Biomolekuláris szerkezeti dinamika



Hasonló dokumentumok
Biomolekuláris szerkezeti dinamika

Times, október 9 MRI

Medical Imaging Mágneses rezonancia (MR, MRI, NMR) x B. Makroszkopikus tárgyalás

NMR, MRI. Magnetic Resonance Imaging. Times, október 9 MRI

Mágneses rezonanciás képalkotás AZ MRI elve, fizikai alapok

Biomolekuláris szerkezet és dinamika vizsgálata. Gerjesztés során elnyelt energia sorsa. Fluoreszcencia és különleges alkalmazásai

Dóczy-Bodnár Andrea október 3. Magmágneses rezonancia (NMR) és elektronspinrezonancia (ESR) alapjai

Magmágneses rezonancia (NMR) és elektronspinrezonancia (ESR) alapjai

Elektronspinrezonancia (ESR) - spektroszkópia

Lumineszcencia alapjelenségek

MRI áttekintés. Orvosi képdiagnosztika 3. ea ősz

Az időtől független Schrödinger-egyenlet (energia sajátértékegyenlet), A Laplace operátor derékszögű koordinátarendszerben

lásd: enantiotóp, diasztereotóp

MÁGNESES MAGREZONANCIA A KÉMIÁBAN, GYÓGYSZERÉSZETBEN, ORVOSTUDOMÁNYBAN

M N. a. Spin = saját impulzus momentum vektor: L L nagysága:

CT/MRI képalkotás alapjai. Prof. Bogner Péter

A fény. Abszorpciós fotometria Fluoreszcencia spektroszkópia. A fény. A spektrumok megjelenési formái. A fény kettıs természete: Huber Tamás

Fizikai kémia és radiokémia labor II, Laboratóriumi gyakorlat: Spektroszkópia mérés

ESR színképek értékelése és molekulaszerkezeti értelmezése

Lumineszcencia Fényforrások

MÁGNESES MAGREZONANCIA A KÉMIÁBAN, GYÓGYSZERÉSZETBEN, ORVOSTUDOMÁNYBAN

Elektromágneses módszerek geofizikai-földtani alkalmazásai. Pethő Gábor (Miskolci Egyetem)

Morfológiai képalkotó eljárások CT, MRI, PET

Röntgendiffrakció, tömegspektrometria, infravörös spektrometria.

Mágneses módszerek a mőszeres analitikában

Az NMR spektroszkópia a fehérjék szolgálatában. Bodor Andrea. ELTE Szerkezeti Kémia és Biológia Laboratórium Visegrád

Speciális fluoreszcencia spektroszkópiai módszerek

Rádióspektroszkópiai módszerek

BIOFIZIKA. Metodika- 4. Liliom Károly. MTA TTK Enzimológiai Intézet

Műszeres analitika II. (TKBE0532)

Szerves kémiai analízis TANTÁRGYI KOMMUNIKÁCIÓS DOSSZIÉ

Modern mikroszkópiai módszerek

Sohár Pál Varázslat, amitől láthatóvá válnak és életre kelnek a molekulák: Az NMR spektroszkópia

Magmágneses rezonancia. alapjai. Magmágneses rezonanciához kapcsolódó Nobel-díjak. γ N = = giromágneses hányados. v v

Atomszerkezet. Fehérjék szerkezetvizsgáló módszerei. Molekulaszerkezet. Molekula energiája. Lumineszcenciás technikák. E e > E v > E r. + E v.

Az elektromágneses spektrum

A testek részecskéinek szerkezete

Mágneses módszerek a műszeres analitikában

Biofizika tesztkérdések

Az NMR képalkotás alapjai. Bányai István Kolloid- és Környezetkémiai Tanszék DE, TEK

A fény és az anyag kölcsönhatása

Alkalmazott spektroszkópia Serra Bendegúz és Bányai István

24/04/ Röntgenabszorpciós CT

Műszeres analitika II. (TKBE0532)

Az Orvosi Fizika Szigorlat menete a 2012/2. tanévtől

Fluoreszcencia módszerek (Kioltás, Anizotrópia, FRET)

Fluoreszcencia módszerek (Kioltás, Anizotrópia, FRET) Modern Biofizikai Kutatási Módszerek

Fontos fogalmak. A pörgettyűmodell

Biofizika és orvostechnika alapjai

Elektronspinrezonancia (ESR) - spektroszkópia

A MÁGNESES REZONANCIA LEKÉPEZÉS (MRI) HASZNÁLATA TERMÉNYEK HŐFIZIKAI VIZSGÁLATAINÁL KOVÁCS, A. J.

Sugárzások kölcsönhatása az anyaggal. Dr. Vincze Árpád

KOVÁCS ENDRe, PARIpÁS BÉLA, FIZIkA II.

Abszorpciós fotometria

Atomfizika I. Az anyagszerkezetről alkotott kép változása Ókori görög filozófusok régi kérdése: Miből vannak a testek? Meddig osztható az anyag?

Fizika 2 (Modern fizika szemlélete) feladatsor

Az MR(I) módszer elve. Dr.Fidy Judit 2012 március 7

Szakdolgozat. Elektron spin rezonancia spektrométer fejlesztése. Témavezető: Simon Ferenc egyetemi docens BME Fizikai Intézet Fizika Tanszék

τ Γ ħ (ahol ħ=6, evs) 2.3. A vizsgálati módszer: Mössbauer-spektroszkópia (Forrás: Buszlai Péter, szakdolgozat) A Mössbauer-effektus

Az MR(I) módszer elve. Az MR(I) módszer. (Nuclear) Magnetic Resonance Imaging mag (atommag) mágneses rezonancia alapu képalkotó módszer

Fluoreszcencia 2. (Kioltás, Anizotrópia, FRET)

RAJZOLATI ÉS MÉLYSÉGI MINTÁZATKIALAKÍTÁS II:

Száloptika, endoszkópok

Lizozim fehérje vizsgálata NMR-spektroszkópiával

L Ph 1. Az Egyenlítő fölötti közelítőleg homogén földi mágneses térben a proton (a mágneses indukció

5.4. Elektronspektroszkópia

Fény kölcsönhatása az anyaggal:

Pár szó az Optikáról

Az optikai jelátvitel alapjai. A fény két természete, terjedése

NEUTRON-DETEKTOROK VIZSGÁLATA. Mérési útmutató BME NTI 1997

Hogyan bírhatjuk szóra a molekulákat, avagy mi is az a spektroszkópia?

PÉCSI TUDOMÁNYEGYETEM. Oxidkristályok lineáris terahertzes spektroszkópiai vizsgálata. Unferdorben Márta

Stern Gerlach kísérlet. Készítette: Kiss Éva

Az (N)MR(I) módszer elve

Nagy Sándor: Magkémia

A magkémia alapjai. Magpotenciálok, magspin, mágneses momentumok & kölcsönhatások. Nagy Sándor ELTE, Kémiai Intézet

Szerves vegyületek szerkezetfelderítése NMR spektroszkópia

Konfokális mikroszkópia elméleti bevezetõ

2 Mekkora az egyes sejtekre vonatkozó nyugalmi potenciál értéke? 30 és 100 mikrovolt közötti értékek nagyságrendjébe esik

Műszeres analitika. Abrankó László. Molekulaspektroszkópia. Kémiai élelmiszervizsgálati módszerek csoportosítása

Anyagvizsgálati módszerek

Mágneses alapjelenségek

Fotogerjesztett biofizikai rendszerek. Barócsi Attila

Dipoláris relaxáció vizsgálata idıbontott spektroszkópiai módszerekkel

Ph Mozgás mágneses térben

A Ca 2+ szerepe a tormaperoxidáz enzim aktív szerkezetében. Szigeti Krisztián

Feladatok haladóknak

A fehérjék szerkezete és az azt meghatározó kölcsönhatások

Abszorpció, emlékeztetõ

Magnetorezisztív jelenségek vizsgálata mágneses nanoszerkezetekben

I. Atomszerkezeti ismeretek (9. Mozaik Tankönyv: oldal) 1. Részletezze az atom felépítését!

A nehézfémek növényi vízháztartásra gyakorolt hatásának vizsgálata Mágneses Rezonancia készülékkel. Készítette: Jakusch Pál Környezettudós

palkotás alapjai Bányai István Kolloid- és Környezetkémiai Tanszék DE, TEK

3 He ionokat pedig elektron-sokszorozóval számlálja. A héliummérést ismert mennyiségű

Mi mindenről tanúskodik a Me-OH néhány NMR spektruma

F1404 ATOMMAG- és RÉSZECSKEFIZIKA

Székhelye: H-6771 Szeged, Szerb u. 59. Telefon/fax: Telefon: , Adószám:

Fizikai kémia 2. ZH V. kérdések I. félévtől

Készítette: Bujnóczki Tibor Lezárva:

OSZTÁLYOZÓ VIZSGA TÉMAKÖREI

Átírás:

Kísérletek, mérések célja Biomolekuláris szerkezeti dinamika Kellermayer Miklós Biomolekuláris szerkezet és működés pontosabb megismerése (folyamatok, állapotok, átmenetek, kölcsönhatások, stb.) Rádióspektroszkópiák : forradalmasították a fizikát, kémiát, biológiát és orvostudományt Atomi, molekuláris rendszerek elemi mágnesként viselkedhetnek Elektronspin rezonancia (ESR, elektron paramágneses rezonancia - EPR) Mágneses magrezonancia (NMR, MRI) EPR spektroszkópia NMR spektroszkópia Ferhérje molekuláris dinamika NMR-rel Nagyfelbontású, anatómiai MRI Stern-Gerlach kísérlet (1922) Az eredő mágneses dipólmomentumot az 5s 1 elektron adja (pályaperdület=0) A nyaláb két részre hasad Otto Stern (1888-1969) Walther Gerlach (1889-1979) Inhomogén mágneses térben nemcsak forgatónyomaték, hanem eredő erő is hat a mágneses dipólra: A spin mágneses momentum két értéket vehet fel. MRI spektroszkópia MRI angiográfia Funkcionális MRI (fmri) Diffúziós MRI (tractographia) Musculoskeletalis MRI Mágneses magrezonancia ( nuclear magnetic resonance, NMR) Nobel-díj, 1952 Isidor Rabi (1898-1988) Felix Bloch (1905-1983) Edward Mills Purcell (1912-1997) Mágneses rezonancia: Mágneses térbe helyezett minta általi, rezonancia-abszorpció jellegű elektromágneses energia elnyelés.

Eredő spinnel rendelkező rendszerek: elemi mágnesek Elemi részecskék (p, n, e) saját spinnel rendelkeznek. Az elemi részecskék száma és bizonyos rendező elvek (pl. Pauli-elv) szerint a rendszerben eredő spin léphet fel. Atommag: páratlan tömegszám - feles magspin ( 1 H, 13 C, 15 N, 19 F, 31 P); páros tömegszám, páratlan rendszám - magspin egész; páros tömegszám és rendszám - magspin zérus. Elektron: eredő elektronspin stabil párosítatlan elektront tartalmazó rendszerekben (pl. szabad gyökök). Töltés és eredő spin miatt mágneses momentum lép fel. Magmágneses momentum: γ N = atommag giromágneses hányadosa (mágneses momentum és perdület aránya) L = magspin ( ), ahol l=eredő spinkvantumszám. Elektronspin mágneses momentuma: Mágneses tér hiányában: elemi mágnesek orientációja random Paramágnesség: külső mágneses tér hatására fellépő mágnesezettség (mágneses dipólok orientációja). Mágneses térben: elemi mágnesek orientálódnak parallel E energiaszintek felhasadnak ΔE Rezonanciafeltétel: ΔE=hf Pörgettyűmodell g = elektron g-faktora (a mágneses momentum és giromágneses hányados kapcsolatát leíró dimenziónélküli arányszám) μ β = Bohr magneton (az elektron mágneses dipólmomentumának egysége) S = spinkvantumszám antiparallel B Precesszió NMR és EPR spektroszkópia Pörgettyűmodell szerint - Precessziós vagy Larmor frekvencia: ω 0 =γ NMR spektrum: elnyelt elektromágneses sugárzás intenzitása frekvencia függvényében. NMR-vonal görbe alatti területe az abszorbeáló atommagok számával arányos. Elektronfelhő (i.e., annak szerkezete) befolyásolja a lokális mágneses teret: frekvenciafeltétel elhangolódik ( kémiai eltolódás ). Kémiai szerkezetmeghatározás lehetősége. Acetaldehid NMR spektruma Rezonanciafeltétel: EPR spektrum: elnyelt elektromágneses sugárzás intenzitása a mágneses tér függvényében. NMR-énél alacsonyabb mágneses tér, de nagyobb elektromágneses sugárzási frekvenciák (mikrohullám). Spin-jelölés: stabil párosítatlan elektront tartalmazó vegyülettel való jelölés. Mozgási (rotációs) sebességek mérési lehetősége a 10-4 - 10-2 s időtartományban. Mágneses tér (G) Spinjelölt citokróm-c ESR spektruma

Makroszkópos mágnesezettség különböző energiaszinteken spintöbblet miatt Gerjesztés rádiófrekvenciás elektromágneses sugárzással M = mágneses tér M = makroszkópos mágnesezettség Rezonancia feltétel: Larmor frekvencia μ i Alacsony energia állapot proton esetében parallel M B 1 Magas energia állapot proton esetében antiparallel = mágneses tér M = makroszkópos mágnesezettség B 1 = besugárzott rádiófrekvenciás elektromágneses tér Spin-rács relaxáció T1 vagy longitudinális relaxáció Spin-spin relaxáció T2 vagy tranzverzális relaxáció M z M xy free induction decay (FID) T1 relaxációs idő: elemi mágnes (proton) és környezete közötti kölcsönhatásra utal t t T2 relaxációs idő: elemi mágnesek (protonok) közötti kölcsönhatásra utal

MRI: non-invazív tomográfiás módszer MRI: az emberi test makroszkópos mágnesezettségét hozza létre Nobel-díj (2003) Raymond V. Damadian (1936-) Paul C. Lauterbur (1929-) Ábra Damadian szabványügyi bejelentéséből indomitable : a rettenthetetlen Peter Mansfield (1933-) MRI képalkotás I: Térbeli felbontás NMR jel térbeli kódolása: a precesszió frekvenciaváltozására épül voxel: térfogatelem pixel: felületelem, elemi képpont Kép B z Elemi 3D képpontok (voxel) definiálása és címezhetősége: grádiens tér segítségével B y RF tekercs Fourier transzformáció B x

MRI képalkotás II: színfelbontás (kontraszt) relaxációs idők alapján MRI összefoglalás A szövet B szövet Tranzverzális jelveszteség Zsír Liquor Gerjesztő impulzus Tekercs Rövid T1 Hosszú T1 Idő (ms) A proton RF hullámot emittál gerjesztést követően. Kriogén mágnes Grádiens tekercs Rádiofrekvenciáns tekercs Vízmolekula Képanalízis (2D-FFT) NMR berendezés T1-súlyozás protonsűrűségsúlyozás T2-súlyozás MRI: képi információ manipulálása I MRI: Non-invazív angiográfia Újraszeletelés merőleges síkban képszelet telített spinek véráram telítetlen spinek Térbeli projekció ( volume rendering )

MRI mozgókép Nagy időfelbontású felvételek alapján Funkcionális MRI (fmri) Élettani folyamattal szinkron felvett Nagy időfelbontású képsorozat Aortabillentyű nyílása-záródása Villogó fény hatása a látókéregre Szuperponált MRI és PET képsorozat Függelék: FRET PET aktivitás: szemmozgatás során Térbeli rekonstrukció

Lumineszcencia A lumineszcencia lépései Gerjesztett állapotból fényemisszióval járó relaxáció A hőmérsékleti sugárzáson felül kibocsátott sugárzás Hideg fény Fluoreszcencia és foszforeszcencia Abszorpció Emisszió Gerjesztés (magasabb energiaszintre lépés) De-excitáció (relaxáció az alapállapotba) Gerjesztés során elnyelt energia sorsa Fluoreszcencia Rezonancia Energia Transzfer Belső konverzió (hő) Rendszerek közötti átmenet S T Fluoreszcencia (ns) Foszforeszcencia (ms) k isc k ic k Q ENERGIA k k FRET f Fluoreszcencia kioltás FRET Általánosan: A gerjesztett állapotban lévő molekula (donor), valamint egy megfelelő spektroszkópiás követelményeket kielégítő molekula (akceptor) között dipól-dipól kölcsönhatás révén, sugárzás nélküli energiaátadás formájában jön létre. Fluoreszcencia Rezonancia Energia Transzfer (FRET): ha az energiatranszfer szereplői fluorofórok. Sugárzásos v. nem sugárzásos átmenetek!

- D + FRET A gerjesztett donor relaxációjához hozzájárul az akceptor molekula emissziója! hν hν E ~ k FRET ~ 1/R 6 R - A + hν A FRET feltételei Fluoreszcens donor és akceptor molekula. A donor és akceptor molekula közötti távolság (R) 2-10 nm! Átfedés a donor emissziós spektruma és az akceptor abszorpciós spektruma között. Fl intenzitás ill. OD Hullámhossz (nm) A FRET távolságfüggése A FRET alkalmazása E = R 0 6 R 0 6 + R 6 A fluorofórok közötti aktuális távolság E Förster-távolság (Az a távolság melyen a FRET hatásfok felére csökken: transzferhatásfok 0.5) Molekuláris mérőszalag: távolságmérés a nm-es (10-9 m) tartományban. Nagyon érzékeny! Alkalmazás: Molekulák közötti kölcsönhatások tanulmányozása. Molekulákon belüli szerkezeti változások tanulmányozása. R 0