A genetikai betegségtől a fehérje szerkezetig: Az ABCC6 transzporter betegség okozó misszensz mutánsainak vizsgálata
|
|
- Natália Rácz
- 7 évvel ezelőtt
- Látták:
Átírás
1 A genetikai betegségtől a fehérje szerkezetig: Az ABCC6 transzporter betegség okozó misszensz mutánsainak vizsgálata Doktori tézisek Fülöp Krisztina Eötvös Loránd Tudományegyetem Természettudományi Kar Biológia Doktori Iskola Klasszikus és Molekuláris Genetika Program Témavezető: Doktori Iskola vezetője: Doktori Program vezetője: Dr. Váradi András Dr. Erdei Anna Dr. Vellai Tibor Magyar Tudományos Akadémia, Természettudományi Kutatóközpont Enzimológiai Intézet 2014
2 Bevezetés Az ABC (ATP Binding Cassette) trranszporterek a nagy transzmembrán fehérjék családjába tartoznak. ATP hasításából származó energia terhére szubsztrátok transzportját végzik a plasmamembránon vagy más intracelluláris membránokon keresztül. Minimális funkcionális egységüket két ABC és két transzmembrán domén alkotja. Az ABC domének un. head to tail elrendeződésben találhatók; két kompozit katalitikus helyet alakítanak ki, amelyek az ATP kötés hatására nyerik el a zárt konformációt. Egy-egy katalitikus zsebet egy azonos ABC domén Walker-A és Walker-B motívuma valamint az ellenoldali ABC domén Signature motívuma képezi. A transzmembrán domének egy szubsztrát transzlokációs csatornát alakítanak ki, amely rigid intracelluláris hurkokon keresztül kapcsolódik az ABC doménekhez. Ezen intracelluláris régiók közvetítik az ATP hidrolízise során bekövetkező konformációs átrendeződéseket a transzlokációs csatorna felé. Az ABCC6 fehérje génjét érintő mutációkat két kötőszöveti kalcifikációval járó betegség hátterében azonosították. A pseudoxanthoma elasticum (PXE) recesszív betegség az elastikus rostok progresszív kalcifikációjával jár; tünetei elsősorban a bőrben, a közepes méretű artériák falában és a retina Bruch membránjában jelentkeznek. A betegeket érintő legsúlyosabb következményt a kardiovaszkuláris komplikációk jelentik, illetve a látáskárosodáshoz vagy teljes látáskieséshez vezető makula degeneráció. A PXE-t mind populáció szinten, mind az érintett csaláldokon belül, kifejezetten nagy fenotípusos variabilitás jellemzi. A generalized arterial calcification of infancy (GACI) betegség egy extrém ritka, nagyon súlyos érelmeszesedési tünetekkel járó betegség, amely perinatális vagy néhány hónapos korban az arteriák stenozisához, illetve miokardiális infarktushoz vezet. Az elmúlt 14 évben, az ABCC6 gén azonosítása óta, több, mint 400 szekvencia variációt írtak le. A mutációk nagy száma ellenére mindezidáig nem sikerült genotípus-fenotípus összefüggéseket feltárni. Az ABCC6 fehérje fiziológiás szerepéről, illetve a betegségek hátterében meghúzódó patológiás folyamatokról szintén nagyon keveset tudunk. Az ABCC6 fehérje elsősorban a hepatociták bazolaterális membránjában található, míg a betegség tüntei által érnitett szövetekből szinte alig kimutatható. Fiziológiás elhelyezkedésének megfelelően, illetve állatmodeleken végzett transzplantációs kísérletek alapján valószínűsíthető, hogy az 1
3 ABCC6 egy máig ismeretlen metabolit transzportját végzi a májból a vér felé, amely a keringési rendszeren keresztül a perifériás szövetek kalcifikációs folyamatainak megakadályozásában tölt be fontos szerepet. Ennek megfelelően a PXE betegséget ma metabolikus betegségként azonosítják. Egy másik egygénes Mendeli betegség, a PXE-like szindróma által érintett emberek kalcifikációs bőrtünetei nagyon hasonlóak a PXE-s betegek tüneteihez. A betegség hátterében álló GGCX (gamma-glutamyl carboxylase) gén egy a Ca-kötő fehérjék, például véralvadási faktorok illetve anti-kalcifikációs folyamatokban résztvevő fehérjék, másodlagos módosításáért felelős gamma-karboxilázt kódol. A GGCX fehérje kofaktorai K-vitamin vegyületek. PXE-like szindrómás betegekeknél a perifériás kalcikációs tünetek mellett a májban szintetizálódó véralvadási faktorok zavara is jelentkezik. Ennek alapján felmerült, hogy az ABCC6-nak szerepe lehet K-vitamin vegyületek májból való transzportjában. A májban elégséges a K-vitamin szint a koagulációs faktorok szintéziséhez, ennek megfelelően a PXE-s betegenél nem jelentkezik véralvadási zavar, a hiányos ABCC6 funkció következtében azonban a perifériás szövetekben az antikalcifikációs fehérjék aktiválása zavart szenved, aminek következtében meszesedési tünetek jelentkeznek. Dolgozatom első felében az ABCC6 K-vitamin vegyületek transzportjában betöltött lehetséges szerepére irányuló kísérleteimet részletezem, míg második felében az ABCC6 gén illetve ABCC6 fehérje betegséget okozó mutációval kapcsolatos munkáimat foglalom össze. Célkitűzések 1. Radioaktív és jelöletlen K3-vitamin glutation konjugátum (VK3GS) szintézise és tisztítása. ABCC1, ABCC2, ABCC3, ABCC6 és ABCG2 hepatikus transzporterek aktivitásának vizsgálata VK3GS szubsztrát kandidáns jelenlétében in vitro vezikuláris transzport kísérletekben. Az ABCC6 fehérje VK3GS K-vitmain konjugátum transzportjában betöltött szerepének tisztázása. 2. Az ABCC6 génben leírt több száz betegség okozó mutáció és szekvencia variáns jobb áttekinthetőségéhez egy, a rendelkezésre álló adatokat feldolgozó ABCC6 mutációs adatbázis létrehozása. 2
4 3. A gén kódoló régióját érintő nagyszámú betegséget okozó illetve neutrális mutációk, mint genetikai információ, fehérje térszerkezetben való elhelyezése, lehetőséget nyújthat szerkezet-funkcó összefüggések tanulmányozásához. Rokon fehérjék kristályszerkezeti koordinátái alpján célul tűztük ki ABCC6 homológiai modelek építését. 4. A betegséget okozó ABCC6 mutációk fehérjeszerkezetet, illetve funkciót érintő hatásainak in vitro vizsgálatához kiválasztottam négy gyakori betegséget okozó missens mutánst, amelyek a fehérje funkcionális illetve kiemelt szerkezeti struktúráit érintik. Célul tűztem ki ezek in vitro transzport aktivitásának, valamit in vitro MDCKII sejtvonalakban való lokalizációjának viszgálatát. Egy nemzetközi kollaborációs kísérletsorozatban elsősorban olyan betegség okozó mutánsokat terveztük azonosítani amelyek transzport funkciójukat megőrizték. PXE illetve GACI betegségekben a fehérje funkció kiesését ezen esetekben feltehetőleg stabilitási és az ennek következtében kialakuló lokalizációs defektusok okozhatják. Ezek a mutánsok kémiai chaperonok általi korrekción alapuló allélspecifikus terápia kiindulópontjául szolgálhatnak. Módszerek Adatfeldolgozás az ABCC6 mutációs adatbázishoz Az ABCC6 génben leírt szekvenciaváltozatokat a PubMed adatbázisban megtalálható közleményekből gyűjtöttük ki. Az online adatbázis a PXE International szervezettel való nemzetközi együttműködés során jött létre, LOVD formátumban az NCBI szerverén üzemel. Modell építés: Az ABCC6, Sav1866, HlyB-ABC, CFTR-ABC és P-gp fehérjék szekvenciáit ClustalW2 programmal, alapbeállítások mellett illesztettük. A homológiai modelleket a Sav1866 bakteriális ABC transzporter (PDB: 2ONJ 3.4Å), HlyB ABC-ABC dimmer (PDB: 1XEF 2.5Å) N-ABC CFTR homodimer (PDB: 2PZE 1.7Å) és az egér P-gp (PDB: 3G5U 3.8Å) koordinátáit felhasználva építettük. Kétszáz szerkezetet modelleztünk Modeller 9.3 program segítségével, amelyek közül azt választottuk ki, amihez a legkisebb objective function érték tatozott. Az ábrákat PyMOL programmal készítettük, a statisztikai adatokat Fisher exact teszttel értékeltük ki. 3
5 Az ABCC6 variánsok DNS konstrukciói Az S1121W, T1301I, Q1347H és R1459C mutánsokat overlap extension mutagenezis PCR módszerével készítettem pacuw21l bakulovírus expressziós vektorban, majd a mutagenezis kazettákat SpSldS retrovírusvektorba, valamint plive vektroba szubklónoztuk. Sejtkultúrák fenntartása Az Sf9 sejteket 27 C-on TNM-FH médiumban (FBS, penicillin, sztreptomicin); a Phoenix-Ampho és MDCKII sejteket CO 2 termosztátban 37 C-on, DMEM médiumban (FBS, penicillin, sztreptomicin) tartottuk fenn. S1121W, T1301I, Q1347H és R1459C mutánsok expressziója Sf9 rovarsejtekben Sf9 (Spodoptera frugiperda) rovarsejteket a gyártó (BaculoGold kit (BD Biosciences Pharmingen) által meghatározott körülmények között kotranszfektáltuk linearizált bakulovíussal és pacuw21l vector konstrukciókkal. A vírusfelülúszókat magas expressziós szint biztosításához végponthígításos módszerrel klónoztuk. Az amplifikált vírusfelülúszóval membránpreparálás céljára 3x10 7 sejtet fertőztünk, amelyeket 72 óra elteltével dolgoztunk fel. Membránpreparálás és a membránok fehérje tartalmának meghatározása Mosási és homogenizálási lépéseket követően a sejtek membrán frakcióját differenciálultracentrifugálás módszerével izoláltuk, g-n. A membrán frakció koncentrációját szuszpendálással 5-10 mg/ml koncentrációra állítottuk be, majd homogenizáltuk. A membránpreparátumokat felhasznállásig -70 C-on tároltuk. A vezikulák össz-fehérje tartalmát módosított Lowry módszerrel határoztuk meg. A uptake-kompetens insideout vezikulák relatív mennyiségét a különböző preparátumokban az endogén Sf9 Catranszporterek aktivitásának alapján hasonlítottuk össze. Leammli SDS-poliakilamide gél-electroforézis és immunoblot A membránpreparátumokat és sejtlizátumokat diszaggregáló pufferben vittük fel 6-7.5%-os poliakrilamid gélre. Az elektroforézist Protean gél-elektroforézis készülékkel (Biorad) végeztük. A fehérjéket polivinilidén-difluorid (PVDF) membránra blottoltuk sztenderd elektroblot technikával Mini-Trans-Blot, illetve semidry blot készülékekkel (Biorad), a gyártó által előírt körülményeknek megfelelően. A vad típusú és mutáns ABCC6 fehérjéket HB6 poliklonális, illetve M6II-7 monoklonális, valamint HRPkonjugált másodlagos ellenanyagokkal hívtuk elő. 4
6 A [ 3 H]K3GS konjugátum szintézise és tisztítása 280µM [ 3 H]GSH-t 0.1M etanolban oldott K3 vitaminhoz adtunk hozzá, majd a reakcióelegyet egy éjszakán át 4 o C-on inkubátuk szilanizált üvegcsövekben. [ 3 H]K3GS kristályokat vákum alatt szárítottuk, majd 5% trifluor acetátban oldottuk fel és HPLC-vel tisztítottuk. A jelöletlen VK3GS-t hasonlóképpen szintetizáltuk, majd kristályosítással és kloroformos mosással tisztítottuk. Mindkét esetben a vegyületek kémiai tisztaságát HPLC- MS módszerrel ellenőritük. A VK3GS oldatokat -20 o C-on, sötétfalú üvegekben felhasználásig, maximum 30 napig, tároltuk. [ 3 H]LTC4, [ 3 H]E 2-17G, [ 3 H]MTX és [ 3 H]K3GS transport mérések A vezikuláris transzport méréseket rapid filtrációs technika segítségével végeztük. Az ATP-függő transzport értékeket a 4mM MgATP jelenlétében illetve hiányában, vagy AMP jelenlétében mért értékek különbségeiből számítottuk. A radioaktivitást scintillációs detektor (Wallac 1409 DSA) segítségével határoztuk meg. A transzport kinetikai paramétereket Kaleidagraph (Synergy) program seítségével értékeltük. Az ABCC6 mutánsok retrovirális expressziója MDCKII sejtekben Phoenix-Ampho pakolósejteket SpSldS rekombináns retrovírus konstrukciókkal valamint M57 és GALV helper vektorokkal ko-transzfektáltuk. A transzfekciót kalciumfoszfát precipitációs módszerrel a gyártó (GIBCO) előírásait követve végeztük. A vírusfelülúszóval 6mg/ml polibrén jelenlétében MDCKII sejteket transzdukáltunk. A sejteket centrifugálást követően (1000g, 90min) 37 o C-os CO 2 termosztátban tartottuk fenn. MDCKII sejtek immunfestése és konfokális mikrosztkópia Nem polarizált sejtkultúra nyeréséhez a sejteket 8-lyukú kamrákon tartottuk fenn. Polarizált sejtkultúrához az MDCKII sejteket Transwelleken növesztettük, majd 8-10 nappal a konfluencia elérését követően immunfestettük. Mindkét esetben, immunfestés előtt a sejteket DPBS pufferben mostuk, fixáltuk 4% paraformaldehiddel és 5 percig előkezeltük jéghideg metanollal. Blokkolást követően a mintákat blokkoló oldatban oldott elsődleges, majd másodlagos ellenanyagokkal inkubáltuk egy-egy órán át. A sejtmagokat DAPI-val festettük meg, majd a mintákat konfokális mikroszkóp (Olympus IX-81/FV500 lézer-szkenning mikroszkóp) segítségével vizsgáltuk. A felvételeket Olympus FluoView 4.7 program segítségével készítettük. 5
7 Eredmények 1. VitK3 illetve GSH/[ 3 H]GSH felhasználásával szintetizáltam és tisztítottam a transzport kísérletekhez szükséges, kereskedelmi forgalomban nem kapható VK3GS illetve [ 3 H]VK3GS konjugátumokat. 2. Vezikuláris transzport kísérletekben vizsgáltam az ABCC6, ABCC1, ABCC2, ABCC3 és ABCG2 transzporterek ATP-függő VK3GS transzport aktivitását. Az ABCC6 fehérje esetén nem tudtam szignifikáns ATP-függő transzport aktivitást kimutatni. Megállapítottam, hogy az általunk elsősorban vizsgált ABCC6 transzporter feltehetően nem vesz részt a VK3GS K-vitamin konjugátum májból való exportjában [Fülöp et al., 2011]. 3. Kapcsolódó kísérletek alapján megállapítottam, hogy az ABCC1 transzporter nagy kapacitással, 1.45µM K M, és 240 pmol/mg membrán fehérje/perc V max paraméterekkel jellemezhetően transzportálja a VK3GS vegyületet [Fülöp et al., 2011]. A transzport specifikusnak bizonyult, az ABCC1 fehérje fiziológiás szubsztrátja, az LTC4 (500nM) 35%-ra, valamint az MK571 (10µM) MRP-inhibítor gátolta. A G771D variáns, az ABCC1 fehérje inaktív mutánsa esetén nem tudtam szignifikáns, ATP-függő transzport aktivitást kimutatni. 4. Ugyanezen kísérleti körülmények között az ABCC2 transzporter a VK3GS konjugátum egy lehetséges, kis kapacitású transzporterének bizonyult. 5. Az ABCC3, illetve ABCG2 transzporterek esetén VK3GS szubsztrát jelenlétében nem tapasztaltam szignifikáns ATP-fügő aktivitást. 6. Részt vettem az ABCC6 mutációs adatbázis létrehozásásban, amely tartalmazza valamennyi GACI, illetve PXE betegségekben leírt ABCC6 mutációt, valamint az ABCC6 génben napjainkig azonosított szekvenciavariációkat. Az adatbázis tartalmazza az egy-egy variánsra vonatkozó legszükségesebb információkat, úgymint: a DNS, illetve fehérje szintű szekvencia eltérést; a variáns státuszát a betegség szempontjából: polimorfizmus, vagy mutáció; a szekvenciaeltérés típusát; az érintett genomi pozíciót; az érintett régió nevét a génben illetve a fehérjében; valamint, hogy a szekvenciamegváltozás egy olyan mutáció-e, ami egy 5 CpG dinukleotid mutációjaként keletkezhetett. Az adatbázis tartalmazza valamennyi publikációt, amelyben az adott varáns szerepel. Amennyiben allélfrekvencia adatok is rendelkezésre álltak azokat is feltüntettük. Adataink nagyban hozzájárultak az 6
8 online ABCC6 mutációs adatbázis létrejöttéhez, amelyet a PXE International szervezettel együttműködésben hoztunk létre; az NCBI szerverén LOVD formátumban érhető el ( 7. Elemeztem a 4512 nukleotid hosszúságú cdns CG tartalmát és az 5 CpG dinukleotidok eloszlását a kódoló régióban. Megállapítottam továbbá, hogy a single nucleotide szubsztitúciók eloszlása nem random, a CpG nukleotidokat gyakrabban érinti mutáció. A kódoló régióban leírt single nucleotide szubsztitóciók 29%-a esik 5 CpG dinukleotid (312 nukleotid, CpG) szekvenciarészre, amelyek a kódoló nukleotidok mindössze 6.9%-át alkotják. 8. Megmutattam, hogy az 5 CpG dinukleotidokat érintő mutációk jelentős mértékben hozzájárulnak az ABCC6 génben található betegséget okozó mutációk nagy számához (220), azok 20.5%-át adják (2013-ig publikált adatok alapján). 9. Részt vettem az ABCC6 fehérje homológiai modelljeinek elkészítésében. A Sav 1866 (PDB ID: 2ONJ, 3.4Å) bakteriális ABC fehérje nukleotid szubsztrát-kötött és az egér Abcb1 (PDB ID: 3G5U) apo állapotú kristályok térszerkezeti koordinátái alapján egy zárt és egy nyitot konfigurációjú modellt építettünk. 10. Elemeztük a betegség okozó misszensz ABCC6 mutációk eloszlását a model által jósolt funkcionális felszíneken, és azok szignifikáns dúsulását figyeltük meg az ABC-ABC, valamint az ABC-ICL kontakt felszíneken [Fülöp et al., 2009]. Megállapítottam továbbá, hogy nem a DNS-szerkezetre visszavezethető mutációs hot spotok okozzák a mutációk érintett felszíneken való dúsulását. 11. ABC fehérjékhez kapcsolt genetikai betegségeket okozó misszensz mutációkról online elérhető adatok alapján vitatjuk a Kelly és munkatársai által 2011-ben publikált a molekulamodellek prediktivitásáról szóló eredményeit, azaz hogy egyes aminosavcserét okozó megváltozások patogenitását illetően mennyiben bízhatunk meg a térszerkezeti modelek szerkezetet-, illetve funkcióváltozást jósló erejét illetően. 12. In vitro módszerekkel vizsgáltam négy gyakori PXE-t okozó misszensz ABCC6 mutáció: S1121W, T1301I, Q1347H és R1459C hatását a fehérje funkciójára, illetve lokalizációjára. Valamennyi variáns transzport aktivitása kísérleti rendszerünkben a vad típusú fehérjével összevethető volt, azonban in vitro emlős (MDCKII) 7
9 expressziós kísérleteimben a vad típustól eltérő lokalizációt mutattak [Pomozi, Brampton, Fülöp, Chen, Apana, Li, Uitto, LeSaux and Váradi, 2014]. Diszkusszió Az ABCC6 fehérje, egy ismeretlen vegyületet transzportál a májból a keringésbe. A PXE iletve GACI betegségek tünetei alapján azt gondoljuk, hogy ez a metabolit közvetlenül, vagy közvetve periferiás anti-kalcifikációs folyamatokban vesz részt. In vitro kísérleteim alpján megállapítottam, hogy az ABCC6 transzporter feltehetőleg nem vesz részt a K3GS, GSH-konjugált K-vitamin származék, májból való transzportjában, azaz nem ez a vegyület áll az ABCC6 függő kalcifikációs folyamatok hátterében. Mások in vitro és in vivo eredményei is témogatták megállapításomat. A PXE hátterében álló ABCC6 gén pozícionális klónozása óta több, mint 400 a gént érintő szekvenciavariációt írtak le. Ilyen nagy számú variáns esetén in vitro illetve in vivo módszerekkel nem tisztázható valamennyi megváltozás fehérje-szerkezetre, illetve funkcióra gyakorolt hatása. A szekvencia variánsokat és a rendelkezésre álló in vitro illetve in vivo adatokat, betegség asszociált gének esetén a mutációkat hordozó betegek klinikai adatait rendszerező adatbázisok kiemelkedő fontosságúak. Kutatócsoportunkban elkészítettünk egy ABCC6 mutációs adatbázist, amely nagymértékben hozzájárult az online elérhető, a betegek klinikai adatait is tartalmazó LOVD ABCC6 adatbázis létrejöttéhez ( Az általunk készített ABCC6 homológiai model [Fülöp et al, 2009], amely az online LOVD ABCC6 adatbázis felületén is elérhető, lehetőséget nyújt az egyes mutációk térszerkezetben való elhelyezésére, kiindulásul szolgáhat misszensz mutációk a fehérje szerkezet/funkció változásaira kifejtett hatásának tanulmányozásában. Az ABCC6 fehérje betegség okozó missszensz mutációinak fehérjeszerkezetben való nem homogén eloszlására irányuló megfigyelésünk, miszerint a fehérje struktúrális, illetve funkcionális felszínek a teljes fehérjeszerkezethez képest érzékenyebbek az aminosavcserét okozó mutációkra, az első genetikai bizonyítéka ezen felszínek kiemelt fontosságának. In vitro transzport aktivitási kísérletek, illetve in vitro és in vivo modelek amelyekben a fehérjék lokalizációját/érését/stabilitását vizsgálhatjuk a leggyakrabban használatos 8
10 rendszerek az egyes mutánsok fehérje aktivitásra, illetve szerkezetre gyakorolt hatásának vizsgálatában. Egy nemzetközi együttműködés keretein belül in vitro transzport aktivitási kísérletekben és lokalizációs vizsgálatokban jellemeztem négy gyakori, PXE-t okozó ABCC6 mutánst. Vizsgálataink célja olyan transzport aktív, betegség okozó mutációk azonosítása volt, ahol a betegségeket feltehetőleg a fehérje mutáció következtében sérült stabilitása, illetve az ennek következtében kialakuló lokalizációs defektusok okozzák. Célunk kémia chaperon molekulák alkalmazásával szerkezeti korrekción alapuló allélspecifikus terápia kifejlesztése PXE és GACI betegségekben. Publikációim: 1. Fülöp K, Barna L, Symmons O, Závodszky P, Váradi A.: Clustering of diseasecausing mutations on the domain-domain interfaces of ABCC6. Biochem Biophys Res Commun Feb 13; 379(3): Váradi A, Szabó Z, Pomozi V, de Boussac H, Fülöp K, Arányi T.: ABCC6 as a target in pseudoxanthoma elasticum. Curr Drug Targets May; 12(5): Review. 3. Arányi T, Fülöp K, Symmons O, Pomozi V, Váradi A.: Predictable difficulty or difficulty to predict. Protein Sci Jan; 20(1): Le Saux O, Fülöp K, Yamaguchi Y, Iliás A, Szabó Z, Brampton CN, Pomozi V, Huszár K, Arányi T, Váradi A.: Expression and in vivo rescue of human ABCC6 disease-causing mutants in mouse liver. PLoS One. 2011; 6(9): e Fülöp K, Jiang Q, Wetering KV, Pomozi V, Szabó PT, Arányi T, Sarkadi B, Borst P, Uitto J, Váradi A.: ABCC6 does not transport vitamin K3-glutathione conjugate from the liver: relevance to pathomechanisms of pseudoxanthoma elasticum. Biochem Biophys Res Commun Nov 25; 415(3): Arányi T, Bacquet C, de Boussac H, Ratajewski M, Pomozi V, Fülöp K, Brampton CN, Pulaski L, Le Saux O, Váradi A.: Transcriptional regulation of the ABCC6 gene and the background of impaired function of missense disease-causing mutations. Front Genet Mar 11; 4: Pomozi V, Brampton C, Fülöp K, Chen LH, Apana A, Li Q, Uitto J, Le Saux O, Váradi A.: Analysis of pseudoxanthoma elasticum-causing missense mutants of ABCC6 in vivo; pharmacological correction of the mislocalized proteins. J Invest Dermatol Apr; 134(4):
11 Köszönetnyilvánítás Mindenekelőtt szeretnék köszönetet mondani témavezetőmnek, Váradi Andrásnak, aki PhD tanulmányaim során mindvégig támogatott, a mindennapokban felmerülő nehézségeket szakmai tapasztalatával és humorával könnyen feloldotta. Köszönettel tartozom Sarkadi Balázsnak, aki kritikai észrevételeivel, tanácsaival nagyban hozzájárult szakmai fejlődésemhez. Szeretném megköszönni Iliás Attilának és Sinkó Emesének, a rengeteg tapasztalatot és tudást amit kezdeti éveimben megosztottak velem. Köszönöm a kiegyensúlyozott, nyugodt légkört, amiben együtt dolgoztunk. Köszönettel tartozom Klein Izabellának, aki egyetemi éveim alatt segítette a tudományos élettel való első ismerkedéseimet. Szeretném megköszönni a rengetek szakmai tanácsot és technikai segítséget amit kísérleteink során Liliom Károlytól, Homolya Lászlótól, Bakos Évától és Arányi Tamástól kaptam. Köszönöm a K-vitamin konjugátum preparálása során kapott szakmai és technikai segítséget Szabó Pálnak. Szeretném megköszönni Barna Lászlónak a kitartó támogatást és motiváló légkört, amiben együtt dolgoztunk. Hálás vagyok Vermes Györgyi és Kis Judit asszisztenseknek, akik kiváló szaktudásukkal kísérleteinket az évek során támogatták. Szeretnék köszönetet mondani Szeri Flórának, Pomozi Violának és Köblös Gabriellának, valamit a Váradi- és Sarkadi-csoport valamennyi tagjának a rengeteg inspiráló szakmai és baráti beszélgetésért, a laborban töltött mindennapok jó hangulatáért. Végül hálával tartozom szüleimnek, hogy mind egyetemi éveim alatt, mind későbbi tanulmányaim során szeretettel és lelkesedéssel támogattak. Köszönöm családom valamennyi tagjának a rengeteg türelmet és a számomra bitosított szabadidőt, amivel lehetővé tették, hogy tudományos munkámat a gyermekvállalás mellett is folytathassam. Köszönöm azt a szeretetteli kiegyensúlyozott légkört, amivel férjem és gyermekeim támogatnak nap, mint nap. 10
ABCC6: EGY ÚJONNAN AZONOSÍTOTT FEHÉRJE FAKTOR A LÁGY SZÖVETI KALCIFIKÁCIÓBAN
ABCC6: EGY ÚJONNAN AZONOSÍTOTT FEHÉRJE FAKTOR A LÁGY SZÖVETI KALCIFIKÁCIÓBAN Doktori tézisek Pomozi Viola Eötvös Lóránd Tudományegyetem Biológia Doktori Iskola (a doktori iskola vezetője: Dr. Erdei Anna)
Gyógyszerrezisztenciát okozó fehérjék vizsgálata
Gyógyszerrezisztenciát okozó fehérjék vizsgálata AKI kíváncsi kémikus kutatótábor 2017.06.25-07.01. Témavezetők : Telbisz Ágnes, Horváth Tamás Kutatók : Dobolyi Zsófia, Bereczki Kristóf, Horváth Ákos Gyógyszerrezisztencia
Két kevéssé ismert humán ABCG fehérje expressziója és funkcionális vizsgálata: ABCG1 és ABCG4 jellemzése
Két kevéssé ismert humán ABCG fehérje expressziója és funkcionális vizsgálata: ABCG1 és ABCG4 jellemzése Doktori tézisek Dr. Cserepes Judit Semmelweis Egyetem Molekuláris Orvostudományok Doktori Iskola
Tézis tárgyköréhez kapcsolódó tudományos közlemények
Tézis tárgyköréhez kapcsolódó tudományos közlemények ABC transzporterek és lipidkörnyezetük kölcsönhatásának vizsgálata membrán koleszterin tartalom hatása az ABCG2 (BCRP/MXR) fehérje működésére Ph.D.
Doktori tézisek. Doktori tézisek. A Drosophila MRP, az emberi hosszú multidrog rezisztencia-asszociált fehérjék nagykapacitású modellje
Doktori tézisek Doktori tézisek A Drosophila MRP, az emberi hosszú multidrog rezisztencia-asszociált fehérjék nagykapacitású modellje A Drosophila MRP, az emberi hosszú multidrog rezisztencia-asszociált
Molekuláris genetikai vizsgáló. módszerek az immundefektusok. diagnosztikájában
Molekuláris genetikai vizsgáló módszerek az immundefektusok diagnosztikájában Primer immundefektusok A primer immundeficiencia ritka, veleszületett, monogénes öröklődésű immunhiányos állapot. Családi halmozódást
Xenobiotikum transzporterek vizsgálata humán keratinocitákban és bőrben
DOKTORI (PHD) ÉRTEKEZÉS TÉZISEI Xenobiotikum transzporterek vizsgálata humán keratinocitákban és bőrben Bebes Attila Témavezető: Dr. Széll Márta tudományos tanácsadó Szegedi Tudományegyetem Bőrgyógyászati
Az ABCG2 multidrog transzporter fehérje szerkezetének és működésének vizsgálata
Az ABCG2 multidrog transzporter fehérje szerkezetének és működésének Kutatási előzmények Az ABC transzporter membránfehérjék az ATP elhasítása (ATPáz aktivitás) révén nyerik az energiát az általuk végzett
TDK lehetőségek az MTA TTK Enzimológiai Intézetben
TDK lehetőségek az MTA TTK Enzimológiai Intézetben Vértessy G. Beáta egyetemi tanár TDK mind 1-3 helyezettek OTDK Pro Scientia különdíj 1 második díj Diákjaink Eredményei Zsűri különdíj 2 első díj OTDK
I. Molekuláris genetikai, genom-szintű és populációgenetikai eredmények:
I. Molekuláris genetikai, genom-szintű és populációgenetikai eredmények: I.1. Epigenetikai kutatások: Elsőként sikerült feltárnunk a humán ABCC6 gén transzkripciós szabályozásának fő vonásait. Azonosítottunk
Transzporterek vizsgálata lipidmembránokban Sarkadi Balázs MTA-SE Molekuláris Biofizikai Kutatócsoport, MTA-TTK Budapest
Transzporterek vizsgálata lipidmembránokban 2016. Sarkadi Balázs MTA-SE Molekuláris Biofizikai Kutatócsoport, MTA-TTK Budapest Membrántranszport fehérjék típusok, lipid-kapcsolatok A membránok szerkezete
Lymphoma sejtvonalak és gyerekkori leukémia (ALL) sejtek mikro RNS (mir) profiljának vizsgálata
Lymphoma sejtvonalak és gyerekkori leukémia (ALL) sejtek mikro RNS (mir) profiljának vizsgálata Dr. Nemes Karolina, Márk Ágnes, Dr. Hajdu Melinda, Csorba Gézáné, Dr. Kopper László, Dr. Csóka Monika, Dr.
Gyógyszer rezisztenciát okozó fehérjék vizsgálata
Gyógyszer rezisztenciát okozó fehérjék vizsgálata Bereczki Kristóf SzTE Gyakorló Gimnázium, Szeged Dobolyi Zsófia ELTE Apáczai Csere János Gyakorló Gimnázium, Budapest Horváth Ákos Bonyhádi Petőfi Sándor
Maléth József. Az endoplazmás retikulum - plazma membrán mikrodomének szerepe az intracelluláris Ca 2+ szignalizáció szabályzásában
Az endoplazmás retikulum - plazma membrán mikrodomének szerepe az intracelluláris Ca 2+ szignalizáció szabályzásában Maléth József Tudományos munkatárs MTA Orvosi Tudományok Osztálya 2017. 04. 19. Az endoplazmás
Mit tud a genetika. Génterápiás lehetőségek MPS-ben. Dr. Varga Norbert
Mit tud a genetika Génterápiás lehetőségek MPS-ben Dr. Varga Norbert Oki terápia Terápiás lehetőségek MPS-ben A kiváltó okot gyógyítja meg ERT Enzimpótló kezelés Őssejt transzplantáció Genetikai beavatkozások
2. Ismert térszerkezetű transzmembrán fehérjék adatbázisa: a PDBTM adatbázis. 3. A transzmembrán fehérje topológiai adatbázis, a TOPDB szerver
A 2005 és 2007 között megvalósított project célja transzmembrán fehérjék vizsgálata és az ehhez szükséges eljárások kifejlesztése volt. Ez utóbbi magába foglalta új adatbázisok és szerkezet becslő módszerek
Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen
Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen Azonosító szám: Az orvosi biotechnológiai mesterképzés
A doktori értekezés tézisei. A növényi NRP fehérjék lehetséges szerepe a hiszton defoszforiláció szabályozásában, és a hőstressz válaszban.
A doktori értekezés tézisei A növényi NRP fehérjék lehetséges szerepe a hiszton defoszforiláció szabályozásában, és a hőstressz válaszban. Bíró Judit Témavezető: Dr. Fehér Attila Magyar Tudományos Akadémia
Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban. Biológiai adatbázisok. Cserző Miklós 2018
Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban Biológiai adatbázisok Cserző Miklós 2018 A mai előadás Mi az adatbázis A biológia kapcsolata az adatbázisokkal Az adatbázisok típusai Adatbázis formátumok,
Válasz Dr. Szőllősi János opponensi véleményére
Válasz Dr. Szőllősi János opponensi véleményére Mindenekelőtt szeretném megköszönni Dr. Szőllősi Jánosnak, hogy elvégezte disszertációm bírálatát, és hogy felhívta a figyelmemet a dolgozatban lévő hibákra.
Fehérje expressziós rendszerek. Gyógyszerészi Biotechnológia
Fehérje expressziós rendszerek Gyógyszerészi Biotechnológia Expressziós rendszerek Cél: rekombináns fehérjék előállítása nagy tisztaságban és nagy mennyiségben kísérleti ill. gyakorlati (therapia) felhasználásokra
A pseudoxanthoma elasticum öröklődő betegség kialakulásáért felelős ABCC6/MRP6 gén transzkripciós szabályozásának vizsgálata F48684.
A pseudoxanthoma elasticum öröklődő betegség kialakulásáért felelős ABCC6/MRP6 gén transzkripciós szabályozásának vizsgálata F48684 Zárójelentés 2000-ben vált ismertté, hogy a pseudoxanthoma elasticum
Molekuláris biológiai eljárások alkalmazása a GMO analitikában és az élelmiszerbiztonság területén
Molekuláris biológiai eljárások alkalmazása a GMO analitikában és az élelmiszerbiztonság területén Dr. Dallmann Klára A molekuláris biológia célja az élőlények és sejtek működésének molekuláris szintű
Kutatási beszámoló ( )
Kutatási beszámoló (2008-2012) A thrombocyták aktivációja alapvető jelentőségű a thrombotikus betegségek kialakulása szempontjából. A pályázat során ezen aktivációs folyamatok mechanizmusait vizsgáltuk.
TRIPSZIN TISZTÍTÁSA AFFINITÁS KROMATOGRÁFIA SEGÍTSÉGÉVEL
TRIPSZIN TISZTÍTÁSA AFFINITÁS KROMATOGRÁFIA SEGÍTSÉGÉVEL Az egyes biomolekulák izolálása kulcsfontosságú a biológiai szerepük tisztázásához. Az affinitás kromatográfia egyszerűsége, reprodukálhatósága
1b. Fehérje transzport
1b. Fehérje transzport Fehérje transzport CITOSZÓL Nem-szekretoros útvonal sejtmag mitokondrium plasztid peroxiszóma endoplazmás retikulum Szekretoros útvonal lizoszóma endoszóma Golgi sejtfelszín szekretoros
Klónozás: tökéletesen egyforma szervezetek csoportjának előállítása, vagyis több genetikailag azonos egyed létrehozása.
Növények klónozása Klónozás Klónozás: tökéletesen egyforma szervezetek csoportjának előállítása, vagyis több genetikailag azonos egyed létrehozása. Görög szó: klon, jelentése: gally, hajtás, vessző. Ami
KALPAINOK SZABÁLYOZÁSA: AZ ENZIM AKTIVÁLÁSA IN VITRO ÉS IRÁNYÍTÁSA IN VIVO
KALPAINOK SZABÁLYOZÁSA: AZ ENZIM AKTIVÁLÁSA IN VITRO ÉS IRÁNYÍTÁSA IN VIVO Doktori értekezés tézisei Bozóky Zoltán Eötvös Loránd Tudományegyetem Biológiai Doktori Iskola (A Doktori Iskola Vezetője: Dr.
Búza tartalékfehérjék mozgásának követése a transzgénikus rizs endospermium sejtjeiben
TÉMA ÉRTÉKELÉS TÁMOP-4.2.1/B-09/1/KMR-2010-0003 (minden téma külön lapra) 2010. június 1. 2012. május 31. 1. Az elemi téma megnevezése Búza tartalékfehérjék mozgásának követése a transzgénikus rizs endospermium
NÖVÉNYGENETIKA. Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP /1/A
NÖVÉNYGENETIKA Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP-4.1.2-08/1/A-2009-0010 A NÖVÉNYI TÁPANYAG TRANSZPORTEREK az előadás áttekintése A tápionok útja a növényben Növényi tápionok passzív és
AZ IS30 BAKTERIÁLIS INSZERCIÓS ELEM CÉLSZEKVENCIA VÁLASZTÁSÁNAK MOLEKULÁRIS TÉNYEZŐI DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI SZABÓ MÓNIKA
AZ IS30 BAKTERIÁLIS INSZERCIÓS ELEM CÉLSZEKVENCIA VÁLASZTÁSÁNAK MOLEKULÁRIS TÉNYEZŐI DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI SZABÓ MÓNIKA Gödöllő 2007. 1 A Doktori Iskola megnevezése: Szent István Egyetem Biológia Tudományi
Algaközösségek ökológiai, morfológiai és genetikai diverzitásának összehasonlítása szentély jellegű és emberi használatnak kitett élőhelykomplexekben
Algaközösségek ökológiai, morfológiai és genetikai diverzitásának összehasonlítása szentély jellegű és emberi használatnak kitett élőhelykomplexekben Duleba Mónika Környezettudományi Doktori Iskola I.
NÖVÉNYGENETIKA. Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP /1/A
NÖVÉNYGENETIKA Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP-4.1.2-08/1/A-2009-0010 A citológia és a genetika társtudománya Citogenetika A kromoszómák eredetét, szerkezetét, genetikai funkcióját,
A génterápia genetikai anyag bejuttatatása diszfunkcionálisan működő sejtekbe abból a célból, hogy a hibát kijavítsuk.
A génterápia genetikai anyag bejuttatatása diszfunkcionálisan működő sejtekbe abból a célból, hogy a hibát kijavítsuk. A genetikai betegségek mellett, génterápia alkalmazható szerzett betegségek, mint
A szamóca érése során izolált Spiral és Spermidin-szintáz gén jellemzése. Kiss Erzsébet Kovács László
A szamóca érése során izolált Spiral és Spermidin-szintáz gén jellemzése Kiss Erzsébet Kovács László Bevezetés Nagy gazdasági gi jelentıségük k miatt a gyümölcs lcsök, termések fejlıdésének mechanizmusát
A plazma membrán mikrodomének szabályzó szerepe a sejtek növekedési és stressz érzékelési folyamataiban. Csoboz Bálint
A PhD értekezés összefoglalása A plazma membrán mikrodomének szabályzó szerepe a sejtek növekedési és stressz érzékelési folyamataiban Csoboz Bálint Témavezető: Prof. László Vígh Biológia Doktori Iskola
Hátterükben egyetlen gén áll, melynek általában számottevő a viselkedésre gyakorolt hatása, öröklési mintázata jellegzetes.
Múlt órán: Lehetséges tesztfeladatok: Kitől származik a variáció-szelekció paradigma, mely szerint az egyéni, javarészt öröklött különbségek között a társadalmi harc válogat? Fromm-Reichmann Mill Gallton
FOLYÉKONY ÉS POR ALAKÚ MOSÓSZEREK IRRITÁCIÓS HATÁSÁNAK ÉS MOSÁSI TULAJDONSÁGAINAK ÖSSZEHASONLÍTÁSA
Eötvös Loránd Tudományegyetem Természettudományi Kar Környezettudományi Centrum FOLYÉKONY ÉS POR ALAKÚ MOSÓSZEREK IRRITÁCIÓS HATÁSÁNAK ÉS MOSÁSI TULAJDONSÁGAINAK ÖSSZEHASONLÍTÁSA Varga Dóra Környezettudomány
Genetikai panel kialakítása a hazai tejhasznú szarvasmarha állományok hasznos élettartamának növelésére
Genetikai panel kialakítása a hazai tejhasznú szarvasmarha állományok hasznos élettartamának növelésére Dr. Czeglédi Levente Dr. Béri Béla Kutatás-fejlesztés támogatása a megújuló energiaforrások és agrár
A genetikai lelet értelmezése monogénes betegségekben
A genetikai lelet értelmezése monogénes betegségekben Tory Kálmán Semmelweis Egyetem, I. sz. Gyermekklinika A ~20 ezer fehérje-kódoló gén a 23 pár kromoszómán A kromoszómán található bázisok száma: 250M
Elméleti és kísérletes módszerek lipidek és membránfehérjék tanulmányozására
SE, Modellmembránok 2014.04.23. Membránok és membránfehérjék Elméleti és kísérletes módszerek lipidek és membránfehérjék tanulmányozására Hegedűs Tamás tamas@hegelab.org MTA-SE Molekuláris Biofizikai Kutatócsoport
A Hardy-Weinberg egyensúly. 2. gyakorlat
A Hardy-Weinberg egyensúly 2. gyakorlat A Hardy-Weinberg egyensúly feltételei: nincs szelekció nincs migráció nagy populációméret (nincs sodródás) nincs mutáció pánmixis van allélgyakoriság azonos hímekben
~ 1 ~ Ezek alapján a következő célokat valósítottuk meg a Ph.D. munkám során:
~ 1 ~ Bevezetés és célkitűzések A sejtekben egy adott időpillanatban expresszált fehérjék összessége a proteom. A kvantitatív proteomika célja a proteom, egy adott kezelés vagy stimulus hatására bekövetkező
T-2 TOXIN ÉS DEOXINIVALENOL EGYÜTTES HATÁSA A LIPIDPEROXIDÁCIÓRA ÉS A GLUTATION-REDOX RENDSZERRE, VALAMINT ANNAK SZABÁLYOZÁSÁRA BROJLERCSIRKÉBEN
T-2 TOXIN ÉS DEOXINIVALENOL EGYÜTTES HATÁSA A LIPIDPEROXIDÁCIÓRA ÉS A GLUTATION-REDOX RENDSZERRE, VALAMINT ANNAK SZABÁLYOZÁSÁRA BROJLERCSIRKÉBEN Mézes Miklós a,b, Pelyhe Csilla b, Kövesi Benjámin a, Zándoki
DNS-szekvencia meghatározás
DNS-szekvencia meghatározás Gilbert 1980 (1958) Sanger 3-1 A DNS-polimerázok jellemzői 5'-3' polimeráz aktivitás 5'-3' exonukleáz 3'-5' exonukleáz aktivitás Az új szál szintéziséhez kell: templát DNS primer
A humán ABCB6 transzmembrán fehérje sejten belüli lokalizációjának és funkciójának tanulmányozása
A humán ABCB6 transzmembrán fehérje sejten belüli lokalizációjának és funkciójának tanulmányozása Doktori (Ph.D.) értekezés Kiss Katalin Eötvös Loránd Tudományegyetem Természettudományi Kar Biológia Doktori
Szerkezet és funkció kapcsolata a membránműködésben. Folyadékkristályok típusai (1) Dr. Voszka István
MODELLMEMBRÁNOK (LIPOSZÓMÁK) ORVOSI, GYÓGYSZERÉSZI ALKALMAZÁSA 2012/2013 II. félév II. 7. Szerkezet és funkció kapcsolata a membránműködésben Dr. Voszka István II. 21. Liposzómák előállítási módjai Dr.
Ellenanyag reagensek előállítása II Sándor Noémi
Ellenanyag reagensek előállítása II 2019.03.04. Sándor Noémi noemi.sandor@ttk.elte.hu Ellenanyagok módosítása 1. Kémiai módosítás Részleges redukció láncok közötti diszulfid hidak megszűnnek, szabad SH
Többgénes jellegek. 1. Klasszikus (poligénes) mennyiségi jellegek. 2.Szinte minden jelleg több gén irányítása alatt áll
Többgénes jellegek Többgénes jellegek 1. 1. Klasszikus (poligénes) mennyiségi jellegek Multifaktoriális jellegek: több gén és a környezet által meghatározott jellegek 2.Szinte minden jelleg több gén irányítása
A TATA-kötő fehérje asszociált faktor 3 (TAF3) p53-mal való kölcsönhatásának funkcionális vizsgálata
Ph.D. ÉRTEKEZÉS TÉZISEI A TATA-kötő fehérje asszociált faktor 3 (TAF3) p53-mal való kölcsönhatásának funkcionális vizsgálata Buzás-Bereczki Orsolya Témavezetők: Dr. Bálint Éva Dr. Boros Imre Miklós Biológia
Az AT 1A -angiotenzinreceptor G-fehérjétől független jelátvitelének vizsgálata C9 sejtekben. Doktori tézisek. Dr. Szidonya László
Az AT 1A -angiotenzinreceptor G-fehérjétől független jelátvitelének vizsgálata C9 sejtekben Doktori tézisek Dr. Szidonya László Semmelweis Egyetem Molekuláris Orvostudományok Doktori Iskola Témavezető:
A plazmamembrán kalcium ATPáz (PMCA) 2 és 4 izoformák lokalizációjának szabályozása. Doktori értekezés tézisei
A plazmamembrán kalcium ATPáz (PMCA) 2 és 4 izoformák lokalizációjának szabályozása Doktori értekezés tézisei Antalffy Géza ELTE TTK Biológia Doktori Iskola Molekuláris sejt- és neurobiológia program Témavezető:
Bioinformatika 2 6. előadás
6. előadás Prof. Poppe László BME Szerves Kémia és Technológia Tsz. Bioinformatika proteomika Előadás és gyakorlat 2018.10.08. PDBj: http://www.pdbj.org/ Fehérjék 3D szerkezeti adatbázisai - PDBj 2 2018.10.08.
Dr. Csanády László: Az ioncsatorna-enzim határmezsgye: egyedi CFTR és TRPM2 csatornák szerkezete, működése c. MTA doktori értekezésének bírálata
Dr. Csanády László: Az ioncsatorna-enzim határmezsgye: egyedi CFTR és TRPM2 csatornák szerkezete, működése c. MTA doktori értekezésének bírálata Ezúton is köszönöm a lehetőséget és a megtiszteltetést,
Immunológia 4. A BCR diverzitás kialakulása
Immunológia 4. A BCR diverzitás kialakulása 2017. október 4. Bajtay Zsuzsa A klónszelekciós elmélet sarokpontjai: Monospecifictás: 1 sejt 1-féle specificitású receptor Az antigén receptorhoz kötődése aktiválja
Bioinformatika előadás
10. előadás Prof. Poppe László BME Szerves Kémia és Technológia Tsz. Bioinformatika proteomika Előadás és gyakorlat Genomika vs. proteomika A genomika módszereivel nem a tényleges fehérjéket vizsgáljuk,
Preeclampsia-asszociált extracelluláris vezikulák
Preeclampsia-asszociált extracelluláris vezikulák hatása(i) a monocita sejt működésére Kovács Árpád Ferenc 1, Láng Orsolya 1, Kőhidai László 1, Rigó János 2, Turiák Lilla 3, Fekete Nóra 1, Buzás Edit 1,
transzporter fehérjék /ioncsatornák
Sejtpenetráló peptidek biológiailag aktív vegyületek sejtbejuttatásában Bánóczi Zoltán MTA - ELTE Peptidkémiai kutatócsoport megalakulásának 50. évfordulója 2011.12.09 Sejtpenetráló peptidek rövid, pozitívan
Terápiarezisztencia-fehérjéket kódoló mrns kvantitatív kimutatása PCRtechnikával. nyirokcsomójában
Terápiarezisztencia-fehérjéket kódoló mrns kvantitatív kimutatása PCRtechnikával lymphomás kutyák nyirokcsomójában Sunyál Orsolya V. évfolyam Témavezetık: Dr. Vajdovich Péter Szabó Bernadett SZIE-ÁOTK
Szerkezet és funkció kapcsolata a membránműködésben. Folyadékkristályok típusai (1) Dr. Voszka István
MODELLMEMBRÁNOK (LIPOSZÓMÁK) ORVOSI, GYÓGYSZERÉSZI ALKALMAZÁSA 2015/2016 II. félév Időpont: szerda 17 30-19 00 Helyszín Elméleti Orvostudományi Központ Szent-Györgyi Albert előadóterme II. 3. Szerkezet
Összefoglalók Kémia BSc 2012/2013 I. félév
Összefoglalók Kémia BSc 2012/2013 I. félév Készült: Eötvös Loránd Tudományegyetem Kémiai Intézet Szerves Kémiai Tanszékén 2012.12.17. Összeállította Szilvágyi Gábor PhD hallgató Tartalomjegyzék Orgován
Natív antigének felismerése. B sejt receptorok, immunglobulinok
Natív antigének felismerése B sejt receptorok, immunglobulinok B és T sejt receptorok A B és T sejt receptorok is az immunglobulin fehérje család tagjai A TCR nem ismeri fel az antigéneket, kizárólag az
Multidrog rezisztens tumorsejtek szelektív eliminálására képes vegyületek azonosítása és in vitro vizsgálata
Multidrog rezisztens tumorsejtek szelektív eliminálására képes vegyületek azonosítása és in vitro vizsgálata Doktori értekezés tézisei Türk Dóra Témavezető: Dr. Szakács Gergely MTA TTK ENZIMOLÓGIAI INTÉZET
Pozitron emittáló izotópok. [18F]FDG előállítása. Általunk használt izotópok. Magreakció: Dual Beam 18F. Felezési idő (min) 109,7
Pozitron emittáló izotópok [F]FDG előállítása Nuklid Felezési idő (min) 109,7 20,4 10 2,05 F 11C 13 N 15 2 Általunk használt izotópok Izotóp Molekula Mit mutat ki Fontosabb klinikai jelentősége F dezoxiglükóz
Gyógyszermolekulák és ABC transzporterek kölcsönhatásának vizsgálatára alkalmas in vitro rendszerek fejlesztése és validálása
Ph.D. értekezés tézisei Gyógyszermolekulák és ABC transzporterek kölcsönhatásának vizsgálatára alkalmas in vitro rendszerek fejlesztése és validálása Kis Emese Témavezető: Dr. Krajcsi Péter Belső konzulens:
Zárójelentés. Állati rotavírusok összehasonlító genomvizsgálata. c. OTKA kutatási programról. Bányai Krisztián (MTA ATK ÁOTI)
Zárójelentés Állati rotavírusok összehasonlító genomvizsgálata c. OTKA kutatási programról Bányai Krisztián (MTA ATK ÁOTI) 2012 1 Az Állati rotavírusok összehasonlító genomvizsgálata c. programban azt
A preventív vakcináció lényege :
Vakcináció Célja: antigénspecifkus immunválasz kiváltása a szervezetben A vakcina egy olyan készítmény, amely fokozza az immunitást egy adott betegséggel szemben (aktiválja az immunrendszert). A preventív
Hogyan lesznek új gyógyszereink? Bevezetés a gyógyszerkutatásba
Hogyan lesznek új gyógyszereink? Bevezetés a gyógyszerkutatásba Keserű György Miklós, PhD, DSc Magyar Tudományos Akadémia Természettudományi Kutatóközpont A gyógyszerkutatás folyamata Megalapozó kutatások
Hálózati modellek alkalmazása a molekuláris biológia néhány problémájára. Doktori (PhD) értekezés tézisei. Ágoston Vilmos
Hálózati modellek alkalmazása a molekuláris biológia néhány problémájára Doktori (PhD) értekezés tézisei Ágoston Vilmos Témavezető: Dr. Pongor Sándor SZEGED 2007 Konferencia-részvétel: Bevezetés Ágoston,
A Drosophila melanogaster poszt-meiotikus spermatogenezisében szerepet játszó gének vizsgálata. Ph.D. értekezés tézisei.
A Drosophila melanogaster poszt-meiotikus spermatogenezisében szerepet játszó gének vizsgálata Ph.D. értekezés tézisei Vedelek Viktor Témavezető: Dr. Sinka Rita Biológia Doktori Iskola Szegedi Tudományegyetem
Növényvédelmi Tudományos Napok 2014
Növényvédelmi Tudományos Napok 2014 Budapest 60. NÖVÉNYVÉDELMI TUDOMÁNYOS NAPOK Szerkesztők HORVÁTH JÓZSEF HALTRICH ATTILA MOLNÁR JÁNOS Budapest 2014. február 18-19. ii Szerkesztőbizottság Tóth Miklós
A Telomerase-specific Doxorubicin-releasing Molecular Beacon for Cancer Theranostics
A Telomerase-specific Doxorubicin-releasing Molecular Beacon for Cancer Theranostics Yi Ma, Zhaohui Wang, Min Zhang, Zhihao Han, Dan Chen, Qiuyun Zhu, Weidong Gao, Zhiyu Qian, and Yueqing Gu Angew. Chem.
TRANSZPORTEREK Szakács Gergely
TRANSZPORTEREK Szakács Gergely Összefoglalás A biológiai membránokon keresztüli anyagáramlást számos membránfehérje szabályozza. E fehérjék változatos funkciója és megjelenésük mintázata biztosítja a sejtek
avagy az ipari alkalmazhatóság kérdése biotechnológiai tárgyú szabadalmi bejelentéseknél Dr. Győrffy Béla, Egis Nyrt., Budapest
Iparilag alkalmazható szekvenciák, avagy az ipari alkalmazhatóság kérdése biotechnológiai tárgyú szabadalmi bejelentéseknél Dr. Győrffy Béla, Egis Nyrt., Budapest Neutrokin α - jelentős kereskedelmi érdekek
CYP2C19 polimorfizmusok szerepe a clopidogrel rezisztencia vizsgálatában iszkémiás stroke-on átesett betegekben
CYP2C19 polimorfizmusok szerepe a clopidogrel rezisztencia vizsgálatában iszkémiás stroke-on átesett betegekben Bádogos Ágnes DE-ÁOK V. évfolyam Témavezető: Dr. Bagoly Zsuzsa Debreceni Egyetem, Általános
Flagellin alapú filamentáris nanoszerkezetek létrehozása
Flagellin alapú filamentáris nanoszerkezetek létrehozása Vonderviszt Ferenc PE MÜKKI Bio-Nanorendszerek Laboratórium MTA Enzimológiai Intézete MTA MFA Bakteriális flagellumok Flagelláris filamentum: ~10
Norvég Finanszírozási Mechanizmus által támogatott projekt HU-0115/NA/2008-3/ÖP-9 ÚJ TERÁPIÁS CÉLPONTOK AZONOSÍTÁSA GENOMIKAI MÓDSZEREKKEL
Norvég Finanszírozási Mechanizmus által támogatott projekt HU-0115/NA/2008-3/ÖP-9 ÚJ TERÁPIÁS CÉLPONTOK AZONOSÍTÁSA GENOMIKAI MÓDSZEREKKEL KÖZÖS STRATÉGIA KIFEJLESZTÉSE MOLEKULÁRIS MÓDSZEREK ALKALMAZÁSÁVAL
KERINGŐ EXTRACELLULÁRIS VEZIKULÁK ÁLTAL INDUKÁLT GÉNEXPRESSZIÓS MINTÁZAT VIZSGÁLATA TROPHOBLAST SEJTVONALBAN
2016. 10. 14. KERINGŐ EXTRACELLULÁRIS VEZIKULÁK ÁLTAL INDUKÁLT GÉNEXPRESSZIÓS MINTÁZAT VIZSGÁLATA TROPHOBLAST SEJTVONALBAN Kovács Árpád Ferenc 1, Pap Erna 1, Fekete Nóra 1, Rigó János 2, Buzás Edit 1,
A nukleinsavak polimer vegyületek. Mint polimerek, monomerekből épülnek fel, melyeket nukleotidoknak nevezünk.
Nukleinsavak Szerkesztette: Vizkievicz András A nukleinsavakat először a sejtek magjából sikerült tiszta állapotban kivonni. Innen a név: nucleus = mag (lat.), a sav a kémhatásukra utal. Azonban nukleinsavak
A humán HLTF fehérje HIRAN doménjének strukturális és funkcionális vizsgálata
A humán HLTF fehérje HIRAN doménjének strukturális és funkcionális vizsgálata Ph.D. értekezés tézisei Balogh Dávid Témavezető: Dr. Haracska Lajos Tudományos főmunkatárs Biológia Doktori Iskola Szegedi
B-sejtek szerepe az RA patológiás folyamataiban
B-sejtek szerepe az RA patológiás folyamataiban Erdei Anna Biológiai Intézet Immunológiai Tanszék Eötvös Loránd Tudományegyetem Immunológiai Tanszék ORFI, Helia, 2015 április 17. RA kialakulása Gary S.
HUMÁN ABC TRANSZPORTEREK FUNKCIONÁLIS VIZSGÁLATA. Homolya László
Akadémiai doktori értekezés HUMÁN ABC TRANSZPORTEREK FUNKCIONÁLIS VIZSGÁLATA Homolya László MTA-SE Membránbiológiai Kutatócsoport Budapest, 2010. "Az ember minden jel szerint arra van teremtve, hogy gondolkozzék;
Sejtmozgás és adhézió Molekuláris biológia kurzus 8. hét. Kun Lídia Genetikai, Sejt és Immunbiológiai Intézet
Sejtmozgás és adhézió Molekuláris biológia kurzus 8. hét Kun Lídia Genetikai, Sejt és Immunbiológiai Intézet Sejtmozgás -amőboid - csillós - kontrakció Sejt adhézió -sejt-ecm -sejt-sejt MOZGÁS A sejtmozgás
In Situ Hibridizáció a pathologiai diagnosztikában és ami mögötte van.
In Situ Hibridizáció a pathologiai diagnosztikában és ami mögötte van. Kneif Józsefné PTE KK Pathologiai Intézet Budapest 2017. 05. 26 Kromoszóma rendellenesség kimutatás PCR technika: izolált nukleinsavak
TEMATIKA Biokémia és molekuláris biológia IB kurzus (bb5t1301)
Biokémia és molekuláris biológia I. kurzus (bb5t1301) Tematika 1 TEMATIKA Biokémia és molekuláris biológia IB kurzus (bb5t1301) 0. Bevezető A (a biokémiáról) (~40 perc: 1. heti előadás) A BIOkémia tárgya
Lipidek anyagcseréje és az ateroszklerózis (érelmeszesedés)
Lipidek anyagcseréje és az ateroszklerózis (érelmeszesedés) Rácz Olivér Miskolci Egyetem Egészségügyi Kar 22.9.2009 ateromisk.ppt 1 Az érelmeszesedés csak a XIX. évszázad második felétől orvosi probléma
Mangalica specifikus DNS alapú módszer kifejlesztés és validálása a MANGFOOD projekt keretében
Mangalica specifikus DNS alapú módszer kifejlesztés és validálása a MANGFOOD projekt keretében Szántó-Egész Réka 1, Mohr Anita 1, Sipos Rita 1, Dallmann Klára 1, Ujhelyi Gabriella 2, Koppányné Szabó Erika
A gidrán fajta genetikai változatosságának jellemzése mitokondriális DNS polimorfizmusokkal Kusza Szilvia Sziszkosz Nikolett Mihók Sándor,
1 A gidrán fajta genetikai változatosságának jellemzése mitokondriális DNS polimorfizmusokkal Kusza Szilvia Sziszkosz Nikolett Mihók Sándor, (Debreceni Egyetem Állattenyésztéstani Tanszék) A bármilyen
A PET szerepe a gyógyszerfejlesztésben. Berecz Roland DE KK Pszichiátriai Tanszék
A PET szerepe a gyógyszerfejlesztésben Berecz Roland DE KK Pszichiátriai Tanszék Gyógyszerfejlesztés Felfedezés gyógyszertár : 10-15 év Kb. 1 millárd USD/gyógyszer (beleszámolva a sikertelen fejlesztéseket)
Elválasztástechnikai és bioinformatikai kutatások. Dr. Harangi János DE, TTK, Biokémiai Tanszék
Elválasztástechnikai és bioinformatikai kutatások Dr. Harangi János DE, TTK, Biokémiai Tanszék Fő kutatási területek Enzimek vizsgálata mannozidáz amiláz OGT Analitikai kutatások Élelmiszer analitika Magas
Bioinformatika 2 10.el
10.el őadás Prof. Poppe László BME Szerves Kémia és Technológia Tsz. Bioinformatika proteomika Előadás és gyakorlat 2009. 04. 24. Genomikavs. proteomika A genomika módszereivel nem a tényleges fehérjéket
A humán multidrog transzporter MDR1 klinikai és biokémiai vizsgálata
A humán multidrog transzporter MDR1 klinikai és biokémiai vizsgálata Doktori (Ph.D.) értekezés Dr. Szakács Gergely Semmelweis Egyetem Doktori Iskola Pathobiokémia Program Témavezető: Dr. Sarkadi Balázs
Az X kromoszóma inaktívációja. A kromatin szerkezet befolyásolja a génexpressziót
Az X kromoszóma inaktívációja A kromatin szerkezet befolyásolja a génexpressziót Férfiak: XY Nők: XX X kromoszóma: nagy méretű több mint 1000 gén Y kromoszóma: kis méretű, kevesebb, mint 100 gén Kompenzációs
ADATBÁNYÁSZAT I. ÉS OMICS
Az élettudományi-klinikai felsőoktatás gyakorlatorientált és hallgatóbarát korszerűsítése a vidéki képzőhelyek nemzetközi versenyképességének erősítésére TÁMOP-4.1.1.C-13/1/KONV-2014-0001 ADATBÁNYÁSZAT
A T sejt receptor (TCR) heterodimer
Immunbiológia - II A T sejt receptor (TCR) heterodimer 1 kötőhely lánc lánc 14. kromoszóma 7. kromoszóma V V C C EXTRACELLULÁRIS TÉR SEJTMEMBRÁN CITOSZÓL lánc: VJ régió lánc: VDJ régió Nincs szomatikus
PhD DISSZERTÁCIÓ TÉZISEI
Budapesti Muszaki és Gazdaságtudományi Egyetem Fizikai Kémia Tanszék MTA-BME Lágy Anyagok Laboratóriuma PhD DISSZERTÁCIÓ TÉZISEI Mágneses tér hatása kompozit gélek és elasztomerek rugalmasságára Készítette:
Membrántranszport. Gyógyszerész előadás Dr. Barkó Szilvia
Membrántranszport Gyógyszerész előadás 2017.04.10 Dr. Barkó Szilvia Sejt membránok A sejtmembrán funkciói Védelem Kommunikáció Molekulák importja és exportja Sejtmozgás Általános szerkezet Lipid kettősréteg
ONKOGÉN K-RAS MUTÁCIÓK: SZERKEZET ALAPÚ ALLÉL SPECIFIKUS INHIBITOR TERVEZÉS. Vértessy G. Beáta MedInProt Konferencia Budapest, április 22.
ONKOGÉN K-RAS MUTÁCIÓK: SZERKEZET ALAPÚ ALLÉL SPECIFIKUS INHIBITOR TERVEZÉS Vértessy G. Beáta MedInProt Konferencia Budapest, 2017. április 22. HOGYAN KEZDŐDÖTT? MEDINPROT KONFERENCIA, 2015. NOVEMBER 14.
HAPMAP -2010 Nemzetközi HapMap Projekt. SNP GWA Haplotípus: egy kromoszóma szegmensen lévő SNP mintázat
HAPMAP -2010 Nemzetközi HapMap Projekt A Nemzetközi HapMap Project célja az emberi genom haplotípus* térképének(hapmap; haplotype map) megszerkesztése, melynek segítségével katalogizálni tudjuk az ember
Tüdő adenocarcinomásbetegek agyi áttéteiben jelenlévő immunsejtek, valamint a PD-L1 és PD-1 fehérjék túlélésre gyakorolt hatása
Tüdő adenocarcinomásbetegek agyi áttéteiben jelenlévő immunsejtek, valamint a és PD-1 fehérjék túlélésre gyakorolt hatása Téglási Vanda, MoldvayJudit, Fábián Katalin, Csala Irén, PipekOrsolya, Bagó Attila,