Szintetikus receptorokon és nanoszerkezeteken alapuló kémiai és bioszenzorok Gyurcsányi E. Róbert

Hasonló dokumentumok
Biomolekuláris nanotechnológia. Vonderviszt Ferenc PE MÜKKI Bio-Nanorendszerek Laboratórium

Nature. 1990;346(6287): Lee JF, Hesselberth JR, Meyers LA, Ellington AD. Aptamer Database. Nucleic Acids Research. 2004;32(suppl 1):D95-D100.

Zárójelentés NF OTKA pályázat

Új irányok a biomolekuláris felismerés detektálásában

Szelektív szintetikus receptorok fejlesztése és alkalmazása fehérjék meghatározására

Nanofizika, nanotechnológia és anyagtudomány

Szén nanoszerkezetek grafén nanolitográfiai szimulációja

mintasepcifikus mikrokapilláris elektroforézis Lab-on-Chip elektroforézis / elektrokinetikus elven DNS, RNS, mirns 12, fehérje 10, sejtes minta 6

TRIPSZIN TISZTÍTÁSA AFFINITÁS KROMATOGRÁFIA SEGÍTSÉGÉVEL

Ciklodextrinek alkalmazási lehetőségei kolloid diszperz rendszerekben

Lehet-e tökéletes nanotechnológiai eszközöket készíteni tökéletlen grafénból?

Debreceni Egyetem Orvos- és Egészségtudományi Centrum Biofizikai és Sejtbiológiai Intézet

Biotechnológia, egészség- és környezetvédelem. Műegyetem - Kutatóegyetem Biotechnológia, egészség-és környezetvédelem

Mesterséges és természetes ellenanyagokon alapuló analitikai módszerek antiepileptikumok meghatározására

Nanotechnológia. Vonderviszt Ferenc. Veszprémi Egyetem Nanotechnológia Tanszék

Immunológia alapjai előadás. Az immunológiai felismerés molekuláris összetevői.

ALKÍMIA MA Az anyagról mai szemmel, a régiek megszállottságával.

Immunológia alapjai előadás Az immunológiai felismerés molekuláris összetevői. Az antigén fogalma. Antitestek, T- és B-sejt receptorok:

Immunológia alapjai előadás. Az immunológiai felismerés molekuláris összetevői

Az ellenanyagok orvosbiológiai. PhD kurzus 2011/2012 II. félév

VILÁGÍTÓ GYÓGYHATÁSÚ ALKALOIDOK

Elválasztástechnikai és bioinformatikai kutatások. Dr. Harangi János DE, TTK, Biokémiai Tanszék

Az ioncsatorna fehérjék szerkezete, működése és szabályozása. A patch-clamp technika

Immunszerológia I. Agglutináció, Precipitáció. Immunológiai és Biotechnológiai Intézet PTE-KK

Nagyhatékonyságú folyadékkromatográfia (HPLC)

Kromatográfiás módszerek

Immunológia alapjai. 10. előadás. Komplement rendszer

Kolloidkémia 1. előadás Első- és másodrendű kémiai kötések és szerepük a kolloid rendszerek kialakulásában. Szőri Milán: Kolloidkémia

Bio-nanorendszerek. Vonderviszt Ferenc. Pannon Egyetem Nanotechnológia Tanszék

Útközben A BME kutatóegyetemi pályán. Műegyetem - Kutatóegyetem. Nanofizika, nanotechnológia és anyagtudomány

Immunológiai módszerek a klinikai kutatásban

Célkitűzés/témák Fehérje-ligandum kölcsönhatások és a kötődés termodinamikai jellemzése

UV-sugárzást elnyelő vegyületek vizsgálata GC-MS módszerrel és kimutatásuk környezeti vízmintákban

4.3. Mikrofluidikai csipek analitikai alkalmazásai

Analitikai és szerkezetvizsgálati szakirány. Tájékoztató a vegyészmérnöki alapszak (B.Sc.) szakirányáról

TUDOMÁNYOS KOLLOKVIUM

A kolloidika tárgya, a kolloidok osztályozása rendszerezése. Bányai István

Modellszámításokkal kapcsolatos kutatások bemutatása

Mikrofluidika I. - Alapok

Az élő anyag szerkezeti egységei: víz, nukleinsavak, fehérjék. elrendeződés, rend, rendszer, periodikus ismétlődés

Jegyzet. Kémia, BMEVEAAAMM1 Műszaki menedzser hallgatók számára Dr Csonka Gábor, egyetemi tanár Dr Madarász János, egyetemi docens.

Gyors-kinetikai módszerek

Mangalica specifikus DNS alapú módszer kifejlesztés és validálása a MANGFOOD projekt keretében

XXXVIII. KÉMIAI ELŐADÓI NAPOK

Kolloidstabilitás. Berka Márta 2010/2011/II

Köszönetnyilvánítás. Budapest, július

Ragyogó molekulák: dióhéjban a fluoreszcenciáról és biológiai alkalmazásairól

Víz. Az élő anyag szerkezeti egységei. A vízmolekula szerkezete. Olyan mindennapi, hogy fel sem tűnik, milyen különleges

NÉHÁNY KÜLÖNLEGES FÉMES NANOSZERKEZET ELŐÁLLÍTÁSA ELEKTROKÉMIAI LEVÁLASZTÁSSAL. Neuróhr Katalin. Témavezető: Péter László. SZFKI Fémkutatási Osztály

Rezervoár kőzetek gázáteresztőképességének. fotoakusztikus detektálási módszer segítségével

Western blot technika

Kémiai alapismeretek 4. hét

MTA DOKTORI ÉRTEKEZÉS

Immunológia alapjai. 16. előadás. Komplement rendszer

Környezetvédelmi analitika II. (BMEVESAM108) Immunanalitika, Lab-on-a-chip

MIKROELEKTRONIKAI ÉRZÉKELİK I

Immunológiai módszerek a klinikai kutatásban

Peptidek LC-MS/MS karakterisztikájának javítása fluoros kémiai módosítással, proteomikai alkalmazásokhoz

A POLIELEKTROLIT/TENZID ASSZOCIÁCIÓ SZABÁLYOZÁSA NEMIONOS TENZIDEK ÉS POLIMEREK SEGÍTSÉGÉVEL

Módszer az ASEA-ban található reaktív molekulák ellenőrzésére

A 9,9 -biantril különleges fluoreszcenciája

FEHÉRJÉK A MÁGNESEKBEN. Bodor Andrea ELTE, Szerkezeti Kémiai és Biológiai Laboratórium. Alkímia Ma, Budapest,

Anyagvizsgálati módszerek Elektroanalitika. Anyagvizsgálati módszerek

Patkó Dániel. Tézisfüzet. Pannon Egyetem Molekuláris- és Nanotechnológiák Doktori Iskola

Az élő sejt fizikai Biológiája:

Kapilláris elektroforézis lehetőségei. Szabó Zsófia Országos Gyógyintézeti Központ Immundiagnosztikai Osztály

Sejt - kölcsönhatások az idegrendszerben

Anyagtudomány BMEGEMTMK02, 4 krp (2+0+1/v) Ajánlott segédanyagok. Határfelület-kohézió-adhézió

Nano-biotechnológia: érzékelés és építkezés biológiai makromolekulák segítségével

PhD DISSZERTÁCIÓ TÉZISEI

Makromolekulák. Fehérjetekeredé. rjetekeredés. Biopolimer. Polimerek

CO 2 aktiválás - a hidrogén tárolásban

Az anyagi rendszer fogalma, csoportosítása

Kolloidkémia 5. Előadás Kolloidstabilitás. Szőri Milán: Kolloidkémia

Elválasztástechnikai Kutató és Oktató Laboratórium

Szubmolekuláris kvantuminterferencia és a molekuláris vezetőképesség faktorizációja

A basidiomycota élesztőgomba, a Filobasidium capsuligenum IFM törzse egy olyan

Mikrobiális antigének

Molekuláris biológiai eljárások alkalmazása a GMO analitikában és az élelmiszerbiztonság területén

Flagellin alapú filamentáris nanoszerkezetek létrehozása

Dér András MTA SZBK Biofizikai Intézet

Zárójelentés. ICP-OES paraméterek

A SZTE KDI képzési terve

Kémiai biológia avagy mit nyújt(hat) a kémia az élettudományoknak

Lab-on-a-chip rendszerek a betegágy melletti diagnosztikában

Adszorbeálható szerves halogén vegyületek kimutatása környezeti mintákból

Membránszerkezet Nyugalmi membránpotenciál

Biodegradábilis, gyógyszerhordozó nanorészecskék

Jedlovszky Pál Eszterházy Károly Egyetem, Kémiai és Élelmiszerkémiai Tanszék Tanszék, 3300 Eger, Leányka utca 6

Molekuláris és bioszenzorok. Molekuláris és bioszenzorok

Bakteriális identifikáció 16S rrns gén szekvencia alapján

A keringı tumor markerek klinikai alkalmazásának aktuális kérdései és irányelvei

AZ ÉLET KÉMIÁJA... ÉLŐ ANYAG SZERVEZETI ALAPEGYSÉGE

Geokémia gyakorlat. 1. Geokémiai adatok értelmezése: egyszerű statisztikai módszerek. Geológus szakirány (BSc) Dr. Lukács Réka

Havancsák Károly Nagyfelbontású kétsugaras pásztázó elektronmikroszkóp az ELTÉ-n: lehetőségek, eddigi eredmények

Szilícium karbid nanokristályok előállítása és jellemzése - Munkabeszámoló -

MAGYAR TUDOMÁNYOS AKADÉMIA SZILÁRDTESTFIZIKAI ÉS OPTIKAI KUTATÓINTÉZET (MTA SZFKI)

NAGYHATÉKONYSÁGÚ OXIDÁCIÓS ELJÁRÁSOK ALKALMAZÁSA PESZTICIDTARTALMÚ VIZEK UTÓKEZELÉSÉRE

A Telomerase-specific Doxorubicin-releasing Molecular Beacon for Cancer Theranostics

Tevékenység: Olvassa el a fejezetet! Gyűjtse ki és jegyezze meg a ragasztás előnyeit és a hátrányait! VIDEO (A ragasztás ereje)

Átírás:

Szintetikus receptorokon és nanoszerkezeteken alapuló kémiai és bioszenzorok Gyurcsányi E. Róbert Szervetlen és Analitikai Kémia Tanszék Budapesti Műszaki és Gazdaságtudományi Egyetem

Érzékelés Minta Molekuláris felismerés Jelátalakítás Analitikai információ Kémiai információ

Gazdasági jelentőség 15 milliárd dollár

Star Trek (2369) TR580 Medical Tricoder The medical tricorder is used by doctors to help diagnose diseases and collect bodily information about a patient; the key difference between this and a standard tricorder is a detachable handheld highresolution scanner stored in a compartment of the tricorder when not in use.

Helyszíni mérés gyors válasz gyors döntés

Kémiai és bioszenzorok

Molekuláris felismerés Antigénantitest Antigén Antitest Hidrogén AB híd N Elektrosztatikus H H N Van der Waals Hidrofób antitest antigén

Detektálás Jelölés Szendvics eljárás Meghatározandó antigén Jelzett antigén Szilárd hordozóhoz kötött antitest Jelzett antitest

Nanoszerkezetek, Szintetikus ligandumok? Nanoszerkezetek molekuláris szintű kontroll (jelátalakítás) egymolekula kimutatása jelölés nélküli detektálás Szintetikus receptorok Stabilitás Reprodukálhatóság Fizikai /kémiai tulajdonságok tetszőleges beállítása Költségek csökkentése

Kutatási témák Nanopórusos detektálás Aptamernanoszerkezetek Felületi lenyomatú polimerek

Nanopórusos érzékelés Elméleti kutatás (sztochasztikus érzékelés, durva szemcsézettségű modellezés) Proteinek meghatározása aptamer módosított nanopórusokkal Vírusok szelektív meghatározása és számlálása

Ultragyors DNS szekvenálás (1000 $ 1h) http://golgi.harvard.edu/branton/index.htm

Szintetikus nanopórusok alkalmazása érzékelésre A célvegyület modulálja a pórus nyitást /zárást, ( Inger) A detektált marker koncentrációja sok nagyságrenddel meghaladja a célvegyületét (Jelerősítés) Jelölés nélküli módszer

Érzékelési sémák Molecular counting No use Direct affinity assays Stochastic sensing (Interevents interval) (Event lifetime) Gyurcsányi RE. Chemicallymodified nanopores for sensing. TracTrends In Analytical Chemistry 2008;27(7):627639.

Pórus átmérő E I d p Nem csak a méret számít! Fontos a felületi töltés, kémiai összetétel, pórus geometria is. ssdns: ~ 1.5 nm 260 % a pórus átmérőnek dsdns (2 nm): ~ 2.5 nm Proteinek (~1.511): 2nm több tíz nm lysozyme (15.1 kda, r H =1.9 nm, BSA (66 kda, r H =3.6 nm), IgG (150 kda, r H = 5.5 nm) Virusok (5300 nm): 10 nm 1 m

Pórus Arany nanopórus sorok Kvarc nanopipetták Nanofabrikációs módszerek

Arany nanopórusok kémiai szintézissel 3:10 1.08 µm 4.32 µm 0.1 µm

Kvarc nanopipetták 2 m Gaston Crespo PhD. thesis

Egynanopórus (FIB)

DNS meghatározás Nano Letters 2007;7(6):16091612.

Az aranynanocsövek módosítása S H S NH NH 2 HN N Base HN N Base HN N Base S H S H S NH NH 2 HN N Base HN N Base HN N Base Arany nanopórusos membrán S H S H S H Biokompatibilis tiol PNS/MH Nanopórus

Aptamerek DNS vagy RNS molekula amely egy adott célvegyület nagy affinitású, szelektív megkötésére alkalmas. A célvegyület lehet makromolekula (pl. fehérje), de kis molekulatömegű vegyület is (pl. metabolit, toxin). SELEX (systematic evolution of ligands by exponential enrichment) Tuerk és Gold, 1990. Science 249, pp. 505 510 Ellington és Szostak, 1990. Nature 346, pp. 818 822 1:10 10 kis molekulatömegű komponens esetében

Aptamerek Stabilitás liofilizált készítmény(évek), oldatban (hónapok), szérumban (percek), ugyanakkor nem természetes terminális módosítások ellenállóvá teszik az exonuklezázokkal szemben a kiürülés lassítható a molekulatömeg növelésével nincs erős immunogén hatása nem toxikus gyógyszerek célzott bevitele (pl. kemoterápiás gyógyszerek/toxinok) Macugen: Korfüggő makula degeneráció nedves formájának gyógyítására (1,4 milliárd $) Archemics Corp.

ASPV (Apple Stem Pitting Virus) Aminosav szekvenciák homológiája: 80% 24

Aptamerek 25

Önrendezödő monorétegek HS H

Aptamer biochip

ASPV fertőzött minták

Új aptamerek Troponin I Baromfipestis (vírus) (oltóanyaggyártás) Procalcitonin, CRP (bakteriális vs. vírusos fertőzés) Stb.

Q / C Q / C Electromechanical gating effects at DNAmodified nanopores 1.8x10 17 1.6x10 17 0.05 V/nm 0.05 V/nm 1.4x10 17 1.2x10 17 1.0x10 17 8.0x10 18 6.0x10 18 4.0x10 18 2.0x10 18 0.0 0 2 4 6 8 10 12 14 time / ns 1.2x10 17 1.0x10 17 0.05 V/nm 0.05 V/nm 8.0x10 18 6.0x10 18 4.0x10 18 Biosensing with conically shaped nanopores and nanotubes. hysical Chemistry Chemical Physics 2006;8(43):49764988. 10 11 mol cm 2 a b c d 2.0x10 18 0.0 0 5 10 15 20 10 12 mol cm 2 time / ns Höfler, L., Gyurcsányi, R.E., 2008. Coarse grained molecular dynamics simulation of electromechanicallygated DNA modified conical nanopores. Electroanalysis 20(3), 301307.

Kimutatási határ DNA t D 4.1 10 C D r kt B 6π r 15 p mol t 9 mol 1.7 10 r rc p if r r mol p C 1 nm if r r mol p C 1 pm t 1.7 s t 1700 s

t / s 0.1 V Elektromos fókuszálás NernstPlanckPoisson 1 0.1 U 0.1 t 0.20exp U 0.19 U 0.1 t 0.0175 U 0.01 0 5 10 15 20 25 30 35 40 45 r / nm

t / s Kimutatási határ találkozás valószínűsége 100000 10000 1000 100 10 1 0.1 0.01 10 14 10 13 10 12 10 11 10 10 10 9 C / M

Számlálás, bekötödés modellezése

Módosított arany nanopórus Permszelektivitás 3 S Ionszelektivitás Ag < 5 nm Hidrofobicitás F F F F F F F F F F F F F F F F F Jagerszki G, Takács Á, Bitter I, Gyurcsányi RE. Solidstate ion channels for potentiometric sensing. Angew. Chem. Int. Edit. 2011; (anie.2010038499).

E (mv) E (mv) Potenciometriás Ag szenzor 550 500 450 500 400 300 10 7 10 5 10 6 10 3 10 4 400 200 10 10 10 9108 350 300 0 5 10 15 20 25 time (min) 250 59.16 mv/dekád 200 150 6.8 10 9 M 11 10 9 8 7 6 5 4 3 2 1 log a Ag

Molekuláris lenyomatú polimerek (Molecularly imprinted polymermip) Makromolekulák szelektív felismerése Homogén és hozzáférhető kötőhelyek Viszonylag vékony polimerréteg lyan polimer anyag amelyen nem lép fel nem specifikus adszorpció

Felületi lenyomatú polimerek EDT (0.01 M)/NaPSS(0.025 M) 5Hz between 0.2 and 1.1 V for 5000 cycles Elektromosan vezető polimer

Felületi lenyomatú polimerek

Szelektív protein felismerés Menaker, A., Syritski, V., Reut, J., Öpik, A., Horváth, V., Gyurcsányi, R.E., Electrosynthesized Surface Imprinted Conducting Polymer Microrods for Selective Protein Recognition. Advanced Materials 2009, 21(22), 22712275.

Felületi lenyomat fotolitográfiával

Felületi lenyomatú mágneses nanorudak

PedotPSSmágneses nanokompozit

Jágerszki Gyula Szűcs Júlia Lautner Gergely

Dr. Mészáros Tamás (STE) Dr. Fürjes Péter (MFA) Dr. Vitali Syritski, Észtország Dr. Tom Lindfors, Finnország Dr. Horváth Viola, Giorgio Ceolin