A BIOLÓGIAI JELENSÉGEK FIZIKAI HÁTTERE Zimányi László



Hasonló dokumentumok
A metabolizmus energetikája

1 Műszaki hőtan Termodinamika. Ellenőrző kérdések-02 1

Termodinamika (Hőtan)

A diffúzió leírása az anyagmennyiség időbeli változásával A diffúzió leírása a koncentráció térbeli változásával

9. évfolyam. Osztályozóvizsga tananyaga FIZIKA

Kémiai átalakulások. A kémiai reakciók körülményei. A rendszer energiaviszonyai

Az atommag összetétele, radioaktivitás

Kémiai reakciók mechanizmusa számítógépes szimulációval

A kvantummechanika kísérleti előzményei A részecske hullám kettősségről

Az energia. Energia : munkavégző képesség (vagy hőközlő képesség)

A munkavégzés a rendszer és a környezete közötti energiacserének a D hőátadástól eltérő valamennyi más formája.

Speciális fluoreszcencia spektroszkópiai módszerek

A METABOLIZMUS ENERGETIKÁJA

A METABOLIZMUS ENERGETIKÁJA

Magfizika tesztek. 1. Melyik részecske nem tartozik a nukleonok közé? a) elektron b) proton c) neutron d) egyik sem

Orvosi Biofizika I. 12. vizsgatétel. IsmétlésI. -Fény

1. SI mértékegységrendszer

A kémiai és az elektrokémiai potenciál

Újpesti Bródy Imre Gimnázium és Ál tal án os Isk ola

Sugárzások kölcsönhatása az anyaggal

Osztályozó vizsga anyagok. Fizika

Kémiai kötések. Kémiai kötések kj / mol 0,8 40 kj / mol

Vezetők elektrosztatikus térben

10/21/11. Miért potenciálfüggvények? (Honnan kapta a nevét?) Termodinamikai potenciálfüggvények. Belső energia. Entalpia

Határfelületi jelenségek. Fogorvosi anyagtan fizikai alapjai 3. Általános anyagszerkezeti ismeretek. N m J 2

ATOMMODELLEK, SZÍNKÉP, KVANTUMSZÁMOK. Kalocsai Angéla, Kozma Enikő

Alkalmazás a makrókanónikus sokaságra: A fotongáz

Atomfizika. Az atommag szerkezete. Radioaktivitás Biofizika, Nyitrai Miklós

Termodinamika. Belső energia

Hőtan I. főtétele tesztek

Az eukarióta sejt energiaátalakító organellumai

Fermi Dirac statisztika elemei

Kémiai átalakulások. A kémiai reakciók körülményei. A rendszer energiaviszonyai

A légzési lánc és az oxidatív foszforiláció

Szilárd testek sugárzása

Spontaneitás, entrópia

Thomson-modell (puding-modell)

8. AZ ATOMMAG FIZIKÁJA

Az anyagi rendszer fogalma, csoportosítása

Kötések kialakítása - oktett elmélet

összetevője változatlan marad, a falra merőleges összetevő iránya ellenkezőjére változik, miközben nagysága ugyanakkora marad.

Membránszerkezet Nyugalmi membránpotenciál

Víz. Az élő anyag szerkezeti egységei. A vízmolekula szerkezete. Olyan mindennapi, hogy fel sem tűnik, milyen különleges

A lézer alapjairól (az iskolában)

Biofizika szeminárium. Diffúzió, ozmózis

ELTE Apáczai Csere János Gyakorló Gimnázium és Kollégium Biológia tagozat. Fizika 10. osztály. II. rész: Elektrosztatika. Készítette: Balázs Ádám

Spontaneitás, entrópia

Bevezetés a modern fizika fejezeteibe. 4. (a) Kvantummechanika. Utolsó módosítás: november 15. Dr. Márkus Ferenc BME Fizika Tanszék

Műszeres analitika II. (TKBE0532)

Fizika vizsgakövetelmény

61. Lecke Az anyagszerkezet alapjai

Atommodellek de Broglie hullámhossz Davisson-Germer-kísérlet

Az atom- olvasni. 1. ábra Az atom felépítése 1. Az atomot felépítő elemi részecskék. Proton, Jele: (p+) Neutron, Jele: (n o )

Adatgyűjtés, mérési alapok, a környezetgazdálkodás fontosabb műszerei

Egy részecske mozgási energiája: v 2 3 = k T, ahol T a gáz hőmérséklete Kelvinben 2 2 (k = 1, J/K Boltzmann-állandó) Tehát a gáz hőmérséklete

Célkitűzés/témák Fehérje-ligandum kölcsönhatások és a kötődés termodinamikai jellemzése

ELEKTRONIKAI ALKATRÉSZEK

Szentjánosbogár, trópusi halak, sarki fény Mi a közös a természet fénytüneményeiben?

Általános kémia képletgyűjtemény. Atomszerkezet Tömegszám (A) A = Z + N Rendszám (Z) Neutronok száma (N) Mólok száma (n)

A testek részecskéinek szerkezete

Röntgensugárzás. Röntgensugárzás

Energia. Energia: munkavégző, vagy hőközlő képesség. Kinetikus energia: a mozgási energia

Reakciókinetika. aktiválási energia. felszabaduló energia. kiindulási állapot. energia nyereség. végállapot

Határfelületi jelenségek. Fogorvosi anyagtan fizikai alapjai 3. Általános anyagszerkezeti ismeretek E A J 2. N m

Az enzimműködés termodinamikai és szerkezeti alapjai

2. A hőátadás formái és törvényei 2. A hőátadás formái Tapasztalat: tűz, füst, meleg edény füle, napozás Hőáramlás (konvekció) olyan folyamat,

ALKÍMIA MA Az anyagról mai szemmel, a régiek megszállottságával.

Kérdések Fizika112. Mozgás leírása gyorsuló koordinátarendszerben, folyadékok mechanikája, hullámok, termodinamika, elektrosztatika

Az élő sejt fizikai Biológiája:

A bioenergetika a biokémiai folyamatok során lezajló energiaváltozásokkal foglalkozik.

Az atommag összetétele, radioaktivitás

Energiaminimum- elve

Biofizika I. DIFFÚZIÓ OZMÓZIS


Kémia kerettanterve a Német Nemzetiségi Gimnázium és Kollégium évfolyama számára

Molekuláris dinamika I. 10. előadás

Makroszkópos tulajdonságok, jelenségek, közvetlenül mérhető mennyiségek leírásával foglalkozik (például: P, V, T, összetétel).

AZ ANYAGI HALMAZOK ÉS A MÁSODLAGOS KÖTÉSEK. Rausch Péter kémia-környezettan

A fény tulajdonságai

2. Energodinamika értelmezése, főtételei, leírási módok

-2σ. 1. A végtelen kiterjedésű +σ és 2σ felületi töltéssűrűségű síklapok terében az ábrának megfelelően egy dipól helyezkedik el.

Folyadékkristályok; biológiai és mesterséges membránok

Elektronegativitás. Elektronegativitás

Légköri termodinamika

Belső energia, hőmennyiség, munka Hőtan főtételei

Biofizika. Sugárzások. Csik Gabriella. Mi a biofizika tárgya? Mi a biofizika tárgya? Biológiai jelenségek fizikai leírása/értelmezése

A kovalens kötés elmélete. Kovalens kötésű molekulák geometriája. Molekula geometria. Vegyértékelektronpár taszítási elmélet (VSEPR)

Az atom felépítése Alapfogalmak

Minta feladatsor. Az ion neve. Az ion képlete O 4. Szulfátion O 3. Alumíniumion S 2 CHH 3 COO. Króm(III)ion

OPTIKA. Fénykibocsátás mechanizmusa fényforrás típusok. Dr. Seres István

Hogyan bírhatjuk szóra a molekulákat, avagy mi is az a spektroszkópia?

Abszorpció, emlékeztetõ

Termodinamikai bevezető

Fluoreszcencia módszerek (Kioltás, Anizotrópia, FRET) Modern Biofizikai Kutatási Módszerek

A biofizika alapjai. Szerkesztette. Tarján Imre Rontó Györgyi. Hatodik, átdolgozott kiadás. írta

Mézerek és lézerek. Berta Miklós SZE, Fizika és Kémia Tsz november 19.

Sztehlo Gábor Evangélikus Óvoda, Általános Iskola és Gimnázium. Osztályozóvizsga témakörök 1. FÉLÉV. 9. osztály

Kémiai reakciók sebessége

Membránpotenciál, akciós potenciál

1. Elektromos alapjelenségek

Átírás:

A BIOLÓGIAI JELENSÉGEK FIZIKAI HÁTTERE Zimányi László Összefoglalás A négy alapvető fizikai kölcsönhatás közül az elektromágneses kölcsönhatásnak van fontos szerepe a biológiában. Atomi és molekuláris szinten a biológiai jelenségek hátterében a kvantumfizika és az ezen alapuló molekulafizika (kvantumkémia) áll. Statisztikus mennyiségű alkotóelemből álló rendszerek makroszkópikus viselkedését a termodinamika törvényei szabályozzák. Az élő rendszerek termodinamikai szempontból nyitott, nem egyensúlyi rendszerek, így bennük a beáramló energia hatására növekedhet a rendezettség, a szervezettség. Makromolekulák egymás közti, illetve szubsztrátokkal fellépő nem kovalens kölcsönhatásaiban az elektrosztatika a meghatározó. Az alapvető fizikai kölcsönhatások A fizikai törvényszerűségek érvénye az élővilágra is kiterjed. A jelenleg ismert élővilág 0 és 200 C közötti hőmérsékleteken és nem túl nagy nyomáson lejátszódó olyan atomi és molekuláris folyamatokon alapul, amely folyamatokban alapvető szerepe van a víznek és az elemek egy viszonylag szűk körének. A négy ismert alapvető kölcsönhatás, tehát az erős, az elektromágneses, a gravitációs és a gyenge kölcsönhatás közül messze a legnagyobb jelentőségű az élet szempontjából az elektromágneses kölcsönhatás. Az erős és a gyenge kölcsönhatás hatótávolsága ugyanis az atommagok (10 15 m), illetve az elemi részecskék (10 18 m) mérettartományába esik, ennél nagyobb távolságokban nincs jelentőségük. Az elektromágneses kölcsönhatás és a gravitációs kölcsönhatás (azaz az általános tömegvonzás) hatótávolsága elvileg végtelen. A gravitációs kölcsönhatás igen gyenge, ezért csak nagyon nagy tömegek esetén van jelentősége. Az elektromágneses kölcsönhatás nagyságrendekkel erősebb a tömegvonzásnál, de a tömegvonzással ellentétben leárnyékolható, hiszen elektromos töltésből van negatív és pozitív is (szemben a mindig pozitív tömeggel). A molekuláknak az életfolyamatokat is megalapozó kialakulását és viselkedését a kvantummechanika magyarázza meg, a kvantummechanika pedig az atomi (molekuláris) méretű testek viselkedésének elmélete elsősorban elektromágneses térben. Termodinamika és komplexitás Az élő anyag legfontosabb tulajdonságai az összetettség és a bonyolultság (komplexitás): a szerves molekulákból általában jól meghatározott szerkezetű makromolekulák, ezek kapcsolódásából 1

sejtalkotó elemek (pl. citoszkeleton, lipid-fehérje membránok stb.), sejtek, szövetek, szervek és egyedek épülnek fel. Mindez ellentmondani látszik a termodinamika második főtételének, amely a rendetlenség (az azt leíró fizikai mennyiség, az entrópia) növekedését írja elő minden magától végbemenő folyamatra (ilyenek például az életfolyamatok). Az entrópia növekedésének törvénye azonban csak a zárt rendszerekre igaz. Az élő rendszerek termodinamikai értelemben nyitott rendszerek, környezetükkel együtt alkotnak zárt rendszert. Egy nyitott rendszer és környezete esetén a rendszerbe a környezetből áramló energia teszi lehetővé azt, hogy a rendszer szerkezete bonyolultabb, szervezettsége, rendezettsége egyre magasabb fokú legyen, de ennek ára a rendetlenség növekedése a környezetben. A földi bioszférára vonatkoztatva végül is az állandóan beáramló energia forrása a Nap, és ez teszi lehetővé a bioszférában tapasztalt magas fokú szerveződést. Ahogy a termodinamika második főtétele, ugyanúgy az első főtétel, az energiamegmaradás is általános érvényű az élő rendszerekben, illetve az élő rendszerek és környezetük együttesében. Az energiamegmaradás törvénye akár egyetlen molekulára vagy atomra és a környezetére is érvényes. Az entrópia (rendetlenség) növekedésének törvénye viszont valószínűségen alapuló törvény, ezért csak nagyszámú egyedből (pl. hasonló molekulákból) álló sokaságra értelmezhető. Az élő sejtekben lezajló (bio)kémiai folyamatokra már teljesül ez a feltétel, tehát a folyamatok ahogy a kémiai folyamatok általában azért mennek maguktól végbe, mert a rendszernek és környezetének az összes entrópiája növekszik. Ha csak a rendszert szemléljük a környezete nélkül, akkor a spontán folyamatok irányát az energiaminimumra és entrópiamaximumra való együttes törekvés szabja meg (ez az elméletben úgy írható le, hogy egyensúly esetén a rendszer szabadentalpia függvényének minimuma van ez a függvény a rendszernek mind az energiáját, mind az entrópiáját tartalmazza). A törvény azonban nem mond semmit a folyamatok sebességéről. Azt a nem egyensúlyi termodinamika magyarázza meg. Eszerint a spontán folyamatok sebessége (pl. az energia és az anyag áramlásának sebessége) annál nagyobb, minél távolabb van a folyamat az egyensúlytól. Az élő rendszerek a környezetükkel folytatott energia- és anyagcsere miatt sohasem érik el a termodinamikai egyensúly állapotát. Az ekvipartíció elve szerint T abszolút hőmérsékleten egy rendszer minden szabadsági fokára átlagosan kt/2 energia jut, ahol k a Boltzmann állandó (1,38 10 23 J/K). Ez szobahőmérsékleten (295 K) kb. 2 10 21 J energiát jelent. A (bio)kémiai reakciók, így például az enzimreakciók sebességét a hőmérséklet is befolyásolja. Annak a valószínűsége, hogy a reaktánsok egységnyi idő alatt eljutnak az aktivált komplex állapotába, arányos exp( E a /kt)-vel, ahol E a az aktiválási energia. Ez utóbbit csökkentik a katalizátorok (az enzimek), ezzel felgyorsítva adott T hőmérsékleten a reakciót. Elektrosztatika a biológiában Kiemelt szerepe van az álló (vagy elhanyagolható sebességgel mozgó) elektromos töltések közötti kölcsönhatásnak (lásd Coulomb-törvény). Elektromos kölcsönhatás jön létre töltések között, töltés és 2

dipólus, dipólus és dipólus között. Egy töltés vagy dipólus elektromos terében egy semleges molekula polarizálódhat (indukált dipólus keletkezhet). Az élő anyagra jellemző elektrolitikus vizes oldatokban a töltések, dipólusok és indukált dipólusok között fellépő erők felelősek a nem kovalens kölcsönhatásokért. Maga a vízmolekula is dipólus, így töltések közelében rendeződik (jó példájaként az energiacsökkenésre és entrópianövekedésre való ellentétes törekvések egyensúlyának). Töltetlen, hidrofób molekulák közelében a víz rendeződését nem kompenzálja az elektrosztatikus kölcsönhatás, ezért kedvezőbb, ha ilyen találkozás minél kisebb felületen jön létre. Ez szerepet játszik olyan fontos jelenségekben, mint például a biomembránok vagy a fehérjék végleges szerkezetének kialakulása. Ugyancsak elektrosztatikus kölcsönhatások, valamint hidrogénkötések a felelősek sok molekuláris felismerőfolyamatban, mint amilyenek a fehérjealegységek, illetve a fehérjék és szubsztrátjaik összekapcsolódása (pl. a fehérjék felszínén olyan töltésmintázatok találhatók, amelyek ellentett töltésmintázata megtalálható a partner molekula felszínén). Membránpotenciál A biológiai membránok a kisméretű ionok számára átjárhatatlanok, illetve csak speciális membránfehérjéken keresztül átjárhatók. A membránok két oldala között gyakran elektromospotenciálkülönbség alakul ki, és egyes molekulák, ionok koncentrációja is eltérő lehet a két oldalon. Ez az energiaátalakító membránok esetén (pl. tilakoid membrán, a mitokondrium belső membránja) az elektrontranszportot (a redox reakciókat) és az ATP-szintézist összekötő energetikai kapocs. Az elektromospotenciál-különbség az elektrosztatikai, a koncentrációkülönbség az entrópikus hozzájárulást jelenti a teljes energiához. Az F 1 -F 0 ATP szintetáz (ATP-áz) enzim a legszebb példája az energiaátalakításnak. A protonok az elektrokémiai potenciálkülönbség hatására átáramlanak az ATP-áz transzmembrán, turbinaszerű részén (F 0 ), azt forgómozgásba hozva (elektrosztatikus kölcsönhatás). A mechanikai forgás áttevődik egy tengelyre, s ez a membránból kilógó fehérjerészben (F 1 ) forogva ciklikus konformációváltozást okoz (mechanikai kölcsönhatás). Az F 1 konformációváltozásai érintik saját ADP/ATP kötőhelyeit, energizálva az oda bekötő ADP- és foszfátmolekulákat, és létrehozva közöttük a kovalens kötést. Ugyancsak a transzmembrán potenciál, leginkább annak elektromos komponense teszi lehetővé az idegi ingerület kialakulását és terjedését. Elektromágneses sugárzás Az elektromágneses tér részecskeként hat kölcsön az anyaggal akkor, ha energiája (E = hν) megfelel például egy molekula alap- és gerjesztett állapota közötti energiakülönbségnek (rezonancia). Itt ν a hullám frekvenciája (mértékegysége 1/s, azaz Hz), h a Planck-állandó (6,63 10 34 W). Az elnyelő 3

(bizonyos esetekben fénykibocsátó) molekulák hν energiájú csomagok, ún. fotonok elnyelésére (kibocsátására) képesek, tehát ennyivel változtatják az elektromágneses tér teljes energiáját, azaz az intenzitást. A dózis a valamely időtartam alatt elnyelt összes foton energiája. Az ultraibolya és a röntgensugárzás fotonjainak energiája már képes a kémiai kötéseket felszakítani. Károsító hatásuk szempontjából a dózis a meghatározó. Az elektromágneses tér hullámként lép kölcsönhatásba az anyaggal akkor, ha a fenti megfelelés nem áll fenn. Ekkor a sugárzás (fény) számára átlátszó közeg, például a szem alkotóelemei a fénytörésen alapuló leképezésben, éles kép létrehozásában játszanak szerepet. (1. ábra.) 1. ábra. Az elektromágneses spektrum forrás: http://hu.wikipedia.org/wiki/elektromágneses_spektrum 4

SZÓSZEDET Kvantummechanika: A XX. sz. első harmadában kidolgozott, az atomi mérettartományban zajló jelenségek leírására (pl. elektronok, atommagok viselkedése, a kémiai kötés elmélete, atomok, molekulák kölcsönhatása elektromágneses sugárzással, fényelnyelés, fénykibocsátás, stb.) alkalmas fizika. Makroszkópikus mérettartományban visszaadja a klasszikus fizika eredményeit fordítva viszont az állítás nem igaz. Termodinamika: Nagy mennyiségű, hasonló alkotóelemekből álló rendszer makroszkópikus viselkedését, energiaállapotát, egyensúlyi állapotát, a spontán végbemenő folyamatok irányát és sebességét leíró ága a fizikának. Entrópia: fizikai mennyiség, mely egy (termodinamikai) rendszer rendezettségét jellemzi. Minél kevésbé rendezett (minél rendetlenebb ) a rendszer, annál nagyobb az entrópiája. Szabadentalpia (angol nyelvterületen free energy, azaz szabadenergia), más néven Gibbs potenciál: G = U + pv TS, ahol U a belső energia, p a nyomás, V a térfogat, T az abszolút hőmérséklet, S az entrópia. Állandó külső nyomás és hőmérséklet esetén egy rendszer egyensúlyában ennek minimuma van, illetve egyensúlytól távol a rendszerben spontán módon lejátszódó folyamatok a G csökkenésével járnak. A biokémiai reakciók is általában ennek a törvénynek engedelmeskednek. Coulomb törvény: Egymástól r távolságra lévő q 1 és q 2 elektromos töltések között ható erő arányos a két töltés nagyságával és fordítva arányos a távolság négyzetével: F = k q 1 q 2 / r 2. Azonos előjelű töltések esetén az erő taszító, ellentétes töltések esetén vonzó. 5