográf (CT)

Fényérzékeny amorf nanokompozitok: technológia és alkalmazásuk a fotonikában. Csarnovics István

Optikai mikroszkópia. Bereznai Miklós SZTE Optika és Kvantumelektronikai Tanszék

11.3. Az Achilles- ín egy olyan rugónak tekinthető, amelynek rugóállandója N/m. Mekkora erő szükséges az ín 2 mm- rel történő megnyújtásához?

Optikai spektroszkópiai módszerek

Fluoreszcencia módszerek (Kioltás, Anizotrópia, FRET) Modern Biofizikai Kutatási Módszerek

FONTOS! a március 14-i előadás március 19-én (szombat) 9 h-kor lesz

In vivo szövetanalízis. Különös tekintettel a biolumineszcens és fluoreszcens képalkotási eljárásokra

Gamma-röntgen spektrométer és eljárás kifejlesztése anyagok elemi összetétele és izotópszelektív radioaktivitása egyidejű elemzésére

Orvosi Biofizika I. 12. vizsgatétel. IsmétlésI. -Fény

6. Fehérjék kimutatása. Biokémiai és sejtszintű vizsgálatok

A pásztázó mikroszkóp. (Takács Gergő)

Fluoreszcencia módszerek (Kioltás, Anizotrópia, FRET)

A nanotechnológia mikroszkópja

NANOMEDICINA BIONIKA

Alapvető eljárások Roncsolásmentes anyagvizsgálat

A lézer alapjairól (az iskolában)

Biofizika. Sugárzások. Csik Gabriella. Mi a biofizika tárgya? Mi a biofizika tárgya? Biológiai jelenségek fizikai leírása/értelmezése

A módszerek jelentősége. Gyors-kinetika módszerek. A módszerek közös tulajdonsága. Milyen módszerekről tanulunk?

Havancsák Károly Nagyfelbontású kétsugaras pásztázó elektronmikroszkóp az ELTÉ-n: lehetőségek, eddigi eredmények

BIOFIZIKA. Metodika- 2. Liliom Károly. MTA TTK Enzimológiai Intézet

Az áramlási citométer és sejtszorter felépítése és működése, diagnosztikai alkalmazásai

MIKRO- ÉS NANOTECHNIKA II: NANOTECHNOLÓGIA

Világító molekulák: Új típusú, szolvatokróm fluorofórok előállítása, vizsgálata és alkalmazásaik

Lumineszcencia spektrometria összefoglaló

Lumineszcencia. Lumineszcencia. mindenütt. Lumineszcencia mindenütt. Lumineszcencia mindenütt. Alapjai, tulajdonságai, mérése. Kellermayer Miklós

6. Fehérjék kimutatása. Biokémiai és sejtszintű vizsgálatok

Dr. JUVANCZ ZOLTÁN Óbudai Egyetem Dr. FENYVESI ÉVA CycloLab Kft

6. Fehérjék kimutatása. Biokémiai és sejtszintű vizsgálatok

A fény keletkezése. Hőmérsékleti sugárzás. Hőmérsékleti sugárzás. Lumineszcencia. Lézer. Tapasztalat: a forró testek Hőmérsékleti sugárzás

Laterális feloldás és képminőség javítása vonalpásztázó tomográfiás optikai mikroszkópban

Dicsı Ágnes: Lézer a restaurálás szolgálatában Álom és valóság

A kvantummechanika kísérleti előzményei A részecske hullám kettősségről

Atomi erőmikroszkópia

Biofizika 2 Fizika-Biofizika

Szerves oldott anyagok molekuláris spektroszkópiájának alapjai

Lumineszcencia alapjelenségek

Infravörös, spektroszkópia

Konfokális mikroszkópia elméleti bevezetõ

SZENZOROK ÉS MIKROÁRAMKÖRÖK

Fluoreszcencia 2. (Kioltás, Anizotrópia, FRET)

Modern Biofizikai Kutatási Módszerek Kereskedelmi forgalomban kapható készülékek. Áramlási citometria (flow cytometry)

Optika gyakorlat 6. Interferencia. I = u 2 = u 1 + u I 2 cos( Φ)

A fény keletkezése. Hőmérsékleti sugárzás. Hőmérsékleti sugárzás. Lumineszcencia. Lézer. Tapasztalat: a forró testek Hőmérsékleti sugárzás

Műszeres analitika II. (TKBE0532)

Átírás:

Abszorpció és fluoreszcencia spektroszkópia előnyei Biomolekuláris rendszerek vizsgálata érzékeny Osváth Szabolcs kvalitatív analízis Semmelweis Egyetem szabolcs.osvath@eok.sote.hu kvantitatív analízis képalkotó módszerekkel kombinálható Fény abszorpció és emisszió Jablonski diagram Fény abszorpció és emisszió spektrum Stokes eltolódás (hullámhossz vagy frekvencia egységekben) az abszorpció és emisszió spektrum maximuma közötti távolság.

Hans Jansen és Zacharias Jansen 1590-ben összetett mikroszkópot épít Quantitative Light-induced Fluorescence (QLF) Antoni van Leeuwenhoek (Thonis Philipszoon) 1632-1723 1674-ben egyszerű mikroszkópot készít Mekkorák a dolgok?

Ernst Karl Abbe (1840-1905) Összetett mikroszkóp optikai útja Fizikus és társadalomreformer Az optikai eszközök gyártását tudományos alapokra helyezte. Végtelenre korrigált optika Köhler megvilágítás 1893-ban találta fel August Köhler a Carl Zeiss műveknél.

Numerikus apertúra Point Spread Function (PSF) A (fluoreszcens) tárgy egy pontjának képe, nem egy pont, hanem adott intenzitáseloszlású folt. Ez a tulajdonság a fény hullámtermészetének a következménye. Az objektív segítségével egy térrészbe lehet a fényt fókuszálni, nem egy pontba. A numerikus apertúra hatása a PSF-re A fény hullámtermészetének hatása a képre

Abbe összefüggés δ = 0,61 λ / (n sinω) Hallgatólagos feltevések: - a minta különböző részeiről egyszerre alkotunk képet; - a minta részleteit úgy különböztetjük meg, hogy a róluk jövő fény a létrejövő képben megkülönböztethető képpontokat (foltokat) ad. A konfokális fluoreszcencia mikroszkóp működése Fluoreszcencia mikroszkóp Epifluoreszcens és konfokális mikroszkóp összehasonlítása epifluoreszcens konfokális humán medulla nyúl izom pollen

Dentinalis tubulusok humán fogban A kétfotonos mikroszkóp működési elve Az ideális fluorofór Fluoreszcens kvantumpöttyök - kicsi - hidrofil - a látható tartományban nyel el és emittál - nagy Stokes eltolódás - specifikus kötődés (biotin/avidin, His-tag/Ni, antitest/antigén, NH2, SH) - fényes (abszorpció*fluoreszcencia hatásfok) - nem, vagy lassan ég ki - nem csinál fotokémiai reakciókat - nem pislog (a) CdSe-ből ZnS borítással készült kvantumpöttyök fluoreszcenciamikroszkópos képe A kvantumpöttyök mérete határozza meg az emittált fluoreszcencia színét. (b) tíz eltérő méretű, ezért elérő színben fluoreszkáló CdSe/ZnS kvantumpötty

Roger Y. Tsien 1995-ben előállított az első javított változatot Martin Chalfie 1994-ben génkifejeződés indikátoraként használta Douglas Prasher 1992-ben klónozta és szekvenálta a génjét Osamu Shimomura a '60 as években izolálta és elkezdte tanulmányozni 2008. évi kémiai Nobel díj GFP (Green Fluorescent Protein) Fluoreszcens kvantumpöttyökkel jelölt rákos daganatok Acropora millepora (korall) A képet teljes egészében fluoreszcens fehérjéket kifejező baktériumokkal festették. A fluoreszcens fehérjék sokfélesége Aequorea victoria (medúza) Fluoreszcens fehérjék

Fluoreszcens jelölő módszerek párhuzamos alkalmazása Öt különböző módszerrel megfestett HeLa sejtek. A vonal 20 µm hosszú. Hullám-részecske kettősség Louis De Broglie: λ = h/p fluorofullerén C 60 F 48 1632 Da tetrafenilporfirin C 44 H 30 N 4 Egyedi molekulák vizsgálata Plenty of Room at the Bottom " The principles of physics, as far as I can see, do not speak against the possibility of maneuvering things atom by atom. It is not an attempt to violate any laws; it is something, in principle, that can be done; but in practice, it has not been done because we are too big." Richard Feynman, 1959 Hullám-részecske kettősség Grafitról készült Pásztázó Alagútmikroszkópi (Scanning Tunneling Microscope, STM) kép

Egyedi F1 motor (ATP szintáz) forgó mozgása STimulated Emission Depletion (STED) mikroszkóp Szinaptolizin szerveződése az újra-hasznosított szinaptikus vezikulákban. STimulated Emission Depletion (STED) mikroszkóp Stefan Hell úttörő munkája nyomán I max a használt maximális STED intenzitás I s a STED telítési intenzitása Lokalizáció

Photo-Activated Localization Microscopy (PALM) Eric Betzig és Harald Hess találmánya nyomán Pásztázó tűszondás mikroszkópok (Scanning Probe Microscopy - SPM) A mikroszkópok olyan családja, amely a minta felszínének domborzati képét hozza létre. Egy hegyes tűvel pásztázzunk a felszínt és a hegy-minta kölcsönhatást mérjük. Photo-Activated Localization Microscopy (PALM) CD63, lizoszóma transzmembrán fehérje Atomerő mikroszkóp (Atomic Force Microscopy - AFM) AFM: a mért kölcsönhatás a hegy és minta közötti erő lézer lencse kvadráns dióda pásztázó tű minta piezoelektr. asztal

A tű és a minta közötti erő A tű jellemzői: - tipikusan 100 μm hosszú, 1μm vastag, V alakú - kis rugóállandó - nagy rezonanciafrekvencia - szilícium (-oxid, -nitrid) Erő Távolság taszítás vonzás Előnyök és hátrányok Contact Mode AFM Előny: gyors pásztázás atomi felbontás érdes felületekre jó Hátrány: a vízszintes erők torzítják a képet torzítás a minta felületén lévő víz miatt a lágy biológiai mintákat megkarcolja Tapping Mode AFM Előny: nagyobb laterális felbontás (1 5nm) kevésbé teszi tönkre a lágy mintákat Hátrány: lassabb pásztázás Contact Mode AFM A tű és a minta állandó kontaktusban vannak. A taszító tartományban dolgozik. Állandónak tartja az erőt: követi a felszín hullámzását. A mérőrugó függőleges deformációját detektáljuk. Lokális erő spektroszkópia: a felület egy adott pontjában az erő/elmozdulás függvény. Tapping Mode AFM A tű 20-100 nm amplitúdójú rezgéseket végez, minden rezgésnél érinti a felületet. A rezgési amplitúdó és fázis változik ahogy a felszínen a kiemelkedések és mélyedések vannak. Extra-celluláris konnexon AFM képe Kalcium-indukált konformáció változás az extra-celluláris konnexon felszínben. A vonal 23 nm hosszú.