(www.biophys.dote.hu./icys).



Hasonló dokumentumok
A lézer-szkenning citometria lehetőségei. Laser-scanning cytometer (LSC) Pásztázó citométer. Az áramlási citometria fő korlátai

Az áramlási citométer és sejtszorter felépítése és működése, diagnosztikai alkalmazásai

Rövid ismertető. Modern mikroszkópiai módszerek. A mikroszkóp. A mikroszkóp. Az optikai mikroszkópia áttekintése

Az áramlási citometria gyakorlati alkalmazása az ondó rutin analízisben. Hajnal Ágnes, Dr Mikus Endre, Dr Venekeiné Losonczi Olga

Kvantitatív immunhisztokémia a patológiában

Röntgen-gamma spektrometria

International GTE Conference MANUFACTURING November, 2012 Budapest, Hungary. Ákos György*, Bogár István**, Bánki Zsolt*, Báthor Miklós*,

Modern Biofizikai Kutatási Módszerek Kereskedelmi forgalomban kapható készülékek. Áramlási citometria (flow cytometry)

Abszorpciós spektroszkópia

Számítógépes képelemzés projektmunkák 2012

Daganat immunterápia molekuláris markereinek tanulmányozása biofizikai módszerekkel. Áramlási és képalkotó citometria

ORVOSI LABORATÓRIUMI ÉS KÉPALKOTÓ DIAGNOSZTIKAI ANALITIKUS ALAPSZAK

BUDAPEST május 4-6. V. Magyar Sejtanalitikai Konferencia Molekuláris medicina: Sejtanalitika Innováció Alkalmazás ÉRTESÍTÔ

Mozgékony molekulák vizsgálata modern mikroszkópiával

Száloptika, endoszkópok

Tartalomjegyzék. Emlékeztetõ. Emlékeztetõ. Spektroszkópia. Fényelnyelés híg oldatokban A fény; Abszorpciós spektroszkópia

Foglalkozási napló a 20 /20. tanévre

Foglalkozási napló a 20 /20. tanévre

Áramlási citometria elve

TANULÓI KÍSÉRLET (45 perc)

A LÉZERSUGÁRZÁS ALAPVETŐ ISMÉRVEI SPONTÁN VS. INDUKÁLT EMISSZIÓ A FÉNYERŐSÍTÉS FELTÉTELE A POPULÁCIÓ INVERZIÓ FELTÉTELE

dátumok közti fuvarok:

Tartalomjegyzék. Emlékeztetõ. Emlékeztetõ. Spektroszkópia. Fényelnyelés híg oldatokban 4/11/2016. A fény; Abszorpciós spektroszkópia

JASCO FTIR KIEGÉSZÍTŐK - NE CSAK MÉRJ, LÁSS IS!

mintasepcifikus mikrokapilláris elektroforézis Lab-on-Chip elektroforézis / elektrokinetikus elven DNS, RNS, mirns 12, fehérje 10, sejtes minta 6

ÁRAMKÖRÖK SZIMULÁCIÓJA

Mikroszkóp vizsgálata Folyadék törésmutatójának mérése

41. A minıségügyi rendszerek kialakulása, ISO 9000 rendszer jellemzése

A mikroszkóp új dimenziókat nyit

OPTIKA. Optikai rendszerek. Dr. Seres István

Ragyogó molekulák: dióhéjban a fluoreszcenciáról és biológiai alkalmazásairól

Konfokális mikroszkópia elméleti bevezetõ

Digitalizált immunhisztokémiai reakciók automatikus kiértékelése a Pannoramic TM Platform-mal

In vivo szövetanalízis. Különös tekintettel a biolumineszcens és fluoreszcens képalkotási eljárásokra

CENTRIFUGA KATALÓGUS és CYTOSET ISmERTETô

TUMORSEJTEK FENOTÍPUS-VÁLTOZÁSA TUMOR-SZTRÓMA SEJTFÚZIÓ HATÁSÁRA. Dr. Kurgyis Zsuzsanna

Tudásmenedzsment és gyógyszerinnováció


Az Idegsebészeti Szövetbank jelentősége a neuro-onkológiai kutatásokban

Tóth Mónika Ágnes PTE ÁOK Biofizikai Intézet Kereskedelmi forgalomban kapható készülékek

MicroQ mini USB digitális mikroszkópok fém állvánnyal

Áramlási citometria / 4. Immunológiai és Biotechnológiai Intézet PTE KK

dátumok közti fuvarok:

Anyagismeret a gyakorlatban Implantátumok: az ötlettől a termékig

Fény- és fluoreszcens mikroszkópia. A mikroszkóp felépítése Brightfield mikroszkópia

Biomolekulák nanomechanikája A biomolekuláris rugalmasság alapjai

VIII. Magyar Sejtanalitikai Konferencia Fény a kutatásban és a diagnosztikában

Automatikus szivárgáskeresés Zajszint-adatgyűjtő hálózat korrelátoros funkcióval

Orvosi Biofizika I. 12. vizsgatétel. IsmétlésI. -Fény

Új lehetőségek a tumoros emlőanyagok patológiai feldolgozásában

Szívbetegségek hátterében álló folyamatok megismerése a ciklusosan változó szívélettani paraméterek elemzésén keresztül

GIS Open 2011 Székesfehérvár Leica Viva Integrált felmérés eszközei Leica Viva Képalkotási Technológiák Horváth Zsolt Leica Geosystems Hungary Kft

Áramlási citometria, sejtszeparációs technikák. Immunológiai és Biotechnológiai Intézet ÁOK, PTE

Jegyzetelési segédlet 7.

Jelátvitel az idegrendszerben:

dátumok közti fuvarok:

MONITOROK ÉS A SZÁMÍTÓGÉP KAPCSOLATA A A MONITOROKON MEGJELENÍTETT KÉP MINŐSÉGE FÜGG:

Mikroszkóp vizsgálata Lencse görbületi sugarának mérése Folyadék törésmutatójának mérése

Ismerkedjünk tovább a számítógéppel. Alaplap és a processzeor

A fotogrammetria ismeretek és a szakmai tudás fontossága

Ragasztócsík ellenőrző kamerás rendszer

2008 Small World contest -18th Prize - Dr. Tamily Weissman (Harvard University - Cambridge, Massachusetts, United States) Specimen: Brainbow

Vérsejtszámlálás. Bürker kamra

Ló tréningmonitorozó rendszer bemutatása

Gamma-röntgen spektrométer és eljárás kifejlesztése anyagok elemi összetétele és izotópszelektív radioaktivitása egyidejű elemzésére

Automatizált Térfigyelő Rendszer. Sensor Technologies Kft

Mikroszerkezeti vizsgálatok

A módszerek jelentősége. Gyors-kinetika módszerek. A módszerek közös tulajdonsága. Milyen módszerekről tanulunk?

A Debreceni Egyetem Orvosegészségügyi Centrum Biofizikai és Sejtbiológiai Intézete

kompakt fényképezőgép

Szöveges feladatok a mátrixaritmetika alkalmazására

icollware szoftver portfolió

A mágneses szuszceptibilitás vizsgálata

Láthatósági kérdések

Pécsi Tudományegyetem. Szegmentált tükrű digitális csillagászati távcső tervezése

A harkányi gyógyvízzel végzett vizsgálataink eredményei psoriasisban között. Dr. Hortobágyi Judit

3/29/12. Biomatematika 2. előadás. Biostatisztika = Biometria = Orvosi statisztika. Néhány egyszerű definíció:

Szacharóz OH HO O O OH HO O OH HO OH HO 1

Tartalomjegyzék. 1. Hagyományos fakötések rajzai Mérnöki fakötések rajzai Fedélidomok szerkesztése,

Megfelelőségi nyilatkozat (elektronikus hírközlési szolgáltatás 13/2011. (XII. 27.) NMHH rendelet szerinti megfelelőségéről a 2015.

A 2017/2018. tanévi Országos Középiskolai Tanulmányi Verseny döntő forduló FIZIKA II. KATEGÓRIA JAVÍTÁSI ÚTMUTATÓ. Pohár rezonanciája

In Situ Hibridizáció a pathologiai diagnosztikában és ami mögötte van.

Az Ampère-Maxwell-féle gerjesztési törvény

TANULÓI KÍSÉRLET (45 perc) A növényi szövetek összehasonlító vizsgálata mikroszkóppal 1. (osztódószövet, bőrszövet)

Emelt Szintű etanácsadó Képzés

Citotechnológia követelménymodul szóbeli vizsgafeladatai

beugro

Digitális képfeldolgozó rendszer

DTMF Frekvenciák Mérése Mérési Útmutató

Közbeszerzés és Innováció. GIS Open Bartha Csaba Navicom Plusz Bt.

Megfelelőségi nyilatkozat (elektronikus hírközlési szolgáltatás 13/2011. (XII. 27.) NMHH rendelet szerinti megfelelőségéről a 2014.

Szakmai nap Nagypontosságú megmunkálások Nagypontosságú keményesztergálással előállított alkatrészek felület integritása

Szupergyors Internet? Szupergyors mérések!

DF20 Jet Fiber lézer jelölő berendezés

A nanotechnológia mikroszkópja

Program verzió:

FEGYVERNEKI SÁNDOR, Valószínűség-sZÁMÍTÁs És MATEMATIKAI

Áttekintés 5/11/2015 MIKROSZKÓPIAI MÓDSZEREK 1 FÉNYMIKROSZKÓPIA FLUORESZCENCIA MIKROSZKÓPIA. Mikroszkópia, fénymikroszkópia

Mit is csinál pontosan a patológus?

A Hisztogram használata a digitális képszerkesztésben

Átírás:

1 (www.biophys.dote.hu./icys). A Debreceni Egyetem GVOP-3.2.1.-2004-04-0351/3.0 számú projektje során a Debreceni Egyetem Biofizikai és Sejtbiológiai Intézetében telepítésre került egy nagy értékű képalkotó citométer nagyműszer. A képalkotó citométer egy mikroszkóp-alapú innovatív berendezés, melynek egyedülállóan rugalmas tulajdonságai teszik lehetővé a rendszer széleskörű alap- és klinikai kutatásbeli felhasználását. (A műszer további szokásos elnevezései még: lézerpásztázó citométer, tárgylemez citométer, laser-scanning cytometer, LSC, imaging cytometer; a rendszer gyártója: www.compucyte.com.) A gyorsan fejlődő képalkotó citometria egyesíti az áramlási citometria és a mikroszkópia előnyeit, ugyanakkor betölti a közöttük tátongó technikai szakadékot. Feloldja ugyanis egyrészről a digitális képanalizáló mikroszkópiának, mint az egyedi sejtekkel foglalkozó technikának a biológiai variabilitással kapcsolatos alapvető "melyik néhány sejtet vizsgáljam a sok különböző közül" problematikáját, másfelől képes az áramlási citometriával kivitelezhetetlen tárgylemezhez rögzült letapadó sejtek populáció szintű képi vizsgálatára. Minőségileg új szituáció jön létre az u.n. High Throughput mérések területén. Az áramlási citometria eddig csak a vérsejtek fiziológiás vizsgálatára volt alkalmas. A képalkotó citometria ugyanakkor a szövettenyészeteken vagy szolid tumorokon végezhető, a gyógyszergyárakban a gyógyszerkipróbálások kapcsán egyre inkább terjedő automatizált High Troughtput mérésekre is megfelelő. Ennek a kutatásban igen nagy jövője van, kb. akkora, mint az 1970-es évek elején az azóta is töretlenül fejlődő áramlási citometriának volt. A rendszer alkalmazása a mérési és diagnosztikus lehetőségeken ugyanakkor jóval túlmutat, lehetőséget ad ugyanis statisztikailag reprezentatív mintából a képi paraméterek alapján kiválasztott sejtek gyors mikromanipulációjára is, vagy pl. sejtek célzott klónozására. Hazánkban ez az első ilyen berendezés.

2 A projektben közvetlenül résztvevő intézmények: DE OEC Biofizikai és Sejtbiológiai Intézet DE OEC Biokémiai és Molekuláris Biológiai Intézet DE OEC Immunológiai Intézet DE OEC Farmakológiai és Farmakoterápiai Intézet DE OEC III. sz. Belgyógyászati Klinika DE OEC I. sz. Sebészeti Klinika A projekt megvalósításáért felelős személyek: Dr. Gáspár Rezső DE OEC Biofizikai és Sejtbiológiai Intézet Intézetigazgató Dr. Bacsó Zsolt DE OEC Biofizikai és Sejtbiológiai Intézet Projekt koordinátor Debrecen, 2005. május 31.

3 A képalkotó citométer leírása A lézer-pásztázó citométer alkalmazza egy egyszerű áramlási citométer megvilágítási elemeit, egy konvencionális fluoreszcenciás mikroszkóp és képanalizáló rendszer kiépítésével ötvözve azokat. Ilyen, most már "hagyományosnak" mondható elemek felhasználásával minőségileg viszont teljesen új sejt- és orvosbiológiai problémák megoldására biztosít lehetőséget. A minta gerjesztését egy 400 nm-es UV dióda, egy 488 nm-es kék argon-ion, egy 546 nm-es zöld vagy egy 633 nm-es vörös helium-neon lézerrel oldják meg. A keletkező szórt és fluoreszcenciás fényt a mikroszkóp optikai elemei gyűjtik össze, fotoelektron-sokszorozó érzékeli, és végül számítógép dolgozza fel. A rendszerbe integrált mikroszkóp kamerájával fluoreszcens képeket lehet készíteni az azonosított objektumokról. A lézer-pásztázó citometria forradalmi újítása az, hogy hagyományos szövettani metszeteken és lerögzített sejteken is elvégezhetőek citometriai mérések. A tárgylemezen elhelyezkedő mintát lézer fény tapogatja le olymódon, hogy a mozgatható tárgyasztalon a minta x irányban halad 0.5 mikrométeres lépésekben 1024 egységet, míg a mikroszkóp objektívje felől érkező lézer nyaláb, - melyet egy rezgő tükör mozgatva - a haladási irányra merőlegesen y irányban lépésenként 768 egységet "pásztáz be". Így áll elő a tárgylemez egy kicsiny 1 024. 0,5 x 768. 0,5 mikrométeres téglalap alakú - felületéről egy 1024x768 pixelből álló "képablak", melyet a számítógép feldolgoz. A számítógép képfeldolgozó rutinjai ezen képablak kiértékelésével az áramlási citometriában alkalmazotthoz hasonló, továbbá azokhoz képest - a képi információ feldolgozásából eredően - alapvetően új paramétereket számolnak ki. A képablakokat egymás után alkalmazva a tárgylemez egész felületét, vagy a szoftverrel beállítható módon annak tetszőleges alakú és számú részfelületét képes a rendszer megvizsgálni. Az így nyert adatokat, sőt akár az adatok arányát is (ez gyakorta hasznos, különböző "ratiometric" fluoreszcens festék alkalmazásánál) az áramlási citometriából már ismert hisztogrammos vagy korrelált dot-plot formában jeleníti meg rendszer. A minta sejtjei az LSC esetén tehát nem folynak el a folyadékkal, mint az áramlási citometria esetében, hanem a mikroszkóp tárgylemezének állandó helyén helyezkednek el. A sejtenként végzett mérés így magában foglalja a sejtek pontos helyét és a mérés idejét, a sejtek területét és kerületét, a sejt teljes fluoreszcencia intenzitását, a sejten belüli csúcs fluoreszcencia intenzitást (maximal pixel v. maxpixel) és a fluoreszcencia intenzitás szórását, illetve még további származtatott képi paramétereket. Minden sejtet tetszőleges alkalommal újra lehet vizsgálni a sejtek helyének az ismeretében, melynek a fotokioltás jelensége szabhat határt, ami viszont tervezhető, vagy figyelembe vehető paraméterré tehető. A percenként vizsgálható sejtszám felső határa nagyságrendileg néhány ezer sejt (1000 sejt/min), ami függ a tárgylemezre vitt sejtek denzitásától, vagyis a használt sejtek koncentrációjától. Ez átlagos esetben maximum 100-1000 sejt/mm2-es sejt koncentrációt jelenthet a tárgylemezen különálló, szoliter sejtek szuszpenziójából készített minta esetén. Gyorsabb a mintagyűjtés, de nagyobb a további felhasználásra és számolásra kizárandó sejtek aránya letapadó sejttenyészet, szövettani metszet, vagy szövet lenyomat (touchprint minta) esetén. Magi jelölés alapján ilyenkor is azonosíthatóak az egyedi sejtek, de

4 az ilyenkor összeérő és egyértelműen nem azonosítható sejteket ki kell zárni a további adatfeldolgozásból, melyet a szoftver automatikusan elvégez. Ez a jelenség magyarázza azt, hogy összefüggő sejtkultúra esetén sem emelkedik nagyon a fent említett percenkénti sejtszám fölé a vizsgálat sebessége egymással összeérő sejtek esetében sem. Az LSC-vel tehát egy kétdimenziós sorozat mérés eredményeképpen nyerjük a sejtekről az adatokat, az áramlási citometriától eltérően, ahol egy foltszerű gerjesztéssel lineáris sorozat mérés történik. Az adatok gyűjtése és ábrázolása a modern áramlási citometriához hasonló módon történik. A mikroszkóphoz kapcsolt kamera és képernyő pedig lehetővé teszi a sejtek mérés közbeni azonnali megtekintését, illetve a készített képek digitális rögzítését különböző nagyítások felhasználása mellett (10X, 25X, 40X). Ilyen módon közvetlen korrelációt kaphatunk, - még a mérés elvégzése közben - a sejtek fluoreszcens paraméterei és a sejtek morfológiája között, mely az áramlási citométerrel vagy konfokális mikroszkópiával nem tehető meg.

Képek a telepített citométerről és a műszerhasználati tréningről. 5

6

7