Hasonló dokumentumok
Az áramlási citométer és sejtszorter felépítése és működése, diagnosztikai alkalmazásai

Tóth Mónika Ágnes PTE ÁOK Biofizikai Intézet Kereskedelmi forgalomban kapható készülékek

Modern Biofizikai Kutatási Módszerek Kereskedelmi forgalomban kapható készülékek. Áramlási citometria (flow cytometry)

Az áramlási citométer és sejtszorter felépítése és működése, diagnosztikai alkalmazásai

Áramlási citometria, sejtszeparációs technikák. Immunológiai és Biotechnológiai Intézet ÁOK, PTE

1. Az immunrendszer működése. Sejtfelszíni markerek, antigén receptorok. 2. Az immunrendszer szervei és a leukociták

Száloptika, endoszkópok

A lézer-szkenning citometria lehetőségei. Laser-scanning cytometer (LSC) Pásztázó citométer. Az áramlási citometria fő korlátai

Áramlási citometria / 4. Immunológiai és Biotechnológiai Intézet PTE KK

Modern mikroszkópiai módszerek

Őssejtek és hemopoiézis 1/23

Mikrofluidika I. - Alapok

Mérési jegyzőkönyv. Coulter számláló és áramlási citometria. 1. mérés: Semmelweis Egyetem, Elméleti Orvostudományi Központ Biofizika laboratórium

Tóthné Fülep Beatrix. Korszerű lehetőségek a fizioterápiában III. Hévíz

Konfokális mikroszkópia elméleti bevezetõ

Immunológia. Hogyan működik az immunrendszer? password: immun

Immunológiai Gyakorlatok II április

A jel-molekulák útja változó hosszúságú lehet. A jelátvitel. hírvivő molekula (messenger) elektromos formában kódolt információ

Immunológia alapjai. Az immunválasz szupressziója Előadás. A szupresszióban részt vevő sejtes és molekuláris elemek

Lumineszcencia alapjelenségek

Röntgendiffrakció. Grama László május

Az áramlási citometria - fogalmak. Áramlási citometria. TörténeZ há]ér 5/21/12. Az áramlási citometria alapjai. alkalmazhatósága.

HLA-B27 pozitivitás vizsgálati lehetőségei

V. A MIKROSZKÓP. FÉNYMIKROSZKÓPOS VIZSGÁLATOK A MIKROSZKÓP FELÉPÍTÉSE ÉS MŐKÖDÉSE

Abszorpciós fotometria

Immunológiai módszerek a klinikai kutatásban

Tumor immunológia

Lehet-e molekulára csomót kötni?

Immunológiai módszerek a klinikai kutatásban

KLINIKAI IMMUNOLÓGIA I.

Sejttenyésztési alapismeretek

Dr. Komócsi András Doktori (Ph. D.) értekezés

Használati útmutató a Cell Lab Quanta SC (Beckman Coulter) áramlási citométerhez

Az áramlási citometria gyakorlati alkalmazása az ondó rutin analízisben. Hajnal Ágnes, Dr Mikus Endre, Dr Venekeiné Losonczi Olga

A vér alakos elemei és azok funkciói

10. Genomika 2. Microarrayek és típusaik

TÚLÉRZÉKENYSÉGI I. TÍPUSÚ TÚLÉRZÉKENYSÉGI REAKCIÓ A szenzitizáció folyamata TÚLÉRZÉKENYSÉGI REAKCIÓK ÁTTEKINTÉSE TÚLÉRZÉKENYSÉGI REAKCIÓK

A veleszületett (természetes) immunrendszer. PAMPs = pathogen-associated molecular patterns. A fajspecifikus szignálok hiányának felismerése

A fény. Abszorpciós fotometria Fluoreszcencia spektroszkópia. A fény. A spektrumok megjelenési formái. A fény kettıs természete: Huber Tamás

A vér folyékony sejtközötti állományú kötőszövet. Egy átlagos embernek 5-5,5 liter vére van, amely két nagyobb részre osztható, a vérplazmára

A CD44 ellenes monoklonális antitest kezelés hatásmechanizmusa kísérletes artritiszben. Doktori értekezés. Dr. Hutás Gábor

Az ABCG2 multidrog transzporter fehérje szerkezetének és működésének vizsgálata

Az immunrendszer működésében résztvevő sejtek Erdei Anna Immunológiai Tanszék ELTE

Röntgendiffrakció, tömegspektrometria, infravörös spektrometria.

Adatgyőjtés, mérési alapok, a környezetgazdálkodás fontosabb mőszerei

Biomolekuláris kölcsönhatások vizsgálata felületi plazmonrezonancia elvén működő Biacore keszülékkel

A KAQUN-víz hatása onkológiai kezelés alatt álló betegeken. Randomizált vizsgálat.

A sejtfelszíni FasL és szolubilis vezikulakötött FasL által indukált sejthalál gátlása és jellemzése

Immunpatológia kurzus, - tavaszi szemeszter

Nemszinaptikus receptorok és szubmikronos Ca2+ válaszok: A két-foton lézermikroszkópia felhasználása a farmakológiai vizsgálatokra.

Vérképző és egyéb szöveti őssejtek

Környezetvédelmi mérések fotoakusztikus FTIR műszerrel

7. előadás: A plazma mebrán szerkezete és funkciója. Anyagtranszport a plazma membránon keresztül.

Immunbetegségek. Asztma. Szénanátha. Reumatoid artritisz. 1-es típusú Diabétesz mellitusz

5. gyakorlat: Áramlási citometria, sejtszeparációs technikák

Dr. Fröhlich Georgina

A vér élettana III. Fehérvérsejtek és az immunrendszer

1. Atomspektroszkópia

A születéskor gyűjthető. őssejtekről, felhasználási. lehetőségükről, valamint a KRIO Intézet. szolgáltatásairól

Szerves kémiai analízis TANTÁRGYI KOMMUNIKÁCIÓS DOSSZIÉ

10. Tumorok kialakulása, tumor ellenes immunmechanizusok

A basidiomycota élesztőgomba, a Filobasidium capsuligenum IFM törzse egy olyan

Glikohisztokémiai és mikrovaszkularizációs prognosztikai faktorok tüd rákban. Doktori (Ph.D) értekezés tézisei. Készítette:

NANOPARTIKULUMOK BEJUTÁSA AZ IDEGRENDSZERBE: A VÉR-AGY GÁT SZEREPE

AZ IMMUNRENDSZER VÁLASZAI A HPV FERTŐZÉSSEL KAPCSOLATOS KÉRDÉSEINKRE RAJNAVÖLGYI ÉVA DE OEC Immunológiai Intézet

Gázfázisú biokatalízis

A membránpotenciál. A membránpotenciál mérése

Diagnózis és prognózis

MŰSZAKI ISMERETEK. Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP /1/A

KEDVES BETEGÜNK! MI A VÉRÁTÖMLESZTÉS (TRANSZFÚZIÓ)?

Immunológia Alapjai. 13. előadás. Elsődleges T sejt érés és differenciálódás

POSEIDON DNS PRÓBÁK. Felhasználói Kézikönyv. Használati útmutató. Használati útmutató

Laterális feloldás és képminőség javítása vonalpásztázó tomográfiás optikai mikroszkópban

IONCSATORNÁK. I. Szelektivitás és kapuzás. III. Szabályozás enzimek és alegységek által. IV. Akciós potenciál és szinaptikus átvitel

Immunológia I. 4. előadás. Kacskovics Imre

Áramlási citometria elve

Elektromágneses hullámok, a fény

Az oldott oxigén mérés módszereinek, eszközeinek tanulmányozása

Sejt - kölcsönhatások az idegrendszerben

II./3.4. fejezet: Daganatos betegségek sugárkezelésének alapelvei

Lendület Napok: mozgásban a hazai tudomány MTA december 16. és 18.

A MITOKONDRIUMOK SZEREPE A SEJT MŰKÖDÉSÉBEN. Somogyi János -- Vér Ágota Első rész

A szervezet immunválasza a vérátömlesztésre

Egyidejű hidrodinamikai és morfológiai vizsgálatok a Dunán

Gyors DNS alapú mangalica specifikus kimutatási rendszer kidolgozás a MANGFIELD projekt keretében

SE Bővített fokozatú sugárvédelmi tanfolyam, 2005 márc IONIZÁLÓ SUGÁRZÁSOK DOZIMETRIÁJA. (Dr. Kanyár Béla, SE Sugárvédelmi Szolgálat)

A proteomika új tudománya és alkalmazása a rákdiagnosztikában

Sajtószemle szeptember 7.

Az áramlási citometria alkalmazási területei

MULTIDROG REZISZTENCIA IN VIVO KIMUTATÁSA PETEFÉSZEK TUMOROKBAN MOLEKULÁRIS LEKÉPEZÉSSEL

6. Fehérjék kimutatása. Biokémiai és sejtszintű vizsgálatok

MŰSZERTECHNIKA Gépészmérnöki BSc Felkészülési kérdések és válaszok a ZH-hoz

A csodálatos Immunrendszer Lányi Árpád, DE, Immunológiai Intézet

Fénysugarak visszaverődésének tanulmányozása demonstrációs optikai készlet segítségével

II./3.3.2 fejezet:. A daganatok célzott kezelése

Az áramlási citometria elve

Akuszto-optikai fénydiffrakció

Extracelluláris vezikulum fehérjék tömegspektrometriai vizsgálata

A mesenchymalis őssejtek funkcionális heterogenitása nem gyulladásos és gyulladásos mikrokörnyezetben

OZMÓZIS, MEMBRÁNTRANSZPORT

Átírás:

PÉCSI TUDOMÁNYEGYETEM ÁLTALÁNOS ORVOSTUDOMÁNYI KAR Áramlási citometria, sejtszeparálás ÁRAMLÁSI CITOMETRIA, SEJTSZEPARÁLÁS BIOFIZIKA 2. 2015. március 3. Dr. Bugyi Beáta Biofizikai Intézet ÁRAMLÁSI folyadékáramban lévõ heterogén részecske szuszpenzióban CITO = SEJT különálló részecskék (pl: sejtek) METRIA = MÉRÉS egyedi tulajdonságait mérhetjük optikai (fény) jelek alapján (darab, méret, komplexitás, speciális marker jelenléte, mennyisége) SZEPARÁLÁS = ELVÁLASZTÁS a mért paraméterek szerint a számunkra érdekes részecske populáció(ka)t elkülöníthetjük Folyamatábra Áramlási citométer vizsgált objektum: 0.2 150 µm részecske szuszpenzió (biológiai részecskék: sejtek, mikroorganizmusok, vér-, csontvelõminta ) mûszer: áramlási citométer mért mennyiségek: optikai jelek: fényszórás, fluoreszcencia emisszió információ/eredmény: fizikai, kémiai, biológiai jellemzõk (méret, összetettség, speciális markerek jelenléte) 1

Áramlási citométer Áramlási citométer 1. ÁRAMLÁSI RENDSZER részecskék áramlása és hidrodinamikai fókuszálása FÉNYFORRÁS (lézerek) 4. SZEPARÁLÁS sejtek szétválasztása 3. ADATFELDOLGOZÓ RENDSZER fényjelek digitális jellé alakítása, elemzés 2. OPTIKAI RENDSZER fényforrás, tükrök, szűrők, detektorok ELŐRESZÓRÁS (FSC) FLUORESZCENCIA EMISSZIÓ (FL) OLDALSZÓRÁS (SSC) 1. Áramlási rendszer, fluidika: részecskék áramlása és fókuszálása 2. Optikai rendszer: fényforrás, optikai elemek (tükrök, szûrõk), detektor 3. Adatfeldolgozó rendszer: fényjelek digitális jellé alakítása 4. Sejtszeparáló rendszer: sejtek szétválasztása Áramlási rendszer hidrodinamikai fókuszálás Hidrodinamikai fókuszálás mintafolyadék (részecske szuszpenzió, 10 5-10 6 sejt/ml, v= 10 m/s) LAMINÁRIS ÁRAMLÁS! (a két folyadékrendszer ne keveredjen) ÁRAMLÁSI FEJ köpenyfolyadék (mintafolyadékot körülvevő folyadék, a részecskék védelmére, desztillált víz, izotóniás oldat) megvilágítási pont Az áramlási fej méretei és geometriája (minta-, köpenyfolyadék, és a fejen lévõ nyílás), valamint az áramlási viszonyok (nyomás) olyanok, hogy az áramlás stabilan lamináris legyen (a két folyadékrendszer ne keveredjen), és a részecskék egyesével hagyják el az áramlási fejet. d = 50-200 µm a részecskék egyesével haladnak át a fénynyalábon (10 4-10 5 sejt/s) 2

Áramlási fej Optikai rendszer: mérhetõ jelek fényszórás, fluoreszcencia emisszió ELŐRE IRÁNYULÓ FÉNYSZÓRÁS FSC: forward angle light scatter kisebb szögekben sejt mérete sejt törésmutatója FÉNYSZÓRÁS OLDALRA IRÁNYULÓ FÉNYSZÓRÁS SSC: side light scatter nagyobb szögekben intracelluláris strukturáltság granularitás FLUORESZCENCIA EMISSZIÓ FL1, FL2, speciális paraméter sejthez, sejtalkotóhoz specifikusan kötődő fluorofór mennyisége Optikai rendszer: detektálás elõre-, oldalra irányuló fényszórás Optikai rendszer: detektálás elõre irányuló fényszórás DETEKTOR fotódióda, fotoelektron-sokszorozó sejt detektor előre irányuló fényszórás SSC ELŐRE IRÁNYULÓ FÉNYSZÓRÁS detektor a megvilágító fénynyalábbal egy irányban FSC lézer lemez OLDALRA IRÁNYULÓ FÉNYSZÓRÁS detektor a megvilágító fénynyalábra merőlegesen 90 o FÉNYFORRÁS (lézerek) Animáció: http://media.invitrogen.com.edgesuite.net/tutorials/4intro_flow/player.html 3

Optikai rendszer: detektálás fluoreszcencia emisszió FL4 FL3 FL2 FL1 DIKROIKUS TÜKRÖK: hullámhossz függő abszorpció és refrakció OPTIKAI SZŰRŐK: hullámhossz függő abszorpció Különböző fluoreszcencia emissziók szétválasztása: megfelelő fluoreszcencia emisszió a megfelelő detektorhoz jusson. lista mód LISTA MÓD: minden részecskérõl mért minden adat listaszerû megjelenítése (nyers adatok, amit a számítógép tárol). sejt mért paraméter FLUORESZCENCIA EMISSZIÓ detektor a megvilágító fénynyalábra merőlegesen FÉNYFORRÁS (lézerek) 90 o egyparaméteres ábrázolás hisztogram HISZTOGRAM: adott paraméterrel jellemezhetõ elemek számát ábrázolja (relatív gyakoriság). részecskék száma, db több kevesebb egyparaméteres ábrázolás hisztogram FSC SSC FLUORESZCENCIA kisebb nagyobb növekvő méret méret kevésbé komplex komplexebb intracelluláris strukturáltság fluoreszcens nemfluoreszcens fluorofór mennyisége mért paraméter értéke (FSC, SSC, FL) 4

multiparaméteres ábrázolás dot plot FELHÕ ÁBRÁZOLÁS (DOT PLOT): korrelációs módszer egy-egy mért paraméter (x, y tengely) összetartozó értékeit tûnteti fel pontként (minden pont egy részecskének felel meg). multiparaméteres ábrázolás dot plot oldalra irányuló szórás: komplexitás méret előre irányuló szórás: méret intracelluláris komplexitás multiparaméteres ábrázolás dot plot multiparaméteres ábrázolás dot plot fluoreszcecnia FL1 FL1 + FL1 - +/- +/+ -/- -/+ FL2 - FL2 + fluoreszcencia FL2 Példa: fehérvérsejt minta dot plotja (minta előállítása: Szedimentáció, elektroforézis) oldalra irányuló szórás: komplexitás előre irányuló szórás: méret LEUKOCITA GRANULOCITÁK neutrofil (50-70 %), eosinophil(2-5 %), basophil(< 1%) ~ 75 % méret~ 15 µm magas komplexitás MONOCITÁK ~ 3-6 % méret ~ 12 µm közepes komplexitás LIMFOCITÁK ~ 20-40 % méret ~ 7-8 µm alacsony komplexitás 5

további ábrázolási lehetõségek Kapuzás, gating KAPUZÁS: egy, vagy multiparaméteres ábrázolásban a sejteknek/részecskéknek egy részletesen vizsgálni/elemezni kívánt alpopulációját definiálhatjuk. SŰRŰSÉG PLOT pont színe ~ KONTÚR PLOT szintvonal azonos ú pontok (~ térkép) 3D PLOT z tengely (magasság) ~ Kapuzás, gating Sejtszeparálás Példa: a segítő/citotoxikust limfocitákarányának vizsgálata B sejt: CD19+ T sejt: CD3+ CD3+/CD4+ segítő CD3+/CD8+ citotoxikus természetes ölősejt: CD3-/CD16+ oldalra irányuló szórás: komplexitás fehérvérsejt minta dot plotja előre irányuló szórás: méret CD8+ CD4+ SEJTSZEPARÁLÁS: a sejtek adott paraméterekkel (FSC, SSC, FL) rendelkezõ alpopulációinak egymástól való elválasztása további vizsgálatok céljából (morfológiai, biokémiai vizsgálatok, sejttenyésztés). 6

Sejtszeparálás Alapelv Alkalmazások 1 2 3 4 5 késleltetési idő ++ áramlási fej + - -- 1. Adatgyűjtés 2. Döntés: a kapuzás alapelvei szerint kiválasztjuk a elválasztani kívánt alpopulációt. 3. Cseppképzés: a fejet piezoelektromos vibrátor(30-40 khz) segítségével rázatjuk, így az azt elhagyó folyadékoszlop cseppekre bomlik (1 csepp = 1 sejt). 4. Elektrosztatikus eltérítés: a cseppképződés helyén az elválasztani kívánt sejtet tartalmazó cseppet elektromosan feltöltjük, majd elektromos tér segítségével irányát eltérítjük. Széleskörû alkalmazási lehetõségek orvos-biológiai kutatások (alap és alkalmazott kutatások) klinikai gyakorlat (diagnosztika, terápiás monitorozás prognosztika) sejtek minőségi, mennyiségi elemzése abszolút és relatív meghatározás speciális markerek azonosítása és mennyiségi elemzése sejtfunkciók vizsgálata: jelátviteli útvonalak sejt-sejt kapcsolatok morfológiai vizsgálatok DNS károsodás és repair sejtciklus autofágia sejthalál őssejtdifferenciáció parazitológia mikrobiológia onkológia hematológia klinikai immunológia (immunterápia, immunhiányos állapot, autoimmun betegségek, fertőzések) 5. Szétválasztás: 3000 5000 sejt/s HIV fertőzött páciensből származó vérminta elemzése segítő T-limfocita fehérvérsejteket támadja meg, és azok pusztulását idézi elő segítő T-limfocita szám csökkenés Markerek: CD4+ segítő T sejt CD8+ citotoxikust sejt B-sejteskrónikuslimfocitásleukémiábanszenvedő páciensből származó vérminta elemzése B limfociták daganatos felszaporodása, normál vérsejtek kiszorítása abnormális FSC-SSC dot plot T limfocitákmennyisége lecsökken (CD3+) B limfocitákmennyisége megnő (CD20+) humán leukocita antigén-dr+ sejtek mennyisége megnő 7

alapja: CD (cluster of differentiation) protokoll sejtfelszíni marker molekulákat (CD) specifikusan felismerõ antitestek alkalmazásával lehetõvé teszi különbözõ sejttípusok azonosítását változatos szerepû marker molekulák (receptor, ligand, jelátviteli utak, antigén felismerés, növekedési faktor, sejt adhéziók) + / - szimbólum: marker molekula kifejezõdik/nem fejezõdik ki humán sejtekre > 360 CD marker Példa: lymfoidsejtek differenciációjánakmarkerei limfociták(t sejt, B sejt), természetes ölő sejtek, dendritikus sejtek csontvelő timusz szövet nyirok vér Példa: myeloid cell sejtek differenciációjánakmarkerei vörösvértest, vérlemezkék, granulociták, monociták, makrofágok, dendritikus sejtek csontvelő Limfocitákkiválasztása a leukociták közül FSC/SSC dot plot, kapuzás oldalra irányuló szórás: méret kapuzás LIMFOCITÁK előreirányuló szórás: komplexitás leukociták limfociták markerek: T sejtek CD3+ CD3+/CD8+ citotoxikus T sejt CD3+/CD4+ segítő T sejt vér szövet 8

CD3+ T-limfocitákkiválasztása a limfocitákközül CD3 fluoreszcencia emisszió hisztogram, kapuzás CD4+ segítő T-limfocitákkiválasztása a T-limfocitákközül CD4-CD8 fluoreszcencia dot plot nemfluoreszcens B & NKsejtek fluoreszcens T sejtek limfocita T-limfocita CD3 fluoreszcencia emisszió HIV fertőzött páciensből származó vérminta elemzése Áramlási citometria és sejtszeparálás - kulcsfogalmak Hidrodinamikai fókuszálás Optikai jelek (fényszórás, fluoreszcencia emisszió) eredete és jelentõsége Adatok ábrázolása: lista mód, hisztogram, korrelációs ábrázolási módszerek: dot plot Kapuzás Sejtszeparálás Korábban ismertetett fogalmak: lamináris áramlás, fotoelektron-sokszorozó, lézer, fényszórás, fluoreszcencia Késõbbiekben is elõkerülõ fogalmak: Fluoreszcencia mikroszkópia: optikai szûrõk, dikroikus tükrök Ultrahang: piezoelektromos jelenség Szedimentáció: vérminta elõkészítése 9

Javasolt internetes anyagok Kiegészítõ https://www.youtube.com/watch?v=2p7ysj0zkio http://media.invitrogen.com.edgesuite.net/tutorials/4intro_flow/play er.html http://media.invitrogen.com.edgesuite.net/tutorials/5data_analysis/ player.html Optikai szûrök, dikroikus tükrök Fotoelektron-sokszorozó fotokatódbaütköző foton fotoelektron(fotoelektromoshatás) sokszorozás, erősítés dinódaláncon keresztül anód elektromos áram 10

Fényjel elektromos jellé alakítása 11