Agilent MassHunter szoftvercsalád

Méret: px

Mutatás kezdődik a ... oldaltól:

Download "Agilent MassHunter szoftvercsalád"

Ödön Szőke
8 évvel ezelőtt
Látták:

1 Agilent MassHunter szoftvercsalád A szoftver szerepe a tömegspektrometriában Tölgyesi László Applikációs mérnök Kromat Kft. HPLC/MS Szeminárium Hotel Hélia január 14.

2 Tartalom I. Rész MS Szoftver helye és szerepe II. Rész MassHunter Workstation III. Rész MassHunter Qualitative Analysis IV. Rész MassHunter Quantitative Analysis

Szoftver szerepe az analitikai munkafolyamatban Lépések Teljes időszükséglet Erőforrás elosztás Mintaelőkészítés Mérés Kiértékelés - riport készítés Eredmény Megbízható Pontos Teljes Hardver

3 Szoftver szerepe az analitikai munkafolyamatban Lépések Teljes időszükséglet Erőforrás elosztás Mintaelőkészítés Mérés Kiértékelés - riport készítés Eredmény Megbízható Pontos Teljes Hardver Érzékenység, dinamikus tartomány, felbontás, adatgyűjtési sebesség Szoftver Gyors módszerfejlesztés, megfelelő sebességű és inteligenciájú adatgyűjtés Algoritmusok, applikáció specifikus, hatékony adatvizualizáció és riportolás Automatizálható munkafolyamatok, könnyű használhatóság, egyetlen szoftver minden feladatra

adatgyűjtési sebesség Szoftver Gyors módszerfejlesztés, megfelelő sebességű és inteligenciájú adatgyűjtés Algoritmusok,

(pl.: összegképlet és tisztaság ellenőrzés) Egyetlen szoftver minden készülékre és a legtöbb

4 Szoftveres kihívás MS felhasználóknak Könnyen tanulható Könnyen kezelhető Egyszerű adatbevitel Feladatok minimált ismétlése Stabilitás Teljesítmény Automatizálhatóság Munkafolyamatok támogatása (pl.: összegképlet és tisztaság ellenőrzés) Egyetlen szoftver minden készülékre és a legtöbb feladatra Mindig van hova tovább fejlődni, valamint bizonyos funkciók használata nem teljesen fájdalomentes!

korai stádiumban Egyensúly a szoftveres funkciók és a használhatóság

5 Szoftveres kihívás MS forgalmazóknak Jó kapcsolat ápolása felhasználókkal Gyors reagálás a felhasználói kérdésekre Applikációs igények felmérése még korai stádiumban Egyensúly a szoftveres funkciók és a használhatóság között Növekvő felhasználói bázis, készülék és applikáció folyamatos támogatása

6 Tartalom I. Rész MS Szoftver helye és szerepe II. Rész MassHunter Workstation, új fejlesztések III. Rész MassHunter Qualitative Analysis IV. Rész MassHunter Quantitative Analysis

7 MassHunter Workstation Egyetlen szoftver az összes MS készülék vezérlésére Agilent 6000 series QQQ, TOF és Q-TOF rendszerek vezérlése A legtöbb 1100-as és 1200-as HPLC modul vezérlése (Chip- LCMS is!) Infinity! LC/MS adatfeldolgozás: QQQ, TOF, QTOF és SQ GC/MS/MS rendszer vezérlése, valamint GC/MS és GC/MS/MS adatok feldolgozása Jövő: LC/SQ és GC/SQ vezérlése, valamint LC/Trap adatok értékelése

8 MassHunter Workstation Vezérlés Aktuális készülék paramétere (testreszabható) Rendszer diagram Valós idejű kromatogram és MS spektrum Minden információ egy felületen (At-A-Glance) LC MS módszer szerkesztő Worklist (Szekvencia)

kromatogram és MS spektrum Minden információ egy

9 MassHunter Workstation Autotune

10 Automatikus vagy manuális Tune Beépített pneumatikus rendszer a gyors tunolás érdékében 6460 QQQ 6230 TOF 6540 QTOF

11 Dinamikus MRM (Dynamic MRM) I 40 peszticid komponens elúciója 1 perces időablakban

12 Dinamikus MRM (Dynamic MRM) II Szegmentált MRM vs. Dinamikus MRM => 2x rövidebb ciklusidő >>> kisebb félértékszélességgel rendelkező csúcsok detektálhatósága >>> több komponens vagymagasabb dwell time érték

Dinamikus MRM (Dynamic MRM) III Az új applikációkkal esetenként 100 1000 komponenst kell meghatározni egyetlen MRM módszerrel. Élelmiszer és környezeti minták (pl.

13 Dinamikus MRM (Dynamic MRM) III Az új applikációkkal esetenként komponenst kell meghatározni egyetlen MRM módszerrel. Élelmiszer és környezeti minták (pl. peszticidek) Proteomika Dinamikus MRM nékül Időszegmensek manuális definiálása a dwell time maximálásának érdekében Fáradságos módszer szerkesztés retenciós idő csúszásakor Dinamikus MRM használatával Az átlapoló MRM ablakok automatikus elrendezése Még kevesebb MRM átmenet adott idő alatt > nagyobb dwell time > nagyobb érzékenység Retenciós idők csúszása nem befolyásolja a mérést

peszticidek) Proteomika Dinamikus MRM nékül Időszegmensek manuális definiálása a dwell time maximálásának érdekében Fáradságos módszer

14 Dinamikus MRM (Dynamic MRM) IV MRM átmenetek Idő >>>

MassHunter Optimizer Automatizált MRM módszer készítés Vegyület specifikus optimálás Prekurzor és fragmens ionok kiválasztása és optimálása Több módszer lehetősége (pozitív/negatív) Az eredmények

15 MassHunter Optimizer Automatizált MRM módszer készítés Vegyület specifikus optimálás Prekurzor és fragmens ionok kiválasztása és optimálása Több módszer lehetősége (pozitív/negatív) Az eredmények adatbázisban való tárolása Lehetőségek: Infúziós, FIA, oszlopra Optimizer nélkül 500 komponens, komponensenként 2 db átmenettel >>> hetes munka Optimizer használatával Teljesen automatizálható >>> napok alatt

adatbázisban való tárolása Lehetőségek: Infúziós, FIA, oszlopra Optimizer nélkül 500 komponens,

16 MassHunter Workstation B (2010 eleje) Új funkciók DMRM nézegető (Viewer) Szegmentált MRM > DMRM, RT idők frissítése Osztott DMRM módszer

17 Tartalom I. Rész MS Szoftver helye és szerepe II. Rész MassHunter Workstation, új fejlesztések III. Rész MassHunter Qualitative Analysis IV. Rész MassHunter Quantitative Analysis

18 MassHunter Qualitative Analysis DataNavigator (kromatogram, spektrum, vegyület..) Teljes testreszabhatóság Kromatogramok (TIC, BPC, EIC, UV...) Tömegspektrum (MS, MS/MS) Módszerparaméterek Integrálási eredmények

19 Egyetlen szoftver minden rendszerhez GC, LC, CE vagy egyéb technika Egységnyi vagy nagyobb tömegpontosság Egyéb beépülő programok MS fragmentációs szint (MS<>MS/MS) Nem MS detektorok Tapasztalt felhasználóknak opció

Egyéb beépülő programok MS fragmentációs szint

20 Egyetlen szoftver minden rendszerhez A korábbi rendszerek (ChemStatiom, MSD ChemStation) rendszerek integráló algoritmusainak a beépítése Új MS/MS MS/MS (GC) Universal General ChemStation

21 Új help rendszer Struktúrált felépítés Munkafolyamatok Automatizálás Felhasználói grafikus felület Alapvető szoftveres műveletek Működési elv

22 Help: pl.: MFG algoritmus működése

sablon XML scheme Nyomtatás Excel létrehozása Eredmények Eredmények

23 MS Excel alapú riportgenerálás I MassHunter Értékelő MS Excel 2007 Prof MassHunter Excel modul Eredmény generáló motor XML scheme Riport sablon XML scheme Nyomtatás Excel létrehozása Eredmények Eredmények (*.xml) Grafikus elemek (*.emf, *.bmp) Excel dokumentum (*.xls vagy *.xlsx)

24 MS Excel alapú riportgenerálás II VBA makró alapú Táblák és grafikonok hozzáadása XML adatokból húzd és ejtsd módszerrel Excel alapú formázás Nyomtatási előnézet

25 Adat > Információ Adatgyűjtés LC/MS + GC/MS Vegyületek keresése Vegyületek összehasonlítása Vegyületek azonosítása TOF MS Q-TOF MS/MS QQQ MS/MS SQ MS Trap MS n GC/MS GC/MS/MS Vegyület keresés MFE Vegyület keresés LMFE (fehérjék) Vegyület keresés Auto MS/MS Vegyület keresés Target MS/MS Vegyület keresés Összegképlet Vegyületek minták között Metabolite ID Mass Profiler Vegyületek mintacsoportok között Mass Profiler PRO Mass Profiler Vegyületek >2 mintacsoport között Mass Profiler PRO Fehérje adatbázis keresés Spectrum Mill Mascot Egyéb (mzxml, mzdata) Pontos tömeg adatbázis keresés Endogén metabolitok (METLIN) Élelmiszer, igazságügyi, környezeti adatbázisok Spektrum könyvtárak LC/MS/MS NIST GC/EI-MS Fiehn GC/EI-MS Vegyület keresés AMDIS (GC/MS) Összegképlet generálás (pontostömeg MS és MS/MS) MS/MS szerkezet-spektrum korreláció (hamarosan) Teljesen mértékben automatizálható!

26 Workflow configuration 1. Ionkromatogram extrakciója 2. Kromatogram integrálása 3. Csúcs alatti MS spektrum extrakciója 4. Spektrum(ok) azonosítása (opcionális) 5. Összegképlet generálása az MS spektrumok felhasználásával 6. Riport elkészítése: PDF, nyomtatás

Pontos tömeg adatbázisok (TOF/Q-TOF) Accurate Mass Personal Compound Databases (AM-PCD) Monoizotópos tömeg Izotóp eloszlás Izotóp távolság TOF alapú szűrővizsgálatokra különböző könyvtárak

27 Pontos tömeg adatbázisok (TOF/Q-TOF) Accurate Mass Personal Compound Databases (AM-PCD) Monoizotópos tömeg Izotóp eloszlás Izotóp távolság TOF alapú szűrővizsgálatokra különböző könyvtárak (retenciós idő is definiálható!) METLIN endogén metabolit adatbázis (23000 db) Peszticid adatbázis (1600 db) Igazságügyi és toxikológiai adatbázis (7000 db) Egyedi, felhasználó által is létrehozható

28 Tömegspektrum alapú könyvtárak Fragmens spektrumok! GC/MS könyvtárak (elektron ionizáció) LC/MS/MS és GC/MS/MS könyvtárak ütközéses fragmentáció alapján Valós MS/MS (Q-TOF, QQQ, Trap és GC-QQQ), Eltérő ütközési energiák (CE) LC/MS forrásbeli fragmentáció: SQ, TOF, Q-TOF MS/MS könyvtárak Endogén metabolitok Igazságügy/Toxikológia (fejlesztés alatt) NIST LC/MS/MS és GC/MS könyvtárak

29 Tartalom I. Rész MS Szoftver helye és szerepe II. Rész MassHunter Workstation, új fejlesztések III. Rész MassHunter Qualitative Analysis IV. Rész MassHunter Quantitative Analysis

30 MassHunter Qualitative Analysis MRM infomráció Mintatábla Kromatogram Kalibráció

31 MassHunter Qualitative Analysis - előnyök Dinamikusan kapcsolt eredmények Minta ill. komponens alapú eredmény megjelenítés Több mint 20 paraméter kiugró értékének vizsgálata (Outlier criteria) Dinamikus MRM támogatása Paramétermentes MRM integrátor a gyors és hatékony értékeléshez SD Baseline Offset Paraméterek meghatárzása Elvetett csúcs Elfogadott csúcsok

32 Mennyiségi és minőségi analízis THC ISTD THC-D 3 THC konfirmációs ion - normált THC konfirmációs ion nem normált

33 Kalibráció

34 MS Excel alapú riportgenerálás VBA makró alapú Táblák és grafikonok hozzáadása XML adatokból húzd és ejtsd módszerrel Excel alapú formázás Nyomtatási előnézet Feltételed formázás

Összefoglalás Készülékvezérlés Mérés nyomonkövetése Módszer szerkesztés Optimálás Autotune Minőségi analízis Mérések megtekintése UV, MS kromatogramok UV,

35 Összefoglalás Készülékvezérlés Mérés nyomonkövetése Módszer szerkesztés Optimálás Autotune Minőségi analízis Mérések megtekintése UV, MS kromatogramok UV, MS spektrumok Komponensek keresése Excel alapú riportolás Mennyiségi analízis Szűrhető eredmények Kalibráció Kiguró érték vizsgálat Excel alapú riportolás

36 Köszönöm a megtisztelő figyelmet!

Hasonló dokumentumok

Sciex X500R készülék bemutatása a SWATH alkalmazásai tükrében. Szabó Pál, MTA TTK

Sciex X500R készülék bemutatása a SWATH alkalmazásai tükrében Szabó Pál, MTA TTK Hagyományos QTOF rendszer Aggályok: Termetes Bonyolultnak tűnő Nem rutin feladatokra való Következmény: Nem merjük megvenni